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兼容型maizeSNP384标记筛选与玉米杂交种DNA指纹图谱构建 被引量:12
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作者 田红丽 杨扬 +7 位作者 王璐 王蕊 易红梅 许理文 张云龙 葛建镕 王凤格 赵久然 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1006-1015,共10页
为加强玉米品种管理和知识产权保护,评估确定了一套兼容多技术平台,适于玉米分子鉴定的SNP位点组合,该组合包含384个位点;构建了335个玉米杂交种SNP-DNA指纹,并针对位点和样品从各个角度进行分析。384个位点全部分布在基因内区域,显示... 为加强玉米品种管理和知识产权保护,评估确定了一套兼容多技术平台,适于玉米分子鉴定的SNP位点组合,该组合包含384个位点;构建了335个玉米杂交种SNP-DNA指纹,并针对位点和样品从各个角度进行分析。384个位点全部分布在基因内区域,显示了较好的多态性;MAF、PIC、DP平均值分别为0.39、0.36、0.60,384个位点中88%的位点MAF值高于0.30,98%的位点PIC值高于0.30,98%的位点DP值高于0.50。对335个玉米杂交种进行遗传相似系数两两比较,GD(1−Nei遗传距离)的变异范围为0.60~0.99,GD≥0.98、0.95、0.90者分别占比0.10%、0.38%、1.40%;GS(相同等位基因比)的变异范围为0.50~0.99,GS≥0.98、0.95、0.90者分别占比0.03%、0.11%、0.35%。从384个位点中抽取最优位点组合,12个位点组合时品种识别率为0.99,20个位点组合能够识别335个品种。综上所述,本研究报道的384个核心SNP位点具有兼容多平台、高稳定性、高重复性、高品种区分能力,利用核心位点构建了335个玉米杂交种SNP-DNA指纹,为玉米品种分子鉴定、指纹数据构建以及分子育种提供了关键数据支撑。 展开更多
关键词 玉米 SNP 位点组合 品种分子鉴定 dna指纹图谱 芯片
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利用SSR分子标记构建Y58S及部分重要两系杂交水稻亲本的DNA指纹图谱 被引量:16
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作者 武文 邓启云 +5 位作者 周丽洁 朱校奇 陈春光 庄文 金德敏 王斌 《杂交水稻》 CSCD 北大核心 2008年第3期52-56,共5页
以优良光温敏核不育系Y58S及其杂交组合Y两优1号和生产中广泛应用的部分光温敏核不育系和恢复系等18个水稻品种为材料,利用SSR分子标记进行了DNA指纹图谱的构建。聚类分析表明,18个供试水稻品种的遗传相似度为0.672-0.945;利用筛选到的R... 以优良光温敏核不育系Y58S及其杂交组合Y两优1号和生产中广泛应用的部分光温敏核不育系和恢复系等18个水稻品种为材料,利用SSR分子标记进行了DNA指纹图谱的构建。聚类分析表明,18个供试水稻品种的遗传相似度为0.672-0.945;利用筛选到的RM164、RM18和RM258等3对引物扩增出的14条多态性片段初步构建了18个供试水稻品种的DNA指纹图谱,每个品种的DNA指纹图谱具有特异性,可互相鉴别;引物RM164可在超级杂交稻组合Y两优1号、两优培九中扩增出父母本的互补带型,从而可鉴别其杂交种子中混杂的母本杂株。 展开更多
关键词 两系杂交水稻 Y58S dna指纹图谱 SSR分子标记 种质鉴定
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烟草品种的DNA指纹图谱和品种鉴定 被引量:21
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作者 梁明山 刘煜 +1 位作者 侯留记 李霞桥 《烟草科技》 EI CAS 2001年第1期34-37,共4页
随机扩增多态性DNA(RAPD)是目前常用的DNA指纹图谱技术。采用改进的“ROSE法”提取DNA ,并建立了重复性较好的RAPD标准分析条件。在此标准条件下 ,检测了烟草 10个品种材料基因组的多态性。经 10个引物扩增 ,在得到的 53条扩增带中 ,有... 随机扩增多态性DNA(RAPD)是目前常用的DNA指纹图谱技术。采用改进的“ROSE法”提取DNA ,并建立了重复性较好的RAPD标准分析条件。在此标准条件下 ,检测了烟草 10个品种材料基因组的多态性。经 10个引物扩增 ,在得到的 53条扩增带中 ,有 10个片段为 10个材料所共有 ,多态性达81.1%。其中引物P7的扩增图谱 ,各品种间可以互相区别 ,差异明显 ,可用作烟草 展开更多
