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盐酸四环素长期暴露对序批式反应器性能、微生物酶活性及微生物群落的影响
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作者 齐维毅 王倩芝 +6 位作者 楚光玉 陈文正 张雨乔 刘甲滕 高畅 鲁帅领 高孟春 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期88-98,共11页
本文研究了0.5 mg/L盐酸四环素(TC)长期暴露对序批式反应器(SBR)性能、脱氮酶活性、抗氧化酶和微生物群落的影响。结果表明,SBR中有机物去除能力和氨氧化能力随运行时间的延长而降低,在反应器运行第70天时,COD去除率从97.10%降低至70.33... 本文研究了0.5 mg/L盐酸四环素(TC)长期暴露对序批式反应器(SBR)性能、脱氮酶活性、抗氧化酶和微生物群落的影响。结果表明,SBR中有机物去除能力和氨氧化能力随运行时间的延长而降低,在反应器运行第70天时,COD去除率从97.10%降低至70.33%,NH_(4)^(+)-N去除率从99.24%降低至67.44%,出水NO_(3)^(-)-N逐渐降低,SBR内没有出现NO_(2)^(-)-N积累。TC长期暴露降低了氨单加氧酶(AMO)、亚硝酸盐氧化酶(NOR)、硝酸盐还原酶(NR)和亚硝酸盐还原酶(NIR)等脱氮酶活性,增加了活性氧(ROS)的相对产生量、乳酸脱氢酶(LDH)相对释放量和部分抗氧化酶的相对活性。进水中加入TC后,微生物的丰富度、多样性和均匀性均降低,硝化菌属(Nitrospira)和反硝化菌属(Zoogloea、Thauera、Dechloromonas、Dokdonella、Hyphomicrobium和Pseudomonas)的相对丰度发生变化,微生物群落和关键微生物具有显著性差异,从而影响了SBR的脱氮性能。 展开更多
关键词 盐酸四环素 微生物酶活性 微生物群落 lefse分析 关键微生物
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妊娠期糖尿病患者肠道菌群特征与妊娠期高血压疾病的关联研究
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作者 代愉恒 高畅 +4 位作者 梁新袖 卢莎 华雯 郑钜圣 胡文胜 《中国全科医学》 北大核心 2024年第2期156-162,共7页
背景患有妊娠期糖尿病(GDM)的孕妇常合并妊娠期高血压疾病(HDP),进而严重影响妊娠期健康及分娩结局。肠道菌群与妊娠健康关系受到越来越多的关注,但其与GDM合并HDP的关联还有待研究。目的探究GDM患者肠道菌群特征与并发HDP的关联。方法... 背景患有妊娠期糖尿病(GDM)的孕妇常合并妊娠期高血压疾病(HDP),进而严重影响妊娠期健康及分娩结局。肠道菌群与妊娠健康关系受到越来越多的关注,但其与GDM合并HDP的关联还有待研究。目的探究GDM患者肠道菌群特征与并发HDP的关联。方法以2019年8月—2020年1月在杭州市妇产科医院行产前检查的204例GDM患者为研究对象。仅确诊GDM的孕妇作为GDM组(n=181),同时确诊GDM和HDP的孕妇作为GDM合并HDP组(n=23)。收集入组孕妇的临床资料与炎症检测指标,并留取同期粪便样本进行肠道菌群16S rDNA扩增子测序分析;采用LEfSe分析,在门、科和属水平分别对两组孕妇肠道菌群的组成结构进行比较,识别各组明显富集的菌群;通过Logistic回归分析探索GDM合并HDP相关的肠道菌群特征;采用Spearman秩相关分析探究肠道菌群与炎症指标的关联。结果两组肠道菌群组成及主要门水平上的菌群相对丰度比较,差异无统计学意义(P>0.05)。LEfSe分析结果:科水平分析显示,与GDM组相比,韦荣氏菌科(Veillonellaceae)在GDM合并HDP组明显富集(P<0.05),而柔膜菌纲RF39未分类菌科(Mollicutes RF39 unclassified family)和毛螺菌科(Lachnospiraceae)的相对丰度降低(P<0.05);属水平分析显示,与GDM组相比,小杆菌属(Dialister)、肠杆菌属(Intestinibacter)、真杆菌属(Eubacterium)和副萨特氏菌属(Parasutterella)在GDM合并HDP组明显富集(P<0.05);与GDM合并HDP组相比,嗜木聚糖真杆菌属([Eubacterium]xylanophilum group)、Ruminiclostridium 6、柔膜菌纲RF39未分类菌属(Mollicutes RF39 unclassified genus)和毛螺菌科未分类菌属(Lachnospiraceae unclassified genus)在GDM组明显富集(P<0.05)。Logistic回归分析结果显示,Veillonellaceae(OR=1.06,95%CI=1.01~1.11)、Dialister(OR=1.26,95%CI=1.10~1.45)、Intestinibacter(OR=2.07,95%CI=1.12~3.84)丰度上升是GDM孕妇合并HDP的独立危险因素(P<0.05);Lachnospiraceae unclassified genus(OR=0.24,95%CI=0.08~0.75)丰度上升是GDM孕妇合并HDP的保护因素(P<0.05)。Spearman秩相关分析结果显示,Veillonellaceae与单核细胞比例呈正相关(rs=0.149,P<0.05);Dialister与白细胞计数、嗜酸粒细胞比例、嗜酸粒细胞计数呈正相关(rs=0.151、0.163、0.171,P<0.05)。结论Veillonellaceae、Dialister、Intestinibacter丰度上升是GDM孕妇合并HDP的独立危险因素,Lachnospiraceae unclassified genus丰度上升是GDM孕妇合并HDP的保护因素,其中Veillonellaceae、Dialister与多项炎症指标呈正相关,肠道菌群可能是GDM合并HDP的重要风险因子。 展开更多
