长链非编码RNAMIR22HG和微RNA-9-3p在骨关节炎病人血清中的表达及与病情严重程度的相关性

目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)MIR22HG和微RNA-9-3p(miR-9-3p)在骨关节炎(OA)病人血清中的表达及与病情严重程度的相关性。方法 选取2020年10月至2021年10月在南充市中医医院确诊为OA的病人120例,作为OA组,60例体检健康人群作为对照组;采用实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测血清lncRNA MIR22HG和miR-9-3p的表达水平;Pearson法分析lncRNA MIR22HG和miR-9-3p的相关性以及二者与视觉模拟(VAS)评分、美国特种外科医院膝关节评分(HSS)以及西安大略和麦马斯特大学骨关节炎指数可视化量表(WOMAC)评分的相关性;绘制受试者操作特征(ROC)曲线分析lncRNA MIR22HG和miR-9-3p对OA的诊断价值。结果 OA组的血清中lncRNA MIR22HG表达水平显著高于对照组(1.48±0.25比1.01±0.22),miR-9-3p的表达水平显著低于对照组(0.72±0.13比1.05±0.12)(P<0.05);相关性分析显示,lncRNA MIR22HG和miR-9-3p的表达水平呈负相关关系(P<0.05);KLⅣ级血清lncRNA MIR22HG的表达水平、VAS评分、WOMAC评分显著高于KLⅢ级和KLⅡ级,KLⅢ级显著高于KLⅡ级(P<0.05),KLⅣ级血清miR-9-3p的表达水平、HSS评分显著低于KLⅢ级和KLⅡ级,KLⅢ级显著低于KLⅡ级(P<0.05);OA病人lncRNA MIR22HG的表达水平与VAS评分、WOMAC评分均呈正相关,与HSS评分呈负相关(P<0.05);miR-9-3p表达水平与VAS评分、WOMAC评分均呈负相关,与HSS评分呈正相关(P<0.05);二者联合诊断的AUC高于lncRNA MIR22HG、miR-9-3p单独诊断的AUC值(Z=2.22,P=0.012;Z=1.43,P=0.025)。结论OA病人血清中lncRNA MIR22HG表达水平显著升高,miR-9-3p表达水平显著降低,二者与OA病情严重程度密切相关,且对OA具有一定的诊断价值。

LncRNA MIR22HG调节miR-132-3p/TLR2轴对急性心肌梗死小鼠心肌细胞凋亡和心室重构的影响

目的:探讨长链非编码RNA miR-22宿主基因(lncRNA MIR22HG)调节miR-132-3p/Toll样受体2(TLR2)轴对急性心肌梗死(AMI)小鼠心肌细胞凋亡和心室重构的影响。方法:取C57BL/6J小鼠随机分为sham组、AMI组、AMI+sh-NC组、AMI+shMIR22HG组、AMI+sh-MIR22HG+antagomir-NC组、AMI+sh-MIR22HG+antagomir-132-3p组,每组10只,除去sham组外,其它组都进行冠状动脉左前降支结扎,sham组只开胸不结扎冠状动脉,其中AMI+sh-NC组、AMI+sh-MIR22HG组、AMI+shMIR22HG+antagomir-NC组、AMI+sh-MIR22HG+antagomir-132-3p组小鼠分别相对应的对尾静脉注射sh-NC、sh-MIR22HG、sh-MIR22HG+antagomir-NC、sh-MIR22HG+antagomir-132-3p。超声心动图评估小鼠心室重构和心脏功能;HE染色和Masson染色观察心肌组织病理学变化及纤维化;RT-qPCR检测心肌组织MIR22HG、miR-132-3p表达;TUNEL法检测心肌细胞凋亡;Western blotting检测心肌组织B细胞淋巴瘤-2(Bcl-2)、激活型半胱氨酸蛋白酶-3(cleved caspase-3)/半胱氨酸蛋白酶-3(caspase-3)、Ⅰ型胶原蛋白(collagenⅠ)、collagenⅢ和α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)表达;双荧光素酶报告基因实验分别验证MIR22HG和miR-132-3p、miR-132-3p和TLR2的关系。结果:与sham组比较,AMI组小鼠心功能显著降低,心肌组织损伤、心肌纤维化加重,心肌细胞凋亡率、MIR22HG、TLR2、cleved caspase-3/caspase-3、collagenⅠ、collagenⅢ和α-SMA蛋白表达水平显著升高,miR-132-3p和Bcl-2蛋白表达降低(P<0.05);与AMI+sh-NC组比较,AMI+sh-MIR22HG组小鼠心功能改善,心肌组织损伤、心肌纤维化减轻,心肌细胞凋亡率、MIR22HG、TLR2、cleved caspase-3/caspase-3、collagenⅠ、collagenⅢ和α-SMA蛋白表达水平显著降低,miR-132-3p和Bcl-2蛋白表达上升(P<0.05);下调miR-132-3p减弱了敲减MIR22HG对心肌组织的保护作用;双荧光素酶报告基因实验结果显示,MIR22HG靶向调控miR-132-3p表达,miR-132-3p靶向负调控TLR2表达。结论:抑制MIR22HG表达可通过调节miR-132-3p/TLR2轴抑制AMI小鼠心肌细胞凋亡,改善小鼠心室重构。

