期刊文献+
共找到37篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
hsa-miR-22-3p靶基因预测及功能分析
1
作者 张伟 周涛 蒙国鑫 《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》 2024年第2期196-200,共5页
本研究旨在通过生物信息学分析,预测和验证hsa-miR-22-3p的靶基因,并探讨其在不同物种、组织和信号通路中的功能。方法 本研究利用了多种在线数据库和软件,如miRBase、ClustalOmega、Cytoscape3.6.1等,进行了对不同物种间的miR-22-3p保... 本研究旨在通过生物信息学分析,预测和验证hsa-miR-22-3p的靶基因,并探讨其在不同物种、组织和信号通路中的功能。方法 本研究利用了多种在线数据库和软件,如miRBase、ClustalOmega、Cytoscape3.6.1等,进行了对不同物种间的miR-22-3p保守性分析。预测hsa-miR-22-3p的靶基因,绘制Venn图,得到交集靶基因集合。对交集靶基因进行GO功能注释和KEGG Pathway富集分析,探索其在生物过程和信号通路中的作用。预测交集靶基因编码蛋白质之间的相互作用关系,构建蛋白蛋白互作网络图谱,筛选出核心基因。结果 miR-22-3p是一种在多种生物中高度保守的miRNA,与心肌细胞分化和心血管疾病密切相关。hsa-miR-22-3p的36个交集靶基因在肿瘤、淋巴和腹腔等组织中表达较高,参与了组蛋白修饰、染色质重构、低氧应答等276个生物学过程,在乳腺癌、雌激素、FoxO、破骨细胞分化、肿瘤、PI3KAkt等8个信号通路中显著富集。hsa-miR-22-3p的10个核心基因ESR1、SIRT1、PTEN、CREB1、SP1、HDAC4、MECP2、YWHAZ、MAPK14、SNAI1在多种疾病中发挥重要作用,如肿瘤、糖尿病、神经退行性疾病、炎症、衰老、心肌肥厚、心肌缺血再灌注、心房纤维化、动脉粥样硬化等。结论 本研究为hsa-miR-22-3p在肿瘤、心血管等多种疾病中的关键调控机制提供了新的理解,也为肿瘤、心血管等疾病的早期诊疗提供了新的思路。 展开更多
关键词 hsa-mir-22-3p 靶基因 生物信息学
下载PDF
Mex3a promotes oncogenesis through the RAP1/MAPK signaling pathway in colorectal cancer and is inhibited by hsa-miR-6887-3p 被引量:8
2
作者 Haixia Li Jinghui Liang +4 位作者 Jiang Wang Jingyi Han Shuang Li Kai Huang Chuanyong Liu 《Cancer Communications》 SCIE 2021年第6期472-491,共20页
Background:Although Mex3 RNA-binding family member A(Mex3a)has demonstrated an important role in multiple cancers,its role and regulatory mechanism in CRC is unclear.In this study,we aimed to investigate the role and ... Background:Although Mex3 RNA-binding family member A(Mex3a)has demonstrated an important role in multiple cancers,its role and regulatory mechanism in CRC is unclear.In this study,we aimed to investigate the role and clinical significance of Mex3a in CRC and to explore its underlying mechanism.Methods:Western blotting and quantitative real-time polymerase chain reaction(qRT-PCR)were performed to detect the expression levels of genes.5-Ethynyl-2’-deoxyuridine(EDU)and transwell assays were utilized to examine CRC cell proliferation and metastatic ability.The R software was used to do hierarchical clustering analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)pathway analysis.Overexpression and rescue experiments which included U0126,a specific mitogen activated protein kinase kinase/extracellular regulated protein kinase(MEK/ERK)inhibitor,and PX-478,a hypoxia-inducible factor 1 subunit alpha(HIF-1α)inhibitor,were used to study the molecularmechanisms of Mex3a in CRC cells.Co-immunoprecipitation(Co-IP)assay was performed to detect the interaction between two proteins.Bioinformatics analysis including available public database and Starbase software(starbase.sysu.edu.cn)were used to evaluate the expression and prognostic significance of genes.TargetScan(www.targetscan.org)and the