Identification and characterization of genes related to m^(6)A modification in kiwifruit using RNA-seq and ATAC-seq

N6-methyladenosine(m^(6)A)RNA modification is a conserved mechanism that regulates the fate of RNA across eukaryotic organisms.Despite its significance,a comprehensive analysis of m^(6)A-related genes in non-model plants,such as kiwifruit,is lacking.Here,we identified 36 m^(6)A-related genes in the kiwifruit genome according to homology and phylogenetic inference.We performed bioinformatics and evolutionary analyses of the writer,eraser,and reader families of m^(6)A modification.Reanalysis of public RNA-seq data collected from samples under various biotic and abiotic stresses indicated that most m^(6)A-related genes were remarkably expressed under different conditions.Through construction of gene co-expression networks,we found significant correlations between several m^(6)A-related genes and transcription factors(TFs)as well as receptor-like genes during the development and ripening of kiwifruit.Furthermore,we performed ATAC-seq assays on diverse kiwifruit tissues to investigate the regulatory mechanisms of m^(6)A-related genes.We identified 10 common open chromatin regions that were present in at least two tissues,and these regions might serve as potential binding sites for MADS protein,C2H2 protein,and other predicted TFs.Our study offers comprehensive insights into the gene family of m^(6)A-related components in kiwifruit,which will lay foundation for exploring mechanisms of post-transcriptional regulation involved in development and adaptation of kiwifruit.

Evaluation of Resistance of Different Kiwifruit Varieties (Lines) to Canker Disease and Brown Spot Disease

Kiwifruit canker and brown spot are significant diseases affecting kiwis,caused by Pseudomonas syringae patho-genic variations(Pseudomonas syringae pv.Actinidiae(Psa))and Corynesporapolytica(Corynespora cassiicola).At present,the research on canker disease and brown spot disease mainly focuses on the isolation and identification of pathogenic bacteria,drug control,resistance gene mining and functional verification.Practice has proved that breeding disease resistant varieties are an effective method to control canker disease and brown spot disease.However,most existing cultivars lack genes for canker and brown spot resistance.Wild kiwifruit resources in nat-ure exhibit extensive genetic diversity due to prolonged natural selection,containing numerous resistance genes.But,due to insufficient understanding of the resistance of most kiwifruit varieties(lines)to canker disease and brown spot disease,some high-quality resources have not been fully utilized.The incidence of canker and brown spot of 18 kiwifruit cultivars(lines)was measured by inoculating isolated branches and leaves,and their resistance to canker and brown spot was analyzed according to the length,disease index,mean diameter,and systematic clustering.The results were as follows:Among 18 different kiwifruit varieties(lines)for canker disease,there were two highly resistant materials,eight disease-resistant materials,four disease-susceptible materials,and two highly susceptible materials.Moreover,regarding brown spot disease,there were one highly resistant material,five dis-ease-resistant materials,four susceptible materials,and three highly susceptible materials.Furthermore,four resources were resistant to both diseases.The outcomes provided a theoretical basis for breeding kiwifruit against canker and brown spot.

猕猴桃采后真菌病害生物防治研究进展

猕猴桃果实易受多种病原真菌的侵染,采后易发生软腐病、灰霉病、青霉病等严重危害果实品质的真菌性病害。传统的有效防治方法主要为采前使用化学杀菌剂,但其易污染环境并可能危害人类健康。目前,已有一系列生物防治方法被研究并报道,这些方法可有效防控猕猴桃采后真菌病害:第一类为天然抑菌物质,包括植物提取物和其他天然物质;第二类为拮抗微生物,包括生防酵母、生防细菌、生防木霉,生防菌也能与物理及化学方法协同发挥作用。本文概述了各类生物防治方法在猕猴桃采后真菌病害绿色防控方面的研究进展及生防机理,并提出了目前存在的问题,最后展望了这一领域今后的研究方向。

Investigation and Identification of Fungal Diseases of Kiwifruit in Qiandongnan Prefecture

