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Ab initio potential energy surface and anharmonic vibration spectrum of NF_(3)^(+)
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作者 陈艳南 徐建刚 +3 位作者 范江鹏 马双雄 郭甜 张云光 《Chinese Physics B》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第1期327-333,共7页
Potential energy surfaces(PESs), vibrational frequencies, and infrared spectra are calculated for NF_(3)^(+) using ab initio calculations, based on UCCSD(T)/cc-p VTZ combined with vibrational configuration interaction... Potential energy surfaces(PESs), vibrational frequencies, and infrared spectra are calculated for NF_(3)^(+) using ab initio calculations, based on UCCSD(T)/cc-p VTZ combined with vibrational configuration interaction(VCI). Based on an iterative algorithm, the surfaces(SURF) program adds automatic points to the lattice representation of the potential function, the one-dimensional and two-dimensional PESs are calculated after reaching a convergence threshold, finally the smooth image of the potential energy surface is fitted. The PESs accurately account for the interaction between the different modes, with the mode q_(6) symmetrical stretching vibrations having the greatest effect on the potential energy change of the whole system throughout the potential energy surface shift. The anharmonic frequencies are obtained when the VCI matrix is diagonalized. Fundamental frequencies, overtones, and combination bands of NF_(3)^(+) are calculated, which generate the degenerate phenomenon between their frequencies. Finally, the calculated anharmonic frequency is used to plot the infrared spectra.Modal antisymmetric stretching ν_(5) and symmetric stretching ν_(6) exhibit a phenomenon of large-intensity borrowing. This study can provide data to support the characterization in the laboratory. 展开更多
关键词 ab initio methods potential energy surfaces vibration frequencies coupled resonance infrared spectra
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Convergence Issues Associated with Cutoff Energies and Ab Initio Studies of Adsorption of CO on W and Pt
2
作者 Sathya Hanagud Roussislava Zaharieva 《Journal of Materials Science and Chemical Engineering》 2024年第3期1-8,共8页
