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CloneIRD:面向代码溯源的克隆代码继承关系判定方法
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作者 姜智文 任怡 +3 位作者 杨立明 管剑波 李宝 谭郁松 《郑州大学学报(理学版)》 CAS 北大核心 2024年第2期18-25,共8页
随着开源软件的广泛使用,代码溯源成为管理软件源代码、降低潜在风险的重要技术手段。基于代码克隆检测的大规模代码溯源分析,从其检测结果中鉴别代码克隆对之间的继承关系,对代码来源追踪、组件依赖关系分析、软件脆弱性分析以及代码... 随着开源软件的广泛使用,代码溯源成为管理软件源代码、降低潜在风险的重要技术手段。基于代码克隆检测的大规模代码溯源分析,从其检测结果中鉴别代码克隆对之间的继承关系,对代码来源追踪、组件依赖关系分析、软件脆弱性分析以及代码缺陷修复等具有重要意义。目前,已有方法在原始代码片段存在微小修改的情况下,会产生许多误判,并且检测克隆对的效率也有待提高。针对上述问题,提出了代码溯源中克隆代码继承关系的判定方法CloneIRD,包括一个基于自研快速分布式克隆检测工具FastDCF的代码溯源分析框架,以及该框架的核心算法——基于代码演化信息的克隆代码继承关系判定算法EIHR。为验证框架和算法的有效性,首先设计并实现了CloneIRD方法,并在Linux内核V4.9和V4.12的开源代码上进行了实验。实验结果表明,CloneIRD方法能够有效判定代码溯源结果中克隆对的继承关系,且基于FastDCF的溯源分析框架能够胜任大规模代码的溯源分析任务。 展开更多
关键词 代码溯源 克隆代码 克隆检测 代码继承关系
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Economical phase-covariant cloning with multiclones 被引量:1
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作者 张文海 叶柳 《Chinese Physics B》 SCIE EI CAS CSCD 2009年第9期3702-3705,共4页
This paper presents a very simple method to derive the explicit transformations of the optimal economical 1 to M phase-covariant cloning. The fidelity of clones reaches the theoretic bound [D'Ar]ano G M and Macchiave... This paper presents a very simple method to derive the explicit transformations of the optimal economical 1 to M phase-covariant cloning. The fidelity of clones reaches the theoretic bound [D'Ar]ano G M and Macchiavello C 2003 Phys. Rev. A 67 042306]. The derived transformations cover the previous contributions [Delgado Y, Lamata Let al, 2007 Phys. Rev. Lett. 98 150502] in which M must be odd. 展开更多
关键词 quantum cloning economical phase-covariant cloning
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Superovulation of the Cloned Cattle Derived from Somatic Cells and the Transfer of the Vitrified-Thawed Embryos of the Cloning Cattle
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作者 DONGYa-juan BAIXue-jin LIJian-dong CHENGMing 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2004年第12期937-942,共6页
In this experiment, it was designed to carry out superovulation on the two cloned cattles, vitrification and transfer of the embryos recovered from them. First of all, it was carried out vitrification on embryos obt... In this experiment, it was designed to carry out superovulation on the two cloned cattles, vitrification and transfer of the embryos recovered from them. First of all, it was carried out vitrification on embryos obtained by IVF. Results showed that there were no significant differences between the blastocysts (obtained by IVF) vitrified in EPS10 and these in EPS20 on the resuscitative rate and the developmental rate. The hatched rate of the blastocysts vitrified in EPS10 (31.3%, 35/112) was significantly higher than that in EPS20 (12.2%, 13/107)(P<0.01), so EPS20 was selected as the vitrification solution to freeze the embryos recovered from the cloned cattle. After superovulation, six (four usable embryos) and ten (nine usable embryos) embryos were respectively recovered from Kangkang and Shuanghuang. Two embryos were selected from the recovered embryos of each cloned cattle