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Gene Expression and Activities of SOD in Cucumber Seedlings Were Related with Concentrations of Mn^(2+),Cu^(2+),or Zn^(2+) Under Low Temperature Stress 被引量:17
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作者 GAO Jun-jie LI Tao YU Xian-chang 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2009年第6期678-684,共7页
Effects of increasing Mn^2+, Cu^2+, or Zn^2+ on SOD expressions were studied in cucumber seedlings under low temperature stress. Both gene expressions and activities of Cu/Zn-SOD and Mn-SOD in cucumber seedling lea... Effects of increasing Mn^2+, Cu^2+, or Zn^2+ on SOD expressions were studied in cucumber seedlings under low temperature stress. Both gene expressions and activities of Cu/Zn-SOD and Mn-SOD in cucumber seedling leaves were induced by increasing Mn^2+, Cu^2+, or Zn^2+ under low temperature stress, especially 48 h afterwards. The activities of Cu/Zn-SOD and Mn-SOD at 0 and 48 h after treatment were in accordance with their gene expression levels, which implied that the transcriptional regulation plays key roles in regulating their activities at the early stage of low temperature stress. Gene expressions of Cu/Zn-SOD and Mn-SOD declined at 96 h, but Cu/Zn-SOD and Mn-SOD activities still remain high, which suggested that Cu/Zn-SOD and Mn-SOD activities might be regulated by other factors after transcription at the later stage of low temperature stress. Therefore, we concluded that the increasing Mn^2+, Cu^2+, or Zn^2+ could increase the capacity of scavenging ROS in cucumber seedlings under low temperature stress by inducing gene expressions of Cu/ Zn-SOD and Mn-SOD, elevating activities of Cu/Zn-SOD, Mn-SOD, or regulating other factors after transcription. 展开更多
关键词 real-time quantitative PCR cucumber seedlings SOD low temperature stress MANGANESE copper zinc
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油棕C2H2基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析
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作者 程秋如 刘子凡 曾宪海 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期453-467,共15页
