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上调lncRNA MEG3对大鼠心肌细胞系缺氧/复氧损伤的影响
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作者 余敏 崔跃 +2 位作者 黎鹏飞 谢丹 陈芬 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年第4期660-664,共5页
目的:探究长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)对大鼠心肌H9c2细胞缺氧/复氧(H/R)的保护作用及其与核因子E2相关因子2(Nrf2)/抗氧化反应元件(ARE)通路的关系。方法:将H9c2细胞分为Control组、H/R组、H/R+Ad-绿色荧光蛋白(GFP)组、... 目的:探究长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)对大鼠心肌H9c2细胞缺氧/复氧(H/R)的保护作用及其与核因子E2相关因子2(Nrf2)/抗氧化反应元件(ARE)通路的关系。方法:将H9c2细胞分为Control组、H/R组、H/R+Ad-绿色荧光蛋白(GFP)组、H/R+Ad-MEG3组、H/R+Ad-MEG3+si-NC组及H/R+Ad-MEG3+si-Nrf2组。实时荧光定量逆转录酶聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测MEG3表达;噻唑蓝(MTT)法检测细胞活力;流式细胞仪检测细胞凋亡率;2′,7′-二氯荧光黄双乙酸盐(DCFH-DA)法检测活性氧(ROS)水平;酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)活性;蛋白质印迹(Western Blot)检测Nrf2/ARE通路相关蛋白表达。结果:与Control组比较,H/R组细胞凋亡率、细胞中ROS水平及Nrf2、血红素氧化酶1(HO-1)和醌氧化还原酶-1(NQO-1)蛋白水平均增高,而细胞活力、细胞中MEG3表达水平、SOD和CAT活性均降低(P<0.05)。MEG3过表达可部分逆转H/R对H9c2细胞和Nrf2/ARE通路蛋白的影响(P<0.05);敲低Nrf2可削弱MEG3过表达对H/R损伤的保护作用(P<0.05)。结论:MEG3过表达可抑制氧化应激和细胞凋亡减轻H/R心肌损伤,可能与激活Nrf2/ARE抗氧化信号有关。 展开更多
关键词 缺氧/复氧 长链非编码RNA母系表达基因3 心肌细胞H9c2 实验研究
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长链非编码RNA-MEG3在人心脏微血管内皮细胞缺氧损伤中的作用
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作者 黄静聪 李亮 卢子瑄 《河北医药》 CAS 2024年第4期511-515,共5页
目的研究长链非编码RNA-MEG3在人心脏微血管内皮细胞(HCMEC)缺氧损伤中的作用。方法将HCMEC分为对照组、缺氧/复氧(H/R)组及缺氧/复氧联合MEG3敲减(H/R+siMEG3)组。荧光定量PCR检测MEG3及炎性因子的表达情况[白介素1β(IL-β)、IL-6、I... 目的研究长链非编码RNA-MEG3在人心脏微血管内皮细胞(HCMEC)缺氧损伤中的作用。方法将HCMEC分为对照组、缺氧/复氧(H/R)组及缺氧/复氧联合MEG3敲减(H/R+siMEG3)组。荧光定量PCR检测MEG3及炎性因子的表达情况[白介素1β(IL-β)、IL-6、IL-8、IL-10、肿瘤坏死因子(TNF-α)];CCK-8检测HCMEC细胞的增殖活性;流式细胞术分析细胞凋亡情况;Western blotting检测PI3K/AKT/eNOS信号通路表达变化,ELISA检测一氧化氮(NO)、超氧化物歧化酶(SOD)、血管内皮生长因子(VEGF)和活性氧(ROS)表达水平。结果利用qPCR检测对照组及H/R组细胞MEG3表达,结果发现:H/R组MEG3相对表达倍数[(6.87±0.239)倍]较对照组MEG3表达倍数(1.00±0.026)倍显著升高(n=3,t=42.32,P<0.0001),提示MEG3可能在心脏微血管内皮细胞IRI中起到重要作用。H/R组细胞与对照组比较,细胞增殖活性显著减弱(P<0.01);而H/R+siMEG3组与H/R组比较,细胞增殖活性进步受到抑制(P<0.01)。H/R组较对照组PI3K、AKT及eNOS磷酸化水平显著减低,而H/R+siMEG3组细胞较H/R组磷酸化水平更低(P<0.05)。H/R组与对照组比较,NO、SOD及VEGF显著减低,而ROS水平升高(P<0.05);而H/R+siMEG3组与H/R组比较,NO、SOD及VEGF水平进步下降,ROS升高显著。利用qPCR检测各处理组细胞相关炎症基因表达,结果发现:H/R组较对照组基因表达显著升高(P<0.05);H/R+SiMEG3组较H/R组基因表达进一步升高(P<0.01)。结论长链非编码RNA-MEG3在心脏微血管内皮细胞H/R损伤过程中起到重要保护作用,靶向提升MEG3水平有望成为减缓心脏微血管IRI的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 心脏微血管细胞内皮细胞 meg3 ENOS NO SOD ROS 炎症因子
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急性缺血性脑卒中患者血清长链非编码RNA母系表达基因3和Zeste同源物增强子-2表达与神经功能损伤的相关性分析
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作者 李晨曦 白如玉 《心脑血管病防治》 2024年第3期27-31,共5页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)与Zeste同源物增强子-2(EZH2)在急性缺血性脑卒中(AIS)患者血清中的表达水平及其与神经功能损伤之间的关系。方法选取延安市人民医院2021年1月至2022年11月收治的92例AIS患者为脑卒中... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)与Zeste同源物增强子-2(EZH2)在急性缺血性脑卒中(AIS)患者血清中的表达水平及其与神经功能损伤之间的关系。方法选取延安市人民医院2021年1月至2022年11月收治的92例AIS患者为脑卒中组,92例健康体检者为对照组,根据NIHSS评分将脑卒中组患者分为致残性损伤组19例,非致残性损伤组73例。采用实时荧光定量聚合酶链式反应、酶联免疫吸附法分别检测血清lncRNAMEG3、EZH2水平。采用Spearman相关分析法进行AIS患者血清lncRNAMEG3、EZH2表达水平与美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分之间的相关性分析;采用多因素Logistic回归分析AIS患者合并神经功能致残性损伤的影响因素,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA MEG3、EZH2水平对AIS患者合并神经功能致残性损伤的诊断价值。结果脑卒中组患者血清lncRNA MEG3、EZH2表达水平均高于对照组(t=11.817、11.542,P<0.05)。Spearman相关分析显示,AIS患者血清lncRNA MEG3、EZH2水平与NIHSS评分均呈正相关(r=0.540、0.603,P<0.01)。致残性损伤组体质量指数、吸烟史占比、甘油三酯、总胆固醇、同型半胱氨酸、发病-到院时间(ODT)、lncRNAMEG3、EZH2水平均高于非致残性损伤组(t/χ2=2.103、5.050、9.121、5.585、2.276、5.448、4.638、4.682,P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,甘油三酯、总胆固醇、lncRNA MEG3、EZH2以及ODT均是AIS患者合并神经功能致残性损伤的影响因素(OR=4.853、4.277、2.674、3.052、3.901,P<0.05)。lncRNA MEG3、EZH2联合诊断AIS患者合并神经功能致残性损伤的曲线下面积(AUC)大于lncRNAMEG3以及EZH2单独诊断的AUC(Z=2.626、2.954,P<0.01),敏感度、特异度分别为94.74%、82.15%。结论AIS患者血清lncRNA MEG3、EZH2水平均上升,与AIS患者神经功能损伤程度均正相关,可用作AIS患者合并神经功能致残性损伤的诊断指标,且联合诊断效果更好。 展开更多
关键词 急性缺血性脑卒中 神经功能损伤 长链非编码RNA母系表达基因3 Zeste同源物增强子-2
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长链非编码RNA(LncRNA)母系表达基因3(MEG3)对糖尿病视网膜病变大鼠模型视网膜血管内皮细胞凋亡的影响 被引量:3