miRDB(mirdb.org)website were used to predict the combination site between microRNA and target mRNA.BALB/c nude micewere used to study the function of Mex3a and hsa-miR-6887-3p in vivo.Results:Clinicopathological and immunohistochemical(IHC)studies of 101 CRC tissues and 79 normal tissues demonstrated that Mex3a was a significant prognostic factor for overall survival(OS)in CRC patients.Mex3a knockdown substantially inhibited the migration,invasion,and proliferation of CRC cells.Transcriptome analysis and mechanism verification showed that Mex3a regulated the RAP1 GTPase activating protein(RAP1GAP)/MEK/ERK/HIF-1αpathway.Furthermore,RAP1GAP was identified to interact with Mex3a in Co-IP experiments.Bioinformatics and dual-luciferase reporter experiments revealed that hsa-miR-6887-3p could bind to the 3’-untranslated regions(3’-UTR)of the Mex3amRNA.hsa-miR-6887-3p downregulated Mex3a expression and inhibited the tumorigenesis of CRC both in vitro and in vivo.Conclusions:Our study demonstrated that the hsa-miR-6887-3p/Mex3a/RAP1GAP signaling axis was a key regulator of CRC and Mex3a has the potential to be a new diagnostic marker and treatment target for CRC. 展开更多
关键词 Mex3a RAp1GAp microRNA hsa-mir-6887-3p MEK/ERK/HIF-1αsignaling colorectal cancer proliferation INVASION migration prognosis
原文传递
hsa-miR-877-3p通过靶向MCM10调控卵巢癌细胞迁移和活性氧产生 被引量:1
3
作者 彭琴 崔小波 +3 位作者 孙冰纯 罗辉 莫坚 吴斌华 《广东医科大学学报》 2023年第3期259-265,共7页
目的探讨has-miR-877-3p调控卵巢癌细胞迁移和活性氧(ROS)产生的作用机制。方法运用生物信息学分析hsa-miR-877-3p在卵巢癌组织中表达,RT-qPCR检测卵巢癌细胞株中hsa-miR-877-3p表达。构建hsa-miR-877-3p过表达及抑制SKOV3细胞,RNA干扰... 目的探讨has-miR-877-3p调控卵巢癌细胞迁移和活性氧(ROS)产生的作用机制。方法运用生物信息学分析hsa-miR-877-3p在卵巢癌组织中表达,RT-qPCR检测卵巢癌细胞株中hsa-miR-877-3p表达。构建hsa-miR-877-3p过表达及抑制SKOV3细胞,RNA干扰技术敲低SKOV3细胞中MCM10基因,划痕实验及流式细胞术分别检测细胞迁移、ROS水平。结果hsa-miR-877-3p在卵巢癌中表达低于正常组织(P<0.01),其在卵巢癌细胞株SKOV3、A2780、A1847和8910中表达也降低(P<0.01)。hsa-miR-877-3p过表达抑制SKOV3细胞迁移、增加ROS水平(P<0.01),而抑制hsa-miR-877-3p表达增加SKOV3细胞迁移(P<0.01)。MCM10基因沉默抑制SKOV3细胞迁移、促进ROS表达(P<0.01)。结论hsa-miR-877-3p可以通过调控MCM10基因抑制SKOV3细胞迁移并提高其活性氧水平。 展开更多
关键词 卵巢癌 hsa-mir-877-3p MCM10 活性氧
下载PDF
外泌体hsa-miR-522-3p通过调节CDK6参与卵巢癌进程
4
作者 李亚 张芳 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第23期4334-4340,共7页
目的:探讨外泌体hsa-miR-522-3p在卵巢癌发生发展中的作用及其潜在机制。方法:采用荧光实时定量PCR检测hsa-miR-522-3p在组织和细胞中的表达水平。使用EdU、Transwell和流式细胞术检测外泌体hsa-miR-522-3p对卵巢癌细胞增殖、迁移、侵... 目的:探讨外泌体hsa-miR-522-3p在卵巢癌发生发展中的作用及其潜在机制。方法:采用荧光实时定量PCR检测hsa-miR-522-3p在组织和细胞中的表达水平。使用EdU、Transwell和流式细胞术检测外泌体hsa-miR-522-3p对卵巢癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。通过荧光素酶测定和蛋白质印迹评估hsa-miR-522-3p对CDK6表达的调控作用。进一步构建裸鼠成瘤模型验证外泌体hsa-miR-522-3p对肿瘤生长的影响。结果:本研究发现hsa-miR-522-3p在卵巢癌组织、血浆外泌体及卵巢癌细胞的外泌体中表达显著升高。与NC组比较,hsa-miR-522-3p模拟物组细胞的迁移和侵袭能力显著增高且差异具有统计学意义(P<0.05)。此外,hsa-miR-522-3p抑制剂组可以促进caspase3和Bax的表达并抑制Bcl2的表达。荧光素酶报告结果显示,hsa-miR-522-3p能够靶向结合CDK6的3′-非翻译区(3′-UTR)来抑制其表达。裸鼠成瘤结果表明,外泌体hsa-miR-522-3p可增加瘤的体积及重量。结论:外泌体hsa-miR-522-3p通过调节CDK6参与卵巢癌的进程。本研究的发现将为外泌体hsa-miR-522-3p在卵巢癌发生中的机制提供新的见解。 展开更多
