利用mRNA差异显示技术(DDRT-PCR)研究大豆抗疫霉根腐病的分子机制

文章以中国优良大豆品种东农46及大豆疫霉优势生理小种1号菌株为材料,利用mRNA差异显示技术研究东农46与大豆疫霉根腐病菌非亲和互作中前后基因表达的差异,寻找并分离出与大豆疫霉根腐病抗病性相关的9条cDNA片段,通过这些差异片段的序列分析进一步阐述大豆对疫霉根腐病菌的分子抗病机制。

单个植入前胚胎mRNA差异显示方法的建立

在已有的研究基础上 ,优化和建立了单个植入前胚胎的mRNA差异显示 (singlepreimplantationembryodifferentialdisplaypolymerasechainraction ,SPEDDRT PCR) .以小鼠单个成熟的卵母细胞和单个的 2细胞期胚胎作为起始材料 ,比较二者之间基因的表达差异 .选择在卵母细胞中不表达而在 2细胞期表达的差异片段 .进行GenBank检索和表达序列标签 (EST)库电子克隆 .与多胚研究方法一样 ,由线粒体编码的和 2细胞特异表达的NADH脱氢酶亚单位 2和ATPase 6证实了SPEDDRT PCR方法是可行而且可靠的 ,是一种需要材料极少。

降低mRNA差异显示技术假阳性率的一种方法

为了探讨降低mRNA差异显示技术假阳性率的方法 ,进一步提高此技术的可靠性 ,提取了手术切除肝癌及非癌肝组织成对标本的总RNA ,逆转录获得cDNA片段 ,以mRNA差异显示方法筛选差异表达基因 ,选取较明显的一条差异表达条带 ,行进一步PCR扩增 .分别对PCR产物及其经TA克隆后随机挑选的 6个单克隆质粒DNA进行序列分析 ,并通过GenBank BLAST数据库进行序列的同源性比较 ,以Northern杂交予以来源确认 .自 72 0余条扩增条带中共选出 2 8条差异条带 .序列分析及同源性比较表明 ,所选择条带的PCR产物为一可能的新基因片段 ;而随机选择的 6个TA克隆质粒DNA中 ,有 4个为同一已知基因片段 ,一个为另一已知基因片段 ,一个为一可能的新基因片段 .同源性比较表明 ,PCR产物直接测序所得序列与TA克隆质粒DNA的 6个片段不具同源性 .结果表明 ,mRNA差异显示条带可能由 1条以上分子量相似的片段构成 ,直接对PCR产物行序列分析并以其为探针进行Northern杂交 ,是导致出现假阳性片段的原因之一 .将PCR产物进行TA克隆 ,对单克隆质粒DNA进行序列分析并以其为探针进行Northern杂交 ,可能是解决此问题的一种较好方法 .

mRNA差异显示技术中差异条带的回收与再扩增

目的：对来源于两种或两种以上组织的ＲＮＡ经反转录和ＰＣＲ后进行比较。方法：采用ｍＲＮＡ差异显示过程中差异条带的回收与再扩增的方法。结果：直接将切下的凝胶条简单洗涤和碾碎后制备的再扩增模板比传统的糖原沉淀法简单有效。结论：再扩增过程中将３０循环的低退火温度的ＤＤＰＣＲ和２０循环的严格条件的ＰＣＲ结合，能获得较高的再扩增效率。