关键词 糖尿病 妊娠 高血压 妊娠性 肠道菌群 lefse分析 炎症 影响因素分析
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结直肠癌组织中淋巴增强子结合因子1(LEF1)高表达及其临床意义
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作者 杨晓宇 屈明 +2 位作者 武雪亮 张吉欣 薛军 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第5期878-882,共5页
目的:探讨结肠癌患者癌组织中淋巴增强子结合因子1(lymphatic enhancer binding factor 1,LEF1)的表达水平及其临床意义。方法:免疫组化染色法结合Western blot观察结肠癌患者癌组织和癌旁组织中LEF1的表达情况,并对癌组织中LEF1的表达... 目的:探讨结肠癌患者癌组织中淋巴增强子结合因子1(lymphatic enhancer binding factor 1,LEF1)的表达水平及其临床意义。方法:免疫组化染色法结合Western blot观察结肠癌患者癌组织和癌旁组织中LEF1的表达情况,并对癌组织中LEF1的表达与结肠癌患者临床病理特征的相关性进行统计学分析。Kaplan-Meier生存分析LEF1的表达与结肠癌患者预后的关联,多因素COX回归分析影响结肠癌患者生存预后的危险因素。进一步分析TCGA数据库结肠癌患者癌和癌旁组织中LEF1的表达水平,及其表达与患者预后以及淋巴结转移的相关性。此外,细胞水平采用Western blot检测结肠癌细胞系中LEF1的蛋白表达情况,并通过转染LEF1 siRNA观察对结肠癌HCT116细胞生物学功能的影响。结果:结肠癌组织中LEF1的表达较癌旁组织显著增加(P<0.05),且其表达水平与肿瘤病理分期、分化程度和淋巴结转移呈正相关(P<0.05),与患者年龄、病理类型无关(P>0.05)。LEF1高表达结肠癌患者的生存期明显低于低表达患者(P<0.05)。多因素COX回归分析结果显示,LEF1高表达、肿瘤病理分期、肿瘤分化程度以及淋巴结转移是结肠癌患者不良预后的危险因素(P<0.05)。TCGA数据库分析结果显示,结肠癌组织中LEF1的表达水平显著高于癌旁组织(P<0.05),且其表达水平与患者预后呈负相关(P<0.05),而与患者淋巴结转移呈正相关(P<0.05)。此外,细胞实验结果显示,人结肠癌细胞系中LEF1的表达水平显著高于正常结肠上皮细胞(P<0.05),敲减LEF1可有效降低结肠癌HCT116细胞的迁移和侵袭能力,并抑制Wnt/β-catenin信号通路活性(P<0.05)。结论:LEF1高表达与结肠癌患者的短生存期和不良预后密切相关,可作为结肠癌患者术后复发和转移以及临床预后的重要生物标志物。 展开更多
关键词 结肠癌 LEF1 淋巴转移 危险因素 预后
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IFITM1和Wnt/β-catenin信号通路在结肠癌发生发展中的作用
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作者 付溶川 周涛 +4 位作者 赵学荣 王建平 郑帅 赵恩宏 肖丽君 《承德医学院学报》 2024年第2期100-105,共6页
目的探究干扰素诱导跨膜蛋白1(IFITM1)在结肠癌中的表达以及其在结肠癌中发挥的作用。方法应用生物信息学分析IFITM1在结肠癌中的表达情况和预后情况,并分析IFITM1与β-连环蛋白的相关性。免疫组化观察IFITM1和β-catenin在结肠癌及癌... 目的探究干扰素诱导跨膜蛋白1(IFITM1)在结肠癌中的表达以及其在结肠癌中发挥的作用。方法应用生物信息学分析IFITM1在结肠癌中的表达情况和预后情况,并分析IFITM1与β-连环蛋白的相关性。免疫组化观察IFITM1和β-catenin在结肠癌及癌旁组织中的表达情况。构建IFITM1过表达细胞模型,CCK-8实验检测细胞增殖能力的变化,双荧光素酶报告基因检测TCF/LEF转录因子的激活情况,Western blot检测Wnt/β-catenin信号通路上关键蛋白β-catenin、C-myc、CyclinD1的表达情况。结果在线数据库分析结果显示,IFITM1在结肠癌中高表达(P<0.05),且与患者的预后不良显著相关;IFITM1与β-catenin之间存在正相关关系。免疫组化染色结果显示,IFITM1和β-catenin在结肠癌组织中的表达显著高于癌旁组织,IFITM1的表达同肿瘤直径大小及组织浸润程度有关(P<0.05),与其他因素无关(P>0.05);β-catenin的表达与仅与肿瘤直径大小有关(P<0.05),与其余因素无关(P>0.05),且二者之间存在正向相关性。在结肠癌细胞HCT-15中过表达IFITM1后,OE-IFITM1组细胞的增殖能力显著高于OE-NC组(P<0.05),OE-NC组和MOCK组之间无差异(P>0.05)。双荧光素酶报告基因结果显示,OE-IFITM1组的启动子活性高于OE-NC组(P<0.05),OE-NC组与MOCK组之间无差异(P>0.05)。Western blot结果显示,OE-IFITM1组的β-catenin,CyclinD1,C-myc的表达量高于OE-NC组(P<0.05),OE-NC组和MOCK组之间蛋白表达无差异(P>0.05)。结论IFITM1在结肠癌组织中的表达显著高于癌旁组织,并可能通过Wnt/β-catenin信号通路促进细胞增殖。 展开更多