关键词 烟草 RAPD dna指纹图谱 品种鉴定
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酒花品种的DNA指纹鉴定技术 被引量:2
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作者 谷方红 张五九 +3 位作者 李海峰 冯景章 林智平 陈江安 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期23-26,共4页
采用DNA指纹技术对国内外 5个酒花品种进行了鉴定 ,并对不同酶切组合及 2 0对引物组合进行了筛选。结果发现 ,酶切组合E/M ,P/M以及 5对引物组合均可以扩增出较清晰的条带。通过其中任何一组引物均可鉴别国内的 2个酒花品种。国外的 3... 采用DNA指纹技术对国内外 5个酒花品种进行了鉴定 ,并对不同酶切组合及 2 0对引物组合进行了筛选。结果发现 ,酶切组合E/M ,P/M以及 5对引物组合均可以扩增出较清晰的条带。通过其中任何一组引物均可鉴别国内的 2个酒花品种。国外的 3种酒花由于遗传的相似性 ,不容易区分 ,但通过几组引物综合判断 。 展开更多
关键词 啤酒 酒花 品种鉴定 dna指纹鉴定技术 遗传图谱
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利用DNA指纹图谱进行农作物品种鉴定的研究进展 被引量:19
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作者 佘花娣 陈景堂 +2 位作者 黄亚群 祝丽英 池书敏 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第z1期28-30,33,共4页
阐述了利用DNA指纹技术 (如RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR和STS等 )进行品种鉴定的原理、特点及其研究概况。与形态学鉴定、同工酶鉴定相比 ,DNA指纹技术是通过检测DNA水平上的差异来鉴定品种 ,具有准确、可靠、不受环境因素影响、且可... 阐述了利用DNA指纹技术 (如RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR和STS等 )进行品种鉴定的原理、特点及其研究概况。与形态学鉴定、同工酶鉴定相比 ,DNA指纹技术是通过检测DNA水平上的差异来鉴定品种 ,具有准确、可靠、不受环境因素影响、且可鉴定表型上难于鉴别的品种等优点。DNA指纹技术简单、快速、易于自动化 。 展开更多
关键词 dna指纹图谱 品种鉴定 农作物
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SSR标记在宁波地区水稻品种DNA指纹图谱构建及纯度鉴定中的应用 被引量:11
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作者 王明湖 张孝天 +2 位作者 吴国林 蒋琪 施勇烽 《中国稻米》 2019年第6期50-54,共5页
利用农业行业标准NY/T-1433-2007、NY/T-1433-2014中推荐的53对SSR引物,对宁波地区34个水稻品种进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。53对引物在研究材料中共获得183个等位基因,每对引物得到的等位基因数为1~7个,平均每对引物可获得3.... 利用农业行业标准NY/T-1433-2007、NY/T-1433-2014中推荐的53对SSR引物,对宁波地区34个水稻品种进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。53对引物在研究材料中共获得183个等位基因,每对引物得到的等位基因数为1~7个,平均每对引物可获得3.5个等位基因。遗传相似性和聚类分析结果表明,34份水稻品种在遗传相似系数为0.5处可分为籼粳两个类群,其中,甬优系列籼粳杂交组合、6个常规粳稻及3个糯稻归为粳稻类群,6个常规籼稻和5个杂交籼稻归为籼稻类群。用RM590和RM3331对19个甬优杂交稻系列品种进行100粒种子的纯度鉴定,仅甬优2640和甬优50检测到1个单株的混杂。结果为SSR标记在宁波水稻品种的纯度和真伪鉴定方面的应用提供了一定的技术支撑。 展开更多