[Objectives]The paper was to investigate and identify the fungal diseases of wild and red heart kiwifruit in Qiandongnan Prefecture.[Methods]The pathogenic fungi were isolated from diseased leaves and fruits of wild and red heart kiwifruit by tissue separation method.DNA sequencing was carried out by using the sequence analysis of ribosomal r DNA-ITS region,and molecular evolutionary trees were built by using MEGA 4.0 software.Finally,the pathogenic fungi were classified and identified by combining morphological observation.[Results]The main fungal diseases were anthracnose caused by Colletotrichum gloeosporioides on wild kiwifruit,fruit anthracnose caused by C.acutatum on red heart kiwifruit,leaf soft rot caused by Fusarium incarnatum on red heart kiwifruit,and brown spot caused by Alternaria alternata on red heart kiwifruit.[Conclusions]The study may provide some theoretical basis for the control of kiwifruit diseases in Qiandongnan Prefecture.

Efficacy of a Kiwifruit Extract (PhenActivTM) on Gastrointestinal Tract Function: A Randomised Double-Blind Placebo-Controlled Study

Objective: Gastrointestinal (GI) discomfort is experienced by millions of people every day. This study aimed to evaluate the effect of PhenActivTM, a novel green kiwifruit extract, on gastrointestinal tract (GIT) function in otherwise healthy adults. Methods: 41 healthy adults with mild GI discomfort were enrolled in this double-blind, randomized, placebo-controlled study. Participants were randomized to either take 3.0 g/day of PhenActivTM or a placebo for 6 weeks. Interviews were conducted at baseline, week 3 and week 6, with participants completing questionnaires regarding GI symptoms. Frequency of bowel movements was self-recorded daily. Results: There were no differences in daily and weekly defecation frequency and stool characteristics in either group. The active and placebo groups significantly improve GSRS scores (p , only the active group had a significant improvement in the IBSSS and PAC-QOL scores (p < 0.05) from baseline. Neither group had changes in sleep quality, quality of life and fatigue, plasma zonulin concentrations or macular pigment optical density scores. The product was well tolerated with no GI disturbances or adverse events being reported. Conclusion: Supplementation of 3.0 g/day of PhenActivTM for 6 weeks did not improve defecation frequency or stool composition in healthy adults, but did improve perceived symptoms of GIT function, including symptoms of functional GIT disorders, IBS and constipation. The product was well tolerated and future trials investigating higher doses with more participants and/or a different population would be beneficial.

氯吡脲处理对脐红猕猴桃果实品质的影响

脐红为深受市场欢迎的黄肉红心芽变猕猴桃新品种,研究不同浓度氯吡脲处理对其果实品质的影响,对脐红猕猴桃生产具有重要指导意义。设置5、10 mg/L氯吡脲水溶液2个处理,在谢花后25 d进行浸果,以清水为对照(CK),于果实成熟期测定果实的外观品质、内在品质、矿质元素及水解氨基酸含量。结果表明:10 mg/L氯吡脲水溶液处理后的单果重、横径、侧径、可溶性固形物含量、固酸比均增幅最大,分别提高了32.26%、17.09%、12.45%、9.38%和18.73%;可滴定酸、维生素C、花色苷含量和钙元素含量则显著降低,分别降低了7.75%、17.05%、52.13%和28.30%。在单个氨基酸方面,胱氨酸和精氨酸等2种氨基酸含量随氯吡脲浓度的增加而显著降低,丝氨酸、甘氨酸、脯氨酸等3种氨基酸含量则显著提高,总氨基酸含量有所降低,但差异不显著。在不同类别氨基酸方面,甜味氨基酸含量随着氯吡脲浓度的增加而提高,鲜味氨基酸、芳香氨基酸含量则降低。综上,氯吡脲的施用可促进脐红猕猴桃果实膨大,增加果实风味,如提高可溶性固形物含量、降低可滴定酸含量,但高浓度处理降低了果实营养品质,如维生素C、花色苷、钙元素、鲜味氨基酸和芳香氨基酸含量。建议种植户合理施用氯吡脲,以促进脐红猕猴桃产业健康可持续发展。

