盐胁迫下盐穗木miR393b与预测靶基因Hc TIR1的表达及相关性

【目的】研究盐胁迫下盐穗木生长素通路中miR393b和预测的靶基因 TIR1 的表达模式和相关性。【方法】采用生物信息学方法预测盐穗木miR393b的靶基因;通过qRT-PCR方法检测盐胁迫下盐穗木miR393b及预测靶基因 HcTIR1 ( transport inhibitor response1 )的相对表达模式,并分析其相关性。【结果】 miR393b成熟体在不同植物种中高度保守;盐穗木miR393b预测的靶基因为 TIR1;盐胁迫处理,盐穗木同化枝中两基因响应高盐胁迫,并具有一定的负相关性。【结论】盐穗木miR393b和预测的靶基因响应高盐胁迫,二者具有一定的负相关。该结果为进一步探讨盐穗木miR393b与预测靶基因 TIR1 的生物学功能奠定基础。

桃果实中miR393b靶向生长素受体基因TIR1的作用机制分析

本研究以水蜜桃品种‘小白凤’为试材,利用miR-RACE技术验证了桃miR393b的精确序列,克隆得到了其靶基因生长素受体Pp TIR1的ORF序列。利用RLM-RACE技术以及q RT-PCR方法对Ppe-miR393b作用于靶基因Pp TIR1的作用模式及作用频度进行了分析。结果表明,Ppe-miR393b的精确序列与预测序列在5′端存在1个碱基的差异,其靶基因Pp TIR1编码584个氨基酸且N端含有1个高度保守的FBOX DNA结合域。RLM-5'RACE结果显示,Ppe-miR393b以裂解的方式作用于其靶基因Pp TIR1,且在Ppe-miR393b 5′端的第10和11位碱基之间以及第8和9位碱基间均存在裂解位点,但前者的裂解频度显著高于后者。以上结果表明Ppe-miR393b通过介导靶基因Pp TIR1的裂解参与生长素信号途径。