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Bioinformatic identification of genes encoding Clq-domaincontaining proteins in zebrafish 被引量:7
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作者 Jie Mei Jianfang Gui 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第1期17-24,共8页
C1q is the first subcomponent of classical pathway in the complement system and a major link between innate and acquired immunities. The globular (gC1q) domain similar with C1q was also found in many non-complement ... C1q is the first subcomponent of classical pathway in the complement system and a major link between innate and acquired immunities. The globular (gC1q) domain similar with C1q was also found in many non-complement C1q-domain-containing (C1qDC) proteins which have similar crystal structure to that of the multifunctional tumor necrosis factor (TNF) ligand family, and also have diverse functions. In this study, we identified a total of 52 independent gene sequences encoding C1q-domain-containing proteins through comprehensive searches of zebrafish genome, cDNA and EST databases. In comparison to 31 orthologous genes in human and different numbers in other species, a significant selective pressure was suggested during vertebrate evolution. Domain organization of C1q-domain-containing (C1qDC) proteins mainly includes a leading signal peptide, a collagen-like region of variable length, and a C-terminal C1q domain. There are 11 highly conserved residues within the C1q domain, among which 2 are invariant within the zebrafish gene set. A more extensive database searches also revealed homologous C1qDC proteins in other vertebrates, invertebrates and even bacterium, but no homologous sequences for encoding C1qDC proteins were found in many species that have a more recent evolutionary history with zebrafish. Therefore, further studies on C1q-domain-containing genes among different species will help us understand evolutionary mechanism of innate and acquired immunities. 展开更多
关键词 c1qDc proteins globular (gc1q) domain collagen stalk TNF/c1q family phylogenetic analysis
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血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平联合检测诊断慢性HBV感染肝硬化患者Child-Pugh分级的价值
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作者 葛晓萍 张会芬 《中国民康医学》 2023年第21期100-103,共4页
目的:观察血清磷酸酪氨酸衔接蛋白1(APPL1)、胶原三股螺旋重复蛋白1(CTHRC1)、胱抑素C水平联合检测诊断慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染肝硬化患者Child-Pugh分级的价值。方法:选取2021年1月至2023年1月该院收治的136例慢性HBV感染肝硬化患... 目的:观察血清磷酸酪氨酸衔接蛋白1(APPL1)、胶原三股螺旋重复蛋白1(CTHRC1)、胱抑素C水平联合检测诊断慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染肝硬化患者Child-Pugh分级的价值。方法:选取2021年1月至2023年1月该院收治的136例慢性HBV感染肝硬化患者进行前瞻性研究,设为研究组。选取同期于该院体检的136名健康者为对照组。