泛癌分析长链非编码RNAMIR22HG的表达特征

目的泛癌分析长链非编码RNA(lncRNA)MIR22HG的表达及其与临床特征的关系。方法R语言分析癌症基因组图谱(TCGA)中MIR22HG在不同肿瘤组织中的表达及其与临床分期、淋巴结转移、肿瘤突变负荷(TMB)及微卫星不稳定(MSI)的关系;应用TIMER比较MIR22HG表达与免疫浸润的关系;使用cBioPortal分析MIR22HG的突变频率及其与预后的关系;使用GDSC在线数据库分析MIR22HG与化疗药物敏感性的关系。利用GEO数据库肝癌数据集和12对肝癌标本验证MIR22HG在肝癌中的表达及其与索拉非尼治疗反应的关系;分析MIR22HG表达与索拉非尼治疗预后的关系;在肝癌细胞株HCC-LM3中过表达MIR22HG(NC组,MIR22HG过表达组),在肝癌细胞株MHCC-97H中敲除MIR22HG(NC组,sh-MIR22HG组),采用CCK-8检测肝癌细胞中MIR22HG对索拉非尼IC_(50)的影响。结果MIR22HG在大多数肿瘤中低表达(P<0.05),且多数肿瘤中MIR22HG基因存在缺失突变,其突变与肿瘤不良预后相关(P<0.05)。MIR22HG的表达水平与多种肿瘤的临床分期及淋巴结转移相关(P<0.05)。在多种肿瘤中MIR22HG的表达水平与TBM、MSI、免疫评分、免疫检查点相关基因表达及化疗药的药物敏感性显著相关(P<0.05)。6种常见免疫细胞中,中性粒细胞浸润水平与MIR22HG的表达水平相关性最强,尤其在乳腺癌、直肠癌及肾乳头状细胞癌中明显。多个数据集的分析结果验证MIR22HG在肝癌中低表达,且其低表达与肝癌进展相关(P<0.05)。MIR22HG低表达的患者经索拉非尼治疗后预后较好(HR=2.94,P=0.075),其低表达能有效预测肝癌患者索拉非尼治疗效果(AUC=0.8095)。过表达MIR22HG能降低肝癌细胞对索拉非尼的敏感性(IC_(50 NC) vs IC_(50 MIR22HG)=7.731 vs 15.61);而敲除MIR22HG的表达则能增加肝癌细胞对索拉非尼的敏感性(IC_(50 NC) vs IC50sh-MIR22HG=7.986 vs 5.085)。结论MIR22HG的表达与多种肿瘤的分期、有否淋巴结转移、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、免疫细胞浸润及化疗药物敏感性相关。