to freeze in EPS20, subsequently thawed and transferred into luteal ipsilateral uterine horns of 4 Holstein recipient cows after synchronization of estrus, respectively. At last, one recipient cow (No. 9908) became pregnant and delivered one healthy calf (descendant of the cloned cattle-Shuangshuang). The results of this experi- ment show that the cloned cattle as well as common cattle had better response to the exotic FSH and better ability to multiovulation, the embryos recovered from the cloned cattle can be vitrificated. 展开更多
关键词 Cloned cattle SUPEROVULATION EMBRYO VITRIFICATION
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An integrated microfluidics platform with high-throughput single-cell cloning array and concentration gradient generator for efficient cancer drug effect screening
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作者 Biao Wang Bang-Shun He +6 位作者 Xiao-Lan Ruan Jiang Zhu Rui Hu Jie Wang Ying Li Yun-Huang Yang Mai-Li Liu 《Military Medical Research》 SCIE CAS CSCD 2023年第3期325-341,共17页
Background:Tumor cell heterogeneity mediated drug resistance has been recognized as the stumbling block of cancer treatment.Elucidating the cytotoxicity of anticancer drugs at single-cell level in a high-throughput wa... Background:Tumor cell heterogeneity mediated drug resistance has been recognized as the stumbling block of cancer treatment.Elucidating the cytotoxicity of anticancer drugs at single-cell level in a high-throughput way is thus of great value for developing precision therapy.However,current techniques suffer from limitations in dynamically characterizing the responses of thousands of single cells or cell clones presented to multiple drug conditions.Methods:We developed a new microfluidics-based“SMART”platform that is Simple to operate,able to generate a Massive single-cell array and Multiplex drug concentrations,capable of keeping cells Alive,Retainable and Trackable in the microchambers.These features are achieved by integrating a Microfluidic chamber Array(4320 units)and a sixConcentration gradient generator(MAC),which enables highly efficient analysis of leukemia drug effects on single cells and cell clones in a high-throughput way.Results:A simple procedure produces 6 on-chip drug gradients to treat more than 3000 single cells or single-cell derived clones and thus allows an efficient and precise analysis of cell heterogeneity.The statistic results reveal that Imatinib(Ima)and Resveratrol(Res)combination treatment on single cells or clones is much more efficient than Ima or Res single drug treatment,indicated by the markedly reduced half maximal inhibitory concentration(IC50).Additionally,single-cell derived clones demonstrate a higher IC_(50) in each drug treatment compared to single cells.Moreover,primary cells isolated from two leukemia patients are also found with apparent heterogeneity upon drug treatment on MAC.Conclusions:This microfluidics-based“SMART”platform allows high-throughput single-cell capture and culture,dynamic drug-gradient treatment and cell response monitoring,which represents a new approach to efficiently investigate anticancer drug effects and should benefit drug discovery for leukemia and other cancers. 展开更多