关键词 IFITM1 结肠癌 Β-CATENIN TCF/LEF转录因子
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ABCB5和LEF1基因与高血压相关研究进展
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作者 纪仁晖 常丽 安彩艳 《河南大学学报(医学版)》 CAS 2024年第4期235-239,共5页
动脉高血压的发病机制涉及许多因素和分子途径。最近有研究发现ATP结合盒超家族成员ABCB5与心血管相关疾病和WNT信号通路存在关联,有报告指出Wnt/β-catenin通路在高血压患者的病程和发展中的作用,且LEF1作为WNT信号通路中的关键转录因... 动脉高血压的发病机制涉及许多因素和分子途径。最近有研究发现ATP结合盒超家族成员ABCB5与心血管相关疾病和WNT信号通路存在关联,有报告指出Wnt/β-catenin通路在高血压患者的病程和发展中的作用,且LEF1作为WNT信号通路中的关键转录因子可能通过相关机制引起高血压,本文就其相关性研究进行综述。 展开更多
关键词 高血压 ABCB5基因 LEF1基因 WNT信号通路
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激素分别联合吗替麦考酚酯及来氟米特对lgA肾病的疗效及临床价值
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作者 周群 《中文科技期刊数据库(引文版)医药卫生》 2024年第10期0032-0035,共4页
评价IgA肾病患者接受激素+吗替麦考酚酯(MMF)或激素+来氟米特(LEF)治疗效果。方法 60例IgA肾病患者就诊于2021年6月-2024年6月,随机分组。A组激素+MMF治疗,B组激素+LEF治疗。结果 A组肾功能指标、炎症指标、免疫球蛋白指标、不良反应指... 评价IgA肾病患者接受激素+吗替麦考酚酯(MMF)或激素+来氟米特(LEF)治疗效果。方法 60例IgA肾病患者就诊于2021年6月-2024年6月,随机分组。A组激素+MMF治疗,B组激素+LEF治疗。结果 A组肾功能指标、炎症指标、免疫球蛋白指标、不良反应指标均优于B组,P<0.05。结论 IgA肾病患者接受激素+MMF治疗,可减轻肾功能损伤、抑制炎症进展,还可调节免疫球蛋白水平,高效可行。 展开更多
关键词 IgA肾病 激素 MMF LEF 疗效
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基于16S rDNA测序探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群特征
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作者 张玉双 孔令洋 +4 位作者 管佳畅 李建波 王一然 王瑜 李晶 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2023年第20期2496-2502,共7页
背景食管癌是我国的高发肿瘤之一,其发病与死亡人数均为世界平均水平的2倍以上。在我国大多数食管癌发现时已是中晚期,预后较差,所以迫切需要早期诊断及干预治疗,目前肠道菌群在食管癌诊断及治疗中的作用备受关注。目的探索食管鳞状细... 背景食管癌是我国的高发肿瘤之一,其发病与死亡人数均为世界平均水平的2倍以上。在我国大多数食管癌发现时已是中晚期,预后较差,所以迫切需要早期诊断及干预治疗,目前肠道菌群在食管癌诊断及治疗中的作用备受关注。目的探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群基本特征。方法纳入2022年4—8月就诊于河北医科大学第四医院未经任何抗肿瘤治疗的食管鳞状细胞癌患者35例作为食管癌组,健康志愿者35例作为对照组。收集两组人群粪便标本,应用16S rDNA技术检测肠道菌群,根据检测结果物种注释情况分析两组人群肠道菌群的Alpha多样性、Beta多样性〔主坐标分析(PCoA)〕及菌群物种差异性〔线性判别分析及影响因子(LEfSe)分析〕。结果两组人群肠道菌群Alpha多样性香农(Shannon)、辛普森(Simpson)、Chao1、ACE及Goods_coverage指数比较均无明显差异(P>0.05);而PCoA图显示两组样本整体上相距较远,群落结构存在差异(t=10.837,P<0.001)。两组人群肠道菌群T-test检验结果在属水平共有16类菌属的丰度存在明显差异,相对丰度较高的前8位菌属中,食管癌组栖粪杆菌属(Faecalibacterium)、罗斯氏菌属(Roseburia)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)丰度低于对照组,乳杆菌属(Lactobacillus)、罗姆布茨菌属(Romboutsia)、瘤胃球菌属组(Ruminococcus_torques_group)、肠杆菌属(Intestinibacter)、土杆菌属(Turicibacter)丰度高于对照组(P<0.05)。LEfSe分析结果显示14种肠菌丰度存在差异,在属及种水平上与对照组相比,食管癌组Faeculibacterium及普拉梭菌(Faecalibacterium-prausnitzii)丰度降低,Romboutsia及Rombutsia-ilealis丰度升高(P<0.05)。结论食管鳞状细胞癌患者具有显著性差异肠菌,其中Faecalibacterium、Faecalibacterium-prausnitzii、Romboutsia及Rombutsia-ilealis可能是食管癌特异性改变物种,与食管癌发生密切相关。 展开更多
