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Generation of double knockout cattle via CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein(RNP)electroporation
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作者 Gyeong-Min Gim Kyeong-Hyeon Eom +10 位作者 Dong-Hyeok Kwon Dae-Jin Jung Dae-Hyun Kim Jun-Koo Yi Jae-Jung Ha Ji-Hyun Lee Seong-Beom Lee Woo-Jae Son Soo-Young Yum Won-Wu Lee Goo Jang 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2024年第1期456-462,共7页
Background Genome editing has been considered as powerful tool in agricultural fields.However,genome editing progress in cattle has not been fast as in other mammal species,for some disadvantages including long gestat... Background Genome editing has been considered as powerful tool in agricultural fields.However,genome editing progress in cattle has not been fast as in other mammal species,for some disadvantages including long gestational periods,single pregnancy,and high raising cost.Furthermore,technically demanding methods such as microinjection and somatic cell nuclear transfer(SCNT)are needed for gene editing in cattle.In this point of view,electroporation in embryos has been risen as an alternative.Results First,editing efficiency of our electroporation methods were tested for embryos.Presence of mutation on embryo was confirmed by T7E1 assay.With first combination,mutation rates for MSTN and PRNP were 57.6%±13.7%and 54.6%±13.5%,respectively.In case of MSTN/BLG,mutation rates were 83.9%±23.6%for MSTN,84.5%±18.0%for BLG.Afterwards,the double-KO embryos were transferred to surrogates and mutation rate was identified in resultant calves by targeted deep sequencing.Thirteen recipients were transferred for MSTN/PRNP,4 calves were delivered,and one calf underwent an induction for double KO.Ten surrogates were given double-KO embryos for MSTN/BLG,and four of the six calves that were born had mutations in both genes.Conclusions These data demonstrated that production of genome edited cattle via electroporation of RNP could be effectively applied.Finally,MSTN and PRNP from beef cattle and MSTN and BLG from dairy cattle have been born and they will be valuable resources for future precision breeding. 展开更多
关键词 BETA-LACTOGLOBULIN CATTLE CRISPR-Cas9 ELECTROPORATION knockout MSTN PRNP
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Motor neuron-specific RhoA knockout delays degeneration and promotes regeneration of dendrites in spinal ventral horn after brachial plexus injury 被引量:1
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作者 Mi Li Jiawei Xu +10 位作者 Ying Zou Jialing Lu Aiyue Ou Xinrui Ma Jiaqi Zhang Yizhou Xu Lanya Fu Jingmin Liu Xianghai Wang Libing Zhou Jiasong Guo 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2023年第12期2757-2761,共5页
