CD44表达量对胶质母细胞瘤患者预后的影响分析

目的探讨CD44表达量对胶质母细胞瘤(GBM)患者预后的影响。方法选取2021年7月1日至2023年8月31日解放军总医院第一医学中心收治的102例GBM患者为研究对象,以术中切除肿瘤组织CD44积分光密度(IOD)的平均值为分界线,将研究对象分为CD44高表达组(IOD≥699023,51例)和CD44低表达组(IOD<699023,51例)。比较分析两组患者的一般资料、生存结局。采用单因素分析及Cox多因素回归方法分析GBM患者总生存率的影响因素。结果两组患者的性别、年龄比较差异均无统计学意义(P>0.05)。患者术后随访时间2.6~27.5个月,中位随访时间15.0个月,10例患者存活,其中CD44高表达组有3例患者存活,CD44低表达组有7例患者存活,CD44低表达组患者的中位总生存期为18.3个月,CD44高表达组患者的中位总生存期为13.6个月,log-rank检验结果显示,CD44低表达组患者的总生存率高于CD44高表达组(χ^(2)=22.233,P<0.001)。术后放化疗、手术切除程度、肿瘤性质、MGMT启动子甲基化状态、CD44表达量与GBM患者的总生存率显著相关(P<0.05)。Cox多因素回归分析结果显示,原发GEM、术后放化疗、完全切除、MGMT启动子甲基化、CD44低表达均为GBM患者总生存率的独立保护因素(P<0.05)。结论CD44表达量与GBM患者的预后显著相关,且CD44低表达为GBM患者总生存率的独立保护因素。

NAP1L1基因在脑胶质瘤中的表达特性研究

目的:分析脑胶质瘤组织及癌旁正常组织中核小体组装蛋白1-like-1(NAP1L1)表达情况,并探讨其表达与患者临床病例特征及生存预后的关系。方法:回顾性选取2018年1月~2020年10月在右江民族医学院附属医院进行治疗的86例脑胶质瘤患者作为研究对象,收集患者脑胶质瘤组织及癌旁正常组织。采用实时定量PCR法检测脑胶质瘤组织及癌旁正常组织中NAP1L1表达情况;收集患者临床资料,根据NAP1L1表达情况以NAP1L1表达<3.04视为低表达组(n=32),≥3.04视为高表达组(n=54),分析NAP1L1表达与患者临床病理特征的关系;对患者进行为期36个月的随访,Kaplan-Meier生存曲线分析NAP1L1表达与脑胶质瘤患者预后的关系。结果:与癌旁正常组织比较,脑胶质瘤组织中NAP1L1表达水平明显升高,差异有统计学意义(P<0.01)。NAP1L1低表达组和高表达组在病理分级、Ki-67指数、KPS评分及术后是否复发方面比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。随访36个月,86例患者生存率为52.33%(45/86);经Kaplan-Meier生存曲线分析,NAP1L1低表达患者中位生存时间为31个月,明显高于NAP1L1高表达患者的19个月,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:NAP1L1在脑胶质瘤中呈明显高表达,且其表达与患者病理分级、Ki-67指数、KPS评分、术后是否复发及生存预后明显相关。NAP1L1有可能成为神经胶质瘤发病机制的有前途的生物标志物和治疗靶点。

胶质母细胞瘤的PLK2表达及临床意义

目的探讨Polo样激酶2(PLK2)在胶质母细胞瘤(GBM)中表达及临床意义。方法计算机检索TCGA数据库,获得163个GBM组织、207个正常脑组织的PLK2表达临床资料,分析PLK2的表达情况;检索UALCAN数据库分析PLK1启动子甲基化水平。收集2019年5月至2022年6月手术切除的GBM组织50例及颅脑损伤减压术切除的非肿瘤脑组织20例为对照,RTPCR分析GBM组织PLK2 mRNA表达,MSP法分析PLK2启动子甲基化状态;同时分析GBM组织PLK1 mRNA表达水平与病人总生存期(OS)的关系。结果TCGA数据库分析显示,GBM组织PLK2表达水平显著低于正常脑组织(P<0.05),PLK2高表达组GBM病人中位OS显著低于低表达组(P<0.05)。UALCAN数据库分析显示,与正常脑组织相比,GBM组织PLK2启动子甲基化水平较高(P<0.001)。50例GBM组织标本PLK2 mRNA表达量明显低于对照组(P<0.001)。根据GBM组织PLK2 mRNA表达中位值分为高表达组和低表达组,50例GBM中,高表达20例,低表达30例。多因素Cox回归分析显示,PLK2 mRNA高表达是GBM病人生存预后不良的独立影响因素(P<0.05)。Kaplan-Meier曲线显示,PLK2 mRNA低表达GBM病人中位OS更长(15.5个月vs.10.0个月;P<0.001)。PLK2高甲基化GBM组织PLK2 mRNA表达水平更低(P<0.001)。结论GBM组织PLK2呈低表达,可能受其DNA启动子甲基化水平的调节。GBM组织PLK2低表达水平较低的病人可能是GBM的独立预后因素。