The experimental research programs of 1950s, to understand the adsorption of CO on W surfaces, changed to ab initio studies in 2000s. The goals were to seek improved practical applications. Most of the studies were ba... The experimental research programs of 1950s, to understand the adsorption of CO on W surfaces, changed to ab initio studies in 2000s. The goals were to seek improved practical applications. Most of the studies were based on density functional theory. Many studies also used programs, such as VASP (Vienna Abinitio simulation package) and CPMD. The computational procedures used plane wave approximations. This needed studies with selection of K points and cutoff energy selection to assure convergence in energy calculations. Observations and analysis of papers published from 2006 to 2022 indicate that the cutoff energies were selected arbitrarily without any needed convergence studies. By selecting a published 2006 paper, this paper has clearly showed that an arbitrary selection of cutoff energy, such as 460 eV, is not in the range of, cutoff energies that assure convergence of energy calculations, with ab initio methods and have indicated correction procedures. . 展开更多
关键词 CO Adsorption Tungsten and Pt surfaces Cutoff Energy Selection Convergence of Ab initio Energy
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Ab initio study of chemical effect on structural properties of Ti–Al melts
3
作者 冯运 冯艳 彭海龙 《Chinese Physics B》 SCIE EI CAS CSCD 2023年第10期556-560,共5页
We study chemical effect on the structural properties of Ti–Al melts, with the Al concentration systematically changed,via ab initio molecular dynamics simulations. By calculating the partial coordination numbers, we... We study chemical effect on the structural properties of Ti–Al melts, with the Al concentration systematically changed,via ab initio molecular dynamics simulations. By calculating the partial coordination numbers, we find a preferred connection between the nearest neighbors for Al–Ti pairs. This induces an excess Ti coordination in the cluster characterized by local five-fold symmetry in Voronoi tessellation. Structural entropy measured from the diversity of Voronoi polyhedrons shows an intriguing non-monotonic tendency with concentration: it first decreases to a minimum value at Ti_(40)Al_(60), and then increases beyond this concentration. This implies a more ordered local structure induced by the chemical interaction at the intermediate compositions. The spatial correlation among the crystalline-like or the icosahedral-like clusters also exhibits the highest intensity for Al–Ti pairs, verifying the important role played by the chemical interaction in the local structure connectivity. 展开更多
