miRNA-SNPs与肺癌铂类药物化疗疗效的关联性研究

目的:分析比较miRNA-SNPs与肺癌铂类药物化疗疗效及生存情况的关联,为提高肺癌患者的治疗及预后方案提供理论依据。方法:选择2014年1月—2017年12月期间,在海南医学院附属海南医院和海南医学院第一附属医院经病理学诊断为肺癌,且以接受铂类药物为主的67例患者作为研究对象,采用质谱法检测血样中11个miRNA-SNPs,签署知情同意书后开展问卷调查,并随访至2021年12月。结果:67例肺癌患者中,男性、年龄≥60岁、腺癌占比较多;miRNA 608(G>C)rs4919510位点CG+CC基因型、miRNA 27a(T>C)rs895819位点CT+CC基因型与肺癌铂类药物化疗疗效明显相关(OR=6.071,95%CI=1.259~29.286,P=0.025;OR=0.257,95%CI=0.081~0.818,P=0.021),且经性别、年龄、吸烟、饮酒等混杂因素校正后,相关性仍存在。在校正性别、年龄、吸烟、饮酒等混杂因素后,miRNA 26a-1(C>T)rs7372209位点TT基因型与化疗疗效相关(OR=13.519,95%CI=1.006~181.727,P=0.049)。构建Cox比例风险模型,结果显示CG基因型患者的1、5年生存率明显较高;年龄<60岁、不饮酒的患者1年、5年生存率较高;而吸烟史对患者生存率影响较小。结论:miRNA 608 rs4919510、miRNA 27a rs895819和miRNA 26a-1 rs7372209位点SNP会影响肺癌患者铂类药物化疗疗效及生存率。

miRNA-SNP可作为肿瘤的生物标志物

miRNA相关的单核苷酸多态性可以影响肿瘤的发展、治疗效果和临床结局。因此,作为生物标志物,miRNA相关的单核苷酸多态性可以用来评估个体对肿瘤的易感性,预测患者的临床结局,进而,为肿瘤的临床治疗提供新的策略。

云南汉族人群mircoRNA-149、mircoRNA-219、mircoRNA-let-7基因多态性与非小细胞肺癌发生和发展的相关性

目的探讨mircoRNA基因多态性与云南汉族人群非小细胞肺癌发生发展的相关性。方法选取云南地区汉族人群非小细胞肺癌患者415例,健康对照460例,采用Taqman探针基因分型法对3个SNP位点rs2292832 T>C(pre-miR-149)、rs107822 C>T(pre-miR-219a-1),rs629367 C>A(pri-let-7a-1)进行基因分型并分析其等位基因、基因型在非小细胞肺癌患者(按病理分层为鳞癌、腺癌及其他类型肺癌;按临床分期分层为Ⅰ+Ⅱ期、Ⅲ+Ⅳ期)及健康对照中的频率差异。结果rs2292832、rs107822、rs629367位点的等位基因、基因型频率在非小细胞肺癌组和对照组间的差异没有统计学意义,在分层分析及遗传模式分析中也无显著性差异。结论rs2292832、rs107822、rs629367可能与云南汉族人群非小细胞肺癌无相关性。

