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荧光短片段多重PCR在脊髓性肌萎缩症SMN1基因突变检测中的应用
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作者 杨慧 李桂河 +3 位作者 谢颖璇 陈海珠 李世举 何瑾 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期519-524,共6页
目的设计特异性扩增引物,建立荧光短片段多重PCR技术检测SMN1基因拷贝数变异的方法,验证方法的检测性能并初步应用于基因拷贝数检测。方法选取107例来自神经系统疾病生物样本库的人外周血DNA样品(包括SMN1基因0拷贝30例、1拷贝47例、2拷... 目的设计特异性扩增引物,建立荧光短片段多重PCR技术检测SMN1基因拷贝数变异的方法,验证方法的检测性能并初步应用于基因拷贝数检测。方法选取107例来自神经系统疾病生物样本库的人外周血DNA样品(包括SMN1基因0拷贝30例、1拷贝47例、2拷贝30例),设计5’端带有FAM荧光基团的SMN1基因7号外显子引物以及三对内参基因引物,利用荧光短片段多重PCR技术,使用基因分析仪片段分析多重PCR的产物,并与相应的MLPA检测结果进行比较。结果特异性扩增SMN1基因7号外显子及内参基因的引物可实现目的片段的扩增,通过计算可得到0拷贝、1拷贝、2拷贝的样本结果。对107例DNA样本的SMN1基因拷贝数荧光短片段多重PCR的检测结果进行分析,实验结果均与MLPA检测结果相一致。结论使用荧光标记多重PCR反应检测SMN1拷贝数可重复性好,精确度高,与MLPA得到的结果高度一致,具有便捷、准确、成本低的优势,可满足临床高准确性的检测要求,可用于SMA新生儿携带者的大规模筛查。 展开更多
关键词 荧光短片段多重PCR 脊髓性肌萎缩症 SMN1基因拷贝数检测 多重连接依赖性探针扩增技术 运动神经元生存基因1 运动神经元生存基因2 神经遗传病 携带者筛查
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基于RNA测序的SMN1基因缺失型脊髓性肌肉萎缩症的可变剪接差异性分析 被引量:2
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作者 林炎鸿 张梦雅 曾健 《国际检验医学杂志》 CAS 2021年第23期2861-2865,共5页
目的通过分析运动神经元生存基因1(SMN1)基因纯合性缺失型儿童进行性脊髓性肌肉萎缩症(SMA)患者和SMN1基因拷贝数正常对照外周血淋巴细胞表达谱,研究SMN1基因缺失对可变剪接的影响。方法利用转录组测序对患者组与正常对照组进行表达谱测... 目的通过分析运动神经元生存基因1(SMN1)基因纯合性缺失型儿童进行性脊髓性肌肉萎缩症(SMA)患者和SMN1基因拷贝数正常对照外周血淋巴细胞表达谱,研究SMN1基因缺失对可变剪接的影响。方法利用转录组测序对患者组与正常对照组进行表达谱测序,用rMATS软件对RNA-seq数据进行可变剪接事件差异分析,筛选出患者组与正常对照组中差异的外显子跳跃和内含子保留事件,通过在线工具NovoMagic v3.0对这些差异可变剪接体进行基因功能和代谢通路富集分析,实现个性化分析和作图,同时用NCBI数据库对这些基因进行注释。结果(1)SMN1基因纯合性缺失可导致外周血淋巴细胞mRNA可变剪接及其表达量发生变化;(2)外显子跳跃差异基因主要影响核糖核蛋白组装、胞内转运、翻译、乙酰化修饰、线粒体能量代谢及泛素化调控的降解通路;(3)内含子保留差异基因除参与泛素化调控、内吞、翻译、线粒体能量代谢外,同时还调节细胞骨架和代谢酶活性相关乙酰化修饰。结论SMN1基因纯合性缺失能够改变部分基因的可变剪接,进而影响相关蛋白的合成、组装和降解,最终导致蛋白质稳态失衡,为SMA的发病机制提供新的线索。 展开更多
关键词 运动神经元生存基因1纯合性缺失 外周血 RNA测序 可变剪接 内含子保留 外显子跳跃
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萍乡市育龄妇女脊髓性肌萎缩症SMN1基因突变发生率及分布特征
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作者 欧阳宁 钟丽群 +3 位作者 李彦琳 陈海萍 何蓉 刘红宇 《中国妇幼保健》 CAS 2024年第11期2075-2078,共4页
