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Low testing rates and high BRCA prevalence: Poly (ADP-ribose) polymerase inhibitor use in Middle East BRCA/homologous recombination deficiency-positive cancer patients
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作者 Naveed Syed Ashish Vittalrao Chintakuntlawar +6 位作者 Deepti Vilasini Aisha Mohamed Al Salami Riad Al Hasan Imrana Afrooz Kanishka Uttam Chandani Ashok Uttam Chandani Aref Chehal 《World Journal of Clinical Oncology》 2024年第7期848-858,共11页
BACKGROUND Poly(ADP-ribose)polymerase inhibitors(PARPis)are approved as first-line therapies for breast cancer gene(BRCA)-positive,human epidermal growth factor receptor 2-negative locally advanced or metastatic breas... BACKGROUND Poly(ADP-ribose)polymerase inhibitors(PARPis)are approved as first-line therapies for breast cancer gene(BRCA)-positive,human epidermal growth factor receptor 2-negative locally advanced or metastatic breast cancer.They are also effective for new and recurrent ovarian cancers that are BRCA-or homologous recombination deficiency(HRD)-positive.However,data on these mutations and PARPi use in the Middle East are limited.AIM To assess BRCA/HRD prevalence and PARPi use in patients in the Middle East with breast/ovarian cancer.METHODS This was a single-center retrospective study of 57 of 472 breast cancer patients tested for BRCA mutations,and 25 of 65 ovarian cancer patients tested for HRD.These adult patients participated in at least four visits to the oncology service at our center between August 2021 and May 2023.Data were summarized using descriptive statistics and compared using counts and percentages.Response to treatment was assessed using Response Evaluation Criteria in Solid Tumors criteria.RESULTS Among the 472 breast cancer patients,12.1%underwent BRCA testing,and 38.5%of 65 ovarian cancer patients received HRD testing.Pathogenic mutations were found in 25.6%of the tested patients:26.3%breast cancers had germline BRCA(gBRCA)mutations and 24.0%ovarian cancers showed HRD.Notably,40.0%of gBRCA-positive breast cancers and 66.0%of HRD-positive ovarian cancers were Middle Eastern and Asian patients,respectively.PARPi treatment was used in 5(33.3%)gBRCA-positive breast cancer patients as first-line therapy(n=1;7-months progression-free),for maintenance(n=2;>15-months progression-free),or at later stages due to compliance issues(n=2).Four patients(66.6%)with HRD-positive ovarian cancer received PARPi and all remained progression-free.CONCLUSION Lower testing rates but higher BRCA mutations in breast cancer were found.Ethnicity reflected United Arab Emirates demographics,with breast cancer in Middle Eastern and ovarian cancer in Asian patients. 展开更多
关键词 Homologous recombination repair BRCA1 BRCA2 Homologous recombination deficiency Ovarian cancer Breast cancer Poly(ADP-ribose)polymerase inhibitors OLAPARIB DNA double-strand breaks
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Homologous recombination in DNA repair and DNA damage tolerance 被引量:30
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作者 Xuan Li Wolf-Dietrich Heyer 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2008年第1期99-113,共15页