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作者 王艳平 刘含军 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2023年第1期18-24,共7页
目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)母系表达基因3(MEG3)对糖尿病视网膜病变(DR)大鼠模型视网膜血管内皮细胞凋亡的影响。方法取SPF级雄性SD大鼠以及体外培养的人视网膜微血管内皮细胞(HRMEC),均随机分为对照组、模型组、LncRNA MEG3过表达... 目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)母系表达基因3(MEG3)对糖尿病视网膜病变(DR)大鼠模型视网膜血管内皮细胞凋亡的影响。方法取SPF级雄性SD大鼠以及体外培养的人视网膜微血管内皮细胞(HRMEC),均随机分为对照组、模型组、LncRNA MEG3过表达组、miR-145-5p agomir组、共转染(LncRNA MEG3过表达质粒+miR-145-5p agomir)组、共转染阴性对照(LncRNA MEG3空载质粒+miR-145-5p agomir阴性对照质粒)组,采用腹腔注射链脲佐菌素建立DR大鼠模型,25 mmol·L^(-1)葡萄糖诱导DR细胞模型。对照组大鼠腹腔注射柠檬酸缓冲液,对照组细胞以正常培养基培养,将大鼠与细胞均分组进行处理,以LncRNA MEG3质粒、miR-145-5p agomir转染处理后,通过伊文思蓝(EB)检测大鼠视网膜血管通透性;TUNEL染色检测大鼠视网膜血管内皮细胞凋亡率;EdU染色与Hoechst 33258染色分别检测细胞增殖、凋亡情况;依照试剂盒测量大鼠房水中及HRMEC炎症因子白细胞介素(IL)-6、IL-1β含量;实时荧光定量PCR实验检测HRMEC及大鼠视网膜组织miR-145-5p表达;蛋白免疫印迹法检测HRMEC及大鼠视网膜组织凋亡相关蛋白(Bcl-2、Bax)表达;双荧光素酶实验验证HRMEC中LncRNA MEG3对miR-145-5p的靶向调节作用。结果LncRNA MEG3过表达组大鼠玻璃体中EB含量、视网膜血管内皮细胞凋亡率及房水中IL-6、IL-1β含量均低于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05);miR-145-5p agomir组大鼠玻璃体中EB含量、视网膜血管内皮细胞凋亡率及房水中IL-6、IL-1β含量均高于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05)。LncRNA MEG3过表达组HRMEC增殖率均高于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05),HRMEC凋亡率及IL-6、IL-1β含量均低于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05);miR-145-5p agomir组HRMEC增殖率均低于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05),HRMEC凋亡率及IL-6、IL-1β含量均高于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05)。LncRNA MEG3过表达组HRMEC、大鼠视网膜组织miR-145-5p及Bax表达均低于模型组、共转染组,Bcl-2表达均高于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05);miR-145-5p agomir组HRMEC、大鼠视网膜组织miR-145-5p及Bax表达均高于模型组、共转染组,Bcl-2表达均低于模型组、共转染组,差异均有统计学意义(均为P<0.05)。转染野生型miR-145-5p报告质粒+LncRNA MEG3过表达质粒组细胞相对荧光素酶活性(0.33±0.05)低于转染野生型miR-145-5p报告质粒+LncRNA MEG3空载质粒组(1.02±0.21),差异有统计学意义(P<0.05)。结论LncRNA MEG3可通过靶向下调miR-145-5p表达,抑制炎症反应,减轻DR大鼠视网膜血管内皮细胞凋亡,促使HRMEC DR细胞模型存活,改善DR大鼠视网膜血管屏障功能。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 母系表达基因3 miR-145-5p 糖尿病视网膜病变 视网膜血管内皮细胞凋亡
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熟地黄多糖调控lncRNA MEG3对碘乙酸钠致骨关节炎软骨细胞损伤的保护作用 被引量:1
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作者 杜晨飞 韩磊 +2 位作者 范围 李红旗 郑福增 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第7期92-99,122,共9页
目的探讨熟地黄多糖(RGP)调控长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)对碘乙酸钠(MIA)诱导的骨关节炎(OA)软骨细胞凋亡的影响。方法培养大鼠软骨细胞,不同浓度MIA(0、1、2、4、8μmol/L)诱导建立软骨细胞损伤模型,并给予不同浓度RGP... 目的探讨熟地黄多糖(RGP)调控长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)对碘乙酸钠(MIA)诱导的骨关节炎(OA)软骨细胞凋亡的影响。方法培养大鼠软骨细胞,不同浓度MIA(0、1、2、4、8μmol/L)诱导建立软骨细胞损伤模型,并给予不同浓度RGP(50、100、200、400、800 mg/mL)处理筛选合适的实验浓度。实验分为正常组、MIA组、RGP组、RGP+si-NC组、RGP+si-MEG3组,Cell Counting Kit-8(CCK-8)检测细胞活力;Hoechst 33258染色及流式细胞术检测细胞凋亡情况;实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测细胞中MEG3、金属蛋白酶13(MMP-13)、Ⅱ型胶原α1(COL2A1)和蛋白聚糖(ACAN)mRNA水平;蛋白免疫印迹(Western blot)检测细胞中磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)、p-PI3K、丝/苏氨酸激酶(AKT)、p-AKT、BAX、BCL-2、caspase3蛋白表达水平。结果MIA以剂量依赖性方式降低软骨细胞活力,诱导细胞凋亡,并降低MEG3和COL2A1 mRNA、ACAN mRNA水平,升高MMP-13 mRNA水平(P<0.05)。100、200、400、800 mg/mL RGP可升高软骨细胞活力及MEG3水平(P<0.05)。与正常组相比,MIA组细胞活力、MEG3、COL2A1 mRNA、ACAN mRNA和p-PI3K/PI3K、p-AKT/AKT、BCL-2蛋白水平降低,细胞凋亡率、MMP-13 mRNA和BAX、caspase3蛋白水平升高(P<0.05);与MIA组相比,RGP组细胞活力、MEG3、COL2A1 mRNA、ACAN mRNA和p-PI3K/PI3K、p-AKT/AKT、BCL-2蛋白水平升高,细胞凋亡率、MMP-13 mRNA和BAX、caspase3蛋白水平降低(P<0.05);敲低MEG3可减弱RGP对MIA诱导的软骨细胞损伤的保护作用。结论RGP可促进软骨细胞ECM合成,并抑制细胞凋亡,减轻MIA诱导的软骨细胞损伤,其作用机制可能与上调MEG3表达,诱导PI3K/AKT通路活化有关。 展开更多
关键词 熟地黄多糖 长链非编码RNA 母系表达基因3 骨关节炎 软骨细胞 凋亡
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Analysis of in vivo patterns of caspase 3 gene expression in primary hepatocellular carcinoma and its relationship to p21^(WAF1) expression and hepatic apoptosis 被引量:65
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作者 Bao Hua Sun Jun Zhang Bao JǜWang Xi Ping Zhao You Kun Wang Zhi Qun Yu Dong Liang Yang Lian Jie Hao Department of Clinical Immunology,Tongji Hospital,Tongji Medical University,Wuhan 430030,Hubei Province,China 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2000年第3期356-360,共5页
