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特殊氢原子与丙氨酸二肽构象稳定性的理论研究 被引量:6
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作者 王嘉 王长生 《辽宁师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2004年第3期320-323,共4页
使用B3LYP/6 31G 方法,优化得到了丙氨酸二肽分子的6个稳定构象.从特殊氢原子之间的相互作用及其所形成氢键环和五元环的结构特点,探讨了影响二肽构象稳定性的因素,并估算了相关弱相互作用的能量.
关键词 氢原子 二肽 构象稳定性 B3LYP 弱相互作用 丙氨酸 氢键 分子
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混合配体配合物[Pd(bpy)(L-asp)]·3.5H_2O的晶体结构及其稳定性研究 被引量:4
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作者 高恩君 张丹 刘祁涛 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1834-1838,共5页
合成了混合配体配合物单晶 [Pd(bpy) (L asp) ]·3 .5H2 O (bpy =2 ,2′ 联吡啶 ,L asp2 -=L 天冬氨酸根 ) .用红外光谱和元素分析对配合物的成键及组成进行了表征 .用X射线单晶衍射仪 (CCD)测定了配合物的结构 ,晶体属四方晶系 ,为... 合成了混合配体配合物单晶 [Pd(bpy) (L asp) ]·3 .5H2 O (bpy =2 ,2′ 联吡啶 ,L asp2 -=L 天冬氨酸根 ) .用红外光谱和元素分析对配合物的成键及组成进行了表征 .用X射线单晶衍射仪 (CCD)测定了配合物的结构 ,晶体属四方晶系 ,为P4( 1) 2 ( 1) 2空间群 .配合物为平面四边形结构 ,分子内存在氢键作用 ,其晶胞靠氢键和芳环堆砌等弱相互作用力形成 .用电位滴定法测定了配合物稳定常数lgK[Pd2 + +bpy +L asp2 Pd(bpy) (L asp) ]、表征常数ΔlgK[Pd(bpy) 2 + Pd(L asp)Pd(bpy) (L asp) +Pd2 + ]和lgX[Pd(bpy) 2 + 2 +Pd(L asp) 2 -2 2Pd(bpy) (L asp) ] ,各常数均大于相应的统计期望值 ,从分子内d 展开更多
关键词 混合配体配合物 [Pd(bpy)(L-asp)]·3.5H2O 晶体结构 稳定性 钯配合物 氢键 芳环堆砌 抗肿瘤活性
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草酸根桥联的双核铜髤配合物[Cu_2(phen)_2(H_2O)_2(μ_2-C_2O_4)](NO_3)_2的合成及晶体结构 被引量:7
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作者 卢文贯 潘育方 彭翠红 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第5期709-712,共4页
A new binuclear copper(Ⅱ) complex, [Cu2(phen)2(H2O)2( μ2-C2O4)](NO3)2, has been synthesized and characterized by elemental analysis, IR and UV-Vis spectrum. Its crystal structure was determined by single crystal X-r... A new binuclear copper(Ⅱ) complex, [Cu2(phen)2(H2O)2( μ2-C2O4)](NO3)2, has been synthesized and characterized by elemental analysis, IR and UV-Vis spectrum. Its crystal structure was determined by single crystal X-ray diffraction techniques. Crystal data: monoclinic, space group P21/c, a=0.712 21(8) nm, b=1.170 93(14) nm, c=1.783 7(2) nm, β=111.828(2)°, and V=1.380 8(3) nm3, Dc=1.769 Mg·m-3, Z=2, F(000)=744, R1=0.025 4, wR2=0.069 5, Gof=1.077, Δρ=328^-455 e·nm-3. The complex is packed by one centrosymmetry binuclear copper(Ⅱ) unit, oxalate dianion and NO3- anion. In the molecule structure of