Homologous recombination (HR) comprises a series of interrelated pathways that function in the repair of DNA double-stranded breaks (DSBs) and interstrand crosslinks (ICLs). In addition, recombination provides c... Homologous recombination (HR) comprises a series of interrelated pathways that function in the repair of DNA double-stranded breaks (DSBs) and interstrand crosslinks (ICLs). In addition, recombination provides critical support for DNA replication in the recovery of stalled or broken replication forks, contributing to tolerance of DNA damage. A central core of proteins, most critically the RecA homolog Rad51, catalyzes the key reactions that typify HR: homology search and DNA strand invasion. The diverse functions of recombination are reflected in the need for context-specific factors that perform supplemental functions in conjunction with the core proteins. The inability to properly repair complex DNA damage and resolve DNA replication stress leads to genomic instability and contributes to cancer etiology. Mutations in the BRCA2 recombination gene cause predisposition to breast and ovarian cancer as well as Fanconi anemia, a cancer predisposition syndrome characterized by a defect in the repair of DNA interstrand crosslinks. The cellular functions of recombination are also germane to DNA-based treatment modalities of cancer, which target replicating cells by the direct or indirect induction of DNA lesions that are substrates for recombination pathways. This review focuses on mechanistic aspects of HR relating to DSB and ICL repair as well as replication fork support. 展开更多
关键词 DNA repair double-strand breaks genome stability homologous recombination interstrand crosslinks stalled replication forks
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BLM helicase inhibition synergizes with PARP inhibition to improve the radiosensitivity of olaparib resistant non-small cell lung cancer cells by inhibiting homologous recombination repair 被引量:2
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作者 Yangyang Kong Chang Xu +11 位作者 Xiaohui Sun Hao Sun Xiaotong Zhao Ningning He Kaihua Ji Qin Wang Liqing Du Jinhan Wang Manman Zhang Yang Liu Yan Wang Qiang Liu 《Cancer Biology & Medicine》 SCIE CAS CSCD 2022年第8期1150-1171,共22页
Objective:We aimed to investigate the radiosensitizing efficacy of the poly-ADP-ribose polymerase(PARP)inhibitor,olaparib,and the Bloom syndrome protein(BLM)helicase inhibitor,ML216,in non-small cell lung cancer(NSCLC... Objective:We aimed to investigate the radiosensitizing efficacy of the poly-ADP-ribose polymerase(PARP)inhibitor,olaparib,and the Bloom syndrome protein(BLM)helicase inhibitor,ML216,in non-small cell lung cancer(NSCLC)cells.Methods:Radiosensitization of NSCLC cells was assessed by colony formation and tumor growth assays.Mechanistically,the effects of ML216,olaparib,and radiation on cell and tumor proliferation,DNA damage,cell cycle,apoptosis,homologous recombination(HR)repair,and non-homologous end joining(NHEJ)repair activity were determined.Results:Both olaparib and ML216 enhanced the radiosensitivities of olaparib-sensitive H460 and H1299 cells,which was seen as decreased surviving fractions and Rad51 foci,increased total DNA damage,andγH2AX and 53BP1 foci(P<0.05).The expressions of HR repair proteins were remarkably decreased in olaparib-treated H460 and H1299 cells after irradiation(P<0.05),while olaparib combined with ML216 exerted a synergistic radiosensitization effect on olaparib-resistant A549 cells.In addition to increases of double strand break(DSB)damage and decreases of Rad51 foci,olaparib combined with ML216 also increased pDNA-PKcs(S2056)foci,abrogated G2 cell cycle arrest,and induced apoptosis in A549 lung cancer after irradiation in vitro and in vivo(P<0.05).Moreover,Western blot showed that olaparib combined with ML216 and irradiation inhibited HR repair,promoted NHEJ repair,and inactivated cell cycle checkpoint signals both in vitro and in vivo(P<0.05).Conclusions:Taken together,these results showed the efficacy of PARP and BLM helicase inhibitors for radiosensitizing NSCLC cells,and supported the model that BLM inhibition sensitizes cells to PARP inhibitor-mediated radiosensitization,as well as providing the basis for the potential clinical development of this combination for tumors intrinsically resistant to PARP inhibitors and radiotherapy. 展开更多
