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Visualization and Characterization of High-Order Chromatin Fibers under Light Microscope during Interphase and Mitotic Stages in Plants
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作者 Jing-Yu Liu Chao-Wen She +4 位作者 Zhong-Li Hu Fen Li Ying Diao Li-Hua Liu Yun-Chun Song 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2007年第11期1634-1639,共6页
Using genomic in situ hybridization with genomic DNA, high-order chromatin fibers were successfully exhibited under a light microscope through the cell cycle in barley, rice, maize and field bean. From the interphase ... Using genomic in situ hybridization with genomic DNA, high-order chromatin fibers were successfully exhibited under a light microscope through the cell cycle in barley, rice, maize and field bean. From the interphase to prophase and metaphase of mitosis, the fibers were basically similar. Each was estimated to be around 200 nm in diameter, but the strength of signals was not the same along the fiber length. Through the cell cycle a series of dynamic distribution changes occurred in the fibers. In the interphase, they were unraveled. At the early prophase they were arranged with parallel and mirror symmetry. During late-prophase and metaphase, the fibers were bundled and became different visible chromosomes. The parallel coiling and mirror symmetry structures were visible clearly until the metaphase. In anaphase they disappeared. During telophase, in peripheral regions of congregated chromosome group, borderlines of the chromosomes disappeared and the fibers were unraveled. This demonstrated that mitotic chromosomes are assembled and organized by parallel and adjacent coiling of the fibers and the fibers should be the highest order structure for DNA coiling. 展开更多
关键词 high-order chromatin fibers INTERPHASE mitosis.
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Tunable,High-Order Harmonically Mode-Locked All-Normal-Dispersion Ytterbium Fiber Laser
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作者 吕志国 滕浩 +2 位作者 王立娜 王睿 魏志义 《Chinese Physics Letters》 SCIE CAS CSCD 2015年第8期74-77,共4页
We report the generation of passively tunable high peak signal-to-noise ratio harmonic mode-locked (HML) all- normal-dispersion Yb-doped fiber laser with a single birefringent filter in a ring cavity configuration. ... We report the generation of passively tunable high peak signal-to-noise ratio harmonic mode-locked (HML) all- normal-dispersion Yb-doped fiber laser with a single birefringent filter in a ring cavity configuration. The highest fourth harmonic of the fundamental mode-locked frequency at a repetition rate of 88 MHz is obtained. The pulses are compressed to 627fs by using an