目的评估萍乡市育龄妇女脊髓性肌萎缩症(SMA)运动神经元存活基因1(SMN1)突变发生率及分布特征。方法选取2022年1月—2023年5月在萍乡市进行产前检查的1741例孕妇及46名配偶作为研究对象,使用聚合酶链式反应(PCR)-熔解曲线法检测SMN1基... 目的评估萍乡市育龄妇女脊髓性肌萎缩症(SMA)运动神经元存活基因1(SMN1)突变发生率及分布特征。方法选取2022年1月—2023年5月在萍乡市进行产前检查的1741例孕妇及46名配偶作为研究对象,使用聚合酶链式反应(PCR)-熔解曲线法检测SMN1基因外显子7(E7)和外显子8(E8)的拷贝数。结果1741例孕妇中,SMN1基因异常46例(2.64%,1∶37),其中E7单独杂合缺失3例(0.17%,1∶580),E8单独杂合缺失9例(0.52%,1∶193),E7和E8同时杂合缺失34例(1.95%,1∶51),对上述孕妇均进行复检,阳性筛查率仍为100.00%。46名配偶被召回检测,其中2对夫妇均存在E7杂合缺失,2例孕妇均接受产前胎儿SMA诊断,1例胎儿正常(继续妊娠),1例SMA患儿(E7和E8纯合缺失,终止妊娠),其余胎儿均继续妊娠。结论积极筛查萍乡市育龄妇女SMN1基因异常的发生率及分布特征,联合对高危胎儿进行产前诊断,可有效避免SMA患儿的出生。 展开更多
关键词 育龄妇女 脊髓性肌萎缩症 运动神经元存活基因1 产前诊断 萍乡市
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儿童型脊肌萎缩症SMN基因缺失与微突变检测 被引量:3
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作者 杨晓苏 邓益东 +1 位作者 肖波 罗新明 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 2005年第6期489-492,共4页
目的研究儿童型脊肌萎缩症(SMA)患者中运动神经元生存基因缺失与微突变情况。方法收集经临床和肌肉活检确诊的SMA I^III型25例,其中I型5例,II型3例,III 17例及直系亲属24例。采用PCR-RFLP检测SMNt缺失情况,对无SMNt缺失的患者及SMA直系... 目的研究儿童型脊肌萎缩症(SMA)患者中运动神经元生存基因缺失与微突变情况。方法收集经临床和肌肉活检确诊的SMA I^III型25例,其中I型5例,II型3例,III 17例及直系亲属24例。采用PCR-RFLP检测SMNt缺失情况,对无SMNt缺失的患者及SMA直系亲属,应用PCR-SSCP结合DNA序列分析的方法,进行SMN基因微突变分析。结果5例I型和3例II型SMA患者均见SMNt缺失,缺失率100%,6例III型见缺失,缺失率35%(6/17)。11例无缺失的SMA III型患者的gDNA编码区域未发现微突变;24例SMA的直系亲属中未发现SMN基因缺失及突变。结论①检测到SMNt外显子7缺失可作为SMA的确诊手段,有望替代肌电图和肌活检等有创检查;②对无SMNt外显子7缺失的III型SMA患者,要结合临床进行诊断;③该组无SMNt缺失的III型患者未发现微突变,提示存在遗传异质性。[中国当代儿科杂志,2005,7(6):489-492] 展开更多
关键词 脊肌萎缩症 运动神经元生存基因 缺失 微突变 儿童
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同时检测两种运动神经元存活基因第7外显子缺失的简便方法及其临床应用 被引量:5
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作者 曾卫民 尹飞 杨金莲 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期108-110,共3页
目的 建立同时检测运动神经元存活基因SMNT和SMNC第 7外显子缺失的简便方法 ,用于儿童期起病的脊髓性肌萎缩症 (SMA)的临床诊断。方法 应用聚合酶链反应 (PCR) 限制性酶切技术 ,用一对引物同时扩增 5 5例正常成年人和 5例SMA患儿及... 目的 建立同时检测运动神经元存活基因SMNT和SMNC第 7外显子缺失的简便方法 ,用于儿童期起病的脊髓性肌萎缩症 (SMA)的临床诊断。方法 应用聚合酶链反应 (PCR) 限制性酶切技术 ,用一对引物同时扩增 5 5例正常成年人和 5例SMA患儿及其父母的SMN基因 2个成员的第 7外显子中的高度保守区 ,扩增产物经限制性内切酶酶切及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。结果 此法可检测 2个SMN基因第 7外显子的缺失情况。经检测 ,5 5例正常成人均无SMNT基因第 7外显子缺失 ,SMNC基因第 7外显子缺失仅 3例。 5例SMA患儿的SMNT基因第 7外显子均有缺失。患儿父母无SMNT基因和SMNC基因第 7外显子缺失。结论 此法对检测 2个SMN基因第 7外显子的缺失提供了简便、特异 ,且适合临床特别是基层医院应用、优于PCR 展开更多