关键词 食管肿瘤 食管鳞状细胞癌 肠道菌群 16S rDNA测序 Alpha多样性 Beta多样性 lefse分析
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鸡粪堆肥中的细菌群落组成及多样性分析 被引量:1
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作者 何东贤 莫红芳 +6 位作者 侯小露 熊晓妍 覃振斌 孙琪 陈孟姣 刘平 李军成 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期128-136,共9页
【目的】了解鸡粪堆肥过程中不同发酵阶段优势细菌群落的变化情况,为改善鸡粪堆肥工艺及提高堆肥效率提供参考依据。【方法】对不同发酵时间鸡粪堆肥样品进行细菌高通量测序,分析其Alpha多样性和相对丰度,并对获得的有效序列在门、纲、... 【目的】了解鸡粪堆肥过程中不同发酵阶段优势细菌群落的变化情况,为改善鸡粪堆肥工艺及提高堆肥效率提供参考依据。【方法】对不同发酵时间鸡粪堆肥样品进行细菌高通量测序,分析其Alpha多样性和相对丰度,并对获得的有效序列在门、纲、目、科、属、种水平进行聚类,使用LEfSe(LDA effect size)分析不同发酵时间样品间的物种相对丰度差异,从而进一步分析鸡粪堆肥过程中的优势菌群落特征和变化情况。【结果】鸡粪堆肥在各发酵阶段的细菌群落多样性一直处于动态变化中,其中,堆肥上层和中层的细菌群落多样性均呈先上升再下降最后又略微上升的变化趋势,下层的细菌群落多样性表现与上层和中层相反。在门水平,鸡粪堆肥的厚壁菌门(Firmicutes)在各发酵阶段均为主要类群,变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度在高温阶段降低,首次在鸡粪堆肥中发现厌氧的盐厌氧菌门(Halanaerobiaeota)且其相对丰度随着堆肥时间的延长逐渐上升。在属水平,鸡粪堆肥起始阶段的优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)及一些潜在的致病菌属如肠球菌属(Enterococcus)、埃希氏-志贺菌属(Escherichia-Shigella)、韦荣氏球菌属(Veillonella)和库特氏菌属(Kurthia),其相对丰度均随着堆肥时间的延长逐渐下降,并被堆肥后期的优势菌群盐胞菌属(Halocella)和芽孢杆菌属(Bacillus)替代。LEfSe分析也表明,堆肥发酵能降低鸡粪中潜在的致病菌属相对丰度。【结论】鸡粪在堆肥过程中其细菌群落结构随着发酵时间的延长发生变化,厚壁菌门为鸡粪堆肥各阶段的主要类群,变形菌门和拟杆菌门主要存在温度较低的发酵阶段。首次发现盐厌氧菌门在堆肥过程中的相对丰度占比较高,并随着堆肥时间的延长逐渐升高。堆肥发酵能显著降低鸡粪潜在病原菌属的相对丰度。 展开更多
关键词 鸡粪堆肥 高通量测序 细菌群落结构 lefse(LDA effect size)分析
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婴幼儿手足口病的肠道菌群结构变化分析 被引量:2
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作者 吴让 朱苏月 +4 位作者 乔继冰 蒋亚洲 朱娟 沈男 王军 《徐州医科大学学报》 CAS 2023年第4期258-262,共5页
目的测定婴幼儿手足口病(HFMD)的肠道菌群结构及变化特征。方法纳入2021年1月—2022年6月经徐州医科大学附属宿迁医院确诊的HFMD婴幼儿48例为HFMD组,健康婴幼儿20例为对照组。提取所有婴幼儿粪便标本DNA并质检,合格后行16S rDNA扩增子... 目的测定婴幼儿手足口病(HFMD)的肠道菌群结构及变化特征。方法纳入2021年1月—2022年6月经徐州医科大学附属宿迁医院确诊的HFMD婴幼儿48例为HFMD组,健康婴幼儿20例为对照组。提取所有婴幼儿粪便标本DNA并质检,合格后行16S rDNA扩增子测序。对测序后的生物学信息进行丰度、多样性及结构分析。结果α多样性分析和β多样性分析显示2组间的肠道菌群丰度和多样性未见明显差异。HFMD组肠道菌群结构发生改变,主要表现为毛螺菌属、韦荣球菌属丰度降低,而巨单胞菌属、埃希菌属丰度升高。结论HFMD婴幼儿存在肠道菌群结构改变,产乙酸盐和丙酸盐的菌属减少。该结果可能为HFMD发病机制及其微生态干预研究提供部分理论依据。 展开更多
关键词 手足口病 婴幼儿 肠道菌群 多样性分析 lefse分析
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β-catenin、LEF1在宫颈鳞状细胞癌及其癌前病变中的表达及临床意义 被引量:3
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作者 汪钊 王艳峰 关兵兵 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第16期3061-3065,共5页
