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Mutation analysis of 13 driver genes of colorectalcancer-related pathways in Taiwan Residents patients
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作者 Yuli Christine Chang Jan-Gowth Chang +5 位作者 Ta-Chih Liu Chien-Yu Lin Shu-Fen Yang Cheng-Mao Ho William Tzu-Liang Chen Ya-Sian Chang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2016年第7期2314-2325,共12页
AIM To investigate the driver gene mutations associatedwith colorectal cancer (CRC) in the Taiwan Residentspopulation.METHODS: In this study, 103 patients with CRCwere evaluated. The samples consisted of 66 menand ... AIM To investigate the driver gene mutations associatedwith colorectal cancer (CRC) in the Taiwan Residentspopulation.METHODS: In this study, 103 patients with CRCwere evaluated. The samples consisted of 66 menand 37 women with a median age of 59 years and anage range of 26-86 years. We used high-resolutionmelting analysis (HRM) and direct DNA sequencing tocharacterize the mutations in 13 driver genes of CRCrelatedpathways. The HRM assays were conductedusing the LightCycler? 480 Instrument provided with the software LightCycler 480 Gene Scanning SoftwareVersion 1.5. We also compared the clinicopathologicaldata of CRC patients with the driver gene mutationstatus.RESULTS: Of the 103 patients evaluated, 73.79%had mutations in one of the 13 driver genes. Wediscovered 18 novel mutations in APC , MLH1 , MSH2 ,PMS2 , SMAD4 and TP53 that have not been previouslyreported. Additionally, we found 16 de novo mutationsin APC , BMPR1A , MLH1 , MSH2 , MSH6 , MUTYH andPMS2 in cancerous tissues previously reported in thedbSNP database; however, these mutations couldnot be detected in peripheral blood cells. The APCmutation correlates with lymph node metastasis(34.69% vs 12.96%, P = 0.009) and cancer stage(34.78% vs 14.04%, P = 0.013). No association wasobserved between other driver gene mutations andclinicopathological features. Furthermore, having twoor more driver gene mutations correlates with thedegree of lymph node metastasis (42.86% vs 24.07%,P = 0.043).CONCLUSION: Our findings confirm the importanceof 13 CRC-related pathway driver genes in the developmentof CRC in Taiwan Residents patients. 展开更多
关键词 COLORECTAL cancer driver gene Colorectalcancer-related pathway Mutation High-resolutionmelting analysis
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Identification of Driver Genes in Primary Liver Cancer by Integrating NGS and TCGA Mutation Data
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作者 Lin Li Lin Niu +7 位作者 Na Guo Luyang Cheng Tengfei Hao Ying Xu Xiangling Li Qian Xu Lei Liu Songhe Yang 《Open Journal of Gastroenterology》 2022年第1期1-18,共18页
