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C/EBPα通过结合鸡神经调节蛋白4基因外显子2正调控其表达
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作者 罗昊玉 黄佳新 +3 位作者 高帆 闫晓红 牟芳 王宁 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期1608-1617,共10页
神经调节蛋白4(NRG4)是一个新发现的脂肪细胞因子,它在机体能量平衡、糖脂代谢等许多生理过程中发挥重要调控作用。目前,NRG 4基因的转录调控机制尚不清楚。我们前期的5′RACE分析显示,鸡NRG 4基因转录起始位点(TSS)弥散分布于一段约200... 神经调节蛋白4(NRG4)是一个新发现的脂肪细胞因子,它在机体能量平衡、糖脂代谢等许多生理过程中发挥重要调控作用。目前,NRG 4基因的转录调控机制尚不清楚。我们前期的5′RACE分析显示,鸡NRG 4基因转录起始位点(TSS)弥散分布于一段约200 bp的区域,提示鸡NRG 4基因的启动子为分散型启动子(dispersed promoter)。本研究开展了鸡NRG 4基因近端外显子和内含子的启动子活性分析,报告基因分析显示,包含NRG 4基因外显子1、内含子1和外显子2的基因组片段(-122/+452)具有很强的双向启动子活性。生物信息学分析显示,鸡NRG 4基因外显子2上存在1个转录因子CCAAT增强子结合蛋白α(C/EBPα)的潜在结合位点;报告基因分析发现,删除或突变C/EBPα结合位点会导致C/EBPα丧失对NRG 4基因片段(-122/+452)启动子活性的调控作用。基因表达相关性分析显示,鸡脂肪组织中C/EBPα和NRG 4基因的mRNA表达存在显著正相关(P<0.01)。进一步的脂肪组织ChIP-qPCR分析显示,C/EBPα直接结合鸡NRG 4基因的外显子2。本研究发现,鸡NRG 4基因的近端外显子和内含子具有双向启动子活性,C/EBPα通过直接结合外显子2调控鸡脂肪组织NRG 4基因的表达。 展开更多
关键词 神经调节蛋白4 近端外显子和内含子 启动子活性 转录调控 CCAAT增强子结合蛋白α(C/EBPα)
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Knock in p53 sequences with and without intron 4 to determine its function in gene expression control
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作者 Q.Yang Z-Q.Wang M.Hollstein 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 1999年第11期22-22,共1页
关键词 Knock in p53 sequences with and without intron 4 to determine its function in gene expression control
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大豆11S球蛋白Gy5(A_3B_4)的基因克隆和序列分析 被引量:4
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作者 陈三凤 深泽亲房 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期215-217,共3页
大豆11S球蛋白(Glycinin)是大豆种子的主要贮藏蛋白,分子量为360kD,由6对相同的蛋白亚基(每对亚基的分子量约60kD)构成。每对亚基又是由一个酸性A肽(35~45kD)和一个碱性B肽(22kD)通过二硫键连接而成。A肽和B肽源... 大豆11S球蛋白(Glycinin)是大豆种子的主要贮藏蛋白,分子量为360kD,由6对相同的蛋白亚基(每对亚基的分子量约60kD)构成。每对亚基又是由一个酸性A肽(35~45kD)和一个碱性B肽(22kD)通过二硫键连接而成。A肽和B肽源自同一个基因,即首先由一个大的mR?.. 展开更多
关键词 大豆球蛋白 Gy5(A3B4)基因 外显子 DNA 序列分析
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广西人群TLR4基因内含子区基因多态性的研究
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作者 王海彦 廖品琥 +6 位作者 熊滨 覃纲 李军 黄冰 仇晓文 胡东海 黄孔文 《广西医学》 CAS 2014年第4期413-415,共3页
目的探讨人类Toll样受体4(TLR4)基因内含子区单核苷酸多态性在广西人群中分布情况及其与不同人群的差异。方法采用单碱基延伸PCR技术和DNA测序方法检测196例健康广西人群(男115例,女81例)TLR4基因内含子区rs11536879A/G位点多态性,并与... 目的探讨人类Toll样受体4(TLR4)基因内含子区单核苷酸多态性在广西人群中分布情况及其与不同人群的差异。方法采用单碱基延伸PCR技术和DNA测序方法检测196例健康广西人群(男115例,女81例)TLR4基因内含子区rs11536879A/G位点多态性,并与人类基因组计划研究的4个人群(欧洲、北京、日本、非洲)单核苷酸多态性分型数据进行对比。结果广西人群TLR4基因内含子区rs11536879A/G位点存在AA、GA、GG 3种基因型,其基因型及等位基因频率在男性、女性组间分布差异无统计学意义(P>0.05);广西人群TLR4基因内含子区rs11536879A/G位点基因型及等位基因频率与欧洲、非洲、日本人群比较,差异有统计学意义(P<0.05),而与北京人群比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论广西人群TLR4基因内含子区基因多态性的基因型及等位基因频率分布在男女性之间无明显差异,在不同地区人群之间存在明显差异。 展开更多