关键词 卵巢癌 外泌体 hsa-mir-522-3p CDK6
下载PDF
肝癌病人血清中长链非编码RNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p表达水平及其临床诊断价值分析
5
作者 罗兴红 杨柳 +2 位作者 董琪 田爱霞 龙丹 《临床外科杂志》 2023年第9期852-855,共4页
目的检测肝癌病人血清中长链非编码RNA BSN-AS2(lncRNA BSN-AS2)、hsa-miR-4782-3p表达水平,并分析两者在肝癌中的临床诊断价值。方法选取2018年3月~2020年3月在我院诊治的肝癌病人100例为研究组,另取同期体检健康者90例为对照组。采用... 目的检测肝癌病人血清中长链非编码RNA BSN-AS2(lncRNA BSN-AS2)、hsa-miR-4782-3p表达水平,并分析两者在肝癌中的临床诊断价值。方法选取2018年3月~2020年3月在我院诊治的肝癌病人100例为研究组,另取同期体检健康者90例为对照组。采用实时定量聚合酶链式反应法(qRT-PCR)检测病人血清中lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p的表达水平;采用Spearman等级相关分析血清中lncRNA BSN-AS2与hsa-miR-4782-3p表达的相关性,同时分析二者与临床病理特征的关系;受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p表达水平对肝癌的诊断效能。结果研究组血清lncRNA BSN-AS2的表达水平为(2.02±0.59),显著高于对照组的(1.05±0.25),研究组血清hsa-miR-4782-3p的表达水平为(0.69±0.15),低于对照组的(1.08±0.29),两组比较差异有统计学意义(P<0.05)。血清lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p表达水平与TNM分期、分化程度、甲胎蛋白(AFP)有关(P<0.05)。Spearman等级相关分析显示,肝癌病人血清lncRNA BSN-AS2与hsa-miR-4782-3p表达呈负相关(r=-0.536,P<0.05)。血清lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3单独及联合诊断肝癌的AUC分别是0.890、0.856和0.937,灵敏度分别为87.00%、93.00%和86.00%,特异度分别为78.89%、70.00%和92.22%;二者联合优于lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p各自单独预测(Z^(二者联合-lncRNA BSN-AS)=2.481、P=0.013,Z_(二者联合-hsa-miR-4782-3P)=3.503,P=0.001)。结论肝癌病人血清lncRNA BSN-AS2表达水平显著升高,hsa-miR-4782-3p水平显著降低,可作为诊断肝癌的潜在分子标志物。 展开更多
关键词 肝癌 长链非编码RNA BSN-AS2 hsa-mir-4782-3p 临床诊断
下载PDF
Hsa-miR-98-5p/DKK3信号轴对乳腺癌细胞生物学行为的影响 被引量:3
6
作者 姚嘉 李冠乔 +1 位作者 杨时平 苏慧銮 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期807-816,共10页
背景与目的:乳腺癌威胁着全世界女性的健康。虽然已发现大量微小RNA(microRNA,miRNA)在乳腺癌中异常表达,但仍需要构建一个完整的miRNA-信使RNA(messenger RNA,mRNA)网络。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据... 背景与目的:乳腺癌威胁着全世界女性的健康。虽然已发现大量微小RNA(microRNA,miRNA)在乳腺癌中异常表达,但仍需要构建一个完整的miRNA-信使RNA(messenger RNA,mRNA)网络。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载乳腺癌相关数据集,分析肿瘤组织与正常组织之间差异表达的miRNA。利用miRDB、miRTarBase和StarBase数据库分析差异miRNA靶向的基因。使用R语言中的ClusterProfiler包对靶基因进行富集分析。使用String数据库联合Cytoscape 3.6.2软件进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析及Hub基因的筛选;构建miRNA-Hub mRNA调控网络确定研究信号轴,然后通过细胞实验进行验证。结果:采用TCGA数据集识别出两个差异miRNAs。3个数据库取交集预测得到278个靶基因。共鉴定出10个Hub基因,从构建的miRNA-Hub基因网络图中发现,hsa-miR-98-5p/DKK3轴可能在乳腺癌的进展中起关键作用。细胞功能学实验证实hsa-miR-98-5p可抑制细胞凋亡,促进细胞的增殖、迁移和侵袭。双荧光素酶报告基因实验进一步验证了hsa-miR-98-5p与DKK3的结合作用。结论:本研究首先通过生物信息学分析鉴定出一个与乳腺癌进展相关的hsa-miR-98-5p/DKK3轴,初步证实hsa-miR-98-5p可通过靶向DKK3抑制乳腺癌细胞凋亡,促进细胞的增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 乳腺癌 hsa-mir-98-5p DKK3 双荧光素酶活性报告实验
下载PDF
Hsa-miR-21-3p对食管癌细胞运动与侵袭能力的影响 被引量:1
7
作者 石亚娟 刘辉 刘冉 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2013年第6期422-425,共4页
