SSR标记用于玉米自交系遗传变异与优势类群划分的研究(英文)

采用 SSR和杂种优势聚类方法分析我国 1 5个玉米骨干自交系的遗传变异 ,并初步进行了杂种优势类群划分。从 62个 SSR引物中筛选出的 40对有效引物对 1 5个玉米自交系进行了分析 ,共检测到 1 88个等位基因变异 ,每个 SSR座位的等位基因数 2～ 9个 ,平均为 4.7个。 SSR位点的多态信息含量 PIC值平均为 0 .675 ,分布范围在 0 .360～ 0 .85 1之间。根据SSR数据对供试材料进行遗传相似性分析 ,Nei氏相似性系数分布在 0 .5 74～ 0 .777之间。 1 0对多态性高的 SSR引物可有效区分 1 5个自交系。应用 SSR聚类分析的结果与系谱关系相一致 ,与杂种优势聚类法相比较 ,SSR方法具有效率高、结果可靠、可标准化的特点。对

根据SSR标记划分优质蛋白玉米自交系的杂种优势群

利用 SSR标记技术对 18个优质蛋白玉米 (QPM)自交系和 4个代表国内主要杂种优势群的普通玉米标准测验种进行杂种优势群划分 ,研究热带、亚热带 QPM与温带玉米自交系之间的遗传关系。从 70对引物中筛选出 39对扩增谱带清晰且具有多态性的 SSR引物 ,在供试材料中检测到 134个等位基因变异 ,平均多态性信息量为 0 .5 5。根据扩增谱带建立 0、 1型数据 ,计算 2 2个自交系间的遗传相似值 ,然后做聚类分析。结果表明 ,供试的 18个 QPM自交系可划分为 5群 :第一群与旅大红骨种质的遗传距离较近 ,包括 CML 14 9、 CA339、 CML 15 4、长 6 31/o2、中系 0 96 /o2、CML 16 6和 CML 16 4。第二群接近四平头种质 ,包括 CML 14 0、 YML 2 3、 YML 2 9和 CML 194。第三群接近瑞得种质 ,包括忻 910 1/o2和齐 2 0 5。第四群与兰卡斯特种质的距离较近 ,包括 YML 12和 YML 10 2。第五群与四个主要杂种优势类群的距离都比较远 ,包括 CML 14 7、 CML 16 1和 CML 171。 SSR标记划群与田间产量配合力划分结果及系谱分析基本一致。

贵州70份玉米自交系的SSR标记遗传多样性及其杂种优势群分析

从251个SSR标记中筛选出均匀分布在玉米基因组上的88个SSR标记,用以分析评价贵州省2000年以来47个审定品种的70份亲本材料的遗传多样性。SSR标记检测的结果:88个标记共检测出466个等位基因,每个标记可检测等位基因2～18个,平均为5.31个;每个标记位点的多态性信息量(PIC)变化为0.213～0.965,平均为0.586,这表明贵州玉米自交系具有较为丰富的遗传多样性。POPTREE聚类分析结果:70份自交系分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类群。Ⅰ类群含8个自交系,以瑞德和兰卡斯特等温带种质为主。Ⅱ类群有11个自交系,以PN78599、瑞德和兰卡斯特等温带种质为主。Ⅲ类群拥有51个自交系,可分为A和B 2个亚群,B亚群还可再分为B1和B2 2个次亚群,A亚群中的10个系以我国地方温带种质为主,B1次亚群中的19个系以贵州地方亚热带种质为主,B2次亚群中的22个系以泰国苏湾热带种质为主。杂种优势利用分析的结果表明,贵州近些年在玉米育种中,主要是利用贵州地方亚热带种质和泰国苏湾热带种质2个杂种优势群,这与其多态位点百分率较高有关,与其群内SSR位点的平均等位数较多有关。贵州玉米育种利用的种质类型较少,有必要加强玉米种质的扩增、改良与创新研究。