长链非编码RNA MIR22HG通过微小RNA-9-3p调节CTLA4抑制前列腺癌

目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)MIR22HG通过微小RNA-9-3p(miR-9-3p)调节细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA4)抑制前列腺癌的机制。方法收集26例前列腺癌组织样本和26例前列腺增生组织样本,培养VCAP、PC3、LNCap和DU145细胞。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测前列腺癌组织、前列腺增生组织及4种前列腺癌细胞的MIR22HG和miR-9-3p mRNA水平。筛选MIR22HG和miR-9-3p mRNA表达较高的细胞。将筛选出的细胞按不同干预方法分为OE-CTLA4(CTLA4过表达组)、OE-MIR22HG(MIR22HG过表达组)、miR-9-3p mimic(miR-9-3p过表达组)、OE-MIR22HG+miR-9-3p mimic(MIR22HG及miR-9-3p联合过表达组)、OE-NC+NC mimic(转染对照组)、NC mimic(miR-9-3p过表达对照组)。采用TargetScan数据库及荧光素酶报告基因实验验证MIR22HG与miR-9-3p及miR-9-3p与CTLA4是否存在靶向抑制关系。采用qRT-PCR及Western blot检测各组细胞MIR22HG和miR-9-3p mRNA及CTLA4蛋白表达。取裸鼠96只,按干预方法不同分为OE-NC+NC mimic组(转染对照)、OE-MIR22HG组(MIR22HG过表达)及OE-MIR22HG+miR-9-3p mimic组(MIR22HG及miR-9-3p联合过表达),每组32只。接种后4周期间,每周检测小鼠原位移植瘤并统计瘤体的质量和体积变化。结果前列腺癌细胞VCAP、PC3、LNCap和DU145细胞中,PC3细胞MIR22HG mRNA相对较低,miR-9-3p mRNA相对较高,因此选择PC3细胞进行研究。在PC3细胞中成功过表达MIR22HG,荧光素酶报告基因实验验证了MIR22HG和miR-9-3p的靶向抑制关系,过表达MIR22HG,miR-9-3p表达下调,差异有统计学意义(P<0.05)。TargetScan数据库预测免疫基因CTLA4和miR-9-3p的靶向关系,荧光素酶报告基因实验验证miR-9-3p和CTLA4的靶向抑制关系,过表达miR-9-3p,CTLA4表达上调,差异有统计学意义(P<0.05)。过表达MIR22HG的裸鼠皮下肿瘤的质量降低,差异有统计学意义(P<0.05)。OE-MIR22HG+miR-9-3p mimic组裸鼠皮下肿瘤的质量、体积与OE-NC+NC mimic组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论MIR22HG与miR-9-3p存在靶向负调节关系,miR-9-3p与CTLA-4存在靶向调节关系,MIR22HG/miR-9-3p可能通过抑制CTLA4达到免疫治疗前列腺癌的目的。

长链非编码RNA-MALAT1调控miR-22/snail轴对胃癌增殖、迁移及侵袭的影响

目的:探讨长链非编码RNA MALAT1(long non-coding RNA MALAT1,lnc RNA MALAT1)调控miR-22/snail轴对胃癌增殖、迁移及侵袭的影响。方法:采用siRNA干扰技术抑制MALAT1表达,同时过表达miR-22和Snail;采用RT-PCR检测MALAT1,miR-22和snail在胃癌细胞系中的表达水平(n=3);采用Western blot检测NC组、si-MALAT1组中snail蛋白的表达水平(n=3);采用CCK-8法在12、24、48、72 h检测NC组、si-MALAT1组、miR-22组、miR-22+snail组、si-MALAT1+miR-22组中细胞吸光度值(n=3);采用划痕实验检测NC组、si-MALAT1组、miR-22组迁移速度(n=3);采用Transwell检测NC组、siMALAT1组、miR-22组、miR-22+snail组、si-MALAT1+miR-22组穿过膜细胞的个数(n=3);采用双荧光素酶检测NC+pMIRMALAT1-WT组、NC+pMIR-MALAT1-MUT组、miR-22+pMIR-MALAT1-WT组、miR-22+pMIR-MALAT1-MUT、NC+pMIRSnail-WT组、NC+pMIR-Snail-MUT组、miR-22+pMIR-Snail-WT组、miR-22+pMIR-Snail-MUT组的荧光活性(n=3)。两独立样本间的比较采用t检验,多组数据之间的比较采用单因素方差进行分析,涉及时间因素时采用重复测量方差分析。结果:MALAT1在胃癌细胞系中的表达水平明显高于正常胃黏膜上皮细胞(均P=0.000);低表达MALAT1后,AGS和SGC-7901增殖能力(P1=0.001,P2=0.005),迁移能力(P1=0.018,P2=0.007),侵袭能力(P1=0.024,P2=0.015)均降低;同时双荧光素酶结果显示MALAT1能够靶向结合miR-22(P=0.001),miR-22能够靶向结合snail(P=0.001);miR-22在胃癌细胞中的表达水平明显低于正常胃黏膜上皮细胞(均P<0.05);过表达miR-22后,AGS和SGC-7901增殖能力(P1=0.004,P2=0.009),迁移能力(P1=0.034,P2=0.005),侵袭能力(P1=0.037,P2=0.011)均降低;在低表达MALAT1和过表达miR-22后能够更进一步增加低表达MALAT1后对AGS和SGC-7901的增殖(P1=0.022,P2=0.006)和侵袭(P1=0.024,P2=0.015)的抑制作用;同时过表达miR-22和snail后能够反转miR-22对AGS和SGC-7901的增殖(P1=0.003,P2=0.004)和侵袭(P1=0.015,P2=0.01)的抑制作用。结论:MALAT1在胃癌细胞中明显高表达,并能通过调控miR-22/snail轴促进胃癌增殖、迁移及侵袭。