关键词 MICROFLUIDICS Single-cell analysis LEUKEMIA High-throughput drug screening Single-cell cloning
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Cloning of PsMYB62 and analysis of cadmium resistant in Potentilla sericea
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作者 ZHENGHONG FENG BING GAO +1 位作者 YU GAO JIANHUI WU 《BIOCELL》 SCIE 2023年第7期1571-1582,共12页
Potentilla sericea is a heavy metal hyperaccumulator landscaping plant.MYB transcription factors play an important role in regulating plant stress response to adversity.However,there are few studies on MYB transcripti... Potentilla sericea is a heavy metal hyperaccumulator landscaping plant.MYB transcription factors play an important role in regulating plant stress response to adversity.However,there are few studies on MYB transcription factors in stress tolerance in Potentilla sericea.In this study,the PsMYB62 gene was successfully cloned from Potentilla sericea.Methods:Bioinformatic analysis and real-time quantitative PCR(qPCR)methods were used to evaluate this gene.The transgenic A.thaliana were obtained by flower dipping and the gene function was identified by determining physiological indicators under cadmium stress.Results:The open reading frame of PsMYB62 is 942 bp,which encodes 313 amino acids(aa)and belongs to the R2R3 MYB transcription factor.The plant overexpression vector PBI121-PsMYB62-GFP was constructed and successfully transferred into A.thaliana.The relative expression level of PsMYB62 was significantly increased by CdCl_(2),NaCl,ABA,and mannitol treatments.The germination rate of transgenic seeds was higher than those of wild type(WT)and empty vector(EV)under different concentrations of cadmium treatment.Upon treatment with 100μmol·L^(−1)of CdCl_(2)·2.5H_(2)O,the activities of superoxide dismutase(SOD),peroxidase(POD),and catalase(CAT)in the transgenic plants were significantly higher than those in the WT and EV.The contents of H_(2)O_(2),O_(2)·−and malondialdehyde(MDA)in transgenic lines were increased,but lower than those in WT and EV.The expression levels of AtGSH,AtPCS,and AtNAS4 that were related to the regulation of cadmium were increased,but the expression levels of transgenic lines were higher than those of WT and EV.Conclusion:The above results showed that PsMYB62 could be induced by cadmium and could improve the cadmium resistance of plants. 展开更多
关键词 Potentilla sericea MYB Cadmium stress Gene cloning Functional analysis
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Cloning and Functional Validation of Mung Bean VrPR Gene
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作者 Xiaokui Huang Yingbin Xue +3 位作者 Aaqil Khan Hanqiao Hu Naijie Feng Dianfeng Zheng 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2023年第8期2369-2382,共14页
