LncRNA44372在卵巢癌中的差异表达及生物信息学分析

目的:探讨lncRNA44372在卵巢癌中的表达及其在卵巢癌发生发展过程中的作用机制。方法:从NCBI GEO数据库中下载卵巢癌样本及其对照样本的基因芯片数据GSE119054,选用在线工具CRN分析在卵巢癌中差异表达的lncRNA;利用在线工具Annolnc筛选与lncRNA44372有关的共表达基因,然后使用David进行基因本体论(Gene Ontology,GO)分析、信号通路富集分析;通过starbase构建lncRNA44372可能存在的竞争性内源RNA网络;用qRT-PCR检测lncRNA44372在卵巢癌细胞系中的表达。结果:GSE119054数据集中筛选出在卵巢癌中表达上调的lncRNA有6个,表达下调的lncRNA有4个;GO分析显示,与lncRNA44372相关的共表达基因在细胞凋亡、细胞周期调控和蛋白苏氨酸/酪氨酸磷酸酶活性中具有调控作用。信号通路分析显示,与lncRNA44372相关的共表达基因主要参与细胞凋亡、肿瘤形成及发展相关的信号通路。lncRNA44372可与miR-190和miR-193结合并调控Unc-51自噬激活激酶-2(ULK2)和依赖LON的过氧化物酶体-2(LONP2)在卵巢癌中的表达。qRT-PCR结果显示,lncRNA44372在卵巢癌细胞系中表达量较卵巢正常细胞系低(P<0.05)。结论:lncRNA44372在卵巢癌中呈低表达,其可能通过影响细胞凋亡、细胞周期等参与卵巢癌的发生发展。