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奶牛无浆体病PCR诊断及msp5基因序列分析 被引量:1
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作者 邵红 李春龙 +3 位作者 周玉龙 李娜 侯喜林 朴范泽 《畜牧与兽医》 北大核心 2008年第4期73-76,共4页
本研究应用PCR方法鉴定出1例无浆体病牛,将扩增的DNA片段进行克隆测序鉴定并进行同源性分析。结果发现目的基因与边缘无浆体(Anaplsma marginale)LZ株和HN株msp5基因的同源性是100%,进而证实黑龙江分离株与兰州株边缘无浆体msp5基因序... 本研究应用PCR方法鉴定出1例无浆体病牛,将扩增的DNA片段进行克隆测序鉴定并进行同源性分析。结果发现目的基因与边缘无浆体(Anaplsma marginale)LZ株和HN株msp5基因的同源性是100%,进而证实黑龙江分离株与兰州株边缘无浆体msp5基因序列高度同源。 展开更多
关键词 无浆体病 pcr msp5基因 序列分析 奶牛
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改良的甲基化特异PCR法在人宫颈癌Hela细胞检测中的应用 被引量:6
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作者 邢学森 黄利鸣 +2 位作者 黄益玲 陈梅花 石新兰 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期191-194,共4页
目的介绍一种CpG岛甲基化分析方法,即甲基化特异PCR法(methylation-specific PCR,MSP)以及对该方法的改良。方法用亚硫酸氢盐修饰被测DNA后,进行甲基化与非甲基化特异PCR的扩增,并对MSP法进行改良。应用该法分析人宫颈癌Hela细胞中RASS... 目的介绍一种CpG岛甲基化分析方法,即甲基化特异PCR法(methylation-specific PCR,MSP)以及对该方法的改良。方法用亚硫酸氢盐修饰被测DNA后,进行甲基化与非甲基化特异PCR的扩增,并对MSP法进行改良。应用该法分析人宫颈癌Hela细胞中RASSF1A、p16基因5'CpG岛甲基化状态。结果发现人宫颈癌Hela细胞中有RASSF1A、p16基因的甲基化,改良后的MSP更容易获得较好的效果。结论MSP法是一种较为简便、灵敏和具特异性的甲基化检测方法,改良后该方法更加简便可行。 展开更多
关键词 RASSF1A P16 人宫颈癌HELA细胞 甲基化特异pcr法(msp)
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间日疟原虫MSP1 C端编码基因的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 高世同 吴少庭 +2 位作者 张仁利 袁仕善 黄达娜 《中国寄生虫病防治杂志》 CSCD 2003年第4期204-207,共4页
目的 克隆间日疟原虫MSP1C端编码基因,并进行序列测定和分析。方法 根据间日疟原虫MSP1C端编码基因设计1对引物,采用PCR技术从深圳间日疟患者血样(编号为PvSZ1)的核酸提取物中扩增出MSP1C端编码基因,回收纯化后,与T载体连接构建重组子pM... 目的 克隆间日疟原虫MSP1C端编码基因,并进行序列测定和分析。方法 根据间日疟原虫MSP1C端编码基因设计1对引物,采用PCR技术从深圳间日疟患者血样(编号为PvSZ1)的核酸提取物中扩增出MSP1C端编码基因,回收纯化后,与T载体连接构建重组子pMD/MSP1,并转化大肠杆菌JM109。阳性克隆以限制性酶切分析与PCR法鉴定后,双脱氧链末端终止法双向测定序列并分析。结果 从间日疟血样提取的DNA中扩增出1119bp的基因片段,所构建的pMD/MSP1阳性克隆重组子经双酶切和PCR鉴定与预期结果一致。所测定的间日疟原虫PvSZ1C端基因序列与国外Sal-1株比较,碱基数相同,未发现碱基缺失,相同的核苷酸占96.7%,序列中第542位碱基变化为同义突变(GTC→GTT,均编码缬氨酸),第375~542区间的碱基变化数占整个序列变化碱基总数的92.9%(34/37)。所推测的氨基酸序列与Sal-1株比较,同源性为92.5%。结论 成功克隆了间日疟原虫PvSZ1株MSP1C端编码基因,该基因在不同间日疟原虫地理株间相对保守,所克隆基因序列的第375~542核苷酸区域为高频变化区。 展开更多
关键词 间日疟原虫 msp1-C端编码基因 克隆 基因序列分析 pcr技术
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实时荧光定量PCR检测膀胱癌TWIST1基因启动子的甲基化状态 被引量:1
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作者 陆明 钱麟 +2 位作者 潘彬 陈建刚 王朔 《临床医学工程》 2011年第5期644-646,共3页