miRNA-34a、miRNA-145、miRNA-335在脑胶质瘤组织中的表达分析

目的分析微小RNA(miRNA)-34a、miRNA-145及miRNA-335在脑胶质瘤组织的表达意义。方法选取2018年1月~2023年2月沧州市中心医院神经外一科收治的60例脑胶质瘤患者为观察组,同时期到院体检的20例健康者为对照组,比较2组miRNA-34a、miRNA-145、miRNA-335水平,并分析不同疾病脑胶质瘤患者的mi RNA-34a、mi RNA-145、mi RNA-335水平表达情况。结果观察组mi RNA-34a、mi RNA-145、mi RNA-335水平低于对照组,且高级别胶质瘤组各指标水平更低(P<0.05)。结论在脑胶质瘤患者中,miRNA-34a、miRNA-145、miRNA-335水平表达均呈现较低状态,且分级越高,其水平越低,可为患者病情诊断及病理分级提供可靠参考。

血清miRNA-21、术前清蛋白-球蛋白比值对大脑胶质瘤预后的预测价值

目的:探讨血清miRNA-21、术前清蛋白-球蛋白比值与胶质瘤预后的关系。方法:选取2019年1月—2023年1月243例术后病理检查确诊为胶质瘤的病人,收集病人年龄、性别、吸烟和饮酒情况、体质指数、Karnofsky表现状态(KPS)、肿瘤大小、肿瘤位置(脑区)、切除范围、术前淋巴细胞计数、术前清蛋白水平、辅助放疗、化疗等资料,并根据磁共振成像数据计算肿瘤大小,采集病人术前1周血液学指标数据,评估术前清蛋白与球蛋白比值(AGR)及总生存期(OS)。检测血清miRNA-21,OS由Kaplan-Meier分析估计,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析AGR和miRNA21的预测能力。Cox比例风险模型用于单变量和多变量分析。结果:排除65例不符合纳入标准的病人和12例失访病人,共纳入166例病人。Kaplan-Meier分析曲线显示,AGR≤1.75或miRNA-21≤48的病人OS明显低于AGR>1.75或miRNA-21>48的病人(P均<0.001)。1年生存期:AGR和miRNA-21的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.680,0.631;2年生存期:AGR和miRNA-21的AUC分别为0.651,0.656。在多变量分析中,AGR[HR=0.785,95%CI(0.357,0.979),P=0.040]和miRNA-21[HR=0.757,95%CI(0.378,0.985),P=0.039]均是OS的独立预测因子。结论:术前AGR和miRNA-21与胶质瘤病人的OS显著相关。基于术前炎症、免疫和营养状况等指标,AGR和miRNA-21可为胶质瘤病人制定更有效的术前调节策略和更好的辅助治疗方案。

