一种有机质谱谱图的库检索新算法

一种有机质谱谱图的库检索新算法律祥俊，林少凡，张金碚，张法义（南开大学中心实验室，天津，３０００７１）关键词检索，算法，质谱，数据库利用计算机匹配技术识别有机质谱谱图中的库检索方法仅需用低分辨质谱图即可识别未知化合物，似为最成功的方法［１～３］．质谱...

基于MUSIC算法的宽带频谱感知

利用MUSIC算法进行宽带频谱感知时,主用户信号个数估计是关键问题。为此,提出一种动态门限搜索匹配的信号个数估计算法。利用信号子空间和噪声子空间的正交性动态调整门限,搜索与预设维度最匹配的信号个数作为最终的估计值。仿真结果表明,在低信噪比的情况下,该算法能准确估计信号个数,提高宽带频谱感知性能。

一种基于信息论的蛋白质数据库搜索鉴定算法

为了有效地利用蛋白质串联质谱数据,提高蛋白质鉴定的准确性,提出了一种基于信息论的蛋白质数据库搜索鉴定算法——ITPIA(information theory based protein identification algorithm)算法.针对多肽串联质谱质量低、噪音多等问题,ITPIA算法利用了信息论中的熵理论提出了一种有效的实验串联质谱和多肽的理论质谱的匹配打分算法.该算法更大程度上从多肽串联质谱中获得蛋白质的结构信息.实验结果表明,ITPIA算法有效地提高了蛋白质鉴定的准确性.

质谱数据库KDD预处理算法

本文针对谱图数据库的特性 ,在利用数据库知识发现 (KDD)技术对谱图数据库进行数据预处理过程中 ,对质谱匹配算法、MultiAdaBoost聚类分析算法和Beynon表审核等方面进行了研究 ,使我们对质谱库有了更进一步的认识 。

基于泊松分布模型的蛋白质串联质谱鉴定算法研究

数据库搜索方法被广泛应用于蛋白质串联质谱的鉴定之中,该方法主要包括4部分:去同位素峰、选取有效峰、产生理论图谱、对理论图谱与实验图谱进行相似度打分.其中打分函数是数据库搜索方法的核心,在此基础上探究了一种基于泊松分布模型下的蛋白质串联质谱鉴定算法,并合理的融入了峰强度信息.为了验证该算法的有效性及可靠性,将该算法搜索结果与主流鉴定商业软件Mascot和Sequest在FDR为1%的条件下进行比较,基于泊松分布模型的蛋白质串联质谱鉴定算法具有更高的鉴定量和鲁棒性.

一种有机质谱检索的匹配算法

本文针对现有质谱匹配算法在实现物质的相似性检索方面存在的问题,提出了以权重m/z·I为峰的重要性因子的质谱匹配新算法。该算法充分强调了m/z和I的重要性,其权重能很好的反映谱图的特征。将该算法应用在NIST02谱库的检索中,其检索结果令人满意。