关键词 Ti–Al alloys chemical effect atomic structure ab initio simulations
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基于语言模型的蛋白质结构域边界预测方法
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作者 张贵军 汪乾梁 彭春祥 《浙江工业大学学报》 CAS 北大核心 2024年第5期521-529,共9页
蛋白质结构域对于蛋白质结构和功能研究具有重要意义。针对目前从头预测蛋白质结构域的方法普遍存在精度不高、耗费资源多等问题,提出了一种基于语言模型的蛋白质结构域边界预测方法DomTransformer,该方法基于蛋白质结构分类数据库(CATH... 蛋白质结构域对于蛋白质结构和功能研究具有重要意义。针对目前从头预测蛋白质结构域的方法普遍存在精度不高、耗费资源多等问题,提出了一种基于语言模型的蛋白质结构域边界预测方法DomTransformer,该方法基于蛋白质结构分类数据库(CATH)、蛋白质结构预测关键评估(CASP)竞赛数据,以及在AFDB(AlphaFold protein structure database)基础上建立的域数据库等共同构建数据集,搭建了基于Transformer网络架构和稀疏多头自注意力机制的网络模型,引入了新的特征、接触数和域级MSA(Domain multiple sequence alignment),通过直接预测结构域边界来解决数据不平衡等问题。在独立测试集上的测试结果表明了DomTransformer的有效性。 展开更多
关键词 蛋白质结构域 语言模型 从头预测
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8-羟基喹啉铝光电性质的Ab initio和DFT研究 被引量:19
5
作者 苏忠民 程红 +4 位作者 高洪泽 孙世玲 初蓓 王荣顺 王悦 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2000年第9期1416-1421,共6页
利用 ab initio HF和密度泛函理论 B3L YP等方法 ,对金属有机配合物 8-羟基喹啉铝 (Al Q3)进行几何结构优化 ,探索分子内部电子跃迁的机理 .结果表明 ,电子从基态跃迁到低激发态时主要为π-π* 跃迁 ;电荷从含氧的苯酚环转移至含氮的吡... 利用 ab initio HF和密度泛函理论 B3L YP等方法 ,对金属有机配合物 8-羟基喹啉铝 (Al Q3)进行几何结构优化 ,探索分子内部电子跃迁的机理 .结果表明 ,电子从基态跃迁到低激发态时主要为π-π* 跃迁 ;电荷从含氧的苯酚环转移至含氮的吡啶环上 ,包括两环之间 C→ C转移和 O→ N转移 ,与金属离子关系不大 .考虑到配体对发光性质的贡献 ,进一步设计了 3种 Al Q3的衍生物 . 展开更多
关键词 8-羟基喹啉铝 ab initio DFT 电子跃迁机理
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Cu^+和Ag^+叠氮盐晶体的周期性ab initio计算 被引量:4
6
作者 居学海 姬广富 +1 位作者 邱玲 肖鹤鸣 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第11期2125-2127,共3页
The energy bands,electronic structures of CuN3 and AgN3 crystallines were investigated by periodic ab initio method.The charge density projection shows that there are overlaps of isodensities between the terminal nitr... The energy bands,electronic structures of CuN3 and AgN3 crystallines were investigated by periodic ab initio method.The charge density projection shows that there are overlaps of isodensities between the terminal nitrogen and metallic ion,indicating that the metals and the azides are combined by covalent bonds.The crystal lattice energies are-781.05 and-840.83 kJ/mol for CuN3 and AgN3 respectively.These results approach the data obtained by Gray′s approximate method.The frontier crystal orbital mainly consists of the atomic orbital of azide′s terminal nitrogen.The energy gap for AgN3 is smaller than that of CuN3,and the highest occupied crystal orbitals of AgN-3 consist of both the atomic orbitals of the terminal nitrogen in azide and the silver ion,which facilitates the electron to leap from terminal nitrogen in azide to metallic ion directly.Hence silver azide is slightly more sensitive than copper azide.The elastic coefficients C11,C22 and C33 of CuN3 are predicted to be 96.52,96.86 and 154.06 GPa,C11 and C22 of AgN3 are 303.29 and 138.80 GPa. 展开更多