miRNA-146a基因多态性与长江以南女性汉族人群系统性红斑狼疮(SLE)的病例对照研究

目的研究miRNA-146a（microRNA-146a）基因rs2910164、rs57095329、rs6864584多态性与中国长江以南汉族女性人群系统性红斑狼疮（systemic lupus erythematosus,SLE）易感性间的关系。方法采用病例-对照研究设计纳入病例和对照各179例,应用限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）等分子生物学技术分型,利用单因素及多因素Logistic回归,在多个遗传模型（加性、隐性、显性）下,研究miRNA-146a基因多态性与SLE的关系,用χ2检验分析基因多态与临床表型的关系。结果 miRNA-146a基因rs2910164等位基因G相对于C可能增加SLE的患病风险（P=0.003,OR=1.572,95%CI：1.169~2.114）;多因素Logistic回归提示rs57095329在3个模型下均与SLE相关（加性：P=0.007,OR=1.849,95%CI：1.182~2.893;显性：P=0.031,OR=3.478,95%CI：1.121~10.792,隐性：P=0.010,OR=2.081,95%CI：1.189~3.642）,且相对于AA基因型来说,AG、GG基因型的个体患SLE的风险增加。单纯病例设计中,表型研究提示,rs2910164等位基因G相对于C增加肾脏损害风险及抗SM异常;rs57095329位点A相对于G等位基因降低肾脏、关节、神经系统损害风险;而AA基因型携带者抗RNP异常风险下降。结论 miRNA-146a基因rs2910164位点与rs57095329位点多态在长江以南汉族女性人群中与SLE易感性存在相关性,且与临床表型（如肾损伤）和免疫学指标（抗RNP）存在相关,但是rs6864584位点多态性可能与SLE的易感性无关。

高分辨率溶解曲线分析miRNA-196a2基因多态性与肺癌相关性

目的探讨microRNA-196a2基因多态性（rs1614913）与中国人群肺癌发病相关性。方法应用高分辨率溶解曲线（high resolution melting,HRM）分析技术对32例肺癌患者、27例肺部良性肿瘤患者及84例健康个体的microRNA-196a2基因多态性进行分析,并采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-restriction fragment length polymorphism,PCRRFLP）技术加以佐证。结果 micro-196a2在各组基因型分布均达到Hardy-Weinberg平衡。肺癌组C等位基因的分布频率高于对照组（P=0.0016）,OR=2.592（95%CI1.424～4.716）,说明C等位基因增加肺癌患病风险。结论 MicroRNA-196a2T/C（rs1614913）多态性增加肺癌的发病风险。MicroRNA-196a2基因多态性rs1614913可能是肺癌的一种有效的遗传标记物。

miRNA及其相关SNP在非小细胞肺癌预后中作用的研究概况

原发性肺癌是迄今为止恶性程度最高的肿瘤之一,而病发的患者中约有85%是非小细胞肺癌(NSCLC)。因此,找到NSCLC的发病机制,确定有效的治疗方案并改善预后状况,对于降低病发率就显得尤为重要。本文对近些年与NSCLC预后相关的miRNA-SNP的作用机制以及常用研究方法做了归纳总结,为确定NSCLC的有效分子标记物,改善患者术后病情和降低复发死亡率提供了理论依据。

microRNAs的SNPs研究进展

miRNAs是一类重要的基因调节因子,已有的研究表明它在生物体发育、细胞增殖、凋亡、脂类代谢、激素分泌以及肿瘤发生等多种生理和病理过程中发挥重要作用。本文通过对pre-miRNAs、成熟miRNAs、miRNAs的靶基因以及畜禽miRNAs的SNP的研究情况进行综述,对miRNAs的SNP在未来可能的为人类疾病治疗、提高畜禽生产性能方面的作用进行思考。

基因芯片技术在水稻研究中应用进展

随着"后基因组时代"的到来,基因芯片技术成为研究功能基因组学最重要的手段之一。文章简述了基因芯片技术的基本原理及其在生命科学领域的应用,并主要从基因表达水平检测与基因功能鉴别,新一代分子标记-单核甘酸多态性(SNPs),miRNA表达调控三个方面,阐述其在水稻研究中的应用进展。

鸡miRNA let-7b前体区单核苷酸多态性与生长肉用性状关联分析

为了探讨miRNA let-7b前体区SNP多态位点rs71292045、rs71292453与鸡生长肉用性状的关联性,以杏花鸡和隐性白洛克鸡杂交所得到的F2代肉鸡生长性状和肉用性状资料为研究素材,进行相关性分析。结果显示:1)SNP多态位点rs71292045不同基因型与鸡的胸肌率、腿胸比呈显著相关;2)SNP多态位点rs71292453不同基因型与鸡的胸肉重、腿肉重、腿肌率、胸肌率、腿胸比呈显著相关;3)SNP多态位点rs71292045对胸肌率的优势基因型是GA,腿胸比的优势基因型是AA;对位点71292453而言,胸肉重的优势基因型是TC,腿肉重的优势基因型是CC,腿肌率的优势基因型是CC,胸肌率的优势基因型是TC,腿胸比的优势基因型是TT。本研究结果可为肉鸡经济性状的选育和提高提供一定的参考。