关键词 NSCLC PARP BLM RADIOSENSITIZATION homologous recombination repair
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Maternal gene Ooep may participate in homologous recombination-mediated DNA double-strand break repair in mouse oocytes 被引量:1
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作者 Da-Jian He Lin Wang +5 位作者 Zhi-Bi Zhang Kun Guo Jing-Zheng Li Xie-Chao He Qing-Hua Cui Ping Zheng 《Zoological Research》 SCIE CAS CSCD 2018年第6期387-395,共9页
DNA damage in oocytes can cause infertility and birth defects. DNA double-strand breaks (DSBs) are highly deleterious and can substantially impair genome integrity. Homologous recombination (HR)-mediated DNA DSB r... DNA damage in oocytes can cause infertility and birth defects. DNA double-strand breaks (DSBs) are highly deleterious and can substantially impair genome integrity. Homologous recombination (HR)-mediated DNA DSB repair plays dominant roles in safeguarding oocyte quantity and quality. However, little is known regarding the key players of the HR repair pathway in oocytes. Here, we identified oocyte-specific gene Ooep as a novel key component of the HR repair pathway in mouse oocytes. OOEP was required for efficient ataxia telangiectasia mutated (ATM) kinase activation and Rad51 recombinase (RAD51) focal accumulation at DNA DSBs. Ooep null oocytes were defective in DNA DSB repair and prone to apoptosis upon exogenous DNA damage insults. Moreover, Ooep null oocytes exhibited delayed meiotic maturation. Therefore, OOEP played roles in preserving oocyte quantity and quality by maintaining genome stability. Ooep expression decreased with the advance of maternal age, suggesting its involvement in maternal aging. 展开更多
关键词 Ooep Homologous recombination DNA double-strand break repair ATM RAD51
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The Role of DNA Mismatch Repair and Recombination in the Processing of DNA Alkylating Damage in Living Yeast Cells 被引量:1
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作者 Hernan Flores-Rozas Lahcen Jaafar Ling Xia 《Advances in Bioscience and Biotechnology》 2015年第6期408-418,共11页
It is proposed that mismatch repair (MMR) mediates the cytotoxic effects of DNA damaging agents by exerting a futile repair pathway which leads to double strand breaks (DSBs). Previous reports indicate that the sensit... It is proposed that mismatch repair (MMR) mediates the cytotoxic effects of DNA damaging agents by exerting a futile repair pathway which leads to double strand breaks (DSBs). Previous reports indicate that the sensitivity of cells defective in homologous recombination (HR) to DNA alkylation is reduced by defects in MMR genes. We have assessed the contribution of different MMR genes to the processing of alkylation damage in vivo. We have directly visualized recombination complexes formed upon DNA damage using fluorescent protein (FP) fusions. We find that msh6 mutants are more resistant than wild type cells to MNNG, and that an msh6 mutation rescues the sensitivity of rad52 strains more efficiently than an msh3 mutation. Analysis of RAD52-GFP tagged strains indicate that MNNG increases repair foci formation, and that the inactivation of the MHS2 and MSH6 genes but not the MSH3 gene result in a reduction of the number of foci formed. In addition, in the absence of HR, NHEJ could process the MNNG-induced DSBs as indicated by the formation of NHEJ-GFP tagged foci. These data suggest that processing of the alkylation damage by MMR, mainly by MSH2-MSH6, is required for recruitment of recombination proteins to the damage site for repair. 展开更多