关键词 水稻 品种鉴定 SSR标记 dna指纹
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中国玉米审定品种标准SSR指纹库的构建 被引量:73
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作者 王凤格 杨扬 +8 位作者 易红梅 赵久然 任洁 王璐 葛建镕 江彬 张宪晨 田红丽 侯振华 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期1-14,共14页
【目的】对数量庞大的已知玉米品种构建可共享的作物品种标准DNA指纹库。【方法】基于荧光毛细管电泳检测平台和植物品种DNA指纹库管理系统,利用筛选的40对SSR核心引物对3 998份中国玉米审定品种标准样品进行建库,通过多实验室、多检测... 【目的】对数量庞大的已知玉米品种构建可共享的作物品种标准DNA指纹库。【方法】基于荧光毛细管电泳检测平台和植物品种DNA指纹库管理系统,利用筛选的40对SSR核心引物对3 998份中国玉米审定品种标准样品进行建库,通过多实验室、多检测平台进行建库数据的质量评估。【结果】绘制了40个玉米建库引物的等位基因频率分布图作为每个引物的特征图谱,在建库试验中发挥了相当于参照样品的作用。形成了一套十重荧光毛细管电泳组合,并在SSR指纹分析器中建立了一套系统默认PANEL作为不同实验室建库时的标准PANEL。统计玉米审定品种指纹库构建的试验情况,每份样品具有2—5套原始试验数据及对应的指纹图谱,其中61%的样品做了2组独立试验,33%的样品做了3组独立试验,最终建成的标准指纹库累计缺失和差异位点仅占0.2%,数据完整性达到99.8%。在不同实验室、不同电泳检测平台的评估结果表明,同一荧光电泳检测平台上获得SSR指纹数据一致性高,而不同的电泳检测平台获得的数据存在一定偏差,为实现不同实验室的SSR指纹数据共享,需要统一荧光引物、分析软件及电泳检测平台。对所有审定品种指纹数据进行整体两两比较,表明中国玉米审定品种之间差异比较大,品种间差异位点百分比集中在80%—95%(占78.28%),品种间差异位点百分比在50%以上的已达到99.21%,而低于20%的只有0.09%;对玉米审定品种杂合率水平进行分析,平均品种杂合率达到64%,主要集中在50%—80%(占89%)。通过玉米品种标准指纹比对服务平台(网址:http://www.maizedna.org/)实现了指纹库的共享。【结论】形成了构建作物品种SSR指纹库的标准化程序,构建了3 998份玉米审定品种的SSR指纹库,通过多实验室联合比较试验,保证建库数据的准确性和数据库的可共享性;建立了玉米品种标准指纹比对服务平台网站,实现玉米审定品种指纹库在全国种子检验系统的共享。 展开更多
关键词 玉米 品种鉴定 dna指纹库 SSR
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柑橘品种鉴定的SSR标记开发和指纹图谱库构建 被引量:61
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作者 李益 马先锋 +7 位作者 唐浩 李娜 江东 龙桂友 李大志 牛英 韩瑞玺 邓子牛 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第15期2969-2979,共11页
【目的】筛选出一套SSR核心引物,用于构建柑橘品种的DNA指纹图谱库,为柑橘种苗认证、品种登记和植物新品种保护提供技术支撑。【方法】以柑橘属8个主要栽培种类为试材进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测,筛选出多态性丰富、扩增... 【目的】筛选出一套SSR核心引物,用于构建柑橘品种的DNA指纹图谱库,为柑橘种苗认证、品种登记和植物新品种保护提供技术支撑。【方法】以柑橘属8个主要栽培种类为试材进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测,筛选出多态性丰富、扩增条带稳定的引物对部分参试品种进行PCR扩增,扩增产物通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行进一步的引物筛选;筛选得到的引物进行荧光标记,并选用部分柑橘品种进行PCR扩增,扩增产物利用基因分析仪检测,分别计算各引物的PIC值、等位基因数目,选取一套多态性丰富的适合进行荧光毛细管电泳检测的SSR引物组合,进而对所有参试品种进行分析,构建柑橘品种的DNA指纹图谱库,同时利用筛选的SSR标记对参试品种进行鉴定。