miRNA序列及其靶基因结合位点的单核苷酸多态性对畜禽生产性状调控的研究进展

miRNA是一类小的非编码RNA,通过与靶基因mRNA 3’UTR区互补配对引起靶基因降解或翻译抑制,从而发挥调节作用。靶基因3’UTR区域内miRNA结合位点的SNP可能会破坏或产生新的结合位点,使基因表达水平发生变化。本文综述了与miRNA相关SNP对畜禽生产性状影响的研究进展,为进一步研究将miRNA相关多态性位点作为畜禽品种选育的潜在分子标记、培育具有优良生产性状的畜禽品种提供理论基础。

精神分裂症相关单核苷酸多态性调控microRNA功能研究进展

MicroRNA(miRNAs)是一类长约22nt且对基因表达具有广泛的调控作用的非编码RNA,并在神经元增殖、分化和发育成熟的过程中扮演重要角色。近年来全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)发现了众多的精神分裂症相关单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点多位于非编码区,表明miRNA在精神分裂症的发病过程中存在重要作用。本文综述了精神分裂症相关SNP与miRNA可能发生相互作用的4种机制(SNP位于miRNA基因、SNP位于miRNA宿主基因、SNP位于miRNA种子序列和SNP位于miRNA结合位点),为研究miRNA在精神分裂症发生发展中的作用提供参考。

牦牛TLR-4基因3′-UTR区扩增克隆及相关miRNAs生物信息学分析

本试验采用构建DNA混池和测序的方法,对西藏、青海341头牦牛TLR-4基因3′-UTR区单核苷酸多态性(SNP)位点进行筛选,然后用DNAMAN 8.0软件进行序列对比分析,并通过TargetScan 7数据库预测牦牛TLR-4基因3′-UTR区的微小RNAs(miRNAs)的可能靶定。结果显示,牦牛TLR-4基因3′-UTR区可能存在2个SNP位点,分别为A^(380)G和A^(382)G,通过TargetScan7数据库在线预测到牦牛TLR-4基因3′-UTR区共18个miRNAs可能靶定。本试验为牦牛TLR-4基因3′-UTR区可能存在的A^(380)G和A^(382)G突变位点与所预测的miRNAs之间靶向验证提供了初步理论根据,提示可通过分子水平进行抗病育种提高牦牛群体免疫力。

miR-124a和miR-146a基因多态性与中国人群代谢综合征的相关性研究

目的探讨微小RNA(miRNA)多态性位点与中国人群MS的相关性。方法选取581例MS患者和599名健康者。采用TaqMan方法对5个miRNAs的多态性位点(miR-27a rs895819、miR-124a rs531564、miR-128a rs11888095、miR-194a rs3820455、miR-146a rs2910164)分型。评估以上5个多态性位点与MS的相关性。Logistic回归分析miR-124a rs531564和miR-146a rs2910164与MS风险的关系。结果 miR-124a rs531564C可能为MS的保护性等位基因(P=0.01,OR=0.75,95%CI.0.60~0.94)。miR-146a rs2910164C等位基因可能增加患MS的风险(P<0.01,OR=1.55,95%CI:1.31~1.84)。经FPG和胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)分别校正后,miR-146a rs2910164 C等位基因仍为MS的危险因素(P<0.01,OR=1.87,95%CI:1.39~2.50;P=0.03,OR=1.55,95%CI:1.05~2.31)。结论miR-124a和miR-146a多态性可能与中国人群MS相关。

