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Subcutaneous and intramuscular fat transcriptomes show large differences in network organization and associations with adipose traits in pigs 被引量:6
1
作者 Yifeng Zhang Yingchun Sun +6 位作者 Zhongzi Wu Xinwei Xiong Junjie Zhang Junwu Ma Shijun Xiao Lusheng Huang Bin Yang 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2021年第10期1732-1746,共15页
Subcutaneous fat(SCF)and intramuscular fat(IMF)deposition is relevant to health in humans,as well as meat production and quality in pigs.In this study,we generated RNA sequence data for 122 SCF,120 IMF,and 87 longissi... Subcutaneous fat(SCF)and intramuscular fat(IMF)deposition is relevant to health in humans,as well as meat production and quality in pigs.In this study,we generated RNA sequence data for 122 SCF,120 IMF,and 87 longissimus dorsi muscle(LDM)samples using 155 F6 pigs from a specially designed heterogeneous population generated by intercrossing four highly selected European commercial breeds and four indigenous Chinese pig breeds.The phenotypes including waist back fat thickness and intramuscular fat content were also measured in the 155 F6 pigs.We found that the genes in SCF and IMF differed largely in both expression levels and network connectivity,and highlighted network modules that exhibited strongest gain of connectivity in SCF and IMF,containing genes that were associated with the immune process and DNA double-strand repair,respectively.We identified 215 SCF genes related to kinase inhibitor activity,mitochondrial fission,and angiogenesis,and 90 IMF genes related to lipolysis and fat cell differentiation,displayed a tissue-specific association with back fat thickness and IMF content,respectively.We found that cis-expression QTL for trait-associated genes in the two adipose tissues tended to have tissuedependent predictability for the two adipose traits.Alternative splicing of genes was also found to be associated with SCF or IMF deposition,but the association was much less extensive than that based on expression levels.This study provides a better understanding of SCF and IMF gene transcription and network organization and identified critical genes and network modules that displayed tissue-specific associations with subcutaneous and intramuscular fat deposition.These features are helpful for designing breeding programs to genetically improve the two adipose traits in a balanced way. 展开更多
关键词 pig TRANSCRIPTOME subcutaneous fat intramuscular fat network gene connectivity gene splicing
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Effect of High-fat Diet on Cholesterol Metabolism in Rats and Its Association with Na^+/K^+-ATPase/Src/pERK Signaling Pathway 被引量:4
2
作者 汪理 徐飞 +2 位作者 张学俊 金润铭 李欣 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2015年第4期490-494,共5页