目的:观察宫颈鳞状细胞癌(SCC)及鳞状上皮内病变组织中β连环蛋白(β-catenin)、淋巴增强子结合蛋白1(LEF1)的表达并探讨其临床意义。方法:选取宫颈SCC组织55例、低级别鳞状上皮内病变(low grade squamous intraepithelial lesion,LSIL... 目的:观察宫颈鳞状细胞癌(SCC)及鳞状上皮内病变组织中β连环蛋白(β-catenin)、淋巴增强子结合蛋白1(LEF1)的表达并探讨其临床意义。方法:选取宫颈SCC组织55例、低级别鳞状上皮内病变(low grade squamous intraepithelial lesion,LSIL)组织42例、高级别鳞状上皮内病变(high grade squamous intraepithelial lesion,HSIL)组织34例、正常宫颈组织21例,对上述组织进行β-catenin、LEF1免疫组化检测,分析两者在宫颈鳞状上皮病变中的表达、二者与病变的相关性及其与SCC临床病理参数的关系。结果:SCC、HSIL、LSIL、正常宫颈组织中β-catenin细胞质表达率分别为32.7%、29.4%、23.8%、4.8%,差异有统计学意义(P=0.003);在以上病变中,β-catenin细胞核表达率分别是41.8%、32.4%、28.6%、9.5%,差异有统计学意义(P=0.002);LEF1阳性率分别为69.0%、50.0%、26.2%、9.5%,差异有统计学意义(P<0.001)。β-catenin的异常表达与SCC分化程度(P=0.036)、淋巴结转移(P=0.033)相关,LEF1的表达与FIGO分期(P=0.020)及淋巴结转移(P=0.024)相关。β-catenin(r s=0.375,P<0.001)及LEF1(r s=0.443,P<0.001)的表达情况与宫颈病变发展呈正相关,β-catenin与LEF1的表达在各组病变中呈正相关(r s=0.403,P<0.001)。结论:宫颈鳞状细胞癌及其癌前病变中β-catenin和LEF1蛋白异常表达,并与宫颈鳞状细胞癌的分化、淋巴结转移及FIGO分期相关。 展开更多
关键词 Β-CATENIN LEF1 宫颈鳞状细胞癌 低级别鳞状上皮内病变 高级别鳞状上皮内病变
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用于民机透明件的定向有机玻璃材料性能研究
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作者 杨雪梅 朱子旻 《合成材料老化与应用》 CAS 2023年第6期8-11,共4页
按照民用飞机旅客观察窗透明件的设计和验证要求,综合对比国内外定向拉伸有机玻璃的物理性能,其中透光率、雾度、抗银纹、热松弛性能均相当。通过二级热松弛计算定向有机玻璃的定向度,国内玻璃的定向度为68.7%,行业成熟材料的定向度则过... 按照民用飞机旅客观察窗透明件的设计和验证要求,综合对比国内外定向拉伸有机玻璃的物理性能,其中透光率、雾度、抗银纹、热松弛性能均相当。通过二级热松弛计算定向有机玻璃的定向度,国内玻璃的定向度为68.7%,行业成熟材料的定向度则过高,破坏时易产生层间分层,因而剪切强度较差,故国内定向拉伸有机玻璃力学性能更优。采用载荷放大系数法对该材料的性能稳定性进行研究分析。该定向拉伸有机玻璃的载荷放大系数为1.015,满足民用飞机旅客观察窗透明件对材料稳定性的要求,该材料制造的民用飞机旅客观察窗透明件有望实现装机应用。 展开更多
关键词 定向有机玻璃 民用飞机 透明件 载荷放大系数(LEF)
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“上火”人群的肠道微生物结构特征研究 被引量:2
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作者 何志兴 谢冠群 +1 位作者 范永升 邵铁娟 《浙江中医药大学学报》 CAS 2018年第10期810-814,820,共6页
[目的]对比研究"上火"人群与健康人群的肠道菌群种类,揭示"上火"对肠道微生物的影响。[方法]收集"上火"和健康人群的粪便,利用Illumina MiSeq高通量测序技术对粪便样本DNA测序,利用QIIME软件处理测序数... [目的]对比研究"上火"人群与健康人群的肠道菌群种类,揭示"上火"对肠道微生物的影响。[方法]收集"上火"和健康人群的粪便,利用Illumina MiSeq高通量测序技术对粪便样本DNA测序,利用QIIME软件处理测序数据并计算Alpha多样性,利用PCoA和LEfSe分析方法挖掘两类人群的差异肠道菌群种类。[结果]本次研究共纳入"上火"和健康人群各35例。肠道菌群Alpha多样性指数结果显示,"上火"人群的肠道菌群多样性指数略微低于健康人群。与健康人群比较,"上火"人群肠道内含量显著上调的微生物属主要是放线菌门中的厌氧管状菌属、布劳特菌属、栖粪杆菌属、颤螺菌属、瘤胃球菌属、厌氧弧菌属、考拉杆菌属和粪芽孢菌属,显著下调的微生物属主要是拟杆菌门中的B拟杆菌属和普氏菌属。[结论]"上火"发生与肠道菌群改变密切相关,变化的肠道菌群在一定程度上能反映"上火"发生的能量代谢紊乱和黏膜免疫失衡。 展开更多
关键词 上火 肠道菌群 能量代谢 黏膜免疫 ILLUMINA MiSeq测序 PCoA分析 lefse分析 Alpha多样性
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白斑综合征病毒感染对克氏原螯虾肠道菌群的影响 被引量:14
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作者 陈一铭 顾泽茂 +2 位作者 李莉娟 陈天圣 袁军法 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期40-46,共7页
