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数据非依赖采集张量质谱数据计算平台的开发
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作者 周海洋 刘朋欢 金尚忠 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第3期412-421,I0005,共11页
数据非依赖采集张量(data independent acquisition tensor,DIAT)是一种质谱数据格式,用于处理和分析数据非依赖采集方法获得的蛋白质组学数据。与传统方法相比,DIAT技术具有便捷的数据可视化处理和高效的深度学习模型训练等优势。但由... 数据非依赖采集张量(data independent acquisition tensor,DIAT)是一种质谱数据格式,用于处理和分析数据非依赖采集方法获得的蛋白质组学数据。与传统方法相比,DIAT技术具有便捷的数据可视化处理和高效的深度学习模型训练等优势。但由于目前缺乏支持DIAT格式数据的软件平台,限制了其应用。为解决这一问题,本文基于PyQt框架设计了一款用于处理和分析DIAT数据的软件,涵盖了与DIAT技术相关的所有功能,使用户能够轻松地利用DIAT数据进行复杂分析,降低了使用门槛,为数据非依赖采集(DIA)质谱数据分析注入了活力。 展开更多
关键词 质谱 数据非依赖采集(dia) 图形化用户交互界面(GUI) 深度学习 视觉变换网络
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长期应用β-受体阻滞剂对高血压病人左房、左室结构及功能的影响
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作者 丛洪良 陈树涛 +1 位作者 郑成环 黄体钢 《实用心脑肺血管病杂志》 1999年第2期79-82,共4页
目的 评价β-受体阻滞剂对高血压病人左房、左室结构及功能的影响。方法 应用超声多普勒对长期服用美多心安的Ⅱ期高血压病患者的左室舒张功能、左房功能及左室重量指标进行测量。结果 长期应用美多心安除降低血压外,还可减低高血压病... 目的 评价β-受体阻滞剂对高血压病人左房、左室结构及功能的影响。方法 应用超声多普勒对长期服用美多心安的Ⅱ期高血压病患者的左室舒张功能、左房功能及左室重量指标进行测量。结果 长期应用美多心安除降低血压外,还可减低高血压病人室壁厚度及左室重量;改善左室舒张期充盈频谱或舒张功能;纠正左房功能指标异常。结论 长期应用β受体阻滞剂对高血压病患者的降压,改善心房、心室结构和功能具有较好的效果。 展开更多
关键词 超声多谱勒 美多心安 心室重量 舒张功能 心房功能 高血压 治疗
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基于数据非依赖性采集质谱技术对注射用曲妥珠单抗及其类似药结构的表征及相似性研究
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作者 李克 李恒 周琴 《医药导报》 CAS 北大核心 2022年第4期519-523,共5页
目的基于数据非依赖性采集(DIA)质谱技术对注射用曲妥珠单抗(赫赛汀)及其类似药进行结构表征和相似性研究。方法用液相色谱/质谱(LC/MS)对赫赛汀及其类似药的完整蛋白及轻链和重链的相对分子质量进行测定;应用DIA质谱技术进行肽图分析,... 目的基于数据非依赖性采集(DIA)质谱技术对注射用曲妥珠单抗(赫赛汀)及其类似药进行结构表征和相似性研究。方法用液相色谱/质谱(LC/MS)对赫赛汀及其类似药的完整蛋白及轻链和重链的相对分子质量进行测定;应用DIA质谱技术进行肽图分析,确定赫赛汀及其类似药的氨基酸全序列。结果LC/MS可准确测定赫赛汀的相对分子质量,赫赛汀类似药与原研药相对分子质量的偏差在1Da以内。应用DIA质谱技术对检测到的106个肽段进行肽图分析,显示赫赛汀类似药的氨基酸序列覆盖率>99%。赫赛汀类似药与原研药的相对分子质量和糖型信息相符、氨基酸序列完全一致。结论DIA质谱技术可用于赫赛汀及其类似药的结构表征和相似性比较研究,为今后其他单克隆抗体结构表征平台的建立提供了依据。 展开更多
