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Density Functional Calculations on a Double Hydrogen-bonded Dimer
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作者 建方方 赵朴素 汪庆祥 《Chinese Journal of Structural Chemistry》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第2期184-190,共7页
Density functional theory (DFT) calculations on a double hydrogen-bonded dimer of o-hydroxybenzoic acid were carried out at the B3LYP/6-31G* level. The optimized geometry of the dimer closely resembles that of the c... Density functional theory (DFT) calculations on a double hydrogen-bonded dimer of o-hydroxybenzoic acid were carried out at the B3LYP/6-31G* level. The optimized geometry of the dimer closely resembles that of the crystal. The calculated results show that the total energy of the dimer is much lower than the sum energies of the two monomers, and the average strength of the double hydrogen bonds is about 38.37 kJ/mol. In order to probe the origin of the interactions in the dimer, natural bond orbital analyses were performed. The thermodynamic properties of the title compound at different temperatures have also been calculated on the basis of vibrational analyses and ?GT, the change of Gibbs free energy for the aggregation from monomer to the dimmer, is 26.47 kJ/mol at 298.15 K and 0.1 MPa, implying the spontaneous process of forming the dimer. The correlation graphics of S0m, H0m and temperatures is depicted. 展开更多
关键词 hydrogen bond DIMER density functional theory natural bond orbital thermodynamic properties
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Hydrogen-bonding Interaction of 1,2,3-triazine-waters Complexes 被引量:2
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作者 Quan Li Fang-qian Huang Jing-dan Hu Ke-qing Zhao 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第5期401-405,共5页
有 6-31++G** 基础的密度功能的理论 B3LYP 方法被用来为 1,2,3-triazine- 优化扎根的状态的几何学(H <SUB>2</SUB > O )<SUB > n </SUB>(n=1,2,3 ) 建筑群。所有计算显示处于扎根的状态的 1,2,3-triazine-wat... 有 6-31++G** 基础的密度功能的理论 B3LYP 方法被用来为 1,2,3-triazine- 优化扎根的状态的几何学(H <SUB>2</SUB > O )<SUB > n </SUB>(n=1,2,3 ) 建筑群。所有计算显示处于扎根的状态的 1,2,3-triazine-water 建筑群有强壮的结合氢的相互作用,和建筑群有 N 惊讶氢债券和被一张 O HC 氢契约终止的水分子的链是最稳定的。拉长建筑群的模式的 HO 相对单体的是转移红的。另外,自然契约轨道(NBO ) 分析显示分子间的起诉在 1,2,3-triazine 之间转,水分别地为最稳定的 1:1, 1:2 和 1:3 建筑群是 0.0222e, 0.0261e 和 0.0273e。第一件汗衫(n, *) 单体 1,2,3-triazine 的垂直刺激精力和 1,2,3-triazine- 的结合氢的建筑群(H <SUB>2</SUB > O )<SUB > n </SUB> 被时间依赖者密度调查功能的理论。 展开更多
关键词 1 2 3-三氮杂苯 氢键 自然键轨道 垂直激发能 密度泛函理论
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Quantum Study on the Hydrogen Bonding Interaction of Luteolin-(CH_3OH)_n
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作者 张伶 咸婧 +4 位作者 张涛 王晓岚 蔡皖飞 张宏 李来才 《Chinese Journal of Structural Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2011年第4期524-532,共9页