比较两组血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平;比较不同Child-Pugh分级慢性HBV感染肝硬化患者入院时血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平;采用Spearman相关性分析慢性HBV感染肝硬化患者入院时血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平与Child-Pugh分级的相关性;采用受试者工作特征(ROC)曲线评估慢性HBV感染肝硬化患者入院时血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平联合检测诊断Child-Pugh分级的价值。结果:入院时,研究组血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);入院时,Child-Pugh分级为C级慢性HBV感染肝硬化患者血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平均高于B级、A级者,且B级者高于A级者,差异均有统计学意义(P<0.05);Spearman相关性分析结果显示,慢性HBV感染肝硬化患者入院时血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平与Child-Pugh分级均呈正相关(r>0,P<0.05);ROC曲线分析结果显示,慢性HBV感染肝硬化患者入院时血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平联合检测诊断Child-Pugh分级为C级的AUC为0.931,具有较高诊断价值。结论:血清APPL1、CTHRC1、胱抑素C水平联合检测诊断慢性HBV感染肝硬化患者Child-Pugh分级的价值高于三者单项检测。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 肝硬化 cHILD-PUGH分级 磷酸酪氨酸衔接蛋白1 胶原三股螺旋重复蛋白1 胱抑素c 相关性
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PICK1蛋白C端酸性区域对其功能的调节 被引量:1
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作者 贾原 黄玉民 +1 位作者 刘俊林 石亚伟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期224-230,共7页
蛋白激酶C相互作用蛋白1(protein interacting with Ckinase1,PICK1)是调节AMPA(alpha-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole propionic acid)受体在细胞膜上的数量与分布,引起LTP与LTD现象的重要蛋白.本文利用基因克隆、荧光光谱以及... 蛋白激酶C相互作用蛋白1(protein interacting with Ckinase1,PICK1)是调节AMPA(alpha-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole propionic acid)受体在细胞膜上的数量与分布,引起LTP与LTD现象的重要蛋白.本文利用基因克隆、荧光光谱以及免疫分析等方法,分析了PICK1蛋白C末端酸性区对BAR结构域与膜脂结合能力以及PICK1分子内BAR(Bin/amphiphysin/RVS)结构域与PDZ结构域相互作用的影响,研究了钙离子结合C末端酸性区后对上述相互作用的调节.结果显示,C末端酸性区的存在使BAR结构域与膜脂的结合能力减弱大约10倍,但PICK1分子内的BAR与PDZ结构域的相互作用与不含C末端的酸性区相比增强了大约4倍.另一方面,C末端酸性区的存在,伴随钙离子浓度的提高,有助于增强BAR与膜脂的结合,却削弱了PDZ和BAR结构域的作用.当钙离子浓度增加到500μmol/L时,BARC的脂质结合能力以及和PDZ的亲和力与不含酸性区相当. 展开更多
关键词 蛋白激酶c相互作用蛋白1 BAR结构域 c末端酸性区 脂质体 钙离子
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Ccbe1病毒对喉癌Hep-2细胞VEGF-C表达的影响
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作者 李文媛 刘艳翠 +2 位作者 尹国华 冯克俭 王莹 《中外医疗》 2015年第21期10-11,18,共3页
目的探讨胶质和钙结合EGF区域1(Collagen and calcium binding EGF domains 1,Ccbe1)病毒对人喉癌细胞系Hep-2细胞增殖及血管内皮生长因子-C(vessel endothelium growth factor C,VEGF-C)表达的影响。方法用1×102,1×104,1... 目的探讨胶质和钙结合EGF区域1(Collagen and calcium binding EGF domains 1,Ccbe1)病毒对人喉癌细胞系Hep-2细胞增殖及血管内皮生长因子-C(vessel endothelium growth factor C,VEGF-C)表达的影响。方法用1×102,1×104,1×106 pfu/m L的Ccbe1腺病毒作用喉癌Hep-2细胞,细胞分为对照组(PBS),Ccbe1病毒高、中、低剂量组。观察各组细胞增殖情况,采用PCR检测各组细胞VEGF-C mRNA的表达水平。结果与对照组比较,Ccbe1病毒各剂量组细胞增殖显著增高,VEGF-C mRNA表达水平显著上升,且均有显著剂量依赖性,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 Ccbe1病毒可能通过上调淋巴管生成因子VEGF-C表达促进喉癌细胞增殖和淋巴管生成。 展开更多
关键词 ccbe1病毒 VEGF-c 喉癌 HEP-2细胞
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C/EBPβ通过pim-1介导足细胞损伤的作用机制
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作者 程维丽 陈晓攀 +2 位作者 齐媛媛 文璐 王晓阳 《天津医药》 CAS 北大核心 2022年第3期230-235,共6页