利用SSR标记划分玉米自交系杂种优势群的研究

利用SSR标记对64个玉米自交系进行了杂种优势群的划分。20对SSR引物在供试材料中共检测出96个等位基因的变异,每对引物检测出等位基因数2～9个,平均4.36个。多态信息量变化范围为0.22～0.86,平均多态信息量为0.61。UPGMA聚类分析结果表明,供试自交系可分为8大类群,分类的结果与系谱关系基本一致。

SSR分子标记在玉米杂种优势群划分中的应用

利用SSR标记研究了20个玉米自交系的遗传变异,初步进行了杂种优势群划分,从85对SSR引物中筛选出70对扩增产物具有稳定多态性的引物。70对引物在供试材料中共检测出270个等位基因变异,每对引物检测到等位基因2～6个,平均3.86个,多态性信息含量变化范围为0.26～0.80,平均多态性信息量为0.59。20个自交系之间的遗传相似系数变化范围为0.5946～0.7711,平均为0.6601。UPGMA聚类分析结果表明,供试自交系可分为5群,分类结果与系谱基本一致,划群后群间平均距离大于群内平均距离,群间平均产量大于群内平均产量。SSR标记可以进行玉米自交系遗传变异分析,并用于杂种优势群的划分。

利用SSR划分56份玉米自交系的杂种优势群

利用SSR标记对50份玉米自交系和6个国内标准测验种的遗传多样性进行分析并划分杂种优势群.结果表明:从60对引物中筛选出43对扩增带清晰且多态性高的SSR引物进行统计,在供试材料中检测出139个等位基因变异,每对引物检测等位基因2～6个,平均3.23个,多态性信息量在0.216～0.821之间,平均为0.607.用UPGMA方法进行聚类分析,将56份玉米自交系划分为5个杂种优势群,合并后为SS(旅大红骨、PA、Reid)和NSS(PB、四平头、Lancaster)两大种质类群.

玉米SSR标记杂优类群划分及群体遗传结构分析

分析玉米自交系的遗传多样性和群体的遗传结构，可以为优势杂交种的配制提供理论依据。本实验利用筛选后均匀分布在玉米基因组上的70对SSR引物对96份来自平凉育种站的玉米自交系和6个国内通用的标准测验种进行遗传多样性分析，从而划分杂种优势群。针对目标群体，使用Structure2．3．1软件，设定亚群数目（K）为1～9，并假定标记位点都是独立的，利用△K（k）确定最适合的K值，生成Q-matrix，进而对群体遗传结构进行评估。研究结果表明，供试材料中有213个等位基因变异，每对引物检测出等位基因数2～7个，平均3．610个。多态性信息量变化范围0．216～0．846，平均0．614。102个玉米自交系间的遗传相似系数，范围在0．282～0．882，平均0．670。用UPGMA方法进行聚类分析，102份玉米自交系划分为6个杂种优势群，合并后为SS（旅大红骨、PA、Reid）和NSS（PB、四平头、Lancaster）两大种质类群。群体结构评估表明，最合适的K值=7，即目标群体中存在7个亚群。研究结果为选配新杂交组合提供了理论依据。

SSR分子标记技术在玉米杂种优势群划分中的应用

利用SSR分子标记研究了32份玉米自交系的遗传变异,初步进行了杂种优势群划分。从40对SSR引物中筛选出24对扩增产物具有稳定多态性的引物,24对引物在供试材料中共检出165个等位基因变异,每对引物检测到等位基因3～12个,平均6.875个。按UPGMA方法进行的聚类分析结果表明,供试自交系可划分为4个类群,利用SSR标记可以对玉米自交系的遗传变异进行初步分析,并可用于杂种优势群划分。

广西玉米骨干自交系的SSR分群及杂种优势模式分析

本研究对广西14个玉米骨干自交系与5个代表国内主要杂种优势群的普通玉米标准测验种(黄早四、Mo17、丹340、掖478和B73)进行SSR分析,旨在探讨广西玉米骨干系跟国内5大玉米杂种优势群之间的遗传关系。结果表明,交51、HI、武125与黄早四同属于四平头群;苏BC、钦8、5公与丹340同属于旅大红骨群;M9、双M9与Mo17同属于兰卡斯特群;CML165、陕72-1-1-1、7239、南60-1与B73同属于瑞德群;花83-2、CML161与掖478同属于PN群。本研究还分析了广西的玉米杂种优势模式,结果表明广西玉米育种中应用的杂种优势模式主要为"兰卡斯特群×旅大红骨群"和"非瑞德群×瑞德群"。研究结果将对当地今后选育新型玉米自交系和杂交组合具有重要指导意义。