the title complex, two Cu(Ⅱ) ions are bridged by oxalate dianion and each Cu(Ⅱ) ions coordinates with two nitrogen atoms from 1,10-phenanthroline ligand and one oxygen atom from water to form a five-coordinate distorted square-pyramidal configuration. The hydrogen bonds are observed between coordinated water molecules and NO3- anions. The analysis of the crystal structure indicates that the complex has a two-dimensional stacking network structure, which is formed by intramolecular hydrogen bonds, intermolecular hydrogen bonds and stacking effect of aromatic ring. CCDC: 255345. 展开更多
关键词 双核铜(Ⅱ)配合物 草酸根桥联 晶体结构 complex analysis CRYSTAL CRYSTAL network NO3^- Cu(Ⅱ) 合成 UV-VIS and spect space group the The data unit with ATOM form one are new Its was ani IR
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煤加氢液化过程中的单原子与双原子氢转移 被引量:1
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作者 魏贤勇 宗志敏 +3 位作者 周仕禄 倪中海 孙林兵 马玉苗 《中国科技论文在线》 CAS 2011年第12期906-910,共5页
氢转移对煤的加氢液化至关重要。大量的研究结果表明,催化剂不仅可以加快氢转移反应的速度,而且影响氢转移反应的历程:温和条件下金属硫化物和活性炭促进单原子氢转移,导致煤中特定桥键的选择性断裂,而金属催化双原子氢转移,造成煤中芳... 氢转移对煤的加氢液化至关重要。大量的研究结果表明,催化剂不仅可以加快氢转移反应的速度,而且影响氢转移反应的历程:温和条件下金属硫化物和活性炭促进单原子氢转移,导致煤中特定桥键的选择性断裂,而金属催化双原子氢转移,造成煤中芳环的加氢。传统的观点认为促进煤的加氢液化的供氢化合物对单原子氢转移起着显著的抑制作用。 展开更多
关键词 加氢液化 单原子氢转移 双原子氢转移 桥键断裂 芳环加氢 催化剂 供氢化合物
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铁硫蛋白模型化合物的研究进展
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作者 孙为银 刘红科 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1998年第1期20-28,共9页
本文综述了目前国际上对铁硫蛋白模型化合物研究的进展情况,介绍了NH--S氢键和芳香环在这些模型化合物及其天然蛋白中的作用。作为铁硫蛋白活性中心的模型,至今已有许多化合物被合成出来,通过这些模型化合物的研究知道,NH-... 本文综述了目前国际上对铁硫蛋白模型化合物研究的进展情况,介绍了NH--S氢键和芳香环在这些模型化合物及其天然蛋白中的作用。作为铁硫蛋白活性中心的模型,至今已有许多化合物被合成出来,通过这些模型化合物的研究知道,NH--S氢键和芳香环在调控配合物及天然蛋白的氧化还原电位和稳定性方面起着非常重要的作用。另外,作为顺式乌头酸酶、固氮酶等金属酶的模型,已成功地合成了含3Fe4S核以及含钼的铁硫簇合物。 展开更多
关键词 铁硫蛋白 模型化合物 活性中心
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喜树碱及其E环修饰衍生物的量子化学研究 被引量:1
6
作者 王译伟 郭建敏 +2 位作者 刘源 杜军 唐斌 《泸州医学院学报》 2012年第4期385-389,共5页
目的:对喜树碱E环修饰的23个衍生物进行了结构优化和能量计算,比较它们的稳定性和活性,以便为实验设计合成活性更高的此类衍生物指明方向。方法:采用密度泛函理论(DFT),在6-311G(d,p)基组水平上对研究对象进行了计算,为了得到更精确的... 目的:对喜树碱E环修饰的23个衍生物进行了结构优化和能量计算,比较它们的稳定性和活性,以便为实验设计合成活性更高的此类衍生物指明方向。方法:采用密度泛函理论(DFT),在6-311G(d,p)基组水平上对研究对象进行了计算,为了得到更精确的能量信息,还计算了QCISD(T)/6-311G(d,p)水平上各物质的能量。结果:化合物6稳定性最强,容易形成分子内氢键;化合物19稳定性最差,不易形成分子内氢键,活性最高。结论:计算结果与临床试验结果一致,该方法用于指导该类化合物的设计合成是可行的。 展开更多