目的:研究hsa-miR-21-3p对人食管癌细胞Eca9706侵袭和迁移能力的影响。方法:采用终浓度为30 nmol/L的寡核苷酸hsa-miR-21-3p mimics和阴性对照转染Eca9706细胞48 h后,用实时荧光定量PCR检测转染后hsa-miR-21-3p的表达水平,通过Transwel... 目的:研究hsa-miR-21-3p对人食管癌细胞Eca9706侵袭和迁移能力的影响。方法:采用终浓度为30 nmol/L的寡核苷酸hsa-miR-21-3p mimics和阴性对照转染Eca9706细胞48 h后,用实时荧光定量PCR检测转染后hsa-miR-21-3p的表达水平,通过Transwell体外侵袭试验和划痕愈合试验分别观察hsa-miR-21-3p对Eca9706细胞侵袭和迁移能力的影响。结果:与阴性对照组相比4较,hsa-miR-21-3p mimics转染组细胞中hsa-miR-21-3p表达明显升高(P<0.01),是阴性对照的1.1×10倍;Transwell体外侵袭试验结果显示镜下每个视野穿膜细胞数试验组(76.67±6.11)较阴性对照组(42.33±2.52)增加了81.1%(P<0.01),表明hsa-miR-21-3p的过表达显著增强食管癌细胞的侵袭能力;划痕愈合试验结果显示,hsa-miR-21-3p试验组的划痕宽度较对照组窄,在相同的时间点,试验组的划痕愈合能力均大于对照组(P<0.01),说明转染了hsa-miR-21-3p mimics的试验组细胞的迁移能力大于对照组。结论:Hsa-miR-21-3p的高表达可以使人食管癌细胞Eca9706的侵袭和迁移能力增强,提示其可能参与了食管癌进程中的浸润和转移。 展开更多
关键词 食管癌细胞 hsa-mir-21-3p 侵袭 迁移
下载PDF
hsa-miR-342-3p 生物信息学分析 被引量:1
8
作者 马占兵 耿芝 +1 位作者 焦海燕 霍正浩 《生物信息学》 2015年第4期212-219,共8页
通过生物信息学方法预测hsa-miR-342-3p靶基因及其功能机制。检索Pub Med有关hsa-miR-342-3p的研究报道并进行功能分析;检索miRBase获取hsa-miR-342-3p序列;通过Target Scan,Pictar和PITA数据库预测靶基因并取交集,对其进行组织和疾病... 通过生物信息学方法预测hsa-miR-342-3p靶基因及其功能机制。检索Pub Med有关hsa-miR-342-3p的研究报道并进行功能分析;检索miRBase获取hsa-miR-342-3p序列;通过Target Scan,Pictar和PITA数据库预测靶基因并取交集,对其进行组织和疾病特异性表达谱分析、功能富集分析(GO enrichment analysis)、信号转导通路富集分析(Pathway enrichment analysis)和蛋白质相互作用网络分析(PPI analysis)。结果发现:hsa-miR-342-3p序列在多物种间具有高度保守性;hsa-miR-342-3p在肾脏组织和急性淋巴细胞性白血病、乳腺癌疾病中表达水平较高(RPM≥1 000);预测得到14个hsa-miR-342-3p靶基因;靶基因分子功能分别富集于转化生长因子活性、DNA结合和蛋白激酶激活等(P<0.05);hsa-miR-342-3p靶基因GO生物学过程主要集中于大分子代谢抑制,肺部组织发育、呼吸系统发育及管状组织发育建成(P<0.05);细胞信号通路主要富集于TGF-Beta信号通路、细胞因子、受体作用信号通路及前列腺疾病信号通路(P<0.01)。hsa-miR-342-3p在体内分布广泛,预测的靶向TGF-Beta信号通路可能在疾病发生中发挥重要调控作用,是具有潜在研究价值的生物学靶标。 展开更多
关键词 hsa-mir-342-3p 靶基因 基因本体 信号通路 生物信息学
下载PDF
hsa-miR-192-3p的靶基因预测及功能分析 被引量:2
9
作者 刘超群 张新生 张越 《生物信息学》 2018年第4期262-268,共7页
通过生物信息学方法预测hsa-miR-192-3p的靶基因及其靶基因的可能功能。首先通过miRbase在线数据库对hsamiR-192-3p的碱基序列及序列在各物种间的保守性进行分析,再通过miRGator v3. 0在线数据库查看hsa-miR-192-3p在各个组织器官中的... 通过生物信息学方法预测hsa-miR-192-3p的靶基因及其靶基因的可能功能。首先通过miRbase在线数据库对hsamiR-192-3p的碱基序列及序列在各物种间的保守性进行分析,再通过miRGator v3. 0在线数据库查看hsa-miR-192-3p在各个组织器官中的表达丰富度情况;其次,应用Target Scan和miRanda在线数据库预测hsa-miR-192-3p的靶基因;最后,将预测得到的两个数据库的靶基因交集用DAVID在线数据库进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。结果表明:hsa-miR-192-3p在人、家鼠、猕猴等生物中存在高度保守性; hsa-miR-192-3p在胃肠道、肾脏、肝胆系统、干细胞、鼻、脾、胸腺中表达丰富度较高;通过两个靶基因预测软件预测的靶基因取交集后共有190个;功能富集分析发现hsa-miR-192-3p靶基因富集在细胞质、细胞核、质膜、高尔基体等15个细胞组件(p<0. 05),参与蛋白结合、GTP酶活性、锌离子跨膜转运蛋白活性等7个分子功能(p<0. 05),涉及金属离子运输、RNA聚合酶II启动子的转录阳性调控、基因表达调节、钙离子跨膜运输、胚胎发育等18个生物过程(p<0. 05);预测靶基因集合显著富集于癌症通路与催乳素信号通路中(p<0. 05)。得出结论:hsa-miR-192-3p预测的靶基因集合富集于多个生物过程,与肿瘤密切相关,生物信息预测为今后的研究奠定了一定的理论基础,为后续实验验证提供了研究方向。 展开更多
关键词 hsa-mir-192-3p 信号转导通路 功能富集分析 癌症
下载PDF
Hsa-miR-6841-3p对宫颈癌细胞系Caski增殖及侵袭转移的影响 被引量:5
10
作者 裴桂华 殷复粉 +5 位作者 王宁 孙欣 于啸 孙业武 于风胜 王言奎 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2016年第8期566-570,共5页
