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使用蛋白质和mRNA序列信息预测蛋白质亚线粒体定位
1
作者
刘娟娟
李前忠
+1 位作者
闫振河
薛济先
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2017年第1期69-79,共11页
线粒体是很重要的半自主性细胞器,主要为细胞提供能量,还承担了许多其他生理功能,而线粒体的某些功能只有在特定亚线粒体位置中才能实现.对亚线粒体定位的研究有助于进一步了解蛋白质的功能.文章计算了蛋白质的进化信息、同源序列的go...
线粒体是很重要的半自主性细胞器,主要为细胞提供能量,还承担了许多其他生理功能,而线粒体的某些功能只有在特定亚线粒体位置中才能实现.对亚线粒体定位的研究有助于进一步了解蛋白质的功能.文章计算了蛋白质的进化信息、同源序列的go信息、氨基酸指数信息、氨基酸粘性、氨基酸组分、平均化学位移,并结合mRNA序列的三联体频数,利用支持向量机算法和离散增量算法对蛋白质亚线粒体定位进行预测,在jackknife检验下准确率达到97.64%,同时用独立检验也取得较好的结果.
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关键词
亚线粒体定位
同源序列go信息
mrna三联体频数
支持向量机
离散增量
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职称材料
题名
使用蛋白质和mRNA序列信息预测蛋白质亚线粒体定位
1
作者
刘娟娟
李前忠
闫振河
薛济先
机构
内蒙古大学物理科学与技术学院
出处
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2017年第1期69-79,共11页
基金
国家自然科学基金(No.31460234和No.61361015)
文摘
线粒体是很重要的半自主性细胞器,主要为细胞提供能量,还承担了许多其他生理功能,而线粒体的某些功能只有在特定亚线粒体位置中才能实现.对亚线粒体定位的研究有助于进一步了解蛋白质的功能.文章计算了蛋白质的进化信息、同源序列的go信息、氨基酸指数信息、氨基酸粘性、氨基酸组分、平均化学位移,并结合mRNA序列的三联体频数,利用支持向量机算法和离散增量算法对蛋白质亚线粒体定位进行预测,在jackknife检验下准确率达到97.64%,同时用独立检验也取得较好的结果.
关键词
亚线粒体定位
同源序列go信息
mrna三联体频数
支持向量机
离散增量
Keywords
submitochondria location
gene ontology of homologous sequence
frequency of
mrna
triplet code
support vector machine
increment of diversity
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
使用蛋白质和mRNA序列信息预测蛋白质亚线粒体定位
刘娟娟
李前忠
闫振河
薛济先
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2017
0
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