Summary: Abnormal cholesterol metabolism is associated with an elevated risk of developing athero- sclerosis, hypertension, and diabetes etc. Na+/K+-ATPase was found to regulate cholesterol synthesis, distribution ... Summary: Abnormal cholesterol metabolism is associated with an elevated risk of developing athero- sclerosis, hypertension, and diabetes etc. Na+/K+-ATPase was found to regulate cholesterol synthesis, distribution and trafficking. This study aimed to examine the effect of high-fat diet on cholesterol me- tabolism in rats and the role of Na+/K+-ATPase/Src/ERK signaling pathway in the process. Forty male SD rats were evenly divided into high-fat diet group and control group at random. Animals in the former group were fed on high-fat diet for 12 weeks, and those fed on basic diet served as control. Blood lipids, including total cholesterol (TC), triglyceride (TG), high density lipoprotein-cholesterol (HDL-C), and low density lipoprotein-cholesteral (LDL-C) levels, were detected at 3, 6 and 12 weeks. The ratio of cholesterol content in cytoplasm to that in cell membrane was detected in liver tissues. RT-PCR and Western blotting were used to measure the expression of lipid metabolism-associated genes (HMG-CoA reductase and SREBP-2) after 12-week high-fat diet. Na+/K+-ATPase/Src/ERK signaling path- way-related components (Na+/K+-ATPase ctl, Src-PY418 and pERK1/2) were also measured by West- ern blotting. The results showed that the serum TC, TG, and LDL-C levels were significantly higher in high-fat diet group than those in control group, while the HDL-C level was significantly lower in high-fat diet group at 6 weeks (P〈0.01). High-fat diet led to an increase in the cholesterol content in the cytoplasm and cell membrane. The ratio of cholesterol content in cytoplasm to that in cell membrane was elevated over time. The expression of HMG-CoA reductase and SREBP-2 was significantly sup- pressed at mRNA and protein levels after 12-week high-fat diet (P〈0.05). Moreover, high-fat diet pro- moted the expression of Na+/K+-ATPase α1 but suppressed the phosphorylation of Src-PY418 and ERK1/2 at 12 weeks (P〈0.05). It was concluded that high-fat diet regulates cholesterol metabolism, and Na+/K+-ATPase signaling pathway is involved in the process possibly by regulating the expression of lipid metabolism-associated proteins HMG-CoA reductase and SREBP-2. 展开更多
关键词 Na+/K+-ATPase CHOLESTEROL high-fat diet lipid metabolism-associated genes Na+/K+-ATPase/Src/pERK signaling pathway
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Identifying the complex genetic architecture of growth and fatness traits in a Duroc pig population 被引量:2
3
作者 HANG Zhe CHEN Zi-tao +7 位作者 DIAO Shu-qi YE Shao-pan WANG Jia-ying GAO Ning YUAN Xiao-long CHEN Zan-mou ZHANG Hao LI Jia-qi 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2021年第6期1607-1614,共8页
