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鸡传染性支气管炎病毒国内分离株D971 mRNA_3和mRNA_4 cDNA的分子特征 被引量:4
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作者 刘玉芬 刘胜旺 +2 位作者 荣骏弓 孔宪刚 刘宝全 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期122-125,共4页
参照已发表的鸡传染性支气管炎病毒 (infectious bronchitis virus,IBV)基因序列 ,设计合成了 1对引物 ,经 RT-PCR扩增得到了 IBV国内分离株 D971约 1.3kb的片段 ,其中包含 3a、3b、E及 M蛋白基因的完整 ORF,并将该片段进行了克隆和序... 参照已发表的鸡传染性支气管炎病毒 (infectious bronchitis virus,IBV)基因序列 ,设计合成了 1对引物 ,经 RT-PCR扩增得到了 IBV国内分离株 D971约 1.3kb的片段 ,其中包含 3a、3b、E及 M蛋白基因的完整 ORF,并将该片段进行了克隆和序列测定。与国内外部分 IBV毒株序列比较表明 :D9713a基因与 CU- T2、D14 6 6、DE0 72、M4 1、GA/99和 UK/6 6的 3a基因核苷酸序列同源性在 83%~ 89%之间 ,氨基酸序列同源性为 77%~ 91% ,其中与 CU- T2毒株的同源性最低 (分别为 83%和 77% ) ;3b基因与上述毒株的对应核苷酸序列同源性在 85 %~ 95 %之间 ,氨基酸序列同源性为 72 %~ 96 % ,与 CU- T2的同源性最高 (分别为 95 %和 96 % ) ;E蛋白基因与 CU- T2、D14 6 6、DE0 72、M4 1、Ark99、H5 2、Gray、GA/99和 UK/6 6的核苷酸序列同源性在 81%~ 86 %之间 ,氨基酸序列同源性为 74 %~ 80 %。不同毒株推导的 E蛋白 C末端表现不同特征 ,其中 D971E蛋白 C末端比 CU- T2的对应区多 9个氨基酸残基 ,而比本试验选用的其他参考毒株的相应区域短 5~ 7个氨基酸残基。M基因与 CU - T2、DE0 72、Gray、M4 1、H12 0、H5 2、SD/97/0 2、L X4及D4 1的 M基因核苷酸序列同源性在 86 %~ 91%之间 ,氨基酸序列同源性为 85 %~ 95 % ,其? 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 国内分离株 MRNA cdna 分子特征
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无蹼壁虎EMC3基因cDNA全长克隆与进化分析
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作者 夏龙杰 吴海霞 +2 位作者 时昕晔 严洁 李鹏 《天津师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2023年第3期26-34,共9页
为了探究无蹼壁虎(Gekko swinhonis)EMC3基因(命名为GsEMC3)的序列特征,了解GsEMC3蛋白的结构和功能,探讨GsEMC3蛋白与其他物种EMC3蛋白的进化关系,采用SMART RACE技术克隆获得了GsEMC3的全长cDNA序列,通过信息学分析阐明了GsEMC3基因... 为了探究无蹼壁虎(Gekko swinhonis)EMC3基因(命名为GsEMC3)的序列特征,了解GsEMC3蛋白的结构和功能,探讨GsEMC3蛋白与其他物种EMC3蛋白的进化关系,采用SMART RACE技术克隆获得了GsEMC3的全长cDNA序列,通过信息学分析阐明了GsEMC3基因的序列特征以及GsEMC3蛋白的结构和功能,系统发育和选择压力分析研究了GsEMC3的进化特征.GsEMC3基因的cDNA全长为1023 bp,包含1个786 bp的开放阅读框,基因编码1个含261个氨基酸的多肽.GsEMC3蛋白的相对分子质量约为30.074×10^(3),理论等电点为5.57.生物信息学分析表明,无蹼壁虎GsEMC3为疏水性非分泌型蛋白,有2个跨膜区,可能是一个动态定位的蛋白,无信号肽,直接在细胞内发挥作用.