AIM To detect the expression of caspase 3gene in primary human hepatocellular carcinoma(HCC)and investigate its relationship to p21<sup>WAF1</sup>gene expression and HCC apoptosis.METHODS In situ hybridi... AIM To detect the expression of caspase 3gene in primary human hepatocellular carcinoma(HCC)and investigate its relationship to p21<sup>WAF1</sup>gene expression and HCC apoptosis.METHODS In situ hybridization was employedto determine caspase 3 and p21<sup>WAF1</sup>expression inHCC.In situ end-labeling was used to detecthepatocytic apoptosis in HCC.RESULTS Twenty-one of 39(53.8%)cases ofHCC were found to express caspase 3transcripts,while 45.2% of HCC failed toexpress caspase 3.Non-cancerous adjacent livertissues showed more positive caspase 3(87.5%,7/8)as compared with HCC(P【0.05).The expression of caspase 3 is correlated withHCC differentiation,72.2%(13/18)ofmoderately to highly differentiated HCC showedcaspase 3 transcripts positive,while only 38.1%of poorly differentiated HCC harbored caspase 3transcripts(P【0.05).No relationship wasfound between caspase 3 expression and tumorsize or grade or metastasis,although 52.5%(5/8)of HCC with metastasis were caspase 3positive and a little higher than that with nometastasis(51.6%,P】0.05).Expression of caspase 3 alone did not affect the apoptosisindex(AI)of HCC.The AI was 7.12%o in caspase3-positive tumors(n=21),while in caspase 3-negative cases(n=18)6.59%0(P】0.05).Expression of caspase 3 clearly segregated withp21<sup>WAF1</sup>positive tumors as compared withp21<sup>WAF1</sup>-negative cases(16 of 23,69.6% versus5 of 16,31.3%)with statistical significance(P=0.017).In the cases with positive caspase 3and negative p21<sup>WAF1</sup>,the Al was found slightlyhigher,but with no statistical significance,thanthat with expression of p21<sup>WAF1</sup>and caspase 3(7.21‰ vs 6.98‰,P】0.05).CONCLUSION Loss of caspase 3 expressionmay contribute to HCC carcinogenesis,althoughthe expression of caspase 3 does not correlatewell with cell apoptosis in HCC.p21<sup>WAF1</sup>may bemerely one of the inhibitors which can reducecaspase 3 mediated cell apoptosis in HCCs. 展开更多
关键词 carcinoma HEPATOCELLULAR CASPASE 3 APOPTOSIS liver NEOPLASMS gene expression
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LncRNA MEG3调控microRNA-181b-5p/TIMP3对前列腺癌细胞侵袭、迁移的影响
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作者 梁紫积 陈楚义 《现代泌尿外科杂志》 CAS 2023年第1期71-77,共7页
目的探究长链非编码RNA母系表达基因3(lncRNA MEG3)调控微小RNA-181b-5p(microRNA-1816-5P,简称miR-181b-5p)/组织金属蛋白酶抑制因子3(TIMP3)对前列腺癌细胞侵袭、迁移的影响。方法收集2019年12月—2021年12月本院所收治的20例前列腺... 目的探究长链非编码RNA母系表达基因3(lncRNA MEG3)调控微小RNA-181b-5p(microRNA-1816-5P,简称miR-181b-5p)/组织金属蛋白酶抑制因子3(TIMP3)对前列腺癌细胞侵袭、迁移的影响。方法收集2019年12月—2021年12月本院所收治的20例前列腺癌患者前列腺癌组织及其对应癌旁组织;实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测组织MEG3、miR-181b-5p表达;将前列腺癌细胞(PC3细胞)随机分为对照组(未处理)、pcDNA3.1-NC组(转染pcDNA3.1-NC)、pcDNA3.1-MEG3组(转染pcDNA3.1-MEG)、pcDNA3.1-MEG3+miR-NC组(pcDNA3.1-MEG3与miR-NC共转染)、pcDNA3.1-MEG3+miR-181b-5p mimic组(pcDNA3.1-MEG3与miR-181b-5p mimic共转染);qRT-PCR检测细胞MEG3、miR-181b-5p表达;MTT实验、Transwell实验、划痕实验分别检测PC3细胞活力、侵袭及迁移能力;Western blot检测PC3细胞TIMP3、基质金属蛋白酶(MMP)9、MMP2蛋白表达;双荧光素酶实验检测MEG3、miR-181b-5p、TIMP3的靶向关系。结果与癌旁组织的表达相比,MEG3在前列腺癌组织(0.37±0.05 vs.1.00±0.04)及细胞(0.31±0.06 vs.1.00±0.01)中表达显著降低(P<0.05);与对照组相比,pcDNA3.1-MEG3组miR-181b-5p表达(0.26±0.04 vs.1.00±0.02)、细胞存活率(53.60±5.22 vs.100.00±0.00)、侵袭细胞数(62.33±9.85 vs.162.34±21.30)、细胞迁移率(32.85±3.80 vs.75.22±5.96)、MMP9(0.61±0.08 vs.1.62±0.23)、MMP2(0.73±0.10 vs.1.20±0.16)表达显著降低,MEG3(2.31±0.36 vs.1.00±0.01)、TIMP3蛋白(1.32±0.24 vs.0.53±0.08)表达显著增加(P<0.05);miR-181b-5p过表达可逆转上述指标变化(P<0.05);miR-181b-5p与MEG3、TIMP3间均存在靶向关系。结论lncRNA MEG3过表达可通过抑制miR-181b-5p来促进TIMP3表达,从而抑制PC3细胞侵袭、迁移。 展开更多
关键词 母系表达基因3 微小RNA-181b-5p 组织金属蛋白酶抑制因子3 前列腺癌 侵袭 迁移
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烟粉虱MED隐种14-3-3基因克隆及时空表达谱分析