C2H2型锌指蛋白是最常见的锌指蛋白之一,广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、盐、低温、干旱胁迫等非生物胁迫响应中扮演重要作用。本研究以拟南芥C2H2氨基酸序列作为探针,在油棕基因组数据库中进行本地BLASTP比对和保守结构域预... C2H2型锌指蛋白是最常见的锌指蛋白之一,广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、盐、低温、干旱胁迫等非生物胁迫响应中扮演重要作用。本研究以拟南芥C2H2氨基酸序列作为探针,在油棕基因组数据库中进行本地BLASTP比对和保守结构域预测分析,筛选出油棕C2H2型锌指蛋白家族成员,利用生物信息学手段对基因家族成员的理化性质、进化关系、染色体位置、基因结构、保守基序和启动子顺式元件进行分析,并利用转录组数据和荧光定量PCR方法分析EgC2H2基因家族成员在低温胁迫下的表达情况。结果显示:从油棕基因组中共鉴定出73个C2H2型锌指蛋白家族成员,EgC2H2家族成员氨基酸的数目为128~556个,分子量为14176.73~58983.30 Da,等电点为4.99~9.62,不稳定系数为38.84~86.01,亲水性为–1.154~-0.226,亚细胞定位显示C2H2基因家族所有成员均定位于细胞核;系统进化树分析显示EgC2H2家族成员可以分为4个亚家族,EgC2H2家族成员多数归类于第Ⅰ亚家族和第Ⅱ亚家族,且同一亚家族成员的结构域具有较高的一致性;染色体定位结果显示,EgC2H2家族成员不均匀地分布于油棕的16条染色体上;启动子顺式元件分析显示,EgC2H2家族包含许多光响应元件、植物激素响应元件和逆境胁迫响应元件;转录组数据分析显示,大部分EgC2H2基因响应低温胁迫,且大多数EgC2H2基因在耐寒材料中高表达,在冷敏感材料中低表达;荧光定量PCR分析显示,EgC2H2-23、EgC2H2-11、EgC2H2-19、EgC2H2-17和EgC2H2-21显著上调表达,且在耐寒材料中的表达量显著高于冷敏感材料,推测这些基因可能在油棕低温响应中发挥关键作用,可以作为候选基因进一步深入研究。本研究为深入研究油棕C2H2基因家族功能提供理论参考。 展开更多
关键词 油棕 C2H2型锌指蛋白 基因家族 低温胁迫
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燕麦不同锌效率品种苗期耐低锌胁迫的根系形态差异 被引量:2
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作者 齐冰洁 何竹青 +1 位作者 孙艳楠 张智勇 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第5期1119-1124,共6页
为了揭示燕麦耐低锌胁迫的根系形态响应,以燕麦锌高效品种晋燕2004和锌低效品种8202为试验材料,采用营养液培养方法,设置正常供锌(1×10^(-6)mol/L)和低锌胁迫(1×10^(-8)mol/L)2个供锌水平,处理时间为0 d、15 d、25 d、35 d,... 为了揭示燕麦耐低锌胁迫的根系形态响应,以燕麦锌高效品种晋燕2004和锌低效品种8202为试验材料,采用营养液培养方法,设置正常供锌(1×10^(-6)mol/L)和低锌胁迫(1×10^(-8)mol/L)2个供锌水平,处理时间为0 d、15 d、25 d、35 d,测定不同锌效率燕麦品种苗期生长状况及根系形态指标。结果表明:正常供锌和低锌处理0 d、15 d,两品种干物质量、最大根长、根系总长、总根尖数、表面积、体积均无显著差异;低锌处理25 d和35 d时,锌高效品种晋燕2004地上部和根系干物质量显著高于锌低效品种8202,锌高效品种晋燕2004的最大根长、根系总长、总根尖数、表面积、体积均显著高于锌低效品种8202。说明锌高效品种受低锌胁迫的影响小于锌低效品种,且随胁迫时间长短而表现不同差异。 展开更多
关键词 燕麦 低锌胁迫 锌效率 根系形态
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低盐胁迫对刺参4个盐度调节相关基因表达丰度的影响 被引量:3
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作者 傅意然 田燚 +2 位作者 常亚青 莫海波 宋坚 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期902-909,共8页
从刺参(Apostichopus japonicus)低盐转录组数据库中选取与应激(热休克蛋白70基因)和离子传递(甘氨酸转运蛋白基因、锌转运蛋白基因、神经乙酰胆碱受体基因)相关的4个差异表达基因,利用qRT-PCR技术分析这4个基因在不同组织中的表达水平... 从刺参(Apostichopus japonicus)低盐转录组数据库中选取与应激(热休克蛋白70基因)和离子传递(甘氨酸转运蛋白基因、锌转运蛋白基因、神经乙酰胆碱受体基因)相关的4个差异表达基因,利用qRT-PCR技术分析这4个基因在不同组织中的表达水平及低盐对其表达丰度的影响。结果表明甘氨酸转运蛋白基因在刺参呼吸树中表达水平最高,肠次之,体腔液表达较低;锌指蛋白基因和神经乙酰胆碱受体基因均在体腔液中表达最高,肠次之,在呼吸树中不表达;热休克蛋白70基因在体腔液中表达量最高,其次是呼吸树和肠组织。低盐胁迫下这4种基因的表达量均随着胁迫时间的延长呈波动性增减,其中甘氨酸转运蛋白在体腔液中的表达低于正常表达水平,在胁迫后3 h时达到最低表达量。神经乙酰胆碱受体基因除在体腔液中48 h出现明显的上调外,在体腔液其他时间点和肠组织中处于下调表达状态。低盐胁迫下这4个基因表达丰度的变化,说明这些基因或作为功能蛋白直接参与机体的代谢调节,或作为调控蛋白调节胁迫功能蛋白的表达和活性来提高刺参对低盐胁迫的耐受能力。研究结果可为刺参盐度调节适应机制的研究奠定基础。 展开更多
