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Novel,non-colonizing,single-strain live biotherapeutic product ADS024 protects against Clostridioides difficile infection challenge in vivo
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作者 Christopher K Murphy Michelle M O’Donnell +6 位作者 James W Hegarty Sarah Schulz Colin Hill R Paul Ross Mary C Rea Ronald Farquhar Laurent Chesnel 《World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology》 2023年第4期71-85,共15页
BACKGROUND The Centers for Disease Control and Prevention estimate that Clostridioides difficile(C.difficile)causes half a million infections(CDI)annually and is a major cause of total infectious disease death in the ... BACKGROUND The Centers for Disease Control and Prevention estimate that Clostridioides difficile(C.difficile)causes half a million infections(CDI)annually and is a major cause of total infectious disease death in the United States,causing inflammation of the colon and potentially deadly diarrhea.We recently reported the isolation of ADS024,a Bacillus velezensis(B.velezensis)strain,which demonstrated direct in vitro bactericidal activity against C.difficile,with minimal collateral impact on other members of the gut microbiota.In this study,we hypothesized that in vitro activities of ADS024 will translate in vivo to protect against CDI challenge in mouse models.AIM To investigate the in vivo efficacy of B.velezensis ADS024 in protecting against CDI challenge in mouse models.METHODS To mimic disruption of the gut microbiota,the mice were exposed to vancomycin prior to dosing with ADS024.For the mouse single-dose study,the recovery of ADS024 was assessed via microbiological analysis of intestinal and fecal samples at 4 h,8 h,and 24 h after a single oral dose of 5×108 colony-forming units(CFU)/mouse of freshly grown ADS024.The single-dose study in miniature swine included groups that had been pre-dosed with vancomycin and that had been exposed to a dose range of ADS024,and a group that was not pre-dosed with vancomycin and received a single dose of ADS024.The ADS024 colonies[assessed by quantitative polymerase chain reaction(qPCR)using ADS024-specific primers]were counted on agar plates.For the 28-d miniature swine study,qPCR was used to measure ADS024 levels from fecal samples after oral administration of ADS024 capsules containing 5×109 CFU for 28 consecutive days,followed by MiSeq compositional sequencing and bioinformatic analyses to measure the impact of ADS024 on microbiota.Two studies were performed to determine the efficacy of ADS024 in a mouse model of CDI:Study 1 to determine the effects of fresh ADS024 culture and ADS024 spore preparations on the clinical manifestations of CDI in mice,and Study 2 to compare the efficacy of single daily doses vs dosing 3 times per day with fresh ADS024.C.difficile challenge was performed 24 h after the start of ADS024 exposure.To model the human distal colon,an anerobic fecal fermentation system was used.MiSeq compositional sequencing and bioinformatic analyses were performed to measure microbiota diversity changes following ADS024 treatment.To assess the potential of ADS024 to be a source of antibiotic resistance,its susceptibility to 18 different antibiotics was tested.RESULTS In a mouse model of CDI challenge,single daily doses of ADS024 were as efficacious as multiple daily doses in protecting against subsequent challenge by C.difficile pathogen-induced disease.ADS024 showed no evidence of colonization based on the observation that the ADS024 colonies were not recovered 24 h after single doses in mice or 72 h after single doses in miniature swine.In a 28-d repeat-dose study in miniature swine,ADS024 was not detected in fecal samples using plating and qPCR methods.Phylogenetic analysis performed in the