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miR-1/133基因簇的进化及其调控网络
被引量:
1
1
作者
陈怡香
岳虎
+1 位作者
张超文
刘杰
《华中师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018年第2期231-239,共9页
miR-1/133基因簇在心肌和骨骼肌中特异性表达,对心脏以及骨骼肌的发育及生理病理具有重要作用.该研究采用生物信息学方法,研究了miR-1/133基因簇的进化特征,预测了其靶基因及其调控的生物学过程.利用miRBase数据库对23种不同物种间miR-1...
miR-1/133基因簇在心肌和骨骼肌中特异性表达,对心脏以及骨骼肌的发育及生理病理具有重要作用.该研究采用生物信息学方法,研究了miR-1/133基因簇的进化特征,预测了其靶基因及其调控的生物学过程.利用miRBase数据库对23种不同物种间miR-1/133基因簇的序列、组织方式进行了比较.采用最大似然法构建miR-1/133基因簇的系统进化树,显示该基因簇的进化与物种进化关系有一定差异.利用在线数据库对miR-1/133基因簇上游转录因子及下游靶基因进行预测,并对其进行综合分析,绘制出该基因簇的网络调控图,表明miR-1/133基因簇参与了骨骼肌与心肌发育、胰岛素受体信号通路、经典Wnt信号通路、p53信号通路等体内重要生理过程,为进一步阐明miR-1/133基因簇的生物学功能提供了理论依据.
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关键词
mir-
1
/133
基因簇
生物信息学分析
进化分析
靶基因预测
下载PDF
职称材料
雷帕霉素对S180肉瘤细胞及CD90、CD133、Notch1蛋白表达的影响
被引量:
1
2
作者
孔萍
王康嵘
张静
《西北药学杂志》
2021年第4期595-600,共6页
目的探讨雷帕霉素对小鼠S180肉瘤细胞生长及抗原分化簇90(CD90)、抗原分化簇133(CD133)、神经源性基因同源蛋白(Notch1)蛋白表达的影响。方法选取处于对数生长期的S180肉瘤细胞,雷帕霉素低、中、高剂量组加入20、50、100 nmol·L-1...
目的探讨雷帕霉素对小鼠S180肉瘤细胞生长及抗原分化簇90(CD90)、抗原分化簇133(CD133)、神经源性基因同源蛋白(Notch1)蛋白表达的影响。方法选取处于对数生长期的S180肉瘤细胞,雷帕霉素低、中、高剂量组加入20、50、100 nmol·L-1雷帕霉素,对照组加入等量培养液,采用CCK-8法检测细胞增殖,流式细胞术法检测细胞周期与凋亡。将KM雄性小鼠随机分为对照组以及雷帕霉素低、中和高剂量组,每组10只。按照人体临床用量的0.5、1.0、2.0倍换算小鼠雷帕霉素用量后灌胃,对照组以等量生理盐水灌胃,每日1次,共3周,构建小鼠S180肉瘤皮下荷瘤模型。末次灌胃后24 h,测定小鼠体质量,记录瘤质量并计算抑瘤率。分别采用免疫荧光染色和免疫组织化学染色检测小鼠肿瘤组织CD90、CD133和Notch1的蛋白表达。结果雷帕霉素作用S180肉瘤细胞后,细胞增殖抑制率显著升高(P<0.05),且与作用时间呈正相关;同一作用时间,细胞增殖抑制率随雷帕霉素浓度的增加而升高(P<0.05);不同浓度雷帕霉素作用S180肉瘤细胞48 h后,细胞阻滞于G0/G1期,细胞凋亡率显著升高(P<0.05);免疫荧光染色结果显示,与对照组比较,其他3组小鼠肿瘤组织CD90、CD133和Notch1表达水平显著降低,且随雷帕霉素浓度增加而降低(P<0.05);免疫组织化学染色结果显示,与对照组比较,其他3组小鼠肿瘤组织CD90、CD133和Notch1表达水平显著降低,且随雷帕霉素浓度增加而降低(P<0.05)。结论雷帕霉素能通过下调CD90、CD133和Notch1蛋白表达影响S180肉瘤细胞的增殖和凋亡,达到体内外抑瘤作用。
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关键词
雷帕霉素
S
1
80肉瘤细胞
抑瘤作用
抗原分化簇90(CD90)
抗原分化簇
133
(CD
133
)
神经源性基因同源蛋白(Notch
1
)
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职称材料
题名
miR-1/133基因簇的进化及其调控网络
被引量:
1
1
作者
陈怡香
岳虎
张超文
刘杰
机构
湖北理工学院肾脏疾病发生与干预湖北省重点实验室
出处
《华中师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018年第2期231-239,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81600773)
湖北省教育厅自然科学基金项目(Q20164505)
湖北理工学院青年人才引进项目(16xjz08R)
文摘
miR-1/133基因簇在心肌和骨骼肌中特异性表达,对心脏以及骨骼肌的发育及生理病理具有重要作用.该研究采用生物信息学方法,研究了miR-1/133基因簇的进化特征,预测了其靶基因及其调控的生物学过程.利用miRBase数据库对23种不同物种间miR-1/133基因簇的序列、组织方式进行了比较.采用最大似然法构建miR-1/133基因簇的系统进化树,显示该基因簇的进化与物种进化关系有一定差异.利用在线数据库对miR-1/133基因簇上游转录因子及下游靶基因进行预测,并对其进行综合分析,绘制出该基因簇的网络调控图,表明miR-1/133基因簇参与了骨骼肌与心肌发育、胰岛素受体信号通路、经典Wnt信号通路、p53信号通路等体内重要生理过程,为进一步阐明miR-1/133基因簇的生物学功能提供了理论依据.