含α-Arrestin结构域蛋白3在脑胶质瘤组织中的表达及其临床意义

目的探讨含α-Arrestin结构域蛋白3(ARRDC3)基因在人脑胶质瘤组织中的表达水平及其临床意义。方法使用中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库与癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析脑胶质瘤患者的临床资料及其基因表达情况。收集2018年1月至2021年12月徐州医科大学附属医院神经外科收治的9例原发性脑胶质瘤患者的脑胶质瘤组织标本,免疫组织化学实验检测ARRDC3在不同分级胶质瘤中的表达水平。应用非参数检验分析ARRDC3在不同分子类型、不同分级胶质瘤中的表达水平;通过Kaplan-Meier生存曲线分析ARRDC3表达对脑胶质瘤患者生存时间的影响;应用单因素和多因素Cox回归分析ARRDC3的表达对胶质瘤患者预后的影响。结果CGGA和TCGA数据库中的数据显示,Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ级人脑胶质瘤中ARRDC3基因的表达逐渐升高(P<0.05);免疫组织化学染色实验结果与其一致。异柠檬酸脱氢酶(IDH)野生型胶质瘤患者中,ARRDC3基因表达水平显著高于IDH突变型患者(P<0.05);ARRDC3高表达组患者的中位生存期显著短于ARRDC3低表达组(P<0.05);多因素Cox回归分析结果显示,年龄、IDH突变状态、放射治疗、ARRDC3表达情况是人脑胶质瘤患者预后的危险因素(P<0.05)。结论人脑胶质瘤组织中ARRDC3的相对表达量随着肿瘤组织病理分级的上升逐渐升高;ARRDC3低表达的脑胶质瘤患者的预后明显好于高表达患者;ARRDC3可能成为预测胶质瘤患者预后的指标之一。

KDELR2在胶质瘤中的表达及临床意义:基于组织芯片技术分析

目的探讨KDELR2在脑胶质瘤中的表达及其与胶质瘤病人临床特征、病理特征和预后的关系。方法选择组织芯片HBraG180Su01作为实验标本,收集并整理完整的临床资料。免疫组化染色检查胶质瘤组织KDELR2的表达,分析KDELR2的表达水平与胶质瘤病人临床特征、病理特征以及预后的关系。结果最终纳入165例胶质瘤。免疫组化染色显示,KDELR2主要表达于胶质瘤细胞的细胞质。胶质瘤KDELR2表达阳性率高达98.18%;KDELR2表达水平与胶质瘤WHO分级、复发状态、PDL1表达及病人年龄、生存状态呈显著相关(P<0.05),与胶质瘤Ki-67、EGFR表达及病人性别无明显关系(P>0.05)。Cox比例回归风险模型分析显示,KDELR2高表达是胶质瘤病人生存预后不良的独立危险因素(P<0.05);生存曲线分析显示,KDELR2高表达组总体生存期和无进展生存期较KDELR2低表达组明显缩短(P<0.05)。结论胶质瘤KDELR2呈高表达,与胶质瘤WHO分级、复发显著相关,并与胶质瘤病人的生存预后显著相关。这提示KDELR2可作为胶质瘤靶向治疗的一个潜在靶点。

miRNA在胶质瘤组织和细胞中的表达及作用

miRNA是调节mRNA转录和翻译的一类非编码小RNA，可与特定的mRNA3’UTR区完全或部分互补而调节蛋白质翻译过程，在细胞的增殖、凋亡、生长、分化和代谢等过程中有重要功能。miRNA在肿瘤的发生、发展中发挥重要作用，部分miRNA有调节多种肿瘤相关基因及致癌功能，其表达失调可致下游肿瘤抑制基因、癌基因和其他信号分子活动改变。