为揭示白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)感染克氏原螯虾(Procambarus clarkii)后对其肠道菌群的影响,运用16S rDNA基因的高通量测序技术分析健康与人工感染WSSV的克氏原螯虾的肠道菌群的组成及多样性。结果显示,感染组... 为揭示白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)感染克氏原螯虾(Procambarus clarkii)后对其肠道菌群的影响,运用16S rDNA基因的高通量测序技术分析健康与人工感染WSSV的克氏原螯虾的肠道菌群的组成及多样性。结果显示,感染组与对照组在肠道丰度及多样性无显著差异,但其优势菌群组成发生变化。对照组优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)和软壁菌门(Tenericute),分别占75.42%和19.17%;感染组肠道优势菌门为变形菌门和拟杆菌门(Bacteroidetes),分别占78.14%和17.38%。利用LEfSe分析差异菌属发现,感染组与对照组相比,Candidatus bacilloplasma丰度显著减少(P<0.05),拟杆菌科(Bacteroidaceae)和黄杆菌科(Flavobacteria)的丰度显著上升(P<0.05)。此外,部分潜在病原菌如黄杆菌属(Flavobacterium)、气单胞菌属(Aeromonas)的丰度在感染后显著升高(P<0.05)。以上结果说明WSSV感染导致克氏原螯虾肠道菌群发生变化,提示WSSV或可通过干扰肠道稳态致病。 展开更多
关键词 甲壳动物 克氏原螯虾 肠道菌群 白斑综合征病毒 高通量测序 lefse分析 稻田养虾
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水分管理措施对施用有机肥麦田土壤酶活性和微生物群落结构的影响 被引量:34
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作者 张传更 高阳 +2 位作者 张立明 司转运 李双 《灌溉排水学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期38-44,共7页
【目的】研究不同水分管理措施对施用有机肥麦田土壤微生物群落结构和土壤酶活性的影响。【方法】通过田间试验,分析了充分供水和水分胁迫条件下施加有机肥与常规施肥下土壤微生物群落结构和土壤酶活性变化。【结果】在相同施肥处理下,... 【目的】研究不同水分管理措施对施用有机肥麦田土壤微生物群落结构和土壤酶活性的影响。【方法】通过田间试验,分析了充分供水和水分胁迫条件下施加有机肥与常规施肥下土壤微生物群落结构和土壤酶活性变化。【结果】在相同施肥处理下,充分供水处理较水分胁迫处理能大幅提高土壤蔗糖酶、纤维素酶、脲酶、过氧化氢酶和碱性磷酸酶活性;同一水分条件下,施加有机肥可以提高蔗糖酶、碱性磷酸酶和纤维素酶活性,而对脲酶无显著影响;有机肥在充分供水条件下才可以提高过氧化氢酶活性。Shannon和Simpson指数表明,T1与T2处理的群落多样性要高于T3和T4处理。T1处理的丰富度指数为31,分别比T2、T3和T4处理提高了15.01%、40.90%、72.22%。主成分分析表明,处理间的微生物群落结构差异明显,并且水分处理影响小麦根际微生物种群结构。根据LEFSE分析,厚壁菌门(Firmicutes)、黏球菌目(Myxococcales)和鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)是对T1和T2处理起重要作用的物种类群,绿弯菌门(Chloroflexi)是T3和T4处理中能起重要作用的物种类群。【结论】在充分供水下施用有机肥可提高土壤中蔗糖酶、碱性磷酸酶、纤维素酶和过氧化氢酶活性及土壤微生物多样性;充分供水是保证有机肥显著提高麦田土壤酶活性和微生物多样性的前提,尤其是在作物需水和需肥的关键期。 展开更多
关键词 有机肥 水分胁迫 土壤酶活性 微生物多样性 微生物群落结构 主成分分析 lefsE分析
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C/N对SBR生物脱氮硝化过程微生物结构的动态影响 被引量:9
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作者 宁高阳 牛永健 +2 位作者 李维维 杨浩 孙洪伟 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第5期2053-2061,共9页
为揭示碳氮比(C/N)对硝化过程影响的机理本质,试验以人工模拟废水为研究对象,采用4组平行的SBR(R0、R5、R10、R15)反应器,基于16S rRNA基因-Illumina MiSeq高通量测序技术,考察了4种C/N(0、5、10、15)对硝化过程功能微生物组成和结构特... 为揭示碳氮比(C/N)对硝化过程影响的机理本质,试验以人工模拟废水为研究对象,采用4组平行的SBR(R0、R5、R10、R15)反应器,基于16S rRNA基因-Illumina MiSeq高通量测序技术,考察了4种C/N(0、5、10、15)对硝化过程功能微生物组成和结构特征的影响.结果表明:4种C/N条件下,系统均获得了较好的去除氨氮(去除率>95%)和COD(去除率>90%)效果,TN也有不同程度的降低.此外,C/N会显著影响系统内微生物的多样性、种群结构和功能.R0系统Chao1指数(922)、ACE指数(1232.4)、Shannon指数(6.76)和Simpson指数(0.96)均最大,故微生物多样性最丰富,而R5的物种丰富度最低.在微生物门水平上,变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)等9个相对丰度较高的门是重要的微生物门,其中变形菌门(Proteobacteria)约全部微生物的40.7%~65.2%,是4个系统中最优势的菌门.硝化过程的关键菌群亚硝化单胞菌科(Nitrosomonadaceae)及硝化螺旋菌属(Nitrospira)的相对丰度表现出随着C/N升高而急剧降低的趋势.基于LEfSe分析共获得了34组具有显著差异的微生物,从而得到了每种C/N条件下在微生物学分类水平上的菌群关键生物标记物. 展开更多
关键词 C/N IlluminaMiSeq高通量测序 硝化过程 微生物多样性 lefse组间差异