关键词 CuN3和AgN3晶体 Ab initio 能带结构 电子结构 感度 弹性系数
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TiC/Ni固液界面异质形核行为的第一性原理分子动力学模拟
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作者 王文菲 康瑶 +3 位作者 黄盛星 黄昊 王旭东 姚曼 《中国有色金属学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第8期2673-2683,共11页
本文借助第一性原理分子动力学方法和密度泛函理论,针对四种TiC/Ni固液界面,从原子的异质形核行为与界面的电子性质两方面综合分析,进一步研究TiC促进Ni异质形核的机制。结果表明:TiC(100)、[Ti]-TiC(111)、[C]-TiC(111)基底均可诱导出N... 本文借助第一性原理分子动力学方法和密度泛函理论,针对四种TiC/Ni固液界面,从原子的异质形核行为与界面的电子性质两方面综合分析,进一步研究TiC促进Ni异质形核的机制。结果表明:TiC(100)、[Ti]-TiC(111)、[C]-TiC(111)基底均可诱导出Ni的预形核层(Pre-nucleation layer,PNL),且界面PNL的层间及面内有序度排序均为:[Ti]-TiC(111)/Ni>[C]-TiC(111)/Ni>TiC(100)/Ni。[Ti]-TiC(111)与PNL的Ni原子之间的强相互作用及化学键合使得其诱导出的PNL有序度最高。而TiC(110)基底无法诱导液体Ni原子形成预形核层,相较于上述三种基底,其促进Ni原子形核的能力最弱。在降温过程中,液相中剩余的Ni原子通过在TiC(100)、[Ti]-TiC(111)及[C]-TiC(111)基底诱导出的PNL作为过渡层的基础上,随温度的降低在PNL外侧聚集成簇,形成稳定的晶核。 展开更多
关键词 TiC/Ni固液界面 预形核层 异质形核 第一性原理分子动力学模拟
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硝酸甲酯分子间相互作用的DFT和ab initio比较 被引量:9
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作者 谭金芝 肖鹤鸣 +1 位作者 贡雪东 李金山 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第4期307-314,共8页
用密度泛函理论(DFT)和从头算(abinitio)方法,分别在B3LYP/6-31G和HF/6-31G水平上求得硝酸甲酯三种二聚体的全优化几何构型和电子结构,并用6-311G和6-311++G基组进行总能量计算.对HF/6-31G计算结果进行MP4SDTQ电子相关校正.在各基组下... 用密度泛函理论(DFT)和从头算(abinitio)方法,分别在B3LYP/6-31G和HF/6-31G水平上求得硝酸甲酯三种二聚体的全优化几何构型和电子结构,并用6-311G和6-311++G基组进行总能量计算.对HF/6-31G计算结果进行MP4SDTQ电子相关校正.在各基组下均进行基组叠加误差(BSSE)和零点能(ZPE)校正求得结合能.对6-31G优化构型作振动分析并基于统计热力学求得200~600K温度下单体和二聚体的热力学性质.详细比较两种方法的相应计算结果,发现DFT求得的分子间距离较短,分子内键长较长,所得结合能均小于相应abinitio计算值. 展开更多
关键词 硝酸甲酯二聚体 分子间相互作用 密度泛函理论 DFT 从头算 热力学性质
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[Si(S_2Ph)_n]^(m±)(n=1~3)化合物稳定性的ab initio和DFT研究 被引量:3
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作者 高洪泽 段红霞 +3 位作者 祖薇 程红 仇永清 苏忠民 《东北师大学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2000年第2期44-47,共4页
采用ah initio HF及密度泛函(DFT)B3LYP方法对[Si(S2Ph)n]m± (n=1~3)的稳定结构以及结合能进行系统的理论计算,分析了该配合物体系 稳定存在的可能性,并运用完全均衡校正法对基函数重叠... 采用ah initio HF及密度泛函(DFT)B3LYP方法对[Si(S2Ph)n]m± (n=1~3)的稳定结构以及结合能进行系统的理论计算,分析了该配合物体系 稳定存在的可能性,并运用完全均衡校正法对基函数重叠误差(BSSE)进行了校 正,同时对配合物分子轨道进行了分析,为实验研究提供了有参考价值的理论结 果. 展开更多