ANXA1在脑胶质母细胞瘤中表达上调并促进胶质母细胞瘤的恶性进展

目的 分析ANXA1 mRNA和蛋白在脑胶质母细胞瘤组织与正常脑组织之间的表达差异以及ANXA1在脑胶质母细胞瘤的表达,及其与脑胶质母细胞瘤患者预后的关系;体外探讨ANXA1对脑胶质母细胞瘤细胞系增殖、迁移、侵袭、凋亡能力的影响。方法 (1)从公共数据库获取脑胶质母细胞瘤组织及正常脑组织的表达数据及相应的临床数据。比较脑胶质母细胞瘤组织与正常脑组织之间ANXA1 mRNA的表达差异及ANXA1 mRNA高低表达组之间胶质母细胞瘤患者的生存时间差异。(2)通过人类蛋白质图谱公共数据库获取ANXA1蛋白在U251细胞内定位;免疫组化检测脑胶质母细胞瘤组织及其对应的癌旁组织中ANXA1蛋白的表达。(3)体外培养脑胶质母细胞瘤细胞系U87和U251,构建敲低ANXA1基因表达的小干扰RNA(ANXA1-siRNA)并转染至U87和U251细胞中。qRT-PCR和Western blot用于检测mRNA和蛋白的表达。细胞计数试剂盒(CCK-8)、Transwell和流式细胞术分别用于检测细胞增殖、细胞迁移和侵袭、细胞凋亡。结果 (1)在TCGA、Rembrandt和GSE16011队列中均发现ANXA1 mRNA在胶质母细胞瘤组织中表达明显上调,差异有统计学意义(P <0.05)。另外,在这三个队列中均发现ANXA1 mRNA高表达组患者总体生存时间明显低于低表达组患者(P <0.001)。(2)qRT-PCR和Western blot的分析结果均表明与阴性对照组相比,ANXA1-siRNA组ANXA1的表达水平明显降低,差异均有统计学意义(P <0.001)。(3)CCK-8检测结果表明敲低ANXA1表达后,U87和U251细胞的增殖能力明显低于阴性对照组,差异有统计学意义(P <0.001)。Transwell细胞迁移检测结果表明:敲低ANXA1表达后U87和U251细胞的迁移能力明显低于对照组[实验组:(25.40±2.70)、(11.20±4.44);阴性对照组:(55.20±8.70)、(32.20±8.11)];细胞侵袭能力明显低于对照组[实验组:(19.60±3.21)、(12.80±4.66);阴性对照组:(43.40±5.13)、(38.6±7.37)]能力均明显低于阴性对照组,差异均有统计学意义(P <0.001)。流式细胞术检测结果显示:U87和U251细胞实验组凋亡细胞(11.84±2.50)%、(29.96±2.57)%均明显高于相应阴性对照组(7.42±2.56)%、(18.39±1.89)%,差异有统计学意义(P <0.05)。结论 ANXA1在胶质母细胞瘤组织中表达上调并与患者的不良预后相关。下调ANXA1基因表达能够抑制胶质母细胞瘤细胞的增殖、迁移及侵袭能力,促进胶质瘤细胞的凋亡。

DSC-PWI与脑胶质瘤分级及Ki-67表达应用研究

目的 探究DSC-PWI与高、低级别胶质瘤以及Ki-67抗原表达差异性与相关性。方法 选取我院于2019年12月至2020年12月病理确诊为脑胶质瘤且有Ki-67表达指数检测患者,采用Philips 3.0T MR扫描及后处理工作站分析,观察其灌注参数值与脑胶质瘤分级及Ki-67表达的关系及检验效能。结果 总共35例患者,12例低级别胶质瘤,23例高级别胶质瘤。两组的rCBF、rCBV及Ki-67指数具有显著统计学差异(P<0.01)和正相关(P<0.01)。ROC分析显示,rCBF、rCBV对鉴别低、高级别胶质瘤和Ki-67表达程度均有一定预测价值,且rCBF=2.33、rCBV=2.10为鉴别低、高级别胶质瘤的临界值,rCBF=2.33、rCBV=2.16为判断Ki-67表达高低的临界值。两者rCBV值诊断效能均优于rCBF值。结论 DSC-PWI技术对初步评估脑胶质瘤分级以及Ki-67表达有重要意义。

IDH突变调控BMP2、COL27A1和SERPINA5基因表达影响人脑胶质瘤的生存预后

目的探讨异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变影响胶质瘤临床预后的潜在分子机制。方法计算机检索CGGA和TCGA数据库,获取胶质瘤RNA测序数据(RNA-seq),应用生物信息学分析方法分析IDH突变改善胶质瘤临床预后的潜在分子机制。结果从TCGA数据库下载胶质母细胞瘤(GBM)和低级别胶质瘤(LGG)相关RNA-seq,从CGCA数据量下载648例胶质瘤的RNAseq(234例GBM和414例LGG),从GEO数据量下载单细胞RNA-seq数据GSE131928数据集(28例IDH野生型GBM)。GO和KEGG分析显示,IDH突变显著下调胞外基质(ECM)相关基因表达,GEPIA分析显示BMP2、COL27A1、SERPINA5、VEGFA基因表达水平与胶质瘤生存预后有关,多因素Cox比例回归风险模型分析显示BMP2、COL27A1、SERPINA5基因表达是胶质瘤生存预后独立影响因素,BMP2联合SERPINA5预测胶质瘤生存预后效果最好。结论我们结果提示胶质瘤IDH基因突变,可能通过调控BMP2、COL27A1和SERPINA5基因表达,影响病人生存预后。