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作者 韦焕文 王培 +4 位作者 陈建斌 杜娇 张德咏 刘勇 史晓斌 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期595-602,共8页
【目的】真核生物中,14-3-3蛋白是一类可与多种蛋白互作的调节蛋白,能够参与信号转导、免疫反应、生长发育和胁迫响应等。本研究旨在克隆烟粉虱Bemisia tabaci MED隐种的14-3-3基因的全长cDNA序列,了解该基因编码的蛋白特征和该基因的... 【目的】真核生物中,14-3-3蛋白是一类可与多种蛋白互作的调节蛋白,能够参与信号转导、免疫反应、生长发育和胁迫响应等。本研究旨在克隆烟粉虱Bemisia tabaci MED隐种的14-3-3基因的全长cDNA序列,了解该基因编码的蛋白特征和该基因的时空表达模式。【方法】使用RT-PCR技术克隆烟粉虱MED隐种的14-3-3基因全长cDNA序列,通过生物信息学软件和在线网站分析14-3-3基因的生物学特性;使用RT-qPCR测定14-3-3基因在烟粉虱MED隐种不同发育阶段(卵、1-4龄若虫和成虫)、雌雄成虫以及雌成虫头、胸和腹中的表达量。【结果】克隆并鉴定了烟粉虱MED隐种14-3-3基因的两个亚型:Bt14-3-3 epsilon(GenBank登录号:XM_019046102.1)和Bt14-3-3 zeta(GenBank登录号:XM_019057395.1),开放阅读框(ORFs)分别长771和744 bp,分别编码256和247个氨基酸,编码的蛋白是无跨膜螺旋区和信号肽的亲水性蛋白,其二级结构主要由α旋螺旋组成。系统发育树分析表明,Bt14-3-3 epsilon与褐飞虱Nilaparvata lugens、温带臭虫Cimex lectularius和茶翅蝽Halyomorpha halys的14-3-3 epsilon聚为一支,同源性较高;Bt14-3-3 zeta与褐飞虱的14-3-3 zeta的亲缘关系更近。RT-qPCR结果表明,Bt14-3-3 epsilon和Bt14-3-3 zeta在烟粉虱MED隐种的卵、雌成虫和雌成虫腹部中的表达量较高。【结论】明确了烟粉虱MED隐种14-3-3基因的两个亚型的全长序列、编码蛋白特征及时空表达特点,为后续研究14-3-3蛋白的分子功能奠定了基础。 展开更多
关键词 烟粉虱 基因克隆 14-3-3蛋白 生物信息学 时空表达
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lncRNA MEG3调控NLRP3/caspase-1/GSDMD通路影响三阴性乳腺癌对紫杉醇的敏感性
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作者 于冰 杨旭 +1 位作者 陈之梦 雷萌 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第4期597-602,共6页
目的:探究长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)母系表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)调控含NLR家族Pyrin域蛋白3(NLR family,Pyrin domain containing protein 3,NLRP3)/含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(cysteinyl a... 目的:探究长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)母系表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)调控含NLR家族Pyrin域蛋白3(NLR family,Pyrin domain containing protein 3,NLRP3)/含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(cysteinyl aspartate specific proteinase 1,caspase-1)/消皮素D(gasdermin D,GSDMD)通路对三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)对紫杉醇(paclitaxel,PTX)敏感性的影响。方法:通过逐渐增加PTX剂量间歇作用的方法诱导TNBC耐药细胞MDA-MB-231/R,qRT-PCR检测lncRNA MEG3表达;将MDA-MB-231细胞分为对照组(未转染+PTX)、Vector组(空载体+PTX)、pcDNA3.1-MEG3组(pcDNA3.1-MEG3表达载体+PTX)、pcDNA3.1-MEG3+BAY11-7082组(pcDNA3.1-MEG3表达载体+PTX+5μmol/L NLRP3抑制剂BAY11-7082),qRT-PCR检测转染后lncRNA MEG3表达;CCK-8法检测MDA-MB-231细胞增殖情况;通过免疫荧光染色和扫描电镜(scanning electron microscope,SEM)观察MDA-MB-231细胞焦亡情况;Western blot检测MDA-MB-231细胞中NLRP3/caspase-1/GSDMD通路蛋白表达;体内成瘤实验检测肿瘤质量。结果:与MDA-MB-231细胞相比,MDA-MB-231/R细胞中lncRNA MEG3表达水平显著降低(P<0.05);与对照组相比,pcDNA3.1-MEG3组细胞增殖抑制率、GSDMD-N+细胞数量、细胞焦亡、细胞凋亡率及NLRP3、cleaved-caspase 1/caspase-1、GSDMD-N/GSDMD表达水平显著增加,IC50、肿瘤质量显著降低(P<0.05);与pcDNA3.1-MEG3组相比,pcDNA3.1-MEG3+BAY11-7082组细胞增殖抑制率、GSDMD-N+细胞数量、细胞焦亡、细胞凋亡率及NLRP3、cleaved-caspase 1/caspase-1、GSDMD-N/GSDMD表达水平显著降低,IC50、肿瘤质量显著增加(P<0.05)。结论:上调lncRNA MEG3表达可通过激活NLRP3/caspase-1/GSDMD通路,促进MDA-MB-231细胞焦亡,以此增加TNBC对PTX的敏感性。 展开更多
关键词 母系表达基因3 含NLR家族Pyrin域蛋白3/含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶/消皮素D 三阴性乳腺癌 紫杉醇 敏感性
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冠心病患者sST2、Gal-3水平与心肌纤维化的相关性研究 被引量:1
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作者 张玉莲 邓玮 +2 位作者 王云会 陈诗语 郑芳 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期37-43,共7页
目的:探讨冠心病(coronary artery disease,CAD)患者可溶性生长刺激表达基因2蛋白(soluble growth stimulation ex‐pressed gene 2,s ST2)、半乳糖凝集素-3(galectin-3,Gal-3)与心肌纤维化(myocardial fibrosis,MF)的关系,指导临床缺血... 目的:探讨冠心病(coronary artery disease,CAD)患者可溶性生长刺激表达基因2蛋白(soluble growth stimulation ex‐pressed gene 2,s ST2)、半乳糖凝集素-3(galectin-3,Gal-3)与心肌纤维化(myocardial fibrosis,MF)的关系,指导临床缺血性MF的评估。方法:以顺序入选2021年9月至2022年9月在重庆医科大学附属第二医院科住院的冠心病受试者56例非冠心病患者31例为研究对象,根据心血管磁共振-延迟钆增强(cardiovascular magnetic resonance-late gadolinium enhancement,CMR-LGE)将冠心病组分为心肌纤维化(LGE阳性)亚组和非心肌纤维化(LGE阴性)亚组。收集所有受试者的一般临床资料。所有受试者均通过酶联免疫吸附法测定血清s ST2、Gal-3水平。分析s ST2、Gal-3与CMR-LGE结果的相关性。结果:(1)CAD组患者s ST2、Gal-3、血压、肌酐、尿酸、室间隔厚、糖化血红蛋白、CAS评分高于非CAD组患者(P<0.05),而肾小球滤过率、高密度脂蛋白低于非CAD患者(P<0.05)。(2)LGE阳性亚组s ST2、Gal-3、B型利钠肽原水平较LGE阴性亚组高(P<0.05),高密度脂蛋白较LGE阴性亚组低(P<0.05)。(3)LGE与s ST2(rs=0.338,P=0.011)、Gal-3(rs=0.428,P=0.001)、B型利钠肽原(rs=0.364,P=0.006)呈正相关,与高密度脂蛋白(rs=-0.339,P=0.011)呈负相关,纳入控制变量进行偏相关分析得出LGE与s ST2(r=0.312,P=0.037)、Gal-3(r=0.419,P=0.004)独立相关。(4)s ST2、Gal-3以及两者联合检测心肌纤维化的敏感度分别是65%、87%、70%,特异度分别是81%、56%、87%,s ST2、Gal-3预测有无心肌纤维化的最佳临界值分别是36.01 ng/m L、13.04 ng/m L。结论:s ST2、Gal-3可用于预测缺血性心肌纤维化,与CMR-LGE评估心肌纤维化具有高度一致性。 展开更多