目的建立针对TWIST1基因启动子甲基化状态的荧光定量检测方法,进而评估其在膀胱癌临床研究的应用前景。方法应用实时荧光定量PCR方法检测南通地区50例确诊膀胱癌患者和25例非膀胱癌的健康对照者的尿液标本中TWIST1基因启动子的甲基化和... 目的建立针对TWIST1基因启动子甲基化状态的荧光定量检测方法,进而评估其在膀胱癌临床研究的应用前景。方法应用实时荧光定量PCR方法检测南通地区50例确诊膀胱癌患者和25例非膀胱癌的健康对照者的尿液标本中TWIST1基因启动子的甲基化和非甲基化含量,对其甲基化率进行对比。结果正常人的TWIST1启动子的甲基化率为8.1%~17.3%,平均值为12.3%,膀胱癌患者的甲基化率为25.2%~48.3%,平均值为38.2%,膀胱癌患者的TWIST1基因启动子甲基化率有明显的增高(P<0.05)。结论 TWIST1基因启动子区在膀胱癌中异常甲基化,能够作为有效检测膀胱癌的基因。 展开更多
关键词 荧光定量pcr检测 msp TWIST1基因 甲基化 膀胱癌
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应用改进MSP法检测非小细胞肺癌患者血清DAPK基因甲基化 被引量:2
5
作者 林勍 于正洪 +2 位作者 陈龙邦 唐永明 王晶 《现代检验医学杂志》 CAS 2006年第5期16-18,共3页
目的通过分析非小细胞肺癌(N SCLC)患者血清中死亡相关蛋白激酶(DAPK)启动子区域甲基化的改变状况及其临床意义,寻找一种切实可行的检测方法及肿瘤的生物标志物。方法运用改良的甲基化特异性PCR(M SP)技术,检测80例N SCLC患者血清DAPK... 目的通过分析非小细胞肺癌(N SCLC)患者血清中死亡相关蛋白激酶(DAPK)启动子区域甲基化的改变状况及其临床意义,寻找一种切实可行的检测方法及肿瘤的生物标志物。方法运用改良的甲基化特异性PCR(M SP)技术,检测80例N SCLC患者血清DAPK基因启动因子区域甲基化的改变情况,并分析与临床病理资料的关系。结果N SCLC患者血清DAPK基因甲基化检出率为31.3%(25/80),而正常对照组和良性肺部疾病组血清未检出DAPK基因甲基化,DAPK基因甲基化检出率与N SCLC病理类型、分期及转移状态无明显关系。结论运用改进的M SP法检测血清中DAPK基因启动因子区域异常甲基化是一种行之有效的方法,检测DAPK基因甲基化可作N SCLC早期辅助诊断的分子标志物之一。 展开更多
关键词 甲基化特异性pcr(msp) 死亡相关蛋白激酶(DAPK)基因 血清 甲基化
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玉米MuDR转座子DNA甲基化的MSP检测(英文)
6
作者 钱叶雄 江海洋 +1 位作者 程备久 朱苏文 《激光生物学报》 CAS CSCD 2009年第6期834-839,共6页
DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,广泛存在于高等动植物中,并在维持基因组稳定性、调节基因表达等方面起着重要作用,因此建立快速有效地DNA甲基化检测技术至关重要。本文以两种不同MuDR活性的玉米转座子材料为研究对象,探讨了甲基... DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,广泛存在于高等动植物中,并在维持基因组稳定性、调节基因表达等方面起着重要作用,因此建立快速有效地DNA甲基化检测技术至关重要。本文以两种不同MuDR活性的玉米转座子材料为研究对象,探讨了甲基化特异性PCR(MSP)在检测DNA甲基化的有效性。结果表明:MSP技术可快速有效地检测MuDR转座子的末端反向重复(TIRs)序列内的CpG岛DNA甲基化的变化,灵敏度高,特异性强,可作为植物已知基因DNA甲基化检测的一种新方法。同时利用MSP研究发现,玉米MuDR转座子的活性随其TIRs序列内的CpG岛DNA甲基化的变化而改变,DNA甲基化是调控玉米MuDR转座活性的重要分子机制之一。 展开更多
关键词 Mutator转座子 DNA甲基化 甲基化特异性pcr(msp)
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利用套式PCR检测牛羊乏质体
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作者 李树清 王贵强 +7 位作者 陈志飞 赵俊龙 王巧全 张子群 由轩 胡永强 杜凯 姚宝安 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1768-1775,共8页