基于SSR标记的96份玉米自交系杂优类群划分

为解决当前玉米自选系种质类群混乱,组配效率低下等问题,选用70对SSR引物分析了96份甘肃当地玉米自交系的遗传多样性.结果表明：70对SSR引物共检测到223个等位片段,每对引物可以稳定检测到2～5个等位片段,平均每对检测到3.61个等位片段.多态性信息量变化范围在0.153～0.787之间,平均0.60.遗传相似系数范围在0.497～0.919之间,平均0.640.采用UPGMA聚类分析法96份玉米自交系可划分为6个杂种优势群,合并为SS和NSS 2大种质类群.

SSR标记用于玉米自交系类群划分的研究

利用SSR标记研究了 10个玉米自交系的遗传变异 ,初步进行了杂种优势群划分。 10对SSR引物在供试材料中共检测出 4 0个等位基因变异 ,每对引物检测出等位基因 2～ 5个 ,平均检出4个 ,平均多态信息含量值为 0 .6 5,10个自交系间平均遗传相似系数为 0 .2 7。聚类分析结果表明 ,供试自交系可归为两个类群 ,每个类群又分别由两个亚群组成。利用SSR标记可以对玉米自交系的遗传变异进行初步分析 ,并可用于杂种优势群划分。

利用SSR标记划分144份玉米自交系的杂种优势群

利用SSR标记对144份玉米自交系遗传多样性进行研究,初步进行了杂种优势群划分。从224对SSR引物中筛选出90对扩增带型稳定且具有多态性的引物,从供试材料中共检测到424个多态性位点,每个SSR标记的等位基因数为2~10个,平均为4.71个;多态性信息量为0.11~0.82,平均为0.53。利用UPGMA方法将144份自交系划分为2大类,5个亚群,分析结果与系谱分析基本一致。

SSR分子标记在玉米种质研究中的应用

SSR分子标记是继形态、细胞和生化标记之后一种重要的遗传标记。主要阐述了SSR分子标记的原理及其在指纹图谱构建、杂种优势群划分、玉米自交系遗传变异研究、玉米新品种纯度及真伪的鉴定等方面的应用,探讨了其在玉米种质研究中存在的问题和应用前景。

48份玉米自交系的SSR遗传多样性分析

利用SSR标记对48个黑龙江省玉米自交系进行遗传多样性分析，初步进行了杂种优势群划分。从100对SSR引物中筛选取20对扩增带清晰且具有稳定多态性的引物。结果表明：20对引物在供试材料中共检测出105个等位基因变异，平均每对引物检测到等位基因数位5．25个，变化范围在3～7个，多态性信息含量变化范围为0．405～0．793，平均多态性信息量为0．664。48个自交系之间的遗传相似系数变化范围为0．400～0．905。UPGMA聚类分析结果表明：供试自交系被划分为5大类群，聚类结果与系谱分析基本一致。因此，SSR标记可以进行玉米自交系遗传变异分析，并用于杂种优势群的划分。

利用SSR核心引物分析257份玉米自交系遗传多样性

为简化杂种优势类群划分,加快育种进程,利用64对SSR核心引物对257份玉米自交系进行遗传多样性分析。结果表明:共检测出422个等位基因变异,每对引物检测出3～9个等位基因,平均6.59个。每个位点的多态性信息量(PIC)为0.444～0.879,平均0.769。257份自交系之间的遗传相似系数变化范围0.036～0.943。按UPGMA类平均方法进行聚类分析,供试自交系可划分为4大类群,6个亚群(Lancaster、旅大红骨、塘四平头、BSSS、PA和PB)。聚类结果与系谱基本一致。