For the purpose of functional validation,the mung bean(Vigna radiata)VrPR gene was cloned and overexpressed in Arabidopsis thaliana.Thefindings revealed that the ORF of VrPR contained 1200 bp,in which 399 amino acids w... For the purpose of functional validation,the mung bean(Vigna radiata)VrPR gene was cloned and overexpressed in Arabidopsis thaliana.Thefindings revealed that the ORF of VrPR contained 1200 bp,in which 399 amino acids were encoded.Bioinformatics analysis showed that the VrPR protein belonged to the NADB Rossmann superfamily,which was one of the non-transmembrane hydrophilic proteins.VrPR was assumed to have 44 amino acid phosphorylation sites and be contained in chloroplasts.The VrPR secondary structure comprised of random coil,αhelix,βangle,and extended chain,all of which were quite compatible with the anticipated tertiary structure.Moreover,analysis of the phylogenetic tree indicated that the soybean PR(Glyma.12G222200)and VrPR were closely related.Furthermore,chlorophyll content in leaves is markedly increased in Arabidopsis when VrPR is overexpressed.Ourfindings will serve as a reference for more functional studies on the PR genes in mung bean. 展开更多
关键词 Mung bean gene cloning VrPR transgenic arabidopsis functional verification
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Cloning and Bioinformatics Analysis of vscB Gene of T3SS Chaperone of Vibrio alginolyticus
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作者 Hongwei ZHENG Liangchuan CHEN +5 位作者 Haiyun FENG Yunsheng CHANG Yu DING Weijie ZHANG Huanying PANG Na WANG 《Asian Agricultural Research》 2023年第4期37-39,46,共4页
[Objectives]To clone and analyze the vscB gene of Vibrio alginolyticus HY9901 by bioinformatics.[Methods]A pair of specific primers were designed according to the vscB gene sequence of Vibrio alginolyticus HY9901.The ... [Objectives]To clone and analyze the vscB gene of Vibrio alginolyticus HY9901 by bioinformatics.[Methods]A pair of specific primers were designed according to the vscB gene sequence of Vibrio alginolyticus HY9901.The full length of the primers was cloned by PCR and analyzed by bioinformatics.[Results]The vscB gene was 429 bp long,encoding 142 amino acids,with a theoretical molecular weight of 16.4 kDa and a pI value of 5.48.Amino acid sequence analysis of VscB showed that VscB was not a secretory protein,without signal peptide and transmembrane region,and there were protein kinase C phosphorylation site and casein kinase II phosphorylation site in the sequence.Homologous comparison of amino acid sequences showed that VscB of V.alginolyticus had the highest protein similarity with Vibrio Parahaemolyticus,reaching 91%.Phylogenetic tree analysis showed that the corresponding proteins of V.alginolyticus VscB,Vibrio Parahaemolyticus and Vibrio diabolicus were clustered in the same subfamily.Functional domain analysis showed that it had CesT family domain.Tertiary structure prediction showed that there were 3α-helices and 5β-turns in VscB protein.[Conclusions]This study provided a theoretical basis for further study on the function of chaperone of V.alginolyticus. 展开更多
关键词 Vibrio alginolyticus Gene cloning vscB Bioinformatics analysis
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The Clones’Struggle for Happiness under the Doomed Fate in Never Let Me Go
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作者 WANG Xue-juan 《Journal of Literature and Art Studies》 2023年第10期769-774,共6页