关键词
mir-
1
/133
基因簇
生物信息学分析
进化分析
靶基因预测
Keywords
mir-1/133 gene cluster
bioinformatic analysis
evolution analysis
predic-tion of target
gene
分类号
Q522 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
雷帕霉素对S180肉瘤细胞及CD90、CD133、Notch1蛋白表达的影响
被引量:
1
2
作者
孔萍
王康嵘
张静
机构
宜昌市夷陵医院药剂科
武汉市普仁医院耳鼻喉口腔头颈外科
出处
《西北药学杂志》
2021年第4期595-600,共6页
基金
湖北省卫生健康委员会联合基金项目(编号:WJ2019H153)。
文摘
目的探讨雷帕霉素对小鼠S180肉瘤细胞生长及抗原分化簇90(CD90)、抗原分化簇133(CD133)、神经源性基因同源蛋白(Notch1)蛋白表达的影响。方法选取处于对数生长期的S180肉瘤细胞,雷帕霉素低、中、高剂量组加入20、50、100 nmol·L-1雷帕霉素,对照组加入等量培养液,采用CCK-8法检测细胞增殖,流式细胞术法检测细胞周期与凋亡。将KM雄性小鼠随机分为对照组以及雷帕霉素低、中和高剂量组,每组10只。按照人体临床用量的0.5、1.0、2.0倍换算小鼠雷帕霉素用量后灌胃,对照组以等量生理盐水灌胃,每日1次,共3周,构建小鼠S180肉瘤皮下荷瘤模型。末次灌胃后24 h,测定小鼠体质量,记录瘤质量并计算抑瘤率。分别采用免疫荧光染色和免疫组织化学染色检测小鼠肿瘤组织CD90、CD133和Notch1的蛋白表达。结果雷帕霉素作用S180肉瘤细胞后,细胞增殖抑制率显著升高(P<0.05),且与作用时间呈正相关;同一作用时间,细胞增殖抑制率随雷帕霉素浓度的增加而升高(P<0.05);不同浓度雷帕霉素作用S180肉瘤细胞48 h后,细胞阻滞于G0/G1期,细胞凋亡率显著升高(P<0.05);免疫荧光染色结果显示,与对照组比较,其他3组小鼠肿瘤组织CD90、CD133和Notch1表达水平显著降低,且随雷帕霉素浓度增加而降低(P<0.05);免疫组织化学染色结果显示,与对照组比较,其他3组小鼠肿瘤组织CD90、CD133和Notch1表达水平显著降低,且随雷帕霉素浓度增加而降低(P<0.05)。结论雷帕霉素能通过下调CD90、CD133和Notch1蛋白表达影响S180肉瘤细胞的增殖和凋亡,达到体内外抑瘤作用。
关键词
雷帕霉素
S
1
80肉瘤细胞
抑瘤作用
抗原分化簇90(CD90)
抗原分化簇
133
(CD
133
)
神经源性基因同源蛋白(Notch
1
)
Keywords
rapamycin
sarcoma S
1
80 cell
antitumor effect
cluster
of differentiation 90(CD90)
cluster
of differentiation
133
(CD
133
)
neurogenic
gene
homologous protein
1
(Notch
1
)
分类号
R965 [医药卫生—药理学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
miR-1/133基因簇的进化及其调控网络
陈怡香
岳虎
张超文
刘杰
《华中师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2018
1
下载PDF
职称材料
2
雷帕霉素对S180肉瘤细胞及CD90、CD133、Notch1蛋白表达的影响
孔萍
王康嵘
张静
《西北药学杂志》
2021
1
下载PDF
职称材料
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