为同时检测和鉴定牛边缘乏质体、中央乏质体及绵羊乏质体,根据这3种病原体的msp4基因核苷酸序列,自行设计、合成了针对3种乏质体的2对通用引物,及分别针对三者的特异引物,通过PCR条件优化,建立了检测乏质体及分别鉴定3种乏质体的套式PC... 为同时检测和鉴定牛边缘乏质体、中央乏质体及绵羊乏质体,根据这3种病原体的msp4基因核苷酸序列,自行设计、合成了针对3种乏质体的2对通用引物,及分别针对三者的特异引物,通过PCR条件优化,建立了检测乏质体及分别鉴定3种乏质体的套式PCR方法,并与OIE推荐的msp5半套式PCR比较。结果显示:该方法对牛巴贝斯虫、双芽巴贝斯虫、羊莫氏巴贝斯虫、山羊泰勒虫、温氏附红细胞体、东方巴贝斯虫、刚地弓形虫、伊氏锥虫均未扩增出特异性片段。套式PCR检测乏质体DNA量为0.2pg(相当于6个感染红细胞)。检测1 119份来自6个不同地区的奶牛、肉牛、水牛及羊的临床样品,阳性106份,经鉴定边缘乏质体46份,中央乏质体15份,绵羊乏质体35份,混合感染中央乏质体和绵羊乏质体4份,混合感染边缘乏质体和绵羊乏质体3份,混合感染边缘乏质体和中央乏质体3份。首次在分子生物学水平证明中央乏质体存在于中国。同时,证明牛可以混合感染边缘乏质体和中央乏质体或绵羊乏质体,以及混合感染中央乏质体和绵羊乏质体。上述848份样品用OIE推荐的msp5半套式PCR同时检测,两者符合率为98.5%(835/848)。检测结果表明,msp4套式PCR特异、敏感,可用于边缘乏质体、中央乏质体、绵羊乏质体的检测和鉴定。 展开更多
关键词 msp4 套式pcr 边缘乏质体 中央乏质体 绵羊乏质体 检测 鉴定
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恶性疟原虫Fcc-1/HN株MSP1_(19)基因的体外扩增及鉴定
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作者 李学荣 余新炳 +3 位作者 罗树红 陈观今 徐劲 方建民 《中国寄生虫病防治杂志》 CSCD 1998年第4期267-271,共5页
本文根据恶性疟原虫MSP119已知序列,自行设计一对用于特异扩增MSP1C端19肽基因的引物P1、P2,在P1引物中引入SalⅠ酶切位点及ATG起始密码子,在P2引物中引入XbaⅠ酶切位点及终止密码子,经PCR扩增获... 本文根据恶性疟原虫MSP119已知序列,自行设计一对用于特异扩增MSP1C端19肽基因的引物P1、P2,在P1引物中引入SalⅠ酶切位点及ATG起始密码子,在P2引物中引入XbaⅠ酶切位点及终止密码子,经PCR扩增获得363bp大小片段,与预期大小相符。采用“压碎与浸泡法”纯化回收PCR产物,PCR产物经套式PCR及酶切鉴定证实与预期大小相符,说明所获确为MSP119基因。为进一步将该基因与PfCMR基因进行重组表达复合抗原和免疫接种奠定基础。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 pcr 疟疾疫苗 msp1
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ApoB100基因第26号外显子6694bp处MspⅠ位点突变与高血脂相关性
9
作者 陈奇奥 孙敏 +1 位作者 沙姗姗 徐永成 《放射免疫学杂志》 CAS 2008年第6期594-597,共4页
目的:载脂蛋白B100(ApoB100)是血浆中低密度脂蛋白(LDL)的组成成分,可与组织中LDL受体结合并介导LDL的降解和清除,此功能对于维持血清中LDL和胆固醇水平的稳定起重要作用。ApoB100的一些基因突变将明显影响ApoB100的结构和功能,导致血浆... 目的:载脂蛋白B100(ApoB100)是血浆中低密度脂蛋白(LDL)的组成成分,可与组织中LDL受体结合并介导LDL的降解和清除,此功能对于维持血清中LDL和胆固醇水平的稳定起重要作用。ApoB100的一些基因突变将明显影响ApoB100的结构和功能,导致血浆中LDL降解受阻,血浆中LDL和胆固醇含量升高从而增加其它心血管疾病的风险。本文将探讨ApoB100基因第26号外显子6694bp处的基因突变所致的MspⅠ位点多态性与高血脂之间的关系。方法:本文采用KI法提取50例高血脂症患者、60例对照组人群外周血细胞基因组DNA,设计并合成PCR引物,利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法(PCR-RFLP)分析其ApoB100基因第26号外显子6694bp处MspⅠ位点的基因型。结果:高血脂组基因型分布为M(+)M(+):42例,M(+)M(-):7例,M(-)M(-):1例;对照组基因型分布为M(+)M(+):59例,M(+)M(-):1例,M(-)M(-):0例。统计分析表明高血脂组与对照组之间基因型分布有明显差异(P<0.05)。结论:ApoB100基因第26号外显子6694bp处MspⅠ位点突变与高血脂相关。 展开更多
关键词 APOB100 msp I位点多态性高血脂 pcr-RFLP方法
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细胞色素P450氧化酶基因MSP1位点多态性与早产的关联性研究 被引量:5
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作者 金莹 陈大方 +4 位作者 杨帆 李志平 方治安 李凌松 王黎华 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期595-599,共5页
