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长期干旱胁迫下Mdm-miR160-MdARF17-MdHYL1模块调控苹果生长发育的研究 被引量:1
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作者 刘晨 毛秀山 +2 位作者 刘祥梅 申小霞 刘振中 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期490-502,共13页
为了研究长期干旱条件下Mdm-miR160- MdARF17- MdHYL1调控网络在苹果生长发育中的作用,以GL-3和Mdm-miR160e OE、 MdARF17RNAi、 MdmARF17OE、 MdHYL1OE及 MdHYL 1 RNAi转基因苹果为试验材料,进行为期3个月的长期干旱处理,测定苹果株高... 为了研究长期干旱条件下Mdm-miR160- MdARF17- MdHYL1调控网络在苹果生长发育中的作用,以GL-3和Mdm-miR160e OE、 MdARF17RNAi、 MdmARF17OE、 MdHYL1OE及 MdHYL 1 RNAi转基因苹果为试验材料,进行为期3个月的长期干旱处理,测定苹果株高、根干质量、根冠比以及叶片净光合速率、胞间CO_(2)浓度、气孔导度、蒸腾速率、叶绿素荧光值和水分利用效率。结果表明,在长期干旱胁迫下,Mdm-miR160e OE转基因苹果植株更矮化,根冠比、根干质量、光合能力及水分利用效率大于GL-3植株,具有更强的耐旱性;MdARF17 RNAi植株比GL-3更矮,且具有更大的根冠比、根干质量、光合能力和水分利用效率,而 MdARF17OE与之相反;MdHYL1RNAi植株对长期干旱胁迫更敏感,其株高大于野生型且具有更小的根冠比、更低的光合能力和水分利用效率,而 MdHYL1OE植物对长期干旱条件具有更强的适应性,生长发育表型与RNAi植株相反。综上所述,Mdm-miR160- MdARF17- MdHYL1调控网络在苹果响应长期干旱过程中发挥了重要功能,为苹果抗旱分子育种提供了候选基因。 展开更多
关键词 苹果 长期干旱 MdARF17 Mdm-mir160 MdHYL1
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miR160a与其靶基因在西瓜嫁接苗中参与抵御低温胁迫 被引量:2
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作者 李严曼 蔡秀秀 +5 位作者 朱磊 李胜利 马长生 王永 穆瑞霞 孙守如 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1703-1713,共11页
miR160在许多研究中被报道靶向生长素响应因子(ARF)并参与植物的生长发育,但其在葫芦科作物以及嫁接西瓜耐冷性中的调控机制尚不清晰。本研究利用生物信息学技术对miR160a进行了保守性分析、候选靶基因ARF的预测及验证、结合位点分析以... miR160在许多研究中被报道靶向生长素响应因子(ARF)并参与植物的生长发育,但其在葫芦科作物以及嫁接西瓜耐冷性中的调控机制尚不清晰。本研究利用生物信息学技术对miR160a进行了保守性分析、候选靶基因ARF的预测及验证、结合位点分析以及ARF基因家族的进化分析。本文以西瓜(Citrullus lanatus)为接穗材料,分别以印度南瓜(Cucurbita maxima)、中国南瓜(Cucurbita moschata)和美洲南瓜(Cucurbita pepo)作为嫁接的砧木材料,以C6实生苗为对照,通过8~oC低温处理7 d后统计冷害指数,检测不同组织中miR160a和靶基因ARF的表达情况来探究嫁接西瓜miR160a与其靶基因在抵御低温胁迫中的调控作用。结果表明:嫁接显著提高了西瓜植株的抗冷性,影响了miR160a和其ARF靶基因的表达,并且miR160a与其靶基因整体上呈现负向调控的模式来参与嫁接西瓜抵御低温胁迫的过程。本文为今后深入研究嫁接耐冷体系提供了新的参考依据和研究基础。 展开更多
关键词 低温胁迫 mir160a 西瓜 嫁接 砧木 接穗 ARF靶基因
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vvi-miR160s介导VvARF18应答赤霉素调控葡萄种子的发育 被引量:6
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作者 白云赫 王文然 +5 位作者 董天宇 管乐 宿子文 贾海锋 房经贵 王晨 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1890-1903,共14页