电感耦合等离子体发射光谱(ICP-OES)法测定陕西眉县猕猴桃矿物质含量及相关营养评价

为探究陕西眉县所产猕猴桃中矿物质含量及评价其相关营养价值。利用电感耦合等离子体发射光谱(ICP-OES)法对陕西眉县主产的徐香、翠香、红心、黄心四个品种猕猴桃中9种矿物质含量进行测定,并采用营养质量指数法(Index of nutritional quality,INQ)对矿物质元素进行营养评价,同时应用SPSS软件对9种矿物质和能量进行相关性分析。陕西眉县四个品种猕猴桃矿物质均以钾、磷、钙、镁四种元素为主,约占总矿物质的99.8%,四个品种中INQ均大于1的矿物质有钙、钾、镁、铜,其中钾的INQ最高在3.89~5.19。矿物总量最高的品种为翠香328 mg/100g,但营养质量指数最高的为徐香16.78(INQ_(总))。通过相关性分析表明各元素间存在着不同程度的相关性,其中钾与能量的相关系数最高为0.982。猕猴桃是一种高钾低钠的优质食品,不同品种猕猴桃矿物质元素的营养价值差异明显,矿物质营养密度最高的为翠香,其次为红心、黄心、徐香,但从营养价值指数方面来看,徐香最高,翠香次之,红心和黄心猕猴桃矿物营养水平稍逊。

猕猴桃便携式无损检测仪影响因素及其精度校准分析

为探究产地、成熟度对便携式可溶性固形物无损检测精度的影响,以同一品种3个产地的猕猴桃为试材,分别采用便携式无损检测仪和常规有损检测仪对其可溶性固形物含量进行测定和比较,并运用人工神经网络对其进行分析。结果表明,在使用便携式无损检测仪对猕猴桃可溶性固形物检测时,3个产地的无损检测R2分别为0.26、0.52、0.61,成熟度会对其检测精度造成一定影响,但在不同产地间没有稳定、统一的规律;基于人工神经网络学习、建模产生的随机预测值可将R2提高5%~49%。因此,可利用预测值来作为中间校准程序,以辅助提高便携式无损检测精度。

3株生防菌对猕猴桃软腐病的作用

为探究生防菌对猕猴桃软腐病的作用,选用前期获得的3株生防菌(贝莱斯芽孢杆菌P2-1、耐盐芽孢杆菌PL7和多黏芽孢杆菌NL4)进行室内抑菌试验、猕猴桃软腐病接种和自然发病防治试验,并研究了3株生防菌对猕猴桃果实病程相关基因表达的影响。试验结果表明,菌株P2-1、PL7和NL4对猕猴桃软腐病菌(Botryosphaeria dothidea)菌丝生长的抑制率分别为83.49%、74.82%和49.33%,P2-1的抑制效果最好,PL7次之,NL4最差;3株生防菌对接种猕猴桃软腐病均具有抑制作用,其中以P2-1的效果最好,PL7次之,NL4最差;3株生防菌均能显著降低猕猴桃软腐病自然发病率,其中以P2-1处理的发病率最低;3株生防菌处理均对猕猴桃果实品质无影响;3株生防菌处理猕猴桃果实后,果实中基因PR1、PR5和SOD的表达显著上调。研究结果可为菌株P2-1、PL7和NL4开发为防治猕猴桃软腐病的生物制剂提供参考。

基于无人机多光谱的猕猴桃园冠层叶绿素含量检测方法

为实现对猕猴桃园区果树整体生长健康状况的快速、大规模监测,以猕猴桃园冠层叶片为研究对象,基于无人机拍摄果园多光谱图像,然后利用Pix4Dmapper软件拼接多光谱图像,获取果园的正射影像图,并进行辐射校正。切分正射影像为420个区域图像作为样本,采用最大类间方差法(Otsu)分割样本图像的冠层叶片与土壤背景,并实测每个样本的冠层SPAD值,构建冠层叶片多光谱数据集。采用箱线图法对数据集进行异常值检测,剔除异常样本;然后利用多光谱图像多通道的数据特点,提取图像的相邻通道变化率和23种常用植被指数,以及二者组合作为样本特征值,接着利用CARS、LARS、IRIV等3种特征筛选算法优选特征,分别结合偏最小二乘回归(PLSR)、支持向量回归(SVR)、岭回归(RR)、多元线性回归(MLR)和极限梯度提升树(XGBoost)、最小绝对收缩和选择算子回归(Lasso)、随机森林回归(RFR)、高斯过程回归(GPR)等8种方法构建模型,识别猕猴桃园冠层SPAD值;最后对比分析以不同样本特征构建的24个模型的性能,实验结果表明:以相邻通道变化率为特征建立的模型中,GPR模型性能最好,R^(2)、RMSE分别为0.770、3.044;以植被指数和相邻通道变化率组合特征建立的模型中,GPR模型性能也最好,R^(2)、RMSE分别为0.783、2.957;以植被指数为数据特征建立的XGBoost模型性能最优,R^(2)、RMSE分别为0.787、2.933;因此基于无人机遥感的智能检测模型能够对果园冠层叶绿素含量进行准确评估。

