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发光细菌PB-P3.9的鉴定与gyrB、luxA基因系统发育分析
被引量:
1
1
作者
周明霞
陈勇喆
+2 位作者
王辉
陈智
邓乐
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第15期220-224,共5页
平板划线分离法从猪肉上分离得到一株发光细菌PB-P3.9,依据细菌DNA促旋酶B亚基基因(gyrB)、荧光素酶A基因(luxA)序列比对及构建系统发育树鉴定其种属,并探讨其来源。扩增gyrB、luxA基因并测序,两个基因序列比对结果与发光杆菌属的明亮...
平板划线分离法从猪肉上分离得到一株发光细菌PB-P3.9,依据细菌DNA促旋酶B亚基基因(gyrB)、荧光素酶A基因(luxA)序列比对及构建系统发育树鉴定其种属,并探讨其来源。扩增gyrB、luxA基因并测序,两个基因序列比对结果与发光杆菌属的明亮发光杆菌(Photobacterium phosphoreum)分别有99%、98%的序列相似性,结合其生物学特性,确定PB-P3.9为一株明亮发光杆菌。根据GenBank数据库中明亮发光杆菌标准菌株gyrB、luxA基因序列,采用距离法构建系统发育树,表明PB-P3.9株与标准菌株NCIMB 1279有最近亲缘关系,结合其生长条件,拟确定此发光细菌PB-P3.9来源于海洋深海鱼或中层海水浮游生物。
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关键词
发光细菌
明亮发光杆菌
gyrB
基因
luxa基因
系统发育分析
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职称材料
题名
发光细菌PB-P3.9的鉴定与gyrB、luxA基因系统发育分析
被引量:
1
1
作者
周明霞
陈勇喆
王辉
陈智
邓乐
机构
微生物分子生物学省部共建国家重点实验室培育基地湖南师范大学
长沙市畜禽水产品质量检测中心
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第15期220-224,共5页
基金
长沙市政府专项基金项目(100304)
文摘
平板划线分离法从猪肉上分离得到一株发光细菌PB-P3.9,依据细菌DNA促旋酶B亚基基因(gyrB)、荧光素酶A基因(luxA)序列比对及构建系统发育树鉴定其种属,并探讨其来源。扩增gyrB、luxA基因并测序,两个基因序列比对结果与发光杆菌属的明亮发光杆菌(Photobacterium phosphoreum)分别有99%、98%的序列相似性,结合其生物学特性,确定PB-P3.9为一株明亮发光杆菌。根据GenBank数据库中明亮发光杆菌标准菌株gyrB、luxA基因序列,采用距离法构建系统发育树,表明PB-P3.9株与标准菌株NCIMB 1279有最近亲缘关系,结合其生长条件,拟确定此发光细菌PB-P3.9来源于海洋深海鱼或中层海水浮游生物。
关键词
发光细菌
明亮发光杆菌
gyrB
基因
luxa基因
系统发育分析
Keywords
Photobacterium
Photobacterium phosphoreum
gyrB gene
luxa
gene
phylogenetic analysis
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
发光细菌PB-P3.9的鉴定与gyrB、luxA基因系统发育分析
周明霞
陈勇喆
王辉
陈智
邓乐
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
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职称材料
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