The optimized geometries and vibration frequencies of luteolin,methanol and luteolin-(CH3OH)n complexes have been investigated by density functional theory using B3LYP method.Four stable luteolin-CH3OH complexes,six... The optimized geometries and vibration frequencies of luteolin,methanol and luteolin-(CH3OH)n complexes have been investigated by density functional theory using B3LYP method.Four stable luteolin-CH3OH complexes,six stable luteolin-(CH3OH)2 complexes and four stable luteolin-(CH3OH)3 complexes have been obtained.The theories of atoms in molecules(AIM) and natural bond orbital(NBO) have been used to analyze the hydrogen bonds of these compounds,and their interaction energies corrected by basis set superposition error are between-8.046 and-76.124 kJ/mol.The calculation results indicate strong hydrogen bonding interactions in the luteolin-(CH3OH)n complexes.Then the nuclear magnetic resonance(NMR) and electronic absorption spectrum of luteolin have been calculated,and the results are in agreement with the experimental data. 展开更多
关键词 density functional theory LUTEOLIN hydrogen bond natural bond orbital analysis
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HX与H_2O分子间氢键理论研究 被引量:2
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作者 张福兰 胡武洪 徐建华 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期403-410,共8页
在B3LYP/6-311++G^(**)水平上对H_2O与HX(F,C1,Br,I)分子间形成的(H_2O)_2HX和H_2O(HX)_2六元环氢键复合物的构型进行了全优化,频率计算表明,所有构型中O(2)—H(1),O(6)—H(5)及X(6)—H(5)的伸缩振动频率均发生红移,而对于X(4)—H(3)的... 在B3LYP/6-311++G^(**)水平上对H_2O与HX(F,C1,Br,I)分子间形成的(H_2O)_2HX和H_2O(HX)_2六元环氢键复合物的构型进行了全优化,频率计算表明,所有构型中O(2)—H(1),O(6)—H(5)及X(6)—H(5)的伸缩振动频率均发生红移,而对于X(4)—H(3)的伸缩振动频率在(H_2O)_2HF、(H_2O)_2HCl、H_2O(HF)_2体系中发生红移,在(H_2O)_2HBr、(H_2O)_2HI、H_2O(HCl)_2、H_2O(HBr)_2、H_2O(HI)_2体系中发生蓝移.在MP2/6-311++G^(**)水平上计算了体系的相互作用能,得到F、Cl、Br所形成的复合物其总相互作用能均为负值,而I形成的复合物其总相互作用能为正值.采用SCRF(PCM)方法研究了体系的溶剂化效应,结果表明溶剂化效应使复合物更稳定.自然键轨道(NBO))分析表明,复合物分子中的直接超共轭作用,导致了复合物中O(2)—H(1)、O(6)—H(5)及X(6)—H(5)键有所拉长,同时增加了复合物的稳定性.综合分析得到八种复合物的稳定性顺序为:H_2O(HF)_2>(H_2O)_2HF>(H_2O)_2HCl>(H_2O)_2HBr>H_2O(HCl)_2>H_2O(HBr)_2>(H_2O)_2HI>H_2O(HI)_2. 展开更多
关键词 氢键 卤化氢 密度泛函理论 自然键轨道
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C_6H_5NH-H□X分子间氢键的理论研究
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作者 陈自然 李权 《四川文理学院学报》 2011年第5期54-57,共4页
在B3LYP/6-311++G(3df,2p)理论水平上,对C6H5NH—H□X(X=H2O,HCOH,CH3COCH3,NH3,CH2NH和HCN)氢键体系进行几何结构优化与振动频率计算,在所得稳定构型的基础上进行自然键轨道分析和热力学性质研究.结果表明,C6H5NH—H□X体系存在较弱的N... 在B3LYP/6-311++G(3df,2p)理论水平上,对C6H5NH—H□X(X=H2O,HCOH,CH3COCH3,NH3,CH2NH和HCN)氢键体系进行几何结构优化与振动频率计算,在所得稳定构型的基础上进行自然键轨道分析和热力学性质研究.结果表明,C6H5NH—H□X体系存在较弱的N—H□O与N—H□N氢键,氢键的形成使H-N伸缩振动频率明显红移.在298.15 K和标准状态下,C6H5NH—H□X体系分子在气相的形成过程是一个放热、熵减的非自发过程. 展开更多
关键词 C6H5NH-H□X体系 氢键 密度泛函理论 自然键轨道
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卤素阴离子与氨分子复合物分子间氢键的密度泛函理论研究(英文)
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作者 李庆 吴军 +1 位作者 张先燚 崔执凤 《安徽师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2011年第4期321-327,共7页