用mRNA差异显示技术分离盐胁迫下小麦耐盐相关cDNA

目的用mRNA差异显示技术分离小麦盐胁迫应答cDNA,为进一步研究小麦耐盐机理奠定基础。方法将小麦(Triticum aesticum L.)耐盐品系宝丰7228r种子分别置于含NaC l 0‰和12‰的Hoagland培养液中生长,7d后分别取叶片,提取总RNA并分离出其中的mRNA,通过锚锭引物O ligo dT10GC反转录和9个10核苷酸随机引物进行PCR扩增。结果DDRT-PCR结果显示,有4个差异DNA片段只在盐胁迫的小麦耐盐品系基因组中表达,而在对照中没有出现。这4个差异cDNA片段分别命名为ts01(260 bp),ts02(330 bp),ts03(420 bp),ts04(600 bp)。4个差异cD-NA片段的RNA杂交结果显示,只有ts04存在明显差异,在盐胁迫条件下有杂交斑点而在对照中没有杂交斑点,其余3个cDNA片段在盐胁迫和对照中都没有杂交斑点。进一步将ts04克隆并进行DNA序列测定及同源性分析。结论ts04可能是耐盐相关cDNA片段,该片段核酸序列与麦属抗性相关的肌动蛋白基因有23%同源。

银染mRNA差异显示方法的条件优化

ｍＲＮＡ差异显示技术是分离差异表达基因的强有力工具。本工作旨在优化无同位素的银染差异显示方法。以总ＲＮＡ为模板，用锚定引物与随机引物的组合进行ＲＴ－ＰＣＲ反应，ＰＣＲ扩增产物在变性的聚丙烯酰胺凝胶上电泳。用银染方法显示电泳ｃＤＡＮ条带，其结果是：（１）ＲＮＡ加入量为１～３μｇ，ＲＴ－ＰＣＲ反应能扩增出较多的ｃＤＮＡ条带，而低于０．５μｇ时扩增条带数目较少；（２）在３６～４２℃的范围内，随着温度的增加，扩增的条带减少；而４２℃时扩增的条带数目锐减，特别是当ＲＮＡ加入量小于１μｇ时几乎无条带显示；３６℃扩增的条带过多而趋于ｓｍｅａｒ；（３）优化了银染液程序，染色液和显色液中３７％甲醛的量分别为０．０３％～０．０５％和０．０７５％～０．１％，显色温度４～１２℃时，显示出清晰的条带；（４）用此方法获得数条电针镇痛有效与无效大鼠表达差异的ｃＤＮＡ条带。总之，通过改变参数条件，优化了快速简便的银染ｍＲＮＡ差异显示方法。

彩色马蹄莲mRNA差异显示技术体系的建立

本研究以彩色马蹄莲品种‘Majestic Red’的新鲜叶芽和花芽为试验材料,提取总RNA,选择3种锚定引物(HT11A,HT11C和HT11G)经反转录成cDNA,再将3种锚定引物和34个随机引物(HAP1-HAP34)组成引物对,对cDNA进行差异显示PCR扩增,将扩增产物选用6%的变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳后银染,得到了比较清晰的差异条带,经过回收以及重扩增验证后,获得了差异基因片段,初步形成了彩色马蹄莲mRNA差异显示技术,有助于进一步分析彩色马蹄莲成花的分子机理。

用mRNA差异显示技术分析中华绒螯蟹早期发育的基因表达

用中华绒螯蟹(Eriocheirsinensis)未受精卵、受精卵、二细胞胚、囊胚、原肠胚为材料 ,提取总RNA ,分别用OligodT12GA、GC、AC3种锚定引物合成以上5种材料的cDNA第一链 ,然后以此cDNA为模板用30种随机引物进行PCR扩增 ,琼脂糖凝胶电泳分析。得到了5个早期发育的特异表达片段。结果表明 ,未受精卵、受精卵、二细胞胚之间的差异不大 ,都表现为母型调控 ,囊胚期有新mRNA的转录 ,开始进入合子型调控。

萝卜总RNA提取与mRNA差异显示技术

以萝卜幼小花药与叶片为材料,初步建立了mRNA差异显示技术体系.4种提取总RNA方法中,改进的SDS/酸酚法比CTAB/酸酚法和SDS/碱酚法更合适;改进的热硼酸法(HB)提取的RNA质量也较高,但所需时间较长,成本较高.以改进的SDS/酸酚法获得的RNA进行纯化后,其OD260/OD280在2.0～2.2之间,表明RNA样品杂质较少;总RNA进行反转录与差异显示分析表明,高分辨力的cDNA片段在100～380 bp之间.