关键词 心肌纤维化 冠心病 可溶性生长刺激表达基因2蛋白 半乳糖凝集素-3
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过敏性哮喘患儿血清lncRNA MEG3表达与Th17/Treg平衡的关系 被引量:1
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作者 王星 李瑞婷 马小苗 《中国医药导报》 CAS 2023年第20期113-116,共4页
目的 探讨过敏性哮喘患儿外周血长链非编码核糖核酸母系表达的基因3(lncRNA MEG3)表达与辅助性T细胞(Th)17/调节性T细胞(Treg)失衡的关系。方法 选择2018年1月至2022年1月西安交通大学第一附属医院(以下简称“我院”)收治的75例过敏性... 目的 探讨过敏性哮喘患儿外周血长链非编码核糖核酸母系表达的基因3(lncRNA MEG3)表达与辅助性T细胞(Th)17/调节性T细胞(Treg)失衡的关系。方法 选择2018年1月至2022年1月西安交通大学第一附属医院(以下简称“我院”)收治的75例过敏性哮喘患儿为哮喘组,另选择我院儿童保健门诊的49名健康儿童为对照组。检测两组Th17细胞百分比、Treg细胞百分比、Th17/Treg比值,lncRNA MEG3表达、白细胞介素(IL)-17、IL-22、IL-10、转化生长因子-β(TGF-β)水平及第1秒用力呼气容积(FEV1),计算FEV1与用力肺活量比值(FEV1/FVC)、FEV1占预计值百分比(FEV1%pred)。分析lncRNA MEG3表达与Th17/Treg及其细胞因子、肺功能的相关性。结果 哮喘组lncRNA MEG3表达、Treg细胞百分比低于对照组,Th17细胞百分比、Th17/Treg高于对照组(P<0.05)。哮喘组IL-17、IL-22水平高于对照组,TGF-β、IL-10水平低于对照组(P<0.05)。哮喘组FEV1、FEV1/FVC、FEV1%pred低于对照组(P<0.05)。哮喘组患儿lncRNA MEG3表达与Treg细胞百分比、IL-10、TGF-β、FEV1、FEV1/FVC、FEV1%pred呈正相关(r=0.502、0.415、0.491、0.493、0.428、0.497,P<0.05),与Th17细胞百分比、Th17/Treg、IL-17、IL-22呈负相关(r=-0.501、-0.727、-0.631、-0.452,P<0.05)。结论 过敏性哮喘患者外周血lncRNA MEG3表达降低,且与Th17/Treg失衡及肺功能低下有关。 展开更多
关键词 过敏性哮喘 长链非编码核糖核酸 母系表达的基因3 免疫 辅助性T细胞17 调节性T细胞
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Effects of salvianolic acid-A on NIH/3T3 fibroblast proliferation,collagen synthesis and gene expression 被引量:25
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作者 Liu CH Hu YY +2 位作者 Wang XL Liu P Xu LM 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2000年第3期361-364,共4页
AIM To investigate the mechanisms ofsalvianolic acid A(SA-A)against liver fibrosisin vitro.METHODS NIH/3T3 fibroblasts were culturedroutinely,and incubated with 10<sup>-4</sup>mol/L-10<sup>-7</s... AIM To investigate the mechanisms ofsalvianolic acid A(SA-A)against liver fibrosisin vitro.METHODS NIH/3T3 fibroblasts were culturedroutinely,and incubated with 10<sup>-4</sup>mol/L-10<sup>-7</sup>mol/L SA-A for 22 h.The cell viability wasassayed by[<sup>3</sup>H]proline incorporation,cellproliferation by[<sup>3</sup>H]TdR incorporation,cellcollagen synthetic rate was measured with[<sup>3</sup>H]proline impulse and collagenase digestionmethod.The total RNA was prepared from thecontrol cells and the drug treated cellsrespectively,and α(1)I pro-collagen mRNAexpression was semi-quantitatively analyzedwith RT-PCR.RESULTS 10<sup>-4</sup>mol/L SA-A decreased cellviability and exerted some cytotoxiciy,while10<sup>-5</sup>mol/L-10<sup>-7</sup>mol/L SA-A did not affect cellviability,but inhibited cell proliferationsignificantly,and 10<sup>-6</sup>mol/L SA-A had the besteffect on cell viability among theseconcentrations of drugs.10<sup>-5</sup>mol/L-10<sup>-6</sup>mol/LSA-A inhibited intracellular collagen syntheticrate,but no significant influence on extracellularcollagen secretion.Both 10<sup>-5</sup>mol/L and10<sup>-6</sup>mol/L SA-A could decrease α(1)I pro-collagen mRNA expression remarkably.CONCLUSION SA-A had potent action againstliver fibrosis.It inhibited NIH/3T3 fibroblastproliferation,intracellular collagen syntheticrate and type I pro-collagen gene expression,which may be one of the main mechanisms of thedrug. 展开更多
关键词 salvianolic acid-A NIH/3T3 FIBROBLAST CELL VIABILITY CELL proliferation COLLAGEN gene expression
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血清DNMT1和lncRNA MEG3表达水平与帕金森病的关联性研究
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作者 马颖 李琴福 祁丽霞 《中国临床新医学》 2023年第12期1277-1281,共5页