In modern pig breeding programs,growth and fatness are vital economic traits that significantly influence porcine production.To identify underlying variants and candidate genes associated with growth and fatness trait... In modern pig breeding programs,growth and fatness are vital economic traits that significantly influence porcine production.To identify underlying variants and candidate genes associated with growth and fatness traits,a total of 1067 genotyped Duroc pigs with de-regressed estimated breeding values(DEBV)records were analyzed in a genome wide association study(GWAS)by using a single marker regression model.In total,28 potential single nucleotide polymorphisms(SNPs)were associated with these traits of interest.Moreover,VPS4 B,PHLPP1,and some other genes were highlighted as functionally plausible candidate genes that compose the underlying genetic architecture of porcine growth and fatness traits.Our findings contribute to a better understanding of the genetic architectures underlying swine growth and fatness traits that can be potentially used in pig breeding programs. 展开更多
关键词 PIG GWAS growth trait fatness trait candidate gene
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Impact of dietary fat levels and fatty acid composition on milk fat synthesis in sows at peak lactation
4
作者 Li Zhe Uffe Krogh +3 位作者 Charlotte Lauridsen Mette Olaf Nielsen Zhengfeng Fang Peter Kappel Theil 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2023年第3期1134-1149,共16页
Background Dietary fat is important for energy provision and immune function of lactating sows and their progeny.However,knowledge on the impact of fat on mammary transcription of lipogenic genes,de novo fat synthesis... Background Dietary fat is important for energy provision and immune function of lactating sows and their progeny.However,knowledge on the impact of fat on mammary transcription of lipogenic genes,de novo fat synthesis,and milk fatty acid(FA)output is sparse in sows.This study aimed to evaluate impacts of dietary fat levels and FA composition on these traits in sows.Forty second-parity sows(Danish Landrace×Yorkshire)were assigned to 1 of 5 dietary treatments from d 108 of gestation until weaning(d 28 of lactation):low-fat control diet(3%added animal fat);or 1 of 4 high-fat diets with 8%added fat:coconut oil(CO),fish oil(FO),sunflower oil(SO),or 4%octanoic acid plus 4%FO(OFO).Three approaches were taken to estimate de novo milk fat synthesis from glucose and body fat.Results Daily intake of FA was lowest in low-fat sows within fat levels(P<0.01)and in OFO and FO sows within highfat diets(P<0.01).Daily milk outputs of fat,FA,energy,and FA-derived carbon reflected to a large extent the intake of those.On average,estimates for de novo fat synthesis were 82 or 194 g/d from glucose according to method 1 or 2 and 255 g de novo+mobilized FA/d according to method 3.The low-fat diet increased mammary FAS expression(P<0.05)and de novo fat synthesis(method 1;P=0.13)within fat levels.The OFO diet increased de novo fat synthesis(method 1;P<0.05)and numerically upregulated mammary FAS expression compared to the other high-fat diets.Across diets,a daily intake of 440 g digestible