关键词 ab-initio 邻苯二酚 配合物 BSSE 结合能 DFT
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硝酸乙酯分子间相互作用的ab initio研究 被引量:5
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作者 谭金芝 肖鹤鸣 +1 位作者 贡雪东 李金山 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第2期200-206,共7页
在abinitio HF/ 6 31G 水平上求得硝酸乙酯二聚体势能面上的四种优化构型和电子结构 .经MP2电子相关校正和基组叠加误差 (BSSE)以及零点能 (ZPE)校正 ,求得二聚体的最大结合能为 11.46kJ·mol-1.还进行HF/ 6 311G 和HF/ 6 31... 在abinitio HF/ 6 31G 水平上求得硝酸乙酯二聚体势能面上的四种优化构型和电子结构 .经MP2电子相关校正和基组叠加误差 (BSSE)以及零点能 (ZPE)校正 ,求得二聚体的最大结合能为 11.46kJ·mol-1.还进行HF/ 6 311G 和HF/ 6 311++G 水平的总能量比较计算 ,发现 6 31G 基组对计算结合能比较适合 .二子体系间的电荷转移很少 .对优化构型进行振动分析 ,并基于统计热力学求得从单体形成二聚体的热力学性质变化 . 展开更多
关键词 硝酸乙酯 分子间相互作用 从头计算 自然键轨道分析 热力学性质 量子化学 ABinitio
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PH_(1-3)^(0-1+)离解能和电离能的精确 ab initio 计算 被引量:3
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作者 苏克和 甘正汀 +3 位作者 胡小玲 李秀仪 王育彬 文振翼 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 1997年第4期352-359,共8页
对PHn、PH+n(n=1~3)及其一些构型反转过渡态的几何构型用MP2(ful)/6-31G(d,p)解析梯度方法优化,同时在该级别上计算了分子振动频率和零点振动能。在此基础上,分别采用Gaussian-94程序中... 对PHn、PH+n(n=1~3)及其一些构型反转过渡态的几何构型用MP2(ful)/6-31G(d,p)解析梯度方法优化,同时在该级别上计算了分子振动频率和零点振动能。在此基础上,分别采用Gaussian-94程序中最大的预置基组6-311++G(3df,3pd)和Dunning基组aug-cc-pVTZ,在冻结芯电子相关能(FC)与非冻芯模型(ful)情况下,用高级别量子化学abinitio方法QCISD(T)及CCSD(T)对这些体系的离解能、PHn的电离能等进行了精确计算,并与已有实验数据和多参考态MRSD-CI及SOCI等理论工作(基组大小接近)进行了比较,理论计算结果与可靠的实验数据比较,离解能符合达±7kJ/mol,电离能达±5kJ/mol。总体效果比CASSCF/COCI等的结果好,说明在平衡构型分子的精确能量计算中,满足大小一致性和考虑三级激发比考虑多参考态可能更重要。还对PH3、PH+3的构型反转势垒及PH3的单-三重态分裂能进行了高级别的计算,也得到了一些有意义的结果。对于所使用的两种基组在FC与ful情况下的比较表明,如果使用FC模型,则较小的6-311++G(3df,3pd)基组比较? 展开更多
关键词 离解能 电离能 从头算 PH3 PH2
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Al2F2分子结构与稳定性的ab initio计算研究 被引量:2
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作者 于海涛 黄旭日 +4 位作者 池玉娟 傅宏刚 丁益宏 李泽生 孙家钟 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第7期1059-1065,共7页
用ab initio方法在UMP2/6-311G(d)水平下计算了Al2F2分子可能的异构体构型和AlF二聚化成Al2F2分子的反应能.UMP2/6-311G(d)和UQCISD(T)/6-311+G(3df)∥UMP2/6-311G(d)水平下的能量值均说明具有D2h对称性、1Ag电子态的异构体是A12F2分子... 用ab initio方法在UMP2/6-311G(d)水平下计算了Al2F2分子可能的异构体构型和AlF二聚化成Al2F2分子的反应能.UMP2/6-311G(d)和UQCISD(T)/6-311+G(3df)∥UMP2/6-311G(d)水平下的能量值均说明具有D2h对称性、1Ag电子态的异构体是A12F2分子的最稳定构型,其Al-F键长为0.19074nm,键角Al-F-Al和F-Al-F分别为104.62°和75.38°,以及两个强振动,441.27cm-1和401.93cm-1,均与实验结果相符合.电子结构分析表明,具有D2h对称性的异构体的活性中心在2个Al原子上,在形成衍生物时是主要的反应加成位置.在UMP2/6-311G(d)和UQCISD(T)/6-311+G(3df)∥UMP2/6-311G(d)水平下得到了AIF二聚化能量分别为-75.01kJ/mol和-66.07kJ/mol,与文献估计值基本一致,说明AlF二聚化反应在能量上是有利的. 展开更多