external grating-pair compressor. For the fourth HML output, the peak signal-to-noise ratio of the rf is 73dB and the average power is as high as 110mW with the pump power of 500mW. Soliton bunches which contain multipulses are also observed in the weak mode-locked regime of the HML, and the separation between interpulses in a dissipative soliton bunch can be controlled by adjustment of the waveplates and spectral filter in the cavity: 展开更多
关键词 Tunable high-order Harmonically Mode-Locked All-Normal-Dispersion Ytterbium fiber Laser
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MyoD介导肌肉特异性基因染色质重塑激活与成肌分化控制 被引量:1
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作者 熊琪 李晓锋 +3 位作者 索效军 张年 刘洋 陈明新 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第20期4780-4782,4804,共4页
骨骼肌纤维的数目由出生前肌源细胞的成肌分化进程所决定,直接影响家畜的生长潜能和肉质。Myo D依赖的肌肉特异性基因的染色质重塑激活是控制成肌分化的重要方式,其作用模式已有一些报道。PI3K/Akt和p38信号也参与了这一过程的调控。对... 骨骼肌纤维的数目由出生前肌源细胞的成肌分化进程所决定,直接影响家畜的生长潜能和肉质。Myo D依赖的肌肉特异性基因的染色质重塑激活是控制成肌分化的重要方式,其作用模式已有一些报道。PI3K/Akt和p38信号也参与了这一过程的调控。对这一研究进展进行了综述。 展开更多
关键词 成肌分化 MYOD 染色质重塑 肌纤维数目
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黑眉锦蛇(Elaphe taeniura)精子形成的电镜观察 被引量:4
4
作者 蔡亚非 李君 陈壁辉 《安徽师大学报》 1998年第1期42-45,49,共5页
本文用透射电镜观察了黑眉锦蛇精子形成的过程.可分成以下四个时期:时期Ⅰ,由高尔基复合体形成前顶体囊泡,并向核移动,至核膜时,核膜凹陷形成电子透明的封闭的顶体囊泡,囊泡底部有一电子致密的顶体颗粒;时期Ⅱ,顶体囊泡变扁平... 本文用透射电镜观察了黑眉锦蛇精子形成的过程.可分成以下四个时期:时期Ⅰ,由高尔基复合体形成前顶体囊泡,并向核移动,至核膜时,核膜凹陷形成电子透明的封闭的顶体囊泡,囊泡底部有一电子致密的顶体颗粒;时期Ⅱ,顶体囊泡变扁平,染色质浓缩成短丝状的染色质纤维,近端中心粒及鞭毛开始形成;时期Ⅲ,核内染色质纤维变粗变长,并沿核纵轴方向排列有序;时期Ⅳ,纵行微管出现,至精子释放前消失,染色质纤维浓缩到最大度而使核呈高电子致密度,终环形成,顶体发育完全,精子的其它部分也逐渐形成,最后讨论了黑眉锦蛇精子形成过程中顶体区变化与其它动物的区别,微管系统存在形式和时间的种的特异性. 展开更多
关键词 黑眉锦蛇 精子 电镜 形成过程
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盐离子浓度对HeLa细胞内提取的“30nm”染色质结构影响的电镜观察
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作者 李宁 李晓敏 +2 位作者 关宏斌 朱平 黄晓星 《电子显微学报》 CAS CSCD 2012年第3期243-250,共8页
染色质是遗传信息发挥作用的重要处所,其结构受到了广泛的关注。研究人员基于不同的实验材料和方法提出一些30 nm染色质纤维结构模型,但并没有形成一个统一的结论。本文选择人源Hela细胞作为实验材料,综合前人的实验方法,从细胞内提取... 染色质是遗传信息发挥作用的重要处所,其结构受到了广泛的关注。研究人员基于不同的实验材料和方法提出一些30 nm染色质纤维结构模型,但并没有形成一个统一的结论。本文选择人源Hela细胞作为实验材料,综合前人的实验方法,从细胞内提取纯化染色质"30 nm"纤维并进行电子显微观察,在不同Na+离子浓度盐溶液中对Hela细胞染色质"30 nm"纤维结构形态及折叠紧密程度的影响进行了分析。结果表明,在0~100 mmol/L Na+之间,随着盐浓度的升高,染色质结构折叠呈现逐渐紧密的趋势。与此同时,在提取染色质纤维的过程中可以通过调节Na+,Ca2+,Mg2+等盐离子浓度抑制Hela细胞内源性核酸酶的活性。本文结果为进一步研究30 nm染色质纤维的高级结构提供了有益的信息。 展开更多
关键词 HELA细胞 “30nm”染色质纤维 电子显微
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30nm染色质纤维的结构及调控 被引量:1
6
作者 梁丹 陈萍 李国红 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1009-1014,共6页
真核细胞中,基因组DNA缠绕组蛋白八聚体形成核小体,核小体再经过多层次折叠压缩形成具有高级结构的染色质.过去30多年,科学家对30 nm染色质纤维的结构进行了大量的研究,然而关于30 nm染色质纤维的精细结构仍然存在很大的争议.本文综述... 真核细胞中,基因组DNA缠绕组蛋白八聚体形成核小体,核小体再经过多层次折叠压缩形成具有高级结构的染色质.过去30多年,科学家对30 nm染色质纤维的结构进行了大量的研究,然而关于30 nm染色质纤维的精细结构仍然存在很大的争议.本文综述了近年来对30 nm染色质纤维结构的最新研究进展,并重点阐述了最近解析的30 nm染色质纤维左手双螺旋结构.同时,我们还进一步讨论了一些对30 nm染色质纤维结构起调控作用的因子及其作用机制.最后,我们对30 nm染色质纤维结构与功能领域所面临的挑战和问题进行了展望. 展开更多
