克罗恩病中过表达的hsa_circRNA_103124下调FGF18抑制巨噬细胞样M2极化

背景:克罗恩病(CD)作为炎症性肠病的类型之一,慢性反复发作,严重影响患者生命质量,其发病机制目前并不明确。目的:通过研究CD中过表达的hsa_circ RNA_103124对下游基因表达的影响,比较hsa_circ RNA_103124及其下游基因在CD与健康对照组中的表达差异,探讨hsa_circ RNA_103124在CD发生、发展中的作用机制。方法:通过转录组测序,发现佛波酯(PMA)诱导巨噬细胞样极化hsa_circ RNA_103124过表达的THP1细胞株中差异表达的基因。以白细胞介素(IL)-4诱导hsa_circ RNA_103124过表达的THP1细胞巨噬细胞样M2极化,流式细胞术检测M2极化标志物CD206和CD163水平,q PCR检测hsa_circ RNA_103124及其下游基因表达。q PCR检测30例CD患者和30名健康对照者外周血单个核细胞中hsa_circ RNA_103124及其下游基因m RNA表达。结果:Hsa_circ RNA_103124过表达且PMA诱导极化的THP1细胞株中,成纤维细胞生长因子18(FGF18)低表达(P<0.01)。Hsa_circ RNA_103124抑制巨噬细胞样M2极化,CD206和CD163表达下调(P<0.05,P<0.01)。Hsa_circ RNA_103124过表达且M2极化的THP1细胞中,FGF18和CC趋化因子配体2(CCL2)表达下调(P<0.05,P<0.01)。CD患者外周血单个核细胞中hsa_circ RNA_103124表达上调(P<0.05),FGF18和CCL2表达下调(P<0.01,P<0.05)。结论:CD患者外周血中过表达的hsa_circ RNA_103124通过下调FGF18和CCL2表达,抑制巨噬细胞样M2极化,可能在CD发生、发展中起促进炎症的作用。

类风湿关节炎患者外周血单个核细胞中环状RNA差异表达分析

目的探讨环状RNA(circRNA)在RA PBMCs表达谱的差异及临床意义。方法收集4例RA患者(T组)及4名健康体检者(C组)静脉血,运用Arraystar circRNA微阵列芯片检测2组PBMCs中circRNA表达谱,应用相关数据库进行生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证表达失调circRNA的表达情况,并对目标circRNA构建circRNA-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)调控网络(即ceRNA网络)。建立受试者工作特征曲线(ROC曲线),对潜在诊断价值进行分析。采用SPSS Statistics 23.0和Graphpad Prism 8.0分析数据,采用两独立样本t检验分析2组间差异。结果①微阵列芯片结果显示,与C组比较,T组PBMCs中异常表达的circRNA共有399个,其中149个上调,250个下调。②生物信息学分析:circRNA与miRNA结合位点预测提示RA中差异表达的circRNA可能通过靶向结合miR-140-5p、miR-338-5p和miR-9-5p等分子影响炎症反应;基因本体论分析发现差异表达的circRNA主要在细胞质、蛋白质结合等方面;京都基因与基因组百科全书通路分析发现涉及的通路多与人体免疫调节相关。③多样本RT-qPCR验证结果显示T组中hsa_circRNA_009012的相对表达量显著高于C组(t=-4.417,P<0.01),hsa_circRNA_101328的表达水平显著低于C组(t=-1.042,P<0.01),hsa_cir-cRNA_058230的表达无明显改变(t=4.691,P>0.05)。④ROC曲线分析提示hsa_circRNA_009012具有诊断RA的潜在价值(ROC曲线下面积=0.96)。结论circRNA在RA患者PBMCs中表达失调,可能参与RA发生发展的调控,其中hsa_circRNA_009012有望成为RA诊疗的新型生物学标志物。