关键词 聚合酶链反应 运动神经元存活基因 基因缺失 检测
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运用DHPLC技术进行脊髓性肌萎缩症SMN-T基因缺失检测的初步研究 被引量:3
6
作者 杨元 彭茜 +1 位作者 阿周存 林立 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期271-274,共4页
目的评价变性高效液相色谱技术(denaturinghighperformanceliquidchromatography,DHPLC)在脊髓性肌萎缩症(spinalmuscularatrophy,SMA)端粒运动神经元生存基因(survivalmotorneurontelomericcopy,SMN-T)缺失筛查中的应用价值。方法应用... 目的评价变性高效液相色谱技术(denaturinghighperformanceliquidchromatography,DHPLC)在脊髓性肌萎缩症(spinalmuscularatrophy,SMA)端粒运动神经元生存基因(survivalmotorneurontelomericcopy,SMN-T)缺失筛查中的应用价值。方法应用扩增限制性长度多态性技术(PCR-RFLP)、DHPLC及DNA测序技术对51例SMA患儿及其双亲与67例非SMA患儿SMN-T与着丝粒运动神经元生存基因(survivalmotorneuroncentromericcopy,SMN-C)碱基差异位点exon7(C/T)与exon8(G/A)进行检测。结果PCR-RFLP与DHPLC技术均同时检出45例SMA患儿SMN-T基因exon7+8或exon7纯合缺失,DNA测序证实了PCR-RFLP与DHPLC检测的可靠性。在DHPLC检测中发现,6例非SMN-T纯合缺失患儿的SMN-T与SMN-C基因拷贝数存在不平衡;在SMN-T基因纯合缺失患儿双亲中,75.5%(77/102例)的个体两基因拷贝数存在不平衡;在非SMA对照组中,22.4%的个体(15/67例)两基因拷贝数存在不平衡,两组个体基因拷贝不平衡频率差异有显著性。结论DHPLC技术不仅能快速有效地检出SMN-T基因的纯合缺失,而且通过比较SMN-T与SMN-C基因拷贝数平衡与否,可初步提示患儿SMN-T基因杂合缺失状态与双亲基因缺失的携带者状态,为进一步的基因突变筛查与产前诊断提供依据。 展开更多
关键词 脊髓性肌萎缩症 运动神经元生存基因 变性高效液相色谱技术 基因缺失
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脊髓性肌萎缩症治疗临床研究进展 被引量:7
7
作者 利婧 张成 《中国现代神经疾病杂志》 CAS 北大核心 2019年第6期385-392,共8页
脊髓性肌萎缩症为常染色体隐性遗传性神经肌肉病,以脑干和脊髓运动神经元变性引起的进行性肌无力和肌萎缩为特征,是临床常见的婴儿致死性遗传性神经肌肉病。运动神经元生存1(SMN1)基因突变致SMN蛋白缺乏为其发病机制,深入了解疾病发病... 脊髓性肌萎缩症为常染色体隐性遗传性神经肌肉病,以脑干和脊髓运动神经元变性引起的进行性肌无力和肌萎缩为特征,是临床常见的婴儿致死性遗传性神经肌肉病。运动神经元生存1(SMN1)基因突变致SMN蛋白缺乏为其发病机制,深入了解疾病发病机制的分子学基础,以促进包括反义寡核苷酸、腺相关病毒介导的SMN1基因替代疗法、上调SMN蛋白表达的口服小分子药物,以及肌肉激活药物、神经保护药物等新兴特异性治疗方法的研发,降低病死率、改善患者生活质量。 展开更多
关键词 肌萎缩 脊髓性 运动神经元生存蛋白质1 基因 综述
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脊髓性肌萎缩症的SMN1基因点突变分析 被引量:6
8
作者 瞿宇晋 都娟 +6 位作者 李尔珍 杨艳玲 邹丽萍 白晋丽 王红 金煜炜 宋昉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期121-126,共6页
