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长链非编码RNA 1010001N08Rik和GATA6在高氧暴露小鼠肺癌细胞中表达和意义
1
作者
罗好
刘怡波
+2 位作者
颜崇兵
翁博雯
蔡成
《现代生物医学进展》
CAS
2024年第15期2805-2816,共12页
目的:探讨长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)1010001N08Rik和GATA6在高氧暴露小鼠肺癌细胞(Lewis lung carcinoma cell,LLC细胞)中表达量的变化与相关性,及其介导Wnt/β-catenin信号通路参与高氧肺损伤的机制。方法:(1)将LLC细...
目的:探讨长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)1010001N08Rik和GATA6在高氧暴露小鼠肺癌细胞(Lewis lung carcinoma cell,LLC细胞)中表达量的变化与相关性,及其介导Wnt/β-catenin信号通路参与高氧肺损伤的机制。方法:(1)将LLC细胞分为空气组、高氧暴露24 h组和高氧暴露48h组,应用RT-PCR和Western blot法分别检测lncRNA1010001N08Rik、GATA6、Wnt及β-catenin的m RNA及相关蛋白表达水平。(2)将LLC细胞分为无干扰空气组、无干扰高氧组、NC-si RNA干扰高氧组、si RNA干扰高氧组。应用RT-PCR和Western blot法分别检测lncRNA1010001N08Rik、GATA6、Wnt及β-catenin的m RNA及相关蛋白表达水平,流式细胞术检测各组细胞凋亡。(3)利用GraphPad Prism 9.4.1进行数据可视化。(4)采用SPSS 26.0统计软件进行数据处理,两组间数据比较采用两独立样本t检验,多组间比较采用单因素方差分析。(5)将Wnt、Fzd2、GATA6等相关基因输入string11.0数据库构建PPI网络并导出PPI网络图。结果:(1)与空气组相比较,高氧暴露24 h组和48h组GATA6的m RNA表达量下降,lncRNA1010001N08Rik、Wnt、β-catenin的m RNA表达量增加,差异具有统计学意义(P<0.05)。(2)与空气组相比,高氧暴露24 h组和48 h组GATA6蛋白表达量下降,Wnt、β-catenin蛋白表达量增加,差异具有统计学意义(P<0.05)。(3)与无干扰空气组相比,无干扰高氧组、NC-si RNA干扰高氧组的GATA6的m RNA表达量和蛋白表达量下降,1010001N08Rik的m RNA表达量、Wnt、β-catenin的m RNA表达量和蛋白表达量增加;无干扰高氧组与NC-si RNA干扰高氧组的比较差异无统计学意义;与干扰高氧组与NC-si RNA干扰高氧组相比,si RNA干扰高氧组GATA6的m RNA表达量和蛋白表达量增加,1010001N08Rik的m RNA表达量、Wnt、β-catenin的m RNA表达量和蛋白表达量下降,差异均具有统计学意义(P<0.05)。(4)与无干扰空气组相比,无干扰高氧组、NC-si RNA干扰高氧组细胞凋亡率增加;无干扰高氧组与NC-si RNA干扰高氧组的比较差异无统计学意义;与无干扰高氧组与NC-si RNA干扰高氧组相比,si RNA干扰高氧组的细胞凋亡率下降,差异均具有统计学意义(P<0.05)。(5)根据string11.0数据库导出Wnt、Fzd2、GATA6等相关基因的PPI网络图显示,GATA6与Wnt有密切相关。结论:高氧暴露下,LCC细胞中lncRNA1010001N08Rik可能通过下调GATA6的表达激活Wnt/β-catenin信号通路的传导,从而促进高氧肺损伤的形成过程。
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关键词
高氧暴露
lncrna1010001n08rik
GATA6
高氧肺损伤
WNT/Β-CATENIN信号通路
原文传递
题名
长链非编码RNA 1010001N08Rik和GATA6在高氧暴露小鼠肺癌细胞中表达和意义
1
作者
罗好
刘怡波
颜崇兵
翁博雯