其分子量与已知的其他物种的EMC3蛋白相近.GsEMC3蛋白含有1个DUF106结构域,二级结构包含12个α-螺旋、1个β-折叠、13个无规则卷曲.系统发育分析表明,无蹼壁虎GsEMC3蛋白序列与美国短吻鳄(Alligator mississippiensis)、安乐蜥(Anolis carolinensis)、绿海龟(Chelonia mydas)、科莫多巨蜥(Varanus komodoensis)等爬行动物的EMC3蛋白序列高度同源.选择压力分析表明,无蹼壁虎的GsEMC3蛋白受到纯化选择,其功能可能高度保守. 展开更多
关键词 无蹼壁虎 GsEMC3基因 cdna 序列分析 选择压力
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中国对虾抗菌肽成熟肽的cDNA克隆 被引量:19
3
作者 康翠洁 王金星 +1 位作者 赵小凡 相建海 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期552-556,565,共6页
利用RT -PCR、嵌套PCR(NestedPCR)和 3′ -RACE等方法 ,从中国对虾血细胞中克隆到 1种抗菌肽基因片段 ,称为中国对虾肽 (Chp)基因 .此基因片段长 5 4 3bp ,开读框共有 15 6个碱基 ,编码 5 2个氨基酸 .该基因所编码的氨基酸序列对应于凡... 利用RT -PCR、嵌套PCR(NestedPCR)和 3′ -RACE等方法 ,从中国对虾血细胞中克隆到 1种抗菌肽基因片段 ,称为中国对虾肽 (Chp)基因 .此基因片段长 5 4 3bp ,开读框共有 15 6个碱基 ,编码 5 2个氨基酸 .该基因所编码的氨基酸序列对应于凡那对虾抗菌肽成熟肽的序列 ,与其一致性为5 2 - 5 9% ,相似性为 61- 73% ,分子量为 5 65 2 .4Da ,理论等电点为 9.76,带正点荷的氨基酸 (Arg -Lys)为 8个 ,不含带负电荷的氨基酸 .上述这些特征 (分子量较小 ,带正点荷 )均为抗菌肽的普遍特征 . 展开更多
关键词 抗菌肽 cdna克隆 嵌套PCR 3'-RACE 中国对虾
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烟草Ⅰ类几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶cDNA植物双价表达载体的构建及转化番茄的研究 被引量:10
4
作者 李继红 邵寒霜 +2 位作者 郑楷 胡东琼 郑学勤 《热带作物学报》 CSCD 1999年第1期29-33,共5页
将烟草中经修饰的Ⅰ类几了质酶和β-1,3-葡聚糖酶cDNA分别加上CaMV35S启动子和NOS终止子,依次插入到同一植物表达载体pBin19上,获得植物双价表达载体pCG-Ⅱ。然后载体pCG-Ⅱ以土壤农杆菌LBA4404介导转化番茄,再生植株的点杂交及... 将烟草中经修饰的Ⅰ类几了质酶和β-1,3-葡聚糖酶cDNA分别加上CaMV35S启动子和NOS终止子,依次插入到同一植物表达载体pBin19上,获得植物双价表达载体pCG-Ⅱ。然后载体pCG-Ⅱ以土壤农杆菌LBA4404介导转化番茄,再生植株的点杂交及PCR扩增证明两种cDNA已随T-DNA同时导入番茄植株中。 展开更多
关键词 几丁质酶 cdna β-1 3-葡聚糖酶 cdna 载体构建
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一步PCR快速扩增辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA3′末端序列(英文) 被引量:11
5
作者 李秋莉 高晓蓉 +2 位作者 袁晓东 刘大伟 安利佳 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期179-181,共3页