<strong>Background:</strong><span style="font-family:""> This study is aimed towards an exploration of mutant genes in primary liver cancer (PLC) patients by using bioinformatics and d... <strong>Background:</strong><span style="font-family:""> This study is aimed towards an exploration of mutant genes in primary liver cancer (PLC) patients by using bioinformatics and data mining techniques. <b>Methods: </b>Peripheral blood or paraffin-embedded tissues from 8 patients with PLC were analyzed using a 551 cancer-related gene panel on an Illumina NextSeq500 Sequencer (Illumina). Meanwhile, the data of 396 PLC cases were downloaded from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database. The common mutated genes were obtained after integrating the mutation information of the above two cohorts, followed by functional enrichment and protein-protein interaction (PPI) analyses. Three well-known databases, including Vogelstein’s list, the Network of Cancer Gene (NCG), and the Catalog of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC) database were used to screen driver genes. Furthermore, the Chi-square and logistic analysis were performed to analyze the correlation between the driver genes and clinicopathological characteristics, and Kaplan</span><span style="font-family:"">-</span><span style="font-family:"">Meier (KM) method and multivariate Cox analysis were conducted to evaluate the overall survival outcome. <b>Results:</b> In total, 84 mutation genes were obtained after 8 PLC patients undergoing gene mutation detection with next-generation sequencing (NGS). The top 100 most mutate gene data from PLC patients in TCGA database were downloaded. After integrating the above two cohorts, 17 common mutated genes were identified. Next, 11 driver genes were screened out by analyzing the intersection of the 17 mutation genes and the genes in the three well-known databases. Among them, RB1, TP53, and KRAS gene mutations were connected with clinicopathological characteristics, while all the 11 gene mutations had no relationship with overall survival. <b>Conclusion:</b> This study investigated the mutant genes with significant clinical implications in PLC patients, which may improve the knowledge of gene mutations in PLC molecular pathogenesis.</span> 展开更多
关键词 Primary Liver Cancer MUTATION Next-generation Sequencing TCGA driver genes
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A feature extraction framework for discovering pan-cancer driver genes based on multi-omics data
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作者 Xiaomeng Xue Feng Li +3 位作者 Junliang Shang Lingyun Dai Daohui Ge Qianqian Ren 《Quantitative Biology》 CAS CSCD 2024年第2期173-181,共9页
The identification of tumor driver genes facilitates accurate cancer diagnosis and treatment,playing a key role in precision oncology,along with gene signaling,regulation,and their interaction with protein complexes.T... The identification of tumor driver genes facilitates accurate cancer diagnosis and treatment,playing a key role in precision oncology,along with gene signaling,regulation,and their interaction with protein complexes.To tackle the challenge of distinguishing driver genes from a large number of genomic data,we construct a feature extraction framework for discovering pan-cancer driver genes based on multi-omics data(mutations,gene expression,copy number variants,and DNA methylation)combined with protein–protein interaction(PPI)networks.Using a network