Dendrites play irreplaceable roles in the nerve conduction pathway and are vulnerable to various insults.Peripheral axotomy of motor neurons results in the retraction of dendritic arbors,and the dendritic arbor can be... Dendrites play irreplaceable roles in the nerve conduction pathway and are vulnerable to various insults.Peripheral axotomy of motor neurons results in the retraction of dendritic arbors,and the dendritic arbor can be re-expanded when reinnervation is allowed.RhoA is a target that regulates the cytoskeleton and promotes neuronal survival and axon regeneration.However,the role of RhoA in dendrite degeneration and regeneration is unknown.In this study,we explored the potential role of RhoA in dendrites.A line of motor neuronal conditional knockout mice was developed by crossbreeding HB9~(Cre+)mice with RhoA~(flox/flox)mice.We established two models for assaying dendrite degeneration and regeneration,in which the brachial plexus was transection or crush injured,respectively.We found that at 28 days after brachial plexus transection,the density,complexity,and structural integrity of dendrites in the ventral horn of the spinal cord of RhoA conditional knockout mice were slightly decreased compared with that in Cre mice.Dendrites underwent degeneration at 7 and 14 days after brachial plexus transection and recovered at 28–56 days.The density,complexity,and structural integrity of dendrites in the ventral horn of the spinal cord of RhoA conditional knockout mice recovered compared with results in Cre mice.These findings suggest that RhoA knockout in motor neurons attenuates dendrite degeneration and promotes dendrite regeneration after peripheral nerve injury. 展开更多
关键词 brachial plexus conditional knockout DEGENERATION DENDRITES motor neuron peripheral nerve injury REGENERATION RHOA spinal cord ventral horn
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Truncating PICK1 Variant Identified in Azoospermia Affected Mitochondrial Dysfunction in Knockout Mice
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作者 Yao-qiang DU Chong-yi SHU +11 位作者 Min ZHENG Wei-de XU Yue SUN Lu SHEN Chen ZHANG Yu-xin ZHANG Qian-ni WANG Kai-qiang LI Bing-yu CHEN Ke HAO Jian-xin LYU Zhen WANG 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2023年第2期313-323,共11页
Objective The protein interacting with C kinase 1(PICK1)plays a critical role in vesicle trafficking,and its deficiency in sperm cells results in abnormal vesicle trafficking from Golgi to acrosome,which eventually di... Objective The protein interacting with C kinase 1(PICK1)plays a critical role in vesicle trafficking,and its deficiency in sperm cells results in abnormal vesicle trafficking from Golgi to acrosome,which eventually disrupts acrosome formation and leads to male infertility.Methods An azoospermia sample was filtered,and the laboratory detection and clinical phenotype indicated typical azoospermia in the patient.We sequenced all of the exons in the PICK1 gene and found that there was a novel homozygous variant in the PICK1 gene,c.364delA(p.Lys122SerfsX8),and this protein structure truncating variant seriously affected the biological function.Then we constructed a PICK1 knockout mouse model using clustered regularly interspaced short palindromic repeat cutting technology(CRISPRc).Results The sperm from PICK1 knockout mice showed acrosome and nucleus abnormalities,as well as dysfunctional mitochondrial sheath formation.Both the total sperm and motility sperm counts were decreased in the PICK1 knockout mice compared to wild-type mice.Moreover,the mitochondrial dysfunction was verified in the mice.These defects in the male PICK1 knockout mice may have eventually led to complete infertility.Conclusion The c.364delA novel variant in the PICK1 gene associated with clinical infertility,and pathogenic variants in the PICK1 may cause azoospermia or asthenospermia by impairing mitochondrial function in both mice and humans. 展开更多