关键词 TOLL样受体4 内含子 单核苷酸多态性 广西
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延黄牛ALDH1A1基因内含子4多态性及其与肉用性状的相关性分析
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作者 胡忠昌 曹阳 +3 位作者 吴健 秦立红 金海国 赵玉民 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第11期3153-3159,共7页
试验旨在研究乙醛脱氢酶1A1(acetaldehyde dehydrogenase 1A1,ALDH1A1)基因内含子4多态性及其对延黄牛肉用性状的影响。选取99头18月龄延黄牛母牛,采用PCR扩增产物Sanger直接测序法测定99头延黄牛ALDH1A1基因内含子4的单核苷酸多态性(SN... 试验旨在研究乙醛脱氢酶1A1(acetaldehyde dehydrogenase 1A1,ALDH1A1)基因内含子4多态性及其对延黄牛肉用性状的影响。选取99头18月龄延黄牛母牛,采用PCR扩增产物Sanger直接测序法测定99头延黄牛ALDH1A1基因内含子4的单核苷酸多态性(SNP),运用SPSS 19.0软件分析ALDH1A1基因内含子4SNP与延黄牛肉用性状(体高、体斜长、十字部高、胸围、腹围、管围、体重、背膘厚、眼肌面积和肌内脂肪)的关联性。结果显示,延黄牛ALDH1A1基因内含子4存在C/T突变位点,该位点的突变引起了编码氨基酸(谷氨酰胺,Q)的改变;共发现3种基因型:TT、TC和CC,2种等位基因:T和C,其中TC为优势等位基因型,C为优势等位基因。卡方适合性检验结果发现,该SNP在延黄牛群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。群体遗传参数分析发现,该突变位点的杂合度(He)相对较低,表明其在延黄牛群体中的变异较小,该位点属于中度多态(0.25<PIC<0.5),说明该遗传标记能够提供遗传信息。关联分析结果表明,延黄牛体尺和肉质性状指标在不同基因型间差异均不显著(P>0.05)。结果表明,ALDH1A1基因内含子4在延黄牛中存在突变,能否作为延黄牛肉用性状的遗传标记有待于扩大样本数量进一步研究。 展开更多
关键词 ALDH1A 1基因 延黄牛 内含子4 多态性 肉用性状
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藏鸡和隐性白羽鸡GH基因的SNP检测及其与生长性状间的关联分析 被引量:25
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作者 李长春 傅田 +6 位作者 强巴央宗 唐晓惠 朱猛进 樊斌 熊统安 李奎 刘榜 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第11期2327-2332,共6页
利用改良等位基因特异性PCR(Modified Allele Specific PCR,M-ASP)结合PCR-RFLP以及直接测序方法对藏鸡和隐性白羽鸡生长激素(Growth Hormone,GH)基因内含子4(Intron4)的一个位点进行了SNP检测,并进行了该基因与藏鸡生长性状的关联分析... 利用改良等位基因特异性PCR(Modified Allele Specific PCR,M-ASP)结合PCR-RFLP以及直接测序方法对藏鸡和隐性白羽鸡生长激素(Growth Hormone,GH)基因内含子4(Intron4)的一个位点进行了SNP检测,并进行了该基因与藏鸡生长性状的关联分析。检测结果显示,GH基因Intron4的这个位点同时具有M-ASP和SacI-RFLP多态。测序结果表明,该位点发生了C→G的碱基突变,产生了CC、CG和GG三种基因型。两个等位基因和三种基因型在两鸡种中的分布基本一致。其中,基因型CC和等位基因C的频率最高。χ2检验结果表明,基因型频率或者等位基因频率在两鸡种之间没有显著差异(P>0.05),而分别在两鸡种内部却存在显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)差异。方差分析结果表明,基因型与藏鸡的2周龄体重等12个生长性状有显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)关联;基因型CC与藏鸡的7周龄体重存在显著关联(P<0.05)。这暗示了GH基因是影响藏鸡生长的主效基因或者它与主效基因相关,而该位点的碱基突变可以作为筛选藏鸡高的7周龄体重的分子标记。 展开更多
关键词 藏鸡和隐性白羽鸡 SNP M-ASP GH基因intron4 生长性状 关联分析
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Association of TSHR gene intron 1 and 4p14 single-nucleotide polymorphisms and gene-gene interactions with Graves' disease
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作者 吴静 《China Medical Abstracts(Internal Medicine)》 2016年第3期129-,共1页
