东方蜜蜂微孢子虫LCFAL 2基因的分子特性及系统进化分析

本研究旨在解析东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae的长链脂肪酸辅酶A连接酶(long chain fatty acid COA ligase)基因LCFAL 2的分子特性,鉴定东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的LCFAL 2蛋白的保守基序和结构域并进行系统进化分析,以期丰富东方蜜蜂微孢子虫LCFAL 2的信息,为深入开展相关功能研究提供基础。通过Expasy网站上的相关软件预测和分析LCFAL 2的理化性质、跨膜螺旋域、信号肽、磷酸化位点、二级结构和三级结构。使用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种LCFAL 2蛋白的保守基序。采用TBtools软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种LCFAL 2的结构域。通过Mega 11.0软件构建东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的LCFAL 2的系统进化树。结果表明,东方蜜蜂微孢子虫LCFAL 2含有1836个核苷酸,可编码611个氨基酸,分子式为C_(3145)H_(4985)N_(813)O_(904)S_(23),分子量约为69.39 kDa,脂溶系数为96.82,等电点为8.79,平均亲水系数为-0.161;不含跨膜螺旋域和典型信号肽;包含27个丝氨酸酸化位点,14个酪氨酸酸化位点及23个苏氨酸磷酸化位点;包含240个α-螺旋,124个延长链,48个β-转角及199个无规则卷曲;可同时定位于细胞核、细胞质和线粒体;另外,LCFAL 2及其模板5mst.1.A之间的同源性为21.44%。东方蜜蜂微孢子虫与蜜蜂微孢子虫Nosema apis等9个物种的LCFAL 2中均含有6个相同的保守基序。东方蜜蜂微孢子虫、管孢属微孢子虫Tubulinosema ratisbonensis、蜜蜂微孢子虫、巨蟹肠孢菌Enterospora canceri、烟粉虱Spraguea lophii、毕氏肠细胞虫Enterocytozoon bieneusi、东方赤孢子虫Hamiltosporidium tvaerminnensis和褶皱臂尾轮虫Brachionus plicatilis的LCFAL 2均包含AFD_class_I superfamily结构域。东方蜜蜂微孢子虫LCFAL 2(XP_024331795.1)与蜜蜂微孢子虫LCFAL 2(EQB61677.1)聚为一支,进化距离最近。研究结果明确了东方蜜蜂微孢子虫LCFAL 2的分子特性,并揭示LCFAL 2可能是亲水性蛋白、胞内蛋白和非跨膜蛋白,东方蜜蜂微孢子虫与蜜蜂微孢子虫的LCFAL 2之间的亲缘关系最近,LCFAL 2在东方蜜蜂微孢子虫和其他微孢子虫中具有较高的保守性。

FACL4 mRNA在PHC中的表达及与肿瘤临床病理特征的相关性

目的探讨脂肪酸辅酶A连接酶长链4(FACL4)在原发性肝癌(PHC)发生中的作用。方法收集40例PHC患者手术切除的癌组织及相应癌旁组织,采用半定量RT-PCR方法检测FACL4 mRNA表达,并分析其与PHC临床病理特征的关系。结果FACL4 mRNA在癌组织中的表达显著高于癌旁组织(P<0.01);FACL4 mRNA表达水平与肿瘤大小、病理分级、肝硬变类型等未见明显相关性(P均>0.05)。结论FACL4 mRNA过表达可能在PHC发生中具有一定作用,此为PHC的临床诊断及治疗提供了新的思路。