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青稞HvtAGO1基因的克隆及其在条纹病胁迫下的表达
被引量:
8
1
作者
姚晓华
王越
+4 位作者
安立昆
姚有华
杨雪
白羿雄
吴昆仑
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期20-28,共9页
AGO蛋白是RNA诱导沉默复合体的核心分子,在植物的生长、发育及胁迫响应中起重要作用。为探索青稞AGO基因在青稞抗条纹病病原菌过程中的作用机制,该研究以抗条纹病青稞品种‘昆仑14号’和感病品种‘Z1141’为材料,利用条纹病原菌侵染两品...
AGO蛋白是RNA诱导沉默复合体的核心分子,在植物的生长、发育及胁迫响应中起重要作用。为探索青稞AGO基因在青稞抗条纹病病原菌过程中的作用机制,该研究以抗条纹病青稞品种‘昆仑14号’和感病品种‘Z1141’为材料,利用条纹病原菌侵染两品种,从感病前后的转录组测序结果中获得一个差异表达基因,克隆验证了该基因为HvtAGO1。结果表明:(1)HvtAGO1基因长3675 bp,其完整开放阅读框为3651 bp,编码1217个氨基酸;蛋白质序列分析表明,HvtAGO1为一个亲水性的不稳定碱性蛋白,具有高度保守的DUF1785、PAZ和PIWI结构域。(2)青稞HvtAGO1蛋白与山羊草、二穗短柄草、乌拉尔图小麦的AGO1蛋白序列相似性分别为96.64%、79.34%和80.07%,DUF1785、PAZ和PIWI结构域相似性分别为97.57%、98.44%和96.02%;系统进化树分析表明,青稞HvtAGO1蛋白与山羊草的亲缘关系最近,与玉米和粟的亲缘关系最远。(3)降解组测序结果表明,hvu-miR168-5p与HvtAGO1存在靶向关系。(4)qRT-PCR分析表明,条纹病胁迫下,与正常叶片相比,‘昆仑14号’与‘Z1141’感病叶片的hvu-miR168-5p和靶基因HvtAGO1表达量均极显著上调,且‘昆仑14号’表达量显著高于‘Z1141’。研究推测,hvu-miR168-5p和靶基因HvtAGO1在青稞抗条纹病的调控过程中发挥着重要作用。
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关键词
青稞
HvtAGO1
hvu-mir168-5p
基因克隆
条纹病
基因表达
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职称材料
题名
青稞HvtAGO1基因的克隆及其在条纹病胁迫下的表达
被引量:
8
1
作者
姚晓华
王越
安立昆
姚有华
杨雪
白羿雄
吴昆仑
机构
青海大学
青海省农林科学院
青海省青稞遗传育种重点实验室/国家麦类改良中心青海青稞分中心
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期20-28,共9页
基金
国家自然科学基金(31660388,31960427)
青海省科技厅应用基础研究项目(2019-ZJ-7075)
国家大麦产业技术体系(CARS-05)。
文摘
AGO蛋白是RNA诱导沉默复合体的核心分子,在植物的生长、发育及胁迫响应中起重要作用。为探索青稞AGO基因在青稞抗条纹病病原菌过程中的作用机制,该研究以抗条纹病青稞品种‘昆仑14号’和感病品种‘Z1141’为材料,利用条纹病原菌侵染两品种,从感病前后的转录组测序结果中获得一个差异表达基因,克隆验证了该基因为HvtAGO1。结果表明:(1)HvtAGO1基因长3675 bp,其完整开放阅读框为3651 bp,编码1217个氨基酸;蛋白质序列分析表明,HvtAGO1为一个亲水性的不稳定碱性蛋白,具有高度保守的DUF1785、PAZ和PIWI结构域。(2)青稞HvtAGO1蛋白与山羊草、二穗短柄草、乌拉尔图小麦的AGO1蛋白序列相似性分别为96.64%、79.34%和80.07%,DUF1785、PAZ和PIWI结构域相似性分别为97.57%、98.44%和96.02%;系统进化树分析表明,青稞HvtAGO1蛋白与山羊草的亲缘关系最近,与玉米和粟的亲缘关系最远。(3)降解组测序结果表明,hvu-miR168-5p与HvtAGO1存在靶向关系。(4)qRT-PCR分析表明,条纹病胁迫下,与正常叶片相比,‘昆仑14号’与‘Z1141’感病叶片的hvu-miR168-5p和靶基因HvtAGO1表达量均极显著上调,且‘昆仑14号’表达量显著高于‘Z1141’。研究推测,hvu-miR168-5p和靶基因HvtAGO1在青稞抗条纹病的调控过程中发挥着重要作用。
关键词
青稞
HvtAGO1
hvu-mir168-5p
基因克隆
条纹病
基因表达
Keywords
Tibetan hulless barley
HvtAGO1
hvu-mir168-5p
gene clone
barley leaf stri
p
e
gene ex
p
ression
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
青稞HvtAGO1基因的克隆及其在条纹病胁迫下的表达
姚晓华
王越
安立昆
姚有华
杨雪
白羿雄
吴昆仑
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
8
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