目的探讨血清DNA甲基转移酶1(DNMT1)、长链非编码RNA人类母系表达基因3(lncRNA MEG3)表达水平与帕金森病(PD)的关联性。方法招募2020年3月至2023年1月青海红十字医院神经内科收治的PD患者106例作为PD组,另选择同期健康体检者103名作为... 目的探讨血清DNA甲基转移酶1(DNMT1)、长链非编码RNA人类母系表达基因3(lncRNA MEG3)表达水平与帕金森病(PD)的关联性。方法招募2020年3月至2023年1月青海红十字医院神经内科收治的PD患者106例作为PD组,另选择同期健康体检者103名作为对照组。比较两组的临床资料,分析PD患者血清DNMT1、lncRNA MEG3表达水平与临床指标的相关性。采用多因素logistic回归分析影响PD发生的因素,采用受试者工作特征(ROC)曲线评估血清DNMT1、lncRNA MEG3水平对PD的诊断价值。结果PD组血清DNMT1水平高于对照组,总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)及lncRNA MEG3水平低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,PD患者血清DNMT1水平与TC、TG、LDL-C水平呈负相关(P<0.05),与统一帕金森病评定量表(UPDRS)Ⅰ评分、UPDRSⅡ评分、UPDRSⅢ评分、Hoehn-Yahr(H-Y)分期呈正相关(P<0.05)。lncRNA MEG3水平与TC、TG、LDL-C水平呈正相关(P<0.05),与UPDRSⅠ评分、UPDRSⅡ评分、UPDRSⅢ评分、H-Y分期呈负相关(P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,较高的血清DNMT1水平是促进PD发生的独立危险因素(P<0.05),较高的lncRNA MEG3水平是抑制PD发生的独立保护因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清DNMT1、lncRNA MEG3水平具有诊断PD的应用价值(P<0.05),且联合两指标可进一步提高诊断效能[AUC(95%CI)=0.906(0.865~0.947)],灵敏度和特异度分别为80.21%和89.34%。结论PD患者血清DNMT1呈高表达,lncRNA MEG3呈低表达,二者联合检测有助于临床诊断PD。 展开更多
关键词 帕金森病 DNA甲基转移酶1 长链非编码RNA人类母系表达基因3
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日本落叶松LkF3H2基因克隆及调控类黄酮代谢功能研究
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作者 李灿 蒋湘宁 盖颖 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期245-252,共8页
【目的】日本落叶松黄烷酮3-羟化酶(flavanone 3-hydroxylase 2,LkF3H2)基因在类黄酮生物合成过程中发挥着重要的调控功能。探究LkF3H2基因在日本落叶松中发挥的具体功能和植物类黄酮生物代谢过程。【方法】根据实验室前期转录组数据克... 【目的】日本落叶松黄烷酮3-羟化酶(flavanone 3-hydroxylase 2,LkF3H2)基因在类黄酮生物合成过程中发挥着重要的调控功能。探究LkF3H2基因在日本落叶松中发挥的具体功能和植物类黄酮生物代谢过程。【方法】根据实验室前期转录组数据克隆日本落叶松LkF3H2基因并进行生物信息学分析及组织表达分析。随后将该基因转化烟草进行转基因烟草组织表达分析及类黄酮含量测定,以探究基因表达量与类黄酮含量之间的关系。【结果】LkF3H2基因cDNA序列长度为1074 bp,其蛋白编码358个氨基酸,分子式C_(1785)H_(2807)N_(481)O_(541)S_(18),分子量为40.24 kD,该蛋白是不稳定的亲水性蛋白且不含信号肽;同时系统进化分析得出日本落叶松LkF3H2与火炬松、辐射松、白云杉和欧洲云杉F3H亲缘关系较近并且该蛋白含有保守结构域2OG-Fe(Ⅱ)oxygenase superfamily,属于2-酮戊二酸依赖性双加氧家族。另外组织表达分析显示LkF3H2基因在一月龄日本落叶松幼苗叶中表达量最高,在一年生日本落叶松幼苗茎中表达量最高,并且在转基因烟草叶中也显示了最高的表达量。值得一提的是,转基因烟草叶中的类黄酮含量也是最高的,其次为茎和根,转基因烟草中类黄酮含量与LkF3H2基因表达量呈正相关关系。【结论】日本落叶松LkF3H2基因属于2-酮戊二酸依赖性双加氧家族并且在类黄酮生物合成过程中发挥着重要功能。 展开更多
关键词 黄烷酮3-羟化酶基因 转基因烟草 组织表达 类黄酮
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合作猪SIRT 3基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究
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作者 闫尊强 梁毓豪 +2 位作者 宋科林 滚双宝 王鹏飞 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1390-1399,共10页
【目的】克隆合作猪沉默信息调节因子3(silence information regulator 3,SIRT3)基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析,探究SIRT 3基因在合作猪不同组织中的表达水平,为研究SIRT 3基因功能奠定基础。【方法】试验选择3月龄合作猪公猪... 【目的】克隆合作猪沉默信息调节因子3(silence information regulator 3,SIRT3)基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析,探究SIRT 3基因在合作猪不同组织中的表达水平,为研究SIRT 3基因功能奠定基础。【方法】试验选择3月龄合作猪公猪3头,采集心脏、睾丸、肺脏等组织,采用PCR扩增、Sanger测序等方法获取SIRT 3基因CDS区序列,并通过Mega 7.0软件构建系统进化树;通过生物信息学在线软件分析SIRT3蛋白结构和功能;采用实时荧光定量PCR检测SIRT 3基因在合作猪不同组织中的表达量。【结果】合作猪SIRT 3基因CDS区长774 bp,共编码257个氨基酸。系统进化树结果显示,合作猪与家猪亲缘关系最近,与斑马鱼亲缘关系最远。SIRT3蛋白的分子质量为28.68 ku,理论等电点为5.81,不稳定系数为37.92,为稳定性亲水蛋白;该蛋白不存在跨膜区域,无信号肽,但存在2个低复杂度结构域,主要分布于内质网中;SIRT3蛋白的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,三级结构模型预测结果与二级结构基本一致。实时荧光定量PCR结果显示,SIRT 3基因在合作猪不同组织中均有表达,在心脏中表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),其次是睾丸、肺脏、肝脏组织。【结论】本研究成功克隆合作猪SIRT 3基因CDS区序列,探究了SIRT 3基因在合作猪不同组织中的表达水平并初步分析了其编码蛋白的生物学功能,为进一步研究合作猪SIRT 3基因功能提供了参考。 展开更多
关键词 合作猪 SIRT 3基因 克隆 生物信息学分析 组织表达
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Maternally expressed gene 3 regulates retinal neovascularization in retinopathy of prematurity 被引量:3
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作者 Yu Di Yue Wang +3 位作者 Yue-Xia Wang Xue Wang Yuan Ma Qing-Zhu Nie 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2022年第6期1364-1368,共5页