FA minimized milk fat originating from glucose and mobilized body fat.Conclusions Sows fed diets with low-fat or octanoic acid,through upregulating FAS expression,increased mammary de novo fat synthesis whereas the milk FA output remained low in sows fed the low-fat diet or high-fat OFO or FO diets,indicating that dietary FA intake,dietary fat level,and body fat mobilization in concert determine de novo fat synthesis,amount and profiles of FA in milk. 展开更多
关键词 Carbon metabolism De novo fat synthesis Dietary fatty acid fat balance Mammary gene expression Mammary lipogenesis Milk fat production Piglet growth
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fat-1转基因小鼠脂类代谢相关基因的表达分析
5
作者 杨淑萍 张莹莹 +1 位作者 刘新峰 郭宏 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第11期5-8,共4页
为了分析fat-1转基因小鼠对3个脂类代谢关键基因(FASN、PPAR、LPL)的组织表达特性,研究利用实时荧光定量PCR技术检测FASN、PPAR和LPL在心脏、肝脏、骨骼肌组织中的表达情况。结果表明:FASN、PPAR、LPL基因在转基因小鼠心脏、肝脏、骨骼... 为了分析fat-1转基因小鼠对3个脂类代谢关键基因(FASN、PPAR、LPL)的组织表达特性,研究利用实时荧光定量PCR技术检测FASN、PPAR和LPL在心脏、肝脏、骨骼肌组织中的表达情况。结果表明:FASN、PPAR、LPL基因在转基因小鼠心脏、肝脏、骨骼肌的表达情况有很大差异。其中PPAR和LPL基因在转基因小鼠肝脏组织中极显著升高(P<0.01),而在心脏、骨骼肌的表达量显著或极显著下降(P<0.01或P<0.05);FASN基因只在骨骼肌中极显著下降(P<0.01),而在心脏和肝脏中没有发生明显变化(P>0.05)。说明fat-1基因能够在机体脂类代谢的调控过程中发挥重要的作用。 展开更多
关键词 fat-1基因 转基因 脂类代谢 调控机制 实时荧光定量PCR
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断尾对兰州大尾羊脂肪细胞结构和脂肪代谢相关基因表达的影响
6
作者 宋淑珍 朱才业 +2 位作者 刘立山 宫旭胤 雒瑞瑞 《草业学报》 CSCD 北大核心 2024年第7期94-104,共11页
旨在观察断尾对兰州大尾羊尾部脂肪细胞数量、结构以及皮下脂肪、大网膜脂肪、尾部脂肪、肾周脂肪和背最长肌脂肪代谢相关基因表达的影响,明确断尾引起脂肪沉积重新分布后,脂肪细胞和各脂肪沉积部位脂肪代谢相关基因表达的变化,为阐明... 旨在观察断尾对兰州大尾羊尾部脂肪细胞数量、结构以及皮下脂肪、大网膜脂肪、尾部脂肪、肾周脂肪和背最长肌脂肪代谢相关基因表达的影响,明确断尾引起脂肪沉积重新分布后,脂肪细胞和各脂肪沉积部位脂肪代谢相关基因表达的变化,为阐明断尾对脂尾型绵羊脂肪代谢调控的分子机理提供参考。选择5日龄[(3.79±0.12)kg]单羔兰州大尾羊羔羊18只,随机分为对照组(C组)和试验组(T组),每组9只羔羊,试验组羔羊采用橡皮圈结扎法断尾。试验羊2月龄断奶后饲喂配合日粮,两组羊日粮相同。试验期240 d。试验结束后,采集样品进行分析。1)相对于背最长肌肌内脂肪和内脏脂肪,断尾对尾部脂肪、皮下脂肪基因表达影响较大,断尾组尾部脂肪SCD、LEP、PLIN1的mRNA表达量显著升高,LPL、FAS、PEPCK的表达量显著降低(P<0.05);皮下脂肪中SCD显著升高,LEP、ADPN、FABP4、PLIN1显著降低(P<0.05);肾周脂肪中LPL、ADPN、PEPCK、UCP1和大网膜脂肪中的PEPCK显著降低(P<0.05);背最长肌中SCD显著升高,PEPCK、PLIN1显著降低(P<0.05)。2)断尾组背最长肌的肌内脂肪含量(6.96%和6.05%)、脂滴面积比(4.28%和3.04%)显著增加(P<0.05),脂滴面积比增加了约1%,而尾部脂肪中脂滴面积比例降低了约10%(87.43%和97.58%),尾部脂肪细胞直径显著降低(P<0.05);3)兰州大尾羊尾部脂肪细胞被融合的大脂滴填充,细胞核、细胞质等被大脂滴挤到细胞边缘,细胞边缘的细胞质薄层中含有线粒体、内质网、高尔基体、自噬小体等细胞器和小脂滴,断尾组尾部脂肪细胞质中单个脂滴体积较小,周围糖原颗粒较多。综上所述,长脂尾型绵羊兰州大尾羊早期断尾后,背最长肌的脂滴面积比增加,尾部脂肪中脂滴面积比降低,尾部脂肪细胞直径减小,各部位脂肪代谢相关基因表达也发生变化,断尾后脂肪沉积分布改变可能是在SCD、PLIN1、LPL、FAS、PEPCK等一系列脂肪代谢相关基因的调控下实现的。 展开更多
关键词 兰州大尾羊 断尾 脂肪代谢 基因表达 脂肪细胞超微结构
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调控肉牛肌内脂肪沉积的分子机制研究进展
7
作者 王思伟 彭朋 +3 位作者 刘婷婷 肖延仁 王昆 周荣艳 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第14期23-31,124,共10页
肉牛肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)是指存在于肌纤维内的脂肪组织,含量与牛肉的多汁性、嫩度和适口性呈正相关关系,是决定牛肉质量等级的重要因素之一。明确肉牛IMF沉积的产生和调控机制是提高牛肉IMF含量的有效途径。文章对肉牛IMF... 肉牛肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)是指存在于肌纤维内的脂肪组织,含量与牛肉的多汁性、嫩度和适口性呈正相关关系,是决定牛肉质量等级的重要因素之一。明确肉牛IMF沉积的产生和调控机制是提高牛肉IMF含量的有效途径。文章对肉牛IMF沉积过程及调控IMF沉积的候选基因、转录因子和非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)进行综述,旨在为进一步解析肉牛IMF沉积的分子机制和推动肉牛肉质性状选育进程提供参考。 展开更多