Objective To identify the association of thyroid stimulating hormone receptor(TSHR)gene intron 1 susceptible loci and 4p14 susceptible locus rs6832151 polymorphisms with Graves’disease(GD)in Han Chinese population in... Objective To identify the association of thyroid stimulating hormone receptor(TSHR)gene intron 1 susceptible loci and 4p14 susceptible locus rs6832151 polymorphisms with Graves’disease(GD)in Han Chinese population in Bengbu,Anhui,China.The gene-gene interaction among TSHR intron 1 susceptible loci and 4p14susceptible locus rs6832151 was also investigated.Methods The genotypes of the single-nucleotide polymor- 展开更多
关键词 TSHR Association of TSHR gene intron 1 and 4p14 single-nucleotide polymorphisms and gene-gene interactions with Graves DISEASE gene
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CD4^+T细胞及其相关前炎症细胞因子基因多态性与胃癌发生的关系 被引量:3
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作者 傅冷西 彭孝纬 +2 位作者 何利平 陈晓露 邓万银 《中国综合临床》 北大核心 2008年第3期204-207,共4页
目的探讨CD4^+T细胞及其前炎症细胞因子基因多态性与胃癌发生的关系。方法①采用PCR—RFLP法检测170例胃癌患者及110例健康对照者肿瘤坏死因子(TNF).B+252、白细胞介素(IL)-10启动子-1082和IL-4内含子3基因多态性。②流式细胞术... 目的探讨CD4^+T细胞及其前炎症细胞因子基因多态性与胃癌发生的关系。方法①采用PCR—RFLP法检测170例胃癌患者及110例健康对照者肿瘤坏死因子(TNF).B+252、白细胞介素(IL)-10启动子-1082和IL-4内含子3基因多态性。②流式细胞术检测63例胃癌患者和31例健康对照者T细胞亚群和共刺激分子CD28。结果①非贵门胃癌组TNF—β+252^*A等位基因频率和IL-10启动子-1082A等位基因频率高于健康对照组(P〈0.05或0.01)。IL-4内含子3基因多态性与非贲门癌患者无明显相关(P〉0.05)。贲门癌组IL-4内含子3RP2基因频率明显高于健康对照组,RP1基因频率低于健康对照组(均P〈0.01)。②胃癌组外周血总T细胞、CD4^+T细胞和CD8^+T细胞均较健康对照组显著减少(P〈0.001或0.05);CD28表达率胃癌组较健康对照组显著增高(P〈0.001)。术后1周总T细胞和CD4^+T细胞明显上升(P〈0.05)。CD28表达率明显下降(P〈0.05)。结论CD4^+T细胞亚群异常与胃癌发生关系密切。TNF—β+252^*A等位基因和IL-10启动子-1082A等位基因可能是胃癌发生的易感基因,IL-4内含子3-RP2等位基因与贲门癌的发生有一定相关。 展开更多
关键词 胃癌 肿瘤坏死因子-β+52基因 白细胞介素-10启动子-1082基因 白细胞介素-4内含子3基因 CD4^+T细胞 共刺激分子CD28
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内蒙古地区蒙汉族早产儿支气管肺发育不良与SP-B内含子4基因多态性的相关性研究 被引量:1
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作者 霍梦月 梅花 +6 位作者 刘春枝 张钰恒 新春 贾昕 闫菲 张艳波 胡亚楠 《中华新生儿科杂志(中英文)》 CAS 2020年第2期87-91,共5页
目的探讨肺表面活性蛋白B(surfactant proteins-B,SP-B)内含子4基因多态性与早产儿支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia,BPD)的相关性。方法选取2016年1月至2019年1月内蒙古医科大学附属医院新生儿科诊断为BPD的早产儿为病例组... 目的探讨肺表面活性蛋白B(surfactant proteins-B,SP-B)内含子4基因多态性与早产儿支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia,BPD)的相关性。方法选取2016年1月至2019年1月内蒙古医科大学附属医院新生儿科诊断为BPD的早产儿为病例组,同期同民族非BPD早产儿为对照组,进行前瞻性研究,采用聚合酶链反应扩增基因分析技术分析SP-B内含子4基因型及等位基因分布情况。结果共纳入BPD患儿74例,其中蒙古族30例,汉族44例;对照组134例,其中蒙古族56例,汉族78例。不论蒙古族或汉族患儿,SP-B内含子4基因均可检出野生型和变异型(包括插入型及缺失型)2种基因型。蒙古族BPD患儿变异型基因型频率及等位基因频率与对照组相比[36.7%(11/30)比19.6%(11/56),21.7%(13/60)比12.5%(14/112)]差异无统计学意义(P>0.05);汉族BPD患儿变异型基因型频率及等位基因频率均高于对照组[31.8%(14/44)比12.8%(10/78),20.5%(18/88)比7.1%(11/156)],差异有统计学意义(P<0.05)。结论SP-B内含子4基因变异可能与内蒙古地区汉族BPD患儿遗传易感性相关。 展开更多