The mouse model of oxygen induced retinopathy is suitable for the study of various retinal neovascularization diseases,including retinopathy of prematurity.The maternally expressed gene 3(MEG3)has been demonstrated to... The mouse model of oxygen induced retinopathy is suitable for the study of various retinal neovascularization diseases,including retinopathy of prematurity.The maternally expressed gene 3(MEG3)has been demonstrated to have an inhibitory effect on diabetic retinopathy.In this study,we investigated the role of MEG3 overexpression in oxygen-induced retinopathy in mice.The results showed that MEG3 overexpression effectively inhibited the production of retinal neovascularization in oxygen-induced retinopathy mice.It acts by down-regulating the expression of phosphoinositide 3-kinase,serine/threonine kinase,and vascular endothelial growth factor and pro-inflammatory factors.MEG3 overexpression lentivirus has a future as a new method for the clinical treatment of retinopathy of prematurity.The animal experiments were approved by the Animal Ethics Committee of Shengjing Hospital of China Medical University,China(approval No.2016PS074K)on February 25,2016. 展开更多
关键词 long noncoding RNA maternally expressed gene 3 NEURODEVELOPMENT oxygen-induced retinopathy phos
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Genome-Wide Analysis of the F3′5′H Gene Family in Blueberry(Vaccinium corymbosum L.)Provides Insights into the Regulation of Anthocyanin Biosynthesis
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作者 Xiaolan Guo Jinbin Hu +2 位作者 Shimei Yang Delu Wang Jianbing Wang 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2023年第9期2683-2697,共15页
The F3′5′H gene family plays an important role in regulating anthocyanin biosynthesis,abiotic stress,and hormone signaling.In this study,14 F3′5′H genes were identified from the blueberry genome.The chromosomal di... The F3′5′H gene family plays an important role in regulating anthocyanin biosynthesis,abiotic stress,and hormone signaling.In this study,14 F3′5′H genes were identified from the blueberry genome.The chromosomal distribution,physicochemical properties,F3′5′H domain,conserved motifs,cis-acting elements,and intron/exon compositions were analyzed.The functional prediction analysis of these VcF3′5′Hs indicated that their biological functions included light response and other secondary metabolites.The results of qRT-PCR showed that VcF3′5′Hs(especially VcF3′5′H4)were highly expressed at the ripening stage.Subcellular localization revealed that VcF3′5′H4 may be located in the endoplasmic reticulum.Co-expression analysis showed that the VcF3′5′H gene family was related to anthocyanin.This research provides an overview of the blueberry F3′5′H family and helps verify the role of these genes in regulating anthocyanin biosynthesis. 展开更多
关键词 BLUEBERRY F3′5′H ANTHOCYANIN gene expression CO-expression
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铁皮石斛14-3-3基因家族鉴定及表达分析
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作者 江林琪 赵佳莹 +3 位作者 郑飞雄 姚馨怡 李效贤 俞振明 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期229-241,共13页
【目的】14-3-3蛋白,亦称通用调节因子(GRF),由多基因家族编码,在植物生长发育和逆境应答发挥关键的作用。鉴定铁皮石斛(Dendrobium officinale)GRF基因家族,为铁皮石斛GRF基因功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】通过生物信息学... 【目的】14-3-3蛋白,亦称通用调节因子(GRF),由多基因家族编码,在植物生长发育和逆境应答发挥关键的作用。鉴定铁皮石斛(Dendrobium officinale)GRF基因家族,为铁皮石斛GRF基因功能研究及遗传改良提供理论依据。【方法】通过生物信息学的方法鉴定铁皮石斛14-3-3家族成员,分析其理化性质、染色体定位、系统进化发育、基因结构和启动子顺式作用元件等,同时通过荧光定量PCR技术检测它们在不同组织、低温处理及盐胁迫处理后的表达量。【结果】铁皮石斛有17个GRF家族成员,分为ε类和非ε类亚族,不均匀地分布在7条染色体上,且存在7对串联复制基因。同一亚族成员基因结构、保守基序和蛋白质二级结构相类似。DoGRF家族基因的启动子区域存在大量激素和环境胁迫应答相关的调控元件。DoGRF家族基因在铁皮石斛各组织中均有表达,具有组织表达特异性,大多数基因在花器官中表达最高,其次是茎和根。同时,在低温处理、盐胁迫处理下呈现差异化表达,可能受到低温和盐胁迫的调控,特别是DoGRF2在铁皮石斛逆境应答过程中起着关键的作用。【结论】在全基因组水平从铁皮石斛中鉴定出17个DoGRF家族成员,不同基因对非生物胁迫响应不一,并具有器官表达特异性。DoGRF2对低温和盐胁迫呈现正向响应。 展开更多
关键词 铁皮石斛 14-3-3家族 基因表达 非生物胁迫
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An improved protein expression system for T3SS genes regulation analysis in Xanthomonas oryzae pv. oryzae 被引量:2
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作者 XU Jin-bo ZHANG Cui-ping +5 位作者 WUNIERBIEKE Mei-li YANG Xiao-fei LI Yi-lang CHEN Xiao-bin CHEN Gong-you ZOU Li-fang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2019年第6期1189-1198,共10页