【结果】初期以柑橘属8个种的代表品种(太田椪柑、沙田柚、沅江酸橙、大红甜橙、邓肯葡萄柚、枸橼、费米耐劳柠檬和墨西哥来檬)为材料,用362对SSR引物进行PCR扩增,扩增产物经4%琼脂糖凝胶电泳检测,初步筛选出80对种间多态性高、扩增稳定的SSR引物;进一步从8个种类里选择不同类型的64个柑橘品种,用上述筛选出的80对SSR引物进行PCR扩增,扩增产物经6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,再筛选出60对品种类型间多态性高、扩增稳定、条带清晰的SSR引物,并分别进行荧光标记;另以168份柑橘品种为材料对上述60对SSR引物进行PCR扩增,经荧光毛细管电泳检测,依据各引物的PIC值、等位基因数目、峰图读取难易程度、扩增稳定性及染色体位置等,最终筛选出21对SSR引物作为指纹图谱库构建的核心引物。为消除不同仪器、不同试验批次等引起的误差,为21对SSR引物各主要等位变异选择相应的参照品种。根据各引物标记的荧光颜色及扩增片段大小进行合理组合,21对SSR引物可分成5组进行多重电泳,共采集500份柑橘品种的DNA指纹。利用SSR标记,有111份品种仅用1对引物即可鉴别,86份品种用2对引物组合即可鉴别,24份品种用3对引物组合即可鉴别,另外279份品种虽无法单独一一鉴别,但可分为87个小组,组内品种无法区分,组间品种易鉴别。【结论】利用筛选出的21对SSR核心引物,构建了包含500份柑橘品种的DNA指纹图谱库,筛选出部分品种的特异标记,可以鉴别221份柑橘品种和87个品种组合,构建了基于毛细管电泳平台的柑橘SSR分子标记品种鉴定体系。 展开更多
关键词 柑橘 SSR 毛细管电泳 品种鉴定 dna指纹图谱库
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应用AFLP分子标记鉴定苹果品种 被引量:92
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作者 祝军 王涛 +2 位作者 赵玉军 张文 李光晨 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期102-106,共5页
在建立苹果品种AFLP分析体系的基础上 ,从 6 8对引物中筛选出了 4对多态性高、分辨能力强的引物 (即P32M4 6、P4 4M53、P59M4 1和P79M6 1)。分析了P32M4 6引物绘制的我国 2 5个苹果重要品种的AFLP指纹图谱的遗传多样性 ,确定了各供试品... 在建立苹果品种AFLP分析体系的基础上 ,从 6 8对引物中筛选出了 4对多态性高、分辨能力强的引物 (即P32M4 6、P4 4M53、P59M4 1和P79M6 1)。分析了P32M4 6引物绘制的我国 2 5个苹果重要品种的AFLP指纹图谱的遗传多样性 ,确定了各供试品种的差异带 ,区分了供试的 2 5个苹果品种。对AFLP分析的关键步骤进行了讨论 ,并对生产上应用AFLP技术检测苹果品种真实性和纯度作了展望。 展开更多
关键词 AFLP dna指纹 苹果鉴定 遗传多样性
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分子标记技术在棉花品种鉴定上的研究进展 被引量:34
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作者 匡猛 杨伟华 +4 位作者 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 王俊芳 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2009年第4期330-334,共5页
DNA指纹技术的发展大体分为三个阶段:第一代的分子标记是以Southern杂交为基础的RFLP,第二代分子标记是以PCR为基础的各种DNA指纹标记,第三代分子标记是以单核苷酸多态性为基础的SNP。本文概述了品种鉴定技术的研究与应用进展,重点介绍... DNA指纹技术的发展大体分为三个阶段:第一代的分子标记是以Southern杂交为基础的RFLP,第二代分子标记是以PCR为基础的各种DNA指纹标记,第三代分子标记是以单核苷酸多态性为基础的SNP。本文概述了品种鉴定技术的研究与应用进展,重点介绍了用于棉花品种鉴定的四种主要的分子标记技术:RFLP、RAPD、AFLP和SSR,对每一种分子标记的技术原理、在棉花品种鉴定上的应用研究状况及存在的优缺点进行了具体阐述。通过比较分析,提出了SSR标记适用于棉花品种鉴定的独特优越性。并对基于SSR分子标记技术构建我国棉花品种DNA指纹库的重要意义与必要性进行了分析。 展开更多
关键词 棉花 分子标记 品种鉴定 dna指纹库