目的 通过运动神经元存活基因1(survival motor neuron gene 1,SMN1)点突变研究,对SMN1单拷贝缺失的疑似脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atroph,SMA)患儿给予基因诊断.探讨SMN1复合杂合突变患儿的临床表型.方法 按照国际SMA诊断标... 目的 通过运动神经元存活基因1(survival motor neuron gene 1,SMN1)点突变研究,对SMN1单拷贝缺失的疑似脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atroph,SMA)患儿给予基因诊断.探讨SMN1复合杂合突变患儿的临床表型.方法 按照国际SMA诊断标准对3例患者进行临床拟诊和随访分型.应用多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)技术进行SMN1和SMN2基因的拷贝数定量分析.应用逆转录PCR和克隆测序技术进行SMN1点突变研究.通过核心家系成员拷贝数和点突变分析,明确突变在家系中的传递.结果 确定了2种SMN1基因点突变:p.Leu228X(1例)和p.Arg288Met(2例).其中错义突变p.Arg288Met为中国SMA中首次报道,无义突变p.Leu228X为中国大陆地区首次报道.携带p.Leu228X突变的患儿具有2个SMN2拷贝,为Ⅰ型SMA;而携带p.Arg288Met突变的2例患儿SMN2的拷贝数均为3,表型分别为Ⅰ型和Ⅱ型.结论 p.Leu228X和p.Arg288Met突变均遗传自父母,而非新发突变.两种突变导致了严重的Ⅰ型和较为严重的Ⅱ型SMA.3例SMA患儿发生SMN1基因杂合缺失同时伴有SMN1基因点突变,提示我国SMA存在复合杂合突变机制.对SMN1基因单拷贝缺失的疑似SMA患儿,进行点突变分析十分必要,能够为患儿的临床诊断、家庭的遗传咨询和产前诊断提供依据. 展开更多
关键词 脊髓性肌萎缩症 运动神经元存活基因1 点突变 拷贝数
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运动神经元存活基因1点突变的鉴定及其对全长运动神经元存活基因1转录表达的影响 被引量:1
9
作者 白晋丽 瞿宇晋 +4 位作者 李尔珍 金煜伟 曹延延 王红 宋昉 《中华神经科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期100-106,共7页
目的对2例脊髓性肌萎缩症(SMA)患者及其核心家系进行运动神经元存活基因1(SMN1)的点突变分析,评估2种SMN1点突变对全长SMN1基因(SMN1-fl)转录水平的影响,结合患者表型初步预测点突变对SMN蛋白及功能的影响。方法采用多重连接依... 目的对2例脊髓性肌萎缩症(SMA)患者及其核心家系进行运动神经元存活基因1(SMN1)的点突变分析,评估2种SMN1点突变对全长SMN1基因(SMN1-fl)转录水平的影响,结合患者表型初步预测点突变对SMN蛋白及功能的影响。方法采用多重连接依赖性探针扩增技术、RT—PCR、克隆测序结合基因组序列分析进行SMN1基因拷贝数和点突变分析,利用患者父母的基因分析明确突变的传递关系。通过实时定量PCR技术分析患者体内SMN1-fl的转录水平。以50名无神经肌肉萎缩病史的个体作为健康对照组,健康个体为含2个SMN1基因拷贝的个体,而健康携带者为纯合缺失患儿的父母(含1个SMN1基因拷贝)。结果2例SMA患者的表型为Ⅱ型和Ⅲ型,SMN1基因分别存在P.Val19GlyfsX21和P.Ala2Gly突变,突变均来自患者父亲。健康个体、健康携带者、携带P.Val19GlyfsX21突变的患者和携带P.Ala2Gly突变的患者,其SMN1-flm RNA表达量分别为23.5±4.9、14.1±4.5、4.9±2.4和13.9±3.6。t检验结果表明,携带上述突变的2例患者,其SMN1-fl mRNA表达量均明显低于健康个体(t=3.322,P=0.011;t=6.964,P=0.000),而与健康携带者相比,P.Ala2Gly突变的患者SMN1-fl mRNA表达量差异无统计学意义(t=0.058,P=0.955),携带P.Val19GlyfsX21突变的患者其SMN1-flm RNA表达量显著下降,差异有统计学意义(t=3.725,P=0.004)。结论共发现2种SMN1基因突变,P.Val19GIyfsX21为国际尚未见报道的新突变,P.Ala2Gly突变首次在中国患者中发现。前者可能通过无义突变介导的mRNA降解途径使SMN1-fl mRNA转录水平显著下降,而后者则并不影响SMN1-flm RNA转录水平,对SMN蛋白功能的影响尚待研究。 展开更多
