海南省三沙市永兴岛的鼠类及 Hunnivirus 监测分析

目的掌握海南省三沙市永兴岛的鼠类分布及Hunnivirus携带情况,为鼠传疾病的防控提供科学依据。方法2022、2023、2024年在三沙市永兴岛通过笼夜法,捕获鼠类,经分类鉴定后取其肝、肺、脾和膀胱等组织。根据病毒宏基因组测序的结果应用RT-PCR法检测Hunnivirus。采用χ^(2)检验和Fisher确切概率法比较不同生境的鼠类密度和构成比差异,用MEGA11软件进行序列比对及系统发育分析。结果共放置有效鼠笼671只,捕获鼠类35只,总体鼠密度为5.22%。不同生境的鼠密度差异无统计学意义(χ^(2)=1.4663,df=3,P=0.6901)。共检测36份鼠类组织样本,2份检测出Hunnivirus阳性,均为褐家鼠。系统发育分析显示阳性病毒序列与美国纽约市报告的褐家鼠Hunnivirus序列(NrHuV/NYC-E21)和中国广东报告的褐家鼠Hunnivirus序列(RatHuV/YY12/CHN)具有最密切的相关性,与牛、绵羊和鼠类中鉴定的Hunnivirus序列具有同源性。结论海南省三沙市永兴岛可能有Hunnivirus的传播风险,该病毒的宿主范围包括牛、鼠和羊等动物,可能在鼠和其他动物物种间发生跨物种传播,且该地区鼠密度较高,应持续监测并制定必要的防控策略。

牛匈爱病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法的建立及应用

水牛匈爱病毒(BufHuV)是2021年在广西水牛中新发现的一种小核糖核酸病毒,本研究旨在建立一种可用于临床快速且特异检测牛匈爱病毒的方法。基于GenBank上公布的bovine hunnivirus、ovine hunnivirus和BufHuV的5′UTR保守区设计了1对特异性引物,首次建立了检测牛匈爱病毒的SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR方法。结果表明,标准曲线在1.1×10^(8)copies/μL~1.1×10^(3)copies/μL质粒标准品稀释浓度范围内呈线性关系,斜率为-3.2657,相关系数为0.9998,熔解曲线为单峰,检测下限为1.1×10^(1)copies/μL,比常规PCR敏感性高100倍;特异性高,与多种常见的牛病病毒均无交叉反应;重复性好,批内和批间变异系数均小于1.0%。收集了257份有腹泻迹象的牛粪样品,用于对所建立平台的性能评估,结果,建立的实时荧光定量PCR的阳性检出率为3.89%,高于普通PCR的阳性检出率(1.56%)。上述结果表明,该方法将为牛匈爱病毒的临床样品检测、流行病学监测提供一种快速、可靠、低成本的替代方案,也为后续研究奠定了基础。