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水稻干旱胁迫的small RNA转录组分析
1
作者
刘源
张秀妍
+4 位作者
徐妙云
郑红艳
邹俊杰
张兰
王磊
《中国农业科技导报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期23-32,共10页
small RNA在植物环境胁迫过程中起重要的调节作用。然而,参与干旱逆境响应复杂过程中的miRNAs及其调控机制仍有待于深入挖掘。对干旱胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶组织进行small RNA文库构建和转录组测序。所有样品共检测到403个miR...
small RNA在植物环境胁迫过程中起重要的调节作用。然而,参与干旱逆境响应复杂过程中的miRNAs及其调控机制仍有待于深入挖掘。对干旱胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶组织进行small RNA文库构建和转录组测序。所有样品共检测到403个miRNAs,其中已知miRNAs 352个,新预测miRNAs 51个。干旱处理后24 h的根、茎和叶中分别有37、35和56个差异表达miRNAs,而96 h的根、茎和叶中分别有35、62和65个差异表达miRNAs。15个miRNAs在干旱处理后两个时间点的根、茎和叶中均差异表达,其中,Osa-miR159f、Osa-miR164f、Osa-miR5082和Osa-miR5493受干旱诱导上调表达,是干旱响应中关键调控因子。预测到miRNAs靶基因4537个,并进行了功能注释和富集分析。这些结果为鉴定干旱响应miRNAs并解析其参与抗旱的分子调控机理提供了理论和数据资源。
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关键词
水稻
干旱胁迫
small
RNA
转录组
已知
mirna
新
mirna
靶基因
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职称材料
题名
水稻干旱胁迫的small RNA转录组分析
1
作者
刘源
张秀妍
徐妙云
郑红艳
邹俊杰
张兰
王磊
机构
中国农业科学院生物技术研究所
出处
《中国农业科技导报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期23-32,共10页
基金
国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2018ZX0801103B)
国家自然科学基金项目(31801283)。
文摘
small RNA在植物环境胁迫过程中起重要的调节作用。然而,参与干旱逆境响应复杂过程中的miRNAs及其调控机制仍有待于深入挖掘。对干旱胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶组织进行small RNA文库构建和转录组测序。所有样品共检测到403个miRNAs,其中已知miRNAs 352个,新预测miRNAs 51个。干旱处理后24 h的根、茎和叶中分别有37、35和56个差异表达miRNAs,而96 h的根、茎和叶中分别有35、62和65个差异表达miRNAs。15个miRNAs在干旱处理后两个时间点的根、茎和叶中均差异表达,其中,Osa-miR159f、Osa-miR164f、Osa-miR5082和Osa-miR5493受干旱诱导上调表达,是干旱响应中关键调控因子。预测到miRNAs靶基因4537个,并进行了功能注释和富集分析。这些结果为鉴定干旱响应miRNAs并解析其参与抗旱的分子调控机理提供了理论和数据资源。
关键词
水稻
干旱胁迫
small
RNA
转录组
已知
mirna
新
mirna
靶基因
Keywords
rice
drought stress
small RNA
transcriptome
known mirna
novel
mirna
target gene
分类号
S511 [农业科学—作物学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻干旱胁迫的small RNA转录组分析
刘源
张秀妍
徐妙云
郑红艳
邹俊杰
张兰
王磊
《中国农业科技导报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
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