不同环境因子对海洋细菌Pseudoalteromonas issachenkoniiHZ引导糖基转移酶基因表达的影响

为了研究海洋细菌Pseudoalteromonas issachenkonii HZ所产多糖的生物合成基因簇,首先需要克隆到在多糖合成中起关键作用的引导糖基转移酶基因。通过设计引物,采用PCR技术从海洋细菌Pseudoalteromonas issachenkonii HZ成功克隆到该基因,并通过实时荧光定量PCR技术检测了温度、p H及海盐浓度对引导糖基转移酶基因表达量的影响。结果表明:低温有利于引导糖基转移酶的表达,随着温度的上升,引导糖基转移酶基因的表达量先增后减,在20 h时,引导糖基转移酶的表达量急剧上升,15℃和35℃引导糖基转移酶表达量分别是20℃表达量的5.2倍、5.8倍;海盐浓度为4.5%时引导糖基转移酶的表达量为海盐浓度3.5%的2.5倍,海盐浓度为5.5%时引导糖基转移酶的表达量为海盐浓度3.5%的2.0倍;10 h时p H为8、9的培养基中引导糖基转移酶的表达量分别为p H为7的1.64和1.67倍。该结果为探究菌体环境适应性机制提供了一定的基础。

污损生物膜细菌Pseudoalteromonas issachenkonii YT1305-1的鉴定及其代谢物化学成分分析

【目的】对污损生物膜细菌YT1305-1进行菌种鉴定;研究其作为污损生物膜优势菌之一的代谢产物。【方法】通过16S rRNA基因序列分析,结合系统进化树和细菌生理生化实验对菌种进行鉴定,通过硅胶柱层析分离方法和核磁共振检测技术分析其代谢物的化学成分。【结果】发现生物膜中存在明显的优势菌株,假交替单胞菌属为优势菌属之一。16S rRNA序列比对分析表明Pseudoalteromonas issachenkonii为优势菌种之一,将目标菌种命名为Pseudoalteromonas issachenkonii YT1305-1,对其代谢物化学成分进行分析,共得到10个化合物,其中包括5个二酮哌嗪(DKPs)类信号分子,环(甘氨酸-丙氨酸)(1)、环(脯氨酸-甘氨酸)(2)、环(脯氨酸-酪氨酸)(3)、环(4-羟基-脯氨酸-亮氨酸)(4)和环(4-羟基-脯氨酸-丙氨酸)(5),以及尿嘧啶(6)、胸腺嘧啶(7)、胸腺嘧啶脱氧核苷(8)、己二酸二(2-乙基己)酯(9)和邻苯二甲酸二(2-乙基己)酯(10)。【结论】污损生物膜中存在明显的优势菌,其中之一为P.issachenkonii YT1305-1,在其代谢产物中发现了疑似信号分子的物质DKPs,有研究表明该物质能调控生物膜的形成,进而影响生物污损的形成,为探究生物污损现象奠定了物质基础。