propagation algorithm,we mine functional information among nodes in the PPI network,focusing on genes with weak node information to represent specific cancer information.From these functional features,we extract distribution features of pan-cancer data,pan-cancer TOPSIS features of functional features using the ideal solution method,and SetExpan features of pan-cancer data from the gene functional features,a method to rank pan-cancer data based on the average inverse rank.These features represent the common message of pan-cancer.Finally,we use the lightGBM classification algorithm for gene prediction.Experimental results show that our method outperforms existing methods in terms of the area under the check precision-recall curve(AUPRC)and demonstrates better performance across different PPI networks.This indicates our framework’s effectiveness in predicting potential cancer genes,offering valuable insights for the diagnosis and treatment of tumors. 展开更多
关键词 cancer driver genes feature extraction multi-omics data network propagation pan-cancer
原文传递
Target genes discovery through copy number alteration analysis in human hepatocellular carcinoma 被引量:6
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作者 De-Leung Gu Yen-Hsieh Chen +3 位作者 Jou-Ho Shih Chi-Hung Lin Yuh-Shan Jou Chian-Feng Chen 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2013年第47期8873-8879,共7页
High-throughput short-read sequencing of exomes and whole cancer genomes in multiple human hepatocellular carcinoma(HCC)cohorts confirmed previously identified frequently mutated somatic genes,such as TP53,CTNNB1 and ... High-throughput short-read sequencing of exomes and whole cancer genomes in multiple human hepatocellular carcinoma(HCC)cohorts confirmed previously identified frequently mutated somatic genes,such as TP53,CTNNB1 and AXIN1,and identified several novel genes with moderate mutation frequencies,including ARID1A,ARID2,MLL,MLL2,MLL3,MLL4,IRF2,ATM,CDKN2A,FGF19,PIK3CA,RPS6KA3,JAK1,KEAP1,NFE2L2,C16orf62,LEPR,RAC2,and IL6ST.Functional classification of these mutated genes suggested that alterations in pathways participating in chromatin remodeling,Wnt/β-catenin signaling,JAK/STAT signaling,and oxidative stress play critical roles in HCC tumorigenesis.Nevertheless,because there are few druggable genes used in HCC therapy,the identification of new therapeutic targets through integrated genomic approaches remains an important task.Because a large amount of HCC genomic data genotyped by high density single nucleotide polymorphism arrays is deposited in the public domain,copy number alteration(CNA)analyses of these arrays is a cost-effective way to reveal target genes through profiling of recurrent and overlapping amplicons,homozygous deletions and potentially unbalanced chromosomal translocations accumulated during HCC progression.Moreover,integration of CNAs with other high-throughput genomic data,such as aberrantly coding transcriptomes and non-coding gene expression in human HCC tissues and rodent HCC models,provides lines of evidence that can be used to facilitate the identification of novel HCC target genes with the potential of improving the survival of HCC patients. 展开更多