目的:探讨早产与母、婴细胞色素 P450氧化酶基因(CYPIAI)MSPI 位点多态性的关系 方法:于1999年到2001年,采用病例对照及核心家系的研究设计,在安徽省安庆市调查了496个核心家系,包括247个正常孕周出生的核心家系(对照核心家系)和... 目的:探讨早产与母、婴细胞色素 P450氧化酶基因(CYPIAI)MSPI 位点多态性的关系 方法:于1999年到2001年,采用病例对照及核心家系的研究设计,在安徽省安庆市调查了496个核心家系,包括247个正常孕周出生的核心家系(对照核心家系)和249个早产中核心家系 采用盐沉淀法提取基因组 DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)对细胞色素 P450氧化酶基因 MSPI 位点进行基因型签定 采用对数-线性回归模型(log-Iinear model)分析母亲和婴儿 CYPIAI 基因 MSPI 位点多态性与早产的关联 观察母亲与婴儿 CYPIAI 基因之间的联合作用是否对早产有影响,并采用 TDT 方法检验早产对照核心家系 CYPIAI 基因 MSPI 位点、等位基因传递是否平衡。结果:婴儿 CYPIAI 基因 C/C6235基因型能明显增加早产的发生危险性(RR=1.80,95%CI=1.02~3.18)。同时,我们也发现母亲 CYPIAI 基因 C/C6235基因型对早产有显著影响(RR=1.82,95%CI=1.11~2.98)。母亲与婴儿CYPIAI 基因之间无明显联合作用存在 对照核心家系 CYPIAI 基因 MSPI 突变等位基因传递符合孟德尔遗传规律。结论:婴儿 CYPIAI 基因 C/C6235基因型和母亲 C/C6235基因型均能够明显增加早产发生风险,在早产核心家系中 CYPIAI 基因 MSOI 突变等位基因传递不符合孟德尔遗传规律。 展开更多
关键词 早产 核心家系 msp 婴儿 对照 酶基因 多态性 位点 细胞色素 pcr)
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MSP网上在线免费引物设计介绍
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作者 张云 《中国检验医学与临床》 2003年第4期188-188,共1页
现在普遍认为肿瘤的发生与DNA的异常甲基化有关,所以DNA甲基化状态的研究成为了研究肿瘤发生机制的一个热点,MSP(methylation specific PCR)则是检测DNA甲基化状态的一个简便有效的方法。理想的引物是MSP扩增成功与否的关键因素之一... 现在普遍认为肿瘤的发生与DNA的异常甲基化有关,所以DNA甲基化状态的研究成为了研究肿瘤发生机制的一个热点,MSP(methylation specific PCR)则是检测DNA甲基化状态的一个简便有效的方法。理想的引物是MSP扩增成功与否的关键因素之一,它决定着MSP扩增的特异性、扩增的效率和扩增的保真度等。 展开更多
关键词 msp 扩增 肿瘤发生 DNA甲基化 引物设计 异常甲基化 网上 pcr) 特异性
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多重MSP检测早期鼻咽癌甲基化基因的初步探索
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作者 叶宇东 王贤斌 邱前辉 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2014年第24期3919-3921,共3页
目的:探讨多重MSP(multiplex-MSP)检测基因甲基化在鼻咽癌早期诊断中的作用。方法:通过MSP方法对35例Ⅰ期鼻咽癌标本18个基因的甲基化状态进行验证;同时通过条件摸索建立多重MSP方法,尝试实现多个基因甲基化状态的快速检测。结果:甲基... 目的:探讨多重MSP(multiplex-MSP)检测基因甲基化在鼻咽癌早期诊断中的作用。方法:通过MSP方法对35例Ⅰ期鼻咽癌标本18个基因的甲基化状态进行验证;同时通过条件摸索建立多重MSP方法,尝试实现多个基因甲基化状态的快速检测。结果:甲基化率超过50%的基因有12个;多重MSP检测中仅1组合的非甲基化特异性产物(U片段)扩增效果没有达到预期结果 ,余3个组合电泳结果与甲基化特异性PCR相符。结论:采取合适的组合进行多重MSP扩增可获得理想结果 ,其结果与MSP以及甲基化芯片扫描结果相似,是一种效率高,成本较低的实验方法。 展开更多
关键词 早期鼻咽癌 甲基化特异性pcr 多重msp
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Detection of Serum DNA in Cancer Patients by Modified Methylation Specific PCR 被引量:4
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作者 LIYUongchang SUNJunning 等 《The Chinese-German Journal of Clinical Oncology》 CAS 2002年第3期170-171,共2页