关键词 肉牛 肌内脂肪(IMF) 候选基因 转录因子 非编码RNA(ncRNA) 调控机制
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饲养方式对滩羊肌内脂肪沉积影响及相关基因表达差异研究
8
作者 张力莉 康燕 +2 位作者 任文义 张宁 徐晓锋 《中国饲料》 北大核心 2024年第13期28-33,共6页
本试验基于转录组学技术探讨舍饲与放牧条件下,滩羊脂肪沉积的差异及相关表达基因的筛选及分析。试验采用随机区组的试验设计方法,将体况相近的12只4月龄滩羊羯羊随机分为2组,每组6只,分别采用放牧和舍饲的饲养模式。于6月龄屠宰取背最... 本试验基于转录组学技术探讨舍饲与放牧条件下,滩羊脂肪沉积的差异及相关表达基因的筛选及分析。试验采用随机区组的试验设计方法,将体况相近的12只4月龄滩羊羯羊随机分为2组,每组6只,分别采用放牧和舍饲的饲养模式。于6月龄屠宰取背最长肌与股二头肌。试验结果表明:舍饲滩羊背最长肌肌内脂肪(IMF)含量显著高于放牧组(P <0.05),放牧组滩羊背最长肌IMF含量为(1.4567±0.0987)%,舍饲组滩羊背最长肌IMF含量为(2.0700±0.1493)%。股二头肌IMF含量舍饲组较放牧组高,但差异不显著。与舍饲组滩羊相比,放牧组滩羊背最长肌与股二头肌饱和脂肪酸含量均低,其中背最长肌己酸(C6:0)、癸酸(C10:0)、肉豆蔻酸(C14:0)、十五烷酸(C15:0)、棕榈油酸(C16:1)、十七烷酸(C17:0)、十七碳烯酸(C17:1)、硬脂酸(C18:0)含量显著低于舍饲组(P <0.05),股二头肌十五烷酸(C15:0)、棕榈油酸(C16:1)、十七烷酸(C17:0)显著低于舍饲组(P <0.05),碳原子数≥18的长链脂肪酸和不饱和脂肪酸含量以放牧组滩羊较高,其中背最长肌二十一烷酸(C21:0)和股二头肌十七碳烯酸(C17:1)含量显著低于舍饲组(P <0.05)。基于转录组学分析得知,与舍饲组相比,放牧组滩羊背最长肌脂肪代谢基因表达量显著下调的有酰基辅酶A硫酯酶7(ACOT7)、脂肪细胞分化转录因子(ADIG)与酰基辅酶A氧化酶2(ACOX2)(P <0.05),显著上调的有溶质载体家族7成员8(SLC7A8)、游离脂肪酸受体4(FFAR4)与胰岛素样生长因子2(IGF2)(P <0.05)。放牧组滩羊股二头肌脂肪代谢基因表达显著下调的有ACOT7、ADIG、脂肪酸结合蛋白4(FABP4)与脂肪酶A(LIPA)(P<0.05),显著上调的有花生四烯酸15-脂加氧酶(ALOX15)与二酰基甘油O-酰基转移酶2(DGAT2)(P <0.05)。 展开更多
关键词 滩羊 转录组 脂肪代谢 差异基因筛选
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德昂酸茶水提物对高脂饮食小鼠肠道病理及脂肪代谢相关基因表达的影响
9
作者 杨卫星 侯艳 +2 位作者 张智芳 肖蓉 杨莉 《粮食与油脂》 北大核心 2024年第6期148-152,共5页
通过灌胃不同剂量的德昂酸茶水提物,研究德昂酸茶对高脂饮食诱导肥胖小鼠的生理指标、肠道病理及脂肪代谢等相关基因的影响。结果表明:与高脂对照组相比,德昂酸茶可显著降低高脂饮食小鼠的体质量、腹脂比(P<0.05),对高脂饮食造成的... 通过灌胃不同剂量的德昂酸茶水提物,研究德昂酸茶对高脂饮食诱导肥胖小鼠的生理指标、肠道病理及脂肪代谢等相关基因的影响。结果表明:与高脂对照组相比,德昂酸茶可显著降低高脂饮食小鼠的体质量、腹脂比(P<0.05),对高脂饮食造成的小鼠小肠组织肠黏膜损伤具有一定的改善和保护作用;同时德昂酸茶中剂量组能显著上调高脂饮食小鼠肝脏组织、脂肪组织中PPARα、AOX、CPT-1的基因表达水平,并有效下调肝脏组织中脂肪酸合成酶的基因表达水平。 展开更多
关键词 德昂酸茶 高脂饮食 脂肪代谢 基因表达
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不同年龄梅花鹿肌内脂肪沉积规律及其对风味品质影响
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作者 彭章蓉 孙皓然 +5 位作者 张乔儒 杨颖 郭鸿莹 常彤 赵卉 张铁涛 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期3541-3551,共11页
旨在揭示不同年龄段梅花鹿肌内脂肪沉积规律,研究肌内脂肪含量对风味品质的影响。分别选取2、3、4岁梅花鹿母鹿,检测不同年龄段梅花鹿肌肉组织特性,并根据肌内脂肪(intramuscular fat, IMF)含量将样品分为高IMF组(IMFH组)和低IMF组(IMFL... 旨在揭示不同年龄段梅花鹿肌内脂肪沉积规律,研究肌内脂肪含量对风味品质的影响。分别选取2、3、4岁梅花鹿母鹿,检测不同年龄段梅花鹿肌肉组织特性,并根据肌内脂肪(intramuscular fat, IMF)含量将样品分为高IMF组(IMFH组)和低IMF组(IMFL组),分析其对肌苷酸、脂肪酸含量以及脂肪酸结合蛋白4(FABP4)、脂肪酸合成酶(FASN)、甾醇调节元件结合转录因子1(SREBF1)和乙酰辅酶A羧化酶(ACACA)4种基因表达量。结果表明,梅花鹿肌内脂肪含量随年龄增长逐渐增加(P<0.001),里脊肌内脂肪含量最高(P<0.001),前腱子含量最低(P<0.001);梅花鹿年龄越长,肌纤维密度显著降低(P<0.05),肌苷酸、棕榈油酸(C16:1)、C18脂肪酸、饱和脂肪酸和单不饱和脂肪酸含量显著增高(P<0.05);高肌内脂肪样本肌纤维面积显著高于低肌内脂肪样本(P<0.05),IMFH组4岁龄梅花鹿肌束内肌纤维根数和肌苷酸以及3岁龄梅花鹿C16:1、C18:1和C18:3含量高于IMFL组(P<0.05),肌纤维密度高于IMFL组。油酸(C18:1)和亚麻酸(C18:3)含量高于低肌内脂肪样本(P<0.05);FABP4和SREBF1基因表达量显著高于低肌内脂肪样本(P<0.05),肌内脂肪与多不饱和脂肪酸呈负相关(P<0.05),与单不饱和脂肪酸呈正相关(P<0.05)。综上所述,梅花鹿随年龄增长,肉质嫩度降低,风味物质含量增加,高肌内脂肪组肉质更嫩,FABP4、FASN、SREBF1和ACACA四种基因高效表达和单不饱和脂肪酸含量对肌内脂肪沉积有促进作用。 展开更多
关键词 梅花鹿 肌内脂肪 风味品质 基因调控
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宁乡猪不同发育阶段肌内脂肪沉积差异表达基因及其调控通路分析