关键词 30 nm染色质纤维 核小体 连接组蛋白H1 表观遗传学
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30nm染色质纤维高级结构的研究进展 被引量:1
7
作者 董立平 陈萍 李国红 《自然杂志》 北大核心 2014年第4期274-279,共6页
真核生物的遗传物质DNA以染色质形式通过逐级折叠压缩存在于细胞核中。DNA缠绕组蛋白八聚体形成核小体,相邻的核小体由连接DNA串联起来形成染色质的一级结构:核小体串珠结构(beads-on-a-string)。一级结构进一步折叠形成30 nm染色质纤... 真核生物的遗传物质DNA以染色质形式通过逐级折叠压缩存在于细胞核中。DNA缠绕组蛋白八聚体形成核小体,相邻的核小体由连接DNA串联起来形成染色质的一级结构:核小体串珠结构(beads-on-a-string)。一级结构进一步折叠形成30 nm染色质纤维。近30多年来,30 nm染色质纤维高级结构的解析一直是困扰分子生物学家们的一大难题。研究者利用电镜和X射线晶体学等生物物理学方法对30 nm染色质纤维结构进行研究,提出30 nm结构的两大模型:螺线管(solenoid)模型和Z字结构(zig-zag)模型。笔者综述了30 nm染色质纤维结构解析方面的研究进展,并着重阐述最近利用冷冻电镜方法解析的30 nm染色质结构,即以四个核小体为结构单元的左手双螺旋结构模型,最后对30 nm染色质纤维在体内是否存在,以及它在表观遗传调控中可能发挥的重要作用等问题进行了讨论和展望。 展开更多
关键词 30 nm染色质纤维 螺线管模型 Z字结构模型 左手双螺旋 冷冻电镜技术 核小体 组蛋白H1
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30nm染色质的体外组装和电镜分析
8
作者 孙大鹏 宋峰 +4 位作者 黄丽 张阔 季刚 陈萍 朱平 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第8期739-747,共9页
真核生物的基因组以染色质的形式存在,染色质在真核生物的基因表达调控及胚胎发育过程中起重要作用,为表观遗传提供一个重要的信息整合平台.染色质的高级结构,特别是30 nm染色质的动态变化在基因转录沉默和激活过程中起着重要的调控功能... 真核生物的基因组以染色质的形式存在,染色质在真核生物的基因表达调控及胚胎发育过程中起重要作用,为表观遗传提供一个重要的信息整合平台.染色质的高级结构,特别是30 nm染色质的动态变化在基因转录沉默和激活过程中起着重要的调控功能.但是目前对30 nm染色质纤维的组装及其精细结构的认识还十分有限.本文通过体外表达系统,表达未经修饰的组蛋白,并利用克隆构建的601DNA均一重复序列,通过逐步降低盐离子浓度并加入组蛋白H1或镁离子的方法,体外重组均一的30 nm染色质纤维.并利用镀金属、负染色制样和冷冻电镜制样等手段通过透射式电子显微镜(TEM)对30 nm纤维结构的形成原因、组蛋白H1的作用和核小体重复单位(nucleosome repeat lengths,NRLs)长度对30 nm染色质纤维的影响进行研究.研究结果显示在组蛋白H1或二价镁离子存在的情况下,均可形成30 nm染色质纤维.其形成的染色质拓扑结构有所不同.统计分析表明,不同长度核小体重复单位(NRLs)形成的染色质纤维直径有所不同(P<0.05).同时,我们得到了较为均一的冷冻电镜样品,为进一步研究30 nm染色质纤维的高级结构及理解体内染色质存在的形式及动态过程打下了较好的基础. 展开更多
关键词 30nm染色质纤维 透射电子显微镜 染色质高级结构 体外重组
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Direct Observation of Histone-Induced DNA Shortening
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作者 冉诗勇 王晓玲 +5 位作者 付文博 赖振华 王渭池 刘晓晴 麦振洪 李明 《Chinese Physics Letters》 SCIE CAS CSCD 2006年第2期504-507,共4页
We construct a system of magnetic tweezers and apply it to study the interaction between histones and DNA. The condensation of DNA by purified histones at low ionic strengths is directly monitored by recording the len... We construct a system of magnetic tweezers and apply it to study the interaction between histones and DNA. The condensation of DNA by purified histones at low ionic strengths is directly monitored by recording the length of the DNA as a function of elapsed time. It is found that DNA condensates in a dynamic manner. The binding of hist, ones to DNA is energetically favoured, but the ten,sion applied on DNA tends to unravel the DNA-histone complex, The competition between the two processes determiners the rate of the DNA condensation. 展开更多
