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印记基因H19上游高甲基化区SNPs多态性研究 被引量:6
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作者 林晓燕 黄代新 +3 位作者 翟仙敦 林宇新 李小廷 杨庆恩 《中国法医学杂志》 CSCD 2008年第5期302-305,308,共5页
目的建立简单、高效的DNA甲基化标记和SNPs联合检测技术,并用于H19基因上游高甲基化区两组SNPs群体遗传学检测。方法用PCR-DGGE技术对232例武汉汉族无关个体H19基因上游启动子区H19FR1和H19FR2单倍型进行检测;同时选用两种甲基化敏感的... 目的建立简单、高效的DNA甲基化标记和SNPs联合检测技术,并用于H19基因上游高甲基化区两组SNPs群体遗传学检测。方法用PCR-DGGE技术对232例武汉汉族无关个体H19基因上游启动子区H19FR1和H19FR2单倍型进行检测;同时选用两种甲基化敏感的限制酶(msRE)HpaⅡ和HhaⅠ,检测H19FR等位基因亲代来源。结果H19FR1区检出5种单倍型、9种表型组合,其个体识别能力(DP)、多态性信息含量(PIC)和非父排除率(PE)分别为0.803、0.58和0.322;H19FR2区检出2种单倍型、3种表型组合,其DP、PIC和PE值分别为0.626、0.37和0.162。测序结果显示,片段H19FR1含有a7342g、a7357g和g7547a 3个SNPs与1个g7351c点突变;H19FR2仅含a8097g 1个SNP。msRE HpaⅡ或HhaⅠ可消化个体母源等位基因,PDP-DGGE分析仅能检测到父源等位基因。结论PDP-DGGE是一种简单、灵敏、高效的DNA甲基化标记和SNPs联合分析技术,其在进行多态性分型同时还可以确定等位基因的亲代来源,具有较高的法医学应用价值。 展开更多
关键词 法医物证学 印记基因 SNP 聚合酶链反应 变性梯度凝胶电泳 甲基化敏感的限制酶
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HUMARA基因座差异甲基化的法医学意义 被引量:4
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作者 赵贵森 杨庆恩 +2 位作者 黄代新 余纯应 杨荣芝 《中国法医学杂志》 CSCD 2004年第5期275-277,共3页
目的 探讨X连锁差异甲基化多态性基因座的法医学应用意义。方法 以STR基因座HUMARA为例 ,应用甲基化敏感性限制酶消化后PCR技术 ,复合分析该基因座的STR多态性和甲基化状态 ,调查并比较男、女检材的分型效果。结果 基因组DNA经HpaⅡ... 目的 探讨X连锁差异甲基化多态性基因座的法医学应用意义。方法 以STR基因座HUMARA为例 ,应用甲基化敏感性限制酶消化后PCR技术 ,复合分析该基因座的STR多态性和甲基化状态 ,调查并比较男、女检材的分型效果。结果 基因组DNA经HpaⅡ消化后 ,男性没有扩增产物 ,女性分型不受影响 ,男女混合检材得到女性的分型图谱。女性单克隆瘤细胞只能检出 1个等位基因。结论 差异甲基化的HUMARA基因座是混合斑分析、性别鉴定和组织克隆性判断的有用工具。 展开更多
关键词 甲基化状态 分型 女性 多态性 瘤细胞 基因座 克隆性 检材 法医学应用 混合斑
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Revolutionizing Non-Invasive Biomarker Discoveries: The Power of Methylation Screening Analysis in Cell-Free DNA Liquid Biopsy
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作者 Min Seob Lee Na Young Min +2 位作者 Hyuk Jung Kwon Yonjung Kim Isaac Kise Lee 《Open Journal of Genetics》 CAS 2023年第1期48-74,共27页
Epigenetic changes of DNA, including methylation, have long been recognized as key indicators of various diseases, including aging, cancer, and neurological disorders. Biomarker discoveries based on distinct methylati... Epigenetic changes of DNA, including methylation, have long been recognized as key indicators of various diseases, including aging, cancer, and neurological disorders. Biomarker discoveries based on distinct methylation patterns for both hypermethylation and hypomethylation lead the way in discovery of novel diagnosis and treatment targets. Many different approaches are present to detect the level of methylation in whole genome (whole genome bisulfite sequencing, microarray) as well as at specific loci (methylation specific PCR). Cell-free DNA (cf-DNA) found in body fluids like blood provides information about DNA methylation and serves as a less invasive approach for genetic screening. Cell-free DNA and methylation screening technologies, when combined, have the potential to transform the way we approach genetic screening and personalized therapy. These technologies can help enhance disease diagnostic accuracy and inform the development of targeted therapeutics by providing a non-invasive way for acquiring genomic information and identifying disease-associated methylation patterns. We highlight the clinical benefits of using cell-free DNA (cf-DNA) liquid biopsy analysis and available methylation screening technologies that have been crucial in identifying biomarkers for disease from patients using a non-invasive way. Powering such biomarker discoveries are various methods of cf-DNA methylation analysis such as Bisulfite Sequencing and most recently, Methylation-Specific Restriction Enzyme (MSRE-seq) Analysis, paving the way for novel epigenetic biomarker discoveries for more robust diagnosis such as early disease detection, prognosis, monitoring of disease progression and treatment response as well as discovery of novel drug targets. 展开更多
关键词 Epigenetics Biomarkers Cell-Free DNA (cf-DNA) METHYLATION Liquid Biopsy Drug Target Methylation-Specific restriction enzyme (msre) Cancer Epigenetic Drugs HYPERMETHYLATION HYPOMETHYLATION
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H19基因上游差异性甲基化区SNPs多态性研究
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作者 王鑫 韦文滔 +6 位作者 王冬梅 丁梅 王保捷 庞灏 邢佳鑫 宣金锋 李春梅 《中国法医学杂志》 CSCD 2013年第1期14-17,I0003,共5页
目的获得H19基因上游差异性甲基化区中SNPs的群体遗传学信息。方法采用PCR和测序技术,对105例中国北方汉族健康无关个体H19上游启动子区检测;使用Haploview 4.1和PowerStats V12软件进行统计学分析。选用甲基化敏感的限制内切酶(msRE)Hp... 目的获得H19基因上游差异性甲基化区中SNPs的群体遗传学信息。方法采用PCR和测序技术,对105例中国北方汉族健康无关个体H19上游启动子区检测;使用Haploview 4.1和PowerStats V12软件进行统计学分析。选用甲基化敏感的限制内切酶(msRE)HpaⅡ,检测5个家系样本H19等位基因的亲代来源。结果测序结果显示,H19启动子区含有13个SNPs,组成5种单倍型,13种单倍型组合,其个体识别能力为0.856、多态性信息含量为0.67、非父排除率为0.498。经msRE HpaⅡ消化母源等位基因后,进行PCR及测序分析,检测出父源等位基因,排除1例和肯定4例家系的亲缘关系。结论 DNA甲基化标记和SNPs多态性检测,可同时进行多态性分型并确定等位基因的亲代来源,具有较高的法医学应用价值。 展开更多
关键词 法医物证学 DNA测序 单核苷酸多态性 甲基化敏感的限制内切酶
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