目的:探讨miRNA-6841-3p对宫颈癌细胞生物学行为的影响。方法:将miRNA-6841-3p模拟物、miRNA-6841-3p抑制物转染至宫颈癌细胞系Caski。实时荧光定量PCR检测宫颈癌细胞系Caski转染后miRNA-6841-3p mRNA以及其预测靶基因TFF3的转录表达。C... 目的:探讨miRNA-6841-3p对宫颈癌细胞生物学行为的影响。方法:将miRNA-6841-3p模拟物、miRNA-6841-3p抑制物转染至宫颈癌细胞系Caski。实时荧光定量PCR检测宫颈癌细胞系Caski转染后miRNA-6841-3p mRNA以及其预测靶基因TFF3的转录表达。CCK-8法检测细胞增殖能力。Transwell小室检测细胞体外侵袭转移能力。划痕实验检测细胞迁移能力。结果:实时荧光定量PCR显示,miRNA-6841-3p模拟物转染组与miRNA-6841-3p模拟物对照组相比,miRNA-6841-3p mRNA表达明显上调(P<0.01),miRNA-6841-3p抑制物转染组miRNA-6841-3p mRNA转录表达明显受抑制,差异有统计学意义(P<0.01)。其预测靶基因TFF3 mRNA转录表达在miRNA-6841-3p模拟物转染组明显低于抑制物转染组(P<0.01)。与miRNA-6841-3p抑制物转染组比较,转染miRNA-6841-3p模拟物后,宫颈癌细胞系Caski细胞活性、迁移侵袭能力明显减弱(P<0.05)。结论:上调miRNA-6841-3p表达可明显抑制宫颈癌细胞系Caski增殖,抑制其迁移、侵袭能力,其作用机制可能通过抑制预测靶基因TFF3表达实现。 展开更多
关键词 hsa-mir-6841-3p 宫颈癌 CASKI细胞 增殖 侵袭 转移
下载PDF
以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸对NCI-H446细胞生物学特性的影响 被引量:3
11
作者 官士珍 付玉荣 +3 位作者 伊正君 李猛 裴景亮 高昆山 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期171-176,共6页
背景与目的:miRNAs是一类小分子RNA,参与转录后调控。前期研究结果显示,hsa-miR-491-3p在肺癌和肾癌组织中高表达,目前鲜见其功能研究的报道。本研究旨在探讨以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸对人小细胞肺癌NCI-H446细胞生物学特... 背景与目的:miRNAs是一类小分子RNA,参与转录后调控。前期研究结果显示,hsa-miR-491-3p在肺癌和肾癌组织中高表达,目前鲜见其功能研究的报道。本研究旨在探讨以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸对人小细胞肺癌NCI-H446细胞生物学特性的影响。方法:合成以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸和随机对照序列,转染NCI-H446细胞。实验分4组:空白对照组(组1)、空白转染组(组2)、随机对照组(组3)和反义寡核苷酸组(组4)。用四甲基偶氮唑蓝(MTT)法筛选最佳作用浓度,Hoechst33258染色检测细胞核的形态变化,流式细胞术检测细胞凋亡和周期变化,划痕实验检测细胞的迁移能力。结果:转染反义寡核苷酸后细胞生长受到抑制,最佳作用浓度为0.5μmol/L。Hoechst33258染色各组的凋亡率分别为(6.67±0.58)%、(7.00±1.00)%、(6.67±1.53)%和(26.33±1.53)%,组4的凋亡率明显高于前3组,差异有统计学意义(P<0.001)。流式细胞仪检测各组的凋亡率分别为(2.44±0.60)%、(2.59±0.85)%、(2.62±1.11)%和(5.22±0.40)%,组4的凋亡率明显高于前3组,差异有统计学意义(P<0.01),且G1期细胞增多,S期细胞减少。划痕实验显示各组细胞24 h的迁移距离分别为(196.88±39.13)、(163.06±21.28)、(225.49±23.42)和(77.41±6.07)μm,组4细胞的迁移距离小于前3组(P<0.05),迁移能力减弱。结论:以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸能够抑制NCI-H446细胞增殖,诱导其凋亡,并降低其侵袭能力。 展开更多
关键词 hsa-mir-491-3p 反义寡核苷酸 细胞凋亡 NCI-H446细胞
下载PDF
hsa-miR-367-3p靶基因预测及功能分析 被引量:2
12
作者 张新生 郭琳琳 +4 位作者 刘超群 许何丽 窦文静 刘梦瑶 张越 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期393-397,共5页
目的通过生物信息学方法预测hsa-miR-367-3p的靶基因及其靶基因的功能。方法运用miRbase在线数据库、miRGator v3.0在线数据库TargetScan、miRDB在线数据库和DAVID在线数据库进行预测和分析。结果 hsa-miR-367-3p在多个物种之间具有高... 目的通过生物信息学方法预测hsa-miR-367-3p的靶基因及其靶基因的功能。方法运用miRbase在线数据库、miRGator v3.0在线数据库TargetScan、miRDB在线数据库和DAVID在线数据库进行预测和分析。结果 hsa-miR-367-3p在多个物种之间具有高度保守性;在干细胞中表达丰富度较高;功能富集分析发现,hsa-miR-367-3p的靶基因涉及心室发育、转录调节等38个生物过程(P <0.05),富集在神经元等21个细胞组分(P <0.05)。结论 hsa-miR-367-3p个别预测出来的靶基因与通路已经被证实,更多的预测结果需要进一步的研究加以验证。本研究为将来验证hsa-miR-367-3p的靶基因和可能调控的通路指明了方向。 展开更多
关键词 hsa-mir-367-3p 靶基因 功能富集分析
下载PDF
糖尿病相关hsa-miR-223-3p靶基因预测及生物信息学分析 被引量:5
13
作者 余梦娜 杨标 仰礼真 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1477-1484,共8页