关键词 赫赛汀 类似药 抗体药物 结构表征 数据非依赖性采集 质谱技术
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超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱法快速辨识芪玉三龙汤化学成分 被引量:8
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作者 黄梦文 吴欢 +5 位作者 于伟 王影 汪逢灿 张纯纯 周龙生 李泽庚 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期730-743,共14页
利用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(UPLC-QTOF-MS)的数据非依赖性采集(DIA)技术,结合靶向筛查方法,快速辨识芪玉三龙汤(Qi-Yu-San-Long decoction,QYSLD)化学成分。以Waters ACQUITY UPLC BEH C18柱(100 mm×2.1 mm,1.7μm)... 利用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(UPLC-QTOF-MS)的数据非依赖性采集(DIA)技术,结合靶向筛查方法,快速辨识芪玉三龙汤(Qi-Yu-San-Long decoction,QYSLD)化学成分。以Waters ACQUITY UPLC BEH C18柱(100 mm×2.1 mm,1.7μm)为色谱柱,流速为0.2 mL/min,柱温为35℃,进样量为2μL,以0.1%(v/v)甲酸水溶液-乙腈为流动相进行梯度洗脱。采用电喷雾电离(ESI)源,以全信息串联质谱(MSE)技术在正、负离子模式下分别采集QYSLD复杂组分的质谱数据。通过检索文献和在线数据库,建立QYSLD中各单味药材化学成分库。将采集到的样品原始质谱数据与QYSLD化学成分库导入天然产物后处理筛查(UNIFI)平台;在UNIFI平台中设置参数(保留时间偏差为±0.1 min,精确质量数偏差阈值为±5×10^(-6),正离子模式下,选择[M+H]^(+)和[M+Na]^(+)为准分子离子或加合离子,负离子模式下,选择[M-H]^(-)和[M+HCOO]^(-))。经UNIFI平台对MSE模式下采集的质谱数据与自建数据库中成分作靶向筛查,结合化合物准分子离子、质谱裂解途径及部分对照品进行结构确认。从QYSLD中共识别出166种化学成分,其中皂苷类22种,生物碱类13种,黄酮类27种,萜类32种,氨基酸类20种,苯丙素类16种,有机酸类9种,甾醇类6种,蒽醌类6种,其他类15种。其中16种成分使用对照品作验证。研究建立的方法能够快速、可靠的表征QYSLD中的化学成分,为该复方的药效物质及质量控制研究奠定了基础。 展开更多
关键词 超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱 数据非依赖性采集 靶向筛查 芪玉三龙汤
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孕前体质指数、孕期增重与GDM风险关系
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作者 戴美龙 郁林 +1 位作者 陈霞 陈静 《中国计划生育学杂志》 2023年第11期2712-2716,共5页
目的:探讨孕前体质指数(BMI)、不同孕期增重与发生妊娠期糖尿病(GDM)关系。方法:以2020年9-12月于本院产科产前检查孕妇1508例为研究对象,调查孕前BMI,于孕24~28周常规GDM筛查。采用多因素logistic回归分析孕前BMI、孕早期增重、GDM筛... 目的:探讨孕前体质指数(BMI)、不同孕期增重与发生妊娠期糖尿病(GDM)关系。方法:以2020年9-12月于本院产科产前检查孕妇1508例为研究对象,调查孕前BMI,于孕24~28周常规GDM筛查。采用多因素logistic回归分析孕前BMI、孕早期增重、GDM筛查前增重与GDM的相关性。