关键词 DNA MISMATCH repair recombination DNA DAMAGE Non-Homologous End Joining
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重组贻贝粘蛋白在点阵CO_(2)激光治疗面部痤疮萎缩性瘢痕术后创面修复中的应用研究 被引量:1
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作者 陈日新 裴理皓 +1 位作者 许丛丛 司佳薇 《中国美容医学》 CAS 2024年第7期11-14,共4页
目的:探究重组贻贝粘蛋白水凝胶敷料(Recombined mussel adhesive protein hydrogel dressing,Rmaphd)在点阵CO_(2)激光治疗面部痤疮萎缩性瘢痕术后创面修复中的应用效果。方法:选择2022年6月-2023年2月面部痤疮萎缩性瘢痕患者117例,分... 目的:探究重组贻贝粘蛋白水凝胶敷料(Recombined mussel adhesive protein hydrogel dressing,Rmaphd)在点阵CO_(2)激光治疗面部痤疮萎缩性瘢痕术后创面修复中的应用效果。方法:选择2022年6月-2023年2月面部痤疮萎缩性瘢痕患者117例,分为Rmaphd组、重组人表皮生长因子(Recombinant human epidermal growth factor,rhEGF)组和对照组,每组39例,三组均给予点阵CO_(2)激光术治疗,术后分别给予Rmaphd、rhEGF及生理盐水处理,比较三组疗效、ECCA评分、症状持续时间以及生活质量评分。结果:Rmaphd组和rhEGF组总有效率分别为92.31%和94.87%,均高于对照组76.92%(P<0.05),术后ECCA评分低于对照组(P<0.05),术后疼痛、红斑、痂皮持续时间短于对照组(P<0.05),Acne-QoL各指标得分优于对照组(P<0.05);上述各临床Rmaphd组与rhEGF组差异无统计学意义(P>0.05)。结论:Rmaphd用于点阵CO_(2)激光治疗面部痤疮萎缩性瘢痕术后创面修复疗效显著,具备在临床上辅助激光治疗术后修复的应用潜力。 展开更多
关键词 重组贻贝粘蛋白 水凝胶敷料 点阵CO_(2)激光 痤疮 瘢痕 创面 修复
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非小细胞肺癌组织EMSY、PIDD表达与同源重组修复基因的相关性及其临床意义
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作者 陈丽萍 项保利 +3 位作者 王布 姬泽萱 郭志青 赵建清 《疑难病杂志》 CAS 2024年第2期186-191,共6页
目的研究非小细胞肺癌(NSCLC)组织中EMSY转录抑制因子(EMSY)、p53诱导的死亡结构域蛋白1(PIDD)表达与同源重组修复基因表达的相关性及临床意义。方法选择2022年1月—2023年4月河北北方学院附属第一医院呼吸与危重症医学科诊治NSCLC患者8... 目的研究非小细胞肺癌(NSCLC)组织中EMSY转录抑制因子(EMSY)、p53诱导的死亡结构域蛋白1(PIDD)表达与同源重组修复基因表达的相关性及临床意义。方法选择2022年1月—2023年4月河北北方学院附属第一医院呼吸与危重症医学科诊治NSCLC患者80例。采用实时荧光定量PCR检测癌组织及癌旁组织中EMSY、PIDD表达与同源重组修复基因人乳腺癌易感基因1(BRCA1)、切除修复交叉互补基因1(ERCC1),核糖核苷酸还原酶亚单位1(RRM1)表达。Pearson相关分析EMSY、PIDD表达与同源重组修复基因表达的相关性;分析EMSY、PIDD表达与NSCLC临床病理相关参数的关系及在NSCLC诊断中的价值。结果NSCLC癌组织中EMSY、PIDD、BRCA1、ERCC1、RRM1 mRNA相对表达量均高于癌旁组织(t/P=30.176/<0.001,27.821/<0.001,25.075/<0.001,16.680/<0.001,25.610/<0.001)。NSCLC癌组织中EMSY、PIDD mRNA与BRCA1、ERCC1、RRM1 mRNA表达均呈正相关(r/P=0.654/<0.001,0.712/<0.001,0.584/<0.001;0.724/<0.001,0.661/<0.001,0.563/<0.001)。低分化程度、有淋巴结转移及TNM分期Ⅲ期NSCLC癌组织EMSY、PIDD mRNA表达分别显著高于高中分化程度、无淋巴结转移及TNM分期Ⅰ~Ⅱ期NSCLC癌组织(t/P=13.693/<0.001,13.380/<0.001,12.197/<0.001;10.289/<0.001,11.130/<0.001,9.405/<0.001)。EMSY、PIDD mRNA及两项联合诊断NSCLC的AUC分别为0.834、0.802、0.906,两项联合诊断的AUC大于单一指标(Z=4.751、5.257,P均<0.001)。结论EMSY、PIDD在NSCLC癌组织中表达升高,与同源重组修复基因表达及不良临床病理特征有关,两者联合有助于NSCLC的诊断。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 EMSY p53诱导的死亡结构域蛋白1 同源重组修复基因 诊断
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Gap-Repair方式建立一种基于pBR322-Red的新型重组工程系统 被引量:5
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作者 李山虎 洪鑫 +3 位作者 于梅 陈伟 黄翠芬 周建光 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第5期533-537,共5页
应用Gap-Repair新技术,以pBR322为载体,在λ噬菌体Red重组酶的作用下,通过同源重组直接从大肠杆菌DY330染色体上亚克隆了长度为6.7kb的包含Red重组酶基因的λ噬菌体左向操纵子基因序列。建立了一种能够随意在不同细菌宿主中转移的基于pB... 应用Gap-Repair新技术,以pBR322为载体,在λ噬菌体Red重组酶的作用下,通过同源重组直接从大肠杆菌DY330染色体上亚克隆了长度为6.7kb的包含Red重组酶基因的λ噬菌体左向操纵子基因序列。建立了一种能够随意在不同细菌宿主中转移的基于pBR32-2Red的重组工程系统。为了验证pBR32-2Red的生物功能,以大肠杆菌染色体上的galk基因为靶标,用Red介导的单链DNA重组技术敲入T→G单碱基突变,使galk基因内编码第145位氨基酸的密码子由TAT转变成TAG,产生了一个琥珀突变。确定了pBR322Red系统的重组功能。 展开更多
关键词 Gap—repair Red重组酶 重组工程
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同源重组修复基因突变对晚期非小细胞肺癌患者免疫治疗疗效和预后的影响
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作者 王文茜 李洁瑶 +4 位作者 陈飞帆 杨双宁 刘小玉 王丽萍 张毅 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期700-706,共7页