目的·分析人类mi R-223-3p(hsa-miR-223-3p)的靶基因及其参与的生物学过程,并寻找与糖尿病相关的生物标志物。方法·利用starBase数据库筛选hsa-miR-223-3p靶基因,并对其行基因本体数据库(Gene Ontology,GO)富集分析、京都基... 目的·分析人类mi R-223-3p(hsa-miR-223-3p)的靶基因及其参与的生物学过程,并寻找与糖尿病相关的生物标志物。方法·利用starBase数据库筛选hsa-miR-223-3p靶基因,并对其行基因本体数据库(Gene Ontology,GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)和Reactome通路分析。通过构建蛋白-蛋白相互作用(proteinprotein interaction,PPI)网络获得中枢基因,筛选最有意义的模块,并利用Venn图对糖尿病相关的中枢基因进行分析。结果·共筛选出870个hsa-miR-223-3p靶基因。GO、KEGG和Reactome富集分析显示,靶基因主要与RNA聚合酶Ⅱ启动子的调节、细胞对胰岛素刺激的反应、RNA结合等相关,且主要富集于胰岛素分泌、泛素介导的蛋白水解、雌激素依赖型基因表达等通路。PPI网络共得31个中枢基因,且中枢基因PRKACB参与胰岛素分泌通路;共筛选出3个最有意义的基因模块,其中模块1参与泛素介导的蛋白水解作用,模块2参与RNA转运和细胞周期,模块3参与内吞作用。结论·Hsa-miR-223-3p可能通过靶基因参与多种生物学过程,中枢基因PRKACB或可为糖尿病发生机制的探索提供帮助。 展开更多
关键词 糖尿病 hsa-mir-223-3p 生物信息学 模块化 基因
下载PDF
乳腺癌中hsa-miR-24-3p的表达及临床意义 被引量:1
14
作者 吴锦 丁克硕 +1 位作者 王浩 吴正升 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期514-517,521,共5页
目的观察hsa-miR-24-3p在乳腺癌组织中的表达及与乳腺癌临床病理特征的关系,探索其发挥作用的具体机制。方法采用组织原位杂交实验检测乳腺癌组织和乳腺良性病变组织中hsa-miR-24-3p的原位表达,针对112例乳腺癌临床病理参数和相应hsa-mi... 目的观察hsa-miR-24-3p在乳腺癌组织中的表达及与乳腺癌临床病理特征的关系,探索其发挥作用的具体机制。方法采用组织原位杂交实验检测乳腺癌组织和乳腺良性病变组织中hsa-miR-24-3p的原位表达,针对112例乳腺癌临床病理参数和相应hsa-miR-24-3p的表达水平进行相关性分析;预测hsa-miR-24-3p下游靶基因,通过荧光素酶报告实验和实时荧光定量PCR实验进行验证。结果在乳腺癌组织和乳腺良性病变组织中hsa-miR-24-3p的阳性率分别为36.6%(41/112)和66.7%(14/21)。hsa-miR-24-3p表达与乳腺癌患者的腋窝淋巴结转移数以及肿瘤的TNM分期呈负相关(P <0.05),与患者年龄、肿瘤直径、组织学分级、ER、PR和HER-2的表达均无显著相关性(P >0.05)。hsa-miR-24-3p表达与乳腺癌患者的无复发生存期和总体生存期呈正相关(P =0.025,P =0.019)。hsa-miR-24-3p靶向抑制RNF2的表达。结论 hsa-miR-24-3p在乳腺癌中具有抑癌功能,其可作为乳腺癌的潜在靶向治疗药物。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 hsa-mir-24-3p 病理意义 QRT-pCR
下载PDF
早期胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p及ITGA9、VEGF mRNA表达变化 被引量:1
15
作者 张树红 覃超喜 孙燕 《山东医药》 CAS 2018年第42期43-45,共3页
目的观察胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p及整合素9(ITGA9)、血管内皮生长因子(VEGF)mRNA表达变化,并分析其相关性。方法收集正常早孕及胚胎停育行人工流产患者各30例,采用实时荧光定量PCR法检测绒毛组织中的hsa-miR-2276-3p及IT... 目的观察胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p及整合素9(ITGA9)、血管内皮生长因子(VEGF)mRNA表达变化,并分析其相关性。方法收集正常早孕及胚胎停育行人工流产患者各30例,采用实时荧光定量PCR法检测绒毛组织中的hsa-miR-2276-3p及ITGA9、VEGF mRNA,并行Pearson相关分析法分析其相关性。结果与正常早孕者比较,胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p表达增高,而ITGA9、VEGF mRNA均表达降低(P均<0. 05)。在胚胎停育患者绒毛组织中,has-miR-2276-3p与ITGA9、VEGF mRNA的表达均呈负相关(r分别为-0. 679、-0. 528,P均<0. 05)。结论在胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p高表达而ITGA9、VEGF mRNA低表达,hsa-miR-2276-3p与ITGA9、VEGF mRNA表达呈负相关; hsa-miR-2276-3p可能负向调节ITGA9、VEGF表达,从而导致绒毛组织中血管生成减少,引起胚胎停育的发生。 展开更多
关键词 胚胎停育 绒毛组织 hsa-mir-2276-3p 整合素9 血管内皮生长因子
下载PDF
Hsa-miR-139-3p靶基因预测及生物信息学分析 被引量:1
16
作者 何楚琦 钟浩 龙鼎新 《中国现代医学杂志》 CAS 2019年第17期22-28,共7页
目的对hsa-miR-139-3p 的靶基因进行预测及相关生物信息学分析,为hsa-miR-139-3p 靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础。方法采用3 种软件预测hsa-miR-139-3p 的靶基因并对结果进行功能注释(GO)和信号通路富集分析(KEGG)。结果 hs... 目的对hsa-miR-139-3p 的靶基因进行预测及相关生物信息学分析,为hsa-miR-139-3p 靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础。方法采用3 种软件预测hsa-miR-139-3p 的靶基因并对结果进行功能注释(GO)和信号通路富集分析(KEGG)。结果 hsa-miR-139-3p 成熟序列在各物种间高度保守。获得的133 个靶基因存在于细胞各个组分,主要有转录调控、基因表达调控和蛋白连接等分子功能,并富集于发育生物学过程,涉及黏着斑信号转导以及基因信息处理等信号通路。结论 hsa-miR-139-3p 通过调控靶基因参与人类生命活动和疾病过程的很多方面,尤其生长发育和癌症过程是值得进一步研究的方向。 展开更多