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基于肠道微生态研究山楂粉调节高脂膳食小鼠血脂的机制 被引量:14
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作者 宁素云 滕丹 +2 位作者 慕杨娜 王祎 孙笑宇 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期3062-3069,共8页
目的研究山楂冻干粉对高脂膳食模型ApoE-/-小鼠的血脂调节用及在此过程中,小鼠肠道菌群的演替规律,探讨山楂降低血脂的肠道微生态机制。方法6只C57BL/6 J小鼠为正常组,常规饮食喂养,24只ApoE-/-小鼠,全部给予高脂饮食,并随机分为4组,其... 目的研究山楂冻干粉对高脂膳食模型ApoE-/-小鼠的血脂调节用及在此过程中,小鼠肠道菌群的演替规律,探讨山楂降低血脂的肠道微生态机制。方法6只C57BL/6 J小鼠为正常组,常规饮食喂养,24只ApoE-/-小鼠,全部给予高脂饮食,并随机分为4组,其中模型组灌胃生理盐水,其他3组小鼠则分别灌胃山楂冻干粉水溶液1、2、5 g/kg。连续饲养12周后,检测各组小鼠的TG(甘油三酯)、TC(总胆固醇)、LDL-C(低密度脂蛋白胆固醇)及HDL-C(高密度脂蛋白胆固醇)等参数的水平。收集小鼠的肠道内容物,提取DNA后上机测序。分别对获得的样本进行α分析及β分析,考察各组的菌群分布及各组的差异菌群。结果山楂粉的添加可以有效改善ApoE-/-小鼠的血脂异常。高剂量组的Chao1(查奥1)指数显著性的高于其他4组(P<0.05),而低剂量组的Chao1指数则低于其他各组。山楂粉的添加可以有效的改善高脂膳食小鼠的菌群构成,使之恢复正常,LEfSe的结果显示,随山楂粉剂量的不断增加,模型组内小鼠肠道菌群的构成也随之大幅改变。差异菌群属水平的结果显示,肠杆菌、支原体在低剂量组及模型组的构成无差异,而在其他3组内均显著上升(|LDA|>2.0)。而毛螺旋菌属、埃希氏菌属、毛螺菌属及艾克曼菌属则仅仅在正常组及高剂量组中浓度显著性上升(|LDA|>2.0)可以将上述菌群,视为山楂粉改善肠道菌群构成的生物标志物。结论山楂粉可能通过改变小鼠肠道群构成的方式,调节高脂膳食模型小鼠的血脂上升的趋势。 展开更多
关键词 山楂 高脂饮食 肠道菌群 lefse分析
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长期咸水滴灌对棉田土壤细菌和真菌群落结构的影响 被引量:3
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作者 郭晓雯 杜思垚 +3 位作者 王芳霞 叶扬 杨茂琪 闵伟 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期2909-2923,共15页
【目的】研究长期咸水灌溉对棉田土壤理化性质、细菌和真菌群落结构多样性的影响。【方法】设3个灌溉水盐度处理为0.35、4.61和8.04 dS/m,分别代表淡水、微咸水、咸水3种灌溉水质,采用高通量测序法测定土壤中细菌和真菌群落结构多样性... 【目的】研究长期咸水灌溉对棉田土壤理化性质、细菌和真菌群落结构多样性的影响。【方法】设3个灌溉水盐度处理为0.35、4.61和8.04 dS/m,分别代表淡水、微咸水、咸水3种灌溉水质,采用高通量测序法测定土壤中细菌和真菌群落结构多样性。【结果】与淡水灌溉相比,微咸水和咸水灌溉显著提高了土壤盐分和土壤容重,但降低了土壤pH、有机质和全氮含量。微咸水和咸水灌溉显著增加细菌OTUs,而咸水灌溉显著降低真菌OTUs。咸水灌溉显著增加细菌Chao1和ACE指数,降低Shannon指数,降低真菌Chao1和ACE指数,增加Simpson指数。微咸水和咸水灌溉显著降低细菌RB41、H16、Haliangium、硝化螺旋菌属、溶杆菌属、苔藓杆菌属、酸杆菌属和真菌被孢霉属、粉褶菌属、Tetracladium的相对丰度,但显著增加细菌鞘脂单胞菌属、芽单胞菌属、Gaiella、Ilumatobacter、Solirubrobacter、Nocardioides和真菌弯孢菌属、球腔菌属的相对丰度。随着灌溉水盐度的增加,细菌群落潜在生物标志物的数量逐渐减少,为4个、2个和1个,真菌群落潜在生物标志物数量在微咸水灌溉最高12个,咸水灌溉最低5个。细菌群落结构的改变与土壤含水量,容重和盐度的变化密切相关,而真菌群落结构的改变仅与土壤含水量显著相关。【结论】盐分是驱动土壤细菌和真菌群落组成变化的主要因素。土壤细菌和真菌群落通过调节物种组成来适应盐胁迫,不同灌溉水盐度胁迫下土壤细菌和真菌群落会形成显著差异的物种。 展开更多
关键词 灌溉水盐度 细菌群落多样性 真菌群落多样性 lefse分析 高通量测序
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白藜芦醇抑制HCT116结肠癌细胞增殖与Wnt/β-catenin的关系研究 被引量:28
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作者 袁霜雪 王东旭 +7 位作者 伍秋香 陈前昭 李洋 曾于桦 邵英 黄军 刘映孜 何百成 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期537-541,共5页