Ojbective To search for circulating DNA as a biomarker for the cancer burden of patients^[1].Methods Methylation specific PCR(MSP),according to Herman et al,was used to identify this epigenetic modification of DNA fro... Ojbective To search for circulating DNA as a biomarker for the cancer burden of patients^[1].Methods Methylation specific PCR(MSP),according to Herman et al,was used to identify this epigenetic modification of DNA from serum and tissue of 111 patients with different cancers.In parallel the mutant K-ras gene was analyzed in 55 cases for comparison.Results Methylation of the p16 gene was found in serum or cancer tissue in about 50% of patients with a statistically significant difference Results Methylation of the p16 gene was found in serum or cancer tissue in about 50% of patients with a statistically significant difference to healthy controls(P<0.05).There was no difference between the DNA from the tumor and from the neighboring normal tissue or from sereum in early cancer.The positivity rate increased with progression of the tumor.20 days after the operation methylated DNA nearly disappeared.The positivity rate for mutant K-ras was only 30% and thus much lower than that of methlated DNA.The combination of the two markers increased the positivity rate of tumors by 13%.Conclusion The detection of methylation of the p16 gene by MSP combined with mutant K-ras is serum of cancer patients would be a very effective method to estimate the cancer burden. 展开更多
关键词 肿瘤患者 血清DNA 肿瘤DNA 检测 改良甲基化特异性pcr msp
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Expression of O<sup>6</sup>-Methylguanine-DNA Methyltransferase Examined by Alkyl-Transfer Assays, Methylation-Specific PCR and Western Blots in Tumors and Matched Normal Tissue 被引量:1
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作者 Kimiko Ishiguro Krishnamurthy Shyam +4 位作者 Philip G. Penketh Raymond P. Baumann Alan C. Sartorelli Thomas J. Rutherford Elena S. Ratner 《Journal of Cancer Therapy》 2013年第4期919-931,共13页
The tumor selectivity of alkylating agents that produce guanine O6-chloroethyl (laromustine and carmustine) and O6-methyl (temozolomide) lesions depends upon O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) activity bein... The tumor selectivity of alkylating agents that produce guanine O6-chloroethyl (laromustine and carmustine) and O6-methyl (temozolomide) lesions depends upon O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) activity being lower in tumor than in host