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eTM、microRNA319及其调控靶标在龙眼体胚发生早期的表达模式
被引量:
4
1
作者
苏立遥
陈旭
+5 位作者
黄倏祺
蒋梦琦
厉雪
张梓浩
赖钟雄
林玉玲
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期566-573,共8页
MicroRNA319作为最保守的miRNA家族之一,在植物器官形态建成、激素信号转导、抵抗外界胁迫等途径中均有重要作用.为了解miR319在植物体胚中的调控途径,利用龙眼转录组数据库筛选miR319成熟体(miR319)和前体序列(pre-miR319),并通过DNAMA...
MicroRNA319作为最保守的miRNA家族之一,在植物器官形态建成、激素信号转导、抵抗外界胁迫等途径中均有重要作用.为了解miR319在植物体胚中的调控途径,利用龙眼转录组数据库筛选miR319成熟体(miR319)和前体序列(pre-miR319),并通过DNAMAN 6.0和Mfold分析miR319的定位和pre-miR319的二级结构;进而采用TAPIR和psRNAtarget预测选定的miR319成员的内源诱捕靶标(endogenous target mimics,eTM)及候选靶标,并通过RLM-RACE验证靶标裂解位点,最后分析eTM、miR319及其靶标在龙眼体胚发生早期的表达模式.结果显示,龙眼4个miR319成员有1个定位于miR319a scafflod517,有3个定位于miR319a scaffold225.因此,以miR319a scaffold225为研究对象,将其命名为pre-miR319a,其上的成熟体分别命名为miR319a-3p.1、miR319a-5p.1和miR319a-5p.2.裂解位点显示龙眼miR319a 3个成员中,miR319a-3p.1的靶基因为TCP2和TCP4(Dlo_022819.1,Dlo_026743.1),miR319a-5p.1的靶基因为吲哚-3-甘油磷酸合成酶(IGS)和ABI3-5抑制因子,miR319a-5p.2未验证到靶基因.qPCR显示,在龙眼早期体胚发生过程中,miR319a 3个成员的表达模式基本一致,呈显著上调趋势.另外,除eTM8637外,其余eTM的表达模式与其相应的miR319a成员基本呈现为负相关趋势,均为下调趋势.miR319a-3p.1与其靶基因基本呈现为负调控趋势,miR319a-5p.1与ABI3-5抑制因子在龙眼早期体胚发生后期呈现负调控,与IGS没有明显负相关.本研究初步验证了"eTM-miR319a-靶基因"信号途径可能参与到龙眼早期体胚发生的形态建成.
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关键词
龙眼
miR319
内源诱捕靶标
靶基因
体胚发生
原文传递
过量表达大豆MIR319基因提高烟草的低磷耐受性
被引量:
2
2
作者
李超
沙爱华
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期167-171,共5页
MicroRNA是一类非编码小RNA分子,在植物磷信号通路中发挥重要的调控作用,前期研究中发现microRNA319(miR319)在低磷胁迫的大豆根中上调表达。为了进一步验证miR319的功能,本文从大豆中克隆了编码大豆miR319b的基因Gm MIR319并将其转化...
MicroRNA是一类非编码小RNA分子,在植物磷信号通路中发挥重要的调控作用,前期研究中发现microRNA319(miR319)在低磷胁迫的大豆根中上调表达。为了进一步验证miR319的功能,本文从大豆中克隆了编码大豆miR319b的基因Gm MIR319并将其转化到烟草中,获得阳性转基因植株后鉴定其对低磷的耐受性。过量表达Gm MIR319的转基因烟草在低磷胁迫时根长明显较对照长,地上部和地下部鲜重也显著高于对照,表明GmMIR319能够提高烟草对低磷的耐受性。通过荧光定量PCR分析烟草中miR319推定的靶基因的表达,其中一个靶基因TC18729的表达量随着miR319表达的上升而下降,表明miR319可能通过调控TC18729而调节烟草对低磷胁迫的反应。本文的研究结果将有助于应用大豆miR319调控植物对低磷的胁迫反应,为通过基因工程手段培育磷高效植物提供基因源。
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关键词
大豆
microrna319
转基因烟草
磷胁迫
下载PDF
职称材料
ClassⅡTCP转录因子的主要功能和分子调控机制
被引量:
5
3
作者
兰婧秋
秦跟基
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2021年第11期1542-1557,共16页
TCP家族作为一类植物特有的转录因子,广泛参与各类群植物多个阶段的生长发育调控.其中ClassⅡTCP转录因子亚家族在植物的叶片发育、侧枝形成及花发育中发挥核心调控功能.TCP转录因子的活性在转录和转录后水平上均受到复杂而严密的调控....
TCP家族作为一类植物特有的转录因子,广泛参与各类群植物多个阶段的生长发育调控.其中ClassⅡTCP转录因子亚家族在植物的叶片发育、侧枝形成及花发育中发挥核心调控功能.TCP转录因子的活性在转录和转录后水平上均受到复杂而严密的调控.同时,TCP转录因子可通过直接结合基因启动子和增强子,或改变染色质结构等多种方式精细调控下游基因在特定发育时期的表达.本文重点阐述了ClassⅡTCP转录因子亚家族的功能、其上游调控因子及其调控下游基因的分子机制的最新进展,以期理解TCP转录因子在整合内外因素精细调控植物可塑性发育中的重要作用.