目的:探讨同源重组修复(HRR)基因突变对晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者免疫治疗疗效和预后的影响。方法:收集2018年3月至2023年4月间在郑州大学第一附属医院接受PD-1抑制剂治疗的124例晚期NSCLC患者的临床资料。根据有无HRR基因突变将患... 目的:探讨同源重组修复(HRR)基因突变对晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者免疫治疗疗效和预后的影响。方法:收集2018年3月至2023年4月间在郑州大学第一附属医院接受PD-1抑制剂治疗的124例晚期NSCLC患者的临床资料。根据有无HRR基因突变将患者分为突变组(n=57例)和野生组(n=67例),采用卡方检验或Fisher’s精确检验比较两组患者的临床特征及免疫治疗疗效差异,采用Kaplan-Meier方法比较两组患者的PFS,采用单因素和多因素Cox回归分析PFS的影响因素。结果:HRR基因突变组中鳞癌及肿瘤突变负荷(TMB)≥10 mut/Mb的占比显著多于野生组(54.4%vs 32.8%,61.4%vs 29.9%,均P<0.05)。HRR基因突变组与野生组患者的ORR分别为17.5%和10.4%(P=0.252),DCR分别为86.0%和73.1%(P=0.080)。HRR基因突变组与野生组的PFS比较差异具有统计学意义(6.8个月vs 3.9个月,P<0.001)。多因素分析结果显示,有无HRR基因突变[HR=0.550,95%CI(0.352,0.860),P=0.009]与免疫治疗线数[HR=0.468,95%CI(0.312,0.702),P<0.001]和PFS显著相关。结论:HRR基因突变组患者的免疫治疗疗效优于野生组患者,HRR基因突变是晚期NSCLC患者免疫治疗预后的独立保护因素。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 同源重组修复 免疫治疗 预后
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基于GSS算法的HRD评分与高危前列腺癌和转移性激素敏感性前列腺癌患者临床病理特征、基因组突变和预后的关系
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作者 陈志强 高宇 +5 位作者 杜松良 牛少曦 李卓然 贾玉琪 董宇杰 王保军 《现代泌尿外科杂志》 CAS 2024年第3期200-204,共5页
目的分析同源重组修复缺陷(HRD)评分与高危和转移性激素敏感性前列腺癌(mHSPC)患者临床病理特征、基因组突变的关系及对mHSPC患者预后的预测价值。方法纳入2021年12月—2023年11月在解放军总医院第一医学中心泌尿外科诊治的高危前列腺癌... 目的分析同源重组修复缺陷(HRD)评分与高危和转移性激素敏感性前列腺癌(mHSPC)患者临床病理特征、基因组突变的关系及对mHSPC患者预后的预测价值。方法纳入2021年12月—2023年11月在解放军总医院第一医学中心泌尿外科诊治的高危前列腺癌和mHSPC患者127例,进行同源重组修复(HRR)基因测序,并基于基因组疤痕评分(GSS)算法得出HRD评分。分析HRD评分与临床病理特征、基因突变和患者预后之间的关系。结果127例高危前列腺癌和mHSPC患者的中位HRD评分为1.6(0.8,5.2),30例(23.6%)患者HRD评分≥10,11例(8.7%)患者HRD评分≥20。临床病理特征包括国际泌尿病理协会(ISUP)分级≥4(P=0.044)和转移状态(P=0.008)与高HRD评分相关。存在BRCA、TP53和MYC体系基因突变型患者的HRD评分显著高于野生型基因患者(P<0.05)。在mHSPC患者中,HRD评分≥20患者出现生化复发的风险是HRD评分<20患者的12.836倍[OR:12.836(1.332~124.623),P=0.028]。结论HRD评分在高危前列腺癌和mHSPC患者中的基线水平较低;HRD评分高的患者可能倾向于拥有更高的组织学分级(ISUP≥4)和更晚的临床分期。HRD评分作为生化标志物提示不良预后的阈值还需进一步的研究。 展开更多
关键词 同源重组修复 同源重组修复缺陷 基因组疤痕评分 高危前列腺癌 转移性激素敏感性前列腺癌
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马里苷靶向p38α增强卵巢癌细胞对DNA损伤药物敏感度的研究
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作者 曹玉敏 郭凡凡 +2 位作者 王芳 张熠 陈友国 《医学研究杂志》 2024年第3期43-49,共7页
目的探究马里苷抑制同源重组修复,联合使用DNA损伤药物的疗效以及其机制。方法CCK-8法、克隆集落形成实验、类器官药敏实验检验细胞和类器官在联合用药后的增敏情况;Western blot法、彗星实验以及同源重组修复报告基因检测细胞联合用药... 目的探究马里苷抑制同源重组修复,联合使用DNA损伤药物的疗效以及其机制。方法CCK-8法、克隆集落形成实验、类器官药敏实验检验细胞和类器官在联合用药后的增敏情况;Western blot法、彗星实验以及同源重组修复报告基因检测细胞联合用药后的DNA损伤情况及其抑制同源重组修复的机制;细胞热转移实验和药物亲和反应的靶点稳定性技术验证马里苷与p38α的结合情况。结果马里苷与p38α结合增加了癌细胞和类器官对DNA损伤药物的敏感度;马里苷抑制p-p38α,增加癌细胞的DNA损伤,抑制癌细胞同源重组修复。结论马里苷抑制同源重组修复,增强了癌细胞对DNA损伤药物的敏感度,从而为卵巢癌的临床用药提供了新策略。 展开更多
关键词 马里苷 同源重组修复 p38α
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外源性重组膜联蛋白A6对小鼠离心运动后骨骼肌早期质膜损伤修复的影响
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作者 韩艳丽 许寿生 +1 位作者 周越 吴迎 《中国康复医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1409-1416,共8页
目的:探究外源性重组人源膜联蛋白A6(recombinant human Annexin A6,rhANX A6)干预对离心运动损伤模型小鼠骨骼肌早期质膜损伤的影响及其代谢特点。方法:将56只8周龄C57雄性小鼠随机分为安静对照组(C)、运动注射磷酸缓冲盐溶液(phosphat... 目的:探究外源性重组人源膜联蛋白A6(recombinant human Annexin A6,rhANX A6)干预对离心运动损伤模型小鼠骨骼肌早期质膜损伤的影响及其代谢特点。方法:将56只8周龄C57雄性小鼠随机分为安静对照组(C)、运动注射磷酸缓冲盐溶液(phosphate buffer saline,PBS)组(EP)和运动注射rhANX A6组(ER),其中运动组根据运动后不同取材时间点分为EP2、EP6、EP12和ER2、ER6、ER12,每组各8只。运动前2h根据小鼠体重对EP组和ER组分别腹腔注射1倍浓度PBS缓冲液和rhANX A6(0.8mg/kg)。运用ELISA检测各组小鼠血清肌酸激酶(creatine kinase,CK)、膜联蛋白A6(Annexin A6,ANX A6)及骨骼肌中ANX A6的含量,运用伊文思蓝染色(Evans blue dye,EBD)观察各组小鼠骨骼肌质膜的损伤情况。结果:(1)EP组各时相、ER12h血清CK活力值显著高于C组(P<0.01);同一时间点对比,EP组各时相均显著高于ER组(P<0.05)。(2)EP组及ER组各时相EBD阳性区域平均荧光强度均显著高于C组(P<0.01);EP组各时相均显著高于ER组(P<0.01)。(3)ER组各时相及EP6h、EP12h血清ANX A6含量显著高于C组(P<0.01);12h时相ER组显著高于EP组(P<0.05)。(4)ER组及EP组各时相骨骼肌ANX A6显著高于C组(P<0.05);ER组各时相均显著高于EP组(P<0.05)。结论:小鼠离心运动前2h注射外源性rhANX A6可显著改善运动后骨骼肌早期质膜损伤,推测rhANX A6直接参与了离心运动诱导的骨骼肌早期质膜损伤修复。 展开更多