根据已获得的辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA的部分序列 ,设计一条基因特异性引物 ,与通用引物并用 ,一步PCR成功地克隆了辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA 3′末端。与常规的 3′RACE法相比 ,一步PCR法具有快速、简便、经济等优点 ,是一种非常... 根据已获得的辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA的部分序列 ,设计一条基因特异性引物 ,与通用引物并用 ,一步PCR成功地克隆了辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶cDNA 3′末端。与常规的 3′RACE法相比 ,一步PCR法具有快速、简便、经济等优点 ,是一种非常快捷的扩增cDNA 展开更多
关键词 一步PCR 辽宁碱蓬 甜菜碱醛脱氢酶 3′cdna末端 快速扩增
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黄孢原毛平革菌酵母双杂交cDNA文库的构建及应用 被引量:3
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作者 胡国库 颜永红 +3 位作者 姜权 吴波 冯红 张义正 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期678-682,共5页
作为研究木质素降解系统的模式微生物黄孢原毛平革菌,迄今还没有蛋白-蛋白相互作用方面的报道.本研究利用酵母双杂交技术构建了低氮培养基中培养2d和3d的酵母双杂交cDNA文库,分别得到2.5×105和3.0×105个重组子.以14-3-3蛋白... 作为研究木质素降解系统的模式微生物黄孢原毛平革菌,迄今还没有蛋白-蛋白相互作用方面的报道.本研究利用酵母双杂交技术构建了低氮培养基中培养2d和3d的酵母双杂交cDNA文库,分别得到2.5×105和3.0×105个重组子.以14-3-3蛋白为钓饵筛选3d cDNA文库,在SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp缺陷培养基平板上共获得了约600个单克隆,进一步分析发现,有30个克隆可激活3个报告基因.分离自这些克隆中的质粒DNA能转化大肠杆菌.利用HaeⅢ和Sau3AⅠ限制酶切分析可将它们分为4类.序列测定和同源分析结果表明,其中一类为14-3-3蛋白基因,提示14-3-3蛋白可形成二聚体,另外3类在GenBank没有明显同源的基因.通过SBASE网站预测,编号为Y2H333的克隆含有一个OB-fold核酸结合结构域(OB-fold nucleic acid binding domain).这些研究结果表明,所构建的黄孢原毛平革菌cDNA酵母杂交文库是成功的,14-3-3蛋白在黄孢原毛平革菌中能以蛋白-蛋白相互作用的形式发挥功能. 展开更多
关键词 黄孢原毛平革菌 酵母双杂交 cdna文库 14-3-3蛋白
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杜氏盐藻GAPDH cDNA的克隆鉴定及其启动子功能表达载体的构建 被引量:4
7
作者 贾岩龙 牛杰 +2 位作者 贾俊英 邱乐乐 薛乐勋 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期106-110,共5页
根据藻类甘油醛3-磷酸脱氢酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)氨基酸高度保守序列设计简并引物,采用5′,3′-RACE和巢式PCR的方法,得到了杜氏盐藻(Dunaliella salina)GAPDH cDNA全长序列。序列同源性比较和进化树等生... 根据藻类甘油醛3-磷酸脱氢酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)氨基酸高度保守序列设计简并引物,采用5′,3′-RACE和巢式PCR的方法,得到了杜氏盐藻(Dunaliella salina)GAPDH cDNA全长序列。序列同源性比较和进化树等生物信息学分析结果表明,根据获得的盐藻GAPDH的核酸序列推导的氨基酸序列与其他已知物种的GAPDH有较高的同源性。定向克隆于原核表达载体的盐藻GAPDHcDNA在大肠杆菌中以融合蛋白的形式得到了高效表达,并成功构建了由盐藻GAPDH基因启动子驱动的cat(氯霉素乙酰转移酶)基因表达载体pUCGCat,为进一步研究杜氏盐藻GAPDH基因和启动子功能奠定了试验基础。 展开更多