关键词 支气管肺发育不良 肺表面活性物质相关蛋白质B 内含子4 基因型
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Association of endothelial nitric oxide synthase polymorphisms with an increased risk of erectile dysfunction 被引量:4
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作者 Lei Gao Zhifeng Zhao +4 位作者 Fengfu Guo Yan Liu Jianhua Guo Yang Zhao Zhong Wang 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2017年第3期330-337,共8页
The purpose of our meta-analysis is to examine the associations between three single nucieotide polymorphisms of endothelial nitric oxide synthase (eNOS) gene, G894T, intron 4 and T-786C, and the risk of erectile dy... The purpose of our meta-analysis is to examine the associations between three single nucieotide polymorphisms of endothelial nitric oxide synthase (eNOS) gene, G894T, intron 4 and T-786C, and the risk of erectile dysfunction. An electronic database search was performed to identify case-control studies reporting the association between single nucleotide polymorphisms of eNOS gene and erectile dysfunction. Stringent inclusion and exclusion criteria were employed to select high-quality studies for this meta-analysis. Comprehensive Meta-analysis 2.0 software (Biostat Inc., Englewood, New Jersey, USA) was used for statistical analysis of the data extracted from the selected studies. From the initial 203 articles retrieved from database search, this meta-analysis finally selected 12 high-quality case-control studies that conformed to our inclusion criteria. The 12 studies contained a total of 1962 patients with erectile dysfunction and 1752 healthy controls. The results of our meta-analysis showed that G894T correlated with an increased risk erectile dysfunction under both the allele and dominant models (allele: OR = 1.556, 95% CI -- 1.064-2.275, P = 0.023; dominant: OR = 1.613, 95% CI = 1.050-2.476, P = 0.029). A similar association was found between T-786C and erectile dysfunction under the allele model (OR = 1.679, 95% CI = 1.341-2.102, P 〈 0.001), but not under the dominant model (all P 〉 0.05). Our meta-analysis showed that the two single nucleotide polymorphisms in eNOS gene, G894T and T-786C, are strongly associated with the risk of erectile dysfunction. 展开更多
关键词 endothelial nitric oxide synthase erectile dysfunction G894T intron 4 META-ANALYSIS single nucleotide polymorphism
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