关键词 COPY number ALTERATION HIGH-DENSITY single NUCLEOTIDE POLYMORPHISM arrays driver genes HEPATOCELLULAR carcinoma
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安罗替尼联合多西他赛治疗驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌的临床疗效研究
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作者 辛影 马丽霞 《系统医学》 2024年第11期158-160,168,共4页
目的 探究非小细胞肺癌治疗中安罗替尼与多西他赛联合的作用。方法 选取吉林省肿瘤医院于2022年6月—2023年7月收治的120例非小细胞肺癌患者为研究对象,采用随机摸球法分为两组,各60例。对照组使用多西他赛治疗,研究组联用多西他赛和安... 目的 探究非小细胞肺癌治疗中安罗替尼与多西他赛联合的作用。方法 选取吉林省肿瘤医院于2022年6月—2023年7月收治的120例非小细胞肺癌患者为研究对象,采用随机摸球法分为两组,各60例。对照组使用多西他赛治疗,研究组联用多西他赛和安罗替尼治疗。对比两组临床疗效、上皮特异性黏附分子(Epithelial Cell Adhesion Molecule, EP-CAM)、可溶性细胞间黏附分子-1(Soluble Intercellular Adhesion Molecule-1, SICAM1)、血清细胞黏附分子(Cellular Adhesion Molecule, CAM)水平及不良反应发生率。结果 研究组的疾病缓解率为43.33%,高于对照组的21.67%,差异有统计学意义(χ^(2)=6.419,P=0.011)。治疗后,研究组EP-CAM、SICAM1、CAM水平低于对照组,差异有统计学意义(P均<0.05)。研究组不良反应发生率低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 安罗替尼联合多西他赛治疗驱动基因阴性非小细胞肺癌能够降低肿瘤标志物,且有助于降低不良反应发生风险。 展开更多
关键词 安罗替尼 驱动基因 临床疗效 肿瘤标志物 不良反应
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驱动基因阴性非小细胞肺癌二线治疗中国专家共识 被引量:1
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作者 中国临床肿瘤学会非小细胞肺癌专家委员会 周彩存 +4 位作者 王洁 程颖 王宝成 周清华 周斐 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期81-87,共7页
对于驱动基因阴性的晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者而言,既往化疗一直都是标准治疗选择,而免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)的加入为这部分患者提供了新的治疗选择。目前一线治疗可以选... 对于驱动基因阴性的晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者而言,既往化疗一直都是标准治疗选择,而免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)的加入为这部分患者提供了新的治疗选择。目前一线治疗可以选择化疗、抗血管生成药物或免疫治疗。尽管初始治疗能获得一定的有效率,但仍不可避免地会出现疾病进展或治疗失败,二线及以上治疗疗效差,患者预后不佳,临床上需要更多有效的二线治疗药物。中国临床肿瘤学会非小细胞肺癌专家委员会组织呼吸科、肿瘤科、病理科专家对驱动基因阴性人群临床研究证据进行了深入探讨,根据专家组讨论后广泛认可的临床诊疗经验,对驱动基因阴性NSCLC患者二线治疗制定了统一的专家共识,可作为中国临床医师选择驱动基因阴性NSCLC二线治疗的指导依据。 展开更多
关键词 肺肿瘤 免疫治疗 抗血管生成药物 驱动基因阴性 专家共识
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河南豫东地区661例非小细胞肺癌常见驱动基因突变分析 被引量:1
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作者 王延 贺雅静 +1 位作者 黄立娜 张玉文 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2024年第1期38-42,共5页
目的分析河南豫东地区非小细胞肺癌(non-small cell lung cancers,NSCLC)患者常见驱动基因的突变情况。方法回顾性分析2022年3月至2023年7月就诊于商丘市第一人民医院的661例NSCLC患者,入组病例均采用了5种基因突变检测试剂盒(荧光PCR法... 目的分析河南豫东地区非小细胞肺癌(non-small cell lung cancers,NSCLC)患者常见驱动基因的突变情况。方法回顾性分析2022年3月至2023年7月就诊于商丘市第一人民医院的661例NSCLC患者,入组病例均采用了5种基因突变检测试剂盒(荧光PCR法)进行检测。应用统计学方法分析其临床特征与各驱动基因状态之间的关系。结果661例NSCLC中EGFR、KRAS、ALK、ROS1、PIK3CA、BRAF、HER2、RET、MET14和NRAS的突变率分别为47.35%、9.68%、5.45%、1.82%、2.87%、1.82%、1.21%、0.91%、0.61%和0%。EGFR、ROS1和HER2的突变更易发生在在女性患者中(P<0.05),而KRAS突变常发生于男性患者(P<0.05)。EGFR、KRAS和ALK突变在腺癌中的突变率显著高于鳞癌和非小细胞肺癌非特指型(NSCLC.NOS)(P<0.05),PIK3CA在NSCLC.NOS中的突变率最高。KRAS基因在Ⅰ+Ⅱ期的突变率显著高于Ⅲ+Ⅳ期(P<0.05),其他基因与临床分期无明显相关性。与吸烟者相比,非吸烟者的总驱动基因突变率明显较高(P<0.05),EGFR、ALK、PIK3CA、ROS1、BRAF和HER2常发生于非吸烟患者中(P<0.05),而KRAS基因更易发生于吸烟患者中(P<0.05)。沉渣细胞块标本10种驱动基因突变率78.67%,检出率显著高于其他类型标本(P<0.05)。结论EGFR、KRAS、ALK等常见驱动基因与患者性别、病理类型、临床分期以及吸烟具有一定的相关性。质控合格的沉渣细胞块标本用于基因检测的优势明显,可以在有条件的患者中广泛推广;ARMS-PCR法联合检测10种基因可作为初诊初治NSCLC患者的首选基因检测方法。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 驱动基因 多基因检测 ARMS-PCR法