【目的】研究vvi-miR160家族(vvi-miR160s)及其靶基因在‘魏可’葡萄种子发育过程中的作用,探究其应答赤霉素(GA)调控葡萄果实无核的潜在机理。【方法】采用miR-RACE、生物信息学分析、RT-qPCR、RLM-RACE等方法,鉴定vvi-miR160家族成员... 【目的】研究vvi-miR160家族(vvi-miR160s)及其靶基因在‘魏可’葡萄种子发育过程中的作用,探究其应答赤霉素(GA)调控葡萄果实无核的潜在机理。【方法】采用miR-RACE、生物信息学分析、RT-qPCR、RLM-RACE等方法,鉴定vvi-miR160家族成员及其靶基因,分析vvi-miR160s及其靶基因应答GA的时空表达模式及其潜在功能。【结果】花前GA处理强烈抑制‘魏可’葡萄胚珠及种子发育,高效诱导其无核,且无核率达99.8%。克隆鉴定了VvMIR160s前体基因序列(501 bp)及成熟体序列,且它们在不同物种间具有较高的保守性;基于vvi-miR160s序列,预测到靶基因VvARF18,利用RLM-RACE技术检测到vvi-miR160s对VvARF18的裂解位点在第10和第11位之间,裂解频度9/17,证明VvARF18是vvi-miR160s的真实靶基因。该靶基因编码683个氨基酸,在398—411位存在核定位信号,且该蛋白亚细胞定位于细胞核上。VvARF18与其他物种间序列的同源保守性较高,基因结构相似,其中VvARF18蛋白与茶、烟草、梅花等物种亲缘关系较近。VvARF18启动子中包含4种作用元件,且含有较多激素相关元件。RT-qPCR结果显示,随着葡萄果实的发育,vvi-miR160c/d/e呈现‘V’形表达趋势,在硬核种子发育期表达较低,而VvARF18表现出与前者相反的表达趋势,在硬核种子发育期呈现高表达,表明vvi-miR160c/d/e对VvARF18负调控,但vvi-miR160a/b与VvARF18表达水平却不存在明显负相关。GA处理极显著地上调了vvi-miR160a/b在葡萄硬核种子发育期的表达,同时也显著抑制了VvARF18在同时期的表达,且它们的表达水平呈负相关,表明GA处理促进了vvi-miR160a/b对VvARF18的负调控作用;相反,GA减弱了vvi-miR160c/d/e对VvARF18的负调控作用。【结论】在vvi-miR160家族中,vvi-miR160c/d/e可能介导VvARF18在葡萄种子发育的特定阶段调控种子的发育形成,而vvi-miR160a/b可能主要介导VvARF18参与调控GA诱导葡萄种子败育的过程。 展开更多
关键词 葡萄 vvi-mir160s VvARF18 GA 种子发育
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猕猴桃Ac-miR160d启动子区的克隆及表达分析 被引量:3
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作者 李哲馨 祝滢 +4 位作者 蒋娟 决登伟 李洪雷 唐建民 兰建彬 《经济林研究》 北大核心 2021年第3期18-24,共7页
【目的】为深入研究猕猴桃miR160d转录调控机制提供线索,也为猕猴桃分子育种及品种改良提供参考。【方法】根据‘红阳’猕猴桃基因组信息,设计引物克隆miR160d(Ac-miR160d)前体基因及其启动子序列,并对其前体序列进行二级结构验证,对启... 【目的】为深入研究猕猴桃miR160d转录调控机制提供线索,也为猕猴桃分子育种及品种改良提供参考。【方法】根据‘红阳’猕猴桃基因组信息,设计引物克隆miR160d(Ac-miR160d)前体基因及其启动子序列,并对其前体序列进行二级结构验证,对启动子序列进行保守结构域和顺式作用元件分析。同时,对猕猴桃果实进行非生物(NaCl、GA_(3))和生物(灰霉菌)胁迫处理,利用qRT-PCR技术检测miR160d在不同胁迫处理后0~6 d时的表达情况。【结果】获得的Ac-miR160d前体序列具有稳定的茎环折叠的RNA二级结构以及miR/miR*二聚体结构,Ac-miR160d启动子序列不仅具有TATA-box、CAAT-box基本元件,还包含参与激素(GA3、水杨酸、脱落酸、茉莉酸等)应答、厌氧响应、干旱诱导等逆境胁迫以及光响应等多种顺式作用元件。猕猴桃果实内AcmiR160d的表达分析结果显示:当猕猴桃果实受到盐胁迫时,Ac-miR160d的水平在胁迫后1 d时即发生显著下调,胁迫后3~6 d时下调更为明显;当猕猴桃果实受到赤霉素胁迫和灰霉菌侵染时,Ac-miR160d的水平出现先升高、后降低的趋势,在处理后1~2 d时急剧升高,随后逐渐降低。【结论】Ac-miR160d启动子与猕猴桃植物激素信号及胁迫信号响应密切相关。通过非生物和生物胁迫试验,证实Ac-miR160d参与猕猴桃植物激素信号响应,并在其抗逆境胁迫过程中发挥重要调控作用。 展开更多
关键词 猕猴桃 mir160d 启动子 克隆 表达分析
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ghr-miR160负调控棉花叶片衰老机理研究 被引量:1
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作者 段珊 窦玲玲 +7 位作者 程帅帅 郭亚宁 庞朝友 马启峰 魏恒玲 范术丽 王寒涛 喻树迅 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期111-118,共8页