关键词 离心运动 重组人源膜联蛋白A6 骨骼肌损伤 质膜修复
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东方蜜蜂微孢子虫RRDRP的分子特性及系统进化分析
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作者 张凯遥 冯佩林 +6 位作者 宓诗雨 郭思佳 张艺琼 荆欣 陈大福 郭睿 付中民 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期371-376,共6页
【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的Rad18-like重组与DNA修复蛋白(Rad18-like recombination and DNA repair protein,RRDRP)进行系统进化分析,为进一步研究其功能提供理论依据。【方法】利用Protparam、ProtScale和SWISS-mode... 【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的Rad18-like重组与DNA修复蛋白(Rad18-like recombination and DNA repair protein,RRDRP)进行系统进化分析,为进一步研究其功能提供理论依据。【方法】利用Protparam、ProtScale和SWISS-model等软件分析RRDRP的理化性质、亲水性和三级结构。利用SignalP 4.1 Server、NetPhos 3.1 Server、TMHMM和SOPMA等软件预测RRDRP的信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域及二级结构。使用PSORTⅡ软件预测RRDRP蛋白的亚细胞定位。使用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种RRDRP的保守基序。通过Mega 11.0软件对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RRDRP进行氨基酸序列多重比对,并采用邻接法构建系统进化树。【结果】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP基因含有2928个核苷酸,可编码975个氨基酸,分子质量约11.50 ku,脂溶系数93.58,等电点6.63,分子式C_(5135)H_(8253)N_(1377)O_(1545)S_(34),平均亲水系数为-0.627,可同时定位于细胞核、细胞质、过氧化物酶体和细胞骨架;RRDRP包含55个磷酸化位点、678个α-螺旋、99条延长链、22个β-转角及176个无规则卷曲;RRDRP不含信号肽与跨膜结构域。东方蜜蜂微孢子虫、兔脑炎微孢子虫、颗粒病微粒子虫等11个物种的RRDRP中均含有5个相同的保守基序(Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 4和Motif 5)。东方蜜蜂微孢子虫与颗粒病微粒子虫在进化树上聚为一支,同源性较高。【结论】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP是潜在的亲水性蛋白和胞内蛋白,在东方蜜蜂微孢子虫以及其他微孢子虫和真菌中高度保守。【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的Rad18-like重组与DNA修复蛋白(Rad18-like recombination and DNA repair protein, RRDRP)进行系统进化分析,为进一步研究其功能提供理论依据。【方法】利用Protparam、ProtScale和SWISS-model等软件分析RRDRP的理化性质、亲水性和三级结构。利用SignalP 4.1 Server、NetPhos 3.1 Server、TMHMM和SOPMA等软件预测RRDRP的信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域及二级结构。使用PSORT Ⅱ软件预测RRDRP蛋白的亚细胞定位。使用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种RRDRP的保守基序。通过Mega 11.0软件对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RRDRP进行氨基酸序列多重比对,并采用邻接法构建系统进化树。【结果】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP基因含有2 928个核苷酸,可编码975个氨基酸,分子质量约11.50 ku,脂溶系数93.58,等电点6.63,分子式C5135H8253N1377O1545S34,平均亲水系数为-0.627,可同时定位于细胞核、细胞质、过氧化物酶体和细胞骨架;RRDRP包含55个磷酸化位点、678个α-螺旋、99条延长链、22个β-转角及176个无规则卷曲;RRDRP不含信号肽与跨膜结构域。东方蜜蜂微孢子虫、兔脑炎微孢子虫、颗粒病微粒子虫等11个物种的RRDRP中均含有5个相同的保守基序(Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 4和Motif 5)。东方蜜蜂微孢子虫与颗粒病微粒子虫在进化树上聚为一支,同源性较高。【结论】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP是潜在的亲水性蛋白和胞内蛋白,在东方蜜蜂微孢子虫以及其他微孢子虫和真菌中高度保守。 展开更多
关键词 东方蜜蜂微孢子虫 染色体结构维持蛋白 Rad18-like重组和DNA修复蛋白 分子特性 系统进化
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植物DNA双链断裂修复机制及其在重离子诱变和基因编辑中的作用
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作者 隆静 陈婧敏 +3 位作者 刘霄 张一凡 周利斌 杜艳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期55-67,共13页
在自然界中,植物会遭受各种环境或内源因素导致的DNA损伤,其中DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)的影响最为严重,如果修复不当,将导致基因组不稳定、基因突变甚至细胞死亡。一方面,植物进化出了强大且有序的损伤修复机制,以确保... 在自然界中,植物会遭受各种环境或内源因素导致的DNA损伤,其中DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)的影响最为严重,如果修复不当,将导致基因组不稳定、基因突变甚至细胞死亡。一方面,植物进化出了强大且有序的损伤修复机制,以确保其存活及正常繁衍;另一方面,基于修复过程的容错性及致突变性,T-DNA插入、基因编辑、物理诱变等技术广泛应用于动植物品种改良。相较于哺乳动物,植物DSBs修复通路及其分子机制报道较为有限。本文综述了植物对DSBs损伤的响应、主要修复途径及关键因子,介绍了通路机制尚未完全解析的替代末端连接(alternative end joining,Alt-EJ)的最新研究进展;此外,探讨了重离子束引起的植物DSBs修复特征和多途径选择,以及基于不同DSBs修复途径的基因编辑技术的研究进展,旨在为深入了解植物DSBs损伤响应及修复的分子机制和研发高效生物育种技术提供参考。 展开更多
关键词 植物DSBs损伤修复 同源重组 非同源末端连接 重离子束 基因编辑