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作者 夏铭隆 肖银涛 +4 位作者 郑塞珍 谭碧娥 印遇龙 陈家顺 尹杰 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3703-3714,共12页
【目的】分析不同日龄宁乡猪背最长肌组织mRNA表达谱,筛选发育过程中与脂肪沉积相关的差异表达基因及其所参与的信号通路,并确定部分关键基因在肌内脂肪发育过程中的表达特征。【方法】选取30(D30)和250(D250)日龄宁乡猪各3头,采集背最... 【目的】分析不同日龄宁乡猪背最长肌组织mRNA表达谱,筛选发育过程中与脂肪沉积相关的差异表达基因及其所参与的信号通路,并确定部分关键基因在肌内脂肪发育过程中的表达特征。【方法】选取30(D30)和250(D250)日龄宁乡猪各3头,采集背最长肌组织样品提取总RNA进行转录组测序,对测序数据进行比对和处理,筛选参与脂质代谢的差异表达基因进行GO功能、KEGG通路及蛋白互作分析,并随机选取6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。【结果】共筛选出30个与脂质代谢相关的差异表达基因,其中9个上调,21个下调。差异表达基因主要富集在脂肪酸氧化、长链脂肪酸代谢等生物过程,线粒体、细胞器膜等细胞组分,酰甘油O-酰基转移酶活性、氧化还原酶活性等分子功能;参与了脂肪酸降解、甘油酯代谢、PPAR等信号通路。蛋白互作分析筛选出ACSL 1、ACAA 2、HADHB、LIPG、GPCPD 1、ALDH 2等关键蛋白基因处于核心位置,通过其mRNA表达量不同参与脂肪沉积调控。ACSL 1、CPT 1 A等6个基因的实时荧光定量PCR验证结果与转录组测序结果一致。【结论】ACSL 1、ACAA 2、HADHB、LIPG、GPCPD 1、ALDH 2等作为核心基因参与宁乡猪肌内脂肪调控,并通过脂肪酸降解、甘油酯代谢等信号通路发挥调控作用。本研究结果为进一步研究猪肌内脂肪沉积相关基因的分子调控机制提供了理论参考。 展开更多
关键词 宁乡猪 肌内脂肪 脂质代谢 转录组测序
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畜禽肌内脂肪沉积的基因调控及其作用机制
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作者 汪凯歌 闫俊书 宦海琳 《饲料工业》 CAS 北大核心 2024年第14期125-132,共8页
肌内脂肪含量与肉的系水力、嫩度和风味等指标密切相关,是影响肉质的关键因素之一。近年来随着基因测序技术的不断更新发展,调控肌内脂肪沉积的基因被不断挖掘,但其发挥作用的分子机制还需要进一步完善。因此文章主要从影响肌内脂肪沉... 肌内脂肪含量与肉的系水力、嫩度和风味等指标密切相关,是影响肉质的关键因素之一。近年来随着基因测序技术的不断更新发展,调控肌内脂肪沉积的基因被不断挖掘,但其发挥作用的分子机制还需要进一步完善。因此文章主要从影响肌内脂肪沉积的非编码RNA和候选基因两方面进行综述,以期为畜牧生产中提高肌内脂肪的沉积提供一定借鉴和参考。 展开更多
关键词 肌内脂肪 MIRNA lncRNA circRNA 候选基因
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拜城油鸡不同时期脂肪代谢相关基因表达规律的研究
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作者 汪家骏 陈若楠 +3 位作者 孙楠桢 张若彤 杨朝永 孙杰 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第23期50-54,61,共6页
为了探讨拜城油鸡胚胎期及出生后1,60日龄脂肪代谢相关基因CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPα)、脂肪酸合成酶(FAS)、固醇调节元件结合蛋白1(SREBP1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、Spondin3(RSPO3)的表达规律,试验分别采集拜城油... 为了探讨拜城油鸡胚胎期及出生后1,60日龄脂肪代谢相关基因CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPα)、脂肪酸合成酶(FAS)、固醇调节元件结合蛋白1(SREBP1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、Spondin3(RSPO3)的表达规律,试验分别采集拜城油鸡和科宝鸡7,9,11,14,17胚龄及出生后1,60日龄胸肌,采用索氏抽提法测定60日龄胸肌中肌内脂肪(IMF)含量,同时检测脂肪代谢相关基因的相对表达量。结果表明:7,11,17胚龄及出生后1日龄拜城油鸡C/EBPα基因相对表达量极显著高于科宝鸡(P<0.01),7~17胚龄及出生后1日龄拜城油鸡FAS基因相对表达量显著或极显著高于科宝鸡(P<0.05或P<0.01),除9胚龄外其他胚龄及出生后1日龄PPARγ基因相对表达量极显著低于科宝鸡(P<0.01),SREBP1和RSPO3基因相对表达量在7~11胚龄时极显著低于科宝鸡(P<0.01)。60日龄时,拜城油鸡FAS和SREBP1基因相对表达量显著低于科宝鸡(P<0.05),RSPO3基因相对表达量极显著低于科宝鸡(P<0.01),C/EBPα和PPARγ基因相对表达量极显著高于科宝鸡(P<0.01)。60日龄拜城油鸡和科宝鸡胸肌IMF含量分别为(3.99±1.33)%和(1.81±0.19)%,拜城油鸡胸肌IMF含量极显著高于科宝鸡(P<0.01)。两个品种鸡60日龄IMF含量分别与C/EBPα、PPARγ基因相对表达量呈中度正相关(P>0.05),与FAS和RSPO3基因相对表达量呈负相关(P>0.05),与SREBP1基因相对表达量呈显著负相关(P<0.05)。说明拜城油鸡和科宝鸡在不同胚龄条件下,C/EBPα、FAS、PPARγ、SREBP1和RSPO3基因表达趋势存在差异。 展开更多
关键词 拜城油鸡 胚胎期 脂肪代谢 基因 肌内脂肪
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PGC-lα调控畜禽肌肉脂肪生长代谢及其与肉品质研究进展 被引量:1
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作者 辛建增 唐婷 刘盛 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第5期138-145,共8页