miRNA相关单核苷酸多态性

miRNA相关单核苷酸多态性(miRNA-related single nucleotide polymorphisms或mirSNP)是可以导致miRNA基因调控功能缺失或紊乱的一类功能型SNP的总称。不论是miRNA靶基因结合位点,还是miRNA基因或miRNA加工基因上的mirSNP,都有可能影响miRNA对靶基因的调控。miRNA基因及miRNA加工基因上的mirSNP主要通过阻碍miRNA的生物合成而发挥功能,而靶基因结合位点上的mirSNP主要通过导致自由能的改变或功能构象的消失,影响miRNA与靶序列结合而丧失其原有的调控功能。mirSNP大多位于人类基因组基因间区和内含子区,与包括肿瘤在内的众多复杂性疾病密切关联。mirSNP不论对于复杂性疾病发病机制研究还是诊疗预后分子标志的确定都具有极其重要的研究价值。

小分子RNA在心脑血管疾病中作用的研究进展

心脑血管疾病严重危害着人类的健康,肾素-血管紧张素-醛固酮系统的异常在心脑血管疾病发生过程中起着重要的作用。最新的研究显示小分子RNA通过调节该系统中某些基因以维持系统正常功能,但是当单核苷酸多态性发生在小分子RNA的结合区域时可能会严重影响这种调节的功能。本研究主要综述了近几年小分子RNA与单核苷酸多态性在该系统中相关作用。

PON1基因miRNA结合区SNPs与职业性铅中毒的关系

目的通过人群研究和SNP功能分析,探讨对氧磷酶1(PON1)基因3'UTR区SNPs对miRNA结合的影响,为铅中毒对心血管系统产生危害的机制提供新的思路。方法 ELISA方法检测铅中毒组和对照组中血清PON1含量,分析其在不同血铅浓度人群中的变化情况;Taqman MGB探针检测PON1基因rs854550和rs854552基因型分布情况;荧光素酶双报告基因法检测has-miR-218与rs854552所在区域结合情况。结果低浓度血铅值的个体PON1血清水平显著下降(P<0.05);rs854550和rs854552多态性位点在铅中毒组和对照组中未发现显著差异;报告基因实验也未能发现has-miR-218可能受rs854552影响其与3'UTR结合。结论铅暴露能引起人体PON1表达改变,但本研究尚不能证明PON1基因3'UTR区多态性在铅中毒所致心血管疾病中的作用,需进一步实验寻找相关易感SNP,为明确铅中毒分子机制提供依据。

SOX6基因3'UTR区野生型和突变型重组质粒的构建与鉴定

目的:构建含单核苷酸多态性(SNP)位点rs1065024的SOX6基因3'UTR双荧光素酶报告基因载体,并用生物信息学软件预测与rs1065024位点区域相结合的mi RNA,为进一步研究此SNP位点的功能及mi RNA与SOX6基因3'UTR区之间的关系奠定基础。方法:提取人全血基因组DNA,以基因组DNA为模板,通过PCR扩增含SNP位点在内的SOX6基因3'UTR片段,经过胶回收纯化后,将回收的目的片段插入双荧光素酶报告基因载体p MIR-REPORT中,再经DH5a转化扩增,挑单克隆进行菌落PCR并进行质粒提取,对质粒进行双酶切鉴定,最后进行DNA测序鉴定。针对SNP进行定点突变,构建出野生型和突变型重组质粒,并用生物信息学软件预测出与SNP位点相结合的mi RNA。结果:经单菌落质粒测序验证显示带有T碱基的SOX6基因3'UTR重组质粒p MIR-REPORT-3'UTR-T构建成功;经定点突变,成功将p MIR-REPORT-3'UTR-T质粒转变为p MIR-REPORT-3'UTR-C,经比对未引入任何其他突变;生物信息学预测显示,rs1065024位点位于mi R-190b、mi R-190a-5p、mi R-451b、mi R-4791与SOX6基因3'UTR的结合区域,其多态的改变可以影响mi RNA与m RNA的结合效率。结论:本研究成功构建了含SNP位点rs1065024的p MIR-REPORT-SOX6-3'UTR野生型和突变型重组质粒,为今后SOX6基因3'UTR的SNP位点的功能及mi RNA与SOX6基因3'UTR区之间的关系研究奠定基础。