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板栗优良品种(无性系)苗木分子标记鉴别研究 被引量:18
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作者 翁尧富 陈源 +3 位作者 赵勇春 郑康乐 黄少甫 张建忠 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第2期51-55,共5页
利用RAPD标记对浙江省林木良种审定委员会审定 (认定 )和通过省级鉴定的 8个板栗品种及无性系进行指纹分析 ,鉴别出各板栗品种 (无性系 )。实验过程中对 684个随机寡核苷酸引物进行了重复筛选 ,经筛选共获得 9个稳定的RAPD标记 ,构建了... 利用RAPD标记对浙江省林木良种审定委员会审定 (认定 )和通过省级鉴定的 8个板栗品种及无性系进行指纹分析 ,鉴别出各板栗品种 (无性系 )。实验过程中对 684个随机寡核苷酸引物进行了重复筛选 ,经筛选共获得 9个稳定的RAPD标记 ,构建了板栗的DNA指纹图谱。经过大量的实验 ,确定了鉴别板栗优良品种 (无性系 )的较为理想的实验程序 ,获得了RAPD良好的重复性 ,建立了较完整的板栗RAPD分析的技术体系 ,用大田苗进行初步验证 。 展开更多
关键词 板栗 品种 无性系 鉴别 dna指纹图谱 PAPD标记
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SSR标记在江苏粳稻品种鉴定中的应用研究 被引量:14
12
作者 左示敏 周娜娜 +8 位作者 陈宗祥 许明 许学宏 毛从亚 汤义华 张亚芳 叶凯 顾世梁 潘学彪 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期46-51,共6页
利用农业行业标准"NY/T-1433—2007、NY/T-1433—2014"中分别推荐的24和48个SSR标记,对2013年江苏区试粳稻品系和2009~2014年间江苏审定品种中的46个粳稻品种进行鉴定,证实2个版本中的SSR标记均不能完全鉴别供试的江苏粳稻品种。以12... 利用农业行业标准"NY/T-1433—2007、NY/T-1433—2014"中分别推荐的24和48个SSR标记,对2013年江苏区试粳稻品系和2009~2014年间江苏审定品种中的46个粳稻品种进行鉴定,证实2个版本中的SSR标记均不能完全鉴别供试的江苏粳稻品种。以12个代表性粳稻品种为材料,从714个SSR标记中筛选到133个在代表性品种间存在多态性的标记,结合"NY/T-1433—2014"中的多态性标记共计153个,构建了46个粳稻品种的SSR指纹。以品种间SSR指纹差异位点数、标记分布均匀性及多态性评价指标值为筛选依据,从153个SSR标记中初步确定了52个核心标记用于江苏水稻品种鉴定,构建了46个粳稻品种的SSR指纹。对52个标记在江苏水稻尤其是粳稻品种鉴定中的优点及进一步完善的策略进行了讨论。 展开更多
关键词 粳稻 品种鉴定 核心SSR标记 dna指纹
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甘薯品种鉴定中指纹图谱的建立和应用 被引量:9
13
作者 郭金平 潘大仁 +1 位作者 许莉萍 袁照年 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第1期19-22,共4页
应用RAPD分析技术体系,构建了甘薯品种的指纹图谱.结果表明,在20μLPCR反应体积中,含有10mmol·L-1Tris-HCl(pH8.3)、50mmol·L-1KCl、2.5mmol·L-1MgCl2、100μmol·L-1dNTP、0.3μmol·L-1引物、40ng模板、1.5UTa... 应用RAPD分析技术体系,构建了甘薯品种的指纹图谱.结果表明,在20μLPCR反应体积中,含有10mmol·L-1Tris-HCl(pH8.3)、50mmol·L-1KCl、2.5mmol·L-1MgCl2、100μmol·L-1dNTP、0.3μmol·L-1引物、40ng模板、1.5UTaq酶的反应体系适合甘薯RAPD分析.利用上述甘薯RAPD分析的指纹图谱,鉴定了10个供试品种. 展开更多
关键词 甘薯 品种鉴定 dna指纹图谱 RAPD
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利用SSR分子标记建立杂交水稻指纹图谱 被引量:11