关键词 杜氏盐藻 甘油醛3-磷酸脱氢酶 cdna 启动子
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星星草cDNA文库构建和金属硫蛋白(MT-1)基因的克隆 被引量:10
8
作者 刘桂丰 褚延广 +2 位作者 王玉成 侯英杰 杨传平 《植物生理学通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期424-428,共5页
以受NaHCO3胁迫后的星星草叶片组织为材料构建了cDNA文库,文库的初始滴度为2.0×106pfu,重组率为95%,平均插入片段长度为0.8kb,扩增后文库的滴度为4.0×109pfu·mL-1。文库克隆随机测序获得了星星草的金属硫蛋白(MT-1)基因... 以受NaHCO3胁迫后的星星草叶片组织为材料构建了cDNA文库,文库的初始滴度为2.0×106pfu,重组率为95%,平均插入片段长度为0.8kb,扩增后文库的滴度为4.0×109pfu·mL-1。文库克隆随机测序获得了星星草的金属硫蛋白(MT-1)基因的全长cDNA序列,显示文库中含有一定量的全长基因。MT-1基因全长622bp,其中5'非翻译区57bp,3'非翻译区343bp,开放读码框长222bp,编码73个氨基酸,氨基酸序列中具有植物MT-1蛋白特有的金属响应元件(MRE)序列,MT-1蛋白的分子量为7.814kD,理论等电点为4.72。 展开更多
关键词 星星草 cdna文库 NAHCO3胁迫 金属硫蛋白 文库构建 全长基因 克隆 全长cdna序列 氨基酸序列 NaHCO3
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高等植物F3′HcDNA及其氨基酸序列的生物信息学分析 被引量:4
9
作者 苏丽 赵昶灵 +2 位作者 杨晓娜 李会容 李云 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期316-326,共11页
用生物信息学方法对GenBank中拟南芥、油菜、大豆、矮牵牛和高梁等的类黄酮3′-羟化酶基因的cD-NA序列及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、功能域和进化关系进行了初步预测和分析。... 用生物信息学方法对GenBank中拟南芥、油菜、大豆、矮牵牛和高梁等的类黄酮3′-羟化酶基因的cD-NA序列及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、功能域和进化关系进行了初步预测和分析。结果表明:不同植物类黄酮3′-羟化酶基因cDNA序列的相似性为69.5%,其起始密码子均为ATG,终止密码子均为TAA、TAG或TGA,包括5,′3′非翻译区和一个开放阅读框;不同植物类黄酮3′-羟化酶基因cDNA序列编码的氨基酸序列的理化性质基本一致,相似性为72.5%,含有6段保守氨基酸序列,是"PPGR"、"AGTDT"、"RPPN"、"AYNY"、"IKALLL"、"TPLS";在进化关系上可划分为两大类;不同植物类黄酮3′-羟化酶具有一个跨膜结构域、定位于内质网上,并有一段与细胞色素P450功能区相匹配的功能域;类黄酮3′-羟化酶属具转运肽的亲水性稳定分泌蛋白,其二级结构为α-β型,α-螺旋和无规卷曲为最主要的结构元件,延伸链和β-转角散布于整个结构。可为类黄酮3′-羟化酶基因的克隆和遗传操作提供理论参考。 展开更多
关键词 高等植物 类黄酮3′-羟化酶基因 cdna序列 氨基酸序列 生物信息学分析
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不同抗冷性水稻中编码甘油-3-磷酸转酰酶的部分cDNA的序列比较研究 被引量:14
10
作者 刘继梅 陈善娜 +2 位作者 鄢波 黄兴奇 杨明挚 《云南植物研究》 CSCD 2000年第3期317-321,共5页