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非小细胞肺癌同源重组修复通路基因与临床特征的相关性分析
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作者 杨茜 赵洁 +4 位作者 唐海涛 廖鑫 牟康 李小松 沈依帆 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期871-876,共6页
目的:采用基因组不稳定评分(genomic instability score,GIS)描述非小细胞肺癌患者的同源重组修复缺陷(homolo⁃gous recombination deficiency,HRD)状态,探讨HRD状态及同源重组通路基因(homologous recombination repair,HRR)与临床特... 目的:采用基因组不稳定评分(genomic instability score,GIS)描述非小细胞肺癌患者的同源重组修复缺陷(homolo⁃gous recombination deficiency,HRD)状态,探讨HRD状态及同源重组通路基因(homologous recombination repair,HRR)与临床特征的相关性。方法:本研究纳入2020年1月至2022年1月在重庆医科大学附属第一医院接受治疗的335例非小细胞肺癌患者,采用二代测序法检测GIS评分及35个HRR基因,根据杂合性缺失(loss of heterozygosity,LOH)、端粒等位基因失衡(telo⁃meric allelic imbalance,TAI)、大片段迁移(large-scale state transition,LST)综合评估GIS评分。GIS评分及HRR基因与临床特征之间的关系通过Mann-Whitney U检验,Kruskal-Wallis检验和Dunn-Bonferroni检验分析。GIS评分和肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)值的相关性采用Spearman分析。结果:在335例患者中,男性患者、年龄大、分期晚、有吸烟史、鳞癌均会导致GIS评分更高,GIS评分Md(P25,P75)分别是13(4,26.75),12(3,22.5),21.5(12,30),16(4,27)和24(18,38.25)(Z=-5.083,P<0.001;Z=2.973,P=0.003;Z=8.225,P<0.001;Z=4.655,P<0.001;Z=-7.082,P<0.001)。HRR体系基因突变组样本GIS评分高于野生组,2组GIS评分分别为18.5(5.25,28.75)和6(1,16)(Z=5.012,P<0.001)。共检测到33个HRR相关基因突变,主要集中在ATM、RECQL4、ATR、FANCM、BRCA1、FANCA、BRIP1、NBN、WRN等基因,其中BRCA2、FANCI、FANCA基因突变均会导致GIS评分升高,GIS评分Md(P25,P75)分别是34(25.25,51),31.5(14.5,50)和22(12,44)(Z=-2.805,P=0.005;Z=-2.216,P=0.027;Z=-2.478,P=0.013)。GIS评分和TMB值之间呈正相关(rs=0.504,P<0.001)。结论:揭示中国非小细胞肺癌患者GIS评分及HRR基因突变特征,提示基于二代测序的GIS评分及HRR基因检测可能成为非小细胞肺癌患者靶向治疗及免疫治疗新的生物标志物。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 同源重组修复缺陷 基因组不稳定评分 同源重组通路
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Sitravatinib联合Niraparib对黏膜黑色素瘤细胞系增殖、凋亡和自噬的影响及其机制
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作者 胡子衿 孔燕 +2 位作者 吴晓雯 郭倩 郭军 《基础医学与临床》 2024年第3期295-302,共8页
目的研究抗血管生成药物Sitravatinib联合多聚(腺苷二磷酸[ADP]-核糖)聚合酶抑制剂(PARPi)Niraparib对黏膜黑色素瘤细胞的作用及其可能的机制。方法CCK8法检测Sitravatinib和Niraparib在黏膜黑色素瘤(MM)细胞系的半数抑制浓度(IC 50);Co... 目的研究抗血管生成药物Sitravatinib联合多聚(腺苷二磷酸[ADP]-核糖)聚合酶抑制剂(PARPi)Niraparib对黏膜黑色素瘤细胞的作用及其可能的机制。方法CCK8法检测Sitravatinib和Niraparib在黏膜黑色素瘤(MM)细胞系的半数抑制浓度(IC 50);CompuSyn模型计算不同浓度联合条件下的联合指数(CI)。细胞集落形成实验测定细胞增殖;流式细胞测量术测定细胞凋亡;Western blot检测蛋白质表达;RT-qPCR检测mRNA表达。结果在人阴道黏膜来源黑色素瘤细胞系(HMVⅡ)和人外阴黏膜黑色素瘤腹股沟淋巴结转移病灶来源细胞系(GAK)中Sitravatinib(2μmol/L)联合Niraparib(20μmol/L)条件下CI值分别为0.19和0.15;与对照组及单药组相比,联合组细胞增殖能力显著下降(P<0.05或P<0.01或P<0.001);细胞凋亡率显著升高(P<0.01或P<0.001),凋亡标志物蛋白质和mRNA表达均显著升高(P<0.001);细胞自噬标志物蛋白质和mRNA表达显著升高(P<0.01或P<0.001);DNA损伤相关蛋白质表达显著升高。而与对照组相比,Sitravatinib单药组和联合组重组酶辐射敏感蛋白51(RAD51)表达显著下降。随着Sitravatinib剂量逐渐升高至2μmol/L,RAD51蛋白和mRNA表达显著下降(P<0.05或P<0.01),BRCA1与BRCA2的mRNA表达显著下降(P<0.05或P<0.01或P<0.001)。结论Sitravatinib联合Niraparib可抑制黏膜黑色素瘤细胞增殖,诱导细胞凋亡并促进细胞自噬,其机制可能与Sitravatinib抑制同源重组修复(HRR)水平相关。 展开更多
关键词 黏膜型黑色素瘤 抗血管生成药物 多聚(腺苷二磷酸核糖)聚合酶抑制剂 同源重组修复
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EDC/NHS交联重组胶原蛋白水凝胶修复关节软骨缺损 被引量:1
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作者 黄长瑾 雷桓 唐晓军 《中国材料进展》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期344-354,共11页
关节软骨损伤、缺损是一种常见且严峻的临床挑战,没有有效的治疗方法,基于胶原蛋白的水凝胶是软骨组织工程的研究热点之一,但在开发具有良好生物相容性且可安全交联的胶原蛋白产品,并提高软骨修复有效性方面仍然存在巨大挑战。将重组Ⅰ... 关节软骨损伤、缺损是一种常见且严峻的临床挑战,没有有效的治疗方法,基于胶原蛋白的水凝胶是软骨组织工程的研究热点之一,但在开发具有良好生物相容性且可安全交联的胶原蛋白产品,并提高软骨修复有效性方面仍然存在巨大挑战。将重组Ⅰ型胶原蛋白和重组Ⅲ型胶原蛋白通过EDC/NHS交联,制备了2种水凝胶,均表现出良好的三维孔隙结构以及优异的力学性能和可降解性。研究发现,重组Ⅰ型胶原蛋白水凝胶(Gel-Ⅰ)和重组Ⅲ型胶原蛋白水凝胶(Gel-Ⅲ)能促进人骨髓间充质干细胞(human bone-marrow mesenchymal stem cells,HBMSCs)糖胺聚糖的分泌,Gel-Ⅰ可以显著上调HBMSCs表达COLⅡ基因和SOX9基因,Gel-Ⅲ可以显著上调SOX9基因表达。在兔子膝关节软骨修复模型中,与对照组和Gel-Ⅲ组相比,Gel-Ⅰ组在骨体积大小方面表现出明显优势,软骨下骨已形成并有效恢复,小梁的数量和厚度最高,小梁分布更均匀,并且缺损处新软骨厚度与相邻软骨厚度相同。因此,Gel-Ⅰ在软骨修复有效性以及安全性方面具有极大的临床应用潜力。 展开更多