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作者 李莉 宋书锋 +3 位作者 刘全胜 付岳峰 符习勤 戴恒 《长江大学学报(自科版)(中旬)》 CAS 2008年第4期67-70,78,共5页
利用微卫星标记对大穗稻1126进行了DNA指纹图谱构建和品种鉴定的研究,77对引物中具有多态性的引物共36对,占所用引物的46.75%。利用这些SSR引物建立了1126的DNA指纹数据库,可以有效解决杂交水稻亲本1126的真伪性及与其他品种的区分问题... 利用微卫星标记对大穗稻1126进行了DNA指纹图谱构建和品种鉴定的研究,77对引物中具有多态性的引物共36对,占所用引物的46.75%。利用这些SSR引物建立了1126的DNA指纹数据库,可以有效解决杂交水稻亲本1126的真伪性及与其他品种的区分问题。三组引物RM21、RM505、RM212共同扩增可以很好地将1126与其亲本Lemont与蜀恢527区分开来,可作为大穗稻1126的特征引物加以鉴定。由此可见利用微卫星分子标记技术进行水稻种子质量鉴定应用前景广阔。 展开更多
关键词 杂交水稻 SSR标记 指纹图谱 品种鉴定
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杂交水稻品种指纹鉴定研究进展 被引量:8
15
作者 金伟栋 洪德林 《上海农业学报》 CSCD 2006年第1期104-108,共5页
从蛋白质指纹和DNA指纹两个方面,综述了杂交水稻品种指纹鉴定研究的进展和不足。对SSR标记在品种指纹鉴定上的应用前景,单一特异标记的筛选和实验室标准检测技术的建立作了探讨和展望,以利于加快杂交水稻品种指纹鉴定的发展和应用。
关键词 杂交水稻 品种指纹 蛋白质标记 dna标记 鉴定
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Advance of Study on SSR Molecular Marker in Citrus and Its Close Relatives
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作者 Xue-Fei Wang Zhi-Hui Wang Xi-Rui Xiong Qiao-Qiao Yan Xue-Li Pu 《Journal of Life Sciences》 2011年第12期1078-1084,共7页
Simple sequences repeat (SSR) molecular maker, as a new type of DNA molecular marker, the second generation based on the polymerase chain reaction (PCR), is valuable and of great potential as genetic markers for i... Simple sequences repeat (SSR) molecular maker, as a new type of DNA molecular marker, the second generation based on the polymerase chain reaction (PCR), is valuable and of great potential as genetic markers for its characteristics of abundant quantity, high polymorphic, reproducibility, specific site amplification, high occurring frequency, and co-dominant inheritance etc. This paper outlined its principles and characteristics, and introduced its application to variety identification, phylogenetic relationship analysis, genetic diversity analysis, DNA fingerprinting and linkage map constructing etc. in recent years in Citrus and its close relatives. 展开更多
关键词 CITRUS SSR variety identification phylogenetic relationship analysis genetic diversity analysis dna fingerprinting linkage map constructing.