tissue. Despite the established role of MGMT as a tumor resistance factor, consensus on how to assess MGMT expression in clinical samples is unsettled. The aim of this study is to examine the relationship between the values derived from distinctive MGMT measurements in 13, 12, 6 and 2 pairs of human tumors and matched normal adjacent tissue from the colon, kidney, lung and liver, respectively, and in human cell lines. The MGMT measurements included 1) alkyl-transfer assays using [benzene-3H]O6-benzylguanine as a substrate to assess functional MGMT activity, 2) methylation-specific PCR (MSP) to probe MGMT gene promoter CpG methylations as a measure of gene silencing, and 3) western immunoblots to analyze the MGMT protein. In human cell lines, a strict negative correlation existed between MGMT activity and the extent of promoter methylation. In tissue specimens, by contrast, the correlation between these two variables was low. Moreover, alkyl-transfer assays identified 3 pairs of tumors and normal tissue with tumor-selective reduction in MGMT activity in the absence of promoter methylation. Cell line MGMT migrated as a single band in western analyses, whereas tissue MGMT was heterogeneous around its molecular size and at much higher molecular masses, indicative of multi-layered post-translational modifications. Malignancy is occasionally associated with a mobility shift in MGMT. Contrary to the prevalent expectation that MGMT expression is governed at the level of gene silencing, these data suggest that other mechanisms that can lead to tumorselective reduction in MGMT activity exist in human tissue. 展开更多
关键词 O6-Methylguanine-DNA METHYLTRANSFERASE (MGMT O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase AGT) [Benzene-3H]O6-Benzylguanine Methylation-Specific pcr (msp) Laromustine (Onrigin Cloretazine VNP40101M 101M) TEMOZOLOMIDE
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模拟I^2C总线技术在MSP430单片机中的应用
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作者 蔡明 《自动化与仪器仪表》 2005年第2期26-29,60,共5页
首先对MSP430系列单片机进行了简要介绍,然后重点分析了目前国际上流行的模拟I2C 总线技术,并通过带有标准I2C接口芯片--PCF8583日历芯片的具体编程,详细地为大家介绍了模拟I2C总线技术在一款崭新的单片机中的实际应用。
关键词 I^2C总线 软件模拟 msp430 单片机 pcr583 日历芯片
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肺癌细胞株APC基因启动子甲基化对其转录的影响 被引量:10