关键词 PICK1 AZOOSPERMIA truncating variant knockout mice mitochondrial dysfunction
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Lycium ruthenicum Murr. treatment attenuates APP_(SWE)/PS1ΔE9 mouse model-like mitochondrial dysfunction in Slc25a46 knockout mouse model
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作者 Min Wang Tianxiong Xu +7 位作者 Li Gao Chujun Huang Piao Xu Congcong Gong William Kwame Amakye Linfeng Liao Maojin Yao Jiaoyan Ren 《Food Science and Human Wellness》 SCIE CSCD 2023年第5期1618-1625,共8页
Mitochondrial dysfunction is proposed to be substantially associated with ageing and ageing-related diseases like Alzheimer's disease(AD). However, it is unclear whether different mouse models with mitochondrialre... Mitochondrial dysfunction is proposed to be substantially associated with ageing and ageing-related diseases like Alzheimer's disease(AD). However, it is unclear whether different mouse models with mitochondrialrelated diseases have similar changes in mitochondrial morphology of the same tissues. Moreover, whether similarities in mitochondrial morphology can be a suitable marker for screening and/or discovering mitochondrial-protective substances remains unknown. Mitochondria morphology in different tissues of a novel mitochondrial outer membrane protein Slc25a46 knockout mouse and a traditional APP_(SWE)/PS1ΔE9 transgenic mouse were examined using transmission electron microscope(TEM). Both young Slc25a46 knockout mice and aged APP_(SWE)/PS1ΔE9 mice models showed similar mitochondrial damage in cerebellum tissues. The results indicated that different mitochondrial-related diseases shared similar alteration and defects in mitochondrial morphology. Furthermore, Lycium ruthenicum Murr. extract, a bioactive food substance with cognition-improving property, could effectively improve muscle strength and increase body weight in the Slc25a46 knockout mice. These findings suggest that mitochondrial morphology defects in mice models, particularly in the mitochondrial compartment, represent a unified and effective marker for screening and validating natural product-derived functional substances with mitochondrial protective properties. It also holds potential application in mitochondrial-impaired senile neurodegenerative diseases, especially in AD. 展开更多
关键词 Mitochondria dysfunction Ageing Slc25a46 knockout mouse Alzheimer’s disease Lycium ruthenicum Murr.
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CaMKK2调控肝细胞癌化疗耐药性的作用和机制
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作者 惠博 张健 +2 位作者 李韧 李江伟 杨正安 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第6期671-679,共9页
