钙胁迫下全基因组水平桑树microRNA分析

钙(Ca)是植物必需的一种大量元素,可作为信号分子转导多种生理过程,钙的缺失或过量均会影响植物生长发育。桑树是重要的多年生经济树木,目前对桑树中microRNA(miRNA)的抗性功能和胁迫响应调控的研究较少。使用桑树品种育71-1为研究材料,构建小RNA(small RNA)文库。通过小RNA深度测序,鉴定得到53个已知miRNA和42个预测的新型miRNA成熟体。3个钙胁迫比较组合中的差异表达miRNA共36个,其中19个上调和17个下调。挑选miR156g为研究对象,预测其茎环结构,符合二级结构规则:成熟体位于5′端,前体自由能为-166.523 kJ/mol,具有典型茎环结构;通过psTarget软件预测到对应靶标mRNA大部分属于SPL家族。试验结果为桑树钙胁迫调控的分子机制以及miRNA功能的研究提供了依据。