采用RT -PCR技术 ,以根据国外报道的几种双子叶植物的甘油 - 3-磷酸转酰酶的相对保守的氨基酸序列而设计的简并引物作为扩增引物 ,从不同抗冷性水稻品种中均扩增到一段约 315bp的cDNA片段。测序结果表明它们都是编码GPAT的部分cDNA ,含... 采用RT -PCR技术 ,以根据国外报道的几种双子叶植物的甘油 - 3-磷酸转酰酶的相对保守的氨基酸序列而设计的简并引物作为扩增引物 ,从不同抗冷性水稻品种中均扩增到一段约 315bp的cDNA片段。测序结果表明它们都是编码GPAT的部分cDNA ,含有 315个核苷酸 ,编码 10 5个氨基酸。比较它们之间的核苷酸及推导氨基酸序列 ,发现有一定差异 ,且抗冷性相差越大的品种间差异越大。抗冷性的差异可能与脯氨酸的替换有关。 展开更多
关键词 甘油-3-磷酸转酰酶 cdna序列比较 抗冷性 水稻
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大鲵皮肤cDNA文库构建及Arpc5l基因cDNA序列和组织表达分析 被引量:6
11
作者 王立新 郑尧 +2 位作者 艾闽 杨辉 杨朝霞 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期273-281,共9页
以健康大鲵背部皮肤为材料,采用Smart技术构建大鲵皮肤cDNA文库,经检测文库容量为1.50×106cfu,文库重组率为98%,插入片段平均长度约为1 kb.通过对大鲵皮肤cDNA文库的随机筛选,分离获得了大鲵肌动蛋白相关2/3复合物亚基-5样蛋白(Arp... 以健康大鲵背部皮肤为材料,采用Smart技术构建大鲵皮肤cDNA文库,经检测文库容量为1.50×106cfu,文库重组率为98%,插入片段平均长度约为1 kb.通过对大鲵皮肤cDNA文库的随机筛选,分离获得了大鲵肌动蛋白相关2/3复合物亚基-5样蛋白(Arp2/3 complex subunit 5-like,Arpc5l)基因cDNA序列.生物信息学分析表明,大鲵Arpc5l基因全长cDNA为699 bp,包含459 bp的开放阅读框,分子量为17 154.36,等电点(pI)为5.43;该基因编码的Arpc5l蛋白分别在7-29 AA处和44-66 AA处具有跨膜结构域及多种二级结构,且三级结构与Arp2/3 complex家族成员相似.实时定量PCR结果表明,该基因在大鲵皮肤、肌肉、肠、肝、脾、肺、胃以及肾等组织中广泛表达,且在肾、肠、肌肉中的表达量极显著高于其它组织(P<0.01).进化分析结果表明,大鲵Arpc5l氨基酸序列和小鼠(77%)等陆生动物同源性最高,和爪蟾同源性为73%,大鲵处于水生到陆生之间的过渡类型,且与陆生动物的亲缘关系更近. 展开更多
关键词 大鲵 皮肤cdna文库 大鲵肌动蛋白相关2/3复合物亚基-5样蛋白(Arpc5l)基因 组织表达 进化关系
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异育银鲫Toll样受体3的cDNA序列分析与蛋白质高级结构预测 被引量:3
12
作者 钱曦 黄旭雄 +2 位作者 华雪铭 冷向军 周洪琪 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期190-199,共10页
利用RT-PCR、RACE及克隆等方法获得了异育银鲫Toll样受体3(cagTLR3)基因全长cDNA序列。该cDNA全长3170bp,5′端非编码区181bp;3′端非编码区283bp;开放阅读框(ORF)2706bp,编码901个氨基酸。经序列同源性分析显示,其编码的氨基酸序列与... 利用RT-PCR、RACE及克隆等方法获得了异育银鲫Toll样受体3(cagTLR3)基因全长cDNA序列。该cDNA全长3170bp,5′端非编码区181bp;3′端非编码区283bp;开放阅读框(ORF)2706bp,编码901个氨基酸。经序列同源性分析显示,其编码的氨基酸序列与金鱼、斑马鱼、斑点叉尾、虹鳟和红鳍东方有较高的相似性,其相似性分别为92%、88%、79%、75%和72%,说明TLR3在长期的进化中具有较高保守性。TLR3全长序列起始21个氨基酸残基为信号肽;50至695个氨基酸残基间包含15个富含亮氨酸的重复序列(LRR);704至726个氨基酸残基为跨膜区(TM);754至897个氨基酸残基为与白介素-1受体高度同源的区域(TIR)。将异育银鲫TLR3与人和斑马鱼胞内TIR结构的氨基酸比对后发现,Phe728、Leu738、Tyr756与Arg736在TLR3的信号转导及胞内定位过程中起到关键作用。异育银鲫TLR3胞外配体结合域的三维结构呈U型,与人TLR3的相应结构十分相似,在N端具有1个二硫键,C端有2个。因LRRs上的插入序列和14个糖基化位点,异育银鲫TLR3胞外配体结合域内表面的大量β-折叠结构呈平坦的平面。 展开更多