关键词 肌萎缩 脊髓性 运动神经存活蛋白质1 点突变 基因剂量 核酸扩增技术
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新疆地区3302例孕妇脊髓性肌萎缩症携带者筛查及产前诊断
10
作者 张翠珍 刘璇 +3 位作者 李慧君 李阳 杨璐嘉 薛淑媛 《重庆医学》 CAS 2024年第10期1508-1511,1518,共5页
目的对新疆地区3302例孕妇进行脊髓性肌萎缩症(SMA)携带者筛查,初步确定该地区孕妇SMA携带率。方法对2020年4月至2023年2月于该院行产前检查的29089例孕妇进行宣教,其中3302例接受SMA携带者筛查,采用荧光定量PCR技术检测运动神经元存活... 目的对新疆地区3302例孕妇进行脊髓性肌萎缩症(SMA)携带者筛查,初步确定该地区孕妇SMA携带率。方法对2020年4月至2023年2月于该院行产前检查的29089例孕妇进行宣教,其中3302例接受SMA携带者筛查,采用荧光定量PCR技术检测运动神经元存活基因1(SMN1)外显子7(E7)和外显子8(E8)的拷贝数筛查SMA携带者,并利用多重连接探针扩增(MLPA)技术对夫妻双方均为SMA携带者的高危胎儿进行产前诊断。结果SMA携带者筛查的接受率为11.35%。3302例孕妇中,共发现58例SMA携带者,总携带率为1.76%(1/57);其中汉族45例,携带率为1.63%(1/61);少数民族13例,携带率为2.39%(1/42)。58例携带者中,46例配偶接受SMA检测,结果显示有2对夫妻均为SMA携带者,进一步行胎儿产前诊断,MLPA检测结果提示胎儿均为SMN1 E7和E8杂合缺失,均建议继续妊娠。结论本研究初步确定了新疆地区孕妇SMA携带率,孕妇SMA携带者筛查和高风险胎儿的产前诊断对出生缺陷防控具有重要意义。 展开更多
关键词 脊髓性肌萎缩症 运动神经元存活基因1 多重连接探针扩增 携带者筛查 拷贝数
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运用MLPA技术分析脊髓性肌萎缩症患儿SMN1基因的部分缺失 被引量:4
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作者 张文慧 曹延延 +4 位作者 宋昉 瞿宇晋 白晋丽 金煜炜 王红 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期430-434,共5页
目的通过对运动神经元生存基因1(SMN1)部分缺失的脊髓性肌萎缩症(SMA)病例进行分析,探讨SMN1基因突变的多样性。方法采用多重连接探针扩增(MLPA)技术分析2011至2013年期间在首都儿科研究所遗传研究室进行基因诊断的7例临床疑似SM... 目的通过对运动神经元生存基因1(SMN1)部分缺失的脊髓性肌萎缩症(SMA)病例进行分析,探讨SMN1基因突变的多样性。方法采用多重连接探针扩增(MLPA)技术分析2011至2013年期间在首都儿科研究所遗传研究室进行基因诊断的7例临床疑似SMA患儿的SMN基因拷贝数。选取SMN1和SMN2基因均为2拷贝的样品作为阴性对照,SMN1基因0拷贝同时SMN2基因2拷贝的样品为阳性对照。应用Coffalyser(版本22.02.2012)软件分析处理MLPA结果。根据MLPA试剂盒的说明判定SMN1和SMN2基因外显子7、8,以及SMN基因(SMN1+SMN2)外显子1、4、6、8的拷贝数。结果7例SMA患儿的SMN1基因均发生了部分缺失。部分缺失类型共分为两种,类型一为SMN1基因仅外显子7缺失,类型二为SMN1基因外显子1、4、7缺失。两种类型的部分缺失均包含了SMN1基因外显子7的缺失。结论SMN1基因部分缺失进一步表明SMN基因结构不稳定。SMN1基因外显子7的缺失为SMA发病的主要原因。 展开更多
关键词 脊髓性肌萎缩 儿童 基因缺失 运动神经元生存基因 多重连接探针扩增技术
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利用实时荧光定量PCR分析孕中期羊水细胞SMN1基因缺失 被引量:4
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作者 胡荷宇 傅行礼 +5 位作者 俞菁 张蓓 唐振华 陈慧芬 章莉 龚波 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期418-422,共5页