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关键词
TCP转录因子
microrna319
转录抑制因子
植物可塑性发育
原文传递
题名
eTM、microRNA319及其调控靶标在龙眼体胚发生早期的表达模式
被引量:
4
1
作者
苏立遥
陈旭
黄倏祺
蒋梦琦
厉雪
张梓浩
赖钟雄
林玉玲
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期566-573,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31672127,31572088)
福建省高原学科建设经费(102/71201801101)
+1 种基金
福建农林大学园艺学院优秀硕士学位论文资助基金(2018S02)
福建农林大学科技创新专项基金(CXZX2017187)资助。
文摘
MicroRNA319作为最保守的miRNA家族之一,在植物器官形态建成、激素信号转导、抵抗外界胁迫等途径中均有重要作用.为了解miR319在植物体胚中的调控途径,利用龙眼转录组数据库筛选miR319成熟体(miR319)和前体序列(pre-miR319),并通过DNAMAN 6.0和Mfold分析miR319的定位和pre-miR319的二级结构;进而采用TAPIR和psRNAtarget预测选定的miR319成员的内源诱捕靶标(endogenous target mimics,eTM)及候选靶标,并通过RLM-RACE验证靶标裂解位点,最后分析eTM、miR319及其靶标在龙眼体胚发生早期的表达模式.结果显示,龙眼4个miR319成员有1个定位于miR319a scafflod517,有3个定位于miR319a scaffold225.因此,以miR319a scaffold225为研究对象,将其命名为pre-miR319a,其上的成熟体分别命名为miR319a-3p.1、miR319a-5p.1和miR319a-5p.2.裂解位点显示龙眼miR319a 3个成员中,miR319a-3p.1的靶基因为TCP2和TCP4(Dlo_022819.1,Dlo_026743.1),miR319a-5p.1的靶基因为吲哚-3-甘油磷酸合成酶(IGS)和ABI3-5抑制因子,miR319a-5p.2未验证到靶基因.qPCR显示,在龙眼早期体胚发生过程中,miR319a 3个成员的表达模式基本一致,呈显著上调趋势.另外,除eTM8637外,其余eTM的表达模式与其相应的miR319a成员基本呈现为负相关趋势,均为下调趋势.miR319a-3p.1与其靶基因基本呈现为负调控趋势,miR319a-5p.1与ABI3-5抑制因子在龙眼早期体胚发生后期呈现负调控,与IGS没有明显负相关.本研究初步验证了"eTM-miR319a-靶基因"信号途径可能参与到龙眼早期体胚发生的形态建成.
关键词
龙眼
miR319
内源诱捕靶标
靶基因
体胚发生
Keywords
Dimocarpus longan
microrna319
endogenous target mimics
target gene
somatic embryogenesis
分类号
S667.2 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
过量表达大豆MIR319基因提高烟草的低磷耐受性
被引量:
2
2
作者
李超
沙爱华
机构
主要粮食作物产业化湖北省协同创新中心长江大学
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期167-171,共5页
基金
长江大学博士基金(801180010133)
文摘
MicroRNA是一类非编码小RNA分子,在植物磷信号通路中发挥重要的调控作用,前期研究中发现microRNA319(miR319)在低磷胁迫的大豆根中上调表达。为了进一步验证miR319的功能,本文从大豆中克隆了编码大豆miR319b的基因Gm MIR319并将其转化到烟草中,获得阳性转基因植株后鉴定其对低磷的耐受性。过量表达Gm MIR319的转基因烟草在低磷胁迫时根长明显较对照长,地上部和地下部鲜重也显著高于对照,表明GmMIR319能够提高烟草对低磷的耐受性。通过荧光定量PCR分析烟草中miR319推定的靶基因的表达,其中一个靶基因TC18729的表达量随着miR319表达的上升而下降,表明miR319可能通过调控TC18729而调节烟草对低磷胁迫的反应。本文的研究结果将有助于应用大豆miR319调控植物对低磷的胁迫反应,为通过基因工程手段培育磷高效植物提供基因源。
关键词
大豆
microrna319
转基因烟草
磷胁迫
Keywords
Soybean
microrna319
Transgenic tobacco
Phosphorus deficiency
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
ClassⅡTCP转录因子的主要功能和分子调控机制
被引量:
5
3
作者
兰婧秋
秦跟基
机构
北京大学生命科学学院
北京大学现代农学院
出处
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2021年第11期1542-1557,共16页
基金
国家杰出青年科学基金(批准号:31725005)
国家自然科学基金创新研究群体项目(批准号:31621001)资助。
文摘
TCP家族作为一类植物特有的转录因子,广泛参与各类群植物多个阶段的生长发育调控.其中ClassⅡTCP转录因子亚家族在植物的叶片发育、侧枝形成及花发育中发挥核心调控功能.TCP转录因子的活性在转录和转录后水平上均受到复杂而严密的调控.同时,TCP转录因子可通过直接结合基因启动子和增强子,或改变染色质结构等多种方式精细调控下游基因在特定发育时期的表达.本文重点阐述了ClassⅡTCP转录因子亚家族的功能、其上游调控因子及其调控下游基因的分子机制的最新进展,以期理解TCP转录因子在整合内外因素精细调控植物可塑性发育中的重要作用.
关键词
TCP转录因子
microrna319
转录抑制因子
植物可塑性发育
Keywords
TCP transcription factors
micro RNA319
transcriptional repressors
plant developmental plasticity
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
eTM、microRNA319及其调控靶标在龙眼体胚发生早期的表达模式
苏立遥
陈旭
黄倏祺
蒋梦琦
厉雪
张梓浩
赖钟雄
林玉玲
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
原文传递
2
过量表达大豆MIR319基因提高烟草的低磷耐受性
李超
沙爱华
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
下载PDF
职称材料
3
ClassⅡTCP转录因子的主要功能和分子调控机制
兰婧秋
秦跟基
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2021
5
原文传递
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