关键词 异育银鲫 TOLL样受体3 cdna末端快速扩增 序列分析 蛋白结构预测 生物信息学
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小鼠补体C3d分子cDNA的克隆及鉴定 被引量:7
13
作者 邹强 郑萍 +3 位作者 杨桦 郭波 万瑛 孟祥贵 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期227-229,共3页
目的 获得小鼠C3d分子的cDNA。方法 从小鼠肝细胞提取总RNA ,通过RT PCR扩增出C3d分子的cDNA ,琼脂糖凝胶电泳鉴定后直接克隆到pMD1 8 T载体 ,构建C3d pMD1 8 T重组质粒 ,转化大肠杆菌 ,酶切鉴定后进行序列测定。结果 通过琼脂糖凝... 目的 获得小鼠C3d分子的cDNA。方法 从小鼠肝细胞提取总RNA ,通过RT PCR扩增出C3d分子的cDNA ,琼脂糖凝胶电泳鉴定后直接克隆到pMD1 8 T载体 ,构建C3d pMD1 8 T重组质粒 ,转化大肠杆菌 ,酶切鉴定后进行序列测定。结果 通过琼脂糖凝胶电泳证明有 1 .0kb左右的PCR扩增片段 ,序列测定表明为C 3d分子的cDNA。结论 通过RT PCR法从小鼠肝细胞RNA中成功地扩增到小鼠C3d分子的cDNA 。 展开更多
关键词 小鼠 补体 C3d分子 cdna 克隆 鉴定
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燕麦β-1,3-葡聚糖酶Ⅱ基因3′端cDNA的克隆及分析 被引量:3
14
作者 何江峰 韩冰 +2 位作者 郭慧琴 张占雄 赵雅丽 《生物技术》 CAS CSCD 2007年第1期5-8,共4页
实验利用3'-RACE技术进行燕麦β-1,3-葡聚糖酶Ⅱ(Oglc13Ⅱ)3'末端cDNA的快速扩增并进行序列分析.将0.01%的HgCl2诱导处理24h之后的燕麦(Avena Sativa)幼叶作为材料,利用RT-PCR技术得到Oglc13Ⅱ的部分cDNA片段,根据此片 段设计一... 实验利用3'-RACE技术进行燕麦β-1,3-葡聚糖酶Ⅱ(Oglc13Ⅱ)3'末端cDNA的快速扩增并进行序列分析.将0.01%的HgCl2诱导处理24h之后的燕麦(Avena Sativa)幼叶作为材料,利用RT-PCR技术得到Oglc13Ⅱ的部分cDNA片段,根据此片 段设计一条特异性上游引物,反转录引物中的部分序列即3'sites Adaptor Primer作为下游引物,按3'RACE试剂盒(Takara)操作流程进行Oglc13Ⅱ3'末端cDN A的快速扩增,成功获取837bp的3'-RACE反应产物,通过BLAST技术,发现该片段与 许多植物β-1,3-葡聚糖酶基因具有较高的相似性(50.0%~72.0%).因此认为成功 克隆了Oglc13ⅡcDNA的3'末端序列. 展开更多
关键词 β-1 3-葡聚糖酶Ⅱ基因 RT-PCR 3'RACE cdna
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小鼠ZnT3 cDNA片断的克隆及其mRNA表达 被引量:5
15
作者 龙建纲 王福俤 +3 位作者 陈坚 沈慧 王海明 张元勋 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期103-105,共3页
为了解ZnT3 (zinctransporter3 )mRNA在小鼠各组织中的表达状况 ,用反转录多聚酶链反应法 (RT PCR)克隆ZnT3cDNA片断 ,荧光标记的全自动测序法确定ZnT3cDNA片断的碱基顺序 ,RT PCR法检测小鼠各组织ZnT3mRNA表达并比较在组织中的表达量... 为了解ZnT3 (zinctransporter3 )mRNA在小鼠各组织中的表达状况 ,用反转录多聚酶链反应法 (RT PCR)克隆ZnT3cDNA片断 ,荧光标记的全自动测序法确定ZnT3cDNA片断的碱基顺序 ,RT PCR法检测小鼠各组织ZnT3mRNA表达并比较在组织中的表达量。结果 :RT PCR获得单一条带的片断 ,其大小 70 0bp ,碱基顺序与文献报道序列一致 ;在大脑皮层、海马和睾丸中检测到ZnT3mRNA表达 ,其中睾丸中表达量最高 ,大脑皮层、海马表达量无显著性差别 ,心、肝、脾、肺、肾、小肠及嗅球、小脑等组织中未见ZnT3mRNA表达。说明克隆到正确的ZnT3cDNA片断。ZnT3mRNA主要表达于睾丸、大脑皮层、海马 。 展开更多