关键词 SINGLE chromatin fibers SUPERCOILED DNA RNA-POLYMERASE STRANDED-DNA MOLECULES ELASTICITY FORCE NUCLEOSOMES RESOLUTION TWEEZERS
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Optimal Higher-order Dispersion Management Methods in WDM Transmission Systems
10
作者 LIUYan LIKang KONGFan-min 《Semiconductor Photonics and Technology》 CAS 2004年第1期5-7,共3页
In order to reduce the four-wave mixing crosstalk and avoid the signal waveform distortion in long-haul dense-wavelength division multiplexing systems,helpful methods on how to choose suitable local parameters in high... In order to reduce the four-wave mixing crosstalk and avoid the signal waveform distortion in long-haul dense-wavelength division multiplexing systems,helpful methods on how to choose suitable local parameters in higher-order dispersion managed line are presented, which are used to increase the system capacity and improve the system performances. 展开更多
关键词 Optical fiber communication high-order dispersion management Four-wave mixing Wavelength division multiplexing
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Amplification characteristics in active tapered segmented cladding fiber with large mode area 被引量:1
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作者 Caijian Xie Tigang Ning +6 位作者 Jingjing Zheng Li Pei Jianshuai Wang Jing Li Haidong You Chuangye Wang Xuekai Gao 《High Power Laser Science and Engineering》 SCIE CAS CSCD 2021年第2期247-256,共10页
A kind of tapered segmented cladding fiber(T-SCF)with large mode area(LMA)is proposed,and the mode and amplification characteristics of T-SCFs with concave,linear,and convex tapered structures are investigated based o... A kind of tapered segmented cladding fiber(T-SCF)with large mode area(LMA)is proposed,and the mode and amplification characteristics of T-SCFs with concave,linear,and convex tapered structures are investigated based on finite-element method(FEM)and few-mode steady-state rate equation.Simulation results indicate that the concave tapered structure can introduce high loss for high-order modes(HOMs)that is advantageous to achieve single-mode operation,whereas the convex tapered structure provides large effective mode area that can help to mitigate nonlinear effects.Meanwhile,the small-to-large amplification scheme shows further advantages on stripping off HOMs,and the large-to-small amplification scheme decreases the heat load density induced by the high-power pump.Moreover,singlemode propagation performance,effective mode area,and heat load density of the T-SCF are superior to those of tapered step index fiber(T-SIF).These theoretical model and numerical results can provide instructive suggestions for designing high-power fiber lasers and amplifiers. 展开更多