目的探讨采用羊水样本进行脊髓性肌萎缩症(SMA)产前诊断的方法。方法利用基于短串联重复序列(STR)遗传标记的分子检测技术对2015年1月至2016年1月4家医院1064份孕中期妇女羊水进行母血污染检测,对无母血污染的羊水样本采用实时荧... 目的探讨采用羊水样本进行脊髓性肌萎缩症(SMA)产前诊断的方法。方法利用基于短串联重复序列(STR)遗传标记的分子检测技术对2015年1月至2016年1月4家医院1064份孕中期妇女羊水进行母血污染检测,对无母血污染的羊水样本采用实时荧光定量PCR进行SMN1基因缺失情况检测,多重连接探针扩增(MLPA)验证实时荧光定量PCR的SMN1基因检测结果。结果1064份孕中期妇女羊水经STR分型检测,2份存在母血污染,其余1062份无母血污染的羊水样本经实时荧光定量PCR检测结果显示,39例孕妇胎儿存在SMN1基因第7外显子(E7)杂合缺失(3.67%),34例孕妇胎儿存在SMN1基因第8外显子(E8)杂合缺失(3.2%),2例孕妇胎儿存在E7纯合缺失、E8纯合缺失(0.19%),其余病例E7、E8均未发现缺失。MLPA对41例SMN1杂合或纯合缺失样本以及55例未检出SMN1缺失样本验证结果均与实时荧光PCR检测结果一致。结论实时荧光定量PCR及MLPA均可用于对孕中期妇女胎儿的SMN1基因缺失情况的检测,实时荧光定量PCR样本需求量少,检测更快速。 展开更多
关键词 肌萎缩 脊髓性 羊水 运动神经元生存蛋白质1 基因缺失 实时聚合酶链 反应 多重聚合酶链反应
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Compound heterozygous mutation in two unrelated cases of Chinese spinal muscular atrophy patients 被引量:15
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作者 QU Yu-jin SONG Fang +2 位作者 YANG Yan-ling JIN Yu-wei BAI Jin-li 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2011年第3期385-389,共5页
Background Infantile proximal spinal muscular atrophy (SMA) is a common autosomal recessive neuromuscular disorder. Approximately 90-95% cases of SMA result from homozygous deletion of survival motor neuron gene 1(... Background Infantile proximal spinal muscular atrophy (SMA) is a common autosomal recessive neuromuscular disorder. Approximately 90-95% cases of SMA result from homozygous deletion of survival motor neuron gene 1(SMN1) and 5% cases are caused by compound heterozygous mutation (a SMN1 deletion on one allele and a subtle mutation on the other allele).Methods In this research, two unrelated patients were clinically diagnosed according to the criteria of proximal SMA. Genetic diagnosis was performed to detect the homozygous deletion of exon 7 of SMN1 by PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP) and genomic sequencing. Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) analysis was carried out to measure copy numbers of SMN1, SMN2 and neuronal apoptosis inhibitor protein (NAIP) in the patients. Further sequencing of SMN1allele-specific PCR (AS-PCR) and SMN1 clones were also performed to analyze the point mutation of SMN1 gene. Additionally,the pedigree analysis of these two families was carried out to identify the transmission of the mutation.Results The inconsistent results using PCR-RFLP and genomic sequencing showed homozygous deletion of exon 7 of SMN1 and heterozygous deletion accompanied with a suspicious mutation in SMN1 gene, respectively. MLPA analysis of these two cases exhibited one SMN1 copy deletion. One identical c.863G〉T (p. Arg288Met) mutation was found in two cases by sequencing the SMN1 clones, which confirmed that both cases were SMA compound heterozygotes. One case showed partial conversion to form hybrid SMN (SMN2 17/SMN1 E8) identified by clones sequencing and another case carrying 3 SMN2 implied complete conversion from SMN1 to SMN2.Conclusion p. Arg288Met is more a disease-causing mutation than a polymorphism variation, and children with this mutation may have more severe phenotypes. 展开更多
关键词 spinal muscular atrophy survival motor neuron gene 1 compound heterozygous mutation gene conversion
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脊髓性肌萎缩症的发病机制及诊治的研究进展 被引量:2
14
作者 王康 赵慧 +1 位作者 高敏 张敬军 《中国临床神经科学》 2023年第2期226-230,共5页
脊髓性肌萎缩症是一组常见的常染色体隐性遗传病,以脊髓前角运动神经元退行性变而导致的进行性、对称性肌萎缩和肌张力减低为临床特征。共分为4种类型即脊髓性肌萎缩症Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型,其临床诊断主要依赖于临床表现、家族遗传史、实... 脊髓性肌萎缩症是一组常见的常染色体隐性遗传病,以脊髓前角运动神经元退行性变而导致的进行性、对称性肌萎缩和肌张力减低为临床特征。共分为4种类型即脊髓性肌萎缩症Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型,其临床诊断主要依赖于临床表现、家族遗传史、实验室检查及基因检测。文中对脊髓性肌萎缩症的发病机制及诊治进展进行综述。 展开更多
关键词 脊髓 肌萎缩 运动神经元存活基因 外显子纯合缺失
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应用基因组测序技术诊断缺失型脊肌萎缩症 被引量:4
15
作者 曹延延 瞿宇晋 +5 位作者 宋昉 白晋丽 金煜炜 王红 李燕 张文慧 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期410-414,共5页