Japanese British writer Kazuo Ishiguro is one of the leading writers in contemporary British literature.He has always been committed to creating works with universal significance.Responsibility and destiny are themes ... Japanese British writer Kazuo Ishiguro is one of the leading writers in contemporary British literature.He has always been committed to creating works with universal significance.Responsibility and destiny are themes that run through his works.His novel Never Let Me Go tells a story of a group of clones growing up in the Hailsham,who are given the mission to donate organs at birth.So,there is no doubt that they will inevitably end their lives in the process of donating organs to human beings again and again.The tragic life of clones is determined by the motivation of human to create them. 展开更多
关键词 Kazuo Ishiguro Never Let Me Go clones FATE
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An Analysis on the Role Identification of Clones in Never Let Me Go
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作者 PENG Si-yu 《Journal of Literature and Art Studies》 2023年第12期946-953,共8页
With the guidance of Erikson’s identity theory,the article analyzes the clones’identity exploration through role identification in Never Let Me Go.It interprets the clones’puzzlement about their identity,and the pr... With the guidance of Erikson’s identity theory,the article analyzes the clones’identity exploration through role identification in Never Let Me Go.It interprets the clones’puzzlement about their identity,and the process of their identity quest as well as role identification.Through the specific analysis,it is concluded that the clones,represented by Kathy,Tommy and Ruth,have gained self-certainty and social identity by realizing the role identity as a“carer”and a“donor”,in the meantime,they have constructed their identity as social persons with souls like ordinary people.Furthermore,the findings shows that Never Let Me Go is actually a microcosm of human’s quest for identity.Ishiguro aims to express his meditation on human life in the novel:human life is a process of seeking self-identity and social roles,and then fulfilling the obligations of the roles,which confirms Ishiguro’s internationalism that he attempts to convey his contemplation on human existence through his works. 展开更多
关键词 Kazuo Ishiguro Never Let Me Go CLONES identity confusion role identity
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洋葱AcSCL4的克隆及其功能分析
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作者 张旭 吴小旭 +3 位作者 张智慧 胡云捷 秦蕾 王勇 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2024年第2期127-134,共8页
【目的】初步探讨AcSCL4在洋葱成花中的功能,为解析洋葱成花分子调控机制提供理论基础。【方法】以长日生态型洋葱品系SB2为试验材料,根据已有的洋葱转录组数据,通过qRT-PCR筛选目的基因AcSCL4后进行基因克隆,并对其进行生物信息学分析... 【目的】初步探讨AcSCL4在洋葱成花中的功能,为解析洋葱成花分子调控机制提供理论基础。【方法】以长日生态型洋葱品系SB2为试验材料,根据已有的洋葱转录组数据,通过qRT-PCR筛选目的基因AcSCL4后进行基因克隆,并对其进行生物信息学分析;构建AcSCL4基因的过表达载体pB221-3300-AcSCL4并转化农杆菌,采用花序浸染法浸染拟南芥,并对T_(3)代纯系转基因植株进行表型分析和开花相关基因表达量分析。【结果】洋葱AcSCL4基因CDS长1515 bp,编码504个氨基酸;AcSCL4蛋白N端高度变异,C端有GRAS结构域。聚类分析发现,AcSCL4与石刁柏和棉花的SCL4蛋白亲缘关系较近。与野生型拟南芥相比,AcSCL4过表达植株表现晚花表型。荧光定量PCR结果表明,与野生型拟南芥相比,AcSCL4过表达植株开花调控基因CO和FT的表达量极显著下降。【结论】AcSCL4通过调控CO及FT基因表达来抑制洋葱开花。 展开更多