胶质母细胞瘤氧化应激相关基因的表达分析

目的探讨胶质母细胞瘤(GBM)氧化应激关键基因的表达变化。方法从UCSC Xena数据库下载167例GBM基因表达谱数据(TCGA-GBM),从GeneCards数据库下载氧化应激基因集(168个氧化应激相关基因);通过富集分析确定差异表达基因(DEGs),建立蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络识别关键基因,利用Spearman相关系数对免疫因子和免疫检查点与关键基因进行相关性分析。结果鉴定出两种与氧化应激相关的GBM分子亚型(Cluster1和Cluster2),Cluster1型GBM生存期明显高于Cluster2型(P<0.05)。共筛选出54个DEGs,在细胞因子/趋化因子相关功能中显著富集。PPI网络鉴定出10个关键基因,即CSF2、CSF3、CCL7、LCN2、CXCL6、MMP8、CCR8、TNFSF11、IL22RA2和ORM1。大多数免疫因子和免疫检查点与关键基因呈正相关。结论本文基于氧化应激相关基因将GBM划分为两个亚型,并且筛选出10个氧化应激基因,可能在GBM的发生、发展过程中起重要作用,也可能对GBM预后评估具有一定的价值。

胶质瘤miRNA-25与NF-кB表达相关性分析

目的探讨胶质瘤微小RNA-25(mi RNA-25)和核因子kappa B(NF-кB)表达变化及其相关性。方法选取2012年7月至2012年9月手术切除胶质瘤标本29例,其中WHOⅠ级5例、Ⅱ级6例、Ⅲ级9例、Ⅳ级9例;选取同期去骨瓣内减压切除正常脑组织8例作为对照组。采用实时PCR检测mi RNA-25表达水平,采用免疫印迹法和免疫组化染色检测NF-кB表达水平。结果相比正常组织,Ⅰ级胶质瘤mi RNA-25表达水平显著降低(P<0.05),Ⅱ级胶质瘤无明显变化(P>0.05),而Ⅲ、Ⅳ胶质瘤均明显增高(P<0.01);随胶质瘤病理级别增高其表达水平显著增高(P<0.01)。正常脑组织NF-кB呈阴性表达,胶质瘤组织均呈阳性表达;而且,随胶质瘤病理级别增高,其表达水平显著增高(P<0.05)。胶质瘤mi RNA-25表达水平与NF-κB表达水平呈显著正相关(r=0.92;P<0.05)。结论胶质瘤mi RNA-25和NF-кB表达均上调,且随病理级别增高显著增高;两者表达呈显著正相关。

基于孟德尔随机化和生物信息学方法鉴定胶质瘤发病关键基因及实验验证

目的鉴定和验证胶质瘤发生发展及预后的相关基因。方法利用孟德尔随机化方法筛选与胶质瘤发生风险相关的蛋白。基于TCGA数据库获取胶质瘤组织与癌旁组织的差异表达基因,整合风险蛋白和差异表达基因,并使用LASSO回归分析进一步筛选关键基因;使用ROC曲线、生存分析和免疫浸润分析方法评估关键基因与胶质瘤的关联效应;体外培养人胶质瘤U251细胞,构建干扰半乳糖凝集素3结合蛋白(lectin galactoside-binding soluble 3 binding protein,LGALS3BP)基因表达的siRNA序列,验证其对肿瘤细胞增殖、侵袭和迁移的影响。结果共发现34种血液蛋白与胶质瘤风险增加相关,30种蛋白与风险降低相关;与差异表达基因整合并进行LASSO回归分析后,7个关键基因包括IBSP、SEMA6B、PPIC、ISLR2、SCN2B、HAVCR2和LGALS3BP被确定。体外实验证实,干预LGALS3BP在胶质瘤细胞系U251中的表达可明显抑制肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭能力。结论本研究基于孟德尔随机化、生物信息学方法鉴定胶质瘤发生发展及预后的相关新基因,并初步证实关键基因LGALS3BP在胶质瘤发生发展中的关键作用。

《中国肿瘤临床》文章推荐:tRNA修饰在胶质瘤中的研究进展

转运RNA(tRNA)是哺乳动物细胞中修饰程度最高的RNA,其修饰不仅高度动态,并且易受环境条件的影响。肿瘤发生常伴有tRNA修饰异常。研究发现tRNA修饰酶在多种肿瘤组织中异常表达,与发病机制密切相关。胶质瘤是最常见的原发性中枢神经系统肿瘤,恶性程度最高,预后极差。2024年第51卷第11期《中国肿瘤临床》国家基金研究进展综述栏目刊发了由中国医科大学王萍教授撰写的《tRNA修饰在胶质瘤中的研究进展》一文。

