m5C修饰调节因子在泛癌中的作用和潜在抑制剂分析

目的 RNA的5-甲基胞嘧啶(m5C)修饰参与多种生理和病理过程,特别是在肿瘤的发生和发展中。本研究通过泛癌中m5C修饰调节因子分析泛癌中的m5C水平与预后的关系,并探究潜在的m5C抑制药物。方法 从癌症基因图谱(TCGA)数据库下载33种癌症的RNA-Seq数据,使用R软件分析m5C修饰调节因子在癌和癌旁组织中的表达水平。随后,我们通过CMap预测可能抑制泛癌中m5C修饰的潜在药物,并通过m5C dot blot和细胞生长实验验证其抑制作用。结果 在大多数肿瘤类型中,m5C的Writers和Readers都有着明显的高表达,肿瘤组织m5C总体水平高的相较于m5C总体水平低的患者,其总体生存期(OS)显著缩短(P<0.05)。重要的是,预测的m5C抑制药物可以有效抑制癌细胞的总体m5C水平以及增殖。结论 我们的研究表明,在多种癌症类型中,高水平的m5C修饰和m5C修饰调节因子的异常表达与恶性肿瘤密切相关,表明m5C修饰调节因子可能是有希望的预后生物标志物,并可作为癌症治疗的潜在靶点。

RNA m5C修饰与甲基转移酶NSUN2相关研究进展

目的基于当前RNA修饰对细胞生物学功能具有多种调控作用的研究日益受到广泛关注,该文章总结了RNA的5-methlcytosine(m5C)修饰与RNA甲基转移酶NSUN2的相关研究进展。方法查阅并引用近10年来国内外发表的53篇相关文献,从m5C修饰的背景知识、检测方法、NSUN2蛋白的功能、以及与疾病的关联性等方面,将RNA的m5C修饰与NSUN2相关研究进展进行总结归纳。结果与结论NSUN2具有tRNA、mRNA、非编码RNA(ncRNA)m5C修饰活性以及非甲基转移酶活性,与肿瘤和神经系统疾病发生具有一定关联性。靶向NSUN2在疾病治疗中具有潜在的应用价值。

HIF-1α/ALYREF/PKM2信号轴在膀胱癌糖酵解和肿瘤发生中的作用

背景与目的 丙酮酸激酶肌肉同工酶M2(pyruvate kinase muscle isozyme M2,PKM2)是糖酵解的限速酶,参与肿瘤的代谢和生长。PKM2在肿瘤中的调控网络复杂,在膀胱癌中尚未得到充分研究。PKM2 mRNA的5-甲基胞嘧啶(5-methylcytidine,m5C)修饰可能参与了膀胱癌的发病过程,机理有待深入研究。本文旨在探讨PKM2在膀胱癌中的生物学功能及其调控机制。方法 用Western blotting、qRT-PCR和免疫组织化学方法检测PKM2和Aly/REF输出因子(Aly/REF export factor,ALYREF)的表达水平。通过一系列体内实验和体外试验,研究膀胱癌细胞的生物学过程。通过RNA免疫沉淀、RNA测序和双荧光素酶报告分析,探讨PKM2在膀胱癌中的调控机制。结果 在膀胱癌中,我们首次证明了ALYREF稳定了PKM2的mRNA,并与其3’-非翻译区的m5C位点结合。ALYREF过表达通过PKM2介导的糖酵解促进膀胱癌细胞增殖。此外,PKM2和ALYREF高表达与膀胱癌患者生存不佳相关。最后,我们发现缺氧诱导因子1α(hypoxia-inducible factor-1 alpla,HIF-1α)除了直接激活转录,还通过激活ALYREF间接上调PKM2的表达。结论 HIF-1α/ALYREF/PKM2轴上PKM2 mRNA的m5C修饰可能促进了膀胱癌的葡萄糖代谢,为膀胱癌的治疗提供了新的靶点。