目的探讨CCAAT增强子结合蛋白β(C/EBPβ)/丝氨酸/苏氨酸激酶1(pim-1)/NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)轴介导小鼠肾脏足细胞损伤的作用机制。方法体外培养及转染足细胞后分为Control组、siRNA-NC组(用siRNA-NC转染足细胞)、siC/... 目的探讨CCAAT增强子结合蛋白β(C/EBPβ)/丝氨酸/苏氨酸激酶1(pim-1)/NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)轴介导小鼠肾脏足细胞损伤的作用机制。方法体外培养及转染足细胞后分为Control组、siRNA-NC组(用siRNA-NC转染足细胞)、siC/EBPβ组(用siC/EBPβ慢病毒转染足细胞)、Vector-NC组(空载体转染足细胞)和pim-1-OE组(pim-1过表达慢病毒转染足细胞)。脂多糖(LPS)与腺苷三磷酸(ATP)刺激足细胞后分为LPS+ATP组、LPS+ATP+siRNA-NC组、LPS+ATP+siC/EBPβ组、LPS+ATP+siC/EBPβ+Vector-NC组和LPS+ATP+siC/EBPβ+pim-1-OE组。实时荧光定量PCR(qPCR)检测C/EBPβ和pim-1 mRNA水平。Western blot检测C/EBPβ、pim1、NLRP3、p20半胱氨酸蛋白酶(Caspase)-1、Gasdermin D(GSDMD)、p17白细胞介素(IL)-1β蛋白水平。酶联免疫吸附试验(ELISA)检测炎性因子IL-1β和IL-6水平。染色质免疫共沉淀(chip)实验及双荧光素酶报告基因实验检测C/EBPβ与pim-1基因启动子结合。结果与Control组和siRNA-NC组相比,siC/EBPβ组的C/EBPβ及pim-1 mRNA水平明显下降(P<0.01)。与Control组相比,LPS+ATP组NLRP3、p20Caspase-1、p17IL-1β蛋白水平及IL-1β、IL-6水平明显升高(P<0.01)。与LPS+ATP+siRNA-NC组相比,LPS+ATP+siC/EBPβ组NLRP3、p20Caspase-1、p17IL-1β蛋白水平及IL-1β、IL-6水平降低(P<0.01)。chip实验及双荧光素酶报告基因实验显示C/EBPβ可与pim-1基因启动子结合。与Control组和Vector-NC组比较,pim-1-OE组pim-1 mRNA水平明显升高(P<0.05)。与LPS+ATP+siC/EBPβ+Vector-NC组相比,LPS+ATP+siC/EBPβ+pim-1-OE组NLRP3、p20Caspase-1、p17IL-1β、GSDMD蛋白水平及IL-1β、IL-6水平升高(P<0.05)。结论C/EBPβ/pim-1/NLRP3轴可能参与足细胞损伤,并作为LN治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 狼疮肾炎 足细胞 NLR家族 热蛋白结构域包含蛋白3 ccAAT增强子结合蛋白β 原癌基因蛋白质cpim-1
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TRX1与JAB1在急性髓系白血病中的表达及其相关性 被引量:5
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作者 惠凌云 申秋菊 +5 位作者 王婷 蒙珊 路晨阳 杨铁林 张王刚 周芙玲 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期62-65,70,共5页
目的探讨硫氧还蛋白1(TRX1)和c-Jun激活区结合蛋白1(JAB1)在白血病各组中的表达,及TRX1水平在急性髓系白血病(AML)各组中的表达及其临床意义。方法应用RT-PCR及Western blot的方法对白血病患者TRX1和JAB1的表达进行检测,比较各组之间的... 目的探讨硫氧还蛋白1(TRX1)和c-Jun激活区结合蛋白1(JAB1)在白血病各组中的表达,及TRX1水平在急性髓系白血病(AML)各组中的表达及其临床意义。方法应用RT-PCR及Western blot的方法对白血病患者TRX1和JAB1的表达进行检测,比较各组之间的差异;进一步分析AML患者其基因表达阳性率与外周血白细胞计数的关系,并采用ELISA方法检测以上血清样本的TRX1水平。结果在白血病患者中TRX1和JAB1基因和蛋白表达明显高于对照组(P<0.05),相关分析显示AML初发和复发病例中TRX1和JAB1表达相关程度高,而且高表达的TRX1和JAB1与外周血白细胞计数有关(P<0.05);ELISA检测外周血TRX1在AML的复发组高于初发组和对照组,初发组高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 TRX1和JAB1之间呈正向关联,与AML的发生及病情进展有密切关系。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 硫氧还蛋白1 c—Jun激活区结合蛋白1
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AP-1辅助激活因子JAB1的分子克隆及其与肝细胞生成素的相互作用 被引量:1
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作者 陆承荣 李勇 +6 位作者 董春娜 黎明 王清明 张成岗 魏玉琳 陈惠鹏 贺福初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第4期528-531,共4页
利用酵母双杂交方法 ,用肝细胞生成素 (HPO)作为诱饵蛋白在人胎肝cDNA文库中筛选到能与HPO相互作用的蛋白 :AP 1辅助激活因子JAB1.并用PCR方法从人胎肝cDNA文库中扩出JAB1全长cDNA ,进行GST JAB1原核融合蛋白表达与纯化 .蛋白质结合实... 利用酵母双杂交方法 ,用肝细胞生成素 (HPO)作为诱饵蛋白在人胎肝cDNA文库中筛选到能与HPO相互作用的蛋白 :AP 1辅助激活因子JAB1.并用PCR方法从人胎肝cDNA文库中扩出JAB1全长cDNA ,进行GST JAB1原核融合蛋白表达与纯化 .蛋白质结合实验表明 。 展开更多
关键词 肝细胞生成素 c-Jun结合蛋白 转录因子 分子克隆 JAB1