关键词 喜树碱 E环修饰 稳定性 分子内氢键
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合理预测甘氨酸-α-多肽构象稳定性的有效途径 被引量:1
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作者 李晓静 王长生 《辽宁师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2005年第1期79-82,共4页
使用B3LYP/6 31G*方法,优化得到了甘氨酸多肽分子 CH3CO(NHCH2CO)nNHCH3(n=1,2,3)的 18 个稳定构象.对构象中存在的非键作用进行了分析,确定了影响构象稳定性的主要非键作用,并估算了相关非键作用的能量.将之应用于判断二肽、三肽、四... 使用B3LYP/6 31G*方法,优化得到了甘氨酸多肽分子 CH3CO(NHCH2CO)nNHCH3(n=1,2,3)的 18 个稳定构象.对构象中存在的非键作用进行了分析,确定了影响构象稳定性的主要非键作用,并估算了相关非键作用的能量.将之应用于判断二肽、三肽、四肽分子构象的相对稳定性,得到了满意的结果.该方法和 B3LYP/6 31G*方法得到的相对能量的线性相关方程为:y=0.887 3 x+0.647 3, 相关系数为R=0.939 7,最大偏差为 3.5 kJ/mol,标准偏差为1.47 kJ/mol. 展开更多
关键词 B3LYP 构象稳定性 大偏差 相关系 二肽 线性相关 能量 多肽 甘氨酸 CH
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一种新的由氢键连成的三维铜配合物[Cu(bpy)_2(ox)]·4H_2O(bpy=2,2′-bipyridine,ox=oxalateion)的合成与晶体结构(英文)
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作者 王玉虎 李冰 +3 位作者 曲婕 王文珍 顾文 刘欣 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期1-5,共5页
合成一种由氢键连成的三维网状Cu()配合物[Cu(bpy)2(ox)]·4H2O(bpy=2,2′-bipyridine,ox=oxalateion)并进行了结构表征.重复单元[Cu(bpy)2(ox)]·4H2O通过由氢键连成的四边形和八边形的环交替连接形成三维网状结构.配合物的晶... 合成一种由氢键连成的三维网状Cu()配合物[Cu(bpy)2(ox)]·4H2O(bpy=2,2′-bipyridine,ox=oxalateion)并进行了结构表征.重复单元[Cu(bpy)2(ox)]·4H2O通过由氢键连成的四边形和八边形的环交替连接形成三维网状结构.配合物的晶体结构属单斜晶系,空间群P2(1)/c,晶胞参数:a=0.9483(5)nm,b=1.7447(7)nm,c=1.6131(7)nm,β=117.94(2)°,V=2.3578(19)nm3,Z=4,F(000)=1108,μ=0.982,偏离因子R(int)=0.0625. 展开更多
关键词 晶体结构 三维氢键结构 Cu(Ⅱ)配合物 四边形环 八边形环
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一个新的七元环吡咯-吡啶氢键分子激发态分子内质子转移的理论研究
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作者 袁慧娟 郭续更 《化学研究》 CAS 2016年第3期294-298,共5页
运用含时密度泛函理论(TD-DFT)方法和以环己烷为溶剂的可极化连续模型(PCM),研究了2-[2-(1 H-pyrrol-2-yl)-cyclopent-1-enyl]-pyridine(7-HB)发生激发态分子内质子转移(ESIPT)的反应机制.结果表明,7-HB分子被光激发到Franck-Condon区域... 运用含时密度泛函理论(TD-DFT)方法和以环己烷为溶剂的可极化连续模型(PCM),研究了2-[2-(1 H-pyrrol-2-yl)-cyclopent-1-enyl]-pyridine(7-HB)发生激发态分子内质子转移(ESIPT)的反应机制.结果表明,7-HB分子被光激发到Franck-Condon区域后,在第一光学亮态(S_1)上会发生一个超快的从Normal(N)式到Tautomer(T)式的质子转移反应,其反应的能垒仅有0.05eV.此外,在相同计算水平下,还研究了7-HB分子的吸收和发射光谱,所得结果与实验数据吻合得很好. 展开更多
关键词 含时密度泛函理论 激发态分子内质子转移 七元环分子 氢键
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4,5-二溴-1-丙基-3-甲基咪唑和1-丙基-3-甲基咪唑基离子液体的密度泛函研究 被引量:1
10