Xanthomonas oryzea pv.oryzae(Xoo)is the causal agent of bacterial blight of rice,which is a significant threat to many of rice-growing regions.The type Ⅲ secretion system(T3SS)is an essential virulence factor in Xoo.... Xanthomonas oryzea pv.oryzae(Xoo)is the causal agent of bacterial blight of rice,which is a significant threat to many of rice-growing regions.The type Ⅲ secretion system(T3SS)is an essential virulence factor in Xoo.Expression of the T3SS is often induced in the host environment or in hrp-inducing medium but is repressed in nutrient-rich medium.The elucidation of molecular mechanism underlying induction of T3SS genes expression is a very important step to lift the veil on global virulence regulation network in Xoo.Thus,an efficient and reliable genetic tool system is required for detection of the T3SS proteins.In this study,we constructed a protein expression vector pH3-flag based on the backbone of pHM1,a most widely used vector in Xoo strains,especially a model strain PXO99A.This vector contains a synthesized MCS-FLAG cassette that consists of a multiple cloning site(MCS),containing a modified pUC18 polylinker,and Flag as a C-terminal tag.The cassette is flanked by transcriptional terminators to eliminate interference of external transcription enabling detection of accurate protein expression.We evaluated the potential of this expression vector as T3SS proteins detection system and demonstrated it is applicable in the study of T3SS genes expression regulation in Xoo.This improved expression system could be very effectively used as a molecular tool in understanding some virulence genes expression and regulation in Xoo and other Xanthomonas spp. 展开更多
关键词 XANTHOMONAS ORYZAE pv.oryzae broad-host range VECTOR expression VECTOR T3SS geneS
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Transcriptomic analysis reveals the effect of the exopolysaccharide of Psychrobacter sp.B-3 on gene expression in RAW264.7 macrophage cells 被引量:1
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作者 ZHANG Pingping LI Jiang +3 位作者 YU Leiye WEI Jingfang XU Tong SUN Guojie 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2018年第8期46-53,共8页
B-3 exopolysaccharide is extracted from the Antarctic psychrophilic bacterium Psychrobacter sp. B-3. We have previously shown that it activates macrophages and affects their immunoregulatory activities. To determine w... B-3 exopolysaccharide is extracted from the Antarctic psychrophilic bacterium Psychrobacter sp. B-3. We have previously shown that it activates macrophages and affects their immunoregulatory activities. To determine what genes are affected during this process, we detected the genes differentially expressed in cells of RAW264.7 macrophages treated with B-3 exopolysaccharide by transcriptomic analysis. B-3 exopolysaccharide treatment caused differential expression of 420 genes, of which 178 were up-regulated and 242 were down-regulated. These genes were shown to be involved in many aspects of cell function, mainly metabolism and immunity. Genes were enriched in multiple immune-related pathways, and the most significantly enriched genes were involved in antigen processing and presentation pathways. The pathway in which differentially expressed genes were the most significantly enriched was the metabolic pathway; specifically, the expression of many metabolic enzyme genes was altered by B-3 exopolysaccharide treatment. Additionally, the genes involved in metabolisms of amino acids, carbohydrates, lipids and nucleotides, varied to certain degrees. B-3 exopolysaccharide, therefore, appears to directly affect the immune function of RAW264.7 macrophages as an immunostimulant, or to indirectly change intracellular metabolism. This is the first study to determine the effect of an Antarctic psychrophilic bacterial exopolysaccharide on RAW264.7 macrophages. Our findings provide an important reference for research into the regulation of macrophage immune function by different polysaccharides. 展开更多
关键词 Psychrobacter sp. B-3 B-3 exopolysaccharide RAW264.7 macrophage differentially expressed genes immunological pathway metabolic pathway
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