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JAB1在胆囊癌中的表达及临床病理意义 被引量:1
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作者 顾国建 顾凤华 练玲芝 《中国临床新医学》 2017年第1期9-11,共3页
目的研究C-Jun激活域结合蛋白1(C-Jun activation domain binding protein 1,JAB1)在胆囊癌组织中的表达,探讨其临床病理意义。方法采用免疫组化方法检测JAB1在65例胆囊癌组织和15例慢性胆囊炎组织中的表达情况。结果胆囊癌组织中JAB1... 目的研究C-Jun激活域结合蛋白1(C-Jun activation domain binding protein 1,JAB1)在胆囊癌组织中的表达,探讨其临床病理意义。方法采用免疫组化方法检测JAB1在65例胆囊癌组织和15例慢性胆囊炎组织中的表达情况。结果胆囊癌组织中JAB1蛋白阳性率为60.0%,显著高于慢性胆囊炎组织(13.3%)(P<0.05)。结论 JAB1蛋白表达增高与胆囊癌发生、发展密切相关,检测JAB1蛋白有助于胆囊癌的早期诊断及判断患者预后。 展开更多
关键词 胆囊癌 c-Jun激活域结合蛋白1 免疫组织化学
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藻蓝色素蛋白诱导非小细胞肺癌H1299细胞凋亡的机制
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作者 郝帅 李前程 +3 位作者 李爽 刘媛璞 王静 王成涛 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第12期8-15,共8页
藻蓝色素蛋白是一种被广泛认可的天然食品着色剂,也是一种重要的功能性食品,具有优良的抗炎、抗氧化及抗肿瘤特性。前期试验表明:藻蓝蛋白能够诱导非小细胞肺癌H1299细胞的凋亡。本研究以高通量转录组技术为手段,对藻蓝蛋白处理前、后的... 藻蓝色素蛋白是一种被广泛认可的天然食品着色剂,也是一种重要的功能性食品,具有优良的抗炎、抗氧化及抗肿瘤特性。前期试验表明:藻蓝蛋白能够诱导非小细胞肺癌H1299细胞的凋亡。本研究以高通量转录组技术为手段,对藻蓝蛋白处理前、后的H1299细胞进行差异基因的筛选,探究藻蓝蛋白在非小细胞肺癌中的调控机制。转录组分析显示:藻蓝蛋白能够显著降低H1299细胞内toll-白介素1受体域接头蛋白(TIRAP)基因的表达;采用siRNA干预TIRAP的表达后,H1299细胞出现凋亡,细胞形态发生非正常改变,细胞增殖能力显著降低,促凋亡蛋白Bax表达上调,抑凋亡蛋白Bcl-xL表达下调;同时,沉默TIRAP的表达能够显著降低H1299细胞中NF-κB信号通路的活性。本研究表明:藻蓝蛋白能够抑制TIRAP的表达,通过降低NF-κB信号通路的活性而诱导H1299细胞的凋亡。此结果揭示了藻蓝蛋白在非小细胞肺癌中的作用机制,为肺癌的潜在治疗和藻蓝类功能性食品添加剂的开发和利用提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 藻蓝蛋白 H1299细胞 转录组 toll-白介素1受体域接头蛋白(TIRAP) 细胞凋亡
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安定-氯胺酮对严重烧伤小鼠腹腔巨噬细胞JAB1蛋白表达的影响
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作者 钟河江 杨天德 粟永萍 《重庆医学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第15期1870-1872,1875,共4页
目的观察严重烧伤早期小鼠腹腔巨噬细胞c~Jun激活区结合蛋白1(JAB1)蛋白表达变化,探讨安定一氯胺酮对其表达变化的影响。方法将成年健康雄性昆明小鼠随机分为4组,即对照组、严重烧伤组、安定~氯胺酮组和严重烧伤后安定~氧胺酮处... 目的观察严重烧伤早期小鼠腹腔巨噬细胞c~Jun激活区结合蛋白1(JAB1)蛋白表达变化,探讨安定一氯胺酮对其表达变化的影响。方法将成年健康雄性昆明小鼠随机分为4组,即对照组、严重烧伤组、安定~氯胺酮组和严重烧伤后安定~氧胺酮处理组,以20%~30%体表总面积(TBsA)Ⅲ度烧伤作为严重烧伤模型,肌肉注射安定0.4mg/kg、氯胺酮10mg/kg给予麻醉。收集腹腔巨噬细胞提取总蛋白,运用Westernblotting方法检测各组小鼠腹腔巨噬细胞JAB1蛋白表达水平的变化。结果在严重烧伤后30min,小鼠腹腔巨噬细胞JAB1蛋白表达水平与对照组相比明显降低(P〈0.05),于6h时达到最低(P〈0.01),严重烧伤后12h逐渐恢复至正常水平。然而,严重烧伤后应用安定氯胺酮麻醉,小鼠腹腔巨噬细胞JAB1蛋白表达水平在各时相点变化差异无统计学意义。结论严重烧伤可引起小鼠腹腔巨噬细胞JAB1蛋白表达水平的早期下降,而严重烧伤后应用安定一氯胺酮麻醉能显著抑制JAB1蛋白表达水平下调。 展开更多
关键词 c-Jun激活区结合蛋白1(JAB1) 严重烧伤 氯胺酮
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BRIP1在胶质瘤中的表达及临床意义
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作者 王圣桃 王新庄 +1 位作者 高铭 韩大勇 《中国临床神经外科杂志》 2021年第6期434-437,共4页