关键词 洋葱 AcSCL4 基因克隆 开花调控
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康乃馨抗尖孢镰刀菌无性系诱变技术
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作者 王丽花 蒋亚莲 +5 位作者 许凤 杨秀梅 黄望启 苏艳 张丽芳 张艺萍 《山西农业科学》 2024年第3期94-101,共8页
枯萎病是康乃馨鲜切花种植过程中较为严重的真菌病害之一,该病的病原菌是尖孢镰刀菌康乃馨专化型(Fusarium oxysporum f.sp.dianthi),培育和合理种植抗病品种是防控康乃馨枯萎病最有效的方法之一。应用植物体细胞无性系变异及真菌毒素... 枯萎病是康乃馨鲜切花种植过程中较为严重的真菌病害之一,该病的病原菌是尖孢镰刀菌康乃馨专化型(Fusarium oxysporum f.sp.dianthi),培育和合理种植抗病品种是防控康乃馨枯萎病最有效的方法之一。应用植物体细胞无性系变异及真菌毒素加压筛选技术,可以定向培育康乃馨抗病育种材料并加快抗病品种选育速度,为康乃馨抗病育种提供新的思路。为获得抗枯萎病的康乃馨育种中间材料,以感枯萎病的康乃馨多花品种紫蝴蝶组培苗为试验材料,诱导愈伤组织并进行悬浮培养建立悬浮培养系,再用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变后添加尖孢镰刀菌毒素粗提液筛选抗病细胞系。结果表明,诱导愈伤组织最适宜的培养基是Murashig-Skoog培养基+麦草畏1.0 mg/L;筛选出EMS最佳处理组合为0.4%处理4 h;在80.0%的粗毒素培养基上培养10 d是康乃馨抗尖孢镰刀菌无性系筛选较适宜的选择压;诱导康乃馨再生植株较好的激素组合是苄氨基腺嘌呤(BA)0.5 mg/L+噻苯隆(TDZ) 0.1 mg/L+萘乙酸(NAA)0.1 mg/L;经人工接种尖孢镰刀菌进行抗病性鉴定后发现,紫蝴蝶抗病无性系的病情指数为45,为中抗水平。 展开更多
关键词 康乃馨 尖孢镰刀菌 诱变 毒素 无性系
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杨树无性系表型性状及ISSR分子标记遗传多样性分析
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作者 杨艳 李永进 +5 位作者 黎蕾 吴毅 杨柳 田野 唐洁 汤玉喜 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期138-147,共10页
【目的】综合表型性状及分子标记多样性分析探明供试的62个杨树无性系的遗传多样性,为杨树进一步遗传改良奠定基础。【方法】选取地径、苗高、叶面积、叶长、叶宽、叶柄长、叶绿素、侧枝数、叶厚、单株总叶片、叶片干质量、叶片含水率... 【目的】综合表型性状及分子标记多样性分析探明供试的62个杨树无性系的遗传多样性,为杨树进一步遗传改良奠定基础。【方法】选取地径、苗高、叶面积、叶长、叶宽、叶柄长、叶绿素、侧枝数、叶厚、单株总叶片、叶片干质量、叶片含水率等12个表型性状和ISSR分子标记对杨树无性系个体间进行遗传多样性分析,利用PopGen 32、SPSS 16.0及NTsys 2.10e等软件分别计算多样性指数、进行表型性状间的方差分析以及对各无性系进行UPGMA法聚类分析。【结果】侧枝数、单株叶片数、叶片干质量、叶面积以及地径的变异系数均达到了10%以上,叶柄长、叶长、苗高的变异系数也达到了8%以上的水平。利用5条ISSR引物检测到62份杨树无性系多态性谱带百分率平均为89.04%,基因多样度平均为0.4074,Shannon多样性指数(I)平均为0.5304。采用UPGMA法构建的形态和分子标记聚类图将供试材料聚成的类群均有家系内聚为一类的趋势,但也存在较大的差异;表型性状聚类分析主要是根据叶片的相关性状相似度越高的被聚为一个类群;分子标记聚类主要呈现出亲缘关系越近的无性系越容易聚为一个类群的聚类规律。【结论】供试的杨树无性系间表型性状分化程度高,具有丰富的遗传多样性,研究结果为杨树种质资源的改良、种质创新及多元化开发利用提供科学依据。 展开更多
关键词 杨树无性系 表型性状 ISSR 遗传多样性 聚类分析
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番木瓜环斑病毒甜瓜分离物的基因组及其侵染性克隆
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作者 刘莉铭 彭斌 +3 位作者 康保珊 吴会杰 刘茜 古勤生 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第2期8-14,共7页
番木瓜环斑病毒(papaya ringspot virus,PRSV)是瓜类作物主要病毒之一,分析了甜瓜分离物HaNHK10的基因组序列和分子变异,构建了具有侵染性的全长cDNA克隆。结果显示,HaNHK10分离物基因组全长为10332 nt,与其他分离物的核苷酸和氨基酸序... 番木瓜环斑病毒(papaya ringspot virus,PRSV)是瓜类作物主要病毒之一,分析了甜瓜分离物HaNHK10的基因组序列和分子变异,构建了具有侵染性的全长cDNA克隆。结果显示,HaNHK10分离物基因组全长为10332 nt,与其他分离物的核苷酸和氨基酸序列一致性分别为74.60%~97.80%和85.30%~98.50%。基于全基因组序列的系统进化分析显示,HaNHK10与来自中国的所有分离物均聚集于II组中,并与中国山东的西葫芦分离物PRSV-SD亲缘关系最近。接种试验显示,HaNHK10分离物的全长cDNA克隆具有侵染性,它能系统侵染甜瓜、黄瓜、西瓜、南瓜、西葫芦和瓠瓜6种作物,经接种产生的病毒后代也能够通过摩擦接种侵染植株。 展开更多
关键词 番木瓜环斑病毒 甜瓜分离物 基因组 侵染性克隆
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大肠杆菌多酚氧化酶的分子克隆及异源高效表达
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作者 邓卉 余丹 +6 位作者 邹成义 范景胜 李斌 屈东 倪青松 郑钰嘉 陈瑾 《中国饲料》 北大核心 2024年第5期26-31,共6页