目的 探讨钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶激酶2(calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2,CaMKK2)调控肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)化疗耐药性的作用及其机制。方法 (1)为了检测CaMKK2在HCC耐药细胞株中的表达变... 目的 探讨钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶激酶2(calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2,CaMKK2)调控肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)化疗耐药性的作用及其机制。方法 (1)为了检测CaMKK2在HCC耐药细胞株中的表达变化,将实验分为亲本组和耐药组。采用浓度梯度递增法建立奥沙利铂(oxaliplatin, OXA)耐药细胞株MHCC97H/OXA和Hep3B/OXA。采用Western blot检测CaMKK2的磷酸化和总蛋白表达水平。(2)为了检测CaMKK2对肝细胞癌化疗药性的调控作用,将实验分为对照组和CaMKK2敲除组。采用CRISPR/Cas9技术敲除MHCC97H/OXA和Hep3B/OXA细胞株中的CaMKK2基因表达,采用Western blot验证CaMKK2敲除效率。采用细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)实验检测CaMKK2敲除对MHCC97H/OXA和Hep3B/OXA细胞株细胞存活率的影响。采用流式细胞术检测CaMKK2敲除对MHCC97H/OXA和Hep3B/OXA细胞株凋亡的影响。采用Western blot检测CaMKK2敲除对微管相关蛋白1轻链3(microtubule-associated protein 1 light chain 3,LC3)、p62、腺苷酸活化蛋白激酶(adenosine 5′-monophosphate-activated protein kinase, AMPK)和UNC-51样激酶1(UNC51-like kinase 1,ULK1)蛋白表达水平的影响。(3)为了验证CaMKK2对肝细胞癌化疗药性的调控作用,将实验分为CaMKK2敲除+空载体组和CaMKK2敲除+CaMKK2载体组。采用Western blot检测CaMKK2的蛋白表达水平。采用CCK-8实验检测重新表达CaMKK2对CaMKK2敲除的细胞耐药性的影响。采用Western blot检测重新表达CaMKK2对CaMKK2敲除的细胞中AMPK、ULK1和LC3蛋白表达水平的影响。结果 (1)与亲本组相比,耐药组HCC细胞株中CaMKK2的总蛋白表达水平无显著变化(P>0.05),而CaMKK2的磷酸化水平显著升高(P<0.01)。(2)与对照组比较,CaMKK2敲除组细胞中CaMKK2表达水平显著减少(P<0.01)。与对照组比较,CaMKK2敲除组HCC耐药细胞对OXA的敏感性显著提高(P<0.05),OXA细胞凋亡率显著升高(P<0.01)。与对照组比较,CaMKK2敲除组LC3Ⅱ/LC3Ⅰ显著降低,p62蛋白水平显著升高,p-AMPK/AMPK以及p-ULK1/ULK1显著降低(均P<0.01)。(3)与CaMKK2敲除+空载体组比较,CaMKK2敲除+CaMKK2载体组HCC耐药细胞对OXA的敏感性显著降低(P<0.01),LC3Ⅱ/LC3Ⅰ、p-AMPK/AMPK和p-ULK1/ULK1显著升高(P<0.01)。结论 基因敲除CaMKK2有效逆转HCC化疗耐药性,其作用机制与调控AMPK/ULK1介导的自噬通路相关。 展开更多
关键词 肝细胞癌 化疗耐药性 细胞自噬 CaMKK2 奥沙利铂 基因敲除
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利用CRISPR/Cas9构建敲除小鼠模型研究PPP2R3A基因对心脏功能的影响
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作者 李洁 崔晓花 +2 位作者 梁媛 李小凤 宋贵波 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2024年第7期1657-1661,共5页
目的 应用CRISPR/Cas9技术构建蛋白磷酸2调节亚基B″家族α亚型(PPP2R3A)基因敲除小鼠,从分子水平及组织水平上研究PPP2R3A缺失对心脏的影响。方法 将Cas9 mRNA和两个靶向PPP2R3A第3外显子翻译起始密码子附近区域的单导向RNA微注射到C57... 目的 应用CRISPR/Cas9技术构建蛋白磷酸2调节亚基B″家族α亚型(PPP2R3A)基因敲除小鼠,从分子水平及组织水平上研究PPP2R3A缺失对心脏的影响。方法 将Cas9 mRNA和两个靶向PPP2R3A第3外显子翻译起始密码子附近区域的单导向RNA微注射到C57BL/6小鼠受精卵中。小鼠出生后取其基因组DNA进行聚合酶链反应(PCR)和测序以鉴定基因型,鉴定后,基因PPP2R3A缺失型小鼠为KO组,野生型C57BL/6小鼠为WT组(雄性3只,雌性2只)。小鼠心脏组织经甲醛固定并制成切片后分别进行苏木素-伊红(HE)染色和免疫组织化学染色。提取小鼠心脏组织总RNA和蛋白,应用荧光定量PCR和Western印迹验证基因敲除小鼠的有效性和检测互作蛋白表达。结果 获得F1代PPP2R3A杂合小鼠,PCR和测序结果表明突变小鼠的基因型存在113 bp的缺失突变。与WT组相比,KO组心脏组织中PPP2R3A mRNA和蛋白表达量明显下降(均P<0.05),参与心脏发育的G蛋白信号转导调控因子(RGS)19表达量明显升高(P<0.05)。PPP2R3A蛋白表达受损引起了心脏组织病理学变化。结论 PPP2R3A在体内可能通过与RGS19蛋白互作来参与心脏的发育并对心脏功能产生影响。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 蛋白磷酸2调节亚基B″家族α亚型(PPP2R3A) G蛋白信号转导调控因子(RGS)19 基因敲除小鼠
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香蕉枯萎病菌内源报告基因Foc4carS的鉴定及其应用
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作者 彭军 曾凡云 +5 位作者 王艳玮 漆艳香 丁兆建 王少伶 谢艺贤 张欣 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期873-885,共13页