关键词 EDC/NHS 交联 重组胶原蛋白 可注射水凝胶 关节软骨修复
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RAD54L在肝硬化中的表达及临床意义
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作者 李宏达 凌翔宇 +1 位作者 孙东跃 周庆 《医学研究杂志》 2024年第4期35-39,51,共6页
目的 探讨RAD54样蛋白(RAD54-like protein, RAD54L)在肝硬化中的表达情况以及临床意义。方法 通过生物信息学分析RAD54L的表达情况,并通过临床标本和小鼠肝硬化模型验证了RAD54L的表达,与血清标本的肝功能指标进行相关性分析,探究RAD54... 目的 探讨RAD54样蛋白(RAD54-like protein, RAD54L)在肝硬化中的表达情况以及临床意义。方法 通过生物信息学分析RAD54L的表达情况,并通过临床标本和小鼠肝硬化模型验证了RAD54L的表达,与血清标本的肝功能指标进行相关性分析,探究RAD54L的临床意义。结果 RAD54L作为同源重组修复的关键基因,通过肝硬化的数据库中验证其存在表达差异(P<0.05)。RAD54L在临床标本(P<0.01)和小鼠模型标本(P<0.01)中表达均升高,与肝功能指标(谷丙转氨酶、谷草转氨酶)呈正相关,在一定程度上反映了肝损伤的程度。结论 RAD54L可以作为判断肝损伤以及了解进展情况的分子标志物。 展开更多
关键词 RAD54L 肝硬化 同源重组修复 肝损伤
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AKT抑制剂NTQ1062与Olaparib在卵巢癌细胞中的联用研究
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作者 李月楚 周秋华 +5 位作者 苗雷 季晓君 马昌友 吴舰 李念光 徐丹 《药学与临床研究》 2024年第2期97-102,共6页
目的:探讨AKT抑制剂NTQ1062和PARP抑制剂Olaparib的对卵巢癌细胞的联用增效可行性及作用机制。方法:研究NTQ1062和Olaparib联用对三种人卵巢癌细胞系(OVCAR-3、TOV-21G、A2780)增殖的影响,并通过Western blot技术检测PI3K/AKT信号通路... 目的:探讨AKT抑制剂NTQ1062和PARP抑制剂Olaparib的对卵巢癌细胞的联用增效可行性及作用机制。方法:研究NTQ1062和Olaparib联用对三种人卵巢癌细胞系(OVCAR-3、TOV-21G、A2780)增殖的影响,并通过Western blot技术检测PI3K/AKT信号通路及同源重组修复、DNA损伤修复相关蛋白的表达,最后使用Annexin V-FITC双染法检测细胞凋亡。结果:实验结果显示,NTQ1062对TOV-21G、A2780细胞株具有较强的增殖抑制作用,对OVCAR-3细胞增殖的抑制作用较弱,并且联合处理会增加三株卵巢癌细胞的增殖抑制作用;Western blot实验中NTQ1062增加卵巢癌细胞中AKT的磷酸化、抑制S6RP的磷酸化、增加γH2AX蛋白表达、降低RAD51蛋白表达,并发现联合处理具有协同作用;进一步研究发现,联合用药会降低TOV-21G细胞中BRCA1蛋白的表达,但对A2780细胞影响不显著;细胞凋亡实验中,NTQ1062增加细胞凋亡群,并且联合处理显著增加了细胞凋亡效果。结论:NTQ1062可抑制OVCAR-3、TOV-21G、A2780细胞增殖,与Olaparib联用具有协同作用,通过抑制PI3K/AKT通路、DNA损伤、减少同源重组修复、降低BRCA1蛋白表达、增加凋亡来发挥作用。本研究可为临床制订AKT抑制剂NTQ1062与PARP抑制剂联合应用于卵巢癌治疗策略提供理论和技术依据。 展开更多
关键词 卵巢癌 AKT抑制剂 PARP抑制剂 联用 DNA损伤 同源重组修复
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RAD54L 在口腔鳞状细胞癌中的表达及功能研究
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作者 曹显 陈佳琳 +1 位作者 张锐 过新民 《口腔疾病防治》 2024年第11期853-862,共10页
目的探讨DNA修复重组RAD54样蛋白(RAD54-like protein,RAD54L)在口腔鳞状细胞癌(oral squa-mous cell carcinoma,OSCC)中的表达及功能作用。方法利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TC-GA)数据库中OSCC相关数据,通过Mann-Whitn... 目的探讨DNA修复重组RAD54样蛋白(RAD54-like protein,RAD54L)在口腔鳞状细胞癌(oral squa-mous cell carcinoma,OSCC)中的表达及功能作用。方法利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TC-GA)数据库中OSCC相关数据,通过Mann-Whitney U检验分析RAD54L在OSCC与对照样本中的表达差异,并采用受试者工作特征曲线评估RAD54L在OSCC诊断中的潜在价值。通过卡方检验分析RAD54L mRNA表达水平与OSCC患者临床病理数据之间的关系。将OSCC样本根据RAD54L mRNA表达中位值分为高低表达两组后,采用Cox回归分析比较两组的预后差异;采用DESeq2软件包筛选组间的差异表达基因,并利用cluster-Profiler包进行KEGG通路富集分析。采用Spearman相关性分析展示RAD54L与同源重组修复途径中基因表达的相关性。在明确RAD54L的生物信息学意义后,在人OSCC细胞株HSC-3中进行RAD54L基因敲低实验,并通过qRT-PCR验证敲低效率。转染后,通过CCK-8、5-乙炔基-2'-脱氧尿苷(5-ethynyl-2'-deoxyuridine,EdU)染色、细胞划痕、细胞凋亡及细胞周期实验,评估HSC-3细胞增殖、迁移、凋亡及周期的变化。结果生物信息学分析结果显示,RAD54L mRNA在OSCC中的表达高于正常对照组(P<0.001),且对预后不良的预测具有较高价值(AUC=0.927)。RAD54L高表达组男性患者比例增加(P=0.032),具有更高的T分期(P=0.040)、临床分期(P=0.027)及病理学分级(P=0.013)。以RAD54L mRNA表达中位值将OSCC样本分为高低表达两组后,RAD54L高表达组的预后较低表达组差(P=0.049);RAD54L高低表达两组间的差异表达基因主要富集于神经活性配体与受体的相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、钙信号通路、细胞周期、胃癌、细胞外基质受体相互作用、化学致癌-DNA加合物、DNA复制、同源重组和错配修复途径(P<0.05),在同源重组修复途径中RAD54L的表达与BRCA1、BLM、EME1、XRCC2、POLD1、TOPBP1、RAD51、BRIP1、RAD54B、BRCA2和SYCP3的表达呈正相关(P<0.05),其中与BRCA1、BLM和EME1的表达呈强正相关(R>0.8,P<0.05)。体外实验结果表明,RAD54L在HSC-3细胞中的表达被敲低至约25%(P<0.001),与对照组相比,RAD54L敲低组的增殖率降低(P<0.05),EdU阳性细胞比例下降(P<0.001),划痕闭合比例降低(P<0.001),G1期细胞比例增加(P<0.001),S期细胞比例降低(P<0.001),细胞凋亡比例增加(P<0.001)。结论RAD54L在OSCC中高表达且与不良预后相关。下调RAD54L表达可抑制HSC-3细胞的增殖和迁移,促进细胞凋亡,并阻碍细胞周期进程。 展开更多
关键词 同源重组修复基因 RAD54L 口腔鳞状细胞癌 预后 细胞增殖 细胞凋亡 细胞周期 生物信息学分析
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