【目的】陆地棉(Gossypium hirsutum L.)叶片早衰会导致棉花减产降质。MicroRNA(miRNA)是1类长度约为21 nt、在转录后水平调节基因表达的内源非编码小分子RNA。研究ghr-miR160对叶片衰老的调控具有重要意义。【方法】对ghr-miR160进行... 【目的】陆地棉(Gossypium hirsutum L.)叶片早衰会导致棉花减产降质。MicroRNA(miRNA)是1类长度约为21 nt、在转录后水平调节基因表达的内源非编码小分子RNA。研究ghr-miR160对叶片衰老的调控具有重要意义。【方法】对ghr-miR160进行生物信息学分析、棉花子叶表达模式分析及过表达载体转化拟南芥验证分析。【结果】对ghr-miR160及pre-miR160结构分析表明,miR160在进化过程中高度保守。qRT-PCR结果显示,ghr-miR160在生长35 d的早熟不早衰品种辽4086子叶中优势表达。农杆菌介导转化拟南芥发现,该基因可使拟南芥出现晚抽薹、晚开花和叶片衰老延迟现象。【结论】ghr-miR160可能对棉花叶片衰老起负调控作用,同时为进一步阐明其作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 GOSSYPIUM hirsutumL. ghr-mir160 叶片衰老 基因表达 负调控 生物信息学分析
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mir160和WOX5过量表达对拟南芥根冠细胞的不同的影响
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作者 张腾腾 严欢欢 张汉马 《植物学研究》 2021年第3期225-230,共6页
WOX5和mir160过量表达均可在拟南芥根冠中诱导未分化的细胞累积,但这些根冠细胞间是否存在差异目前并不十分明了。本研究发现在mir160和WOX5过表达诱导产生的根冠细胞对秋水仙素呈现出不同的响应模式。在相同秋水仙素浓度处理条件下,WOX... WOX5和mir160过量表达均可在拟南芥根冠中诱导未分化的细胞累积,但这些根冠细胞间是否存在差异目前并不十分明了。本研究发现在mir160和WOX5过表达诱导产生的根冠细胞对秋水仙素呈现出不同的响应模式。在相同秋水仙素浓度处理条件下,WOX5过表达诱导产生中央根冠细胞(即柱细胞和柱干细胞)显著膨大(p 【0.01),而侧根冠细胞无明显膨大;相反,经秋水仙素处理后mir160过量表达的幼苗中侧根冠细胞明显膨大,而柱细胞膨大的幅度相对较小。mir160和WOX5过表达诱导的根冠细胞对秋水仙素的不同响应表明该两条途径诱导产生的根冠细胞间存在差异,暗示其诱导机理可能不同。 展开更多
关键词 拟南芥 根冠细胞 WOX5 mir160 秋水仙素
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小麦中MIR160基因家族的生物信息学分析及靶基因鉴定 被引量:1
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作者 赵思航 刘昊东 +3 位作者 徐渴 张树华 赵勇 杨学举 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第1期27-35,共9页
MicroRNA(MIRNA)在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等生物学过程中发挥着重要的作用。为了研究小麦中MIR160家族(MIR160s)的进化规律、表达模式及其靶基因,以小麦中11个MIR160s成员的前体和成熟体序列为基础,进行生物信息学分析,利用RT-... MicroRNA(MIRNA)在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等生物学过程中发挥着重要的作用。为了研究小麦中MIR160家族(MIR160s)的进化规律、表达模式及其靶基因,以小麦中11个MIR160s成员的前体和成熟体序列为基础,进行生物信息学分析,利用RT-qPCR结合RNA-seq数据明确MIR160s在不同小麦组织的表达模式,利用降解组测序和5'RLM-RACE技术验证小麦中MIR160s与靶基因的靶向关系。结果表明,MIR160s成熟体的序列在32个植物物种中高度保守,仅在第15和21位碱基存在多样性;小麦中MIR160s成员分别定位于1、5、6和7号染色体上;Tae-MIR160s成熟体在成熟叶片中表达量较高,其中Tae-MIR160c表达量最低;Tae-MIR160s分别可以在第1716、1562、1305和1931位碱基靶向切割TaARF11、TaARF25、TaARF34、TaARF54生长素响应因子(Auxinresponse factor)。本研究通过揭示Tae-MIR160s的进化规律、表达模式和靶基因,为小麦中MIR160s应答响应机制的解析提供了参考。 展开更多
关键词 小麦 Tae-mir160s 进化规律 靶基因
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过表达AtMIR160对亚麻芥(Camelina sativa)根尖发育的影响 被引量:3
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作者 陈玉莲 秦甜甜 +5 位作者 罗玲 张涛 梁永书 秦小健 张汉马 南文斌 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1789-1798,共10页