关键词 bending loss heat load density high-order modes filtering large mode area tapered fibers
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Applications of image analysis in plant chromosome and chromatin structure study
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作者 Nobuko Ohmido Astari Dwiranti +1 位作者 Seiji Kato Kiichi Fukui 《Quantitative Biology》 CSCD 2022年第3期226-238,共13页
Background:The use of image analysis to understand the structure of chromosome and chromatin is critical to the study of genetic evolution and diversification.Furthermore,a detailed chromosome map and the structure of... Background:The use of image analysis to understand the structure of chromosome and chromatin is critical to the study of genetic evolution and diversification.Furthermore,a detailed chromosome map and the structure of chromatin in the nucleus may contribute to the plant breeding and the study of fundamental biology and genetics in organisms.Results:In plants with a fully annotated genome project,such as the Leguminosae species,the integration of genetic information,including DNA sequence data,a linkage map,and the cytological quantitative chromosome map could further improve their genetic value.The numerical parameters of chromocenters in 3D can provide useful genetic information for phylogenetic studies of plant diversity and heterochromatic markers whose epigenetic changes may explain the developmental and environmental changes in the plant genome.Extended DNA fibers combined with fluorescence in situ hybridization revealed the highest spatial resolution of the obtained genome structure.Moreover,image analysis at the nano-scale level using a helium ion microscope revealed the surface structure of chromatin,which consists of chromatin fibers compacted into plant chromosomes.Conclusions:The studies described in this review sought to measure and evaluate chromosome and chromatin using the image analysis method,which may reduce measurement time and improve resolution.Further,we discussed the development of an effective image analysis to evaluate the structure of chromosome and chromatin.An effective application study of cell biology and the genetics of plants using image analysis methods is expected to be a major propeller in the development of new applications. 展开更多
关键词 CHIAS CHROMOSOME chromatin extended DNA fiber helium ion microscopy NUCLEUS PLANTS
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利用冷冻电镜技术解析30nm染色质高级结构 被引量:2
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作者 朱平 李国红 许瑞明 《中国科学基金》 CSSCI CSCD 北大核心 2014年第3期200-203,共4页
人类基因组计划完成后的一个重要生物学问题是:人体内200多种具有相同基因组,但形态和功能迥异的细胞的命运是如何决定和分化的?这其中,由染色体的基本单元——核小体经多次折叠后形成的30 nm染色质可能起了重要的作用。在高等生物个体... 人类基因组计划完成后的一个重要生物学问题是:人体内200多种具有相同基因组,但形态和功能迥异的细胞的命运是如何决定和分化的?这其中,由染色体的基本单元——核小体经多次折叠后形成的30 nm染色质可能起了重要的作用。在高等生物个体的发育和分化过程中,生命体通过各种表观遗传机制调控染色质高级结构(特别是30 nm染色质纤维)的动态变化,进而调控基因的开放、关闭和转录水平,从而决定细胞的组织特异性和细胞命运。 展开更多