目的研究白藜芦醇(resveratrol,Res)对人结肠癌细胞增殖的抑制作用及可能的分子机制。方法采用结晶紫染色和Western blot分析Res对HCT116细胞增殖的抑制作用;应用流式细胞术和Western blot分析Res对HCT116细胞凋亡的促进作用;利用TCF4/... 目的研究白藜芦醇(resveratrol,Res)对人结肠癌细胞增殖的抑制作用及可能的分子机制。方法采用结晶紫染色和Western blot分析Res对HCT116细胞增殖的抑制作用;应用流式细胞术和Western blot分析Res对HCT116细胞凋亡的促进作用;利用TCF4/LEF萤光素酶报告质粒检测Res对Wnt/β-catenin信号转导的影响。采用Western blot和PCR分析Res对HCT116细胞内β-catenin表达水平的影响。结果与对照组相比,Res能抑制HCT116细胞增殖,下调PCNA蛋白水平;流式细胞术和Western blot检测结果均显示,Res能明显促进HCT116细胞凋亡;报告质粒分析结果显示,Res呈浓度依赖性降低TCF4/LEF报告质粒萤光素酶活性(Res为20μmol·L-1时,P<0.05;Res为40或80μmol·L-1时,P<0.01);Western blot和PCR分析结果显示,Res不仅明显降低HCT116细胞中β-catenin的蛋白水平,同时也下调β-catenin mRNA的表达水平。结论Res能抑制HCT116细胞增殖并促进凋亡,其机制可能至少与Res下调β-catenin mRNA表达,抑制Wnt/β-catenin信号转导有关。 展开更多
关键词 白藜芦醇 结肠癌 增殖抑制 凋亡 TCF4/LEF Wnt/βcatenin
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他克莫司治疗特发性膜性肾病的临床疗效观察 被引量:21
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作者 孙广东 许钟镐 +1 位作者 罗萍 苗里宁 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期469-471,共3页
目的观察他克莫司(Tacrolimus)治疗有肾病综合征表现的特发性膜性肾病的临床疗效和安全性,并与来氟米特(LEF)进行比较。方法将表现为肾病综合征的特发性膜性肾病患者20例随机分为他克莫司治疗组(n=10)和LEF治疗组(n=10),分别给予他克莫... 目的观察他克莫司(Tacrolimus)治疗有肾病综合征表现的特发性膜性肾病的临床疗效和安全性,并与来氟米特(LEF)进行比较。方法将表现为肾病综合征的特发性膜性肾病患者20例随机分为他克莫司治疗组(n=10)和LEF治疗组(n=10),分别给予他克莫司及LEF联合强的松治疗6个月,观察各组的疗效、不良反应以及他克莫司的浓度变化。结果他克莫司治疗组治疗6个月后5例完全缓解,24h尿蛋白量和血清白蛋白的水平完全恢复到正常范围,占50%;4例部分缓解,24h尿蛋白量在0.4~3.0g之间,血清白蛋白>30g/L,占40%;1例无效,24h尿蛋白定量>3.0g,占10%;治疗期间他克莫司的平均药物浓度保持在5~7ng/ml的水平。LEF治疗组在疗程结束时,有2例病人获得完全缓解,占20%;3例获得部分缓解,占30%;5例无效,占50%。结论与LEF相比,他克莫司治疗特发性膜性肾病,可明显缓解病情,不良反应少。 展开更多
关键词 他克莫司 LEF 特发性膜性肾病 肾病综合征
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NGX6对Wnt/β-catenin通路β-catenin/TCF/LEF转录活化的影响 被引量:7
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作者 刘芬 沈守荣 +4 位作者 李宏韬 王晓艳 彭娅 廖曼甜 郭勤 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期985-991,共7页
目的:探讨NGX6基因对结肠癌Wnt信号转导通路β-catenin/TCF/LEF转录活化的影响,明确NGX6在Wnt/β-catenin信号转导通路中的作用机制。方法:(1)构建β-catenin野生型真核表达载体pcDNA3.1(+)-β-catenin(WT),(2)转染外源性pcDNA3.1(+)-β... 目的:探讨NGX6基因对结肠癌Wnt信号转导通路β-catenin/TCF/LEF转录活化的影响,明确NGX6在Wnt/β-catenin信号转导通路中的作用机制。方法:(1)构建β-catenin野生型真核表达载体pcDNA3.1(+)-β-catenin(WT),(2)转染外源性pcDNA3.1(+)-β-catenin(WT)及pCMV-myc-NGX6于COS-7细胞,TCF-4荧光素酶报告质粒检测转染NGX6前后TCF-4的转录活性。(3)无外源性β-cate-nin,pCMV-myc-NGX6单独转染COS-7细胞及结肠癌SW620细胞,TCF-4荧光素酶报告质粒检测TCF-4的转录活性,并采用Western blot的方法检测两组细胞核内β-catenin及TCF-4的表达。结果:(1)成功构建真核表达载体pcDNA3.1(+)-β-catenin(WT);(2)pcDNA3.1(+)-β-catenin(WT)与pCMV-myc-NGX6共转染COS-7细胞较pcDNA3.1(+)-β-catenin(WT)单独转染时TCF-4荧光素酶活性明显下降(P<0.05);(3)无外源性β-catenin,pCMV-myc-NGX6转染COS-7及SW620细胞后TCF-4荧光素酶活性较空白质粒转染组下降(P<0.05);(4)NGX6转染COS-7及SW620后核内β-catenin及TCF-4的表达下降。结论:NGX6对结肠癌中Wnt/β-catenin通路的β-catenin/TCF/LEF转录活化具有负性调节作用,其作用机制可能与NGX6抑制β-catenin的核转位有关。 展开更多
关键词 NGX6基因 结肠癌 信号转导 WNT/Β-CATENIN TCF/LEF
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