关键词 hsa-mir-139-3p 靶基因预测 生物信息学
下载PDF
肺癌组织中lncRNA ZFAS1和hsa-miR-372-3p的表达与患者恶性特征及预后的关系 被引量:2
17
作者 杨晔 党荣广 +2 位作者 张静 董超 宋雪晶 《基础医学与临床》 2022年第12期1861-1866,共6页
目的探究肺癌组织中长链非编码RNA锌指结构反义转录本1(lncRNA ZFAS1)、hsa-miR-372-3p表达水平及与患者恶性特征及预后的关系。方法选取2015年3月至2016年10月在石家庄市人民医院诊治的82例肺癌患者。RT-qPCR检测肿瘤组织和癌旁组织ZF... 目的探究肺癌组织中长链非编码RNA锌指结构反义转录本1(lncRNA ZFAS1)、hsa-miR-372-3p表达水平及与患者恶性特征及预后的关系。方法选取2015年3月至2016年10月在石家庄市人民医院诊治的82例肺癌患者。RT-qPCR检测肿瘤组织和癌旁组织ZFAS1和miR-372-3p的表达,分析ZFAS1、miR-372-3p水平与肺癌患者恶性特征的关系;Pearson分析肿瘤组织中ZFAS1和miR-372-3p的关系;用Kaplan-Meier分析ZFAS1、miR-372-3p水平与肺癌患者预后生存期的关系;COX回归分析对肺癌患者预后产生影响的因素。结果与癌旁组织相比,肿瘤组织中ZFAS1、miR-372-3p表达水平均显著升高(P<0.05)。肿瘤组织ZFAS1、miR-372-3p表达水平与TNM分期、浸润胸膜、是否发生淋巴结转移、肿瘤分化程度有关(P<0.05)。肿瘤组织中ZFAS1和miR-372-3p表达水平呈显著正相关(r=0.477,P<0.001)。ZFAS1和miR-372-3p高表达组患者5年内生存率均明显低于低表达组(P<0.05)。TNM分期、淋巴结转移、ZFAS1、miR-372-3p是肺癌患者发生不良预后的独立危险因素(P<0.05)。结论肿瘤组织中ZFAS1、miR-372-3p呈异常高表达,其高水平与肺癌患者恶性特征及预后不良有关,是肺癌患者预后不良的独立危险因素。 展开更多
关键词 肺癌 长链非编码RNA 锌指结构反义转录本1 hsa-mir-372-3p
下载PDF
血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA联合检测在丙肝疾病诊断中的意义 被引量:1
18
作者 宋珊珊 孙婷婷 +1 位作者 陆晓芳 杜合娟 《海南医学院学报》 CAS 2019年第3期217-220,共4页
目的:研究血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA联合检测在丙肝疾病诊断中的意义。方法:选取我院收治的丙肝患者100例为观察组,另选我院同期体检正常者100例为对照组,观察两组研究对象血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA水平、不... 目的:研究血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA联合检测在丙肝疾病诊断中的意义。方法:选取我院收治的丙肝患者100例为观察组,另选我院同期体检正常者100例为对照组,观察两组研究对象血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA水平、不同HCV-RNA组别患者的血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p水平、HCV-RNA与血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p相关性以及联合检测与单独检测对丙肝诊断效能之间的差异。结果:观察组的hsa-miR-17-5p表达量明显高于对照组,25(OH)D_3表达水平低于对照组,HCV-RNA阳性组的hsa-miR-17-5p高于HCV-RNA阴性组,25(OH)D_3低于HCV-RNA阴性组,观察组的HCV-RNA与血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p分别呈现正、负相关,通过对联合检测和单独检测对丙肝患者诊断效能评估,发现血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p以及HCV-RNA的临界值分别为24.23μg/L,1.89相对表达量,1.22×10~3 IU/mL。hsa-miR-17-5p+25(OH)D_3+HCV-RNA联合检测的AUC面积大于单独检测。结论:血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA联合检测对于丙型肝炎诊断效能较高,灵敏度较好,建议在临床应用。 展开更多
关键词 25羟基维生素D3 血清核酸序列hsa-mir-17-5p 丙型肝炎RNA 丙型肝炎 联合检测
下载PDF
Hsa_circ_0087354通过hsa-miR-199-3p/SLC7A11调节MG-63细胞增殖及氧化还原状态 被引量:1
19
作者 郑宝莲 何嘉轩 +3 位作者 梁珮琪 李丹 刘小川 张静莹 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期308-319,共12页