结果:共检出GDM 251例,检出率16.6%;随着孕前BMI的增加、孕早期增重程度的增加、GDM筛查前增重程度的增加,GDM检出率随之增加(P<0.05)。孕前BMI正常和超重/肥胖组孕早期增重过多者GDM的风险高于增重适宜者(OR=1.65、2.21);孕前BMI正常和超重/肥胖组GDM筛查前增重过多者GDM的风险高于增重适宜者(OR=1.60、1.82);孕前超重/肥胖者孕早期、GDM筛查前增重过少者GDM发生风险是低于增重适宜者(OR=0.73、0.53)。结论:孕前超重和肥胖均会增加GDM的发生风险,孕前BMI正常和超重肥胖者,孕期增重过多会增加GDM的发生风险。提示临床应对孕前BMI正常孕妇进行孕期增重的监测和随访,对孕前超重/肥胖者进行合理干预,使孕期增重保持在合理的范围以内,降低GDM的发生。 展开更多
关键词 妊娠期糖尿病 孕前体质指数 孕期增重 发生风险
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血浆中85种有毒生物碱快速筛查方法的建立及其应用
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作者 刘小红 李永刚 +5 位作者 孔芳 唐琳 何晓宏 杨荣娇 闻胜 罗苹 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2022年第6期1202-1211,共10页
目的 利用超高效液相色谱-四级杆/静电场轨道阱高分辨质谱建立血浆中85种有毒生物碱快速筛查方法。方法 构建85种生物碱高分辨数据库;血浆经乙腈沉淀蛋白进行预处理,采用Acquity Waters BEH C_(18)色谱柱(100 mm×2.1 mm,1.7μm),以... 目的 利用超高效液相色谱-四级杆/静电场轨道阱高分辨质谱建立血浆中85种有毒生物碱快速筛查方法。方法 构建85种生物碱高分辨数据库;血浆经乙腈沉淀蛋白进行预处理,采用Acquity Waters BEH C_(18)色谱柱(100 mm×2.1 mm,1.7μm),以5 mmol/L甲酸铵(含0.1%甲酸)和乙腈为流动相进行梯度洗脱,对比了3种数据采集方式下(Full mass/dd-MS~2、Full mass/AIF、Full mass/DIA)加标血浆中85种有毒生物碱筛查情况。结果 血浆在5、50和250 ng/mL 3个浓度添加水平下,Full mass/DIA模式下的筛选准确率均为最高。利用生物碱数据库,选择Full mass/DIA模式采集样品数据信息,建立了血浆中85种有毒生物碱快速筛查方法。80%以上生物碱在血浆中的检出限低于10 ng/mL。利用该方法成功在滇乌头碱毒物代谢动力学实验获得的3份Wistar大鼠血浆中筛选到了目标物滇乌头碱及其可能的代谢产物脱氧乌头碱及印乌头碱。结论 该方法快速、高效,可以在无标准品情况下实现突发性有毒生物碱中毒血浆的快速筛查。 展开更多
关键词 超高效液相色谱-四级杆/静电场轨道阱高分辨质谱 血浆 有毒生物碱 Full mass/dia 快速筛查
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肥胖与眼病 被引量:2
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作者 孙葆忱 胡爱莲 +1 位作者 杨晓慧 郑远远 《国际眼科纵览》 2016年第3期201-205,共5页
肥胖是全球范围内的重大公共卫生问题,在许多国家患病率以惊人的速度增长。肥胖被认为是许多眼病重要的危险因素,尤其是年龄相关的眼病如白内障、青光眼、年龄相关性黄斑病变、糖尿病性视网膜病变等。随着全球老龄化加剧,肥胖引起的... 肥胖是全球范围内的重大公共卫生问题,在许多国家患病率以惊人的速度增长。肥胖被认为是许多眼病重要的危险因素,尤其是年龄相关的眼病如白内障、青光眼、年龄相关性黄斑病变、糖尿病性视网膜病变等。随着全球老龄化加剧,肥胖引起的眼病增加,对社会及家庭的各种负担也会加剧,因此强调防止肥胖至关重要。目前尚缺少肥胖与眼病相关性的病理生理学机制明确的解释,因此是亟需研究的重要课题。 展开更多
关键词 肥胖 体重指数 白内障 青光眼 年龄相关性黄斑变性:糖尿病性视网膜病变
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