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作者 张丽霞 潘世扬 +7 位作者 陈丹 谢而付 高丽 束永前 陆祖宏 程璐 杨迪 张寄南 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第6期576-580,共5页
背景与目的:抑癌基因家族性腺瘤样结肠息肉病易感基因(adenomatous polyposis coli,APC)启动子区的高甲基化在很多肿瘤中被发现,与这些肿瘤的发生发展相关。本实验室在肺癌患者肿瘤组织中检测到APC甲基化率达47%,为了研究其在肺癌细胞... 背景与目的:抑癌基因家族性腺瘤样结肠息肉病易感基因(adenomatous polyposis coli,APC)启动子区的高甲基化在很多肿瘤中被发现,与这些肿瘤的发生发展相关。本实验室在肺癌患者肿瘤组织中检测到APC甲基化率达47%,为了研究其在肺癌细胞株中的甲基化情况,并进一步了解甲基化对其转录的影响,本研究检测了3株肺癌细胞的抑癌基因APC启动子甲基化状态及其对该基因转录水平的影响。方法:提取3株肺癌细胞株(肺腺癌细胞株SPC-A1、小细胞肺癌细胞株NCI-H446、大细胞肺癌细胞株NCI-H460)的DNA,以经转甲基处理和未做处理的脐带血DNA为阳性、阴性对照,亚硫酸氢盐化学修饰后,用甲基化特异性基因扩增(methylation specific-polymerase chain reaction,MSP)和甲基化基因芯片对APC基因启动子1ACpG岛甲基化进行研究,并用实时荧光定量PCR(real time-polymerase chain reaction)技术,以Sybr-GreenⅠ为荧光染料,β-actin基因为内参照,检测mRNA转录;对甲基化阳性的NCI-H460细胞,分别用1、5、10、15μmol/L的5′-杂氮-2'-脱氧胞嘧啶(5-aza-2-deoxycytidine,5-aza-dC)试剂进行脱甲基化,提取RNA,荧光定量检测其转录变化。结果:SPC-A1和NCI-H446细胞APC甲基化阴性,NCI-H460细胞APC甲基化阳性;甲基化芯片检测NCI-H460细胞在APC启动子1A5个CpG位点均存在甲基化(687、707、714、719、726),SPC-A1和NCI-H446甲基化阴性,荧光定量结果NCI-H460的APC转录较SPC-A1和NCI-H446有明显的下降,仅为二者平均的30.04%;经5-aza-dC脱甲基化作用后,NCI-H460细胞的APC表达增加了约5~10倍,其中10μmol/L浓度作用下,APC表达增加最多。结论:肺癌细胞株NCI-H460中存在APC基因高甲基化,5-aza-dC脱甲基化试剂可以激活其转录。 展开更多
关键词 肺癌细胞株 APC msp 甲基化芯片 5-AZA-DC 实时荧光定量pcr
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联合检测vimentin和SFRP2甲基化在大肠癌筛查中的应用评价 被引量:12
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作者 肖著军 王新颖 +6 位作者 李丙生 李钊 马群英 朱伟思 王国振 林金凤 许岸高 《现代消化及介入诊疗》 2014年第1期13-16,20,共5页
目的评价在粪便样本中联合检测vimentin和SFRP2甲基化来筛查大肠癌的性能。方法搜集合格的新鲜粪便标本95例,其中40例大肠癌患者、25例进展期腺瘤患者和30例结肠镜阴性的正常人,应用甲基化特异性PCR(MSP)法检测vimentin和SFRP2甲基化状... 目的评价在粪便样本中联合检测vimentin和SFRP2甲基化来筛查大肠癌的性能。方法搜集合格的新鲜粪便标本95例,其中40例大肠癌患者、25例进展期腺瘤患者和30例结肠镜阴性的正常人,应用甲基化特异性PCR(MSP)法检测vimentin和SFRP2甲基化状态,并与单个基因甲基化检测和粪隐血试验(FOBT)的诊断性能相比较是否有统计学差异。结果大肠癌组中vimentin和SFRP2甲基化阳性检出率分别为55.0%(22/40)和70.0%(28/40);进展期腺瘤组中为48.0%(12/25)和64.0%(16/25);正常对照组中为6.7%(2/30)和0(0/30)。在病例组中两基因联合检测的敏感性为83.1%(54/65),明显高于vimentin的52.3%(34/65)和SFRP2的67.7%(44/65),更要高于FOBT的27.7%(18/65)(均P<0.05)。而在正常对照组中两基因联合检测的特异性为93.3%(28/30),与vimentin的93.3%(28/30)和SFRP2的100%(30/30)以及FOBT的96.7%(29/30)相比均无明显差异(均P>0.05)。结论在大肠癌筛查中,联合检测粪便中vimentin和SFRP2基因甲基化状态明显优于单个基因和粪便潜血试验,具有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 VIMENTIN SFRP2 甲基化 大肠癌 VIMENTIN SFRP2 Methylation-specific pcr (msp)
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膀胱癌中BLU基因启动子高甲基化和转录水平 被引量:3
