分歧多于保守:人、小鼠、大鼠和猪中klf家族进化分析

为研究人、猪、大鼠、小鼠中klf家族的进化特征,笔者用Clustal X和MEGA,在线软件GSGD,K es-timator和PAML,在线软件MEME\MAST和InterProScan,PSORT II分别构建进化亲缘关系树、分析基因结构、鉴定选择压力、注释蛋白质模体和确定核定位信号。结果显示:进化亲缘树及基因结构分析都将KLF家族分为α,β,γ,δ和ε5个亚类,亚类内各基因结构相似,家族各成员基因随机分布于不同染色体,klf1和klf2紧密簇集,猪klf17定位于6号染色体而非15号染色体,猪的两对旁系同源基因:klf9和klf9a,klf10和klf10a,及相似家族成员klf1和klf2,分别起源于近期和远期的基因串联复制事件;适应性进化选择压力分析表明,klf13和klf17经历了正选择,其他基因都受到严格的负选择作用;KLF蛋白羧基端都有3个高度保守的串联锌指结构,核定位信号(NLS)位于3串联锌指内或其紧邻上游,氨基端模体则相对多样化,KLF3,KLF4,KLF8和KLF12以其共有的PVDLS/T模体(单字母氨基酸缩写)结合转录辅因子CtBP(C-terminus-binding protein)进而调控靶基因转录,KLF9,KLF10,KLF11,KLF13,KLF14和KLF16共享转录辅因子Sin3结合结构域SID(Sin3-interacting domain),KLF7中发现的亮氨酸拉链模体表明其以二聚体的形式参与转录调控。klf家族基因结构和氨基端模体的多样化、羧基端保守锌指结构及进化中经历的负选择压力表明家族进化中经历了转录调控方式和调控功能的多样化,同时保留了结合富含GC启动子的基本模式。

转录因子KLF家族的结构、功能及调控机制研究进展

转录因子KLF家族(Krüppel-like factors)成员的C-末端区域中均存在3个保守的Cys2/His2锌指结构,它们能够参与调控真核生物的多种生理过程并发挥重要作用,包括促进脂肪组织和肌肉形成、影响神经系统发育、参与肿瘤发生过程、调控细胞和组织及系统水平的代谢和修复损伤的代谢组织等,是当前生物领域的研究热点。因此,综述了KLF家族成员的共同结构特征,以及KLF3、KLF5、KLF6、KLF7、KLF8、KLF14、KLF15的主要生理功能及其调控机制的研究进展,为未来进一步探讨KLF家族转录因子的作用和相关疾病的分子机制提供参考。

锌指蛋白转录因子KLFs家族与心血管疾病

心血管疾病（cardiovasculardisease）是一系列与心脏血管相关的循环系统疾病。循环系统是指人体内运送血液的器官和组织，主要包括心脏和血管（动脉、静脉、微血管）。心血管疾病以血管病变为主要病理特征，其主要诱因包括炎症反应、内皮细胞损伤、脂代谢异常、血栓和动脉粥样硬化等。在诸多心血管疾病中，危害性最大患病人数最多的有心肌肥大、动脉粥样硬化、糖尿病、冠心病及肥胖等。

KLF家族在胰岛素抵抗中的研究进展

胰岛素抵抗是以胰岛素生物学效应下降为特点的全身代谢性疾病,发病机制复杂,目前主要认为与脂质超载和炎症有关。Krüppel样转录因子(Krüppel-like factors,KLFs)是Cys2/His2锌指结构DNA结合蛋白的一个亚家族,参与调节心血管、内分泌、造血、免疫等系统的等多个生理过程。本文重点介绍了近年来KLF家族在肥胖、炎症和糖尿病发生发展过程中的最新研究进展,为深入了解KLF家族在胰岛素抵抗发病机制中的作用以及寻找药物治疗靶点提供参考。

转录因子KLFs家族与口腔鳞状细胞癌关系的研究进展

本文综述了近年来国内外学者对转录因子KLFs家族与人类口腔鳞状细胞癌(OSCC)关系的研究,探讨KLFs家族中各KLFs的结构和功能及其与OSCC的关系,为寻找OSCC早期发现与诊断的新指标和OCSS的靶向治疗提供依据。

转录因子KLF 5在肿瘤中的研究进展

Krüppel样因子5(KLF 5)属于含锌指的转录因子家族,参与调控多种基因的表达,从而影响细胞的多种功能。如干细胞自我更新、细胞增殖、分化和凋亡。KLF 5作为一种重要的转录因子和潜在的药物靶点受到了越来越多的关注。在这篇综述中,我们阐述了KLF 5和KLF家族的特点及其在相关肿瘤中的研究进展。

microRNA调控猪肌内脂肪沉积的研究进展

肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量是评判猪肉品质的关键指标,其可影响猪肉的嫩度、剪切力、多汁性和风味等。微小RNA(microRNA,miRNA)是一类长度约为22 nt的短链非编码RNA,在胚胎发育、成脂分化、肌纤维形成、神经调节、免疫应答等多种生理过程中发挥重要作用。越来越多的研究表明,miRNA在猪肌内脂肪沉积过程中发挥重要调控作用,是脂质代谢的重要调控因子。作者通过归纳国内外关于miRNA调控猪肌内脂肪沉积的相关研究发现,miR-34a、miR-125a-5p、miR-32-5p等通过靶向作用转录因子Krüppel样因子(Krüppel-like factors,KLF)家族成员调控猪肌内脂肪沉积,miR-130a通过靶向作用过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor,PPAR)家族成员调控猪肌内脂肪沉积,miR-34a、miR-17-5p和miR-125a-5p等通过靶向作用其他家族成员,如长链酯酰辅酶A合成酶4(acyl-CoA synthetase long chain family member 4,ACSL4)、核受体共激活因子3(nuclear receptor coactivator 3,NCOA3)等来调控猪肌内脂肪沉积。然而miRNA调控猪肌内脂肪的具体作用机制尚不完全清楚,还需要进一步探究。作者通过梳理目前已经证实的与猪肌内脂肪沉积相关的miRNA,整理相关miRNA的靶基因以及主要作用通路,以期为筛选肌内脂肪相关miRNA提供参考,为改善肉质提供新的思路和策略,为阐明miRNA在猪脂质代谢中的作用机制提供参考。

黒腹果蝇CG42741基因编码蛋白质结构分析及功能预测

为深入了解黑腹果蝇CG42741基因的表达及其编码蛋白质的结构,利用半定量和生物信息学的方法对其进行了详细的研究。RT-PCR结果显示黒腹果蝇CG42741基因在胚胎期、幼虫期和蛹期均有表达,但表达量比较低,只是在蛹期表达量相对升高。此外,通过生物信息学的方法对果蝇中CG42741基因所编码的蛋白质进行了结构与功能的预测。结果显示,CG42741蛋白定位于细胞核内,其羧基末端含有3个串联的C2H2类型的锌指结构;它属于KLF家族蛋白,是一个转录调控因子,能够与富含GC的基因组序列特异结合,其功能可能与细胞的生长、增殖有关。