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miR-430基因簇的生物信息学分析
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作者 李小慧 王凯 +1 位作者 吴建盛 汤丽华 《南京邮电大学学报(自然科学版)》 北大核心 2014年第2期122-126,132,共6页
很多microRNA(miRNA)基因在基因组上紧密排列形成miRNA基因簇,mir-430是目前已发现的最大miRNA基因簇,但其起源和进化方面却是未知的。为了揭示mir-430基因簇的起源及其在相关物种的进化关系,文中基于miRNA序列同源保守的特点,采用BLAS... 很多microRNA(miRNA)基因在基因组上紧密排列形成miRNA基因簇,mir-430是目前已发现的最大miRNA基因簇,但其起源和进化方面却是未知的。为了揭示mir-430基因簇的起源及其在相关物种的进化关系,文中基于miRNA序列同源保守的特点,采用BLAST程序在NCBI基因数据库中搜索mir-430序列,在14个物种中共搜索到35个mir-430基因序列,这14个物种都为硬骨鱼类。多序列对比发现mir-430基因簇成熟序列的第2到第8位碱基以及第16到第22位碱基为保守序列。进化分析表明七鳃鳗的pma-mir-430基因可能是此基因家族最早出现的基因形式,并且pma-mir-430e可能是其他物种mir-430基因的祖先基因。祖先基因经过个别碱基的缺失及突变、串联重复和大片段重复等方式形成了mir-430基因簇。该研究通过分析不同物种中mir-430基因簇的特征,揭示mir-430基因簇的分子进化规律,为其调控网络和功能研究提供理论基础。 展开更多
关键词 mir-430 基因簇 生物信息学预测 分子进化 mir-430
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miR-430对斑马鱼原始生殖细胞迁移和性腺发育影响的初步研究 被引量:3
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作者 林小涵 金超凡 +4 位作者 高晨 汪波 贺艳 齐洁 张全启 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期72-79,共8页
为了探究microRNAs(miRNAs)在斑马鱼生殖细胞发育过程中所起的作用,本研究在斑马鱼胚胎期过表达miR-430,结果发现原始生殖细胞(Primordial germ cells,PGCs)迁移出现紊乱,并且通过qRT-PCR发现nanos3、piwil2及tdrd7等生殖质基因的表达... 为了探究microRNAs(miRNAs)在斑马鱼生殖细胞发育过程中所起的作用,本研究在斑马鱼胚胎期过表达miR-430,结果发现原始生殖细胞(Primordial germ cells,PGCs)迁移出现紊乱,并且通过qRT-PCR发现nanos3、piwil2及tdrd7等生殖质基因的表达水平显著下调。此外,在斑马鱼性腺发育过程中,通过组织学观察发现过表达miR-430会导致雌性斑马鱼卵母细胞发育异常、卵巢发育迟缓,但是对雄性生殖细胞及性腺的发育没有造成明显的影响,并且进一步统计分析表明,miR-430不影响斑马鱼的性别分化。综上所述,本研究初步明确了过表达miR-430对斑马鱼PGCs迁移、性腺发育以及性别分化的影响,并为进一步探究miR-430在斑马鱼生殖细胞发育过程中的功能及分子机制奠定了理论基础。 展开更多
关键词 斑马鱼 mir-430 显微注射 PGCS 卵母细胞 性腺发育
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MiR-430 Can Affect the Mesoderm Formation and Metamorphosis of Paralichthys olivaceus by Targeting lefty Gene
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作者 LI Rui WANG Zhenwei +3 位作者 SUN Minmin PENG Meiting QI Jie WANG Zhigang 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS CSCD 2020年第2期409-416,共8页
MiR-430 is a non-coding small RNA that participates in early embryonic development by acting on the Nodal signaling pathway.Its functions in Paralichthys olivaceus(P.olivaceus),however,remain unclear.In this study,thr... MiR-430 is a non-coding small RNA that participates in early embryonic development by acting on the Nodal signaling pathway.Its functions in Paralichthys olivaceus(P.olivaceus),however,remain unclear.In this study,through biological information technology,we hypothesized lefty was the target gene of miR-430.Lefty is a divergent member of the transforming growth factor-β(TGF-β)superfamily,and is involved in regulating left-right patterning as an antagonist of the Nodal signaling pathway.To study the relationship between miR-430 and lefty gene,miR-430 and fluorescent expression vector were transfected into embryo cells.Our results showed that miR-430 has important effects on early embryonic development.It can inhibit the expressions of lefty and other genes related to Nodal signaling pathway.Additionally,the expression of miR-430 was involved in the metamorphosis of P.olivaceus.This study clarifies the function of miR-430 in P.olivaceus,which will be helpful for further research on the interactions between miR-430 and the Nodal signaling pathway. 展开更多
关键词 mir-430 LEFTY Nodal signal pathway Paralichthys olivaceus
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