啤酒花潜隐类病毒研究进展

啤酒花潜隐类病毒在啤酒花上的感染较普遍,且一般不产生明显症状,给生产带来一定损失。对于该类病毒病害,较为可行的控制措施是实行检疫控制其扩展和培育与栽培无类病毒苗。较为系统地综述了国内外啤酒花潜隐类病毒的分布与危害、生物学特性、基因组结构与序列分析、检测方法及防治与控制等方面的研究进展。

啤酒花潜隐类病毒的实时荧光RT-PCR检测

根据啤酒花潜隐类病毒(HpLVd)各分离物基因序列,设计并合成1对特异性引物和1条TaqMan-MGB探针,建立了对HpLVd的实时荧光RT-PCR检测方法。通过对反应体系的优化,确定了HpLVd的实时荧光RT-PCR最佳反应条件:Mg2+终浓度为5.5 mmol/L,引物终浓度为0.7μmol/L,探针终浓度为0.5μmol/L。灵敏度对比试验结果显示,实时荧光RT-PCR的灵敏度较普通RT-PCR通过琼脂糖凝胶电泳高10倍,在25μL反应体系中,总RNA含量达到20 pg就能通过实时荧光RT-PCR检测出来。此方法也能成功检测田间样品上的啤酒花潜隐类病毒。

啤酒花潜隐类病毒北京分离物的分子鉴定和序列分析

应用RT-PCR方法对采自北京地区的啤酒花样品进行检测,结果表明啤酒花携带啤酒花潜隐类病毒(Hop latent viroid,HLVd)。将此分离物(HLVd-bj)的全基因组序列克隆后进行序列分析,结果表明HLVd-bj的基因组全长为256bp,与已经报道中国新疆地区的HLVd分离物同源性达100%,与美国HLVd分离物同源性达99%,表明该分离物为啤酒花潜隐类病毒。二级结构比对的结果表明,碱基变异位置基本在左手区(T1),致病区(P)以及右手末端区(T2)。