利用密度泛函理论(DFT)研究了卤素阴离子X-(X=F,Cl,Br,I)与氨分子NH3复合物势能面上的稳定点,计算结果表明氨分子通过一个近似直线的单氢键结合到卤素离子上,优化的几何结构和自然键轨道(NBO)分析表明卤素离子X-(X=F,Cl,Br,I)与NH3分子... 利用密度泛函理论(DFT)研究了卤素阴离子X-(X=F,Cl,Br,I)与氨分子NH3复合物势能面上的稳定点,计算结果表明氨分子通过一个近似直线的单氢键结合到卤素离子上,优化的几何结构和自然键轨道(NBO)分析表明卤素离子X-(X=F,Cl,Br,I)与NH3分子形成的复合物以离子偶极型(ion-dipole)分子的形式存在. 展开更多
关键词 氢键 自然键轨道 密度泛函理论
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N-烷基乙二胺-双(三氟甲基磺酰)亚胺型质子化离子液体的分子间氢键作用 被引量:1
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作者 张欣辰 徐宇 花儿 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第5期540-547,共8页
本文研究选用密度泛函理论中M06-2X及6-311G(d,p)基组,对由N-烷基乙二胺阳离子[HAlkyl]+(hexyl,octyl、2-ethylhexyl及EtHex)与双(三氟甲基磺酰)亚胺阴离子[TFSA]-形成的[HHex][TFSA]、[HOct][TFSA]及[HEtHex][TFSA]型质子化离子液体(Pr... 本文研究选用密度泛函理论中M06-2X及6-311G(d,p)基组,对由N-烷基乙二胺阳离子[HAlkyl]+(hexyl,octyl、2-ethylhexyl及EtHex)与双(三氟甲基磺酰)亚胺阴离子[TFSA]-形成的[HHex][TFSA]、[HOct][TFSA]及[HEtHex][TFSA]型质子化离子液体(Protic ionic liquids,PILs)的分子间氢键相互作用进行理论研究,通过几何优化和分子振动频率分析得到其5种较稳定构型[HAlkyl][TFSA]S1~S5,结果表明:该类PILs的基组重叠误差(basis set superposition error,BSSE)校正后的分子间相互作用能ΔE int BSSE在-88.8^-108.9 kcal/mol范围内;由于阴阳离子间形成了较强的N—H…N或N—H…O型氢键,[HAlkyl]+阳离子中参与氢键的N—H键长延长,红外谱图显示N—H伸缩振动发生了红移,且红移值显著。通过自然键轨道理论分析可知,其稳定化能主要来源于阴离子[TFSA]-中N、O原子的孤对电子与阳离子[HAlkyl]+中N—H反键轨道之间的相互作用,即LP(N/O)→σ*(N—H)。采用分子中原子理论计算二阶微扰能E(2)值、电子密度ρc值及拉普拉斯值2ρc的结果表明,[HAlkyl]+中碳链的长短、支链的引入对[HAlkyl][TFSA]分子间氢键作用的强弱有较大的影响,并且在伯胺质子化构型(S1~S3)中形成的氢键相互作用比仲胺质子化构型(S4、S5)较强。 展开更多
关键词 质子化离子液体 密度泛函理论 分子间氢键作用 自然键轨道理论 分子中的原子理论
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甘氨酸与6-羟基嘌呤氢键作用的理论研究 被引量:2
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作者 裴玲 郝玮 《唐山师范学院学报》 2018年第6期36-40,共5页
采用密度泛函理论方法,在M062X/6-311+G(d,p)水平上对甘氨酸、6-羟基嘌呤及其复合物进行结构优化和频率计算,得到了10种稳定的复合物。分析发现,所有复合物进行基组重叠误差(BSSE)校正后的相互作用能均在-14.60~-70.56 kJ·mol^(-... 采用密度泛函理论方法,在M062X/6-311+G(d,p)水平上对甘氨酸、6-羟基嘌呤及其复合物进行结构优化和频率计算,得到了10种稳定的复合物。分析发现,所有复合物进行基组重叠误差(BSSE)校正后的相互作用能均在-14.60~-70.56 kJ·mol^(-1),属于氢键能量范围;相互作用能主要由氢键贡献,其大小与氢键的数目有关。通过自然键轨道(NBO)理论分析验证了复合物中氢键的存在。分子中的原子(AIM)理论分析表明,Y···H存在键鞍点,且电子密度和Laplacian值都在氢键范围之内,所得复合物的相互作用均为闭壳层体系之间的相互作用。 展开更多
关键词 密度泛函理论 氢键 NBO AIM
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Theoretical Investigation on Interaction between Guanine and Luteolin
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作者 Lai-cai Li Kun-kun Bai Wan-fei Cai 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 2013年第5期533-540,I0003,共9页
luteolin 和 guanine 的交往的模式被使用有 631+G* 基础的功能的理论 B3LYP 方法设置了的密度调查了。为 luteolinguanine 建筑群的十八稳定的结构分别地被发现了。结果显示建筑群被结合的氢主要稳定相互作用。同时,氢债券的数字和力... luteolin 和 guanine 的交往的模式被使用有 631+G* 基础的功能的理论 B3LYP 方法设置了的密度调查了。为 luteolinguanine 建筑群的十八稳定的结构分别地被发现了。结果显示建筑群被结合的氢主要稳定相互作用。同时,氢债券的数字和力量在决定能形成二的建筑群或更多的氢契约的稳定性起重要作用。在分子和天赋的原子的理论结合轨道也被利用了调查涉及所有系统的氢契约。被基础集合重叠错误改正的所有建筑群的相互作用精力是 6.0456.94 kJ/mol。计算结果显示在 luteolinguanine 建筑群有强壮的氢结合相互作用。我们比较了在 luteolin 和 DNA 的四个底之间的相互作用,并且发现 luteolinthymine 是最强壮并且 luteolinadenine 最弱。在 luteolin 和 DNA 底之间的相互作用都比 luteolinwater 强壮。 展开更多
关键词 相互作用模式 木犀草素 鸟嘌呤 氢键相互作用 B3LYP方法 密度泛函理论 相互作用能 稳定性
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