关键词 Al2F2分子 二聚作用 异构化反应 电子结构 ab initio 稳定性 氟化铝 构型
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簇模型选取的配位数原则——CO/ZnO吸附体系的ab initio研究 被引量:4
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作者 吕鑫 徐昕 +1 位作者 王南钦 张乾二 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1998年第5期783-788,共6页
提出并以ZnO为例初步考察了用于金属氧化物的簇模型选取的配位数原则,即尽可能选取边界悬空键总数最少的簇模型,使簇模型“边界效应”尽可能低.在此基础上研究了CO在一系列按配位数原则选取的(ZnO)n表面簇模型上的吸附行... 提出并以ZnO为例初步考察了用于金属氧化物的簇模型选取的配位数原则,即尽可能选取边界悬空键总数最少的簇模型,使簇模型“边界效应”尽可能低.在此基础上研究了CO在一系列按配位数原则选取的(ZnO)n表面簇模型上的吸附行为.结果表明,配位数原则有效地缩小了簇模型的选取范围;依配位数原则确立的ZnO表面簇模型,能够对CO/ZnO吸附体系给出合理的定性解释.计算还表明,考虑相关效应有助于进一步改善计算结果. 展开更多
关键词 簇模型 配位数 化学吸附 一氧化碳 氧化锌
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嵌锂石墨充放电机制的ab initio和DFT理论研究 被引量:4
14
作者 唐前林 黄宗浩 孟素慈 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第10期1582-1586,共5页
用abinitio/HF和DFT/B3LYP方法探究了在锂离子二次电池中锂离子在石墨负电极材料里可逆嵌脱过程 .理论计算结果表明 ,嵌锂石墨LIG (lithiumintercalatedgraphite)充放电机制是锂在石墨碳层间可逆嵌脱 ,同时伴随着锂与碳层间发生电荷连... 用abinitio/HF和DFT/B3LYP方法探究了在锂离子二次电池中锂离子在石墨负电极材料里可逆嵌脱过程 .理论计算结果表明 ,嵌锂石墨LIG (lithiumintercalatedgraphite)充放电机制是锂在石墨碳层间可逆嵌脱 ,同时伴随着锂与碳层间发生电荷连续转移和碳层堆积方式改变的协同过程 ;计算结果也明确证实 ,嵌锂石墨嵌入脱出锂离子的过程就是锂离子二次电池储存与释放能量的过程 .提出的嵌锂石墨充放电机制较好地丰富了固体电解质相界面SEI (solidelectrolyteinterphase) 展开更多
关键词 嵌锂石墨 充放电机制 ab-initio DFT 锂离子二次电池
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用ab initio方法研究NaN_3的几何构型、电子结构和热力学、动力学性质 被引量:6
15
作者 高贫 肖鹤鸣 黄寅生 《分子科学学报》 CAS CSCD 1998年第3期63-67,共5页
用abinitioMO方法,在MP2(ful)/6311G水平下,全优化计算了叠氮化钠(NaN3)分子的线状和环状两种稳定构型及其转化过渡态的几何参数、电荷分布、分子总能量和振动频率,并研究了它们的热力学性质及转... 用abinitioMO方法,在MP2(ful)/6311G水平下,全优化计算了叠氮化钠(NaN3)分子的线状和环状两种稳定构型及其转化过渡态的几何参数、电荷分布、分子总能量和振动频率,并研究了它们的热力学性质及转化速率常数和平衡常数.结果表明,线状比环状构型稍稳定(能量低6.04kJ/mol);两者相互转化的能垒分别为13.15kJ/mol(线型→环状)和7.11kJ/mol(环状→线型).热力学和动力学计算均表明:NaN3通常主要以线型结构存在(占85%以上),且随温度升高而增多(在1000K大于91%). 展开更多
关键词 abinitio方法 叠氮化钠 几何构型 电子结构 振动频率 热力学性质
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取代基对氮自由基稳定性影响的ab initio研究 被引量:2
16
作者 蔡国强 俞庆森 +1 位作者 朱龙观 吴念慈 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1995年第6期532-536,共5页
用UHF/4-31G基组,全构型优化,研究了九个氮自由基NHR(R=CH3,CF3,CCl3,CN,NH2,CHO,OH,COOH,F)的构型和稳定化能ΔE,它们的ΔE分别为25.24,-38.53,-20.59,21.46,19.96,58.82,73.69,31.75,63.85kJ·... 用UHF/4-31G基组,全构型优化,研究了九个氮自由基NHR(R=CH3,CF3,CCl3,CN,NH2,CHO,OH,COOH,F)的构型和稳定化能ΔE,它们的ΔE分别为25.24,-38.53,-20.59,21.46,19.96,58.82,73.69,31.75,63.85kJ·mol-1,表明,除CF3,CCl3以外,其余七个取代基对氮自由基起稳定化作用. 展开更多
关键词 氮自由基 ab-initio计算 稳定化能
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CH_3F分子间相互作用的ab initio研究 被引量:4
17