基于SSR标记和骨干自交系的外引玉米自交系杂种优势群划分

研究玉米杂种优势群及其模式对于提高育种效率及预见性具有重要意义.利用40个SSR核心标记、6份骨干自交系和49份外引自交系进行杂种优势群划分和遗传多样性分析,结果表明,40个SSR标记在49份外引自交系中共检测到242个等位变异,每个标记检测到4～11个等位基因、平均6.05个,PIC变化范围0.3224 （phi072） ～0.8376 （bnlg2235）、平均为0.6347,基因多样性趋势与PIC基本一致,变化范围0.3640（phi072） ～0.8538 （bnlg2235）、平均为0.6767.结合骨干自交系系谱的聚类与基于混合模型的群体结构分析结果,将外引材料划分为唐四平头、瑞德、改良瑞德、兰卡斯特4个类群.

利用SSR对60个玉米自交系进行杂种优势群划分初探

用SSR对60个玉米自交系的DNA进行分子标记和杂种优势群划分研究。利用14对SSR引物在供试材料中检测出57个等位基因变异,每对引物检测等位基因2～7个,平均为4．07个,多态信息量变化范围为0．389～0．832,平均为0．692。自交系间遗传相似系数变幅为0．058～0．756,UPGMA聚类分析表明,供试自交系可分为五个类群。利用这14对具有较高多态性信息量的引物,可以对供试材料进行初步鉴定。

70份玉米自交系的SSR遗传多样性及杂种优势群分析

从80对玉米（Zea mays L.）SSR引物中筛选出26对扩增带型稳定性较高的引物,利用这些SSR引物对70份国内外收集引进的玉米自交系和6个国内标准测验种进行遗传多样性分析.结果表明,26对引物在76份玉米材料中共检测到80个等住基因位点,每对引物检测出2～6个等位基因,平均3.08个;每个位点的多态性信息含量变化范围为0.18～0.80,平均为0.45.UPGMA聚类结果表明,70份玉米自交系可划分为PA、Lancaster、旅大红骨、四平头、PB、BSSS 6个杂种优势类群.

RAPD和SSR标记在玉米遗传多样性分析中的应用

利用RAPD和SSR两种标记方法研究了16个玉米自交系的遗传多样性,并对这两种分子标记系统进行了比较。结果表明,利用15条RAPD引物,检测到了126条有多态性的带。用筛选出的20对SSR引物,检测到69个等位基因。RAPD和SSR分子标记均有很高的多态性,RAPD多态性带比例数86%,SSR位点检测出的平均等位基因数3. 4个。RAPD分子标记结果将16个玉米自交系划分为4组,SSR分子标记将其划分为5组。与系谱分析基本一致,两种分子标记划分的结果也相似。研究认为,RAPD、SSR两种分子标记系统均适合于玉米种质的遗传多样性研究。

河南省主要玉米品种杂种优势利用模式分析

目的分析河南省主要玉米品种杂种优势的利用模式。方法利用玉米基因组的143对SSR引物,从中筛选出均匀覆盖玉米染色体组的95对多态性引物,对河南省主要审(认)定品种的亲本及少数其它自交系进行PCR扩增,用UPGMA法对自交系进行聚类分析,同时对河南省审定品种及部分外引品种在1981～2003年的利用情况进行统计分析。结果(1)河南省审(认)定品种的主要自交系可分为Reid、温热、四平头、旅大红骨、Lancaster和综合种选系6个类群,与系谱分析基本吻合;(2)河南省玉米生产上利用的杂优模式主要有12种,其中Reid×唐四平头、Lan.×旅大红骨两种主要模式的应用面积分别为26.47%和20.62%,约占河南省玉米累计推广面积的47%;Reid×旅大红骨占9.41%;而温热×其它(综合种选系或Reid等)占9.07%,是一种新的杂种优势模式。结论20多年来,河南玉米生产上利用的12种杂优模式中,Reid×唐四平头和Lan.×旅大红骨是两种最主要的模式,应用面积约占1/2。