长链非编码RNA XIST可能通过miR-22/NLRP3促进喉鳞癌细胞增殖

目的:探讨长链非编码RNA X染色体失活特异转录本(XIST)通过miR-22/NLRP3通路对喉鳞状细胞癌(LSCC)增殖的影响。方法:RT-PCR检测34例LSCC患者癌组织和癌旁组织中XIST的表达;CCK-8法和平板细胞克隆形成实验检测肿瘤细胞增殖活性;Western blot检测蛋白表达水平。荧光素酶报告分析法验证XIST对miR-22/NLRP3的靶向作用。用XIST siRNA慢病毒治疗BALB/c肿瘤小鼠,观察肿瘤生长变化。结果:与癌旁组织相比,LSCC组织中XIST表达水平较高(P<0.05)。肿瘤分期越高,XIST表达水平越高(P<0.05)。下调XIST表达可抑制肿瘤细胞增殖(P<0.05)。荧光素酶报告分析结果显示,XIST可通过靶向miR-22调节NLRP3。抑制XIST后,miR-22表达水平显著上调(P<0.05),下调XIST表达或miR-22过表达可导致NLRP3表达上调(P<0.05)。用shXIST慢病毒干预LSCC小鼠后,肿瘤体积和重量明显缩小,肿瘤增殖抗原Ki-67和NLRP3表达水平降低(P<0.05)。结论:XIST过表达可通过调控miR-22/NLRP3通路促进LSCC增殖,靶向XIST可能为LSCC的治疗提供新的方向。

长链非编码RNA MIR22HG在甲状腺癌中作为生物标志物的鉴定

目的分析长链非编码RNA(lncRNAs) MIR22HG在甲状腺癌(TC)中作为生物标志物的可行性。方法通过TCGA、GSE29265、GSE33630和GSE55091等公共数据库, 采用单因素方差分析MIR22HG在TC中的表达水平以及其表达与TC临床病理特征的相关性。通过共表达网络构建、GO和KEGG途径分析, 采用Kaplan Meier和Cox回归分析明确MIR22HG在TC中的意义。结果 TC中MIR22HG表达水平显著低于正常甲状腺组织:GSE29265(F=37.740, P<0.05)、GSE50901(F=20.226, P<0.05)、GSE33630(F=33.930, P<0.001)和TCGA(F=4.610, P<0.001)。此外, MIR22HG低表达水平与TC患者患病年龄(χ^(2)=4.246, P<0.05)、淋巴结转移(χ^(2)=4.747, P<0.01)、肿瘤残留(χ^(2)=5.039, P<0.05)及甲状腺癌肿瘤高分期(χ^(2)=5.867, P<0.001)、T分级(χ^(2)=5.898, P<0.05)和N分级(χ^(2)=4.937, P<0.05)有相关。在TC中, MIR22HG的高表达与更长的总体[风险比(HR)95%可信区间(CI):2.531(1.039~6.166), P<0.05]和无病生存时间[HR 95%CI:4.942(1.064~14.904), P<0.05]相关。为了探讨MIR22HG调控TC进程的可能机制, 本研究构建受MIR22HG调控的4个Hub基因网络。生物信息学分析结果表明, MIR22HG与TC中的细胞凋亡、转录调控、mRNA剪接、细胞周期调控和Hippo信号通路有关。结论 MIR22HG可以作为一种新的甲状腺癌生物标志物。