作者 胡宗超 王一波 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2002年第2期267-270,共4页
在 MP2 /6-31 1 ++G( 3d,3p)电子相关校正水平上 ,对 CH3F二聚体可能存在的几何构型进行全自由度能量梯度优化和频率验证 ,发现 3种势能面上有极小点的构型 .进一步在高级电子相关校正的 MP4 S-DTQ、CCSD( T) /6-31 1 ++G( 3df,3pd)方... 在 MP2 /6-31 1 ++G( 3d,3p)电子相关校正水平上 ,对 CH3F二聚体可能存在的几何构型进行全自由度能量梯度优化和频率验证 ,发现 3种势能面上有极小点的构型 .进一步在高级电子相关校正的 MP4 S-DTQ、CCSD( T) /6-31 1 ++G( 3df,3pd)方法水平上 ,对其中总能量最小的构型进行精确计算 ,得到二聚体的结合能为 -9.70 7k J/mol.研究结果支持了由光谱实验结果推测的构型 ,解释了 展开更多
关键词 CH3F 分子间相互作用 结合能 ABinitio 氟化甲烷 Moller-Plesset微扰理论
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HC_nS^+和HSC_n^+(n=1~9)结构的 ab initio 研究 被引量:2
18
作者 刘朝阳 黄荣彬 郑兰荪 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 1997年第5期413-417,共5页
应用量子化学从头计算方法,在HF/6-31G*水平上,采用Berny优化法,优化了HCnS+和HSC+n(n=1~9)两种同分异构簇离子的几何构型,计算了它们的电子总能量、相邻簇离子的能量差及其平均原子结合能。计算结... 应用量子化学从头计算方法,在HF/6-31G*水平上,采用Berny优化法,优化了HCnS+和HSC+n(n=1~9)两种同分异构簇离子的几何构型,计算了它们的电子总能量、相邻簇离子的能量差及其平均原子结合能。计算结果表明,HCnS+比相应的HSC+n稳定。计算结果还显示,无论是优化后的几何构型,还是各种能量值,均显示出明显的奇偶交替变化的趋势,n为奇数的簇离子比相应的n为偶数的簇离子稳定,这和以前得到的实验结果完全相符。此外,还计算了HCnS+分别碎裂H、HC、HC2、S、CS与C2S六条解离途径的解离能。计算结果同样证明成簇碳原子数为奇数的簇离子比较稳定。 展开更多
关键词 结构稳定性 解离能 碳原子簇 从头算
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灯盏花苷Ⅰ及其衍生物结构与生物活性关系的ab initio计算 被引量:1
19
作者 李西平 陈秀敏 杨晓梅 《昆明理工大学学报(理工版)》 2008年第3期100-103,115,共5页
采用ab initio量子化学方法和定量构效关系(QSAR)研究等理论方法,对灯盏花苷Ⅰ及其衍生物的结构和生物活性的关系进行了探讨.在6-31G水平上,量子化学从头算和QSAR的计算结果表明:当灯盏花苷Ⅰ及其衍生物作用于受体上的时候,其糖体部分... 采用ab initio量子化学方法和定量构效关系(QSAR)研究等理论方法,对灯盏花苷Ⅰ及其衍生物的结构和生物活性的关系进行了探讨.在6-31G水平上,量子化学从头算和QSAR的计算结果表明:当灯盏花苷Ⅰ及其衍生物作用于受体上的时候,其糖体部分是反应的活性中心,而且最高占据轨道与最低空轨道的能量差ΔE(H-L)、第5个碳原子的电荷Q(C5)是影响药物活性的主要因素.计算得到了其药物的构效关系的方程式为:pIC50=-34·525-295·481Q(C5)-805·09[Q(C5)]2+55.876[ΔE(H-L)]2+1·233EL2该方程为类似衍生物生物活性的预测提供了一个简单可行的方法. 展开更多
关键词 灯盏花苷 定量构效关系(QSAR) ab initio 药物提取
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ZnO(110)衬底上单层黑磷烯的外延生长
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作者 赵程宇 张铭军 +1 位作者 赵宋焘 李震宇 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第1期79-86,I0029-I0035,I0118,共16页
二维黑磷烯作为新一代半导体材料,具有可调带隙和高载流子迁移率等优点,具有广阔的应用前景.但二维黑磷烯目前还不能直接大规模制备,限制了其进一步的研究和应用.分子束外延是一种广泛使用的具有较高外延质量的单晶薄膜生长方法,在制备... 二维黑磷烯作为新一代半导体材料,具有可调带隙和高载流子迁移率等优点,具有广阔的应用前景.但二维黑磷烯目前还不能直接大规模制备,限制了其进一步的研究和应用.分子束外延是一种广泛使用的具有较高外延质量的单晶薄膜生长方法,在制备二维黑磷烯方面具有广阔的应用前景.本文基于密度泛函理论计算筛选了ZnO(110)、GaN(110)、BP(110)和SiC(110)四种潜在的衬底,研究了二维黑磷烯在这些衬底上的生长情况.研究表明,ZnO(110)上的黑磷单层及团簇结构是稳定的,且磷在该表面扩散特性也有助于磷团簇的成核生长.本研究为高效制备二维黑磷烯及其他二维材料提供了有益的指导. 展开更多
关键词 黑磷烯 外延生长 密度泛函理论 从头算分子动力学 过渡态理论方法
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