RANBP17在胶质母细胞瘤中的生物学功能研究

目的探讨RAN结合蛋白17(RANBP17)基因在胶质母细胞瘤(GBM)中的生物学功能。方法采用UALCAN和CGGA数据库分析RANBP17在GBM中的表达及预后价值。采用LinkedOmics数据库筛选与RANBP17表达相关的基因并通过DAVID数据库进行基因功能富集分析。采用荧光定量PCR(RT-qPCR)检测RANBP17在GBM和正常胶质细胞(HEB)中的表达水平。采用CCK8、流式细胞术、Tran-swell方法检测过表达RANBP17对GBM U251细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响;采用ENCORI、miRWalk和miRDB数据库预测RANBP17的上游miRNA。结果RANBP17在GBM中的表达水平低于正常组织(P<0.05);RANBP17在41岁以下、继发性GBM、IDH突变型、MGMT启动子甲基化和1p19q联合缺失的GBM患者中高表达(均P<0.01);500个RANBP17表达相关的基因富集分析显示RANBP17表达相关基因能参与炎症反应、细胞粘附、凋亡过程的负向调控、紧密连接和亚油酸代谢等过程和信号通路;过表达RANBP17降低GBM U251细胞的增殖、迁移、侵袭并促进细胞凋亡(均P<0.05);ENCORI、miRWalk和miRDB数据库中有8个共同的miRNAs(hsa-miR-650、hsa-miR-361-5p、hsa-miR-421、hsa-miR-9-5p、hsa-miR-3612、hsa-miR-299-5p、hsa-miR-2115-3p和hsa-miR-19b-3p)调控RANBP17。结论RANBP17可能作为一种抑癌基因参与GBM的发生发展,是GBM潜在的预后生物标志物和治疗靶点。

LncRNA MEG3在胶质瘤组织中的表达变化及其相关功能

目的基于生物信息学分析长链非编码RNA(LncRNA)母系表达基因3(MEG3)在胶质瘤组织中的表达变化及其相关功能。方法基于人类蛋白质图谱(HPA)数据集分析MEG3在不同组织中的表达,根据癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据集应用R软件分析其在泛癌中的表达,进一步使用泛胶质瘤数据集(TCGA-GBMLGG)中的临床病理特征资料分析MEG3在胶质瘤与正常脑组织的表达关系,同时分析不同WHO分级以及胶质瘤重要分子病理标志(IDH突变与1p/19q共缺失)与MEG3表达的相关性;并应用临床预后数据绘制各MEG3亚组患者的生存曲线,用基因型-组织表达(GTEx)数据库匹配TCGA-GBMLGG数据集,绘制受试者工作特征曲线评估其诊断效能。应用Linkedomics数据库中的TCGA-GBMLGG数据分析MEG3共表达基因的功能富集情况,应用R软件DESeq2软件包分析以MEG3作为亚组的不同亚组间差异表达基因,用Metascape数据库分析差异基因的表达,用基因集富集(GESA)分析全部差异表达基因富集的功能通路,单样本基因集富集(ssGESA)与肿瘤免疫估算数据库(TIMER)分析MEG3表达与胶质瘤免疫浸润状态的关系。结果MEG3在胶质瘤组织中低表达,与1p/19q共缺少相关;MEG3可区分正常脑组织与胶质瘤组织。MEG3相关表达基因的功能富集结果显示,其与神经系统与免疫功能密切相关;MEG3的差异基因功能富集结果显示其与干扰素反应相关,主要影响巨噬细胞、细胞毒性细胞的免疫浸润状态,并且不同MEG3分组的临床样本中多种免疫细胞富集分数具有显著差异,提示MEG3低表达可能与胶质瘤的免疫抑制微环境相关。结论MEG3在胶质瘤组织中低表达,可作为胶质瘤的诊断标志物与预后标志物,有望成为胶质瘤免疫治疗和相关研究的重要靶点。