lncRNA HOTAIR促椎间盘髓核细胞凋亡的机制研究

目的研究长链非编码RNA(lncRNA)HOX转录反义RNA(HOTAIR)对椎间盘髓核细胞凋亡的调控作用。方法培养人椎间盘髓核细胞系(HNPC),并将HNPC细胞随机分为对照组(Ctrl组)、晚期糖基化终末产物(AGE)组(AGE组)、微小RNA(microRNA,miR)-22的拟似物组(mimic组)、mimic的阴性对照组(mimic-NC组)、lncRNA HOTAIR过表达组(HOTAIR组)、过表达质粒的空载体组(Vector组)、HOTAIR联合mimic处理组(HOTAIR+mimic组)、HOTAIR联合核苷酸结合寡聚结构域样受体家族Pyrin域蛋白3(NLRP3)的抑制剂mcc950处理组(HOTAIR+mcc950组)。qRT-PCR法检测miR-22和lncRNA HOTAIR的表达。双荧光素酶报告基因实验检测lncRNA HOTAIR和miR-22以及miR-22和NLRP3的关系。Western blot检测NLRP3炎症小体相关蛋白的表达。流式细胞术和Hoechst 33342染色检测HNPC细胞的凋亡水平。结果与Ctrl组比较,AGE组lncRNA HOTAIR及NLRP3、Caspase1、含半胱天冬氨酸蛋白酶激活和招募结构域结构的凋亡相关斑点样蛋白(ASC)均上调,细胞凋亡增加,miR-22表达下调,差异均有统计学意义(P<0.05);lncRNA HOTAIR可以和miR-22的碱基序列结合,且miR-22能和NLRP33'UTR的碱基序列结合。与Vector组比较,HOTAIR组的lncRNA HOTAIR及NLRP3、Caspase1、ASC蛋白表达上调,细胞凋亡增加,miR-22表达下调,差异均有统计学意义(P<0.05)。与HOTAIR组比较,HOTAIR+mimic组的miR-22表达上调,NLRP3、Caspase1、ASC蛋白表达均下调,细胞凋亡数减少,差异均有统计学意义(P<0.05)。与HOTAIR组比较,HOTAIR+mcc950组的lncRNA HOTAIR和miR-22表达差异不显著(P>0.05),NLRP3、Caspase1、ASC蛋白表达下调,细胞凋亡数减少,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论lncRNA HOTAIR通过靶向调控miR-22激活NLRP3炎症小体促进椎间盘髓核细胞凋亡。

LncRNA RP11-307C12.11 promotes the growth of hepatocellular carcinoma by acting as a molecular sponge of miR-138

Background:Abnormal expression of long non-coding RNAs(lncRNAs)has been found in almost all tumors in humans,providing numerous potential diagnostic and prognostic biomarkers,and therapeutic targets.Materials and methods:The Cancer Genome Atlas(TCGA)database was used to screen potential LncRNAs,and 30 paired hepatocellular carcinoma(HCC)tissues were used to investigate RP11-307C12.11 expression levels by qRT-PCR and another 105 HCC tissues by in situ hybridizsation(ISH).RP11-307C12.11 overexpression and knockdown experiments were performed to investigate the effects of RP11-307C12.11 on HCC growth through in vitro and in vivo assays(MTT assay,colony formation assay,EdU assay,and xenograft model).The molecular mechanism underlying these effects was confirmed by MS2-RIP-assay,RIP assay,luciferase assay,and rescue experiments.Results:RP11-307C12.11 expression level was significantly higher in tumor tissues than in the adjacent normal tissues.Elevated RP11-307C12.11 expression level was associated with poor prognosis of HCC patients,and it may be represented as an independent prognostic biomarker in patients with HCC.Functionally,RP11-307C12.11 overexpression promoted HCC growth both in vitro and in vivo;however,its knockdown reversed these effects.Mechanistically,we found that RP11-307C12.11 expressed predominantly in the cytoplasm and sponged microRNA(miR)-138 to regulate its common target CCND1 and PDK1.Conclusions:Thus,we found that RP11-307C12.11 acts as an oncogene in HCC by binding to miR-138,which might provide a novel target for HCC therapy.