菜籽粕、棉籽粕等非粮饲料资源存在的酚类化合物芥子碱、棉酚等抗营养因子,严重影响了其饲喂价值。本课题组筛选出的一株大肠杆菌属芥子碱降解菌SDB2已被证实能通过分泌多酚氧化酶来降解芥子碱和棉酚,本试验旨在运用基因工程技术克隆SDB... 菜籽粕、棉籽粕等非粮饲料资源存在的酚类化合物芥子碱、棉酚等抗营养因子,严重影响了其饲喂价值。本课题组筛选出的一株大肠杆菌属芥子碱降解菌SDB2已被证实能通过分泌多酚氧化酶来降解芥子碱和棉酚,本试验旨在运用基因工程技术克隆SDB2多酚氧化酶基因,实现其高效表达,为SDB2多酚氧化酶在饲料工业上的规模化应用奠定基础。从大肠杆菌SDB2中克隆出多酚氧化酶基因,将其与质粒pET28a连接后转化至大肠杆菌BL21感受态细胞中培养,通过PCR鉴定及质粒酶切验证方法构建重组菌株,同时对重组克隆基因进行生物信息学分析。采用“2×2”交叉试验设计,以温度和诱导剂IPTG浓度两个影响因素诱导SDB2多酚氧化酶基因在重组菌株中高效表达,经SDS-PAGE和WB双重验证后,确立最佳诱导条件,最终纯化出目标酶蛋白。结果表明:(1)成功克隆SDB2多酚氧化酶基因,构建出异源表达重组菌株。(2)克隆出的SDB2重组多酚氧化酶基因含目标核苷酸741个,总编码氨基酸263个(含标签氨基酸20个),氨基酸组成的蛋白相对分子质量为28499.0,理论等电点为6.94,据此预测出SDB2重组多酚氧化酶三维结构模型。(3)确立SDB2多酚氧化酶异源高效表达的最佳诱导条件为温度37℃,IPTG浓度1 mmol,该条件下表达出大量可溶性酶蛋白,有利于工业化生产。本试验条件下,大肠杆菌SDB2多酚氧化酶成功实现了分子克隆及异源高效表达,为我国非粮饲料资源实现高效利用提供了技术参考。 展开更多
关键词 大肠杆菌 多酚氧化酶 克隆 高效表达
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吡虫啉胁迫对红光熊蜂抗氧化酶系与解毒酶系的影响
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作者 王丹丹 王星 +1 位作者 张晓婉 刘丹梅 《东北师大学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第1期125-132,共8页
为探究亚致死剂量吡虫啉胁迫对红光熊蜂工蜂的存活率、解毒酶活力与解毒基因表达量的影响,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)克隆红光熊蜂工蜂(21日龄)解毒基因,检测其表达量变化与抗氧化酶的活性,并通过饲喂外源褪黑素以提高熊蜂的抗药性... 为探究亚致死剂量吡虫啉胁迫对红光熊蜂工蜂的存活率、解毒酶活力与解毒基因表达量的影响,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)克隆红光熊蜂工蜂(21日龄)解毒基因,检测其表达量变化与抗氧化酶的活性,并通过饲喂外源褪黑素以提高熊蜂的抗药性.结果表明:随着胁迫时间的延长,吡虫啉处理组(IMI组)存活率显著下降,但始终低于吡虫啉+褪黑素处理组(IMI+MT组);IMI组4种抗氧化酶的活性均随吡虫啉胁迫时间的延长呈先上升后下降的趋势,始终低于IMI+MT组;IMI组8种解毒基因的表达量除AChE,DDTase和GLD基因外,其余表达量均随吡虫啉胁迫时间的延长呈先激活后抑制的状态,且明显高于对照组(CK组)而低于IMI+MT组;IMI组DDTase基因的表达量与CK组差异不明显,但始终低于IMI+MT组,说明吡虫啉对DDTase的作用不明显,而褪黑素诱导DDTase表达效果较显著(P<0.05);IMI组AChE和GLD基因的表达量均低于CK组,随吡虫啉胁迫时间的延长而呈下降趋势,但IMI+MT组二者的表达量始终高于IMI组.短期亚致死剂量吡虫啉胁迫对红光熊蜂影响不显著,长期胁迫则影响其存活率,红光熊蜂对吡虫啉的代谢解毒是一个多酶系、多基因协同参与的理化过程,褪黑素可提高红光熊蜂的抗药性. 展开更多
关键词 红光熊蜂 吡虫啉 抗氧化酶 解毒酶 克隆 基因表达
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我国斯里兰卡木薯花叶病毒的分子特征及致病性分析
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作者 王国芬 李超萍 +5 位作者 时涛 吴会杰 蔡吉苗 李博勋 陆翠梅 黄贵修 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期187-196,共10页
为进一步探究我国斯里兰卡木薯花叶病毒(Sri Lankan cassava mosaic virus,SLCMV)的分子特征及致病性。以感染SLCMV的木薯叶片基因组DNA为模板,PCR扩增获得DNA-A和DNA-B基因组全长,通过生物信息软件分析比较其核酸及氨基酸序列特征;构... 为进一步探究我国斯里兰卡木薯花叶病毒(Sri Lankan cassava mosaic virus,SLCMV)的分子特征及致病性。以感染SLCMV的木薯叶片基因组DNA为模板,PCR扩增获得DNA-A和DNA-B基因组全长,通过生物信息软件分析比较其核酸及氨基酸序列特征;构建了强、弱致病力分离物(SLCMV-Colombo和SLCMV-DG1922)的侵染性克隆,分别将2种致病力分离物的DNA-A和DNA-B组分进行重组,接种烟草(Nicotianatabacum),比较2种分离物的致病性差异。结果显示:我国SLCMV为“旧世界”双组份菜豆花叶病毒,编码包括AV2基因在内的8个开放阅读框(ORFs);具有双生病毒典型的共同序列(CR)、重复序列、TATABox和TAATATT↓AC茎环结构,Rep蛋白羧基末端有7个氨基酸缺失;我国SLCMV的基因组、编码和非编码区与柬埔寨、泰国和越南分离物的相似性在97.0%~100.0%之间,与印度和斯里兰卡早期的分离物相似性为86.5%~98.6%,DNA-B组份与印度木薯花叶病毒株系(ICMV)编码区序列相似性为95.0%~97.6%,与其他9个非洲木薯花叶病毒株系序列之间的序列相似性均低于80.0%。侵染性克隆接种结果证实,强致病力分离物SLCMV-Col的DNA-A(Col-A)组份在烟草叶片表现典型花叶症状中起主要作用,而我国分离物的DNA-B(DG1922-B)能协同Col-A对烟草产生强致病性。本研究分析了我国SLCMV的全基因组结构,建立的侵染性克隆及其技术为进一步解析SLCMV致病性机理提供重要的研究基础。 展开更多
关键词 斯里兰卡木薯花叶病毒 分子特征 侵染性克隆 致病性
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灰毡毛忍冬bZIP25基因的克隆及其表达模式分析
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作者 王珊 曾娟 +6 位作者 谢瑜 周日宝 刘湘丹 童巧珍 龙雨青 陈言 刘小丽 《中南药学》 CAS 2024年第2期335-340,共6页
目的克隆灰毡毛忍冬bZIP25基因序列全长,并进行生信分析及表达模式分析,以初步探索其在灰毡毛忍冬中的生物学功能。方法通过逆转录PCR技术克隆bZIP25基因的序列全长,采用生物信息学分析方法对bZIP25及其编码的蛋白进行分析。运用实时荧... 目的克隆灰毡毛忍冬bZIP25基因序列全长,并进行生信分析及表达模式分析,以初步探索其在灰毡毛忍冬中的生物学功能。方法通过逆转录PCR技术克隆bZIP25基因的序列全长,采用生物信息学分析方法对bZIP25及其编码的蛋白进行分析。运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术测定其在茎、叶及七个花期花中的表达水平。结果克隆得到LmbZIP25基因(OR551766),其编码191个氨基酸,具有典型的bZIP家族结构,在bZIP结构域中与其他植物同源性较高。LmbZIP25基因具有组织特异性,在茎中的表达量显著高于花和叶,在七个花期中黄色花蕾期的表达量最高。结论克隆得到LmbZIP25基因全长,分析其在不同器官和不同花期的表达差异,为进一步探索其在灰毡毛忍冬中花发育中的功能奠定了研究基础。 展开更多