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PD-1抑制剂联合一线化疗方案对晚期驱动基因阴性肺腺癌的效果及安全性分析 被引量:1
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作者 陈艳妮 张建红 +3 位作者 李健 李瑶 逯震芳 陈亮 《河北医药》 CAS 2024年第8期1184-1187,共4页
目的探讨程序性细胞死亡蛋白-1(PD-1)抑制剂联合一线化疗方案治疗晚期驱动基因阴性肺腺癌的效果及安全性。方法回顾性收集2019年1月至2021年12月收治的60例晚期驱动基因阴性的肺腺癌患者病历资料,依据治疗方式不同分组,将30例接受培美... 目的探讨程序性细胞死亡蛋白-1(PD-1)抑制剂联合一线化疗方案治疗晚期驱动基因阴性肺腺癌的效果及安全性。方法回顾性收集2019年1月至2021年12月收治的60例晚期驱动基因阴性的肺腺癌患者病历资料,依据治疗方式不同分组,将30例接受培美曲塞、顺铂联合PD-1抑制剂(信迪利单抗)治疗的病历资料纳入观察组另30例接受培美曲塞联合顺铂治疗的病历资料纳入对照组。对比2组患者治疗前、治疗30 d时2组临床疗效[客观缓解率(ORR)、疾病控制率(DCR)]、免疫功能[CD_(4)^(+)、CD_(8)^(+)、CD_(4)^(+)/CD_(8)^(+)]、肿瘤标志物[癌胚抗原(CEA)、细胞角蛋白19片段(CYFRA21-1)]、不良反应[恶心、粒细胞减少、肝功能异常、甲状腺功能异常、肺炎、皮疹、血小板降低]。结果观察组ORR显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);2组DCR比较差异无统计学意义(P>0.05);治疗后,观察组CD_(4)^(+)、CD_(4)^(+)/CD_(8)^(+)水平高于治疗前,且高于对照组(P<0.05);治疗后,2组CYFRA21-1、CEA水平均下降,且观察组低于对照组(P<0.05)。观察组甲状腺功能异常、肺炎、皮疹等发生例数显著多于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论PD-1抑制剂联合化疗一线治疗可有效改善晚期驱动基因阴性肺腺癌患者免疫功能,并降低肿瘤标志物水平,疗效确切。 展开更多
关键词 肺腺癌 驱动基因阴性 PD-1抑制剂 化疗 免疫功能
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原发性血小板增多症患者中JAK2、CALR及三阴性驱动突变的临床特征比较
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作者 李雨蒙 杨二鹏 +9 位作者 王子卿 王德好 牛继聪 李芋锦 明静 孙明谦 陈卓 刘为易 吕妍 胡晓梅 《中国实验血液学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第1期197-201,共5页
目的:探讨原发性血小板增多症(ET)患者的突变基因与临床特征的关系。方法:对2018年10月至2022年3月69例ET患者的临床资料进行回顾性分析。将患者按突变的驱动基因类型分为JAK2组、CALR组与三阴性组,对3组患者的性别、年龄、心血管危险... 目的:探讨原发性血小板增多症(ET)患者的突变基因与临床特征的关系。方法:对2018年10月至2022年3月69例ET患者的临床资料进行回顾性分析。将患者按突变的驱动基因类型分为JAK2组、CALR组与三阴性组,对3组患者的性别、年龄、心血管危险因素、血栓、脾肿大、血常规、凝血状态进行分析。结果:69例ET患者中,46例伴随JAK2基因突变,14例伴随CALR基因突变,8例为三阴性,1例伴随MPL基因突变。3组患者的年龄、性别无显著差异(P>0.05)。JAK2组血栓率最高,为26.09%(12/46),三阴性组为12.5%(1/8),CALR组无血栓事件。JAK2组伴随脾肿大发生率最高,为34.78%(16/46),而三阴性组无脾肿大发生。JAK2组的白细胞数为(9.00±4.86)×10^(9)/L,显著高于CALR组的(6.03±2.32)×10^(9)/L(P<0.05)。JAK2组的血红蛋白含量为(148.43±18.79)g/L,显著高于三阴性组的(131.00±15.17)g/L(P<0.05)。JAK2组的红细胞压积为(0.44±0.06)%,亦显著高于三阴性组的(0.39±0.05)%(P<0.05)。JAK2组血小板数为(584.17±175.77)×10^(9)/L,显著低于CALR组的(703.07±225.60)×10^(9)/L(P<0.05)。JAK2组和三阴性组纤维蛋白原含量分别为(2.64±0.69)g/L和(3.05±0.77)g/L,均显著高于CALR组的(2.24±0.47)g/L(P<0.05,P<0.01)。三阴性组活化部分凝血活酶时间为(28.61±1.99)s,较CALR组的(31.45±3.35)s显著降低(P<0.05)。结论:不同驱动基因突变ET患者的血细胞计数与凝血状态存在差异。与CALR组相比,JAK2组血栓率、白细胞数和纤维蛋白原含量均显著升高,而血小板数显著降低;与三阴性组相比,JAK2组脾大发生率和红细胞压积显著升高;与CALR组相比,三阴性组的纤维蛋白原含量显著升高、活化部分凝血活酶时间显著降低。 展开更多
关键词 原发性血小板增多症 二代基因测序 驱动突变 凝血
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不同标本类型在非小细胞肺癌基因检测中的应用及意义
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作者 朱启淦 孟加榕 +3 位作者 魁国菊 张小红 黄江宾 禹乐 《西部医学》 2024年第4期512-517,共6页
