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题名基于控制理论的关键基因预测算法
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作者
宋子健
岳欣蕾
李建伟
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机构
河北工业大学人工智能与数据科学学院
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出处
《电脑知识与技术》
2021年第30期28-32,共5页
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基金
国家自然科学基金(编号:81672113)。
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文摘
针对目前关键基因预测不准确和预测算法缺乏等问题,本文提出一种基于控制理论的关键基因预测算法。首先,从TCGA数据库收集结直肠癌数据,使用计算机工具预处理数据,并利用结直肠癌数据和LncMAP数据库数据构建lncRNATF-gene调控网络。然后,设计一种新的筛选方法,基于控制理论中的最小驱动节点集思想和可控性动态分类理论,筛选得到关键节点基因集;将突变得分和网络拓扑分析方法得分融合分析,得到潜在关键基因集。最后,对关键节点基因集和潜在关键基因集取交集,得到关键基因集。结合相关文献和CGC数据库对关键基因集进行验证,证实了该预测算法的有效性,为预测结直肠癌关键基因提供了一种新的思路和方法。
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关键词
控制理论
关键基因
结直肠癌
最小驱动节点集
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Keywords
control theory
key genes
colorectal cancer
minimum driven node set
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分类号
TP301
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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