关键词 锌转运 ZnT3 cdna 克隆 MRNA
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‘红阳’猕猴桃cDNA文库构建及F3H基因的表达初探 被引量:25
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作者 杨红丽 王彦昌 +1 位作者 姜正旺 黄宏文 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1265-1272,共8页
利用SMART(switching mechanism at 5’end of the RNA transcript)技术构建了红肉猕猴桃品种‘红阳’(Actinidia chinesis cv‘Hongyang’)内果皮组织的全长cDNA文库,此文库的构建有助于克隆与次生代谢相关的基因,特别是红肉猕... 利用SMART(switching mechanism at 5’end of the RNA transcript)技术构建了红肉猕猴桃品种‘红阳’(Actinidia chinesis cv‘Hongyang’)内果皮组织的全长cDNA文库,此文库的构建有助于克隆与次生代谢相关的基因,特别是红肉猕猴桃花青素特异合成代谢的基因。文库滴度为6.7×10^4cfu/mL,库容为2.72×10^8cfu/mL,文库重组率99.8%,插入片段多数分布在700~1000bp。随机挑选1014个克隆进行测序,测序成功963个,经过序列拼接去除低质量序列后获得632个unigenes,包括92个contigs和540个singletons,获得已知功能unigenes共441个。从所测克隆中得到一个花青素途径的结构基因AcF3H,其cDNA序列长1369bp(GenBank登录号:FJ542819),CDS区为1101bp,编码366个氨基酸的多肽。与拟南芥、葡萄及龙胆已知乃日氨基酸序列比对,发现该基因十分保守。通过RT—PCR技术对苍溪栽培的不同发育时期‘红阳’猕猴桃果实AcF3H基因的表达进行了分析。结果表明,果肉转色前AcF3H基因表达量较高,而转色初期表达量降低,此后随着果实着色加深表达量维持在较高水平。 展开更多
关键词 '红阳’猕猴桃 cdna文库 F3H 表达
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cDNA微阵列技术研究NaHCO_3胁迫下星星草基因表达谱 被引量:8
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作者 刘桂丰 褚延广 +2 位作者 王玉成 杨传平 侯英杰 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期887-892,共6页
为研究NaHCO3胁迫下星星草基因的表达,分别将荧光染料Cy5-dCTP和Cy3-dCTP用反转录方法标记在处理和对照星星草cDNA上制成探针,并与载有星星草基因的cDNA芯片进行杂交。通过对芯片的杂交信号强度分析来研究基因的表达情况。分析结果显示... 为研究NaHCO3胁迫下星星草基因的表达,分别将荧光染料Cy5-dCTP和Cy3-dCTP用反转录方法标记在处理和对照星星草cDNA上制成探针,并与载有星星草基因的cDNA芯片进行杂交。通过对芯片的杂交信号强度分析来研究基因的表达情况。分析结果显示,共有25个基因在NaHCO3胁迫处理前后差异表达,其中17个基因在NaHCO3胁迫下表达下调,8个基因在NaHCO3胁迫下表达上调。生物信息学分析表明这些基因的功能涉及了信号传导与转录调控、细胞防御、细胞代谢等多个方面。从而获得了NaHCO3胁迫下星星草的基因表达谱,定量地阐述了NaHCO3胁迫和非胁迫条件下星星草基因的差异表达情况。 展开更多
关键词 星星草 cdna微阵列 NAHCO3胁迫
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一步PCR法快速扩增辽宁碱蓬胆碱单加氧酶cDNA3′末端序列 被引量:2