香蕉枯萎病是由尖孢镰刀菌古巴转化型(Fusarium oxysporum f. sp. cubense, Foc)引起的香蕉毁灭性土传病害,其中4号生理小种(Foc4)能感染几乎所有的香蕉品系,危害最严重。carS基因通过调控下游car结构基因参与调控镰刀菌类胡萝卜素的生... 香蕉枯萎病是由尖孢镰刀菌古巴转化型(Fusarium oxysporum f. sp. cubense, Foc)引起的香蕉毁灭性土传病害,其中4号生理小种(Foc4)能感染几乎所有的香蕉品系,危害最严重。carS基因通过调控下游car结构基因参与调控镰刀菌类胡萝卜素的生物合成,本研究克隆鉴定了Foc4carS基因(FOIG_05085),Foc4carS蛋白具有典型的RING-finger蛋白结构域。利用分割标记法(Split-marker PCR)获得Foc4carS基因的融合片段,同时构建含有Foc4carS基因sgRNA591序列的pUC-fFuCas9-HTBNLS-hph-Foc4carS基因编辑载体,通过PEG介导的原生质体转化获得该基因的敲除突变体、回补突变体以及基因编辑敲除体,并对敲除和回补突变体的生物学特性和致病力进行分析。结果显示:ΔFoc4carS突变体的菌落直径、产孢量和致病力等生物学表型与野生菌株Foc4无显著差异,而ΔFoc4carS突变体菌落颜色呈深橙色,Foc4carS基因的缺失影响了次生代谢产物类胡萝卜素的生物合成;基因编辑的ΔFoc4carS(HDR)突变体不论是再生筛选板还是继代后的PDA平板,其菌落均出现典型的深橙色,表明Foc4carS可作为内源报告基因,在香蕉枯萎菌Foc4中进行基因质粒型CRISPR/Cas9编辑可行。 展开更多
关键词 香蕉枯萎菌Foc4 Foc4carS基因 类胡萝卜素 基因敲除 CRISPR/Cas9基因编辑
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Ghrelin基因敲除对小鼠黑质区多巴胺能神经元突触后电位的影响
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作者 刘静 李焕焕 +3 位作者 焦倩 陈曦 姜宏 杜希恂 《精准医学杂志》 2024年第3期199-202,208,共5页
目的探讨胃饥饿素(ghrelin)基因敲除对小鼠黑质多巴胺能神经元突触后电位的影响。方法分别选取10周龄雄性ghrelin基因敲除小鼠(ghrelin^(-/-)组)及其同窝雄性野生型(WT)小鼠(WT组)的黑质组织,采用转录组学测序(RNA-seq)技术筛选差异表... 目的探讨胃饥饿素(ghrelin)基因敲除对小鼠黑质多巴胺能神经元突触后电位的影响。方法分别选取10周龄雄性ghrelin基因敲除小鼠(ghrelin^(-/-)组)及其同窝雄性野生型(WT)小鼠(WT组)的黑质组织,采用转录组学测序(RNA-seq)技术筛选差异表达基因(DEGs),通过KEGG通路富集分析DEGs可能参与的神经元突触活动相关信号通路,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法对筛选出的DEGs进行验证,并应用蛋白免疫印迹(Western blotting)方法检测神经元突触活动相关基因的蛋白表达情况。结果与WT组相比,ghrelin^(-/-)组小鼠多巴胺能神经元突触传递信号通路上的23个基因水平发生了显著性变化,其中谷氨酸促离子型受体α-氨基-3-羟基-5-甲基-4-异唑丙酸型亚基3(GluA3)和糖原合酶激酶-3β(GSK-3β)分别调控神经元突触后膜上的α-氨基-3-羟基-5-甲基-4-异唑丙酸受体和N-甲基-D-天冬氨酸受体;在ghrelin^(-/-)组小鼠黑质组织中,GluA 3和GSK-3β基因表达出现明显的下调。RT-qPCR方法检测结果显示,与WT组相比,ghrelin^(-/-)组小鼠黑质组织当中GluA 3和GSK-3βmRNA水平明显下调(t=2.408、2.740,P<0.05)。Western blotting方法检测结果显示,与WT组相比,ghrelin^(-/-)组小鼠黑质组织中GluA3蛋白的表达水平明显上调(t=2.530,P<0.05),GSK-3β蛋白的表达明显下调(t=3.469,P<0.05)。结论Ghrelin基因敲除可能通过使小鼠黑质多巴胺能神经元突触后电位长时程增强,从而增强兴奋性突触传递活动,参与运动调控。 展开更多
关键词 胃促生长素 基因敲除技术 黑质 多巴胺能神经元 长时程增强 受体 离子型谷氨酸
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发根农杆菌介导的甜瓜CRISPR/Cas9系统靶位点的检测
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作者 朱蕾 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第8期15-23,共9页
选取甜瓜栽培材料龙庆八号作为受体材料,构建CmCURT1A基因CRISPR/Cas9基因编辑载体,经发根农杆菌介导检测靶位点的编辑情况,为后续甜瓜遗传转化试验提供载体基础。以甜瓜CmCURT1A基因(ID:MELO3C006053.2)为靶基因构建双靶位点敲除载体,... 选取甜瓜栽培材料龙庆八号作为受体材料,构建CmCURT1A基因CRISPR/Cas9基因编辑载体,经发根农杆菌介导检测靶位点的编辑情况,为后续甜瓜遗传转化试验提供载体基础。以甜瓜CmCURT1A基因(ID:MELO3C006053.2)为靶基因构建双靶位点敲除载体,经发根农杆菌K599介导的简单遗传转化技术使甜瓜组织长出不定根,经PCR测序发现在不定根中分别存在65 bp、72 bp不同碱基片段的缺失。该方法成功进行了甜瓜CRISPR/Cas9载体靶位点敲除情况的检测,简单高效,实现了在甜瓜中基因编辑靶点的快速鉴定,为研究甜瓜基因功能和遗传改良奠定基础。 展开更多
关键词 甜瓜 CRISPR/Cas9 发根农杆菌 基因敲除
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利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼prkd1基因敲除品系 被引量:1
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作者 吕丹 陈宇 +4 位作者 谭志霞 李永青 吴秀山 江志钢 叶湘漓 《生命科学研究》 CAS 2024年第1期18-25,共8页
蛋白激酶D1 (protein kinase D1, PKD1;也称作PRKD1)是蛋白激酶家族成员之一,该家族由3种结构相关的应激激活酶组成,可调节机体多种生物学功能,主要涉及细胞增殖、分化、凋亡、免疫调节、心脏收缩、血管生成和癌症等,其中PRKD1与心脏肥... 蛋白激酶D1 (protein kinase D1, PKD1;也称作PRKD1)是蛋白激酶家族成员之一,该家族由3种结构相关的应激激活酶组成,可调节机体多种生物学功能,主要涉及细胞增殖、分化、凋亡、免疫调节、心脏收缩、血管生成和癌症等,其中PRKD1与心脏肥大、收缩和缺血再灌注损伤的底物磷酸化有关。相关研究报道,先天性心脏病患者存在PRKD1基因突变,但其在心脏中的特异性功能和分子机制并未阐明。为了便于后期研究PRKD1基因在人类早期心脏发育的作用机制,本文拟利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼prkd1基因敲除品系。首先,通过生物信息学网站筛选出两个最佳的基因敲除靶位点,合成相应靶位点的单链向导RNA (single guide RNA,sg RNA)和引物;然后,将两个靶位点的sg RNA进行体外转录,并将其与Cas9蛋白混合后共同注射到斑马鱼的1-细胞期;最后,对基因敲除后的F0、F1、F2及F3代斑马鱼的胚胎和成鱼进行有效性鉴定及表型观察。结果显示,靶位点附近出现了不同程度的碱基缺失;成功构建了F1代能够稳定遗传的prkd1基因敲除的3个亚系;与野生型相比, F3代纯合子胚胎表现出不同程度的心腔膨大、环化异常及心管线性化等畸形现象。综上可知,本研究利用CRISPR/Cas9技术成功构建了斑马鱼prkd1基因敲除品系,为进一步研究该基因在人类心脏发育中的特异性功能提供了有益参考,并为后期的先天性心脏病筛查和精准医疗提供了重要依据。 展开更多