近红外光谱结合Stacking集成学习的猕猴桃糖度检测研究

利用近红外光谱技术Stacking集成学习对猕猴桃糖度的无损检测。以湖北“云海一号”猕猴桃为研究对象,采用红外分析仪获取了280个样本的光谱数据,包含了4000~10000cm^(-1)范围内的1557个波长数据,使用折射仪测量糖度值。通过蒙特卡洛随机采样结合T检验的奇异样本识别算法筛除异常值样本。利用SPXY算法按照4∶1的比例划分训练集和测试集。使用多元散射校正(MSC)、SG平滑滤波(SG)、趋势校正(DT)、矢量归一化(VN)、标准正态变换(SNV)五种方法对数据进行预处理。使用无信息变量消除法(UVE)、竞争性自适应重加权算法(CARS)和区间变量迭代空间收缩特征选择算法(iVISSA)提取特征波长,使用连续投影算法(SPA)进行二次提取,消除共线性变量。由于单一模型的泛化能力有限,为了扩大建模能力,设计了一种基于Stacking算法的集成学习模型。选择贝叶斯岭回归(BRR)、偏最小二乘回归(PLSR)、支持向量机回归(SVR)以及人工神经网络(ANN)作为基学习器,线性回归(LR)作为元学习器建立集成模型,比较不同组合下集成模型的性能。使用Pearson相关系数分析基学习器与集成模型之间的关系。结果表明:在五种预处理方法之中,矢量归一化的效果最佳。对预处理后的光谱进行特征波长提取,结果显示VN-CARS-PLSR模型效果最好,在测试集上的RP2为0.805,RMSEP为0.498。模型提取了177个特征波长,数据量相比于原始光谱减少了88.6%。通过Stacking算法对基学习器进行融合,对比不同的组合方式,发现PLS+SVR+ANN集成模型预测精度最高,RP2达到了0.853,RMSEP下降至0.433。通过Pearson相关系数分析了基学习器对集成模型性能的影响。研究表明,与单一模型相比,Stacking集成模型能够进行更加全面的建模,具有更高的泛化能力,该方法为猕猴桃糖度品质的无损检测提供了技术支持。

猕猴桃9个种41份种质花粉形态观察与分析

为了解猕猴桃属植物间的亲缘关系,以9个猕猴桃种41份种质的花粉为供试材料,采用扫描电镜结合ImageJ图像处理软件对花粉进行形态学观测,并根据花粉极轴长度(P)、赤道轴长度(E)、萌发沟长度、萌发沟宽度、极轴长度/赤道轴长度(P/E)和大小(P×E)指标对供试材料进行聚类分析。结果表明,供试花粉均为单粒花粉,均以单粒、等极和辐射对称形式存在。极轴长度范围在21.50~33.40μm之间,赤道轴长度范围在9.87~16.24μm之间,萌发沟长度范围在17.53~29.08μm之间,萌发沟脊宽度范围在0.47~2.03μm之间,花粉粒大小(极轴×赤道轴)范围在218.68~543.18μm^(2)之间,极轴长度/赤道轴长度范围为1.36~2.26,花粉形状为超长球形或长球形,萌发孔类型均为三孔沟,极面观为三裂圆形,均为N3P4C5型。外壁纹饰分为波纹状、颗粒状和疣状,占样品总数的比例分别为63.41%、19.51%和17.08%。在遗传距离为7.5时,供试材料可以分为3个类群;在遗传距离为1.5时,供试材料可以分为6个类群,其中,中华猕猴桃被分为了4类。在两个遗传距离时,四萼猕猴桃均单独分为一类。