目的探讨乳腺癌易感基因相互作用蛋白1(BRIP1)在胶质瘤中的表达及其与病人预后的相关性。方法从GEO数据库GPL570平台选取三个BRIP1基因表达谱芯片(GSE4290、GSE50161和GSE74195)分析胶质瘤BRIP1的表达情况。使用TC⁃GA下载有关胶质瘤BRIP... 目的探讨乳腺癌易感基因相互作用蛋白1(BRIP1)在胶质瘤中的表达及其与病人预后的相关性。方法从GEO数据库GPL570平台选取三个BRIP1基因表达谱芯片(GSE4290、GSE50161和GSE74195)分析胶质瘤BRIP1的表达情况。使用TC⁃GA下载有关胶质瘤BRIP1表达、生存率和临床特征的数据,多因素Cox比例回归风险模型分析胶质瘤生存预后的影响因素;利用受试者工作特征(ROC)曲线评估BRIP1表达水平与胶质瘤生存预后的关系;通过基因富集分析胶质瘤BRIP1相关的细胞信号通路。结果胶质瘤BRIP1表达水平相比于正常样本明显升高(P<0.05)。多因素Cox回归分析结果表明,BRIP1高表达(HR=1.250;95%CI:1.056~1.480;P<0.001)是胶质瘤不良预后的独立危险因素。生存曲线分析显示,相较于BRIP1低表达组,BRIP1高表达组胶质瘤生存期明显缩短(P<0.001)。ROC曲线分析显示BRIP1表达水平预测胶质瘤1年不良预后的曲线下面积(AUC)为0.744,最佳截断值为0.302,敏感性为0.832,特异性为0.528;预测3年不良预后的AUC为0.801,最佳截断值为0.420,敏感性为0.696,特异性为0.809;预测5年不良预后的AUC为0.767,最佳截断值为0.420时,敏感性为0.593,特异性为0.842。基因富集分析显示BRIP1基因主要富集于DNA复制、同源重组、错配修复和细胞周期等信号转导通路。结论BRIP1在人脑胶质瘤表达上调,与胶质瘤不良预后密切相关。 展开更多
关键词 胶质瘤 乳腺癌易感基因相互作用蛋白1(BRIP1) 预后 生物信息学
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Type XIX collagen: a promising biomarker from the basement membranes
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作者 Ana C.Calvo Laura Moreno +11 位作者 Leticia Moreno Janne M.Toivonen Raquel Manzano Nora Molina Miriam de la Torre Tresa López Francisco J.Miana-Mena María J.Munoz Pilar Zaragoza Pilar Larrodé Alberto García-Redondo Rosario Osta 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2020年第6期988-995,共8页
Among collagen members in the collagen superfamily,type XIX collagen has raised increasing interest in relation to its structural and biological roles.Type XIX collagen is a Fibril-Associated Collagen with Interrupted... Among collagen members in the collagen superfamily,type XIX collagen has raised increasing interest in relation to its structural and biological roles.Type XIX collagen is a Fibril-Associated Collagen with Interrupted Triple helices member,one main subclass of collagens in this superfamily.This collagen contains a triple helix composed of three polypeptide segments aligned in parallel and it is associated with the basement membrane zone in different tissues.The molecular structure of type XIX collagen consists of five collagenous domains,COL1 to COL5,interrupted by six non-collagenous domains,NCI to NC6.The most relevant domain by which this collagen exerts its biological roles is NCI domain that can be cleavage enzymatically to release matricryptins,exerting anti-tumor and anti-angiogenic effect in murine and human models of cancer.Under physiological conditions,type XIX collagen expression decreases after birth in different tissues although it is necessary to keep its basal levels,mainly in skeletal muscle and hippocampal and telencephalic interneurons in brain.Notwithstanding,in amyotrophic lateral sclerosis,altered transcript expression levels show a novel biological effect of this collagen beyond its structural role in basement membranes and its anti-tumor and anti-angiogenic properties.Type XIX collagen can exert a compensatory effect to ameliorate the disease progression under neurodegenerative conditions specific to amyotrophic lateral sclerosis in transgenic SOD1 G93 A mice and amyotrophic lateral sclerosis patients.This novel biological role highlights its nature as prognostic biomarker of disease progression in and as promising therapeutic target,paving the way to a more precise prognosis of amyotrophic lateral sclerosis. 展开更多