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作者 张剑英 李智 +1 位作者 于永春 段建敏 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期304-307,共4页
目的研究膀胱癌中BLU基因启动子甲基化状态、转录水平及其意义。方法采用甲基化特异性PCR(meth-ylation specific PCR,MSP)技术和逆转录PCR(RT-PCR)技术分别检测54例膀胱癌患者癌组织及45例相应癌周正常组织、3例非肿瘤患者的正常膀胱... 目的研究膀胱癌中BLU基因启动子甲基化状态、转录水平及其意义。方法采用甲基化特异性PCR(meth-ylation specific PCR,MSP)技术和逆转录PCR(RT-PCR)技术分别检测54例膀胱癌患者癌组织及45例相应癌周正常组织、3例非肿瘤患者的正常膀胱组织中BLU基因启动子甲基化状态和转录水平。结果①31.5%(17/54)膀胱癌组织中BLU基因高甲基化,相应癌周正常组织和3例正常膀胱组织均未发现该基因高甲基化改变;②甲基化状态与膀胱癌临床病理参数无明显相关性;③在45例膀胱癌组织中,BLU表达缺失率为42.2%(19/45);④BLU mRNA表达缺失与肿瘤临床分期和病理分级相关(P<0.05);⑤在启动子高甲基化的膀胱癌中,92.3%(12/13)BLU mRNA表达异常下调或缺失。结论膀胱癌中频繁发生BLU基因的高甲基化和mRNA表达缺失,其高甲基化可能是基因转录失活的重要原因。 展开更多
关键词 膀胱癌 BLU 甲基化 转录 甲基化特异性pcr
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大肠癌p16抑癌基因甲基化及与Dukes分期的关系 被引量:4
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作者 王志伟 易静 +5 位作者 仓辉 赵任 邹鸿志 王灏 郁宝铭 汤雪明 《上海第二医科大学学报》 CSCD 2001年第4期307-309,共3页
目的检测大肠癌患者 p16基因启动子CpG区甲基化的改变 ,探讨其与大肠癌发生、发展和临床资料的关系。 方法采用甲基化特异PCR技术 (MSP法 )研究 5 8例大肠癌标本 p16基因甲基化改变 ,分析临床病理资料。 结果 2 5例标本 (4 3 .1% )呈 ... 目的检测大肠癌患者 p16基因启动子CpG区甲基化的改变 ,探讨其与大肠癌发生、发展和临床资料的关系。 方法采用甲基化特异PCR技术 (MSP法 )研究 5 8例大肠癌标本 p16基因甲基化改变 ,分析临床病理资料。 结果 2 5例标本 (4 3 .1% )呈 p16CpG区甲基化阳性 ;DukesC、D期病人p16CpG区甲基化发生率 (75 % )明显高于DukesA、B期病人 (13.3% )。 结论 p16启动子区甲基化导致p16抑癌基因失活参与了大肠癌的发生和发展 ; 展开更多
关键词 大肠癌 P16 CpG区 甲基化 msp DUKES分期 甲基化特异pcr技术
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DNA修复基因MGMT启动子区过甲基化与脑胶质瘤 被引量:5
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作者 高薇 王之敏 +1 位作者 周岱 朱凤清 《江苏医药》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期26-28,共3页
目的在许多肿瘤中发现启动子区过甲基化而导致O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)的转录失活,本研究拟从胶质瘤患者肿瘤组织和其对应血清中MGMT基因启动子过甲基化是否有一致性对MGMT基因启动子甲基化进行研究。方法采用甲基化特异性PCR... 目的在许多肿瘤中发现启动子区过甲基化而导致O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)的转录失活,本研究拟从胶质瘤患者肿瘤组织和其对应血清中MGMT基因启动子过甲基化是否有一致性对MGMT基因启动子甲基化进行研究。方法采用甲基化特异性PCR法(MSP)进行MGMT基因启动子区甲基化水平的检测。结果27例胶质瘤组织中有14例(51.9%)MGMT甲基化扩增阳性,13例(48.1%)为MGMT去甲基化扩增阳性。相应的血清中有13例(48.1%)MGMT甲基化扩增阳性,14例(51.9%)MGMT去甲基化扩增阳性(P<0.05)。结论胶质瘤患者肿瘤组织和其对应的血清中MGMT基因启动子甲基化状态具有显著相关性。测定血清中MGMT基因启动子区的甲基化状态能反应胶质瘤组织中MGMT基因启动子区甲基化状态。MSP是检测MGMT基因启动子区甲基化灵敏和可靠的方法,可以指导临床脑胶质瘤的个体化化疗方案的设计。 展开更多
关键词 胶质瘤 MGMT基因 甲基化 甲基化特异pcr检测
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