作者 宋彩彩 林进 +1 位作者 曲占庆 吕仁庆 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2012年第3期40-48,共9页
采用密度泛函理论和DNP基组,对比研究了4,5-二溴-1-丙基-3-甲基咪唑和1-丙基-3-甲基咪唑与[PF6]-的相互作用。计算结果表明,H2原子和丙基支链氢原子与[PF6]-的氟原子相互作用形成氢键。[PMIM]+[PF6]-的最低未占轨道(LUMO)是分布在咪唑... 采用密度泛函理论和DNP基组,对比研究了4,5-二溴-1-丙基-3-甲基咪唑和1-丙基-3-甲基咪唑与[PF6]-的相互作用。计算结果表明,H2原子和丙基支链氢原子与[PF6]-的氟原子相互作用形成氢键。[PMIM]+[PF6]-的最低未占轨道(LUMO)是分布在咪唑环上的p*轨道,而[PMIM-Br]+[PF6]-的LUMO为环原子和Br原子构成的s*轨道。 展开更多
关键词 密度泛函理论 基于卤代咪唑的离子液体 氢键
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醋酸水溶液局域结构中氢键环的感知与统计-CPMD模拟结果分析 被引量:2
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作者 蒲亮 缪强 +2 位作者 徐红兰 章留留 张志炳 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1324-1328,共5页
提出了用于分子动力学模拟后处理氢键网络图的感知算法。对从头算分子动力学(CPMD)模拟的轨迹文件进行统计分析,得到了水溶液中醋酸单分子水合体系的局域结构特征信息。由径向分布函数得到定义氢键的上限,运用图论方法分析了溶液结构中... 提出了用于分子动力学模拟后处理氢键网络图的感知算法。对从头算分子动力学(CPMD)模拟的轨迹文件进行统计分析,得到了水溶液中醋酸单分子水合体系的局域结构特征信息。由径向分布函数得到定义氢键的上限,运用图论方法分析了溶液结构中水合团簇大小和简单氢键环结构及头环分布,其中六元环的突出含量与从头算稳定性分析一致。 展开更多
关键词 分子动力学 氢键网络 氢键环 化学图 水溶液 醋酸
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基于氢键作用的内酯开环聚合非金属有机催化剂 被引量:3
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作者 杜凡凡 郑映 +3 位作者 单国荣 包永忠 介素云 潘鹏举 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2018年第6期710-718,共9页
脂肪族聚酯具有生物可降解、生物相容及环境友好等优良性能,其已广泛应用于包装、农用地膜、生物医用材料等领域。与缩聚反应相比,内酯开环聚合反应条件温和,无小分子产生,容易制得高分子量、窄分子量分布的聚合物。目前,脂肪族聚酯主... 脂肪族聚酯具有生物可降解、生物相容及环境友好等优良性能,其已广泛应用于包装、农用地膜、生物医用材料等领域。与缩聚反应相比,内酯开环聚合反应条件温和,无小分子产生,容易制得高分子量、窄分子量分布的聚合物。目前,脂肪族聚酯主要通过配位聚合反应制备,通常使用金属配合物作为催化剂,所得聚合物中含有少量无法除去的金属离子,这限制了其在医用材料等领域的应用。与金属催化剂相比,非金属有机催化剂具有价廉、易制备、低毒等特点,因此非金属有机催化剂催化的内酯开环聚合反应受到了研究者的广泛关注。本文根据非金属有机催化剂作用机理的不同,从氢键作用机理出发,综述近年来基于氢键作用的非金属有机催化剂在内酯开环聚合领域的研究进展。 展开更多
关键词 脂肪族聚酯 开环聚合 非金属有机催化剂 氢键作用
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水溶性单乙氧基刺芒柄花素磺酸镁的合成及晶体结构研究
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作者 王秋亚 《分子科学学报》 CAS 北大核心 2020年第4期331-336,I0005,共7页
以异黄酮化合物刺芒柄花素为先导化合物,合成了水溶性的单乙氧基刺芒柄花素磺酸镁,并通过红外、氢谱、碳谱、元素分析和X射线单晶衍射表征了其结构.标题化合物的分子组成为[Mg(H2O)6](C18H15O4 SO3)2·4H2O,[Mg(H2O)6]2+,C18H15O4S... 以异黄酮化合物刺芒柄花素为先导化合物,合成了水溶性的单乙氧基刺芒柄花素磺酸镁,并通过红外、氢谱、碳谱、元素分析和X射线单晶衍射表征了其结构.标题化合物的分子组成为[Mg(H2O)6](C18H15O4 SO3)2·4H2O,[Mg(H2O)6]2+,C18H15O4SO3-和H2O之间存在多种氢键作用;此外,其晶体结构中还存在着分子间π…π及C—H…π芳环堆积作用.氢键、芳环堆积作用和阴、阳离子之间的静电引力共同将标题化合物组装成三维网络结构. 展开更多
关键词 刺芒柄花素 单乙氧基刺芒柄花素磺酸镁 氢键 芳环堆积作用 晶体结构
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