关键词 anti-tumor and anti-angiogenic properties c1 domain cOL19A1 gene and protein levels compensatory effect FAcIT collagens hippocampal interneurons matricryptins multiplexins Nc1 domain regenerative response skeletal muscle type XIX collagen
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RNA传感器IFIH1对HPV阳性的宫颈癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响
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作者 喻琳 罗莹 +1 位作者 吴迪 洪世垣 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第16期1651-1660,共10页
目的探讨RNA传感器干扰素诱导的解旋酶C结构域蛋白1(interferon-induced helicase C domain protein 1,IFIH1)对人乳头瘤病毒18型(human papillomavirus 18,HPV18)阳性的人宫颈癌细胞HeLa增殖、迁移和侵袭的影响。方法利用GEPIA数据库分... 目的探讨RNA传感器干扰素诱导的解旋酶C结构域蛋白1(interferon-induced helicase C domain protein 1,IFIH1)对人乳头瘤病毒18型(human papillomavirus 18,HPV18)阳性的人宫颈癌细胞HeLa增殖、迁移和侵袭的影响。方法利用GEPIA数据库分析IFIH1在正常宫颈组织和宫颈癌组织中的表达。Western blot检测IFIH1在C33A和HeLa细胞中的表达。将HPV18基因组转染到正常上皮细胞HaCaT中,并利用Western blot和实时定量PCR检测IFIH1的表达水平。利用实时无标记动态细胞分析技术和CCK8法检测细胞的增殖能力。划痕愈合实验、Transwell迁移实验和侵袭实验分别检测细胞的迁移能力和侵袭能力。Western blot和免疫荧光实验检测STAT3和磷酸化STAT3的蛋白表达和定位。结果GEPIA数据库分析显示IFIH1在宫颈癌组织中的表达量明显高于正常宫颈组织(P<0.05);相比于C33A细胞,HeLa细胞中IFIH1的表达水平明显增加(P<0.01);与正常HaCaT细胞相比,转染HPV18的HaCaT细胞中IFIH1的表达增加(P<0.01);与阴性对照相比,敲低IFIH1明显抑制HeLa细胞的增殖、迁移和侵袭能力,而过表达IFIH1则促进C33A细胞的增殖、迁移和侵袭(P<0.01);敲低IFIH1后,磷酸化STAT3蛋白的表达减少(P<0.01)。结论IFIHI在被HPV感染的宫颈癌细胞中表达增加,这将促进细胞的增殖、迁移和侵袭能力,可能与激活STAT3有关。 展开更多
关键词 宫颈癌 IFIH1 增殖 迁移 侵袭
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血清核苷酸结合寡聚化结构域样受体3、小窝蛋白-1、胱抑素C水平联合检测对高血压脑出血患者疾病转归的预测价值
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作者 骆清华 方伟 朱小兰 《中国微侵袭神经外科杂志》 CAS 2023年第12期114-118,共5页
目的观察高血压脑出血(hypertensive intracerebral hemorrhage,HICH)患者血清核苷酸结合寡聚化结构域样受体3(nucleotide-binding oligomerization domain-like receptor protein 3,NLRP3)、小窝蛋白-1(caveolin-1)、胱抑素C(cystatin ... 目的观察高血压脑出血(hypertensive intracerebral hemorrhage,HICH)患者血清核苷酸结合寡聚化结构域样受体3(nucleotide-binding oligomerization domain-like receptor protein 3,NLRP3)、小窝蛋白-1(caveolin-1)、胱抑素C(cystatin C,Cys C)水平,并探究其对疾病转归的预测价值。方法回顾性选取接受微创穿刺血肿引流术治疗的184例HICH患者作为研究组,另选取同期健康志愿者62例作为对照组。比较两组血清NLRP3、Caveolin-1、Cys C水平。依据术后90 d疾病转归情况将研究组患者分为转归不良亚组89例,转归良好亚组95例;比较其术前、术后7d血清NLRP3、Caveolin-1、Cys C水平。多因素Logistic回归分析疾病转归的影响因素。评价术后7d血清NLRP3、Caveolin-1、Cys C水平对术后90d疾病转归的预测价值。结果研究组血清NLRP3、Caveolin-1、Cys C水平高于对照组(P<0.05)。转归不良亚组术后7d血清NLRP3、Caveolin-1、Cys C水平高于转归良好亚组(P<0.05)。血肿体积、血肿破入脑室及血清NLRP3、Caveolin-1、Cys C水平为转归不良的危险因素(P<0.05)。术后7d血清NLRP3、Caveolin-1、Cys C联合预测术后90d疾病转归不良的AUC大于单项指标预测(P<0.05)。结论HICH患者血清NLRP3、Caveolin-1、Cys C水平升高,其对疾病转归具有一定预测价值,联合检测其水平可提高预测效能。 展开更多
关键词 脑出血 高血压 核苷酸结合寡聚化结构域样受体3 小窝蛋白-1 胱抑素c
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解旋酶C诱导干扰素结构域蛋白1基因多态性与江苏地区汉族人群多发性肌炎/皮肌炎的相关性研究 被引量:3