目的评价基因组测序技术在诊断缺失型脊肌萎缩症(spinal muscular atrophy, SMA)中的应用。方法应用聚合酶链反应扩增100例SMA临床确诊患儿和110名对照样本的运动神经元存活基因(spinal muscular atrophy,SMN),基因组测序技术通过... 目的评价基因组测序技术在诊断缺失型脊肌萎缩症(spinal muscular atrophy, SMA)中的应用。方法应用聚合酶链反应扩增100例SMA临床确诊患儿和110名对照样本的运动神经元存活基因(spinal muscular atrophy,SMN),基因组测序技术通过识别扩增片段中SMN1和SMN2的4个差异位点用来诊断SMN1的纯合缺失,并以多重连接探针扩增进行验证。结果100例SMA样本中基因组测序显示差异位点仅有SMN2基因特有碱基峰,多重连接探针扩增检测示SMN1与SMN2拷贝数为0:2或0:3,表明SMN1基因纯合缺失。对照组中5例样本的差异位点仅为SMN1基因特有碱基峰,SMN1与SMN2拷贝数为2:0,为SMN2纯合缺失。105例样本的差异位点均为杂合峰,SMN1与SMN2拷贝数为2:2,未显示SMN1和SMN2的缺失。所有测序结果与MLPA检测结果一致。结论基因组测序技术在进行缺失型脊肌萎缩症的分子诊断中具有特异、准确、实用的特点。 展开更多
关键词 基因组测序 脊肌萎缩症 运动神经元存活基因 纯合缺失
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基于脊髓性肌萎缩症注册队列人群的基因诊断技术应用调查分析 被引量:2
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作者 白晋丽 瞿宇晋 +5 位作者 宋昉 曹延延 贾妮 王嘉 金煜炜 王红 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期743-748,共6页
目的调查分析基于中国罕见病注册系统中脊髓性肌萎缩症(SMA)队列人群相关基因诊断技术的应用现况和发展趋势。方法本项横断面调查研究以2016年7月至2018年12月在首都儿科研究所注册登记的200例SMA患儿为研究对象,通过查阅注册信息、基... 目的调查分析基于中国罕见病注册系统中脊髓性肌萎缩症(SMA)队列人群相关基因诊断技术的应用现况和发展趋势。方法本项横断面调查研究以2016年7月至2018年12月在首都儿科研究所注册登记的200例SMA患儿为研究对象,通过查阅注册信息、基因检测报告以及电话随访等方式获得患儿基本信息、疾病分型、基因型、基因诊断相关信息等。按照检测时间分层后,分别统计采用不同基因诊断技术的人数和构成比,采用Pearson相关分析基因诊断技术的应用与时间的相关性。结果除3例资料不全的病例,共纳入197例SMA病例。SMAⅠ、Ⅱ和Ⅲ型的患儿分别为37例(18.8%)、115例(58.4%)和45例(22.8%),SMN1基因纯合缺失和复合杂合变异病例分别为185(93.9%)和12例(6.1%)。2004—2017年SMA基因诊断技术有7种:以多重连接探针扩增技术(MLPA)为主,占54.1%(100/185),其次是聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和一代测序,分别为22.7%(42/185)和10.3%(19/185),等位基因特异性PCR(AS-PCR)、实时定量PCR(qPCR)、全外显子组测序(WES)及变性高效液相色谱分析(DHPLC)分别9、6、5和4例,占2.2%~4.9%。MLPA的应用从2010年开始逐步增加(r=0.95,P<0.05),而PCR-RFLP从2004年开始逐步下降(r=-0.99,P<0.05),其他检测方法应用与时间暂未发现相关性(P>0.05)。定量检测技术(MLPA、qPCR和DHPLC)的应用从2010年开始逐渐增高(r=0.94,P<0.05),定性检测技术(PCR-RFLP、一代测序、AS-PCR和WES)从2004年开始逐渐下降(r=-0.94,P<0.05)。纯合缺失与复合杂合变异的基因重复检测率分别为12.4%(23/185)和41.7%(5/12),差异有统计学意义(χ^(2)=5.86,P<0.05)。基因检测结果显示,同时提供SMN1、SMN2基因定量分析报告的构成比在2008—2015年为56.8%(21/37),2016—2017年上升至69.1%(56/81)。结论SMA基因检测技术从定性检测技术逐步发展为以MLPA和qPCR为主的定量检测技术。SMA定量检测报告不仅提供了SMN1致病基因的定量结果,也提供了SMN2修饰基因的定量结果。 展开更多
关键词 肌萎缩 脊髓性 分子诊断技术 SMN1基因 SMN2基因
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