目的研究分析不同标本类型在非小细胞肺癌(NSCLC)患者的驱动基因检出率,并分析表皮生长因子受体(EGFR)、间变性淋巴瘤激酶(ALK)、C-ros原癌基因1-受体酪氨酸激酶(ROS1)、Kristen鼠肉瘤病毒原癌基因同源体(KRAS)、鼠类肉瘤滤过性毒菌致... 目的研究分析不同标本类型在非小细胞肺癌(NSCLC)患者的驱动基因检出率,并分析表皮生长因子受体(EGFR)、间变性淋巴瘤激酶(ALK)、C-ros原癌基因1-受体酪氨酸激酶(ROS1)、Kristen鼠肉瘤病毒原癌基因同源体(KRAS)、鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌基因同源体B(BRAF)等驱动基因异常情况及与临床病理特征关系。方法收集2021年1月—2021年12月我院病理科明确诊断为NSCLC样本180例,包括手术切除标本25例,肺活检标本80例,恶性胸腔积液细胞蜡块标本29例,转移病灶标本46例,采用扩增阻滞突变系统(ARMS)法检测驱动基因突变状态。结果5种驱动基因的总突变率为53.33%(96/180),驱动基因突变可在不同标本类型中检出,不同标本间突变率比较差异无统计学意义(P>0.05)。EGFR基因突变率40.56%(73/180),性别及组织类型突变率比较差异有统计学意义(P<0.05),年龄类型突变率比较差异无统计学意义(P>0.05);KRAS基因突变率6.11%(11/180),其中性别类型突变率比较差异有统计学意义(P<0.05),年龄与组织类型突变率比较差异无统计学意义(P>0.05);ALK融合基因突变率4.44/%(8/180),年龄、性别及组织类型突变率比较差异无统计学意义(P>0.05);BRAF基因突变率1.11%(2/180),ROS1融合基因突变率1.11%(2/180)。结论不同标本类型均可检出驱动基因,增加了临床基因检测的取样途径。NSCLC患者EGFR基因突变率明显高于其他驱动基因,EGFR基因突变与患者性别及组织类型有差异,KRAS基因突变与患者性别有差异;ALK、ROS1、BRAF基因突变率较低,但指导NSCLC治疗有重要意义。多基因联合检测可一次获取更多驱动基因突变信息,能够更快、更全面地指导临床治疗。 展开更多
关键词 扩增阻滞突变系统 非小细胞肺癌 驱动基因 基因突变
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胰腺癌中核心甲基化驱动基因的功能探究
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作者 张旭升 柳科军 +2 位作者 唐超峰 康付平 陈本栋 《宁夏医科大学学报》 2024年第4期371-380,共10页
目的 筛选胰腺癌中的核心甲基化驱动基因,探究其生物功能及临床意义。方法 基于TCGA/GEO数据库中胰腺癌的mRNA-seq数据及匹配的临床数据,利用R分析软件相关数据包及部分在线分析工具,分析并获得胰腺癌中甲基化驱动基因;采用Lasso-Cox回... 目的 筛选胰腺癌中的核心甲基化驱动基因,探究其生物功能及临床意义。方法 基于TCGA/GEO数据库中胰腺癌的mRNA-seq数据及匹配的临床数据,利用R分析软件相关数据包及部分在线分析工具,分析并获得胰腺癌中甲基化驱动基因;采用Lasso-Cox回归分析筛选核心甲基化驱动基因,并探究其在胰腺癌中的功能特点及临床意义;最后基于核心甲基化驱动基因构建预后模型并进行相关探究。结果 甲基化驱动基因ZSCAN18、FERMT1、LIPH、LAMA3及S100A16对胰腺癌表现出良好的诊断效能,且FERMT1、LIPH、LAMA3及S100A16的表达上调与患者较差的预后相关(P<0.05),ZSCAN18的表达上调则与患者较好的生存预后相关(P<0.05),而基于甲基化驱动基因ZSCAN18、FERMT1、LIPH、LAMA3及S100A16的预后模型表现出良好的预测效能,具有较好的临床应用潜能。结论 甲基化驱动基因ZSCAN18、FERMT1、LIPH、LAMA3及S100A16是胰腺癌的潜在诊断靶点及预后标志物,基于以上基因的预后模型表现出良好的预测效能。 展开更多
关键词 胰腺癌 甲基化 甲基化驱动基因
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靶向肿瘤驱动基因的胃癌治疗研究进展
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作者 吴世英 徐平龙 张飞 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期73-83,共11页
随着胃癌致病机制深入解析及胃癌驱动基因的鉴定,靶向胃癌驱动基因的药物逐渐应用临床。其中,曲妥珠单抗作为首个胃癌靶向药物,通过靶向过表达的人表皮生长因子受体2(HER2)抑制肿瘤细胞的增殖、生存和转移等过程,已成为HER2阳性胃癌患... 随着胃癌致病机制深入解析及胃癌驱动基因的鉴定,靶向胃癌驱动基因的药物逐渐应用临床。其中,曲妥珠单抗作为首个胃癌靶向药物,通过靶向过表达的人表皮生长因子受体2(HER2)抑制肿瘤细胞的增殖、生存和转移等过程,已成为HER2阳性胃癌患者的一线治疗药物。雷莫芦单抗则通过靶向血管内皮生长因子受体2(VEGFR2)抑制肿瘤血管生成,用于晚期胃癌患者的二线治疗。此外,贝马利珠单抗和佐妥昔单抗分别靶向过度表达的成纤维细胞生长因子受体2(FGFR2)和紧密连接蛋白18.2(CLDN18.2),在临床试验中显著延长胃癌患者的无进展生存期和总生存期。本文回顾了靶向HER2、VEGF、FGFR2、CLDN18.2和MET等肿瘤驱动基因的胃癌治疗策略,介绍了肿瘤驱动基因在胃癌进程中的作用及其靶向药物的应用,以期为胃癌靶向治疗药物的研发和临床应用提供参考。 展开更多
关键词 胃癌 驱动基因 靶向治疗 临床试验 综述
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肺癌驱动基因检测研究进展
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作者 秦樱 徐兴祥 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第8期1563-1566,共4页
肺癌靶向治疗为晚期非小细胞肺癌患者的生存带来了希望,而肺癌驱动基因的检测为肺癌的靶向治疗提供了证据。临床中,只有准确的检测出肺癌相关的驱动基因突变,才能正确的选择靶向治疗的优势人群,进而达到肺癌精准治疗的目标。因此,在肺... 肺癌靶向治疗为晚期非小细胞肺癌患者的生存带来了希望,而肺癌驱动基因的检测为肺癌的靶向治疗提供了证据。临床中,只有准确的检测出肺癌相关的驱动基因突变,才能正确的选择靶向治疗的优势人群,进而达到肺癌精准治疗的目标。因此,在肺癌的临床诊治中,驱动基因检测的准确性显得尤为重要。临床医师应该重视肺癌驱动基因检测结果的准确性。本文现就肺癌驱动基因检测的研究进展作一综述,以帮助临床医师更规范的进行肺癌驱动基因的检测。 展开更多
关键词 肺癌 驱动基因 研究进展
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青年型肺腺癌临床特征及驱动基因突变的研究进展 被引量:1
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作者 孙卓琛 田丰 魏俊 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第7期1340-1343,共4页
近年来,随着低剂量螺旋CT(low-dose CT,LDCT)在肺癌筛查中的应用,越来越多的年轻患者被确诊为肺癌。虽然青年非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者(≤45岁)占比较低,但其有独特的临床病理特征及基因突变位点。肺腺癌作... 近年来,随着低剂量螺旋CT(low-dose CT,LDCT)在肺癌筛查中的应用,越来越多的年轻患者被确诊为肺癌。虽然青年非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者(≤45岁)占比较低,但其有独特的临床病理特征及基因突变位点。肺腺癌作为年轻患者中最常见的NSCLC病理类型,其致癌基因改变(genomic alterations,GAs)和临床特征研究较少。随着肺癌个体化治疗观念的提出,其群体研究也逐渐受到重视。因此对青年肺腺癌进行研究极具临床意义。本文就青年肺腺癌患者的发病趋势、病理特征和驱动基因突变等特点作一综述。 展开更多