亚麻芥(Camelina sativa)作为重要的油料作物,其研究获得越来越多的关注。本实验通过Lugol淀粉粒染色观察了亚麻芥与拟南芥的根尖结构,并构建了亚麻芥的AtMIR160过表达株系,探索过表达AtMIR160对亚麻芥根尖发育的影响。结果显示:与拟南... 亚麻芥(Camelina sativa)作为重要的油料作物,其研究获得越来越多的关注。本实验通过Lugol淀粉粒染色观察了亚麻芥与拟南芥的根尖结构,并构建了亚麻芥的AtMIR160过表达株系,探索过表达AtMIR160对亚麻芥根尖发育的影响。结果显示:与拟南芥根尖静止中心和柱干细胞中无淀粉粒分布不同,在亚麻芥根尖可能是静止中心和柱干细胞的位置有淀粉粒分布。进一步在亚麻芥中过表达AtMIR160,qRT-PCR分析显示亚麻芥AtMIR160过表达株系中其同源靶基因CsARF10和CsARF16的表达量显著降低,AtMIR160过表达株系呈现根冠细胞排列紊乱和淀粉粒减少的表型。以上结果说明亚麻芥和拟南芥根尖淀粉粒的分布存在差异,拟南芥MIR160能通过下调亚麻芥同源靶基因影响其根冠发育。 展开更多
关键词 亚麻芥 过表达 mir160 根尖发育
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A long noncoding RNA involved in rice reproductive development by negatively regulating osa-miR160 被引量:8
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作者 Meng Wang Hua-Jun Wu +2 位作者 Jun Fang Chengcai Chu Xiu-Jie Wang 《Science Bulletin》 SCIE EI CAS CSCD 2017年第7期470-475,共6页
Long noncoding RNAs (IncRNAs) participate in the regulation of multiple biological processes via diverse manners, one of which is functioning as endogenous target mimics (eTMs) to modulate microRNAs (miRNAs) by ... Long noncoding RNAs (IncRNAs) participate in the regulation of multiple biological processes via diverse manners, one of which is functioning as endogenous target mimics (eTMs) to modulate microRNAs (miRNAs) by competing for their targets. Previously, we have predicted one IncRNA (osa-eTM160) as an endogenous repressor of osa-miR160 and validated the target mimicry ability of osa-eTM160 for ath-miR160 in Arabidopsis thaliana, yet the functions of osa-eTM160 in rice remain obscure. Here, we demonstrated that osa-eTM160 attenuated the repression of osa-miR160 on osa-ARF18 mRNAs during early anther developmental stages through the target mimicry manner, therefore to regulate rice seed setting and seed size. These findings revealed the roles of osa-eTM160 in rice, and indicated that lncRNAs with eTM functions may serve as temporal regulators to modulate the effects of miRNAs at specific developmental stages. 展开更多
关键词 microRNA IncRNA mir160 Target mimic
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地黄内生真菌GG22侵染下miR160家族成员及靶基因的鉴定分析
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作者 许姣 赵乐 +1 位作者 董诚明 朱畇昊 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期3198-3207,共10页