结直肠癌远处转移相关miRNA的基因多态性研究

为了探讨miRNA-499、miRNA-146、miRNA-149基因多态性与结直肠癌远处转移的相关性,本研究收集了376例结直肠癌患者,分为无远处转移组(n=167)和有远处转移组(n=180),同时搜集健康对照组患者(n=193)。采用PCR-限制性内切酶片段长度多态性技术对患者外周血miR-146a rs2910164 G>C、miR-149rs2292832 C>T和miR-499 rs3746444 T>C进行基因型分析。结果证实携带miR-146a rs2910164 CC基因型的结直肠癌患者在远处转移组和健康对照组(CC vs CG,p=0.006;CC vs GG,p=0.047)以及无远处转移组和远处转移组(CC vs CG,p=0.02;CC vs GG,p=0.012)之间的差异均具有统计学意义。病理分期分析显示携带miR-146a rs2910164 CC基因型的结直肠癌患者在病理低分化组和高分化组(CC vs CG,p=0.03;CC vs GG,p=0.047)之间差异具有统计学意义。因此本研究推测携带miR-146a rs2910164 CC基因型的结直肠癌患者分化程度更低,更容易发生远处转移。

微小核糖核酸调控通路基因多态性与原发性肝癌相关性的研究进展

微小核糖核酸(miRNA)的调控异常可见于多种恶性肿瘤的发生发展过程中,其调节通路中相关基因的单核苷酸多态性(SNP)通过对miRNA的表达及靶位的调节在原发性肝癌(PLC)的发展中发挥着重要作用。本文分别从合成与加工miRNA相关基因SNP、转录miRNA基因SNP以及miRNA靶位基因SNP阐述miRNA调节通路基因多态性在PLC中的临床意义。

miRNA-146a SNP及表达水平与急性STEMI患者诊断及预后的关系

目的:观察急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者血浆miRNA-146a rs2910164单核苷酸多态性(SNP)的分布特征及其与miRNA-146a表达水平的关系。方法:选取急性STEMI患者92例和正常对照组100例,在入院即刻检测两组miRNA-146a rs2910164基因的多态性及表达水平,观察两组人群中miRNA-146a基因多态性的分布特征,miRNA-146a表达水平在两组人群中的差异以及基因多态性与血浆中miRNA-146a表达水平的关系;用受试者工作特征(ROC)曲线评估患者入院即刻血浆miRNA-146a表达水平对急性STEMI患者的诊断价值;随访急性STEMI患者住院期间及出院后28个月内主要心血管不良事件(MACE)的发生情况;应用中位数分组法将92例急性STEMI患者的miRNA-146a表达水平分为高表达组和低表达组,采用Kaplan-Meier法分析miRNA-146a不同表达水平患者的MACE发生率,应用多因素Cox回归模型计算风险比(HR)及其95%置信区间(CI)。结果:与正常对照组相比,CC+GC基因型在急性STEMI患者中更常见,且CC+GC基因型携带者比非携带者罹患急性STEMI的风险高3.189倍(OR=3.189,95%CI1.450~7.015,P=0.004);急性STEMI组miRNA-146a表达水平明显高于正常对照组(P<0.001);入院即刻血浆miRNA-146a表达水平对于诊断急性STEMI的ROC曲线下面积为0.742;miRNA-146a高表达组患者MACE发生率明显高于低表达组(Log rank:P=0.001);miRNA-146a表达水平是急性STEMI患者MACE发生的独立危险因素(HR=2.712,95%CI1.450~5.072,P=0.002)。结论:血浆miRNA-146a基因型在两组人群中分布存在差异,与GG基因型相比,携带CC+GC基因型的人群罹患急性STEMI的可能性更大;急性STEMI患者血液中miRNA-146a表达水平明显高于正常人,且携带CC、GC基因型的患者miRNA-146a表达水平较携带GG基因型高;血浆miRNA-146a有可作为早期诊断急性STEMI的生物标志物,其表达水平的高低与急性STEMI患者预后相关。