ITGA4基因在脑胶质瘤中的表达及临床意义

目的 探讨整合素α4(ITGA4)基因在脑胶质瘤中的表达与临床意义。方法 计算机检索CGGA数据库获取mRNAseq-325数据集中325例脑胶质瘤的转录组测序(RNA-seq)数据及临床资料,并用m RNAseq-693数据集中693例脑胶质瘤进行验证。结果 胶质瘤ITGA4基因呈高表达(P<0.05),与胶质瘤IDH基因型、1p/19q共缺失状态、WHO病理分级有关(P<0.05),与胶质瘤MGMT启动子甲基化状态无明显关系(P>0.05)。多因素Cox回归分析显示,ITGA4高表达是胶质瘤生存预后不良的独立危险因素(P<0.05)。生存曲线分析显示,ITGA4高表达胶质瘤病人生存期明显缩短(P<0.05)。GO分析和KEGG分析显示,ITGA4基因调控的生物过程包括细胞粘附、血管生成及细胞迁移等,主要调控PI3K/AKT信号通路。结论 我们的结果提示胶质瘤ITGA4呈高表达,与胶质瘤不良生存预后密切相关,主要调控PI3K/AKT信号通路。

生物信息学分析髓系细胞触发受体-2对低级别胶质瘤的影响

目的通过生物信息学手段探究髓系细胞触发受体-2(TREM-2)在低级别胶质瘤(LGG)中的表达情况及对患者生存率的影响,为LGG的早期发现、早期诊断及治疗提供潜在的靶点。方法运用在线网站GEPIA2和UALCAN分析TREM-2在LGG肿瘤组织和正常组织中的表达差异;与年龄、性别、种族、肿瘤分级等临床病理特征之间的关系;以及TREM-2的LGG肿瘤组织中的异常表达对LGG患者总体生存率的影响。DAVID6.8软件对TREM-2相关基因进行KEGG通路富集分析;使用TIMER数据库分析TREM-2表达与肿瘤纯度和免疫细胞浸润程度之间的相关性。结果与正常组织相比,TREM-2在LGG肿瘤组织中的表达较正常组明显升高(P<0.05),并且与肿瘤分级和组织学分型相关(P<0.001),而与患者的年龄、性别及种族不相关(P>0.05),生存分析表明TREM-2与LGG预后密切相关,LGG表达越高,患者的总体生存率越低(P=0.00025和P=0.0029),同时无病生存率也降低(P=0.015);通路富集结果表明与TREM-2正相关基因通路主要涉及结核、癌症通路、吞噬体等,负相关基因通路主要涉及MAPK信号通路、神经活性配体-受体相互作用等;TREM-2的表达与肿瘤微环境中6种免疫细胞的浸润水平呈正相关。结论TREM-2在LGG肿瘤组织中表达明显升高,并且与患者生存率相关,是LGG诊断和治疗的潜在靶点。

人脑胶质瘤中miR-106b^25基因簇表达的研究

目的:检测胶质瘤细胞系及组织中miR-106b^25基因簇成员miR-106b、miR-93、miR-25的表达情况。方法:运用实时定量PCR的方法检测不同人脑胶质母细胞瘤细胞系及不同病理级别胶质瘤标本中miR-106b^25基因簇成员miR-106b、miR-93和miR-25的表达水平。原位杂交技术检测含不同病理级别及瘤旁正常脑组织的胶质瘤组织芯片中miR-106b^25基因簇成员的表达情况,进而分析该簇miRNAs的表达与胶质瘤病理级别的相关性。结果:以正常脑组织表达量为基准,3种miRNA在所有检测细胞系中均有增高的趋势。收集43例胶质瘤标本中,RT-PCR结果显示,随着肿瘤病理级别的升高,3种miRNA在各组中的平均表达量也逐步升高。其中,miR-106b(F=4.479,P=0.018)和miR-93(F=3.493,P=0.040)各组间的表达差异均有统计学意义。而miR-25表达无明显的统计学差异(F=2.766,P=0.075)。原位杂交结果显示3种miRNA的表达在高级别胶质瘤中的表达量明显高于低级别肿瘤。Spearman等级相关分析表明3种miRNA的表达信号强度分布均与胶质瘤的WHO病理分级呈正相关,在miR-106b、-93、-25中的相关系数分别为rs=0.617(P<0.001)、rs=0.438(P<0.001)、rs=0.463(P<0.001)。结论:miR-106b^25在胶质瘤中表达呈不同程度增高,并与肿瘤分级呈正相关。