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作者 李秋莉 高晓蓉 +2 位作者 袁晓东 刘大伟 安利佳 《植物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期584-587,共4页
根据已获得的辽宁碱蓬 (SuaedaliaotungensisKitag)胆碱单加氧酶cDNA的部分序列 ,设计一条基因特异性引物 ,与通用引物并用 ,一步PCR成功地克隆了辽宁碱蓬胆碱单加氧酶cDNA 3′末端。与常规的3′_RACE法相比 ,一步PCR法具有快速、简便... 根据已获得的辽宁碱蓬 (SuaedaliaotungensisKitag)胆碱单加氧酶cDNA的部分序列 ,设计一条基因特异性引物 ,与通用引物并用 ,一步PCR成功地克隆了辽宁碱蓬胆碱单加氧酶cDNA 3′末端。与常规的3′_RACE法相比 ,一步PCR法具有快速、简便、经济等优点 ,是一种非常快捷的扩增cDNA 展开更多
关键词 一步PCR法 快速扩增 辽宁碱蓬 胆碱单加氧酶 cdna3′末端序列
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草原兔尾鼠卵透明带3(ZP3)cDNA保守序列的克隆与序列分析 被引量:9
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作者 张富春 张蕴斌 +5 位作者 李轶杰 张渝疆 李阔宇 钟哲 马正海 恩特马克 《地方病通报》 2001年第4期70-73,共4页
根据 Gene Bank数据库中 5种啮齿目动物卵透明带 3 (ZP3 ) c DNA的序列 ,利用 DNAMAN和 NIH NCBI BLAST同源性分析程序设计了特异性引物。从 6周龄的未孕雌性的草原兔尾鼠卵巢中用柱离心法得到总 RNA,利用反转录技术得到 c DNA,通过特... 根据 Gene Bank数据库中 5种啮齿目动物卵透明带 3 (ZP3 ) c DNA的序列 ,利用 DNAMAN和 NIH NCBI BLAST同源性分析程序设计了特异性引物。从 6周龄的未孕雌性的草原兔尾鼠卵巢中用柱离心法得到总 RNA,利用反转录技术得到 c DNA,通过特异性引物进行 PCR扩增草原兔尾鼠的 ZP3 c DNA保守序列。将扩增产物连接到 p MD1 8- T载体上 ,通过蓝白斑筛选得到阳性克隆 ,酶切鉴定后进行测序。将其与 Gene Bank中啮齿目动物 ZP3 c DNA进行同源性比较 ,获得了草原兔尾鼠 ZP3 c DNA的保守基因序列 ,与啮齿类同类基因比较 ,具有较高的同源性。 展开更多
关键词 草原兔尾鼠 卵透明带3 cdna保守序列 序列分析
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烟草Ⅰ类几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶cDNA在大肠杆菌中的表达 被引量:14
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作者 李继红 邵寒霜 郑学勤 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第3期309-313,共5页
对经过修饰的烟草Ⅰ类几丁质酶(Ⅰchitinase,ⅠChi)和β1,3葡聚糖酶(Ⅰglucanase,ⅠGlu)cDNA分别构建了原核表达载体,并转化大肠杆菌BL21。经IPTG诱导表达,SDSPA... 对经过修饰的烟草Ⅰ类几丁质酶(Ⅰchitinase,ⅠChi)和β1,3葡聚糖酶(Ⅰglucanase,ⅠGlu)cDNA分别构建了原核表达载体,并转化大肠杆菌BL21。经IPTG诱导表达,SDSPAGE法证明表达产物ⅠChi和ⅠGlu的分子量分别约为30kDa和31kDa,在菌内以包涵体形式存在。经包涵体的收集、洗涤、裂解和复性,两种表达产物在体外均表现出较强的抑病原真菌活性,且ⅠChi的抑菌活力大于ⅠGlu。 展开更多
关键词 几丁质酶 β-1 3-葡聚糖酶 cdna 基因表达 抑菌
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