关键词 青年肺腺癌 病理特征 驱动基因突变
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PD-1抗体与抗血管生成药物分别联合化疗治疗晚期驱动基因阴性肺腺癌的近远期效果对比
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作者 李丹青 张少锋 +4 位作者 张芬 焦会茹 牛立梅 杨立鑫 张钦 《川北医学院学报》 CAS 2024年第7期896-899,共4页
目的:比较程序性细胞死亡受体-1(PD-1)抗体与抗血管药物分别联合化疗治疗晚期驱动基因阴性肺腺癌的近远期效果。方法:选取118例晚期驱动基因阴性肺腺癌患者为研究对象,根据不同治疗方式将PD-1抗体联合化疗的患者纳入A组(n=60);将抗血管... 目的:比较程序性细胞死亡受体-1(PD-1)抗体与抗血管药物分别联合化疗治疗晚期驱动基因阴性肺腺癌的近远期效果。方法:选取118例晚期驱动基因阴性肺腺癌患者为研究对象,根据不同治疗方式将PD-1抗体联合化疗的患者纳入A组(n=60);将抗血管生成药物联合化疗的患者纳入B组(n=58)。观察两组患者临床近期疗效,毒副反应,免疫功能和预后分析。结果:治疗后,A组患者近期临床疗效的客观有效率(ORR)、疾病控制率(DCR)和疾病无进展期(PFS)明显高于B组(P<0.05);两组患者CD3^(+)、CD4^(+)、CD4^(+)/CD8^(+)水平均上升(P<0.05),且A组高于B组(P<0.05);CD8^(+)水平均降低,且A组低于B组(P<0.05);A组患者和B组患者治疗期间毒副反应发生率无统计学差异(P>0.05)。结论:PD-1抗体联合化疗治疗晚期驱动基因阴性肺腺癌患者临床疗效更好,有助于恢复免疫功能,且毒副反应少,具有良好的安全性,有助于延长PFS,值得临床推广应用。 展开更多
关键词 PD-1抗体 抗血管生成药物 驱动基因阴性 晚期肺腺癌
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安罗替尼联合信迪利单抗同步放化疗治疗驱动基因阴性非小细胞肺癌临床研究 被引量:1
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作者 吴春锋 蒋健 +1 位作者 朱惠平 柳燕冬 《中国药业》 2024年第3期96-100,共5页
目的探讨安罗替尼联合信迪利单抗同步放化疗一线治疗驱动基因阴性非小细胞肺癌(NSCLC)的临床疗效和安全性。方法选取苏州大学附属张家港医院2021年3月至2022年3月收治的驱动基因阴性NSCLC患者80例,按随机数字表法分为观察组和对照组,各4... 目的探讨安罗替尼联合信迪利单抗同步放化疗一线治疗驱动基因阴性非小细胞肺癌(NSCLC)的临床疗效和安全性。方法选取苏州大学附属张家港医院2021年3月至2022年3月收治的驱动基因阴性NSCLC患者80例,按随机数字表法分为观察组和对照组,各40例。对照组患者给予NP化疗方案(顺铂30 mg/m^(2)+长春瑞滨25 mg/m^(2))+肺内原发灶和区域淋巴结放射治疗,观察组患者在对照组基础上加用安罗替尼联合信迪利单抗200 mg/m^(2)(第1天)。两组患者均以21 d为1个周期,共治疗4个周期。结果观察组客观缓解率和疾病控制率分别为72.50%和85.00%,均显著高于对照组的37.50%和52.50%(P<0.05)。治疗后,两组患者血清癌胚抗原(CEA)、糖类抗原125(CA125)、细胞角质蛋白19片段抗原21-1(CYFRA21-1)水平均显著降低(P<0.05),生活质量调查核心问卷(QLQ-C30)和肺癌专用问卷(QLQ-LC13)评分均显著升高(P<0.05),且观察组均显著优于对照组(P<0.05)。观察组和对照组患者Ⅲ级及以上不良反应发生率相当(62.50%比52.50%,P>0.05)。所有患者的中位随访时间为15个月(12~24个月),失访3例。观察组中位无进展生存期(PFS)和中位总生存期(OS)分别为6.9个月和12.6个月,均显著长于对照组的4.3个月和8.9个月(Log-rankχ2=13.760,31.830,P<0.05)。结论安罗替尼联合信迪利单抗同步放化疗可提高驱动基因阴性NSCLC患者的临床疗效,改善生活质量,降低血清肿瘤标志物水平,延长生存时间,且安全性高。 展开更多
关键词 安罗替尼 信迪利单抗 非小细胞肺癌 同步放化疗 驱动基因
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浸润性肺腺癌的倍增时间与驱动基因状态的相关性
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作者 丁鲁敏 孙希文 《同济大学学报(医学版)》 2024年第2期182-188,共7页
目的比较伴或不伴基因突变的原发性肺腺癌在体积倍增时间(volume doubling time,VDT)和质量倍增时间(mass doubling time,MDT)间的差异。方法选取2019年1月—2020年12月在同济大学附属上海市肺科医院进行手术治疗且术前至少进行2次胸部... 目的比较伴或不伴基因突变的原发性肺腺癌在体积倍增时间(volume doubling time,VDT)和质量倍增时间(mass doubling time,MDT)间的差异。方法选取2019年1月—2020年12月在同济大学附属上海市肺科医院进行手术治疗且术前至少进行2次胸部非增强CT扫描的患者为研究对象。根据放射科医师手工分割的三维掩模计算VDT和MDT。采用Bland-Altman方法进行观察者内变异性评估。采用Mann-Whitney U检验比较驱动基因有无突变肿瘤的VDT和MDT差异。采用Kruskal-Wallis检验比较不同EGFR突变位点VDT和MDT的差异。结果共计279例患者(男性99例,女性280例),平均年龄(62.15±8.90)岁,共287个结节。根据驱动基因状态分为突变组72例,野生组215例,基因突变发生率为74.9%(215/287)。突变组和野生组MDT在驱动基因状态上的差异有统计学意义(537 d vs 824 d,P=0.004),VDT的差异无统计学意义(767 d vs 593 d)。EGFR阳性腺癌的MDT比EGFR阴性腺癌长,但VDT差异并不显著(VDT,758 d vs 593 d,P=0.382;MDT,824 d vs 537 d,P=0.004)。在生长结节中,驱动基因阳性腺癌的VDT和MDT均比野生型腺癌长(VDT,759 d vs 592 d,P=0.048;MDT,749 d vs 499 d,P<0.001;VDT,768 d vs 593 d,P=0.081,MDT,737 d vs 518 d,P=0.001)。结论在原发性浸润性肺腺癌中,驱动基因阳性(尤其是EGFR阳性)的肿瘤倍增时间更长,且在生长中的结节中更为显著。 展开更多