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作者 王燕 胡伟 +1 位作者 孙凌云 陈智勇 《中华风湿病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期77-82,共6页
目的探讨解旋酶C诱导干扰素结构域蛋白1基因(IFIH1)的单核苷酸多态性(SNP)rs1990760C〉T与江苏地区汉族PM/DM发病的相关性。方法共纳入183例PM/DM患者和400名健康对照。采用TaqmanMGB探针法对rs1990760进行基因分型;采用ELISA法... 目的探讨解旋酶C诱导干扰素结构域蛋白1基因(IFIH1)的单核苷酸多态性(SNP)rs1990760C〉T与江苏地区汉族PM/DM发病的相关性。方法共纳入183例PM/DM患者和400名健康对照。采用TaqmanMGB探针法对rs1990760进行基因分型;采用ELISA法检测抗黑色素瘤分化相关蛋白5(MDA5)抗体;基因型及等位基因的分布频率、Hardy-Weinberg平衡(HWE)采用r检验或Fisher确切概率法进行统计分析。结果各患者组和对照组IFIHI rs1990760。的基因型均符合HWE分布。T和C等位基因频率在PM/DM组(分别为20.8%和79.2%)、DM组(分别为20.9%和79.1%)、PM组(分别为20.5%和79.5%)和对照组(分别为18.0%和82.0%)之间的分布差异无统计学意义。在隐性模型(TT与CT+CC)和加性模型(TT与CC)中,PM/DM组TT基因型频率均显著高于对照组(6.6%与2.8%,x2值分别为4.8和4.54,P值均为0.03),DM合并间质性肺疾病(ILD)组TT基因型频率均显著高于对照组(8.3%与2.8%,x2值分别为4.84和4.41,P值分别为0.03和0.04)差异有统计学意义。在隐性模型(TT与CT+CC)中,PM未合并ILD组TT基因型频率显著高于对照组(9.8%与2.8%,x2=5.56,P=0.04),差异有统计学意义。抗MDA5阳性患者的rs1990760等位基因和基因型分布与对照组差异无统计学意义。结论IFIHI的rs1990760 TT基因型可能与江苏地区汉族PM/DM易感性相关,且其相关性可能因DM和PM患者是否合并ILD而有所不同。 展开更多
关键词 皮肌炎 解旋酶c诱导干扰素结构域蛋白1基因 多态性 单核苷酸
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固醇调节元件结合蛋白1c激活大鼠Patatin样磷酯酶结构域蛋白3基因转录
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作者 许婧 梁华 +4 位作者 刘宏霞 徐芬 袁丁 严晋华 翁建平 《中华糖尿病杂志》 CAS CSCD 2013年第8期500-506,共7页
目的探讨固醇调节元件结合蛋白1c(SREBP-1e)对Patatin样磷酯酶结构域蛋白3(PNPLA3)基因的转录调控作用。方法构建7周龄雄性体重匹配的禁食(24h)以及禁食后再喂食(48h)SD大鼠(自由饮食组3只,饥饿组3只,再喂食组4只)和高脂及... 目的探讨固醇调节元件结合蛋白1c(SREBP-1e)对Patatin样磷酯酶结构域蛋白3(PNPLA3)基因的转录调控作用。方法构建7周龄雄性体重匹配的禁食(24h)以及禁食后再喂食(48h)SD大鼠(自由饮食组3只,饥饿组3只,再喂食组4只)和高脂及小剂量链脲佐菌素诱导的2型糖尿病sD大鼠(正常对照组5只,2型糖尿病组6只)。用逆转录聚合酶链反应(RT—PCR)和Western blotting法检测各组大鼠肝脏组织中SREBP一1c和PAPM3的表达水平。将大鼠PⅣP翻3启动子5’端上游-1000bp序列分成3段,分别构建荧光素酶报告载体(R—PⅣPM3.1、R—PM似3—2、R—PNPL43—3),转染人正常肝细胞株L02,比较3个载体基础荧光素酶活性以及SREBP-1e过表达诱导的荧光素酶活性。分析上述实验中荧光素酶活性最高的PNPLA3启动子片段可能的SREBP-1c结合位点(SRE),分别构建野生型和SRE突变型报告载体,比较两个载体荧光素酶活性。多组定量资料比较用方差分析,两组定量资料比较用t检验。结果与自由饮食组相比,饥饿组大鼠肝脏SREBP—lc、PNPLA3和脂肪酸合成酶FAS基因表达均下降,再喂食组三者表达显著升高,差异均有统计学意义(F=114.14,334.11,754.20,均P〈0.05)。与正常对照组相比,2型糖尿病组SREBP-1e、PNPLA3基因(t=-18.39,-30.07,均P〈0.05)及蛋白表达(t=4.58,6.81,均P〈0.05)均显著增高。R—PNPLA3-1报告载体基础荧光素酶活性较对照升高51.13倍(t=-28.93,P〈0.05),R一删PM3—2和R—PNPLA3—3无基础荧光素酶活性;在L02细胞中,转染SREBP-1c表达质粒的R—PⅣPL43—1组荧光比值较转染空质粒的组升高2.63倍(t=-7.64,P〈0.05),而R—PⅣPM3.2组及R—PNPLA3—3组转染SREBP-1e表达质粒荧光比值较转染空质粒组均无变化;PNPLA3启动子-100~-911)p存在SRE,SRE突变的报告载体(MUT—R—PNPLA3—1)荧光比值较野生型(R—PNPLA3-1)降低40.80%(t=4.99,P〈0.05)。结论SREBP-1c通过PNPLA3基因启动子-100~-91bp激活大鼠PNPLA3基因转录。 展开更多
关键词 Patatin样磷酯酶结构域蛋白3 固醇调节元件结合蛋白1c 转录调控
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维吾尔族妇女早发性乳腺癌与乳腺癌易感基因1交互作用蛋白1基因多态性的关系 被引量:2
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作者 吴军 董朝 +2 位作者 孙刚 单美慧 马斌林 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1005-1008,共4页