蔡成
机构
上海交通大学医学院附属儿童医院上海市儿童医院新生儿科
出处
《现代生物医学进展》
CAS
2024年第15期2805-2816,共12页
基金
2023年"科技兴蒙"上海交通大学行动计划专项项目
2023年上海市儿童医院院级临床研究培育专项(2023YLY02)。
文摘
目的:探讨长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)1010001N08Rik和GATA6在高氧暴露小鼠肺癌细胞(Lewis lung carcinoma cell,LLC细胞)中表达量的变化与相关性,及其介导Wnt/β-catenin信号通路参与高氧肺损伤的机制。方法:(1)将LLC细胞分为空气组、高氧暴露24 h组和高氧暴露48h组,应用RT-PCR和Western blot法分别检测lncRNA1010001N08Rik、GATA6、Wnt及β-catenin的m RNA及相关蛋白表达水平。(2)将LLC细胞分为无干扰空气组、无干扰高氧组、NC-si RNA干扰高氧组、si RNA干扰高氧组。应用RT-PCR和Western blot法分别检测lncRNA1010001N08Rik、GATA6、Wnt及β-catenin的m RNA及相关蛋白表达水平,流式细胞术检测各组细胞凋亡。(3)利用GraphPad Prism 9.4.1进行数据可视化。(4)采用SPSS 26.0统计软件进行数据处理,两组间数据比较采用两独立样本t检验,多组间比较采用单因素方差分析。(5)将Wnt、Fzd2、GATA6等相关基因输入string11.0数据库构建PPI网络并导出PPI网络图。结果:(1)与空气组相比较,高氧暴露24 h组和48h组GATA6的m RNA表达量下降,lncRNA1010001N08Rik、Wnt、β-catenin的m RNA表达量增加,差异具有统计学意义(P<0.05)。(2)与空气组相比,高氧暴露24 h组和48 h组GATA6蛋白表达量下降,Wnt、β-catenin蛋白表达量增加,差异具有统计学意义(P<0.05)。(3)与无干扰空气组相比,无干扰高氧组、NC-si RNA干扰高氧组的GATA6的m RNA表达量和蛋白表达量下降,1010001N08Rik的m RNA表达量、Wnt、β-catenin的m RNA表达量和蛋白表达量增加;无干扰高氧组与NC-si RNA干扰高氧组的比较差异无统计学意义;与干扰高氧组与NC-si RNA干扰高氧组相比,si RNA干扰高氧组GATA6的m RNA表达量和蛋白表达量增加,1010001N08Rik的m RNA表达量、Wnt、β-catenin的m RNA表达量和蛋白表达量下降,差异均具有统计学意义(P<0.05)。(4)与无干扰空气组相比,无干扰高氧组、NC-si RNA干扰高氧组细胞凋亡率增加;无干扰高氧组与NC-si RNA干扰高氧组的比较差异无统计学意义;与无干扰高氧组与NC-si RNA干扰高氧组相比,si RNA干扰高氧组的细胞凋亡率下降,差异均具有统计学意义(P<0.05)。(5)根据string11.0数据库导出Wnt、Fzd2、GATA6等相关基因的PPI网络图显示,GATA6与Wnt有密切相关。结论:高氧暴露下,LCC细胞中lncRNA1010001N08Rik可能通过下调GATA6的表达激活Wnt/β-catenin信号通路的传导,从而促进高氧肺损伤的形成过程。
关键词
高氧暴露
lncrna1010001n08rik
GATA6
高氧肺损伤
WNT/Β-CATENIN信号通路
Keywords
Hyperoxygen exposure
lncRNA 1010001N08Rik
GATA6
Hyperoxygen injury
Wnt/β-catenin signaling pathway
分类号
R-33 [医药卫生]
R722 [医药卫生—儿科]
Q813 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长链非编码RNA 1010001N08Rik和GATA6在高氧暴露小鼠肺癌细胞中表达和意义
罗好
刘怡波
颜崇兵
翁博雯
蔡成
《现代生物医学进展》
CAS
2024
0
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