过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1α(PGC-lα)是一种具有广泛功能的转录调节因子,其在动物体内参与线粒体生物合成、肌纤维类型转化、脂肪分化、肌内脂肪沉积、糖脂代谢、能量代谢等多项生理过程,其中,肌纤维类型和肌内脂肪含... 过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1α(PGC-lα)是一种具有广泛功能的转录调节因子,其在动物体内参与线粒体生物合成、肌纤维类型转化、脂肪分化、肌内脂肪沉积、糖脂代谢、能量代谢等多项生理过程,其中,肌纤维类型和肌内脂肪含量与肉品质密切相关。因此,在分子水平深入探究PGC-1α调控肌肉和脂肪的生长代谢过程将为改善肉品质提供新的研究思路。本文系统概述了PGC-lα的结构特点及PGC-1α调控肌肉线粒体增生、脂肪分化、能量代谢等过程的机制,重点介绍了PGC-lα调控肌纤维类型转化、肌内脂肪沉积、糖类代谢及其与肉品质形成之间的可能关系,以期为今后通过PGC-1α调控畜禽肌肉脂肪生长代谢,进而改善肉品质提供参考。 展开更多
关键词 过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1α 肌纤维类型 肌内脂肪沉积 能量代谢 肉品质
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鸡H-FABP和A-FABP基因表达与肌内脂肪含量相关研究 被引量:71
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作者 李文娟 李宏宾 +3 位作者 文杰 陈继兰 赵桂苹 郑麦青 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期417-423,共7页
选用H-FABP和A-FABP基因作为影响鸡肌内脂肪沉积的候选基因,以北京油鸡、矮脚鸡、白莱航鸡和AA肉鸡为研究群体,利用RT-PCR和实时荧光定量PCR技术,分别对56、90、120日龄H-FABP和A-FABP基因mRNA进行定量分析,结合IMF含量及屠体性状测定,... 选用H-FABP和A-FABP基因作为影响鸡肌内脂肪沉积的候选基因,以北京油鸡、矮脚鸡、白莱航鸡和AA肉鸡为研究群体,利用RT-PCR和实时荧光定量PCR技术,分别对56、90、120日龄H-FABP和A-FABP基因mRNA进行定量分析,结合IMF含量及屠体性状测定,分析H-FABP及A-FABP基因表达水平对IMF含量等的影响。结果表明:H-FABP基因mRNA随日龄的增长表达量显著降低,而A-FABP基因mRNA随日龄的增长表达量显著升高,并表现出显著的品种效应(P<0.01),性别因素对A-FABP基因表达影响显著。北京油鸡、白莱航鸡和AA鸡群体的H-FABP基因mRNA表达水平与IMF含量及屠体重呈现显著的负相关,而A-FABP基因mRNA表达水平与屠体重显著相关,与IMF含量没有显著的相关性。矮脚鸡A-FABP基因mRNA水平与IMF含量呈现显著的负相关,其H-FABP基因mRNA水平对屠体重影响显著,表现出显著的品种差异。 展开更多
关键词 H-FABP A-FABP 基因表达 肌内脂肪
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猪肌内脂肪前体细胞与皮下脂肪前体细胞分化过程中基因差异表达分析 被引量:23
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作者 张罕星 朱晓彤 +6 位作者 束刚 周桂炫 高萍 高淑静 张常明 江青艳 陈瑶生 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期3760-3768,共9页
【目的】探讨猪肌内脂肪细胞与皮下脂肪细胞的基因表达差异。【方法】通过改进的胶原酶消化法,分别从猪(大×长二元杂)皮下脂肪组织和背最长肌肌肉组织中分离脂肪前体细胞,用850nmol·L-1胰岛素和50nmol·L-1地塞米松诱导... 【目的】探讨猪肌内脂肪细胞与皮下脂肪细胞的基因表达差异。【方法】通过改进的胶原酶消化法,分别从猪(大×长二元杂)皮下脂肪组织和背最长肌肌肉组织中分离脂肪前体细胞,用850nmol·L-1胰岛素和50nmol·L-1地塞米松诱导细胞分化,采用油红O提取法测定细胞分化过程中的聚酯水平。同时采用实时荧光定量PCR方法检测细胞分化过程中的转录调控因子基因(PPARγ、C/EBPβ与SREBP-1)、脂肪合成酶相关基因(GPDH、ACC和SCD-1)、脂肪酸转运相关基因(LPL、FAT与AP2)以及肌肉旁分泌因子受体基因(ACVR2B、IL-6R和IGF-1R)的表达模式。【结果】猪肌内脂肪前体细胞诱导后聚酯的速度快于皮下脂肪前体细胞。与此相似,肌内脂肪前体细胞中PPARγ、SREBP-1、SCD-1、LPL、AP2和FAT的mRNA表达在分化后期均显著高于皮下脂肪细胞。肌肉旁分泌因子受体基因ACVR2B、IGF-IR和IL-6RmRNA在皮下脂肪前体细胞随分化程度的增加其表达水平逐渐降低,但肌内脂肪前体细胞ACVR2B却在诱导后不断上调。【结论】建立了猪肌内和皮下脂肪前体细胞的原代培养模型,发现在离体培养条件下猪肌内脂肪前体细胞比皮下脂肪前体细胞具有更强的分化聚酯能力。从在体情况下肌内脂肪的沉积量少,沉积时间晚等现象可以推测肌内脂肪前体细胞的分化有可能受到肌肉旁分泌因子的局部抑制。 展开更多
关键词 脂肪前体细胞 离体培养 肌内脂肪 基因表达
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猪PID1基因CDS区的克隆及其mRNA表达与肌内脂肪沉积关系 被引量:21
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作者 钱源 曾勇庆 +5 位作者 杜金芳 崔景香 李华 陈其美 宋一萍 陈伟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1153-1158,共6页
