鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体分析

NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的1个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.本研究对CNE2细胞所表达的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体克隆、鉴定,发现NPCEDRG基因至少有7个转录起始位点,其中NM_032316的TSS位于ATG上游-85 nt处,AF538150和AK094248的TSS位于-25 nt处;AF538150不存在第2外显子中6核苷酸序列(3'-TTGCAG-3')的缺失,其CDs为516 bp,编码1种由171个氨基酸组成的蛋白质(而非GenBank中公布的CDs为510 bp,1种由169个氨基酸组成的蛋白质).本研究成功克隆得到1种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体V2,其TSS位于-23 nt处,其CDs为297 bp,编码1种由98个氨基酸组成的蛋白质.

雌激素受体α的突变mRNA在乳腺癌肿瘤组织及癌旁正常组织中的表达

为检测正常乳腺组织及乳腺癌组织中野生型雌激素受体α不同mRNA突变体ERC_4、ERD_3、ERD_5mRNA的表达,采用巢式逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测技术,对18例乳腺癌患者正常乳腺组织及乳腺癌组织中野生型雌激素受体α不同mRNA突变体进行检测。结果:在ER阳性/PR阳性组中,ERC_4mRNA在肿瘤组织中的表达比正常组织中明显增高;在肿瘤组织中,ERD_3mRNA的表达比相邻的正常组织中的表达有降低的倾向,但仅在ER阳性组中有统计学显著性差异;乳腺癌组织中ERD5mRNA的表达比相应的正常乳腺组织显著升高;在乳腺癌的发生过程中,ERα突变体mRNA的表达失控。

一个新的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体的克隆及鉴定

目的:克隆并鉴定NPCEDRG基因mRNA剪接变异体。方法:利用5'-RACE、3'-RACE在CNE2细胞中对NPCEDRG基因mRNA剪接变异体进行扩增,T/A克隆入pMD20载体,所获得的阳性重组子经测序证实。结果:成功克隆得到一种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体V2,其TSS位于-23 nt处,其CDs为297 bp,编码一种由98个氨基酸组成的蛋白质,其分子量为10.4 kD,等电点为7.1。结论:利用5'-RACE、3'-RACE等技术成功克隆得到一种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体,为阐述NPCEDRG基因在鼻咽癌发生发展中的可能作用提供线索。