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部分两用桃品种(系)指纹图谱的建立 被引量:7
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作者 李雪莲 王尚德 +2 位作者 刘佳棽 兰彦平 康向阳 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期505-511,共7页
以近亲个体‘顺10-16’、‘青北10-7’和‘贺春’为材料建立了两用桃AFLP研究体系,从64对引物组合中筛选出了E-AAT/M-ACT、E-AAT/M-CTG、E-ACA/M-CTG和E-ACA/M-CTT等4个多态性好、分辨率高的引物组合;应用该体系对‘锦春’等23个两用桃... 以近亲个体‘顺10-16’、‘青北10-7’和‘贺春’为材料建立了两用桃AFLP研究体系,从64对引物组合中筛选出了E-AAT/M-ACT、E-AAT/M-CTG、E-ACA/M-CTG和E-ACA/M-CTT等4个多态性好、分辨率高的引物组合;应用该体系对‘锦春’等23个两用桃品种(系)进行AFLP分析,结果共扩增出127条带,其中多态性带62条,多态性百分率48.8%,以其中特异性较高的23个多态性条带构建了这23个两用桃品系的指纹图谱,为两用桃品种鉴定及保护奠定了基础。 展开更多
关键词 两用桃 AFLP 指纹图谱 品种鉴定
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基于SSR标记的芥菜品种鉴定技术体系建立及应用 被引量:10
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作者 颜新林 管中荣 +6 位作者 温雯 张浙峰 王晨宇 沈进娟 汪启明 韩瑞玺 饶力群 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期758-770,共13页
利用SSR分子标记建立芥菜品种鉴定体系,旨在为我国芥菜育成品种鉴定提供高通量、快速鉴定方法。选取芥菜16个变种代表性品种用于SSR引物初筛,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳从432对引物中筛选出84对条带清晰、稳定性好、多态性高的芥菜SSR引物... 利用SSR分子标记建立芥菜品种鉴定体系,旨在为我国芥菜育成品种鉴定提供高通量、快速鉴定方法。选取芥菜16个变种代表性品种用于SSR引物初筛,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳从432对引物中筛选出84对条带清晰、稳定性好、多态性高的芥菜SSR引物,并对筛选出的引物5′端进行荧光标记。另外选取96份品种对上述84对引物进行复筛,利用基因分析仪对所有扩增片段大小进行分析,依据各引物的扩增稳定性、峰型易读取程度、多态性及染色体位置等,最终筛选出25对SSR引物作为核心引物,并为其设置参照品种以消除不同试验批次或平台等因素引起的误差。根据荧光颜色和扩增片段大小将25对核心引物分成6组,建立基于SSR标记的芥菜品种鉴定体系。利用该套核心引物构建了189份芥菜品种的DNA指纹数据库,共检测到175个等位变异,平均每对引物检测到7个等位变异;基因多样性指数变化为0.239~0.870,平均为0.555;多态性信息含量在0.23~0.86之间,平均为0.493。本研究建立的基于毛细管电泳平台的芥菜SSR分子标记品种鉴定体系,可用于芥菜品种真实性快速鉴定、遗传多样性分析和DUS测试近似品种辅助筛选等。 展开更多
关键词 芥菜 SSR标记 品种鉴定 dna指纹图谱
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基于全基因组SNP高效鉴定燕麦种质资源 被引量:3