关键词 浸润性腺癌 计算机体层成像 驱动基因 倍增时间
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联合免疫检查点抑制剂治疗驱动基因阴性非小细胞肺癌脑转移的研究进展
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作者 郭丽娜(综述) 王宏伟(审校) 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期153-158,共6页
非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是肺癌中最常见的组织学类型,约66%的患者在确诊时就被发现伴有远处转移。脑转移是最常见的转移部位之一,约13%的患者在初诊时即发现颅内受累,严重影响生活质量,预后不佳。驱动基因阳性... 非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是肺癌中最常见的组织学类型,约66%的患者在确诊时就被发现伴有远处转移。脑转移是最常见的转移部位之一,约13%的患者在初诊时即发现颅内受累,严重影响生活质量,预后不佳。驱动基因阳性的NSCLC脑转移患者靶向治疗可以达到较好的颅内控制率,但驱动基因阴性的患者治疗手段较为局限。近年来,随着免疫治疗的兴起,免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)被广泛运用于临床,ICIs联合放疗的治疗模式为驱动基因阴性NSCLC脑转移患者的治疗带来了新希望。本文就放疗联合免疫治疗在敏感驱动基因阴性NSCLC脑转移患者中的临床研究进展进行综述,以期为临床治疗方案的选择提供参考。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 脑转移 驱动基因阴性 放射治疗 免疫检查点抑制剂
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基于多层网络控制的个体化癌症驱动基因识别方法
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作者 张桐 张绍武 +1 位作者 李岩 谢明宇 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1711-1726,共16页
目的识别癌症驱动基因,特别是罕见或个体特异性癌症驱动基因,对精准肿瘤学至关重要。考虑到肿瘤间的高度异质性,最近有一些方法尝试在个体水平上识别癌症驱动基因。然而,这些方法大多是将多组学数据整合到单一生物分子网络(如基因调控... 目的识别癌症驱动基因,特别是罕见或个体特异性癌症驱动基因,对精准肿瘤学至关重要。考虑到肿瘤间的高度异质性,最近有一些方法尝试在个体水平上识别癌症驱动基因。然而,这些方法大多是将多组学数据整合到单一生物分子网络(如基因调控网络或蛋白质相互作用网络)中来识别癌症驱动基因,容易忽略不同网络所特有的重要相互作用信息。为了整合不同生物分子网络的相互作用数据,促进癌症驱动基因识别,迫切需要发展一种多层网络方法。方法本文提出了一种多层网络控制方法(PDGMN),利用多层网络识别个体化癌症驱动基因。首先,利用基因表达数据构建针对个体病人的个体化多层网络,其中包括蛋白质相互作用层和基因相互关联层。然后,整合突变数据,对个体化多层网络中的节点进行加权。最后,设计了一种加权最小顶点覆盖集识别算法,找到个体化多层网络中的最优驱动节点集,以提高个体化癌症驱动基因的识别效果。结果在三个TCGA癌症数据集上的实验结果表明,PDGMN在个体化驱动基因识别方面优于其他现有方法,并能有效识别个体病人的罕见癌症驱动基因。特别是,在不同生物分子网络上的实验结果表明,PDGMN能够捕获不同生物分子网络的独有特征,从而改进癌症驱动基因的识别结果。结论PDGMN能有效识别个体化癌症驱动基因,并从多层网络的视角,加深我们对癌症驱动基因识别的理解。本文所用的源代码和数据集可以从https://github.com/NWPU-903PR/PDGMN获取。 展开更多
关键词 多层生物分子网络 多层网络控制 个体化癌症驱动基因 个体化多层网络 最小节点覆盖集
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安罗替尼联合复方斑蝥胶囊治疗不耐受化疗的驱动基因阴性晚期NSCLC合并COPD的效果
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作者 李洁 吴文峰 +2 位作者 陈卫琴 曾中华 刘云 《中国医学创新》 CAS 2024年第2期45-48,共4页
目的:探讨安罗替尼联合复方斑蝥胶囊治疗不耐受化疗的驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌(NSCLC)合并慢性阻塞性肺疾病(COPD)的效果。方法:选取2021年10月—2022年12月抚州市第一人民医院收治的48例不耐受化疗的驱动基因阴性晚期NSCLC合并COP... 目的:探讨安罗替尼联合复方斑蝥胶囊治疗不耐受化疗的驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌(NSCLC)合并慢性阻塞性肺疾病(COPD)的效果。方法:选取2021年10月—2022年12月抚州市第一人民医院收治的48例不耐受化疗的驱动基因阴性晚期NSCLC合并COPD患者,按随机数字表法分为试验组和对照组,每组24例。对照组采用复方斑蝥胶囊治疗,试验组在对照组的基础上采用安罗替尼治疗,两组均治疗2个疗程。比较两组近期疗效、细胞生长相关因子[血管内皮细胞生长因子(VEGF)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)]、肿瘤标志物[鳞状细胞癌抗原(SCCA)、癌胚抗原(CEA)、细胞角蛋白19片段(Cyfra21-1)]、生活质量及不良反应发生情况。结果:试验组疾病控制率高于对照组,治疗后VEGF、MMP-9、SCCA、CEA、Cyfra21-1水平均低于对照组,生活质量优于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);两组不良反应发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:安罗替尼联合复方斑蝥胶囊治疗不耐受化疗驱动基因阴性晚期NSCLC合并COPD患者的安全性较高,且能降低肿瘤标志物水平,改善生活质量,增强治疗效果。 展开更多
关键词 不耐受化疗 驱动基因阴性 非小细胞肺癌 慢性阻塞性肺疾病 安罗替尼 复方斑蝥胶囊
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