关键词 prkd1基因 CRISPR/Cas9技术 基因敲除 先天性心脏病(CHD)
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H12、RS13和RL6在miR-199b-5p敲除小鼠卵巢中的表达研究 被引量:1
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作者 袁秀秀 王煜 《中国生育健康杂志》 2024年第1期48-53,共6页
目的探讨组蛋白H1变体(H12)、核糖体蛋白S13(RS13)和核糖体蛋白L6(RL6)在miR-199b-5p敲除小鼠卵巢中的表达变化。方法(1)自行繁育miR-199b-5p敲除(Knockout,KO)和野生型(Wild-type,WT)C57BL/6小鼠,分别记录两组雌鼠产仔情况(2)基因型鉴... 目的探讨组蛋白H1变体(H12)、核糖体蛋白S13(RS13)和核糖体蛋白L6(RL6)在miR-199b-5p敲除小鼠卵巢中的表达变化。方法(1)自行繁育miR-199b-5p敲除(Knockout,KO)和野生型(Wild-type,WT)C57BL/6小鼠,分别记录两组雌鼠产仔情况(2)基因型鉴定验证分组,取性成熟期小鼠(鼠周龄为11~13周)卵巢用于验证实验。(3)用实时荧光定量PCR(qPCR)检测每组小鼠(n=10)卵巢组织中H12、RS13和RL6的mRNA表达水平变化。(4)用蛋白免疫印迹法(WB)检测每组小鼠(n=3)卵巢组织中H12、RS13和RL6的蛋白表达水平变化。结果(1)共统计半年内两组雌鼠产仔情况:WT组生产27窝,平均每窝产仔数为(8.15±0.41)只;KO组生产28窝,平均每窝产仔数为6.43±0.32只,与WT组比较,KO组雌鼠产仔数显著下降(P=0.004),差异有统计学意义。(2)qPCR结果示:与WT组比较,KO组卵巢组织中H12(P=0.038)、RS13(P=0.011)和RL6(P=0.009)的mRNA表达水平显著升高,差异均有统计学意义。(3)WB结果示:与WT组比较,KO组小鼠卵巢组织中H12(P=0.014)蛋白表达水平显著升高,而RS13(P=0.005)和RL6(P=0.009)蛋白表达水平显著下降,差异均有统计学意义。结论敲除miR-199b-5p可能影响H12、RL6和RS13基因的表达使小鼠卵巢储备能力下降。 展开更多
关键词 miR-199b-5p 基因敲除 卵巢 小鼠
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cphA基因特异性介导维氏气单胞菌碳青霉烯耐药的初步研究
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作者 李安一 李宏 +4 位作者 刘柱 李娟娟 唐燕琼 迟雪 马香 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期100-109,共10页
目的探究cphA基因对维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)β-内酰胺耐药性的影响,解析基因功能。方法以维氏气单胞菌C4为研究对象,采用同源重组方法构建cphA基因敲除株;利用比浊法测定生长曲线,微量二倍稀释法检测不同β-内酰胺类抗生素对... 目的探究cphA基因对维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)β-内酰胺耐药性的影响,解析基因功能。方法以维氏气单胞菌C4为研究对象,采用同源重组方法构建cphA基因敲除株;利用比浊法测定生长曲线,微量二倍稀释法检测不同β-内酰胺类抗生素对菌株的最小抑菌浓度,实时荧光定量PCR法测定cphA基因对抗生素的响应表达;并通过分子对接解析CphA酶与抗生素互作的重要活性位点。结果成功构建cphA基因敲除株,发现cphA基因缺失不影响维氏气单胞菌生长。虽然cphA基因在碳青霉烯类和青霉素类抗生素处理下均响应性表达增加,但cphA基因缺失仅特异性导致菌株对碳青霉烯类药物由耐受变为敏感,而对其他β-内酰胺类的药物敏感性表型并无影响。此外,分子对接结果表明,CphA酶的Thr135、His174、Asn201氨基酸残基是与亚胺培南分子形成氢键作用的位点。结论维氏气单胞菌中的cphA基因特异性介导碳青霉烯耐药。本研究为进一步完善维氏气单胞菌的耐药研究和β-内酰胺酶的功能研究提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 维氏气单胞菌 cphA基因 基因敲除 耐药性
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金龟子绿僵菌fluG基因的敲除及对产孢的影响
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作者 王苗苗 王广君 +5 位作者 农向群 蔡霓 刘蓉 宋红岩 涂雄兵 张泽华 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期61-70,共10页
丝状真菌的fluG基因参与调控分生孢子的生成,然而在昆虫病原真菌金龟子绿僵菌中fluG的作用鲜有研究报道。本研究利用DNA同源重组方法,构建敲除fluG的金龟子绿僵菌突变株,分析突变株的产孢特性。以苯菌灵抗性基因ben作为筛选标记,fluG基... 丝状真菌的fluG基因参与调控分生孢子的生成,然而在昆虫病原真菌金龟子绿僵菌中fluG的作用鲜有研究报道。本研究利用DNA同源重组方法,构建敲除fluG的金龟子绿僵菌突变株,分析突变株的产孢特性。以苯菌灵抗性基因ben作为筛选标记,fluG基因侧翼序列作为同源臂,构建了打靶载体pDHt/sk-fluG-Ben。利用PEG介导将打靶载体转化金龟子绿僵菌的原生质体,获得了苯菌灵抗性转化子。根据靶基因和标记基因检验,确定获得了敲除fluG的金龟子绿僵菌突变株。表型分析显示,fluG突变株继代培养5代仍保持苯菌灵抗性,菌落呈疏松毛絮状,生长相较野生型明显缓慢,不能或者仅能产生极少量分生孢子。说明fluG基因的敲除影响了菌株生长发育,并阻止了分生孢子形成,是金龟子绿僵菌产孢调节的重要基因。本研究为阐述金龟子绿僵菌产孢调控机制提供依据。 展开更多
关键词 基因敲除 fluG基因 产孢调控 同源重组 昆虫病原真菌
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利用CRISPR/Cas9技术构建Quaking敲除的小鼠胚胎成纤维细胞株