不同美味猕猴桃花粉萌发活力及形态学研究

为探究猕猴桃花粉萌发活力和花粉萌发前后的形态变化,以15份美味猕猴桃花粉为样本,采用离体培养方法测定花粉的萌发活力,利用扫描电镜观察离体培养前后5份雌株花粉和10份雄株花粉的形态变化。结果表明:15份花粉样本萌发率差异较大,5份雌株花粉均不萌发;10份雄株花粉中8号花粉样本的萌发率最高,为79.27%;9号花粉样本的萌发率最低,仅为22.85%。15份花粉样本离体培养前后扫描电镜观察发现:极面观基本相同,均为三裂圆形;赤道面观有差异,5份雌株花粉离体培养前后花粉形态不发生改变,均为近球形,而10份雄株花粉在萌发前为超长球形或长球形,萌发后均为近球形,极轴长度略有变小、赤道轴长变大、极轴长度与赤道轴长度比值变小、萌发沟宽度增宽,但萌发后的雄株花粉样本间各项形态学指标值差异较小。

基于超高压处理的猕猴桃原浆制备研究

为优化猕猴桃超高压灭菌条件下原浆制作工艺,对3种不同原浆制作工艺分别进行单因素优化试验,筛选出两种产品色泽和稳定性较好的工艺,并对这两种工艺所制作样品进行4℃储藏40 d的品质对比。结果表明,在最大程度保留猕猴桃原浆绿色,提高其稳定性的条件下,3种工艺的优选次序为:对辊式挤压制浆>胶体磨制浆>高压微射流制浆;与胶体磨工艺相比,对辊式挤压工艺制作的产品在4℃条件下储藏30 d内无明显的自然分层,产品VC损失较少;优化后的制浆工艺为:采用对辊式挤压工艺,挤压次数为1次。按照该工艺制作的猕猴桃原浆色泽相对均一,以青绿色为主,VC含量为40~50 mg/100 g。

猕猴桃根腐病根际土壤酶活性及真菌群落组成研究

分析猕猴桃根腐病感病植株和未感病植株根际土壤真菌群落差异,可为研究猕猴桃根腐病发生机制及其调控技术提供依据。在浙江省天台县街头镇的“红阳”猕猴桃种植基地,以树龄9年的猕猴桃根腐病感病植株和未感病植株根际土壤真菌为研究对象,对菌群ITS序列进行高通量测序注释后,对比分析了真菌群落结构与多样性指数的差异,并测定分析了根际土壤脲酶、蔗糖酶和酸性磷酸酶的活性。结果表明,猕猴桃根腐病的发生极显著地降低了根际土壤脲酶、蔗糖酶和磷酸酶的活性(p<0.01)。感病植株根际土壤真菌群落丰富度指数(Chao1)显著低于未感病植株根际土壤(p<0.05)。在门分类水平上,感病植株根际土壤真菌中相对丰度降低的有担子菌门、未分类真菌和接合菌门,其差异均为极显著(p<0.01);相对丰度升高的为子囊菌门,其差异达极显著水平(p<0.01)。在属分类水平上,感病植株根际土壤真菌相对丰度增加的有赤霉菌属、丛赤壳属、镰刀菌属、假裸囊菌属和肉座菌属,其差异均达极显著水平(p<0.01);相对丰度降低的有未分类伞菌纲、枝鼻菌属、粗糙孔菌属、线虫草属、支顶孢属、粪盘菌属、木霉属和被孢霉属,其差异均达极显著水平(p<0.01)。猕猴桃感染根腐病后,根际土壤真菌在门和属水平上的菌群变化打破了原有的微生物拮抗平衡关系。

不同叶面肥及株型控制对中科猕砧2号猕猴桃组培苗生长发育的影响

以中科猕砧2号猕猴桃2月龄组培苗为研究对象,研究不同配比的叶面施肥结合株型控制对植株干径生长、叶绿素含量、氮磷钾含量以及幼苗生理指标的影响。结果表明,中科猕砧2号组培穴盘苗的干径、叶绿素含量及植株全氮、全钾含量,根冠比在不同处理间均存在显著差异,植株全磷含量在各处理间差异不显著。4个控制因子中,株型控制对中科猕砧2号组培穴盘苗生长的促进作用最大,全抹芽的株型控制+施复合叶面肥(0.2%尿素+0.1%磷酸二氢钾+0.2%园艺肥)为中科猕砧2号组培穴盘苗育苗期间的最优处理配方。