关键词 刺参 低盐胁迫 甘氨酸转运蛋白 锌指蛋白 神经乙酰胆碱受体 热休克蛋白70
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桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族的鉴定及其在低温胁迫下的表达分析
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作者 郝兰兰 马乃膺 +2 位作者 张仲兴 李小兰 王鸿 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期873-882,共10页
【目的】从桃基因组鉴定Q型C2H2锌指蛋白基因家族成员,并进行生物信息学与低温表达分析,为桃抗逆性研究提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法分析桃46个Q型C2H2锌指蛋白家族成员的理化性质、系统进化和基因结构等,并利用实时荧光... 【目的】从桃基因组鉴定Q型C2H2锌指蛋白基因家族成员,并进行生物信息学与低温表达分析,为桃抗逆性研究提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法分析桃46个Q型C2H2锌指蛋白家族成员的理化性质、系统进化和基因结构等,并利用实时荧光定量分析其低温胁迫下的表达特征。【结果】桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员氨基酸数量介于155~607,且主要位于细胞核中。染色体定位揭示该家族成员不均匀地分布在8条染色体上。系统进化分析将桃和拟南芥的Q型C2H2基因聚为16个亚组。基因结构分析表明:同一亚族成员结构相似,外显子数量基本相同。顺式作用元件分析表明:大多数Q型C2H2锌指蛋白家族成员启动子序列上游2000 bp区域包含大量激素及非生物胁迫响应元件。qRT-PCR分析表明:低温胁迫下,桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员中有16个成员为上调表达,且以PpC2H2-18基因最为显著。【结论】该家族成员均含有较高的保守基序和结构域,且可参与植物生长发育以及生物和非生物胁迫等,为桃的抗寒育种提供了参考。 展开更多
关键词 Q型C2H2锌指蛋白 低温胁迫 表达分析
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茶树CSD1基因及其启动子克隆与低温胁迫下的表达 被引量:4
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作者 郭玉琼 王仲 +7 位作者 朱晨 赵姗姗 张舒婷 常笑君 李小桢 傅海峰 林玉玲 赖钟雄 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期1122-1131,共10页
低温寒害严重影响茶树的生长发育状况及成品茶品质,Copper/zinc-superoxide dismutase(CSD)基因在植物抗胁迫响应中起着关键作用.为了解茶树CSD基因(CsCSD)响应低温胁迫的作用机制,以铁观音茶树叶片为供试材料,采用同源克隆结合RAC... 低温寒害严重影响茶树的生长发育状况及成品茶品质,Copper/zinc-superoxide dismutase(CSD)基因在植物抗胁迫响应中起着关键作用.为了解茶树CSD基因(CsCSD)响应低温胁迫的作用机制,以铁观音茶树叶片为供试材料,采用同源克隆结合RACE方法及染色体步移法,获得茶树CSD1基因的cDNA序列(GenBank登录号:KR078346)、gDNA序列及其启动子序列,并对其进行生物信息学分析,同时对低温胁迫处理下CsCSD1基因的表达模式也进行分析.结果显示,茶树CsCSD1基因cDNA全长860 bp,完整的开放阅读框(ORF)长度为459 bp,共编码152个氨基酸;gDNA基因结构分析发现CsCSD1基因由6个外显子和5个内含子构成;CpG岛预测发现启动子区域内存在1个CpG岛,CpG长度为219bp,GC含量为50.3%;CsCSD1启动子上还存在大量的顺式作用元件,包括光响应元件、激素响应元件、胁迫响应元件和其他响应元件;在低温胁迫下CsCSD1基因的表达模式显示,在低温胁迫前期,CsCSD1基因表达上调;随后CsCSD1基因的表达量不断下降.本研究表明,CsCSD1基因能够响应低温胁迫并在胁迫的不同时期发挥不同的作用,推测与低温胁迫密切相关. 展开更多
关键词 茶树 CSD1基因 低温胁迫 表达分析
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