关键词 灰毡毛忍冬 bZIP25 基因克隆 生物信息学分析 表达模式分析
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锑胁迫对楸树无性系叶片解剖结构的影响
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作者 刘振华 邹武 +6 位作者 汪丽 林峰 张鹏 钟青山 李贵 陈瑞 王涛 《湖南林业科技》 2024年第2期1-9,共9页
以10个楸树无性系为研究对象,采用室内盆栽的方法,共设置4种浓度的锑胁迫处理,各处理锑元素含量分别为0、600、1200、2000 mg·kg^(-1);以石蜡切片方法观测叶片的解剖结构,探讨锑胁迫对楸树叶片解剖结构的影响。结果表明:除2-8、1-1... 以10个楸树无性系为研究对象,采用室内盆栽的方法,共设置4种浓度的锑胁迫处理,各处理锑元素含量分别为0、600、1200、2000 mg·kg^(-1);以石蜡切片方法观测叶片的解剖结构,探讨锑胁迫对楸树叶片解剖结构的影响。结果表明:除2-8、1-1号2个楸树无性系在2000 mg·kg^(-1)锑胁迫下其叶片中锑含量均下降外,10个楸树无性系在0~2000 mg·kg^(-1)锑胁迫下其叶片中锑含量均随着锑胁迫浓度的增加而增加。在不同浓度的锑胁迫下,5-8、0号2个无性系的叶片厚度均没有显著差异,其余无性系的叶片厚度表现出不同的差异性;随着锑胁迫浓度的增加,不同楸树无性系的叶片厚度表现出不同的变化规律。随着锑胁迫浓度的增加,10个楸树无性系的叶片上表皮厚度和下表皮厚度总体呈现先升高后下降的变化规律。在不同浓度锑胁迫下,10个楸树无性系的叶片组织结构存在一定差异;在600~2000 mg·kg^(-1)锑胁迫下,各楸树无性系平均栅海比排序为5-8号的(0.99)>1号的(0.91)=2-8号的(0.91)>0号的(0.90)>5-2号的(0.89)>8402号的(0.88)=72号的(0.88)>1-1号的(0.86)=20-01号的(0.86)>63号的(0.71)。0~2000 mg·kg^(-1)锑胁迫对楸树无性系叶片结构无明显破坏,楸树对锑具有一定的耐受性。 展开更多
关键词 锑胁迫 楸树 无性系 解剖结构
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表达IFN-α的重组猪繁殖与呼吸综合病毒的构建及生物学特性分析
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作者 黄静 王玉旭 +5 位作者 王豪 陈樱 欧阳康 黄伟坚 黄稳妃 韦祖樟 《动物医学进展》 北大核心 2024年第3期48-53,共6页
猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)是危害我国生猪业的重要疫病之一,其病原是猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),是一种免疫抑制性病毒。干扰素(IFN)是一类具有免疫调节功能和抗病毒作用的细胞因子。IFN-α除更直接的抗病毒作用外,还可以调节宿主... 猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)是危害我国生猪业的重要疫病之一,其病原是猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),是一种免疫抑制性病毒。干扰素(IFN)是一类具有免疫调节功能和抗病毒作用的细胞因子。IFN-α除更直接的抗病毒作用外,还可以调节宿主的先天性和适应性免疫。论文构建表达IFN-α的重组PRRSV,分析重组病毒的生物学特性以及IFN-α的生物学活性。通过反向遗传操作方法将IFN-α插入到PRRSV ORF1b和ORF2a之间,重组质粒转染细胞后可以拯救出重组病毒(rGXAM-P-IFN-α)。插入到PRRSV基因组中的IFN-α可遗传稳定9代。重组病毒生长特性分析可发现rGXAM-P-IFN-α复制能力显著低于亲本病毒。rGXAM-P-IFN-α感染猪肺泡巨噬细胞(PAM)可显著上调抗病毒基因(PKR,ISG15和ISG54)mRNA表达水平,为进一步研发新型PRRSV疫苗提供参考。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 感染性克隆 Α干扰素 抗病毒基因
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大白菜BrCYP83B1基因的克隆及表达分析
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作者 王玉书 赵琳琳 +5 位作者 赵爽 胡琦 白慧霞 王欢 曹业萍 范震宇 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期152-160,共9页
【目的】细胞色素P450家族是十字花科植物硫苷合成重要的酶系,其中CYP83亚家族主要参与核心结构的合成,旨在探究大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)CYP83B1基因的功能。【方法】利用RT-PCR技术克隆BrCYP83B1基因,通过生物信息学软件... 【目的】细胞色素P450家族是十字花科植物硫苷合成重要的酶系,其中CYP83亚家族主要参与核心结构的合成,旨在探究大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)CYP83B1基因的功能。【方法】利用RT-PCR技术克隆BrCYP83B1基因,通过生物信息学软件分析其编码蛋白理化性质、同源性及启动子顺式作用元件,利用RT-qPCR技术分析BrCYP83B1的表达模式,并构建其植物超表达载体。【结果】BrCYP83B1 cDNA序列全长为1500 bp,编码499个氨基酸,编码蛋白属于细胞色素P450超家族,主要定位于细胞质,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,与甘蓝型油菜、青花菜的CYP83B1蛋白具有较高的同源性。启动子分析表明,该基因启动子区域包含水杨酸、脱落酸及茉莉酸甲酯等激素响应的顺式作用元件,说明BrCYP83B1基因表达可能受激素调控。RT-qPCR分析结果表明,BrCYP83B1基因在大白菜的根、茎、叶、花和果中均有表达,且以叶中的表达量最高;茉莉酸甲酯够显著促进该基因的表达,而水杨酸处理对其表达具有一定的抑制作用,脱落酸处理下基因先上调后又下调。【结论】BrCYP83B1可能参与大白菜对激素的响应调控。 展开更多
关键词 大白菜 BrCYP83B1 基因克隆 植物激素 表达分析 超表达载体
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