mRNA差异显示阳性cDNA克隆的快速筛选与鉴定

建立了一种快速筛选差异显示阳性ｃＤＮＡ 克隆的方法， 该方法利用两轮Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｎｏｒｔｈｅｒｎ 杂交，结合质粒酶切图谱分析，从３０个ＤＤＲＴ差异ｃＤＮＡ片段中筛选鉴定出两个阳性ｃＤＮＡ克隆， 对其中一个克隆进行的Ｎｏｒｔｈｅｒｎ 分析证实了筛选方法的可靠性。

mRNA差异显示技术中特异条带回收方法的比较

目的:建立简化的mRNA差异显示技术中特异条带的回收方法。方法:用单个小鼠早期发育的胚胎构建mRNA差异显示技术,用一步法和煮沸法分别从银染的聚丙烯酰胺凝胶中回收差异显示的特异条带,并进行再扩增、回收、克隆及酶切鉴定。结果:两种不同的回收方法经过mRNA差异显示技术程序环节,证明其具有相同的实验效果。结论:应用简化的一步法和煮沸法对单胚构建的mRNA差异显示技术中的特异条带进行回收,具有有效性和可靠性。

荧光标记mRNA差异显示法研究中药对肝星状细胞基因表达的影响

目的 :用荧光标记 m RNA差异显示方法研究抗纤维化中药作用于肝星状细胞过程中基因表达的变化。方法 :分离培养肝星状细胞 (HSC) ,分别由正常大鼠血清和中药大鼠血清处理 HSC,用荧光标记 m RNA差异显示方法分离中药血清抑制或者诱导 HSC表达的特异基因。结果 :用荧光标记 m RNA差异显示方法共分离得到 c DNA差异片段 4 5条。结论 :荧光标记 m RNA差异显示方法是一种快速、敏感。

银染mRNA差异显示法的建立及其应用

以银染 m RNA差异显示方法对原发及转移灶胃癌标本总 RNA为研究对象进行银染差示分析和回收差异条带 ,从中获得系列差异表达片段 .随机选取 5个从原发性胃癌样品回收的表达条带 ,以取自体外培养胃癌细胞株的 RNA进行点杂交验证 ,均被证实为真实带 .对 2个差异表达片段进行分析、测序和 Gen Bank同源比较结果表明 :MGD1片段与肿瘤转移相关基因 MTA1完全同源 ,属胃癌转移相关基因 ;PGD2与胃癌转移抑制相关 ,并与细胞周期抑制蛋白 p2 7/ Kip1具 99%的同源性 .结果表明 ,银染差异显示法具有快速、直观、假阳性率低等优点 。

银染mRNA差异显示方法在致突变实验中的初步应用

为建立在药物致突变研究中应用银染 m RNA差异显示的方法 ,试验提取未经过 /经过环磷酰胺处理的 Balb/c小鼠肝组织的总 RNA ,并以此为模板 ,采用 d T1 2 CG、d T1 2 AG、d T1 2 GG为锚定引物 ,通过反转录、差异显示 PCR反应 ,以 6 %变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离差异条带 ,回收后将其再扩增。结果表明 ,RNA投入量为 3μg、镁离子浓度为 1.5～ 2 .0 mm ol/L、退火温度为 4 0℃时 ,扩增的片段条带清晰、背景低 ,差异条带明显 ,再扩增条带单一。银染 m RNA差异显示技术可成功应用于药物致突变的研究。

mRNA差异显示技术在分离水稻基因中的应用

mRNA差异显示技术是分子生物学中分离g隆基因的有效技术。笔者叙述了mRNA差异显示技术的基本原理、存在的问题以及技术改进, 并主要阐述了该技术在分离水稻基因中的应用情况。

mRNA差异显示技术及其在植物生理研究中的应用

简述了 m RNA差异显示技术的基本原理及其在基因表达差异、基因的鉴定与克隆、激素调控机理、抗逆性机理等方面的应用 。