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作者 徐金青 边海燕 +6 位作者 王寒冬 王蕾 张波 尤恩 李晓兰 陈文杰 沈裕虎 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期677-684,共8页
为探究鉴别燕麦品种特异性所需SNP标记的最少数量与鉴别效果,以25个生产上大面积推广的栽培燕麦品种为材料,利用燕麦IlluminaInc.iSelect6K微珠芯片进行基因分型,按照具有多态性、最小等位基因频率(MAF)大于0.05、缺失率小于0.50的条件... 为探究鉴别燕麦品种特异性所需SNP标记的最少数量与鉴别效果,以25个生产上大面积推广的栽培燕麦品种为材料,利用燕麦IlluminaInc.iSelect6K微珠芯片进行基因分型,按照具有多态性、最小等位基因频率(MAF)大于0.05、缺失率小于0.50的条件进行筛选,获得2214个高质量的SNP标记。所有SNP标记的平均MAF为0.75,平均多态性信息含量(PIC)为0.28。群体遗传结构分析将25个燕麦品种划分为5个类群。通过去冗余分析,获得8个能够高效鉴别燕麦参试品种的SNP标记。这8个SNP标记的平均MAF为0.62,平均PIC为0.35,表现出丰富的遗传多样性。测序结果显示,所筛选的8个SNP标记具有较好的稳定性和重现性。进一步利用这8个SNP标记构建了25个燕麦栽培品种的SNP指纹图谱,为燕麦栽培品种真实性鉴定和纯度检测提供了可用的标记组合。 展开更多
关键词 燕麦(AvenasativaL.) SNP 品种鉴定 dna指纹图谱
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基于SSR标记的莴苣品种鉴定体系的建立及应用 被引量:5
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作者 凌晨 赵洪 +6 位作者 颜军 马莹雪 冯艳芳 张靖立 李波 邓超 徐振江 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第4期34-44,共11页
为建立莴苣品种DNA分子快速鉴定技术体系,选择8个表型差异大、不同类型的莴苣品种,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳从245对引物中初筛出81对引物,对初筛引物添加荧光标记,另选择90个有代表性的莴苣品种,利用毛细管电泳复筛出22对核心引物,依据... 为建立莴苣品种DNA分子快速鉴定技术体系,选择8个表型差异大、不同类型的莴苣品种,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳从245对引物中初筛出81对引物,对初筛引物添加荧光标记,另选择90个有代表性的莴苣品种,利用毛细管电泳复筛出22对核心引物,依据扩增片段大小为各引物选择了相应的参照样品,采集了233个莴苣品种的DNA指纹数据。结果表明,22对核心引物在233个莴苣品种中共检测到269个等位基因,每对引物检测到等位基因为4~22个,平均为12.23个,PIC值为0.37~0.89,平均为0.73。聚类分析结果表明,233个供试品种主要划分为茎用和叶用两大类群,叶用类群中结球莴苣聚成一类,半结球莴苣趋于聚成一类,散叶莴苣难以聚成一类。对核心引物未能区分开的6组15个品种进行田间种植对比鉴定,3对品种表型性状无明显差异被判定为相同品种,表型性状有明显差异的品种大部分性状表达状态相同或相近,为近似品种,表明分子指纹聚类结果与基于表型的分类结果基本一致。此外,8组24个同名品种均能从分子上进行区分。利用筛选出的22对核心引物构建了233个莴苣品种的指纹数据库,建立了通用于茎用莴苣和叶用莴苣的品种鉴定技术体系,可用于莴苣品种和种质资源快速鉴定、遗传多样性分析和DUS测试辅助筛选近似品种等工作。 展开更多
关键词 莴苣 品种鉴定体系 SSR标记 dna指纹图谱 DUS测试
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