为了探索PID1(Phosphotyrosine interaction domain containing1)基因的表达与脂肪沉积的关系,文章利用兼并引物进行RT-PCR从猪脂肪和肌肉组织中克隆PID1基因CDS(Coding region)区全序列,并采用荧光定量PCR方法对大白猪、鲁莱黑猪、莱芜... 为了探索PID1(Phosphotyrosine interaction domain containing1)基因的表达与脂肪沉积的关系,文章利用兼并引物进行RT-PCR从猪脂肪和肌肉组织中克隆PID1基因CDS(Coding region)区全序列,并采用荧光定量PCR方法对大白猪、鲁莱黑猪、莱芜猪3个猪品种的肝脏、脂肪和肌肉组织PID1基因mRNA表达进行了相对定量分析。结果表明:经克隆、测序,得到了猪PID1基因654bp全编码区序列,通过Blast比对,与人、大鼠、牛有93.88%、66.94%、88.07%的同源性。PID1基因在同一个品种猪中mRNA表达水平总体表现为:肝脏>脂肪>肌肉。在不同品种3种组织中PID1基因mRNA表达水平总体表现为:莱芜猪>鲁莱黑猪>大白猪,其中肝脏中差异显著(P<0.05),但是在脂肪和肌肉组织中莱芜猪与鲁莱黑猪差异不显著(P>0.05)。对于高肌内脂肪(LWH)、中等肌内脂肪(LWI)和低肌内脂肪(LWL)沉积的3组莱芜猪,PID1基因在肝脏组织中的表达水平是LWH显著高于LWL(P<0.05),在肌肉组织中则是LWH显著高于LWI和LWL(P<0.05)。PID1基因在莱芜猪品种内3个组织中mRNA表达量与IMF含量相关均不显著,而在品种间3个组织中mRNA表达量与IMF含量呈显著正相关(P<0.05)。结果提示:PID1的表达可能与脂肪沉积性状存在一定的关系。 展开更多
关键词 PID1基因 组织表达 肌内脂肪
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利用RNA-seq技术筛选大白猪皮下和肌内脂肪组织差异表达基因 被引量:13
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作者 黄万龙 张秀秀 +1 位作者 李嫒 苗向阳 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期501-511,共11页
为了比较分析大白猪皮下和肌内脂肪组织的全转录组数据,探究调控脂肪沉积的分子机制,本文采用RNA-seq技术和生物信息学方法鉴定大白猪皮下和肌内脂肪组织基因表达谱,对差异表达基因进行GO(Gene Ontology)分析、信号通路富集分析以及蛋... 为了比较分析大白猪皮下和肌内脂肪组织的全转录组数据,探究调控脂肪沉积的分子机制,本文采用RNA-seq技术和生物信息学方法鉴定大白猪皮下和肌内脂肪组织基因表达谱,对差异表达基因进行GO(Gene Ontology)分析、信号通路富集分析以及蛋白互作网络分析。大白猪皮下和肌内脂肪组织中有180个基因差异表达,上调基因主要参与细胞增殖、脂质激酶活性和磷脂代谢等与脂质代谢相关的生物学过程正调控,下调基因显著富集于脂肪细胞分化中起重要调控作用的MAPK信号转导通路。差异表达基因主要通过参与脂质代谢及通过MAPK信号转导通路调控脂肪细胞成脂分化,进而影响大白猪皮下和肌内脂肪的沉积。 展开更多
关键词 肌内脂肪 皮下脂肪 脂质代谢 MAPK信号通路 RNA-SEQ
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猪H-FABP基因多态性及其与肌内脂肪含量的相关研究 被引量:17
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作者 姜延志 刘晓研 +1 位作者 李芳琼 李学伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期792-796,共5页
旨在研究猪H-FABP基因的遗传多态性及其与肌内脂肪含量的遗传效应。利用PCR-RFLP(HinfⅠ、MspⅠ、HaeⅢ、Hinf*Ⅰ4种限制性内切酶)分子标记技术检测了中国地方猪种雅南猪、大河猪,培育品种大河乌猪以及杜洛克与长白和约克三元杂交商业... 旨在研究猪H-FABP基因的遗传多态性及其与肌内脂肪含量的遗传效应。利用PCR-RFLP(HinfⅠ、MspⅠ、HaeⅢ、Hinf*Ⅰ4种限制性内切酶)分子标记技术检测了中国地方猪种雅南猪、大河猪,培育品种大河乌猪以及杜洛克与长白和约克三元杂交商业群体共148头猪心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因5′-上游区和第二内含子的遗传变异,并利用固定效应模型分析了H-FABP基因在杜洛克与长白和约克三元杂交商业群体中对肌内脂肪含量的遗传效应。结果表明:(1)在HinfⅠ和MspⅠ位点上,所有4个猪群都存在多态;在HaeⅢ位点上,除雅南猪只出现单态外,其余3个猪群都出现多态;在Hinf*Ⅰ位点上,除杜洛克与长白和约克三元杂交商业群体出现多态外,其余3个猪群只表现单态。(2)4个位点对肌内脂肪含量的影响差异显著,各基因型肌内脂肪含量最小二乘均值关系即Hh>HH,bb>Bb>BB,Aa>AA,DD>Dd>dd。结合H-FABP基因的生理功能和已有的研究结果来看,可在特定的群体中将其作为影响猪肌内脂肪含量的候选基因。 展开更多
关键词 心脏型脂肪酸结合蛋白基因 PCR-RFLPS 肌内脂肪含量
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猪钙蛋白酶抑制蛋白基因PCR-RFLP多态性与肉质性状及背膘厚间的关系分析 被引量:17
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作者 孙立彬 孟和 +2 位作者 李婧 白春艳 潘玉春 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2005年第1期57-62,共6页
钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)是钙蛋白酶系统的内源性抑制剂,并且已经被确定能影响宰后肉的嫩度。本研究采用PCR-RFLP技术,分析了CAST基因在125头PIC杂交猪中的多态性分布及其与肉质性状和背膘厚间的相关。结果发现,CAST基因在本研究所检测... 钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)是钙蛋白酶系统的内源性抑制剂,并且已经被确定能影响宰后肉的嫩度。本研究采用PCR-RFLP技术,分析了CAST基因在125头PIC杂交猪中的多态性分布及其与肉质性状和背膘厚间的相关。结果发现,CAST基因在本研究所检测的位点均具有多态性。进一步分析表明,CASTA2A2基因型个体与其相应的另外两个基因型个体相比肌内脂肪含量有显著差异,CASTB1B2基因型个体对于肌内脂肪含量的影响也有相同的趋势;CASTB1B2基因型个体与其相应的另外两个基因型个体相比背膘厚有显著差异,CASTC1C2基因型个体和CASTD1D2基因型个体对于背膘厚的影响也有相同的趋势。因此可以把CAST基因作为影响猪肉质性状和屠体性状的候选基因。 展开更多
关键词 背膘厚 钙蛋白酶抑制蛋白 肉质性状 CAST 基因型 肌内脂肪 钙蛋白酶系统 多态性 PCR-RFLP 影响
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