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作者 高登科 马白荣 +5 位作者 郭怡莹 刘薇 刘田 靳亚平 江舟 陈华涛 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期65-72,共8页
【目的】利用CRISPR/Cas9技术构建小鼠胚胎成纤维细胞(NIH3T3)Quaking基因敲除细胞株,并检测Quaking基因对NIH3T3细胞增殖能力的影响。【方法】首先,利用在线网站设计两条靶向作用于Quaking外显子的sgRNA,成功构建了两个分别靶向Quakin... 【目的】利用CRISPR/Cas9技术构建小鼠胚胎成纤维细胞(NIH3T3)Quaking基因敲除细胞株,并检测Quaking基因对NIH3T3细胞增殖能力的影响。【方法】首先,利用在线网站设计两条靶向作用于Quaking外显子的sgRNA,成功构建了两个分别靶向Quaking基因第1、第2外显子的CRISPR/Cas9重组慢病毒质粒。将构建的Quaking基因CRISPR/Cas9重组慢病毒载体和pcDNA3.1-Quaking过表达质粒共转染至HEK293T细胞中,通过Western blot实验检测Quaking蛋白的敲除效率。其次,将筛选得到的敲除效率高的重组慢病毒质粒(LentiCRISPRv2-sgRNA1)与辅助包装质粒共转染入HEK293T细胞进行慢病毒包装,慢病毒转导NIH3T3细胞后,利用嘌呤霉素筛选阳性单克隆细胞株。最后,通过Western blot及免疫荧光染色鉴定敲除效果。【结果】发现Quaking蛋白在该细胞株中不表达,并测序证实了发生片段敲除。CCK8检测发现,Quaking基因敲除显著抑制了NIH3T3细胞的增殖能力。【结论】本研究首次通过CRISPR/Cas9技术成功构建了小鼠胚胎成纤维细胞(NIH3T3)Quaking基因敲除细胞株,为后续研究Quaking基因在小鼠生理功能调节中的作用机制提供了体外模型基础。 展开更多
关键词 Quaking CRISPR/Cas9 小鼠胚胎成纤维细胞 基因敲除
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通过CRISPR/Cas9建立豌豆基因组大片段敲除体系
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作者 黄淑贤 刘荣 +4 位作者 李冠 疏琴 徐斐 宗绪晓 杨涛 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1658-1668,共11页
豌豆是世界上主要食用豆类作物之一,因其丰富的营养价值和良好的生态价值而受到越来越多的重视。CRISPR/Cas9作为一种生物育种的新型技术手段,已广泛应用于各种作物的品种改良中,但在豌豆中的应用报道非常少见。本研究以“中豌6号”品... 豌豆是世界上主要食用豆类作物之一,因其丰富的营养价值和良好的生态价值而受到越来越多的重视。CRISPR/Cas9作为一种生物育种的新型技术手段,已广泛应用于各种作物的品种改良中,但在豌豆中的应用报道非常少见。本研究以“中豌6号”品种为试验材料,采用CRISPR/Cas9技术手段成功地实现了豌豆基因组中Psat01G0240600-T1、Psat03G0303300-T1和Psat03G0304700-T1基因的大片段缺失,其大片段敲除效率分别是24.1%、13.0%和3.6%。进一步对结果分析发现,不同靶点的编辑效率相差较大,并且大片段缺失的效率取决于2个靶点中较低编辑效率的靶点。本研究利用发状根体系探索了CRISPR/Cas9在豌豆中的应用,首次在豌豆中实现了大片段敲除,对于豌豆的研究具有重要意义。 展开更多
关键词 豌豆 CRISPR/Cas9 发状根 大片段敲除
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停滞棒杆菌遗传改造工具和启动子文库构建
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作者 叶光正 余心宇 +5 位作者 林钰宽 蔡友华 邢新会 陈武 薛正莲 张翀 《生物加工过程》 CAS 2024年第2期147-155,共9页
停滞棒杆菌是用于5′-肌苷酸生产的重要微生物底盘。为利用代谢工程技术来创建和优化高效细胞工厂,在停滞棒杆菌中构建遗传改造工具和启动子文库十分必要。本研究使用pCG1复制子构建了大肠杆菌-停滞棒杆菌穿梭载体,建立停滞棒杆菌外源DN... 停滞棒杆菌是用于5′-肌苷酸生产的重要微生物底盘。为利用代谢工程技术来创建和优化高效细胞工厂,在停滞棒杆菌中构建遗传改造工具和启动子文库十分必要。本研究使用pCG1复制子构建了大肠杆菌-停滞棒杆菌穿梭载体,建立停滞棒杆菌外源DNA转化方法、基于自杀质粒同源重组的基因敲除方法,最终形成了停滞棒杆菌异源基因稳定表达系统;停滞棒杆菌游离质粒的电转化效率达到(2.3±0.3)×10^(3)cfu/μg;构建停滞棒杆菌的合成启动子文库,筛选得到24个强度差异达30倍的启动子元件,用于停滞棒杆菌中的基因精细表达调控。 展开更多
关键词 停滞棒杆菌 转化效率 穿梭质粒 启动子 基因敲除
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CXCR2基因敲除HeLa细胞株构建及转录组测序分析
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作者 刁思雨 王家银 +3 位作者 高春海 王言言 訾臣 关向宏 《生殖医学杂志》 CAS 2024年第1期73-82,共10页
目的通过基因敲除和转录组测序探究CXCR2相关功能基因及信号通路,揭示其在宫颈癌中的分子作用。方法设计构建靶向CXCR2基因的CRISPR-Cas9敲除质粒载体,转染HeLa细胞并筛选获得CXCR2基因敲除的细胞株。转录组测序分析差异表达基因,并进... 目的通过基因敲除和转录组测序探究CXCR2相关功能基因及信号通路,揭示其在宫颈癌中的分子作用。方法设计构建靶向CXCR2基因的CRISPR-Cas9敲除质粒载体,转染HeLa细胞并筛选获得CXCR2基因敲除的细胞株。转录组测序分析差异表达基因,并进行基因本体(GO)分类富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析筛选信号通路和重要差异表达基因,差异表达基因经实时荧光定量PCR方法验证。结果成功构建了CXCR2基因敲除细胞株,转录组测序获得1519个差异表达基因,其中上调表达基因428个,下调表达基因1091个。GO富集分析显示了细胞组分、生物学过程、分子功能方面富集量前20的条目;KEGG信号通路富集分析显示,富集基因最多的为肿瘤相关通路,其次为PI3K-Akt信号通路和HPV感染信号通路。通过韦恩图分析获得了7个共同差异表达基因:EGF、FN1、ITGA2B、CCND3、PIK3CD、PDGFRB、CDKN1A,其中前6个基因表达显著下调,CDKN1A表达显著上调。结论转录组测序分析结果进一步提示CXCR2在宫颈癌中发挥作用,并初步确定了与其相关的信号通路和关键功能基因,为宫颈癌的分子机制和临床研究提供了理论基础。 展开更多