为明确地黄miR160家族成员在响应内生真菌尖孢镰刀菌Fusarium oxysporum GG22侵染中的作用,该研究从高通量测序技术获得的小RNA数据库中筛选出地黄miR160家族成员,利用RNAfold分析其前体结构,DNAMAN和MEGA对前体序列和成熟序列进行保守... 为明确地黄miR160家族成员在响应内生真菌尖孢镰刀菌Fusarium oxysporum GG22侵染中的作用,该研究从高通量测序技术获得的小RNA数据库中筛选出地黄miR160家族成员,利用RNAfold分析其前体结构,DNAMAN和MEGA对前体序列和成熟序列进行保守性和进化性分析;对地黄miR160家族成员的靶基因进行预测功能注释以及互作关系分析;结合降解组数据对靶基因进行鉴定分析。结果发现miR160前体具有完整的茎环结构;序列比对显示在前体、成熟序列上都具有较高的保守性,成熟序列中5′端第3~16位碱基高度保守;系统进化树说明了地黄与拟南芥、水稻、丹参及芝麻之间的亲缘关系;预测出22个miR160的靶基因中生长素响应因子(ARF)居多;GO功能分析主要富集到生物学过程、细胞组分以及分子功能;降解组测序获得miR160的4个靶基因注释到ARF18和ARF22;表达特性分析表明,地黄经过内生真菌侵染后,通过改变miR160和靶基因的表达来调控植物生长;对差异表达的rgl-miR160a和rgl-miR160a-3p进行qRT-PCR验证,结果显示与测序结果一致。该研究结果进一步明确了地黄在响应GG22胁迫的分子机制,为地黄今后育种改良以及相关研究提供理论依据。 展开更多
关键词 地黄 mir160 靶基因 GG22
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生长素在拟南芥根尖干细胞中行驶两个相反的调控功能
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作者 王爽 周光蓥 张汉马 《植物学研究》 2022年第2期192-196,共5页
生长素在拟南芥根尖干细胞调控中的作用是近年来植物学研究中的热点之一,受到了广泛的关注。现有实验证据表明生长素在拟南芥根尖干细胞调控中担负2个相反的功能,即既促进干细胞特性的维持,又促进干细胞的分化。生长素如何在同一细胞群... 生长素在拟南芥根尖干细胞调控中的作用是近年来植物学研究中的热点之一,受到了广泛的关注。现有实验证据表明生长素在拟南芥根尖干细胞调控中担负2个相反的功能,即既促进干细胞特性的维持,又促进干细胞的分化。生长素如何在同一细胞群中行驶这两个截然相反的调控功能的机理目前还不清楚。 展开更多
关键词 拟南芥 生长素 根干细胞 PLT mir160
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蕹菜耐受长时间高温后的miRNA分析 被引量:10
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作者 王杏茹 李文静 +4 位作者 陈冰星 刘涛 尚维 赖钟雄 郭容芳 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期486-498,共13页
miRNA是广泛存在于真核生物体内的一类长度为20~24 nt的小分子非编码RNA,在植物生长发育和逆境适应过程中发挥重要作用。蕹菜(Ipomoea aquatica)可以耐受长时间高温,而其miRNA还未被鉴定,其在耐受长时间高温后的作用还未知。以蕹菜耐... miRNA是广泛存在于真核生物体内的一类长度为20~24 nt的小分子非编码RNA,在植物生长发育和逆境适应过程中发挥重要作用。蕹菜(Ipomoea aquatica)可以耐受长时间高温,而其miRNA还未被鉴定,其在耐受长时间高温后的作用还未知。以蕹菜耐热性强的品种‘泰国三叉’和耐热性差的品种‘柳叶’为材料,经42℃高温处理15d后分别构建两个高质量sRNA库,经检测两个库中碱基质量值大于或等于30的序列数量均超过17.3Mb,且‘泰国三叉’中24nt的序列数量远远高于‘柳叶’。与蕹菜转录组比对分析后,分别得到1 363 258和1 629 209条序列,两个库共有的序列仅有1 047 133条(11.36%),说明耐热性不同的蕹菜中s RNA有很大差别。共鉴定出蕹菜中存在71个miRNA,其中差异表达的有22个,通过TargetFinder预测其靶基因,共得到233个靶基因。进一步以耐热性强的品种‘本地三叉’和耐热性弱的品种‘竹叶’为材料研究其在长时间高温后miR160、miR166、miR172、miR393和miR3627前体的差异表达量,结果表明,高温后两品种中pre-miR160-2的表达都显著上调,但是不耐热的‘竹叶’中上调的倍数更多;mi R166在耐热性强的‘本地三叉’中表达量下降,在耐热性较差的‘竹叶’中表达量显著上升;miR172可以被长时间高温诱导,但在耐热性不同的两个品种蕹菜中并没有差异;miR3627的表达量在耐热蕹菜‘本地三叉’中下降,在不耐热蕹菜‘竹叶’中没有明显变化。miRNA前体表达模式的差异说明其在蕹菜耐受长时间高温过程中的作用机制不同。 展开更多
关键词 蕹菜 长时间高温 mir160 miR166 miR393
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