关键词 30 nm染色质 冷冻电镜 三维重构 双螺旋
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冷冻电镜技术的发展推动染色质高级结构的研究 被引量:2
14
作者 朱平 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2015年第11期1465-1471,共7页
染色质的结构及动态变化在基因转录及表观遗传调控中起了关键作用,但对于30 nm染色质纤维(通常认为是基因组DNA的二级结构)的高级结构组成以及细胞体内是否存在30 nm染色质的组织形式一直存在较大争议。近年来,冷冻电镜三维重构技术发... 染色质的结构及动态变化在基因转录及表观遗传调控中起了关键作用,但对于30 nm染色质纤维(通常认为是基因组DNA的二级结构)的高级结构组成以及细胞体内是否存在30 nm染色质的组织形式一直存在较大争议。近年来,冷冻电镜三维重构技术发展迅速,为研究30 nm染色质纤维高级结构提供了一个良好的工具,并起了较大的推动作用。该文介绍了本领域相关的一些研究进展。 展开更多
关键词 染色质高级结构 冷冻电镜 表观遗传调控
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应用原子力显微镜对玉米染色质纤丝及染色体骨架的研究(英文)
15
作者 李琦 丁焰 +1 位作者 贾斌 黄庆生 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1111-1118,共8页
应用原子力显微镜对经化学方法预处理的玉米染色体超微结构进行了研究。原子力显微镜观察的结果揭示,经30%醋酸处理的玉米染色体表面呈现出不均一的颗粒状结构。当缩小扫描范围后,在染色体表面发现直径分别为30和100 nm的两种染色质纤丝... 应用原子力显微镜对经化学方法预处理的玉米染色体超微结构进行了研究。原子力显微镜观察的结果揭示,经30%醋酸处理的玉米染色体表面呈现出不均一的颗粒状结构。当缩小扫描范围后,在染色体表面发现直径分别为30和100 nm的两种染色质纤丝。100 nm的染色质纤丝由30 nm染色质纤丝螺旋缠绕而成。在经25%胰酶处理的玉米染色体上发现了两种类似的螺旋状染色质纤丝结构,其直径分别为30和100~150 nm。较细的染色质纤丝螺旋缠绕成较粗的纤丝,进而构成整个染色体。经低离子浓度溶液抽提,用原子力显微镜观察到了玉米染色体的染色体骨架结构。这种染色体骨架呈不规则的纤维网状,这些网状纤维在染色体中部显得较为紧密,在染色体的边缘则显得较松散。这一结果暗示染色体是由不同级别的染色质纤丝螺旋缠绕构成,为染色体的多级螺旋结构假说提供了新的证据。同时发现染色体骨架并不是呈轴样的结构存在,而是保留了染色体的基本形态,这种骨架形状也许是由分散在染色体中的染色体骨架蛋白在低离子浓度溶液抽提的过程中凝缩形成的。 展开更多
关键词 原子力显微镜 染色体超微结构 染色质纤丝 染色体骨架
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30nm染色质纤维结构与表观遗传调控 被引量:1
16
作者 梁丹 陈萍 李国红 《生命的化学》 CAS CSCD 2014年第5期614-620,共7页
真核生物的DNA以染色质形式通过逐级折叠压缩形成高级结构存在于细胞核中。染色质高级结构直接参与了真核基因的转录调控和其它与DNA相关的生物学事件,因此研究染色质高级结构对了解表观遗传学分子机制有着至关重要的作用。近些年,研究... 真核生物的DNA以染色质形式通过逐级折叠压缩形成高级结构存在于细胞核中。染色质高级结构直接参与了真核基因的转录调控和其它与DNA相关的生物学事件,因此研究染色质高级结构对了解表观遗传学分子机制有着至关重要的作用。近些年,研究者们针对30 nm染色质高级结构提出了两个模型:螺线管模型和Zig-Zag模型。2014年,我们利用体外染色质组装体系重建了30 nm染色质纤维,运用高精度冷冻电镜技术得到了分辨率为11?的30 nm染色质纤维的精细结构,提出了30 nm染色质高级结构的左手双螺旋Zig-Zag模型。本文综述了30 nm染色质纤维结构研究方面的相关进展,并对30 nm染色质高级结构的表观遗传调控机理以及单分子成像和操纵技术在研究30 nm染色质高级结构中潜在的应用作出讨论和展望。 展开更多
关键词 30 nm染色质纤维 冷冻电镜技术 连接组蛋白H1 表观遗传调控 单分子成像和操纵技术
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染色质的高级结构与调控 被引量:1
17
作者 胡杰 李国红 《生命科学》 CSCD 2017年第10期955-967,共13页
真核生物中,DNA作为遗传物质并不是裸露存在的,而是以染色质的形式存储在细胞核中。作为遗传信息的载体,长达数米的基因组DNA被压缩在微米级的细胞核中却能精确地控制生物高度有序的各种生理活动,因此,染色质的空间结构必定具有一定的... 真核生物中,DNA作为遗传物质并不是裸露存在的,而是以染色质的形式存储在细胞核中。作为遗传信息的载体,长达数米的基因组DNA被压缩在微米级的细胞核中却能精确地控制生物高度有序的各种生理活动,因此,染色质的空间结构必定具有一定的规律性且高度可控。而30 nm染色质纤维作为从核小体串珠结构到高级染色质结构中间一个关键的结构阶段,在诸多DNA相关的生命活动中起重要调控功能,因此,对其结构及动态调控相关的研究具有重要的生物学意义。现总结近年来30 nm染色质纤维精细结构解析以及染色质结构动态调控方面的一些重要最新进展,同时,也对细胞核内染色质纤维结构的一些基因组学和电镜方面的最新研究进行了讨论和展望。 展开更多
关键词 30 nm染色质 单分子磁镊 组蛋白变体 核小体 染色质高级结构 表观遗传调控
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