human distal colon model showed that ADS024 had a selective impact on the healthy human colonic microbiota,similarly to the in vivo studies performed in miniature swine.Safety assessments indicated that ADS024 was susceptible to all the antibiotics tested,while in silico testing revealed a low potential for off-target activity or virulence and antibioticresistance mechanisms.CONCLUSION Our findings,demonstrating in vivo efficacy of ADS024 in protecting against CDI challenge in mouse models,support the use of ADS024 in preventing recurrent CDI following standard antibiotic treatment. 展开更多
关键词 Gut Single-strain live biotherapeutic product ADS024 Clostridioides difficile Clostridioides difficile challenge model Microbiota
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微生物合成生物学在疾病诊疗上的应用进展 被引量:2
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作者 高纤云 牛灵雪 +1 位作者 见妮 管宁子 《合成生物学》 CSCD 2023年第2期263-282,共20页
在人体的身体内部居住着数以万亿计的细菌和其他微生物,寄生在我们的皮肤、胃肠道和口腔等部位,微生物群失调已成为炎症性肠病、过敏、肥胖、心血管以及神经退行性疾病和癌症等多种疾病发生发展的重要原因。与此同时,利用微生物制剂改... 在人体的身体内部居住着数以万亿计的细菌和其他微生物,寄生在我们的皮肤、胃肠道和口腔等部位,微生物群失调已成为炎症性肠病、过敏、肥胖、心血管以及神经退行性疾病和癌症等多种疾病发生发展的重要原因。与此同时,利用微生物制剂改善健康状况、治疗疾病也在研究和临床中得到验证。近年来,活体生物药不断被开发用于预防、诊断与治疗疾病。采用合成生物学手段在微生物中设计、构建精准可控的基因电路,获得非致病性、具有疾病微环境感知和响应能力并按需释放治疗药物的活体工程菌,实施活体微生物疗法,已成为临床疾病治疗的新思路和新方法。本文对微生物合成生物学在疾病诊疗中的应用进展,如预防与诊疗病原菌感染、治疗代谢疾病、靶向杀伤肿瘤、缓解炎症等进行了系统性总结,并针对微生物传感器设计和推广到临床应用中面临的问题和未来的发展进行了分析与展望。利用合成生物学在微生物中设计的生物传感器能智能感知疾病微环境并可控地提供药物,在疾病的监测和治疗中有巨大的应用前景。 展开更多
关键词 微生物 合成生物学 活体生物药 微生物细胞工厂 疾病诊疗
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活体生物药的应用及在遗传性代谢缺陷病治疗中的展望 被引量:1
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作者 陈钊炜 郭敏 郑华军 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1290-1303,共14页
活体生物药(live biotherapeutic products,LBPs)是指来自于人体肠道内或自然界中能够治疗人类疾病的活性菌。但天然筛选的活菌存在治疗效果不明显、差异性较大等缺点,难以满足个性化诊疗的需要。近年来,随着合成生物学的发展,研究者利... 活体生物药(live biotherapeutic products,LBPs)是指来自于人体肠道内或自然界中能够治疗人类疾病的活性菌。但天然筛选的活菌存在治疗效果不明显、差异性较大等缺点,难以满足个性化诊疗的需要。近年来,随着合成生物学的发展,研究者利用生命科学及工程科学手段,设计并构建了若干可响应外界复杂环境信号的工程菌株,加快了活体生物药的研发和应用过程。遗传性代谢缺陷病(inherited metabolic disease)是因体内某些酶的遗传缺陷致使体内相应的代谢物不能正常代谢而引发一系列临床症状的一类疾病,因此利用合成生物学技术,针对特定缺陷的酶设计重组活体生物药,未来有希望用于遗传性代谢缺陷病的治疗。本综述以活体生物药为切入点,并结合国内外文献综述,来探讨活体生物药在疾病治疗中的应用,以及对遗传性代谢缺陷病治疗的潜力。 展开更多
关键词 活体生物药 遗传性代谢缺陷病 合成生物学 基因编辑 工程菌
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活体生物药:生物技术推动的创新药研发前沿 被引量:2
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作者 邹丹阳 董雨萌 陈晶瑜 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1275-1289,共15页
随着微生物组学研究的深入,越来越多的研究证据显示微生物与人体的健康密切相关。20世纪,人们发现了益生菌,并将其作为有健康功效的食品或膳食补充剂使用。21世纪以来,随着人体微生物组学、DNA合成与测序,以及基因编辑等技术的飞速发展... 随着微生物组学研究的深入,越来越多的研究证据显示微生物与人体的健康密切相关。20世纪,人们发现了益生菌,并将其作为有健康功效的食品或膳食补充剂使用。21世纪以来,随着人体微生物组学、DNA合成与测序,以及基因编辑等技术的飞速发展,微生物在人体健康方面展示出更为广阔的应用前景。近年来,在新药研发上,提出了“下一代益生菌”的概念,将微生物作为“活体生物药(live biotherapeutic products,LBP)”进行研究和开发。简单地说,LBP是活菌药物,可以用于预防或治疗人类的某些疾病和适应症。LBP因其独特的优势,成为了新药研发领域的前沿方向,具有十分广阔的发展前景。本文着重从生物技术角度介绍LBP的类型和研究进展,并总结了LBP开发所面临的挑战以及对未来的展望,以期为LBP技术的发展与产品开发提供参考。 展开更多
关键词 活体生物药 下一代益生菌 新药研发 微生物 基因编辑
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基因工程菌的构建、性能研究及其在疾病诊断和治疗中的应用
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作者 卢雯 刘睿娜 +2 位作者 雷璞 马现仓 朱峰 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期3758-3772,共15页
随着肠道微生物组与宿主关系研究的深入和基因工程的迅速发展,基因工程菌(genetically engineered bacteria,GEB)在医学领域的应用成为研究热点。GEB是指经基因工程改造而具有高效表达外源蛋白质或分子化合物能力的细菌,相比传统药物具... 随着肠道微生物组与宿主关系研究的深入和基因工程的迅速发展,基因工程菌(genetically engineered bacteria,GEB)在医学领域的应用成为研究热点。GEB是指经基因工程改造而具有高效表达外源蛋白质或分子化合物能力的细菌,相比传统药物具有诸多优势。GEB的构建过程包括底盘的选择、功能基因的获取、基因转移和重组这几个基本步骤,包裹技术能够提高其存活率和定殖能力,合成基因回路的应用可使其智能化。功能稳定性、有效性和安全性是评价GEB的一般指标,也是性能优化过程中需要重点关注的方面。GEB在炎症性疾病、肿瘤、代谢性疾病、感染性疾病和神经系统疾病等疾病中已有广泛应用,但实现临床转化还有很多问题亟待解决。本文介绍了GEB的构建和性能研究方法,总结了近年来其在疾病诊断和治疗中的应用,指出了现存问题并提出了展望。 展开更多
关键词 基因工程菌 合成生物学 临床应用 活体生物药 益生菌
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