关键词 宫颈癌 CXCR2 基因敲除 转录组
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莲腐败病菌多聚半乳糖醛酸酶Fcpg1基因功能研究
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作者 叶丽芳 宋水林 +3 位作者 张连虎 林桠春 崔汝强 况卫刚 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期77-85,共9页
【目的】共享镰刀菌(Fusarium commune)侵染莲引起的莲腐败病严重影响莲的生产,鉴定莲腐败病菌中多聚半乳糖醛酸酶基因Fcpg1,分析其在生长发育及致病过程中的作用,为进一步研究共享镰刀菌的致病机理及莲腐败病菌的防治提供依据。【方法... 【目的】共享镰刀菌(Fusarium commune)侵染莲引起的莲腐败病严重影响莲的生产,鉴定莲腐败病菌中多聚半乳糖醛酸酶基因Fcpg1,分析其在生长发育及致病过程中的作用,为进一步研究共享镰刀菌的致病机理及莲腐败病菌的防治提供依据。【方法】利用BLASTP在莲腐败病菌全基因组数据中查找PG同源蛋白,并使用ExPASy等在线软件对Fcpg1氨基酸序列进行生物信息学分析。通过基因敲除的方法,获得Fcpg1基因敲除突变体ΔFcpg1和回补菌株ΔFcpg1-Com。测定野生型菌株FCN23、突变体ΔFcpg1和回补菌株ΔFcpg1-Com的菌落形态、生长速率、产孢量及致病力。【结果】Fcpg1基因编码388个氨基酸,分子量为40.354 ku,分子式为C_(1756)H_(2775)N_(489)O_(577)S_(12),理论等电点为6.57,脂溶系数为79.9。Fcpg1为稳定的、易溶于水的外泌性蛋白,其信号肽剪切位点在第16~17个氨基酸,主要定位于胞外基质。Fcpg1蛋白与尖孢镰刀菌的多聚半乳糖醛酸酶蛋白序列具有较高的同源性。与野生型菌株FCN23和回补菌株ΔFcpg1-Com相比,ΔFcpg1突变体的菌落形态、营养生长和产孢量等方面均无明显差异,但突变体ΔFcpg1的致病力显著减弱。【结论】Fcpg1是典型的多聚半乳糖醛酸酶蛋白,参与对莲腐败病致病力的调控。 展开更多
关键词 Fusarium commune 基因敲除 多聚半乳糖醛酸酶 表型 致病力
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Vm-milRN7调控苹果树腐烂病菌致病的功能及机理
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作者 张健 赵彬森 +1 位作者 冯浩 黄丽丽 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1930-1942,共13页
【背景】microRNA-like RNA(milRNA)是真菌中普遍存在的一类与动植物microRNA具有相似生成和作用机制的调控因子,广泛参与其生长、发育,以及植物病原真菌的侵染致病等生命活动。苹果树腐烂病菌(苹果黑腐皮壳Valsamali)引起的腐烂病是影... 【背景】microRNA-like RNA(milRNA)是真菌中普遍存在的一类与动植物microRNA具有相似生成和作用机制的调控因子,广泛参与其生长、发育,以及植物病原真菌的侵染致病等生命活动。苹果树腐烂病菌(苹果黑腐皮壳Valsamali)引起的腐烂病是影响苹果生产的最具毁灭性的病害。【目的】探究Vm-milRN7调控苹果树腐烂病菌致病的功能及机理,为苹果树腐烂病的靶向性抗病育种提供理论依据。【方法】以03-8菌株基因组DNA为模板扩增Vm-milRN7前体序列并构建Vm-milRN7前体过表达载体;扩增Vm-milRN7前体上下游序列并利用Double-joint PCR技术构建Vm-milRN7前体敲除盒。利用PEG介导的原生质体转化法构建Vm-milRN7前体过表达及敲除突变体。通过培养皿内生长试验及离体枝条、叶片接种试验分析Vm-milRN7前体过表达及敲除突变体对病菌营养生长及致病的功能。利用qRT-PCR以及烟草共转化试验验证Vm-milRN7对其靶标基因Vm-09496的调控作用;使用生物信息学软件对Vm-09496进行蛋白序列特征和系统发育分析。为解析其功能,创制Vm-09496的敲除突变体以及回补菌株,并鉴定其表型。【结果】利用PEG介导的遗传转化技术获得Vm-milRN7过表达转化株以及敲除突变体。营养生长观察发现,与野生型菌株相比,Vm-milRN7过表达转化株生长表型无明显差异,而敲除突变体营养生长速率显著降低;致病力检测发现,Vm-milRN7过表达转化株对苹果叶片的致病力显著增强,敲除突变体对苹果叶片和枝条的致病力均显著降低。qRT-PCR和烟草共转化试验分析发现,Vm-milRN7能够抑制其候选靶标基因Vm-09496的表达。生物信息学分析发现该基因编码一个假想蛋白,且与梨黑腐皮壳(V.pyri)中的VP1G_09956进化关系最近。创制Vm-09496的敲除突变体和回补菌株,发现与野生型菌株相比,敲除突变体对枝条和叶片的致病力均显著提高,而回补菌株营养生长速率及致病力恢复至野生型水平。【结论】Vm-milRN7通过调控靶标基因Vm-09496的降解参与苹果树腐烂病菌致病过程。靶标基因Vm-09496是影响腐烂病菌侵染的重要内源基因,在苹果树腐烂病菌内负向调控致病力。 展开更多
关键词 苹果黑腐皮壳 milRNA 敲除突变体 致病力 转录后调控
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黑曲霉尿苷/尿嘧啶营养缺陷型转化系统的构建及应用
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作者 王小平 宋问 +6 位作者 张霏 刘燕 王升帆 邵东 梁玲玲 许新德 郑建永 《浙江工业大学学报》 北大核心 2024年第1期105-111,共7页
黑曲霉(Aspergillus niger)是一种重要的工业发酵菌株,它具有强大的蛋白分泌表达能力。为了提高黑曲霉遗传操作效率及优化重组菌株的筛选策略,构建以尿苷/尿嘧啶营养缺陷型为筛选标记的转化系统。利用CRISPR/Cas9技术实现pyrG基因的敲除... 黑曲霉(Aspergillus niger)是一种重要的工业发酵菌株,它具有强大的蛋白分泌表达能力。为了提高黑曲霉遗传操作效率及优化重组菌株的筛选策略,构建以尿苷/尿嘧啶营养缺陷型为筛选标记的转化系统。利用CRISPR/Cas9技术实现pyrG基因的敲除,在含有尿嘧啶核苷和5-氟乳清酸(5-FOA)的抗性培养基中筛选表型正确的转化子。经基因组PCR验证,黑曲霉营养缺陷型菌株可稳定遗传。利用该转化系统可成功实现增强型绿色荧光蛋白在黑曲霉中的表达。通过结合增强型绿色荧光蛋白和流式细胞仪建立了黑曲霉转化子的高通量筛选模型。 展开更多
关键词 黑曲霉 CRISPR/Cas9 基因敲除 尿嘧啶营养缺陷型 增强型绿色荧光蛋白(EGFP)
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