目的探讨乳腺癌易感基因1交互作用蛋白1(BACHl)基因单核苷酸多态性(SNPs)与新疆维族妇女早发性乳腺癌的关系。方法用直接测序法及Snapshot技术分别对新疆80例维族乳腺癌(年龄≤40岁)和240例维族健康女性(年龄≤40岁)进行BACHl... 目的探讨乳腺癌易感基因1交互作用蛋白1(BACHl)基因单核苷酸多态性(SNPs)与新疆维族妇女早发性乳腺癌的关系。方法用直接测序法及Snapshot技术分别对新疆80例维族乳腺癌(年龄≤40岁)和240例维族健康女性(年龄≤40岁)进行BACHl基因外显子检测分析。结果在维族乳腺癌组和对照组,rs4986764、rs4986765和C.587A〉G位点的基因型频率差异均有统计学意义(P=0.001,P=0.011,P=0.049),rs4986764位点TC[优势比(OR)=0.086]、Cc(OR=0.044)和显性模型Tc+CC(OR=0.058)的改变均能够显著降低乳腺癌的发病风险。rs4986765位点GG(OR=5.617)、显性模型AG+GG(OR=4.254)和C.587A〉G位点AG(OR=7.590)、显性模型AG+GG(OR=7.590)均能够显著增加乳腺癌的发病风险。同时,显性模型TC+CC、AG+GG间的交互作用可降低约0.4%的乳腺癌发病风险(OR=0.996)。结论BACHl基因rs4986764位点的SNP变化降低新疆维族妇女早发性乳腺癌的发病风险,rs4986765、c.587A〉G位点变化均增加维族乳腺癌的发病风险。 展开更多
关键词 乳腺癌易感基因1交互作用蛋白1基因 单核苷酸多态性 维吾尔族 乳腺癌
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新疆汉族妇女早发性乳腺癌与乳腺癌易感基因1交互作用蛋白1基因多态性的关系 被引量:1
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作者 吴军 王晓丽 +1 位作者 孙刚 马斌林 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1966-1969,共4页
目的探讨乳腺癌易感基因l(BRCAl)交互作用蛋白1(BRIPl)基因多态性与新疆汉族早发性乳腺癌的关系。方法用直接测序法及Snapshot技术分别对新疆80例汉族乳腺癌(年龄≤40岁)和240例汉族健康女性(年龄≤40岁)进行外显子基因检测分... 目的探讨乳腺癌易感基因l(BRCAl)交互作用蛋白1(BRIPl)基因多态性与新疆汉族早发性乳腺癌的关系。方法用直接测序法及Snapshot技术分别对新疆80例汉族乳腺癌(年龄≤40岁)和240例汉族健康女性(年龄≤40岁)进行外显子基因检测分析。结果(1)rs4986764似点CC[优势比(OR)=0.094]、显性模型TC+CC(OR=0.130)均可降低乳腺癌的发病风险(P〈0.(15),此位点的保护作用在无肿瘤家族史者中更明显(P〈0.01,OR=0.079)。(2)rM986765、n587A〉G位点突变在病例、对照组间差异均无统计学意义(P〉0.05)。结论BRIPl基因rs4986764突变降低新疆汉族早发性乳腺癌的发病风险,无肿瘤家族史可增加此位点的保护作用;rs4986765、c.587A〉G位点突变与新疆汉族早发性乳腺癌无明显相关。 展开更多
关键词 乳腺癌易感基因1交互作用蛋白1 单核苷酸多态性 遗传易感性 早发性乳腺癌
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5种生物标志物对ARDS预后的预测分析 被引量:1
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作者 罗婷 张实 《中华肺部疾病杂志(电子版)》 2023年第4期471-475,共5页
目的 分析5种生物标志物干扰素诱导的解旋酶C域蛋白1(interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, IFIH1)、基因干扰素调节因子1(gene interferon regulatory factor 1, IRF1)、信号传导及转录激活蛋白(signal transdu... 目的 分析5种生物标志物干扰素诱导的解旋酶C域蛋白1(interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, IFIH1)、基因干扰素调节因子1(gene interferon regulatory factor 1, IRF1)、信号传导及转录激活蛋白(signal transducer and activator of transcription, STAT1)、鸟苷结合蛋白1(guanylate binding protein 1, GBP1)、干扰素诱导蛋白与四肽重复序列3(interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, IFIT3)对急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)预后的预测。方法 选择2017年1月至2017年12月东南大学附属中大医院重症医学科收治的26例ARDS患者为对象,采集患者外周血行芯片检测,提取5种生物标志物IFIH1、IRF1、STAT1、GBP1、IFIT3表达量。采用单因素Cox回归和受试者工作特征曲线(ROC)评估5种生物标志物和ARDS严重程度与28 d累积病死率相关性。采用多因素COX回归构建联合模型。结果 5种生物标志物表达与ARDS患者28 d累积病死率相关(P<0.05),ARDS严重程度和28 d累计病死率不相关(P>0.05):IFIH1[HR 2.309 95%CI(1.162, 4.590)];IRF1[HR 3.152 95%CI(1.043, 9.528)];IFIT3[HR 1.793 95%CI(1.103, 2.917)];GBP1[HR 2.342 95%CI(1.087, 5.047)];STAT1[HR 2.492 95%CI(1.388,4.474)];ARDS严重程度[HR 1.665 95%CI(0.598, 4.628)]。5种生物标志物及ARDS严重程度预后预测ROC曲线下面积分别为0.883、0.833、0.900、0.925、0.908、0.625。联合模型对28 d预后预测性为0.950。结论 对ARDS患者预后的预测,5种生物标志物优于柏林标准ARDS严重程度。5种生物标志物构建的模型选出预后不佳的ARDS患者,具有临床意义。 展开更多
关键词 急性呼吸窘迫综合征 严重程度 预后 干扰素诱导的解旋酶c域蛋白1 基因干扰素调节因子1
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