猕猴桃酵素发酵工艺优化及体外抗氧化活性测定

为进一步延伸猕猴桃加工链,该研究以猕猴桃为原料,通过单因素试验、Plackett-Burman试验和响应面试验优化猕猴桃酵素发酵工艺,并分析猕猴桃酵素对2,2'-联氮-双-3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸(ABTS^(+))、1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(DPPH)、羟基自由基清除效果及Fe^(3+)的相对还原能力。结果表明,猕猴桃酵素最佳发酵工艺为料液比38∶100(g∶mL)、菌种(酿酒酵母∶植物乳杆菌∶保加利亚乳杆菌=3∶1∶1)接种量0.24%、白砂糖添加量12%,发酵时间144 h,发酵温度26.4℃。在最佳工艺条件下制备的猕猴桃酵素超氧化物歧化酶(SOD)酶活力可达1893.30 U/mL。抗氧化试验结果表明,猕猴桃酵素对DPPH·、ABTS^(+)·、·OH清除率及Fe^(3+)相对还原能力分别为37.2%、80.13%、79.01%及24.65%;分别比优化前提高了7.98%、2.50%、2.41%及3.58%。综上,经过发酵工艺优化后猕猴桃酵素SOD酶活增加,抗氧化活性有所提升。

基于TRIZ的猕猴桃采摘机设计

针对猕猴桃采摘效率低、易损伤果实等问题,应用TRIZ理论指导猕猴桃采摘机的设计。通过需求分析,确定猕猴桃采摘机的作业流程。基于系统功能分析识别旋拧式猕猴桃采摘末端执行器的功能缺陷,应用因果分析、物场分析等TRIZ工具对采摘末端执行器求解创新方案,创新设计出一种自动定位果树—识别果实—剪断果梗—收集果实的猕猴桃采摘机。应用ADAMS对末端执行器采摘动作进行步态仿真、应用MATLAB对采摘机作业空间和采摘轨迹进行动态仿真,结果表明:猕猴桃采摘机采摘轨迹空间范围为X方向行程约1.4 m、Y方向行程约1.8 m和Z方向行程约2.3 m;采摘速度为8 s/个,末端执行器采摘过程作业动作平稳连贯,满足预期设计要求。在产品概念设计阶段应用TRIZ理论,有利于产生高质量、多层级的概念解,提高产品设计效率。

陕西省周至县猕猴桃产业循环经济发展模式

以陕西省周至县猕猴桃产业作为研究对象,分析了周至县猕猴桃产业发展现状及面临挑战,从生产加工、运输与销售、废弃物循环处置及生态产业园区构建等方面为周至县猕猴桃产业循环经济发展模式提供思路,希望能够进一步助力周至县猕猴桃产业大循环发展。

基于层次分析法的陕西眉县、周至县猕猴桃产业发展研究

为进一步提高猕猴桃产业发展水平,以陕西省眉县及周至县为研究对象,采用层次分析法,对地区猕猴桃产业发展及影响因素进行了实证研究。结果表明,眉县及周至县猕猴桃产业发展处于中等偏下水平,综合得分为5.25分;在主要影响地区猕猴桃产业发展的4个因素中,营销因素影响权重的占比最大为0.49,但问卷得分却相对较低,营销渠道单一、推广方式老旧、营销策略缺乏创新是产业在营销过程中面临的主要问题;政策因素虽然在产业发展中影响权重排行第二,但二级指标的平均得分只有5.26,政策实施效果相对不明显,还有较大提升空间;在市场及资源因素中,眉县及周至县猕猴桃也存在对消费者偏好把握不够精准、技术利用率低等问题,阻碍了产业的进一步发展。提高眉县及周至县猕猴桃产业发展水平,应从拓展营销渠道,加强品牌建设,结合地区生产实践,提升相关政策实施水平,优化产业布局,积极引进新优品种等方面进行提升优化。