环状RNA(circular RNAs,circRNAs)是一类新型非编码RNA。已有研究表明,其在细胞氧化还原反应中发挥重要作用。在本文前期研究中,发现通过real-time PCR检测,hsa_circ_0087354与细胞的氧化还原状态密切相关。过表达hsa_circ_0087354后,... 环状RNA(circular RNAs,circRNAs)是一类新型非编码RNA。已有研究表明,其在细胞氧化还原反应中发挥重要作用。在本文前期研究中,发现通过real-time PCR检测,hsa_circ_0087354与细胞的氧化还原状态密切相关。过表达hsa_circ_0087354后,活性氧1(reactive oxygen species1,ROS1)基因表达显著下降(P<0.01),超氧化物歧化酶1(surperoxide dismutase1,SOD1)表达显著升高(P<0.05);细胞内SOD和谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPx)活性以及谷胱甘肽(glutathione,GSH)浓度显著升高(P<0.01),细胞增殖能力增强(P<0.05)。生物信息学分析预测,hsa-miR-199-3p与hsa_circ_0087354和溶质载体家族7成员11(solute carrier family 7 member 11,SLC7A11)存在结合位点,可能存在靶向调控关系。双荧光素酶报告基因结果证实了hsa-miR-199-3p与hsa_circ_0087354和SLC7A11之间的靶向调控关系。构建过表达hsa_circ_0087354质粒和ctrl质粒,合成hsa-miR-199a-3p、hsa-miR-199b-3p和hsa-miR-NC mimics。通过Real-time PCR分析发现,转染hsa_circ_0087354后,hsa-miR-199-3p表达显著降低(P<0.01),SLC7A11表达显著升高(P<0.05)。转染hsa-miR-199-3p后,SLC7A11基因表达显著下降(P<0.001),细胞内SOD和GPx活性以及GSH浓度显著降低(P<0.01),细胞增殖能力下降(P<0.05)。研究结果表明,hsa_circ_0087354通过吸附hsa-miR-199-3p,增强SLC7A11表达,促进氧化应激MG-63细胞增殖,降低氧化应激水平。 展开更多
关键词 氧化应激 hsa_circ_0087354 hsa-mir-199-3p 核因子E2相关因子2 溶质载体家族7成员11(SLC7A11)
下载PDF
Significance of combined detection of serum 25(OH)D3, hsa-miR-17-5p and HCV-RNA in the diagnosis of hepatitis C disease
20
作者 Shan-Shan Song Ting-Ting Sun +1 位作者 Xiao-Fang Lu He-Juan Du 《Journal of Hainan Medical University》 2019年第3期61-64,共4页
Objective: Significance of combined detection of serum 25(OH)D3, hsa-miR-17-5p and HCV-RNA in diagnosis of hepatitis C disease. Methods: A total of 52 patients with benign ovarian tumor resection were selected from Ap... Objective: Significance of combined detection of serum 25(OH)D3, hsa-miR-17-5p and HCV-RNA in diagnosis of hepatitis C disease. Methods: A total of 52 patients with benign ovarian tumor resection were selected from April 2016 to April 2018 in our hospital. We paid attention to the implementation of perioperative nursing intervention, and observed the prognosis and the occurrence of adverse reactions. Results: The expression of hsa-mir-17-5p in the observation group was significantly higher than that in the control group, the expression of 25(OH)D3 was lower than that in the control group, the expression of hsa-mir-17-5p in the HCV-RNA positive group was higher than that in the HCV-RNA negative group, and the expression of 25(OH) D3 was lower than that in the HCV-RNA negative group. The expression of HCV-RNA in the observation group was positively and negatively correlated with the expression of 25(OH) D3 and hsa-mir-17-5p in the 25(OH)D3 and the critical values of serum 25 (OH)D3, hsa-mir-17-5p and HCV-RNA were 24.23 ug/L, 1.89 relative expression and 1.22 × 103 IU/mL, respectively. The area of AUC detected by hsa-miR-17-5p+ 25 (OH) D3+25(OH)D3 is larger than that detected separately. Conclusion: The combined detection of serum 25(OH)D3, hsa-mir-17-5p and HCV-RNA has high diagnostic efficiency and sensitivity for hepatitis C. It is suggested that they be used in clinical practice. 展开更多
关键词 25(OH)D3 hsa-mir-17-5p HCV-RNA HEpATITIS C Joint detection
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部